山东省新型冠状病毒奥密克戎变异株阳性感染者疾病严重程度影响因素分析

目的 探讨新型冠状病毒(以下简称新冠病毒)奥密克戎变异株感染者的疾病严重程度及其影响因素,为制定针对性防控措施提供科学依据。方法 回顾性收集2022年1月1日-5月30日山东省部分地市新冠病毒肺炎定点医院收治的奥密克戎变异株感染者资料,按疾病严重程度进行临床分型,分析不同年龄、核酸转阴时间、住院时间、接种新冠病毒疫苗剂次感染者的疾病严重程度差异。采用多因素二元logistic回归分析奥密克戎变异株感染者疾病严重程度的影响因素。结果 共纳入新冠病毒奥密克戎变异株感染者573名,临床分型包括无症状感染者315人(55.0%)、轻型感染者214人(37.3%)、普通型感染者44人(7.7%)、重型感染者0人(0%)。已进行疫苗加强接种397人(69.3%),未进行加强接种176人(30.7%)。573名感染者中,83.6%(479/573)的感染者年龄集中在18～69岁年龄段。不同年龄段感染者的疾病严重程度差异有统计学意义(χ²=17.775,P<0.01),不同核酸转阴时间感染者的疾病严重程度差异有统计学意义(χ²=13.693,P<...     

上海某方舱医院新型冠状病毒 奥密克戎变异株感染者流行病学特征分析

[摘要]　目的　探讨上海某方舱医院新型冠状病毒奥密克戎变异株感染者的发病情况及流行病学特征。方法　以2022年4月9日—5月5日上海国家会展中心方舱医院收治的新型冠状病毒奥密克戎变异株感染者为研究对象,对感染者年龄、性别、地区、疫苗接种等疫情数据进行流行病学特征分析。结果　122 151例新型冠状病毒感染者均为奥密克戎变异株BA.2或BA.2.2亚型感染,其流行病学特征结果显示：患者男女比例为1.51:1;平均年龄为（44.91±15.38）岁;0～17岁、18～30岁、31～60岁和≥61岁感染者分别占4.74%、20.80%、62.52%和11.94%;无症状感染者占80.80%,轻型患者占19.20%;平均住院时间为（7.00±2.77）d;未接种和完成1、2和3次疫苗接种的感染者分别占20.30%、3.18%、31.30%和45.22%,其中≥61岁且完成3次疫苗接种的感染者仅占10.10%。结论　各个年龄段人群对于新型冠状病毒奥密克戎变异株普遍易感。无症状感染者是本次疫情的主体人群,临床症状不典型,早期隐匿传播,积极加强核酸检测是早期发现疫情的必要手段。     

一起奥密克戎变异株引起的新型冠状病毒感染本土疫情流行特征与传播动力学分析

目的 分析云南省边境某县一起由奥密克戎变异株（BA. 2）引起的新型冠状病毒感染（新冠）本土疫情的流行特征及传播动力情况，为今后新冠疫情防控策略制定提供参考依据。方法 收集2022年4月8—25日云南省边境某县报告新冠阳性病例的个案信息和流行病学调查资料，采用描述流行病学方法及传染病传播动力学方法进行分析。结果 本次疫情共报告202例病例，经测序为奥密克戎变异株BA. 2；男女性别比1∶1.6，各年龄段、不同疫苗接种史的人群均有发病；出现51个家庭聚集性发病；潜伏期（2.38±2.20） d，代间距（2.85±2.11） d；实时再生数（Rt）最高时达到4.76 (95%CI:3.37～6.39)，但在实施防控措施约9 d后，Rt迅速下降至1以内，与防控效果相呼应。结论 奥密克戎变异株的潜伏期短、代际传播时间短、传播隐匿且速度快、容易造成聚集性发病，防控部门应进行早期疫情研判和采取有效的防控措施，对及时、快速地控制住疫情态势发展具有至关重要的作用。     

