SAGE方法分析永生化BEP2D细胞及α粒子诱发恶性转化BEP2D细胞的基因表达

目的：采用基因表达系列分析（serial analysis of gene expression,SAGE)方法,分析永生化BEP2D细胞及α粒子诱发恶性转化BEP2D细胞的基因表达。方法：细胞培养,收获永生化BEP2D细胞及α粒子诱发恶性转化BEP2D细胞;提取细胞总RNA,分离mRNA,合成生物素标记的双链cDNA;采用SAGE方法获取标签序列,结合UniGene文库分析标签代表的转录本,最终通过SAGE软件分析标签丰度,比较两组细胞基因表达差异。选取SAGE实验得到的在两组细胞中表达的已知基因Smad7和CCR11,以RT-PCR方法制备探针,用两组细胞等量总RNA为样本,做Northernblot杂交。结果：建立了2个独立的SAGE文库。一个是1.5Gyα粒子照射诱发恶性转化BGEP2D细胞的SAGE文库,一个是永生化BEP2D细胞SAGE文库。从2具文库中分别挑取克隆53个、50个,进行测序,测序一共得到总标签2331个,代表单一转录本252个,有70%的SAGE标签可找到与之一一对应的基因,有84个核糖体蛋白基因,约占33%;有12个转录本（4.8%)找不到与之理想匹配的已知基因;2个SAGE文库间,大多数基因表达丰度相近,对2个SAGE文库进行比较发现有在永生化细胞中高表达的基因,也有在恶转细胞中高表达的基因。Northernblot杂交证实SAGE方法得到的TGF-β诱导的Smad7基因在恶转BEP2D细胞中表达略高,化学激活物受体CCR11基因在永生化BEP2D细胞高表达。结论：（1）现有SAGE结果给出两组细胞基因表达丰度及表达差异的趋势。（2）SAGE方法结合Northernblot杂交,证实TGF-βr诱导的Smad7基因在恶转BEP2D细胞中表达略高,化学激活物受体CCR11基因在永生化BEP2D细胞高表达,提示Smad7基因在恶转BEP2D细胞中表达略高,化学激活物受体CCR11基因在永生化BEP2D细胞高表达。结论：（1）现有SAGE结果给出两组细胞基因表达丰度及表达差异的趋势。（2）SAGE方法结合Northernblot杂交,证实TGF-β诱导的Smad7基因在恶转BEP2D细胞中表达略高,化学激活物受体CCR11基因在永生化BEP2D细胞高表达,提示Smad7基因参与细胞恶转,CCR11基因对维持细胞正常生长有作用。（3）SAGE方法同时定量比较两组或两组以上mRNA间基因表达水平,简便、快捷,尤其适于筛查已知基因的新功能。     

α粒子诱发转化人支气管上皮细胞系BEP2D中XRCC5等基因的突变检测

目的与方法:用聚合酶链式反应-单链构象多态性分析(PCR-SSCP)方法观察α粒子诱发人支气管上皮细胞系BEP2D细胞转化过程中相关基因的改变.结果:细胞转化过程中,双链断裂修复基因XRCC5发生碱基突变,改变从转化早期过程就持续存在;而p16基因exon2和hMSH2基因exon12未见变化.结论:XRCC5基因在α粒子照射后早期发生突变,使细胞丧失修复双链断裂损伤的能力,是α粒子诱发支气管上皮细胞转化过程中的启动事件之一.     

p16基因转染对CNE-2细胞放射敏感性的研究

目的 探讨外源性p１６基因转染人鼻咽癌细胞系ＣＮＥ－２后对其放射敏感性的影响。方 法 通过体介导的基因转染方法将野生型p１６基因、空载全分别该基因突变的ＣＮＥ－２ 细胞中,同时设置不加任何质粒的ＣＮＥ－２细胞作为对照。３组细胞在相同的实验条件下,分别接受０,２,４,６,８Ｇｙ照射,经培养后计算细胞贴壁率再换算成存活率,按照多击单靶模型进行数学拟合,获存活曲线,求出Ｄo植等参数;利用流式细胞仪（ＦＣＭ）     

^238Puα粒子诱发人支气管上皮细胞BEP2D转化的初步研究

目的 建立氡及其子体诱发细胞转化的模型,模拟氡致肺癌的过程,方法 利用＾２３８ＰｕＯ２释放的α粒子,照射体外培养的人支气管上皮细胞系ＢＥＰ２Ｄ,诱发转化。结果１．５Ｇｙ单次照射的Ｒ１５Ｈ细胞在连续培养２２周后获得了转化,转化细胞逐步发生生长动力学和形态学的改变,生长失去接触抑制,ＣｏｎＡ凝集现象明显,获得对血清诱导末端分化的抗性和锚着独立性生长能力,与对照细胞相比均有统计学意义上的增强,结论：从ＢＥＰ２Ｄ到α粒子转化的Ｒ１５Ｈ细胞能够在一定程度上模拟体内肿瘤的发生发展过程,可以为深入了解肺支气管肿瘤发生多阶段过程中的细胞和分子机理提供研究模型。     

