蛋白质指纹图谱技术在肺癌分子标志物研究中的应用

目的 分析肺癌与肺部良性疾病及正常人血浆蛋白质指纹图谱的变化,建立肺癌血浆标志物诊断模型。方法 应用蛋白质指纹图谱(SELDI-TOF-Ms)技术检测108例肺癌患者、40例肺部良性疾病患者和22例正常人血浆标本,采用层次聚类分析和主成分分析建立决策树模型,应用该模型盲筛21例肺部良性疾病和47例Ⅰ期肺癌。结果 筛选到23个差异蛋白峰（P<0.001）。盲筛分析显示决策树模型诊断敏感性和特异性分别为72.34%和71.43%,阳性预测值和阴性预测值分别为85.0%和78.95%,诊断正确性为72.06%。结论 应用SELDI-TOF-Ms技术初步建立的蛋白质模型为肺癌的早期诊断提供了新的技术平台。     

血清蛋白质指纹图谱诊断模型在肾癌中的应用

目的 检测肾癌患者血清蛋白质,筛选特异的蛋白质标记物,构建用于肾癌早期诊断的血清蛋白质指纹图谱模型.方法 应用蛋白质芯片CM10及表面增强激光解吸/离子化飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)技术测定168例血清标本(其中肾癌53例,肾良性占位性病变47例,健康志愿者68例)的蛋白质质谱,用随机抽取的118例标本(肾癌38例,肾良性占位病变30例,健康志愿者50例)作为训练组,应用支持向量机进行训练和交叉验证,建立肾癌诊断模型;其余50例标本进行盲法验证.结果 利用质荷比分别为5350、4100、3446、5027和6115的5个蛋白峰建立区分肾癌和正常人的诊断模型,其敏感性为94.74%,特异性为92%.盲法验证显示敏感性为93.33%,特异性为88.89%.区分肾癌和肾良性占位病变的诊断模型,敏感性为92.11%,特异性为90%.区分透明细胞癌和其他病理类型的肾癌的诊断模型对透明细胞癌的判别率为92.84%,对其他病理类型的肾癌的判别率为81.82%.结论 表面增强激光解吸电离/飞行时间质谱技术结合支持向量机建立肾癌血清蛋白质指纹图谱模型对诊断肾癌具有较高的敏感性与特异性.     

脑脊液蛋白质指纹图谱技术在结核性脑膜炎诊断中的作用

[目的]研究脑脊液蛋白质指纹图谱技术在结核性脑膜炎（tubercular meningitis,TBM）诊断中的作用。[方法]应用表面增强激光解吸电离飞行时间质谱技术（surface-enhanced laser desorption/ionization time of flight mass spectrometry ,SELDI-TOF-MS）检测80例脑脊液标本,其中TBM30例、化脓性脑膜炎30例及同期排除中枢感染的上呼吸道感染病例20例,用Biomarker Wizard 软件分析找出差异蛋白峰,蛋白峰差异的比较使用Biomarker Patterns 5.0软件进行统计判别,建立决策树诊断模型,并通过盲法验证评价其准确性和有效性。[结果]蛋白质组谱图分析发现有9个差异显著的蛋白峰（P＆lt;0.01）,4个在TBM组中高表达,m/z分别为15920.00,32540.50,7967.66,8046.85;有4个在TBM组中低表达,其m/z为8762.66,9411.40,6840.92,6649.47。由m/z为8046.85,15920.00及32540.50建立的决策树模型对TBM的诊断准确率为90%。通过盲法验证模型对TBM的诊断准确率为85%。[结论]由3个差异蛋白峰构成的TBM蛋白质指纹图谱诊断模型为TBM的诊断提供了新的借鉴和参考。     