新型冠状病毒疫苗对四川省部分地区新型冠状病毒奥密克戎变异株感染人群中的保护效果评价

目的 评价新型冠状病毒（简称新冠病毒）疫苗预防新冠病毒奥密克戎变异株感染所致发病、肺炎和重症的保护效果（Vaccine effectiveness,VE）。方法 采用病例-病例研究，对2022年2至7月四川省成都市和广安市报告的新冠病毒感染本土病例进行调查，分析新冠病毒疫苗预防奥密克戎变异株发病、肺炎和重症的VE以及经年龄、性别、基础性疾病调整后的VE(aVE,Adjusted vaccine effectivenes)，通过SPSS 21.0软件进行单因素和多因素Logistic回归分析，检验水准α=0.05。结果 本研究共纳入新冠病毒感染病例1 683例，均为新冠病毒奥密克戎变异株BA.2感染，临床结局为发病、肺炎和重症分别是511例（30.4%）、66例（3.9%）和11例（0.7%），重症人群中90.9%(10/11)都是60岁及以上老年人群。加强免疫预防奥密克戎变异株发病和肺炎的aVE分别是52.4%(95%CI:17.8%～72.4%)和81.6%(95%CI:60.0%～91.5%)，基础免疫预防肺炎的a VE是69.2%(95%CI:26.9%～87.0%)，未完成全程...     

严防奥密克戎新变异株输入

当前全球新冠肺炎新增确诊病例仍在增加,我国实施的“外防输入,内防反弹”措施将有利于及时发现输入我国的奥密克戎变异株。一、什么是奥密克戎变异株2021年11月9日,南非首次从病例样本中检测到一种新冠病毒变异株,11月26日,WHO将其列为“需要关注”的变异毒株,并以希腊字母“奥密克戎”命名,定义为奥密克戎变异株。     

奥密克戎毒株最新权威解答

当前,多地报告发现奥密克戎变异株感染病例,引发广泛关注。针对奥密克戎变异株,国家卫生健康委组织中国疾控中心专家就有关问题作了最新解答:奥密克戎变异株的发现和流行情况2021年11月9日,南非首次从病例样本中检测到一种新冠病毒变异株。11月26日,世界卫生组织(WHO)将其命名为Omicron (奥密克戎)变异株。     

新型冠状病毒奥密克戎亚型感染临床随访研究

【目的】观察无症状和轻症奥密克戎变异株感染患者的病毒转阴时间和转阴持续时间。【方法】收集2022年4月9日—5月20日在国家会展中心(上海)方舱医院第三分院5F-B区收治的感染奥密克戎变异株新型冠状病毒(COVID-19)的244例患者临床资料。分析患者的人口统计学和临床数据信息。主要观察结果为COVID-19核酸转阴时间。采用单因素和多因素Cox风险模型确定核酸转阴时间的独立危险因素。【结果】新型冠状病毒RNA转阴持续时间中位数为9 d(7～12 d)。患者确诊感染后的第5、7、10和14天内核酸阳性的患者分别占68.4%、47.1%、20.1%和5.7%。Kaplan-Meier曲线显示,高血压患者的核酸转阴时间中位数为12 d(10～14 d),而非高血压患者为9 d(7～11 d),年龄≥60岁患者为11 d(9～13 d),<60岁患者为9 d(7～11 d)。多变量Cox回归分析显示,仅高血压是核酸转阴的相关因素(RR=1.60;95%CI:1.03～2.49,P=0.036)。【结论】奥密克戎亚型感染的无症状或轻症患者中20.1%在感染10 d时仍会出现病毒核酸阳性...     

一起健身场所内新冠病毒感染聚集性疫情调查

目的 对一起健身场所内新冠病毒感染聚集性疫情进行流行病学调查分析，为大流行期间急性呼吸道传染病防控提供参考。方法 收集2022年3月浙江省嘉兴市嘉兴港区一起新冠病毒感染聚集性疫情现场处置期间报告的病例信息和流行病学调查报告，使用WPS Excel进行数据整理和描述性分析，用Microsoft Visio绘图，用SAS 9.4统计分析。结果 本次聚集性疫情共报告感染者25例，由新冠病毒奥密克戎变异株（Omicron BA.2.2进化分支）引起。末次核酸检测阴性前密接1 231人，无人感染；末次核酸检测阴性后密接416人，其中24人感染。共同打球密接的阳性率为77.8%(14/18)。在球场共同打球是暴露后感染的危险因素（OR=29.75,95%CI:15.41～44.07），而暴露时间（F=0.00,P=0.970）、疫苗接种剂次（F=0.00,P=1.000）、末次疫苗接种与本次暴露间隔时间（F=0.03,P=0.857）等因素与是否感染的差异无统计学意义。结论 在密闭空间内Omicron变异株具有较强传染性，但感染者末次核酸检测阴性前无传染性。建议在急性呼吸道传染病大流行期间，充分重...     