乙酸镍对人支气管上皮细胞系的恶性转化研究

目的：建立乙酸镍(niekel acetate)对永生化人支气管上皮细胞系(16BHE)的恶性转化模型，为下一步关于镍化合物致癌的分子机制的研究提供相应的恶性转化细胞。方法：通过克隆形成率实验确定乙酸镍对16HBEK细胞转化浓度后，对16HBE细胞进行分阶段多次染毒：每隔20d染毒1次，每次染毒24h。染毒12次后，通过软琼脂集落形成试验和鼠体内致瘤试验鉴定细胞恶性转化程度。结果：经乙酸镍多次处理16HBE细胞至75代时，细胞生长速度加快，排列紊乱，失去接触抑制，出现复层生长，并可在软琼脂上生长，且呈剂量反应关系，但在第75代之前的细胞则不能在软琼脂上生长。转化细胞在裸鼠体内成瘤，病理组织学证实为低分化鳞状细胞癌。结论：乙酸镍具有使16HBE细胞发生恶性转化的能力。     

ANXⅠ在原发性肺癌及BEP2D转化细胞中的表达

目的：体内、外体的许多感染模型证实，ANXⅠ介导糖皮质激素的抗炎症效应。被认为是糖皮质激素素抗炎症效应中的第二信使，然而，ANXⅠ与原发性肺癌之间的相关性尚未知晓。本文对此进行研究。方法：采用免疫组化方法检测60例原发性肺癌标本中ANXⅠ的表达分布；蛋白组学方法描绘ANXⅠ在永生化、转化与恶性转化中的表达状况。结果：ANXⅠ的表达分布与原发性肺癌的组织学分型相关（P＜0．05）；在永生化细胞中表达丰度低，转化细胞较高，恶性转化细胞中最高。结论：ANXⅠ可能与原发性肺鳞癌形成的启动或促进阶段，对人支气管上皮细胞恶性转化具有较重要的作用。     

肺癌患者组织样品中p16基因的异常甲基化

目的 分析肺癌患者组织样品中p16基因启动子区域异常甲基化的改变情况,评价该指标作为辅助临床诊断的分子标记物的价值。方法 运用甲基化特异性PCR技术,检测51例原发性肺癌患者的肿瘤组织、外周血血浆和痰标本中p16基因启动子区域的异常甲基化改变。结果 在43例肿瘤组织、36例血浆和39例痰标本中检测到了p16基因异常甲基化。凡在肿瘤组织检出p16基因甲基化阳性的病例,其血浆和(或)痰标本也为阳性;而肿瘤组织p16基因甲基化阴性的病例,其血浆和痰标本也为阴性。将血浆和痰标本的p16甲基化分析与痰细胞学检查相结合,可以发现92．2％的肺癌病例。结论 利用半巢式甲基化特异性PCR进行的血浆和痰标本p16基因甲基化分析,有可能成为辅助肺癌诊断的分子生物学指标。     

~(238)Puα粒子诱发人支气管上皮细胞BEP2D转化的初步研究

目的　建立氡及其子体诱发细胞转化的模型 ,模拟氡致肺癌的过程。方法　利用2 3 8PuO2 释放的α粒子 ,照射体外培养的人支气管上皮细胞系BEP2D ,诱发转化。结果　 1.5Gy单次照射的R15H细胞在连续培养 2 2周后获得了转化 ,转化细胞逐步发生生长动力学和形态学的改变 ,生长失去接触抑制 ,ConA凝集现象明显 ,获得对血清诱导末端分化的抗性和锚着独立性生长能力 ,与对照细胞相比均有统计学意义上的增强。结论　从BEP2D到α粒子转化的R15H细胞能够在一定程度上模拟体内肿瘤的发生发展过程 ,可以为深入了解肺支气管肿瘤发生多阶段过程中的细胞和分子机理提供研究模型。     

p16基因在鼻咽癌中缺失和表达改变的研究：p16基因在鼻咽癌中的改变系列研

目的：探讨ｐ１６基因是否在鼻咽癌活检组织中存在高频的失活,以确定该基因在鼻咽癌发病过程中所起的作用。方法：首先利用免疫组化的方法检测了１４例鼻咽癌活检组织中;ｐ１６基因的表达状况。并用比较多重ＰＣＲ－Ｓｏｕｔｈｅｒｎ杂交的方法检测了这１４例鼻咽癌活检组织中ｐ１６基因外显子１α和外显子２可能的缺失,以了解导致ｐ１６基因表达下调的机制。     