血清蛋白质指纹图谱预测模型在胰腺癌诊断中的应用研究

目的 血清蛋白质指纹图谱预测模型在胰腺癌诊断中的建立及应用.方法 应用表面增强激光解吸离子化飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)技术,分析胰腺癌患者和健康对照者的血清蛋白质指纹图谱,从中筛选出与胰腺癌相关的血清差异蛋白质,通过生物信息学方法建立胰腺癌诊断预测模型,并通过盲法检测验证该模型的可靠性.比较该诊断预测模型与胰腺癌传统血清肿瘤标志物CA19-9对于胰腺癌诊断的灵敏度和特异度,评价其临床应用价值.结果 采用金属亲和捕获芯片(IMAC3),在胰腺癌患者血清中发现了12个差异表达蛋白质,其中有6个蛋白质诊断胰腺癌的价值高于CA19-9;应用决策树原理,建立了由4个节点、5个终结点组成的胰腺癌血清蛋白质指纹图谱诊断预测模型;经盲法检测,该模型在区分胰腺癌与健康对照者时的灵敏度是90.7%(39/43),特异度是89.6%(43/48),均优于传统的肿瘤标志物CA19-9,诊断预测模型与CA19-9的系列试验可以将特异度提高至97.9%(47/48),而平行试验可以将灵敏度提高至95.3%(41/43).结论 血清蛋白质指纹图谱预测模型为胰腺癌的诊断提供了一条快速、简便、准确的新途径,并有助于筛选新的肿瘤标志物.     

应用血清蛋白质指纹谱鉴别结直肠癌与其他恶性肿瘤

目的 建立结直肠癌与其他恶性肿瘤的血清蛋白质指纹谱鉴别诊断模型.方法 收集血清标本235份,其中结直肠癌58例,乳腺癌、胃癌、食管癌、肝癌、肺癌及肾癌各15例,结直肠良性病30例及正常人57例组成建模组,应用表面增强激光解吸/电离飞行时间质谱检测其蛋白质指纹谱.用Biomarker Patterns软件分析结直肠癌与其他恶性肿瘤患者血清中的差异蛋白后,建立结直肠癌鉴别诊断最优分类树模型.再从同期住院或健康体检人群中随机抽取以上诸病种及正常人血清标本各10例组成测试组,盲法验证该模型对结直肠癌的鉴别诊断效能.结果 成功建立了由16种蛋白组成的结直肠癌鉴别诊断最优分类树模型.测试模式下对结直肠癌的鉴别诊断准确率83.8%.灵敏度和总特异性分别为86.2%和83.1%.盲法验证显示,预测总准确率为74.4%.结论 应用血清蛋白质指纹谱技术建立的结直肠癌与其他恶性肿瘤的鉴别诊断模型具有较高的敏感性与特异性,值得进一步研究.     

基于肺癌CT的决策树模型在肺癌诊断中的应用

目的:探讨基于肺癌CT的决策树模型在肺癌辅助诊断中的意义。方法:观察61例肺癌患者和50例肺部良性疾病患者的CT片,对边缘情况、毛刺征、小泡征等放射学特征进行量化,结合临床资料对肺癌相关的危险因素行单因素非条件logistic回归和多因素非条件logistic逐步回归分析,采用有意义的因素分别建立决策树、logistic回归2种肺癌诊断模型。采用筛检实验评价指标和ROC曲线比较2种模型对预测集样本的预测效果。结果:多因素非条件logistic逐步回归分析显示年龄、边缘情况、毛刺征、小泡征及纵隔肿大淋巴结对鉴别诊断肺癌意义较大;logistic回归模型对预测集的预测灵敏度、特异度、准确度、阳性预测值和阴性预测值分别为86.89%、84.00%、85.59%、86.89%、84.00%,决策树模型上述指标分别为95.08%、86.89%、90.99%、89.23%、93.48%;logistic回归模型和决策树模型ROC曲线下面积分别为0.854(0.775~0.914)和1.000(0.967~1.000),差异有统计学意义(Z=4.273,P<0.05)。结论:建立的决策树模型诊断肺癌的效果优于logistic回归模型。     