淮安市1起由奥密克戎变异株BA.5.2引起的聚集性疫情的调查分析

目的 了解1起由奥密克戎变异株引起的新型冠状病毒肺炎(简称“新冠”)聚集性疫情流行病学特点。方法 对本起疫情进行流行病学调查、实验室检测和序列分析，并进行溯源分析。结果 本起疫情持续时间为2022年11月1—6日，报告新冠感染者13例，以男性为主(占61.5%),中位年龄为52岁；包括无症状感染者10例(占76.9%)、确诊病例轻型2例(占15.4%)和普通型1例(占7.7%)。病例病毒基因测序结果显示为奥密克戎变异株BA.5.2,与邻省“10.04”疫情1例本土病例感染毒株高度同源。结论 本起疫情高度怀疑为外省输入引发，病毒株为奥密克戎变异株BA.5.2。     

2023年许昌市新冠病毒分子流行病学特征

目的 动态监测河南省许昌市本土流行的新冠病毒毒株组成，及时发现新变异株，评估变异株的传播力、致病力和免疫逃逸能力等生物学特性，为疫情防控提供技术支撑。方法 采用高通量测序方法对2023年2月15-19日来自哨点医院的6例新冠病毒感染者的咽拭子标本进行全基因测序，进行序列对比和进化分析。结果 6例新冠病毒感染者样本进行全基因测序，获得6条长度为29 844～29 853 bp序列。经过Nextclade V2.11.0在线分析，6条序列均属于新冠病毒奥密克戎BA.5变异株，其中病例1为BF.7.14，其余均为BA.5.2.48分支。进化树显示6条序列位于奥密克戎BA.5进化分支，与河南省其他地市BA.5进化株位于同一分支。未发现BQ、XBB等变异株。结论 测序的6例本土病例新冠病毒均为奥密克戎变异株，BA.5.2.48分支变异株依然是许昌市优势流行毒株。     

大理市某医院534例新冠病毒感染者临床特征及核酸检测结果

目的 回顾性分析大理市某医院新冠病毒感染者临床特征及核酸检测结果，为疫情防控提供参考。方法 用实时荧光定量PCR法检测大理市某医院2020—2022年新冠病毒感染者样本，探讨不同首发症状和样本类型与核酸循环阈值(Ct值)的关系。结果 大理市某医院2020—2022年534例新冠病毒感染者，男性占56.4%、20～59岁占65.9%、转阴时间<10 d占47.0%;确诊病例占89.0%(475例),无症状感染者占11.0%;40～59岁确诊病例占比较高(92.1%),<20岁无症状感染者占比较高(26.7%);475例确诊病例首发症状以发热为主(73.5%);534例新冠病毒感染者鼻拭子和咽拭子的首次核酸阳性率分别为83.9%(26/31)和77.5%(390/503);不同首发症状和不同样本类型的核酸ORFlab基因和N基因Ct值差异无统计学意义。结论 大理市某医院2020—2022年534例新冠病毒感染者，男性占56.4%、20～59岁占65.9%、转阴时间<10 d占47.0%、确诊病例占89.0%、无症状感染者占11.0%;咽/鼻拭子的首次核酸阳性率分别为77....     

2022年7-12月北京入境旅客中新冠病毒变异株监测分析

目的 掌握2022年下半年北京口岸入境旅客感染的新冠病毒变异株分布情况，探讨其与全球新冠病毒变异株流行的关联性。方法 采集2022年7-12月北京口岸全部入境旅客的呼吸道样本，用RT-PCR法检测新冠病毒核酸，对阳性样本开展基因序列测定，用BioEdit软件进行序列一致性分析，病毒分支由Pangolin COVID-19 Lineage Assigner完成。通过世界卫生组织和GISAID获得全球新冠病毒感染和变异株的监测数据，探讨全球监测数据与北京口岸监测数据的关联性。结果 共采集并检测了入境旅客呼吸道样本121 542件，其中阳性712件；对符合测序条件的631件进行基因测序，获得全基因组序列308条，奥密克戎BA.5.2(22.1%)、 BF.7(9.1%)和BQ.1.1(9.1%)为主要流行株，占40.3%。口岸检出新冠病毒阳性率与同期全球新冠发病水平的相关性无统计学意义（r=-0.71,P>0.05），口岸检出的主要变异株分支多为同期全球主导流行株，但两者的相关性无统计学意义（r=0.41,P>0.05）。具有传播优势的变异株在全球成为主导流行株之前，在入境旅客中...     

