曲靖汉族人群19个STR基因座遗传多态性分析

目的调查云南曲靖地区汉族人群19个常染色体STR基因座的遗传多态性。方法用GoldeneyeTM20A试剂盒检测601个曲靖地区汉族群体样本,使用Modified-Powerstates、Phylip3.695、Mega7.0等软件进行统计计算与群体间遗传距离比较。结果在601例曲靖汉族人群中,19个STR基因座均具有高度遗传多态性,共检测出236种等位基因,其分布均符合Hardy-Weinberg平衡定律(P> 0.05)。曲靖汉族人群19个STR基因座的累积个人识别率为0.999 999 999 999 999 999 999 9,累积非父排除率为0.999 999 907。曲靖地区汉族人群与陕西汉族人群遗传距离最近,与新疆维吾尔族人群间的遗传距离最远。结论这19个STRs位点具有较高的个体识别力和多态信息量,能满足法医学个体识别和亲权鉴定的需要,同时对人群进行区分有重要意义。     

湖北汉族人群15个STR基因座的遗传多态性

目的 调查湖北汉族人群15个STR基因座(D8S1179、 D21S11、D7S820、CSF1PO、D3S1358、TH01、D13S317、D16S539、D2S1338、D19S433、vWA,TPOX,D18S51,D5S818,FGA)的遗传多态性分布.方法 采用Identifiler试剂盒复合扩增305例湖北汉族个体的15个STR基因座,产物经3130遗传分析仪电泳分离和分型检测,分析检验基因座的遗传学参数:基因频率、杂合度、多态信息含量(PIC)、个体识别能力(DP)、非父排除概率(PE)和遗传平衡状态.结果 305名无关个体共检测到15个STR基因座的146个等位基因,各基因座基因型分布均符合Hardy-Weinberg平衡(P＞0.05).13个STR基因座的PIC＞0.5,14个STR基因座的DP＞0.8,12个STR基因座的PE＞0.5;累积个体识别力＞0.999 999 999,累积非父排除率＞0.999 998 8.结论 湖北汉族人群15个STR基因座的绝大多数基因座具有较高的遗传多态性,其群体遗传学数据可用于本地人类遗传学、法医亲子鉴定和个体识别等研究领域.     

文山红河地区苗族人群20个常染色体STR基因座遗传多态性研究

  目的  研究文山红河地区苗族群体20个常染色体STR基因座的遗传多态性,评估其在该人群中的法医学应用价值,为法医DNA分析和人类遗传研究提供基础数据。  方法  采用Chelex-100法提取样本DNA,使用PowerPlex?21试剂盒对该地区2 209例苗族无关健康个体STR基因座进行复合扩增,用ABI 3130自动遗传分析仪对扩增产物进行毛细管电泳分析,用Genemapper ID v3.2软件进行基因分型。采用Modified-Powerstats软件进行Hardy-Weinberg平衡检验,并计算法医学参数。应用Arlequin和Phylip软件分别计算Fst值和Nei's遗传距离。使用SPSS软件进行多维尺度（MDS）分析。采用Mega软件构建相邻连接（N-J）系统发育树。  结果  20个常染色体STR基因座共检出265个等位基因和1080种基因型。等位基因频率分布为0.0002～0.5718,各基因座等位基因频率和基因型频率分布均符合Hardy-Weinberg平衡（P > 0.05/20 = 0.0025）。累积非父排除率（CPE）为 0.999 999 935 545 335,累积个人识别概率（CDP）为 0.999 999 999 999 999 999 999 932 674 151。Nei's遗传距离、N-J系统发育树和MDS分析显示,文山红河地区苗族与云南越南人群遗传关系最近。  结论  20个常染色体STR基因座在文山红河地区苗族群体中具有较高的遗传多态性,可用于法医学鉴定和群体遗传学研究。     

