COVID-19患者5种标本的SARS-CoV-2核酸与血浆IgM抗体检测结果分析

目的 分析不同标本类型与检测次数对新型冠状病毒(SARS-CoV-2)核酸检测结果的影响,评价SARS-CoV-2核酸与IgM抗体检测技术在新型冠状病毒肺炎(COVID-19)患者诊断中的应用.方法 连续3次(每天1次)采集患者的痰、咽拭子、血液、唾液和晨尿标本,实时荧光定量逆转录聚合酶链反应(qRT-PCR)检测SARS-CoV-2核酸,同时检测患者血浆SARS-CoV-2 IgM抗体.对检测结果进行以下分析:1次与连续3次(每天1次)检测5种标本的SARS-CoV-2核酸阳性率;1次与连续3次(每天1次)检测SARS-CoV-2 IgM抗体的阳性率;连续3次检测5种标本的SARS-CoV-2核酸阳性率与SARS-CoV-2 IgM抗体检测的阳性率比较,以及两者联合应用对COVID-19患者的检出情况.结果 1次检测5种标本SARS-CoV-2核酸,各标本的阳性率:痰46.66％,咽拭子40.00％,血浆13.33％,唾液33.33％,晨尿0;同种标本连续检测3次SARS-CoV-2核酸,各标本的阳性率:痰80.00％,咽拭子66.66％,血浆13.33％,唾液60.00％,晨尿0.1次与连续3次检测患者血浆SARS-CoV-2 IgM抗体的阳性率均为93.33％.血浆SARS-CoV-2 IgM抗体的阳性率明显高于SARS-CoV-2核酸技术,两种方法联合对COVID-19的检出率为100.00％.结论 SARS-CoV-2核酸检测阳性检出率与采集标本种类相关,多次多部位采集标本可明显提高SARS-CoV-2核酸阳性检出率.SARS-CoV-2 IgM抗体阳性检出率明显高于SARS-CoV-2核酸技术,两种方法联合可明显提高COVID-19的实验室检出率.     

4例COVID-19患者不同类型标本的SARS-CoV-2核酸及抗体检测结果分析

目的选择合适的标本类型进行SARS-CoV-2检测,为新型冠状病毒肺炎(COVID-19)的早期诊断提供依据。方法采集咽拭子核酸检测阳性的4名COVID-19患者的鼻拭子、粪便、尿液、血液(分离血清)标本,用实时荧光RT-PCR进行SARS-CoV-2核酸检测,用化学发光法检测患者血清IgM和IgG。结果 4名患者咽拭子和3例粪便标本的SARS-CoV-2核酸检测阳性、2例鼻拭子核酸检测阳性;1例患者感染SARS-CoV-2一周内血清IgM及IgG出现,其余3例患者同期血清抗体检测阴性。结论 SARS-CoV2可以通过多种途径进行传播,选择多种类型标本联合检测可提高病毒的检出率;同时血清学抗体检测可以作为核酸检测的补充。     

郑州市23例SARS-CoV-2核酸单靶标阳性标本的跟踪检测分析

目的对郑州市23例严重急性呼吸综合征冠状病毒2(SARS-CoV-2)核酸单靶标阳性标本进行跟踪检测分析,为实验室检测提供参考。方法按照《新型冠状病毒肺炎防控方案》采集新型冠状病毒肺炎(COVID-19)疑似患者的鼻拭子或咽拭子,提取SARS-CoV-2核酸并采用实时荧光逆转录聚合酶链反应(RTPCR)检测。对6例开放读码框1ab(ORF1ab)基因单靶标阳性和17例核壳蛋白(N)基因单靶标阳性患者进行重新采样检测。结果首检23例SARS-CoV-2核酸单靶标阳性的标本中有8例疑似病例在随后的重新采样检测中被确认为SARS-CoV-2核酸阳性,重新采样检测阳性率为34.78%。结论 COVID-19同种类型标本2次采样检测中均出现单靶标阳性的检测结果时,应该慎重对待,建议重新采样跟踪检测。     