河南省首起奥密克戎新冠肺炎疫情流行特征分析

目的 分析河南省首起奥密克戎新冠肺炎疫情的流行特点。 方法 收集河南省安阳市2022年1月本土奥密克戎感染者的流行病学特征、实验室检测结果等信息,采用描述流行病学方法进行分析。结果 2022年1月8—29日,安阳市共报告468例感染者,年龄范围在8个月～85岁之间,中位年龄M（P25,P75）为18（17,34）岁,男女比例1∶1.4,职业以学生（64.1%）为主;按照发病日期,疫情共持续28 d（1月2—29日）;按照报告日期,11 d（1月19日起）实现社会面清零;283例（60.5%）来自于汤阴县某寄宿制学校,其他185例涉及4个县区14个乡镇38个村。90例（19.2%）感染者出现临床症状,主要为发热、咽痛、咳嗽、鼻塞流涕、头痛头晕等轻微症状;临床严重程度除2例为重型外,其余均为轻型和普通型,无死亡病例。潜伏期为1～9 d,中位数M（P25,P75）为2 d（2,4）;出现学校、村庄、小区、工厂、诊所、超市、家庭等多起聚集性疫情,家庭续发率为25.0%。基本再生数R0为5.25,实时再生数Rt于采取防控措施后迅速下降,在采取措施后第10 d降至1以下。结论 奥密克戎变异株的潜伏期短,传染性强,引起的临床症状轻微,传播更隐匿,应全面加快疫情防控速度,重点关注疫情放大器场所。     

2022年上海市某方舱医院收治的3054例新冠轻型/无症状感染病例的流行病学特征

目的 对感染新冠病毒奥密克戎(Omicron)BA.2毒株的方舱医院住院患者流行病学特点进行深入分析。方法 回顾性收集2022年4月8日-5月13日入住上海市石龙路方舱医院的新冠病毒轻型和无症状感染病例,分析其流行病学史、一般状况、住院天数、新型冠状病毒(SARS-CoV-2)疫苗接种情况和病毒基因循环阈值(Ct)信息。利用单因素和多因素的Logistic回归分析患者住院>14 d和未注射疫苗的危险因素。结果 研究收集2 896例奥密克戎变异株感染者,平均住院天数(10.79±4.31)d,入院时病毒N基因和ORF1ab基因的Ct值分别为(28.63±6.55)和(29.45±5.50),其中13.05%患者未接种新冠疫苗。年龄越大者,住院时间超14 d可能性越大,而疫苗接种次数越多者,则更有可能14 d内出院;对907例患者入院时的新冠核酸检测显示,未成年患者病毒N和ORF1ab基因Ct值高于成年患者,合并常见慢性病患者的基因Ct值低于未合并的患者;相关性分析显示住院时间与N基因(r=-0.362,P<0.001)和ORF1ab基因Ct值(r=-0.391,P<0....     

输入性新冠病毒奥密克戎XBB.1型全基因组测序及特征

目的 针对江苏口岸1例境外输入性新冠病毒（SARS-CoV-2）感染者咽拭子样本，通过二代测序技术进行全基因组测序及序列分析，掌握输入性SARS-CoV-2基因型及分子特征，为口岸新冠病毒防控提供理论支持。方法 通过荧光定量PCR和二代测序技术对入境感染者咽拭子样本进行新冠病毒核酸检测，对Ct≤32的阳性样本开展全基因组测序。结果 获得1株输入性SARS-CoV-2全基因组序列（GenBank:OQ048285），基因组全长29 772 bp，基因型为奥密克戎XBB.1型。与参考毒株（GenBank:NC＿045512.2）相比，该毒株有56个碱基位点缺失，有88个位点发生了替换；氨基酸缺失位点有13个，突变位点有63个。结论 奥密克戎XBB.1型是江苏口岸首次检出的输入性新冠病毒基因型，为当地口岸新冠病毒的防控及分子溯源提供重要技术支持。     

入境人员集中隔离点房间新型冠状病毒污染状况分析

目的 了解入境人员集中隔离点房间新型冠状病毒污染状况,为集中隔离点规范管理提供科学依据。 方法 采集2021年12月18日—2022年1月16日入境人员集中隔离居住过的房间环境表面涂抹样本,用Real-Time PCR方法对新型冠状病毒核酸进行检测,并对房间污染状况进行分析。 结果 共采集房间环境标本21 150份,其中确诊病例房间35个,样本数为350份,检出新冠病毒核酸阳性25份,均在确诊病例房间内,检出率为7.14%(25/350),物品为马桶、门板、灯开关、地面、床头柜、洗漱台、桌面、遥控器等。81.81%(9/11)的奥密克戎变异株确诊病例房间内检出新冠病毒核酸阳性。 结论 新型冠状病毒肺炎(简称新冠肺炎)确诊病例隔离房间物体表面存在污染风险,尤其是奥密克戎变异株患者房间环境污染风险更高,应按相关要求落实闭环管理,采取严格隔离措施,规范做好消毒工作,才能切实阻断新冠肺炎交叉感染和外溢感染风险。     