子宫内膜癌中p16基因甲基化与表达的研究

目的 研究ｐ１６基因甲基化状态及其ｐ１６基因表达异常与子宫内膜癌发生发展的关系。方法 采用限制性内切酶酶切、ＰＣＲ及ＲＴ－ＰＣＲ检测子宫内膜检测ｐ１６基因５’ＣｐＧ岛甲基化状态及ｐ１６基因ｍＲＮＡ表达。结果 ８例正常子宫内膜无甲基化,且ｐ１６ ｍＲＮＡ表达正常。６例子宫内膜非典型增生中,有１例甲基化;３８例子宫内膜癌中,１３例甲基化,占３４．２％。６例子宫内膜单纯及复合增生中,有５例ｐ１６ ｍＲＮ     

检测痰脱落细胞p16基因甲基化对周围型肺癌的诊断价值

目的　探讨检测痰脱落细胞p16基因甲基化对周围型肺癌的诊断价值。方法　应用甲基化特异性PCR(methylation specificPCR ,MSP)对 5 0例周围型肺结节患者及 2 0例正常人痰脱落细胞p16基因甲基化改变进行检测 ,将检测结果与术后病理报告相对照。结果　周围型肺癌痰脱落细胞 p16MSP阳性率( 2 7/ 44 ,61.4%)明显高于良性周围型肺结节 ( 1/ 6,16.7%)及正常人 ( 3 / 2 0 ,15 .0 %) ( χ2 值分别为 4.2 81和11.869,P <0 .0 5 ) ,良性周围型肺结节 p16MSP阳性率与正常人无显著性差异 ( χ2 =0 .13 6,P >0 .0 5 )。鳞癌和腺癌患者痰脱落细胞 p16MSP阳性率无显著性差异 ( χ2 =3 .416,P >0 .0 5 )。如果以痰脱落细胞 p16MSP阳性作为判断肺结节恶性的标准 ,其诊断周围型肺癌的阳性预测值为 96.4%,阴性预测值 2 2 .7%,灵敏度 61.4%,特异度 83 .0 %。结论　检测痰脱落细胞 p16基因甲基化对周围型肺癌具有辅助诊断价值     

非小细胞肺癌p16基因甲基化及缺失的研究

目的 研究p16基因在非小细胞肺癌组织中的甲基化和缺失情况，探讨其在肺癌诊断中的价值。方法 应用甲基化相关的PCR及双重PCR，检测50例肺癌组织和54例正常肺组织中p16基因第1外显子5′端启动子区域CpG岛甲基化及第2外显子缺失情况。结果 p16基因在非小细胞肺癌组织中甲基化率为32.0%(16/50)。缺失率为28.0%(14/50);54例正常肺组织甲基化率为3.7%(2/54)，缺失率为0，二组比较，甲基化率（Fisher's exact=0.000)及缺失率（Fisher's exact=0.000)均有显著性差异。结论 甲基化和缺失是非小细胞肺癌p16基因失活的主要形式，检测p16基因甲基化和缺失状态可能有助于肺癌的诊断。     

炭末沉着症和p16~(ink4a)基因异常甲基化对小型肺腺癌发生进展的影响

背景与目的 炭末沉着症系长期吸入非生产性粉尘而导致各级支气管壁粘膜和肺膜内有炭末斑形成,可致支气管变形及破坏.有研究表明,炭末沉着症与小型肺腺癌的发生和进展密切相关.本研究旨在探讨炭末沉着症与p16ink4a基因异常甲基化修饰程度在小型肺腺癌发生和进展过程中的影响.方法应用Methylation Specific PCR技术检测68例原发性小型肺腺痛患者的癌组织、癌周正常组织中的p16ink4a基因启动子区域的异常甲基化修饰程度;炭末定量分析法来检测患者肺内的炭末沉着量;采用野口氏病理分型.结果 重度吸烟者(吸烟指数>600)的平均炭末沉着量明显高于轻度吸烟者(吸烟指数<600)和非吸烟者(P=0.005);重度吸烟者的p16ink4a基因异常甲基化检出率为60%,也明显高于轻度吸烟者和非吸烟者的27%(P=0.023);早期小型肺腺癌的p16ink4a基因异常甲基化检出率低于进展期和低分化小型腺癌,但无统计学意义;p16ink4a基因调控产物表达早期小型腺癌高于低分化小型腺癌(P=0.032).结论 炭末沉着定量分析与p16ink4a基因异常甲基化检测二者结合,有可能应用于对吸烟人群的肺腺癌早期发现和早期诊断.     