2例新型冠状病毒肺炎粪便SARS-CoV-2核酸阳性临床启示

目前中国新型冠状病毒肺炎(COVID-19)疫情仍十分严峻,及时、早期地识别COVID-19患者是控制疫情的关键步骤。而新型冠状病毒(SARS-CoV-2)核酸检测作为诊断COVID-19的金标准,不但对检测技术提出更高的要求,同时对不同病程患者如何选择标本类型也是一个挑战。本文报道2例COVID-19确诊病例的诊疗经过,并分析采用不同类型标本检测SARS-CoV-2核酸的检出情况,为临床诊断COVID-19时如何选择标本类型和如何提高核酸检出率提供参考。     

道孚县新型冠状病毒肺炎患者口咽和粪便标本核酸检测结果分析

目的分析新型冠状病毒肺炎确诊患者住院和出院后集中隔离期间新型冠状病毒核酸检测结果。方法收集2020年2月四川省道孚县67例新型冠状病毒肺炎确诊病例核酸检测结果,统计分析一般资料、粪便标本核酸检测情况等。结果轻型、普通型病例组间性别差异无统计学意义(P=0.652),年龄分布有统计学意义(P=0.001);入院后口咽拭子核酸转阴平均天数为(7.4±6.2) d,轻型、普通型两组间差异无统计学意义(P=0.881)。16例患者出院后2周内粪便标本核酸检测呈阳性,阳性率为23.9%(16/67)。结论新型冠状病毒肺炎患者出院后2周内有部分患者粪便中能检出新型冠状病毒核酸,疾病防控部门应重视出院患者排泄物的消杀。     

核酸和血清学指标结合,多类型标本联检,提高新型冠状病毒检出率

新型冠状病毒肺炎(COVID-19)是由新型冠状病毒(SARS-CoV-2)引起的传染性极强,主要经飞沫和接触传播,不排除通过气溶胶和消化道传播的急性传染病。COVID-19有发热、咳嗽、呼吸急促等症状。反转录聚合酶链反应(RT-PCR)检测SARS-CoV-2核酸是目前确诊COVID-19的重要方法,对判断病情严重程度、是否能出院和解除隔离有重要意义。不同类型标本和不同品牌试剂的核酸检测结果不完全一致。血清学检测SARS-CoV-2阳性率比较高,将核酸检测和血清学检测结合,可提高检出率。     

新型冠状病毒核酸检测分析

2020年,由新型冠状病毒(SARS-CoV-2)感染引起的新型冠状病毒肺炎(COVID-19)在国内和其他国家暴发流行。实时荧光定量PCR(RT-PCR)法以其高灵敏度与强特异性,被认为是COVID-19的确诊方法。然而,SARS-CoV-2核酸检测对于阳性患者的阳性率仅有30%~50%,临床较多的疑似病例需多次核酸检测之后才得到阳性结果,使SARS-CoV-2核酸检测阳性作为确诊标准备受质疑。本文结合相关文献及在SARS-CoV-2核酸检测中的工作经验,从病原学、标本采集、核酸提取过程、试剂盒等各个方面对SARS-CoV-2核酸检测方法的影响因素进行深入探讨,对SARS-CoV-2检测出现假阴性或假阳性的原因进行分析与归纳总结,为检测的准确性提供依据,也旨在为基层医院的核酸检测工作提供一定的帮助。     

普通型新型冠状病毒肺炎患者咽拭子病毒核酸检测结果复阳情况分析

目的:探讨普通型新型冠状病毒肺炎(COVID-19)患者住院期间咽拭子新型冠状病毒(SARS-CoV-2)核酸检测转阴后复阳的发生率及可能因素。方法:多次采集2020年2月2日至2020年3月10日武汉大学人民医院东院收治的40例确诊的普通型COVID-19患者咽拭子,采用实时反转录聚合酶链反应(RT-PCR)法进行SARS-CoV-2核酸检测。结果:所有患者在首次RT-PCR检测结果呈阴性后,第2次RT-PCR检测结果为阳性12例(30%),连续2次RT-PCR检测为阴性第3次检测为阳性的患者为13例(32.5%),连续3次RT-PCR检测阴性第4次检测为阳性的患者为3例(7.5%),连续4次RT-PCR检测为阴性第5次检测为阳性的患者为0例。结论:作为COVID-19患者确诊及出院的重要指标,咽拭子核酸检测存在一定的假阴性率。     

北京某综合三甲医院对COVID-19疑似和非疑似患者进行SARS-CoV-2核酸筛查结果分析

目的 以北京综合三甲医院为例,对新型冠状病毒肺炎(COVID-19)疑似患者和非疑似患者的新型冠状病毒(SARS-CoV-2)核酸筛查结果进行分析,为COVID-19的实验室诊断提供实验依据.方法 SARS-CoV-2核酸检测的咽拭子标本来自2595例患者,COVID-19疑似患者81例,非疑似患者2514例.咽拭子标...     