云南彝族人群19个常染色体STR基因座的遗传多态性

目的 研究云南彝族215个健康无关个体19个常染色体STR基因座的遗传多态性, 计算群体遗传学参数, 建立云南彝族群体的遗传学基础数据, 为法医物证亲权鉴定和个体识别提供科学依据。方法 采用Chelex-100法提取样本DNA, Power PlexR21 System试剂盒进行扩增, ABI 3130XL自动遗传分析仪对PCR复合扩增产物进行分析, 用ABI的Gene Mapper v3.2软件进行STR基因分型分析, 用Modified-Powerstates软件进行法医学遗传学参数统计分析以及Hardy-Weinberg平衡检验。结果 共检出203个等位基因和666种基因型。除D1S1656、D5S818、D12S391外, 基因型分布均符合Hardy-Weinberg平衡规律 (P> 0.05) , 累积非父排除率 (CPE) 为0.999 999 907, 累积个人识别能力 (TDP) 为0.999 999 999 999 999 999 999 9。结论 19个常染色体基因座在云南彝族人群中具有较高的多态性和较好的个体识别能力, 能够为法医学个体识别和亲权鉴定提供科学的遗传学基础数据。     

三个STR分型体系在法医学中的应用

摘 要:【目的】 调查PowerplexTM 16 System?STRtyper-10F/G kit以及AGCU 21+1三个分型体系包含的45 个常染色体STR 基因座在中国广东汉族人群中的群体遗传学数据,评估其法医学应用价值?【方法】 采集256例中国广东汉族二代家系(包含512名无关个体)外周血样,提取样本DNA,对D3S1358等45个STR基因座进行扩增,使用ABI 3500XL遗传分析仪电泳扩增产物,GeneMapper ID-X软件进行基因分型,并用相关统计软件计算常用法医学参数并进行Hardy-Weinberg平衡及基因座间连锁不平衡的检验? 【结果】 经Bonferroni 法校正后,45个STR基因座的基因型分布均符合Hardy-Weinberg平衡,不存在连锁不平衡现象?各基因座平均杂合度(Ho)为0.765,平均个体识别力(DP)为0.905,平均多态信息含量(PIC)为0.733?45个STR基因座的累积随机匹配概率(CMP)为9.48 × 10-50,二联体累积非父排除率(CPEduo)为0.999 999 999 94,三联体累积非父排除率(CPEtri)为0.999 999 999 999 999 990 4?【结论】 获得了广东汉族人群45个常染色体STR 基因座的群体资料,为广东汉族人群的法医个体识别和亲子鉴定提供了基础数据?联合应用PowerplexTM 16 System?STRtyper-10F/G kit和AGCU 21+1 系统可以满足突变?单亲?亲缘鉴定等疑难案件的需要?     

南充地区汉族群体15个STR基因座遗传多态性研究

目的获取15个短串联重复序列（STR）基因座在四川南充地区汉族人群的群体遗传学数据。方法160份EDTA抗凝血样采自南充地区无血缘关系的汉族个体。Chelex法提取DNA，AmpFISTR IdentifilerTM kit荧光标记试剂盒进行复合扩增，自动基因分析仪电泳并收集电泳结果数据，基因扫描分析软件计算扩增产物片段相对大小，基因分型软件进行样本基因型分型。结果在南充地区汉族人群160名无血缘关系的个体中共检出140个等位基因，其频率分布介于0．004～0．528之间。15个STR基因座的杂合度介于0．151～0．905之间，累积个人识别率和累积非父排除率分别达到0．999998和0．999999。结论该15个STR基因座具有高度多态性，是较理想的遗传标记，所得到的等位基因频率等数据可为南充地区汉族人群的法医学个人识别、亲子鉴定及群体遗传学研究提供基础依据。     