CDKN2/p16基因5′-CpG岛SmaI位点甲基化与肺癌的关系

目的　研究CDKN2 /p16基因 5′端调控序列CpG岛甲基化的状态与肺癌发生发展的关系。方法　采用对甲基化敏感的核酸内切酶SmaⅠ ,酶切基因组DNA的方法 ,对 89例肺癌标本和 10例正常肺组织的CDKN2 /p16基因进行Southern杂交分析。结果　 89例肺癌中 ,CDKN2 /p16基因甲基化者 15例 ,甲基化频率为 16 .9%。 42例p16蛋白阴性的肺癌患者中 ,有 12例发生甲基化 ,甲基化频率为 2 8.6 % ;另有 47例p16蛋白阳性患者中仅有 3例发生甲基化。 10例正常肺组织中均未发现CDKN2 /p16基因有甲基化现象。结论　CDKN2 /p16基因 5′端CpG岛甲基化是该基因失活的重要机制 ,是肺癌细胞区别于正常细胞的分子事件之一 ,可能参与肺癌的发生发展过程     

p16基因甲基化与胃黏膜异型增生恶性转化的关系

目的 山东省临朐县是我国北方胃癌高发区之一,人群中胃黏膜异型增生(dysplasia,DYS)病变所占比例较高.DYS是胃黏膜癌前病变发展的高级阶段,具有显著的恶性转化潜能.本研究探讨p16基因甲基化与DYS病变恶性转化的关系,验证其作为胃癌预警标志物的应用价值.方法 以胃癌高发现场长期胃镜随访队列为基础,对101例来自山东省临朐县胃癌高发区且随访至2015-12-31的DYS病例,采用Methylight方法定量检测胃黏膜组织p16基因甲基化水平,评价其与DYS进展为胃癌风险的关系.结果 在进展为胃癌组,p16基因甲基化百分比中位数(四分位数)为1.30％(0.13％～1.87％),显著高于非进展组的0.67％(0～1.15％),P=0.047.与p16基因低甲基化者相比,高甲基化水平的DYS患者进展为胃癌的风险显著增加,OR-3.67,95％CI为1.31～10.34.进一步分析发现幽门螺杆菌(H.pylori)感染阳性者p16基因甲基化百分比中位数(0.98％)明显高于阴性者(0.01％),P＜0.001;分层分析发现,p16基因高甲基化同时H.pylori感染阳性者进展为胃癌的风险进一步增加,OR=5.14,95％CI为1.57～16.82.通过分析p16基因甲基化水平与DYS病例进展为胃癌的时间关系,发现随着胃癌诊断时间的临近,p16基因甲基化水平有缓慢升高的趋势,但差异未见统计学意义.结论 胃黏膜组织p16基因甲基化水平升高可作为DYS患者发生恶性转化的潜在预警标志物.     

P16 methylation of the colorectal cancer and association with dukes stages

Since its discovery as a CDKi (cyclin-dependent kinase inhibitor) in 1993, the tumor suppressor p16(INK4/MTS1/CDKN2A) has been found to play animportant role in carcinogenesis[1,2]. A high frequency of p16 gene alterations were observed in many tumors. P16 gene alterations have at least three ways: homozygousdeletion, point mutation and methylation of thepromoter[3]. The first two mechanisms have never been found in colorectal cancer[3-5]. The role of p16 gene methylation in tumorigenesi…     

肺鳞癌、腺癌中p14 ARF基因启动子区甲基化及蛋白表达的研究

背景与目的 p14^ARF基因是新近发现的抑癌基因，其异常表达与多种人类肿瘤发生有关，启动子区异常甲基化作为p14^ARF基因失活的重要形式可能参与了肿瘤的发生。本研究通过检测肺鳞癌、腺癌中p14^ARF启动子区甲基化状态和蛋白表达，探讨p14^ARF启动子区甲基化与肺癌的关系。方法 通过免疫组织化学（IHC）、甲基化特异性PCR（MSP）和相关限制性内切酶PCR（RF-PCR）方法，检测40例肺鳞癌、腺癌组织中p14^ARF启动子区甲基化状态和蛋白表达水平。结果 癌组织及癌旁正常组织中p14^ARF启动子区甲基化阳性率分别为17．5％（7／40）和2．5％（1／40）（P-0．025）。RE-PCR检测结果相同。癌组织及癌旁正常组织中p14^ARF蛋白阳性率分别为70．0％（28／40）和95．0％（38／40）（P-0．003）。p14^ARF基因启动子区甲基化和蛋白表达均与肿瘤分期、组织类型、分化程度、淋巴结转移等临床病理特征无明显关系（P＜0．05）。p14^ARF启动子区甲基化与蛋白表达呈负相关（r=-0．56，P=0．001）。结论 启动子区甲基化是p14^ARF基因失活的重要机制。p14^ARF启动子区异常甲基化可能参与了非小细胞肺癌的发生，是肺癌发生过程的早期事件。     