新型冠状病毒肺炎患者出院标准探讨并文献复习

目的基于新型冠状病毒肺炎(COVID-19)的临床表现、实验室检查特点、影像学特点,探讨COVID-19的出院标准。方法对5例COVID-19确诊患者进行影像学、血清学、流式细胞学、实时荧光逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)检查。结果5例患者经RT-PCR确诊为新型冠状病毒(SARS-CoV-2)感染,实验室检查及影像学检查符合COVID-19特点。经治疗患者体温<37℃,呼吸道症状消失,胸部CT显示病灶明显吸收好转,白细胞、淋巴细胞计数正常,炎性指标[C反应蛋白(CRP)、降钙素原(PCT)、白细胞介素-6(IL-6)]正常,CD4+T淋巴细胞>500/μL,SARS-CoV-2 IgG抗体阳性且滴度为急性期4倍以上,连续2次(间隔1 d)鼻咽拭子SARS-CoV-2核酸检查阴性,连续2次粪便SARS-CoV-2核酸检查阴性,肛拭子SARS-CoV-2核酸检查阴性1次后准予出院,随访2周未见复发且SARS-CoV-2核酸检查阴性。结论基于《新型冠状病毒肺炎诊疗方案(试行第五版)》及炎性指标、CD4+T淋巴细胞计数、IgG抗体滴度作为该地区COVID-19确诊患者解除隔离和出院标准可行。     

四川省甘孜藏族自治州新型冠状病毒肺炎病例流行病学特征分析

目的探讨2020年四川省甘孜藏族自治州（甘孜州）暴发的新型冠状病毒肺炎（COVID-19）疫情的病例特征及流行趋势,旨在为遏制本地疫情扩散及外地疫情输入提供科学依据。方法参照《新型冠状病毒防控方案》、《新型冠状病毒感染的肺炎可疑暴露者和密切接触者管理方案（第二版）》进行流行病学调查与呼吸道样本采集,通过实时反转录–聚合酶链式反应（RT-PCR）方法对其呼吸道样本进行新型冠状病毒（2019-nCoV）核酸检测,并采用描述性流行病学方法对病例特征、疫情趋势及聚集性影响因素进行分析。结果对54例COVID-19病例的682名密切接触者进行筛查,发现确诊病例39例,无症状感染者3例。 截至2020年2月28日,甘孜州累计报告COVID-19病例96例,其中确诊病例78例,无症状感染者18例。 5例有湖北省武汉市旅居史的输入性确诊病例构成本次疫情流行曲线的早期波峰,本地73例确诊病例及18例无症状感染者通过共同聚集性活动使COVID-19疫情进一步扩散。结论甘孜州累计报告COVID-19病例96例,家庭及宗教（寺庙法会及丧葬礼念经）聚集性活动为本次疫情发生的高危传播因素,无症状感染者以中青年人居多,早期对密切接触者进行严格隔离医学观察、对无症状感染者进行及时检测、对高龄确诊病例进行及时救治,可有效降低传染率和死亡率。     

新型冠状病毒肺炎核酸检测中的假阴性分析及对策

新型冠状病毒肺炎(COVID-19)的疫情引发了全世界的关注。早期诊断对COVID-19的治疗、患者预后尤为关键。临床检验中发现早期的COVID-19患者核酸检测多次呈假阴性,特别是不同时间多次阴性结果后转为阳性,给临床诊断和疾病控制带来极大困扰。该文立足于疫情的早日防控,从临床、检验的不同视角,从标本采集、检测方法、产品稳定性等多方面剖析产生假阴性的可能原因,并且结合临床实践和检测技术,从整合特异性实验室指标,规范标本采集方式和过程,严格检测试剂的监管和审批等方面提出行之有效的方案,旨在为切实降低检测假阴性或假阳性率提供临床参考,为COVID-19临床准确诊断及疫情防控提供有力支撑。     