基于人工神经网络的血清蛋白质指纹图谱模型在肝癌诊断中的应用

目的 建立蛋白质芯片技术检测血清蛋白质指纹图谱的方法,探讨基于人工神经网络的血清蛋白质指纹图谱模型在肝癌诊断中的应用价值。方法 应用蛋白质指纹图谱分析仪(表面-增强激光解析-电离-飞行时间质谱仪,SELDI-TOF-MS),测定106例肝癌、肝硬化患者和健康人血清标本的蛋白质指纹图谱并结合人工神经网络方法进行数据的分析。将106例标本随机分成训练组70例(肝癌35例,肝硬化14例,健康人21例)和盲法测试组36例(肝癌17例,肝硬化8例,健康人11例)。利用从训练组得出的基于人工神经网络的血清蛋白质指纹图谱模型,对36例未知血清进行检测,并与甲胎蛋白(AFP)检测结果进行比较。结果 应用该方法对肝癌进行诊断的准确率、敏感性和特异性分别为91．7％(33／36)、88．2％(15／17)和94．6％(18／19),明显高于AFP检测结果。结论 基于人工神经网络的血清蛋白质指纹图谱模型在肝癌的诊断中较以往的传统方法具有更高的敏感性和特异性,值得进一步研究与应用。     

蛋白质指纹图谱模型在肝癌诊断中的应用

目的:建立基于人工神经网络的血清蛋白质指纹图谱模型,并探讨其在肝癌诊断中的应用.方法:应用表面增强激光解析-电离-飞行时间质谱仪(SELDI-TOF-MS),测定了52例肝癌和32例健康人血清标本的蛋白质指纹图谱,并结合人工神经网络方法进行数据分析.将84例标本随机分成训练组56例(肝癌35例,健康人21例)和盲法测试组28例(肝癌17例,健康人11例).利用从训练组得出的基于人工神经网络的血清蛋白质指纹图谱模型,对28例未知血清进行检测,并与甲胎蛋白(AFP)判断结果进行比较.结果:应用该方法对肝癌进行诊断的准确率、敏感性和特异性均为100%(17/17,11/11).AFP检测结果准确率为77.4%(65/84),灵敏度和特异性分别为69.2%(36/52)和90.6%(29/32).结论:该方法在肝癌的诊断中较AFP具有更高的敏感性和特异性.     

运用蛋白质指纹图谱技术建立系统性红斑狼疮诊断模式的研究

目的 运用蛋白质指纹图谱技术筛选系统性红斑狼疮(SLE)患者血清中的特异性蛋白标志物,建立SLE疾病相关的蛋白质组学诊断模型.方法 联用弱阳离子磁珠与蛋白质芯片阅读仪绘制64例SLE患者组及168例对照组的血清蛋白质指纹图谱,用Biomarker Patterns Software 5.0(BPS)软件筛选特异性的血清蛋白标志物并建立SLE诊断模型.结果 在SLE患者组和对照组之间找到60个差异蛋白峰(P<0.05),其中28个蛋白峰在SLE患者表达增高,32个蛋白峰表达降低.由BPS软件筛选的4个蛋白标志物(质荷比为3376.02、4070.09、7770.45、28045.10)建立的诊断模型能很好的把SLE患者与其他自身免疫性疾病和健康对照者区分出来,经过盲法验证,其对SLE的诊断敏感性为78%,特异性为96%.结论 采用蛋白质指纹图谱技术能筛查识别出与SLE疾病相关的特异性血清蛋白标志物,由4个质荷比分别为3376.02、4070.09、7770.45和28045.1的SLE特异性血清蛋白标志物建立的SLE疾病诊断模型具有高敏感性及特异性.     