辽宁锡伯族人群15个STR基因座的遗传多态性及与其他民族之间关系的研究

目的 探索辽宁锡伯族15个常染色体基因座(D3S1358,TH01,D21S11,D18S51,D5S818,D13S317,D7S820,D16S539,CSF1PO,vWA,D8S1179,TPOX,D2S1338,D19S433,FGA)的遗传多态性,分析14个群体间的遗传关系,建立辽宁锡伯族群体的遗传学基础数据,为群体遗传学和法医学应用提供依据.方法 采集辽宁锡伯族150名无关个体口腔黏膜细胞,Chelex 100法提取DNA,应用荧光标记法进行PCR扩增,扩增产物在Li-COR 4300基因分析仪上电泳,E-seq分析软件进行基因型分型,应用PowerStats V1.2软件计算各基因座的相关群体遗传学参数,计算14个群体间的遗传距离,用Neighbor-Joining法构建系统发生树.结果 15个STR基因座在辽宁锡伯族群体中具有遗传多态性,基因型分布符合Hardy-Weinberg平衡定律(P＞0.05).累积非父排除率(CPE)为0.999 991 636 8,累积个人识别能力(TDP)为0.999 999 999 999 999 146 51.辽宁锡伯族与国内及来自亚洲群体的亲缘关系较近,而与来自大洋洲的澳大利亚群体亲缘关系较远.结论 辽宁锡伯族群体15个常染色体STR基因座有较高的非父排除率和个体识别能力,可为法医学亲子鉴定、个体识别及群体遗传学研究提供依据.     

云南拉祜族群体15个STR基因座遗传多态性研究

目的采用PCR-STR及基因分型技术,探讨云南地区拉祜族群体D3S1358、TH01等15个常染色体基因座的遗传多态性,建立拉祜族群体的遗传学基础数据,为群体遗传学和法医学应用提供依据.方法采集101名云南临沧地区拉祜族无关个体的静脉血,经典有机溶剂法提取DNA,应用PCR技术,复合扩增D3S1358、TH01等15个常染色体基因座的短串连重复序列,扩增产物用遗传分析仪毛细管电泳荧光检测,调查云南地区拉祜族群体15个STR基因座等位基因频率,进行遗传多态性分析.结果15个STR基因座在云南拉祜族群体中具有遗传多态性,基因型分布符合Hardy-Weinberg平衡定律（P〉0.05）.其累积匹配概率（PM）为4.36×10^-16,累积非父排除率（CPE）为99.9994%,累积个人识别能力（TDP）为99.9999999999999%.结论云南拉祜族群体15个常染色体STR基因座有较高的非父排除率和个体识别能力,可为法医学亲子鉴定和个体识别及遗传学研究提供依据.     

云南布朗族群体15个STR基因座遗传多态性研究

目的采用PCR-STR及基因分型技术,探讨云南地区布朗族群体中D3S1358、TH01等15个常染色体基因座的遗传多态性,建立布朗族群体的遗传学基础数据,为法医学应用提供依据.方法采集97名云南地区布朗族无关个体的静脉血,经典有机溶剂法提取DNA,应用PCR技术,复合扩增D3S1358、TH01等15个常染色体基因座的短串连重复序列,产物用遗传分析仪电泳荧光检测,调查云南地区布朗族15个STR基因座的等位基因频率,进行遗传多态性分析.结果15个STR基因座在云南布朗族群体中具有遗传多态性,基因型分布符合Hardy-Weinberg平衡定律（P〉0.05）.其累积匹配概率（Pm）为7.25×10^-16,累积非父排除率（CPE）为99.9999966%,累积个人识别能力（CDP）为99.9999999999999%.结论云南布朗族群体15个常染色体STR基因座有较高的非父排除率和个体识别能力,可为法医学亲子鉴定和个体识别及遗传学研究提供依据.     

重庆土家族群体15个STR基因座的遗传多态性

目的:研究重庆土家族人群无关个体的15个STR基因座(CSF1PO、D13S317、D16S539、D18S51、D19S433、D21S11、D2S1338、D3S1358、D5S818、D7S820、D8S1179、FGA、TH01、TPOX、vWA)的遗传多态性.方法:应用AmpFlSTR Identifiler荧光标记复合扩增系统对115名重庆土家族无关个体血样DNA进行15个STR基因座的复合扩增,用ABI310遗传分析仪对扩增产物进行检测,用GeneScan、GenoTyper软件进行基因分型,统计计算15个STR基因座的群体遗传学参数.结果:15个STR基因座均符合Hardy-Weinberg平衡,杂合度在0.634 8～0.887 0之间,累积匹配概率和累积非父排除率分别为3.12×10-17和0.999 997 688 3.结论:15个STR基因座的累积匹配概率和累积非父排除率较高,适用于法医学亲子鉴定和个人识别.     