慢性乙型肝炎病毒感染与p16INK4A基因启动子甲基化关系的研究

目的探讨慢性乙型肝炎病毒(HBV)感染对p16INK4A基因启动子甲基化的影响及其在HBV相关肝细胞癌(HCC)形成中的作用。方法选取23例HBV相关HCC癌及癌旁组织、25例慢性乙型肝炎肝穿刺组织,采用甲基化特异性PCR(MSP)检测p16INK4A基因启动子的甲基化状态;免疫组化EnVision二步法测定肝组织内HBsAg、HBcAg、HBeAg和HBx蛋白的表达;荧光实时定量PCR检测肝组织HBV DNA含量;PCR扩增和直接测序检测HBV x基因变异。结果癌组织p16INK4A基因启动子甲基化阳性率(47.83%)明显高于癌旁组织(17.39%),慢性乙型肝炎患者p16INK4A基因启动子甲基化阳性率(36.00%)与癌组织、癌旁组织差异无统计学意义。在癌旁组织和慢性乙型肝炎, p16INK4A基因启动子甲基化者HBx蛋白表达中位数分别为3.000和0.250,明显高于非甲基化者(0.500和0.000),但在癌组织中,HBx蛋白的表达与p16INK4A基因启动子甲基化状态无关。HBsAg、HBcAg、组织HBV DNA含量和x基因突变均与p16INK4A基因启动子甲基化状态无关。结论在癌前病变中,p16INK4A基因启动子甲基化与HBx蛋白高表达有关,HBx蛋白可能通过诱导p16INK4A基因启动子甲基化而使该抑癌基因失活,在HBV相关HCC形成中起重要作用。     

外源性p16基因对wtp53型人肺腺癌细胞生长的影响

目的 探讨Ｐ１６对人肺腺癌的作用及Ｐ１６基因治疗肺癌的可能性。方法 运用分子克隆技术构建重组人Ｐ１６基因表达载,以电穿孔法将Ｐ１６基因导入到该基因缺失的ｗｔｐ５３型的人肺腺癌Ａ５４９和Ｈ４６０细胞中,得到稳定表达Ｐ１６的人肺腺癌细胞。详细研究Ｐ１６基因对ｗｔｐ５３型人肺腺癌细胞周期的影响和细胞增殖的作用。结果 导入Ｐ１６基因能使人Ａ５４９和Ｈ４６０细胞生长速度较对照细胞明显减慢,细胞周期阻滞在Ｇ１     

Aberrant promoter methylation of p16 in colorectal adenocarcinoma in North Indian patients

AIM: To investigate p16 gene methylation and its expression in 30 patients with sporadic colorectal adenocarcinoma in a North Indian population.METHODS: Methylation specific polymerase chain reaction was used to detect p16 gene methylation and immunohistochemistry was used to study the p16 expression in 30 sporadic colorectal tumors as well as adjoining and normal tissue specimens.RESULTS: Aberrant promoter methylation of p16 gene was detected in 12 (40%) tumor specimens, whereas no promoter methylation was observed in adjoining and normal tissue. Immunohistochemistry showed expression of p16 protein in 26 (86.6%) colorectal tumors whereas complete loss of expression was seen in 4 (13.3%) and reduced expression was observed in 12 (40%) tumors. In the adjoining mucosa, expression of p16 was in 11 (36.6%) whereas no clear positivity for p16 protein was seen in normal tissue. There was a significant difference in the expression of p16 protein in tumor tissue and adjoining mucosa (P < 0.001). The methylation of the p16 gene had a significant effect on the expression of p16 protein (P = 0.021). There was a significant association of methylation of p16 gene with the tumor size (P = 0.015) and of the loss/reduced expression of p16 protein with the proximal site of the tumor (P = 0.047). Promoter methylation and expression of p16 had no relation with the survival of the patients (P > 0.05).CONCLUSION: Our study demonstrated that promoter hypermethylation of the p16 gene results in loss/reduced expression of p16 protein and this loss/reduced expression may contribute to tumor enlargement.