新疆维吾尔族食管癌患者血清蛋白指纹图谱诊断模型的建立

目的:筛选并建立新疆维吾尔族食管癌血清蛋白指纹图谱诊断模型,为食管癌的诊断与临床筛查提供新的途径。方法:采用弱阳离子交换蛋白质芯片(CM10蛋白芯片)及表面增强激光解析离子化飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)技术对23例新疆维吾尔族食管癌和33例新疆维吾尔族正常对照者血清指纹图谱进行检测,所得结果用ZUCI-蛋白芯片数据分析系统(ZUCI-Protein Chip Data Analyze System)软件包进行分析,通过支持向量机运算建立区分新疆维吾尔族食管癌蛋白指纹图谱诊断模型,并用留一法交叉验证作用评估模型,判别效果。结果:通过软件包运算,用2个质荷比峰(3269.4621、6056.8714m/z)建立了新疆维吾尔族食管癌蛋白指纹图谱诊断模型,准确度为92.9%,灵敏度为91.3%,特异度为93.9%,阳性预测值为91.3%。结论:SELDI-TOF-MS技术结合支持向量机建立新疆维吾尔族食管癌血清蛋白质指纹图谱模型为早期筛查及诊断新疆维吾尔族食管癌提供了一种特异性强、灵敏度高的新方法,值得进一步的研究和应用。     

肺癌患者外周血肺组织特异性基因mRNA检测的诊断价值

目的: 探讨荧光定量RT-PCR法测定外周血肺组织特异性基因(lung-specific X protein gene,LUNX) mRNA表达对肺癌的诊断价值。方法: 荧光定量RT-PCR法检测67例肺癌患者(其中30例手术患者测定术前和术后外周血)、40例良性肺疾病患者、20名健康体检者外周血LUNX mRNA表达,67例肺癌患者同时用放免法测定外周血中CEA、CA125、Cyfra21-1。结果: 肺癌患者外周血LUNX mRNA表达阳性率(56.7%)均高于CEA、CA125、Cyfra21-1单项或三者联合检测(分别为16.4%、26.9%、11.9%和32.8%)(P<0.05~P<0.005)。荧光定量RT-PCR法测外周血LUNX mRNA表达诊断肺癌的敏感性为56.7%,特异性100%,阳性预测值为100%,阴性预测值为67.4%。结论: 荧光定量RT-PCR法测定外周血LUNX mRNA可能成为肺癌基因诊断一项较好的指标。     

血清NSE、CYFRA21-1检测对肺癌诊断的临床应用

目的　探讨血清NSE、CYFRA2 1 1检测对肺癌诊断的临床应用价值。方法　检测 173例肺癌、36例肺良性疾病患者和 5 2例正常对照血清NSE、CYFRA2 1 1的水平 ,NSE采用电化学发光免疫分析法 ,CYFRA2 1 1采用放射免疫分析法。结果　肺癌组病人血清NSE、CYFRA2 1 1水平均明显高于肺良性疾病组和正常对照组 (P <0 0 0 1) ,NSE水平升高以小细胞肺癌 (SCLC)最为显著 (86 72± 98 2 μg L) ,灵敏度为 82 4 % ,特异性为 95 5 % ;而CYFRA2 1 1水平升高则以非小细胞肺癌 (NSCLC)最为显著(18 6 7± 2 1 6 1μg L) ,灵敏度为 6 1 4 % ,特异性为 95 5 %。NSE、CYFRA2 1 1联合检测肺癌的灵敏度为 91 9% ,特异性为 95 2 % ,阳性预测值为 95 2 % ,阴性预测值为 85 1% ,实验有效率为 91 6 %。结论　血清NSE、CYFRA2 1 1检测对肺癌诊断均有重要意义 ,NSE、CYFRA2 1 1分别有助于辅助诊断SCLC、NSCLC ;两项联合检测可提高肺癌诊断的临床价值 ,优于单项检测。     