2019-2021年北京市通州区重点场所后厨工作人员诺如病毒隐性感染状况研究

目的 调查2019—2021年北京市通州区学校及托幼机构、餐饮服务单位等重点场所后厨工作人员诺如病毒隐性感染状况,为科学开展诺如疫情防控提供依据。方法 采用简单随机抽样的方法,抽取通州区餐饮服务单位、学校、托幼机构、建筑工地、宾馆住宿场所等的后厨工作人员（冷荤后厨工作人员优先）为研究对象,采集其肛拭子或粪便样本,使用实时荧光RT-PCR试剂盒对样本进行诺如病毒核酸检测,并采用描述性方法分析其隐性感染状况。结果 共采集552家单位,3 880份样本,检出阳性15份,其中GⅠ组1份,GⅡ组14份,隐性感染率为0.39%(15/3 880),其中男性隐性感染率为0.30%(5/1 656);女性隐性感染率为0.45%(10/2 224)。18岁以下及60岁以上年龄组均无隐性感染者;19～岁年龄组2 055人,阳性率为0.34%(7/2 055),46～岁年龄组1 637人,阳性率为0.49%(8/1 637)。新型冠状病毒肺炎（新冠肺炎）疫情发生前2019年采集肛拭子样本100份,隐性感染率为1.00%(1/100);新冠肺炎疫情发生后,2020年采集肛拭子样本2 805份,隐性感染率为0....     

新型冠状病毒肺炎疫情期间I期临床试验病房及受试者管理

目的 探讨在常态化疫情防控下,I期临床试验病房安全开展工作的重点和难点。方法 结合医院疫情防控的常态化管理,制定符合药物I期临床试验特征的病房和受试者管理流程,确保受试者和工作人员安全,保证临床试验顺利进行。具体措施为：深入学习新型冠状病毒肺炎防控相关知识;网格化管理病房;成立3人防疫工作小组;实时调整招募受试者的来源地;“二步骤”落实流行病学筛查;落实入院前新型冠状病毒抗体和核酸检测;加强受试者住院期间防控。结果 我院I期临床试验病房在2020年3—12月安全开展临床试验项目14项,总筛选1 638名,入组585名。试验全部完成且未发生新型冠状病毒感染。结论 在新型冠状肺炎疫情期间,我院I期临床试验通过采取完善防控管理体系、严格执行筛选入住流程和加强受试者管理等措施,保障了受试者和医护人员安全以及I期临床试验的顺利进行。     

北京市通州区新型冠状病毒肺炎流行初期肺炎病例呼吸道病原流行特征分析

  目的   研究北京市通州区新型冠状病毒肺炎（COVID-19）流行初期肺炎病例中主要呼吸道病原的流行情况。  方法   252例肺炎病例被纳入本研究,采集病例的呼吸道样本（对144例病例同时收集咽拭子和痰液样本）进行32种呼吸道病原的实时荧光PCR方法检测。  结果   病毒、细菌和肺囊虫的阳性率分别为13.10%（33/252）、50.00%（126/252）和1.59%（4/252）。 43例病例呼吸道样本中检出多种病原,混合感染率为17.06%（43/252）,其中13例病例为病毒与细菌或病毒与肺囊虫的混合感染,30例病例为细菌与细菌或细菌与肺囊虫的混合感染。 患基础疾病和无基础疾病病例中流感嗜血杆菌（χ2=9.557,P=0.002）、肺炎支原体（χ2=7.831,P=0.005）的阳性率差异均有统计学意义。 5个年龄组病例中病毒（χ2=16.112,P=0.003）、肺炎支原体（χ2=10.741,P=0.030）的阳性率差异均有统计学意义。 144例肺炎病例的痰液和咽拭子样本病毒阳性率差异无统计学意义（χ2=1.003,P=0.316）,而痰液样本中肺炎链球菌的检出率高于咽拭子样本（χ2=5.533,P=0.019）。  结论   COVID-19流行初期（2020年1—3月）,肺炎病例呼吸道中存在一定比例的混合感染,其下呼吸道样本（痰液）的细菌阳性率高于咽拭子样本。     