一起由新型冠状病毒奥密克戎BA.2.76变异株引起的暴发疫情特征分析

目的 分析2022年9月四川省遂宁市发生的一起新型冠状病毒肺炎本土疫情特征，为遂宁市的疫情防控提供参考依据。方法 收集本次疫情相关资料，对感染者的流行病学特征进行描述性分析。结果 本起疫情持续15 d，共报告205例感染者，男性85例，女性120例，年龄中位数M(P25,P75)为52(34.5,60)岁；无症状感染者90例，确诊病例115例（轻型106例、普通型3例、重型4例、危重型2例），无死亡病例报告。病毒基因测序为奥密克戎变异株BA.2.76，未完成新冠疫苗加强免疫组患重症的比例为2.44%，高于完成新冠疫苗加强免疫组的0.49%；未完成新冠疫苗加强免疫组首次核酸阳性ORF1ab靶标为25.10、N靶标Ct值中位数为25.10，均低于完成新冠疫苗加强免疫组的29.30和28.45。结论随着防控措施的落实，疫情得到快速有效控制。新冠疫苗加强免疫可以有效降低感染者体内病毒载量，减少重症病例的发生。     

奥密克戎急性感染首发症状及胸部CT特点分析

目的：提高对奥密克戎病毒感染全程接种新冠疫苗患者首发症状及胸部CT特点的认识。方法：分析收治的80例奥密克戎病毒急性感染的患者CT检查结果。结果：80例奥密克戎感染无症状患者占比最高(37.78%)。胸部CT有11例患者有明显肺部改变。结论：奥密克戎病毒感染全程接种新冠疫苗患者首发症状轻，少部分患者有胸部CT改变。     

上海市长宁区≥60岁人群新型冠状病毒疫苗的接种特征及保护效率

【目的】了解上海市长宁区≥60岁人群新型冠状病毒疫苗（简称“新冠疫苗”）的接种特征和疫苗对新冠病毒感染的保护效率（VE），为进一步实施老年人新冠疫苗接种策略提供参考。【方法】收集2020年12月21日—2022年2月28日长宁区≥60岁人群新冠疫苗接种数据和2022年3月1日—2022年5月31日长宁区≥60岁人群新冠病毒感染确诊病例个案数据，采用过筛法对疫苗的VE进行评价。【结果】老年人群中新冠疫苗至少部分免疫、至少全程免疫和加强免疫的接种率分别为69.89%、63.80%和31.91%,80岁及以上老年人疫苗接种率最低。疫苗对重症、危重症或死亡病例的VE最高，全程免疫的VE为96.15%(95%CI:84.15～99.06)，加强免疫的VE达100%。【结论】老年人新冠疫苗全程和加强免疫接种率偏低，特别是≥80岁的老年人。国产新冠疫苗接种对老年人新冠病毒奥密克戎BA.2变异株感染后的重症、危重症或死亡有保护效果。     

北京市朝阳区2023年2月——5月新冠病毒新型变异株感染者特征分析

目的 分析新冠病毒新型变异株感染者的临床和流行病学特征,为科学开展新型变异株疫情防控提供参考。方法 对北京市朝阳区2023年2月1日—2023年5月31日接报的除BA.5.2和BF.7及其亚分支外,其他未在北京市本土流行的新冠病毒新型变异株感染者进行个案调查,对收集到的信息进行描述性流行病学分析。结果 共调查110例新型变异株感染者,其中100例（90.91%）检出XBB及其亚分支。感染者中,男性64例,女性46例,年龄中位数为32岁,72例（65.45%）为境外感染;境外感染者的年龄、疫苗接种率、再次感染率均高于本土感染者（P <0.05）。100例（90.91%）感染者在此次病程中出现临床症状,主要表现为发热（66.00%）、咽痛（53.00%）、咳嗽（52.00%）,35.00%的病例符合流感样病例定义;再次感染者出现临床症状的比例低于首次感染者（P=0.004）。感染者核酸或抗原转阴时间为（5.92±2.95） d,病程为5.00(4.00～8.75)d;再次感染者转阴时间（5.08±2.60）d短于首次感染者（6.49±3.06）d (P=0.026)。未发现XBB及其...