三种血清肿瘤标志物联合检测在肺癌诊断中的应用研究

目的探讨癌胚抗原（CEA）、神经元特异性烯醇化酶（NSE）和鳞状细胞癌抗原（SCC）辅助诊断肺癌的临床应用。方法用化学发光免疫分析法测定133例肺癌和169例良性疾病患者血清CEA、NSE和SCC水平。评价它们对肺癌的诊断价值。结果单项CEA、NSE和SCC检测的诊断灵敏度、诊断特异性、阳性预测值、阴性预测值、阳性似然比和阴性似然比分别为49.6%、89.3%、78.6%、69.3%、4.8和0.56,41.4%、91.1%、78.6%、66.4%、4.7和0.64,39.8%、92.3%、80.3%、66.1%、5.2和0.65。二项联合平行试验的诊断灵敏度约60%,特异性大于85%。三项联合平行试验的诊断灵敏度为71.4%,特异性为85%。结论 CEA、NSE和SCC联合平行试验可明显提高对肺癌的诊断灵敏度,有利于肺癌的早期诊断。     

SHOX2基因甲基化水平对肺癌和良性肺部疾病的鉴别诊断研究

Objective　To evaluate the value of SHOX2 gene methylation level for differential diagnosis in patients with lung cancer and benign lung diseases.Methods　Patients with lung cancer and benign lung diseases hospitalized in the Department of Thoracic Surgery and Department of Eespiration of the Central Hospital of Wuhan from March 2014 to June 2016 were enrolled.Among them,173 patients with lung cancer were defined as lung cancer group,and 194 patients with benign lung diseases as benign lung disease group.Routine serological examination and tumor markers were detected in all patients.The SHOX2 gene methylation was detected by Sanger sequencing,and the SHOX2 gene methylation level was calculated by △△CT method.The value of each index in differential diagnosis of lung cancer was analyzed by receiver operating characteristic（ROC） curve.The relationship between each index and lung cancer pathological type and TNM staging was analyzed.Results　The white blood cell count（WBC） and △△CT value of lung cancer group were lower than those of benign lung disease group,while the serum gastrin releasing peptide precursor（ProGRP）,squamous cell carcinoma antigen（SCC-Ag）,cytokeratin 21 fragment antigen（Cyfra21-1） and carcinoembryonic antigen（CEA） were higher than those in benign lung disease group（P<0.05）. The result of multivariate Logistic regression analysis showed that serum ProGRP,serum Cyfra21-1,and △△CT values were factors influencing lung cancer（P<0.05）. The area under ROC curve（AUC） of △△CT value for the diagnosis of lung cancer was 0.843.The sensitivity was 58.2%,and the specificity was 93.1% when the optimal threshold was 2.69.The AUC of serum ProGRP was 0.711,with optimal threshold of 32 ng/L,sensitivity of 63.5% and specificity of 77.4%.The AUC of serum Cyfra21-1 was 0.677,the best cut-off value 2.92 μg/L,sensitivity 56.1%,and specificity 72.3%.The AUC of serum ProGRP for the diagnosis of lung cancer was greater than that of serum Cyfra21-1（Z=3.569,P=0.038）. The AUC of the △△CT value combined with serum ProGRP was 0.860.The AUC of △△CT value combined with serum ProGRP in the diagnosis of lung cancer were greater than that of △△CT value,serum ProGRP,and serum Cyfra21-1（Z=4.046,Z=5.607,Z=8.215,P<0.05）. The △△CT value of patients with squamous cell carcinoma,small cell carcinoma was lower than that of patients with adenocarcinoma,large cell carcinoma and other unknown pathological types（P<0.05）. The △△CT value of patients in stage Ⅲ lung cancer was lower than that of those in stage Ⅰ and stage Ⅱ（P<0.05）,and the △△CT value of patients in stage Ⅳ lung cancer was lower than that of those in stage Ⅰ,stage Ⅱ and stage Ⅲ（P<0.05）. Conclusion　SHOX2 gene methylation has its value in the differentiation of lung cancer and benign lung disease.It is correlated with lung cancer pathological type and TNM staging,which can be used as an auxiliary index for diagnosis of lung cancer.     