重庆地区汉族人群15个STR基因座遗传多态性研究

目的 对重庆地区汉族人群的15个短串连重复序列(STR)基因座进行遗传多态性调查.方法 采用荧光标记STR-PCR复合扩增、毛细管电泳基因分型技术对225名无血缘关系的重庆地区汉族人群进行15个STR 基因座的基因分型,计算基因频率,并得到杂合度(H)、个人识别力(DP)、匹配概率(Pm)、非父排除率(PE)、多态信息总量(PIC)、亲权指数(PI)等多态性统计学参数.结果 在重庆地区汉族人群225名无血缘关系的个体中共检出162个等位基因,其频率分布0.002 2～0.508 9.15个STR基因座的杂合度0.644 4～0.870 5;个人识别力0.778 2～0.967 9;累积DP＞0.999 999 999;匹配概率0.032 1～0.221 8;累积Pm=1.21×10-17;非父排除率0.347 6～0.735 7;累积PE=0.999 999 042;多态信息含量0.560 4～0.857 1;累积PIC=0.999 999 999;亲权指数1.406 3～3.862 1.结论 此STR15个基因座具有高度多态性,是较理想的遗传标记,所得到的等位基因频率等数据可为重庆地区汉族的法医学个人识别、亲子鉴定及群体遗传学研究提供依据.     

河南新乡地区汉族人群13个短串联重复序列基因座遗传多态性

目的调查河南新乡汉族群体D3S1358、D5S818、D7S820、D8S1179、D13S317、D16S539、D18S51、D21S11、CSF1PO、FGA、TH01、TPOX、vWA共13个基因座的遗传多态性分布。方法利用聚合酶链式反应和聚丙烯酰胺凝胶电泳技术及银染技术检测STR基因座各等位基因及其基因型。结果13个STR基因座的基因型频率分布符合Hardy-W einberg平衡。13个STR基因座的个体识别力、杂合度、多态性信息含量、非父排除率分别为0.799 1~0.970 8、0.616 0~0.886 2、0.586 8~0.881 1、0.475 3~0.890 5,累计个体识别力为0.999 999 999,累计非父排除率为0.999 999 8。结论13个STR基因座在群体遗传学研究和法医学个人识别中具有较高的应用价值,可应用于法庭科学中的个体识别和亲权鉴定。     

云南昆明汉族9个STR基因座的遗传多态性

目的调查昆明市汉族人群无关个体9个STR基因座的遗传多态性发布，研究其在法医学检验中的应用，方法应用美国ABI公司AmpFSTRR profiler plus、identifiler试剂盒荧光标记复合扩增系统，应用3100 Avant遗传分析仪对昆明市109名无关个体血样的D3S1358、vWA、FGA、D8S1179、D21S11、D18s51、D5S818、D13S317和D7S820等9个STR基因座进行遗传多态性调查。结果获得昆明市汉族人群9个STR等位基因座遗传学参数，其基因型频率发布均符合Hardy-Weinlerg平衡定律，累计个人识别力（TDP）：0.99999999999，累积非父排除能力（PE）为：0.0999999。结论昆明市汉族9个STR基因座遗传等位基因高度多态性与中国汉族群体调查数据无显著差异，适用于个体识别和亲权鉴定。     