我国早期新型冠状病毒肺炎疫情传染病动力学模型分析

  目的   利用传染病动力学模型模拟我国早期新型冠状病毒肺炎的传播过程,分析和评估相关防控措施对疫情的影响。  方法  以2019年12月2日至2020年4月8日中国疾病预防控制中心传染病报告系统上报新型冠状病毒肺炎疫情数据为依据,建立动力学模型对疫情发展进行模拟分析。  结果  我国实施的交通管制措施,使R₀从疫情发展初期的4.82［95%可信区间（CrI）:4.81～4.83］降低到1.13（95% CrI:1.11～1.16）,新型冠状病毒感染者集中隔离和大规模核酸筛查等措施使R₀进一步降低到0.31（95% CrI:0.30～0.32）,模型估计得到无症状感染者的检出率为54.7%（95% CrI:45.7%～65.3%）。 保持防控措施实施的时间点不变,将无症状感染者检出率提高至75%、95%,分别能够避免新增3.4%、5.6%的感染者。 保持无症状感染者检出率不变,将防控措施实施的时间点整体前移1周、2周,分别能够避免新增78.2%、95.3%的感染者。  结论  交通管控措施显著降低了新型冠状病毒的传播速度。对感染者的集中隔离和大规模核酸筛查消除了病毒在人群中的传播。 我国实施的大规模核酸检测能够发现一半以上隐匿的无症状感染者。 相对于提高无症状感染者的检出率,防控措施的尽早实施能够避免更多的新增感染。     

COVID-19疫情期神经外科59例肺炎特点与防控经验

目的回顾分析COVID-19疫情爆发2月内，神经外科收治的112例患者中合并有59例肺炎的情况，总结COVID-19防控措施。方法回顾性分析2020年1月25日~3月30日神经外科急诊收治的住院患者共112人，年龄3~83岁（49.5±18.9岁）。在急诊核酸检测资源匮乏情况下，分析我科所有肺炎患者的类型及胸部CT表现，比较不同肺炎的CT影响学特征，并与COVID-19相鉴别。总结我科COVID-19高度疑似患者的处理办法，及在病人准入流程、医务人员管理、病房管理等疫情防控上的经验措施。结果入院时有86例患者在急诊完善了胸部CT检查，明确合并肺炎患者59例（68.6%）。其中最多的为吸入性肺炎者54例（62.8%）；CT影像显示磨玻璃影的患者有8例（11.76%）；疑似患者被收入神经外科病房仅2例，后转感染科诊治并确诊为普通肺炎；所有入院患者的首次咽拭子核酸检测均为阴性，对部分可疑患者入院后复查仍为阴性。在我科的严格防控下，无新冠肺炎确诊病例。结论神经外科病患肺炎发生率高，专科医师应加强肺炎的认识及读片能力，更好地鉴别肺炎早期胸部CT改变。实行严格的防护措施，尤其是憋气操作以及良好的通风条件，对神经外科这类非传染病专科在今后防范新的不明原因或者变异传染性肺炎的具有借鉴价值。      

西安地区新型冠状病毒肺炎患者康复期2019-nCoV 核酸检测复阳结果分析

目的 研究西安地区新型冠状病毒肺炎（corona virus disease 2019,COVID-19）患者康复期新型冠状病毒（2019-nCoV）核酸检测复阳情况。方法 对2021 年12 月~2022 年2 月在西安秦皇医院的873 例COVID-19 患者康复期采集口咽和鼻咽拭子,应用实时荧光定量PCR 进行2019-nCoV 核酸检测,核酸复阳结果按性别、年龄、标本类型、靶标基因和Ct 值与转阴时间分别进行分组比较。结果 核酸检测复阳患者共201 例,阳性率为23.02%。不同性别（21.58%vs 24.81%）和年龄组（24.70 % vs 25.90%）核酸复阳率之间差异无统计学意义（χ2=1.272,3.223,均P>0.05）。双拭子（鼻咽+ 口咽）联合检测复阳率明显高于单鼻咽或单口咽拭子（23.02% vs 19.01%,5.84%）,且鼻咽拭子核酸复阳率明显高于口咽拭子,差异均有统计学意义（χ2=8.699,121.5,69.59 ,均P<0.05）。双靶标基因阳性标本数明显高于单靶标N 或ORF1ab 基因(55.30% vs 28.57%,16.13%),且单靶标N 基因阳性标本数明显高于ORF1ab 基因,差异均有统计学意义（χ2=31.83,72.51,9.679,均P<0.05）。不同区间Ct 值组间核酸转阴时间差异有统计学意义（F=16.66,P<0.001）,且转阴时间与复阳时的Ct 值呈显著负相关性（r= -0.539,P<0.05）。结论 COVID-19 患者康复期核酸复阳率仍较高,机制和原因尚不明确,仍需加强隔离管理和健康监测。