血清CA125及NSE测定对肺癌的诊断价值

目的 :观察血清CA12 5、NSE测定对肺癌的诊断价值。方法 :采用放射免疫分析法对 5 1例肺癌患者和 32例肺良性疾病患者和 6 8例健康人进行血清CA12 5、NSE水平测定。结果 :发现肺癌患者血清CA12 5、NSE水平明显高于肺良性疾病组和正常对照组 (P <0 .0 0 1) ;其增高的程度与肺癌TNM分期具有一定的相关性。血清CA12 5及NSE测定诊断肺癌的敏感性为 6 2 .72 %及 4 9.0 2 % ;特异性为 99%及 98%。结论 :联合检测血清CA12 5及NSE对肺癌的诊断、分期及疗效判断具有重要的临床价值。     

胸水脱落细胞增殖细胞核抗原检测在肺癌诊断中的应用价值

目的探讨胸水脱落细胞增殖细胞核抗原（PCNA）检测在肺癌诊断中的应用价值。方法收集48例肺癌、40例良性胸水疾病患者,采用S—P法检测胸水脱落细胞PCNA蛋白的表达,并与细胞学检查结果比较。结果PCNA蛋白检测诊断肺癌的特异性为71．20％,低于胸水脱落细胞学检测的91．34％（P〈0．05）,敏感性为100％,高于胸水脱落细胞学检测的82．20％（P〈0．05）。肺癌及良性胸水脱落细胞PCNA表达阳性率分别为78．26％和32．34％。肺癌及良性胸水患者间脱落细胞PCNA表达差异有统计学意义（P〈0．05）。胸水脱落细胞PCNA表达强度随肺癌分级增加而升高（P〈0．05）,与肺癌组织类型及分化程度无关。结论胸水脱落细胞PCNA蛋白检测在肺癌早期诊断、常规筛查以及术后复发监测中具有潜在的应用价值。     

血液中血管内皮生长因子和锰超氧化物歧化酶检测对肺癌的意义

目的 :探讨血液中血管内皮生长因子 (VEGF)及锰超氧化物歧化酶 (Mn -SOD)水平与原发性肺癌的关系。方法 :检测了 5 8例原发性肺癌、38例肺良性疾病、2 5例健康人血液中VEGF含量和Mn -SOD活力。同时测定了 10例原发性肺癌治疗后血液中VEGF和Mn -SOD水平的变化并与治疗前作了对比观察。结果 :与健康人和肺良性疾病相比 ,原发性肺癌患者血液中VEGF含量、Mn -SOD活力均明显升高 (P <0 .0 1) ,VEGF、Mn -SOD的阳性检出率和诊断正确率分别是 86 .2 %、90 .1%和 79.3%、84 .3%。二者对各型肺癌均有较高的检出率 ,VEGF及Mn -SOD水平与肺癌病期进展有关。 10例肺癌患者VEGF及Mn -SOD水平治疗后显著下降 (P <0 .0 1)。结论 :肺癌外周血液中VEGF含量及Mn -SOD活力异常升高 ,可作为肺癌的诊断、鉴别诊断、临床分期及疗效监测的参考指标。     

异机融合99Tcm-MIBI SPECT/CT对肺癌诊断的临床价值

目的:探讨99Tcm-MIBIS PECT/CT异机融合断层显像对肺癌的临床诊断价值。方法:选择65例肺部占位性病变患者行99Tcm-MIBI SPECT/CT异机融合断层显像,分析显像结果,计算SPECT/CT断层融合显像的摄取比值(UR);依据病理诊断将患者分成肺癌组和良性病变组,以良性病变组UR的x 1s为诊断阈值,评价其对肺癌的诊断效能。结果:45例肺癌患者SPECT断层融合显像的UR为2.56±0.53;20例肺部良性病灶患者UR为1.47±0.42,差异有统计学意义(P<0.05);99Tcm-MIBI SPECT/CT异机融合断层显像对肺癌诊断的灵敏度、特异度和准确度分别为86.67%、85.00%、86.15%;假阳性率和假阴性率分别为15.00%和13.33%;阳性预测值和阴性预测值分别为92.86%和73.91%。结论:99Tcm-MIBI SPECT/CT异机融合断层显像对肺癌诊断有较高的临床价值,为制定治疗方案提供重要依据。