云南白族民家支系18个常染色体STR位点的遗传多态性

  目的  调查云南白族民家支系2 323个健康无亲缘关系个体18个STR基因座的遗传多态性,计算群体遗传学参数,建立云南白族民家支系群体的遗传学基础数据,为司法鉴定工作中的亲子鉴定和个体识别提供可靠的科学依据。  方法  收集2323份云南白族民家支系人群无关个体样本,采用DNATyperTM19试剂盒,进行直接PCR复合扩增,用AB 3130XL自动遗传分析仪进行毛细管电泳分离,用GeneMapper ID-X 1.5软件对分离的STR进行分型。使用Modified-Powerstats软件统计等位基因频率,进行Hardy-Weinberg平衡（HWE）检验,计算匹配概率等法医学参数。使用Arlequin软件计算Fst和P值。使用Phylip软件计算Nei’s遗传距离。使用SPSS软件进行多维尺度（MDS）分析。应用Mega软件构建相邻连接（NJ）系统发育树。  结果  18个STR基因座中共观察到230个等位基因和1073种基因型。除D13S317基因座不符合Hardy-Weinberg平衡（P = 0.0008）外,其余基因座等位基因频率和基因型频率均符合Hardy-Weinberg平衡（P>0.05/18 = 0.0028）。18个STR基因座的累积个人识别能力（CDP）达0.999999999,累积非父排除概率（CPE）达0.99999994055。Fst值、Nei's遗传距离以及NJ系统发育树的结果均提示,白族民家支系与云南布朗族和云南佤族相距较远,而与大理白族和怒江白族相距较近。  结论  上述18个STR基因座在云南白族民家支系群体中具有高度多态性,可用于司法鉴定和群体遗传结构研究。     

马鞍山地区汉族人群15个STR基因座遗传多态性调查

目的:调查292名马鞍山地区汉族无关个体15个STR基因座的等位基因类型及其频率。方法:用硅珠法提取DNA,采用AmpFISTR Identifiler荧光标记复合扩增系统进行复合扩增;扩增产物用ABI3130xl型遗传分析仪检测,得到STR分型结果后统计15个基因座的基因频率。结果:15个STR基因座,累计个人识别率达0.999 999 999 999 999 985,累计非父排除率为0.999 998 96。结论:该系统在马鞍山地区汉族人群中具有高度多态性,适用于法医学亲权鉴定、个体识别以及DNA数据库的建立。     

云南白族15个常染色体STR 基因座的遗传多态性

［摘要］目的　采用PCR- STR及基因分型技术,探讨云南怒江白族群体中D3S1358、TPOX 等15个常染色体STR基因座的遗传多态性, 建立怒江白族群体的遗传学基础数据, 为法医学应用提供基础数据．方法　采集124 名云南怒江地区白族无关个体的静脉血, 经典有机法提取DNA, 应用PCR技术, 复合扩增D3S1358等15个常染色体基因座的短串连重复序列,扩增产物用遗传分析仪电泳荧光检测, 获得云南怒江白族15个STR基因座的等位基因频率,进行遗传多态性分析．结果　15个常染色体STR基因座在云南怒江白族群体中具有遗传多态性,基因型分布符合Hardy- Weinberg平衡定律（P > 0.05）. 其累积匹配概率（CPM ）为4.869 1×10-17, 累积非父排除率（ CPE）为99.99% ,累积个人识别能力（ CDP） 为99.99%．结论　云南怒江白族群体15个常染色体STR基因座有较高的非父排除率和个体识别能力, 可为法医学亲子鉴定和个体识别提供基础数据以及遗传学研究提供依据.     

杭州汉族人群17个 STR 基因座的遗传多态性调查及法医学应用

目的：调查17个 STR 基因座在杭州汉族人群中遗传多态性,为其法医学应用提供基础数据。方法采用 AGCU 17＋1 STR 荧光标记复合扩增试剂盒,对杭州汉族506份无关个体进行扩增,利用3130XL 遗传分析仪对扩增产物进行电泳分型,统计17个 STR 基因座的等位基因频率和法医学参数。结果17个 STR 基因座累积个人识别率0.999999999999999999996184739142和累积非父排除率分别为和0.9999999955351207。结论17个 STR基因座组成的复合扩增系统在杭州汉族人群中具有较高的遗传多态性和识别能力,可以应用于法医学个人识别和亲子鉴定。     

广西黑衣壮族人群3个STR基因座遗传多态性

目的:获得广西黑衣壮族人群3个STR基因座:CSF1PO,TPOX,TH01的群体遗传分布资料,以探讨广西黑衣壮族的起源.方法:应用AmpFeSTR IdentifilerTM扩增试剂盒和ABI 3100遗传分析仪,研究广西黑衣壮族152例无关个体3个STR位点的等位基因频率分布情况.以遗传距离和系统发生树来分析群体间遗传关系.结果:CSF1PO,TPOX,TH01基因座共检出19种等位基因,其频率分布在0.003 3～0.421 0之间;观察杂合度分别为0.743 0,0.737 0,0.671 0;多态信息总量分别为0.720 0,0.730 0,0.610 0,累积个体识别力达0.998 395,累积非父排除率达0.951 906.统计结果显示广西黑衣壮族与云南壮族遗传关系最近.结论:广西黑衣壮族3个STR基因座属于高度多态性遗传标记,广西黑衣壮族和云南壮族同源具有常染色体STR遗传学证据.     

广西黑衣壮族5个STR基因座的遗传多态性

目的:研究广西黑衣壮族5个STR基因座的遗传多态性分布.方法:应用AmpFISTR IdentifilerTM扩增试剂盒和ABI 3100遗传分析仪检测152例无关个体血样.结果:D3S1358、D16S539、D19S433、D21S11、FGA5个STR基因座共检测出54种等位基因,其基因频率分布在0.003 3～0.401 3.观察杂合度分别为0.770 0、0.711 0、0.809 0、0.822 0、0.908 0;多态信息总量分别为0.760 0、0.670 0、0.790 0、0.820 0、0.860 0,累积个体识别力达0.999 999 098,累积非父排除率达0.999 548.广西黑衣壮族与其他2个广西壮族支系之间相同基因座的等位基因频率分布差异均有统计学意义(P＜0.05).结论:广西黑衣壮族5个STR基因座属高度遗传多态性标记;广西壮族内部存在多种支系的说法可能具有STR基因座的遗传学基础.     

中国南方汉族人群20个常染色体STR基因座的多态性分析

目的 评估PowerPlex(R)21系统所含基因座的等位基因频率、法医学常用遗传学参数和系统效能.方法 对PowerPlex(R)21系统包含的20个常染色体STR基因座(D3S1358、D1S1656、D6S1043、D13S317、PentaE、D16S539、D18S51、D2S1338、CSF1PO、PentaD、TH01、vWA、D21S11、D7S820、D5S818、TPOX、D8S1179、D12S391、D19S433、FGA)进行基因分型.统计2367个南方汉族无关个体中上述20个基因座的等位基因频率和遗传学参数,并将本研究人群的等位基因频率与文献报道的其他人群数据进行比较.结果 该系统各基因座的个体识别率为0.7839～0.9852,非父排除率为0.2974～0.8099.除D5S818基因座外,其余基因座均符合哈-温平衡.该系统的累积非父排除率和累积个体识别率均超过0.999 999 999 999 999 999 999 999999 999.南方汉族人群与8个少数民族(广西彝族、广西回族、广西苗族、贵州侗族、贵州苗族、青海土家族、青海回族、云南彝族)相比,等位基因频率有显著性差异.中国南方汉族人群和日本、菲律宾、韩国、北意大利和阿根廷等人群相比,在8-20个STR基因座上存在显著性差异.南方汉族人群与上述5组国外人群以及及3组文献报道的国内人群(北京汉族、浙江汉族、福建汉族)在D1S1656基因座上的等位基因频率均有显著性差异.Neighbor-joining系统发生树显示所有亚洲人群聚类为一个分支,意大利北部和阿根廷人群聚集成另一个独立的分支,南方汉族人群和云南彝族人群遗传距离较近.结论 PowerPlex(R)21系统的20个STR基因座在中国南方汉族人群具有较高的遗传多态性,可满足亲子鉴定、个体识别以及人类学研究的需求.