结肠癌组织中CASP9的表达及其多态性

目的:探讨CASP9基因在结肠癌中的表达及其SNP多态位点在结肠癌患者和正常人中的分布情况.方法:应用RT-PCR方法检测170例结肠癌患者及对应癌旁正常组织中CASP9的表达情况;应用限制性片段长度多态性技术结合测序,分析结肠癌患者及100例正常人CPSP9基因2个SNP位点基因型;应用列联表法统计分析患者组和对照组各SNP位点基因型及等位基因频率.结果:47％(80/170)的结肠癌组织CASP9基因表达明显下调,与癌旁正常组织相比差异有统计学意义(P<0.05).位于CASP9基因第5外显子的SNP位点rs1052576的基因型频率和等位基因频率在两组人群中的分布差异有统计学意义;患者组G等位基因频率明显高于对照组(x2=9.99,P=0.001);基因型频率的分布与结肠癌的组织分化程度有关(x2=15.8,P=0.003).结论:CASP9基因在结肠癌中低表达,rs1052576多态位点G等位基因和结肠癌的发生相关.     

尾加压素Ⅱ基因多态性与多囊卵巢综合征相关性的研究

目的 探讨尾加压素Ⅱ(UTS2)基因多态性与多囊卵巢综合征(PCOS)发病的关系.方法 用熔解温度不同的基因分型法.检测PCOS患者101例(PCOS组)及其父母202名和105名健康妇女(对照组)UTS2基因rs228648、rs2890565位点单核苷酸多态性(SNP),并检测基础状态下FSH、LH、睾酮、空腹血糖、空腹胰岛素水平.结果 PCOS组的UTS2基因rs228648 A/G多态性位点与对照组比较,基因型与等位基因频率均无明显差异,两组的SNP rs2890565基因型频率差异有统计学意义(P<0.05),PCOS组A等位基因频率明显高于对照组(P<0.05).传递不平衡检验(TDT)显示,SNP rs228648A/G在杂合子父母的2个不同等位基因无优势传递(P>0.05),而rs2890565 A/G在杂合子父母A等位基因优势传递(P<0.05).PCOS组UTS2基因SNP rs228648 GG基因型较携带A等位基因的PCOS患者稳态模型评估的胰岛素抵抗指数(HOMA-IR)明显增高(P<0.05).SNP rs2890565从和AG基因型空腹血糖、空腹胰岛素较GG基因型明显增高,从基因型HOMA-IR较GG基因型明显增高(P<0.05).结论 UTS2基因SNP rs228648 A/G多态性与PCOS无相关性,但与胰岛素抵抗存在关联.UTS2基因SNP rs2890565可能在PCOS的遗传易感性中起一定作用,A等位基因可能与PCOS的发生有关.     

GLI1基因内2个SNP位点与单纯性先天性心脏病的关联研究

目的在前期工作定位的单纯性先天性心脏病(CHD)易感区域12q13内,选取GLI1基因编码区内2个已知单核苷酸多态(SNP):rs11553626和rs2228226,检测其在单纯性CHD患者和正常人群中的分布情况,分析其与单纯性CHD的相关性。方法对2000年1月至2005年6月于中国医科大学第一临床学院和沈阳军区总医院收集的180例单纯性CHD患者及200名正常人,应用变性高效液相色谱(DHPLC)结合测序分析2个SNP位点基因型,应用χ2检验统计分析CHD组和对照组各SNP位点基因型频率及等位基因频率。结果rs11553626位点未检测到多态;rs2228226位点存在G/C多态,CHD组和对照组等位基因频率分布(χ2=8·956,P<0·005)及基因型频率分布(χ2=11·286,P<0·005)差异显著,CHD组G等位基因频率及GG、GC基因型频率增高,CC基因型频率降低。结论GLI1基因编码区SNP位点rs11553626在中国东北人群中可能不存在多态性;rs2228226位点与单纯性CHD有明显的相关性,具有G等位基因的人发生CHD的危险性相对增高。     

TBX1基因与人类圆锥动脉干畸形相关性的研究

目的在TBX1基因内选取2个已知单核苷酸多态(SNP)G2857C(rs737868)和G2963A(rs28649236),检测其在圆锥动脉干畸形患者和正常人群中的表达情况,分析TBX1基因与圆锥动脉干畸形的相关性。方法2004年3月至2006年5月沈阳军区总医院应用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)方法分析100例圆锥动脉干畸形患者及100名正常人2个SNP位点基因型;应用列联表法统计分析病例组和对照组各SNP位点基因型及等位基因频率。结果G2963A位点等位基因频率及基因型频率在病例组和对照组中的分布差异有显著性,病例组G等位基因频率明显高于对照组(χ2=5.30,P<0.05)。结论TBX1基因编码区的SNP位点G2963A与人类圆锥动脉干畸形有明显的相关性,具有G等位基因的人发生圆锥动脉干畸形的危险性相对增高。     

GLI1基因内2个SNP位点与单纯性 先天性心脏病的关联研究

目的 在前期工作定位的单纯性先天性心脏病（CHD）易感区域12q13内，选取GLI1基因编码区内2个已知单核苷酸多态（SNP）：rsll553626和rs2228226，检测其在单纯性CHD患者和正常人群中的分布情况，分析其与单纯性CHD的相关性。方法对2000年1月至2005年6月于中国医科大学第一临床学院和沈阳军区总医院收集的180例单纯性CHD患者及200名正常人，应用变性高效液相色谱（DHPLC）结合测序分析2个SNP位点基因型，应用x^2检验统计分析CHD组和对照组各SNP位点基因型频率及等位基因频率。结果rs11553626位点未检测到多态；rs2228226位点存在G／C多态，CHD组和对照组等位基因频率分布（x^2=8．956，P〈0．005）及基因型频率分布（x^2=11．286，P〈0．005）差异显著，CHD组G等位基因频率及GG、GC基因型频率增高，CC基因型频率降低。结论GLI1基因编码区SNP位点rs11553626在中国东北人群中可能不存在多态性；rs2228226位点与单纯性CHD有明显的相关性，具有G等位基因的人发生CHD的危险性相对增高。     

p53基因多态性与鼻咽癌遗传易感性的关系

目的研究广西南宁鼻咽癌患者p53基因遗传多态性与鼻咽癌发生的关系。方法采用病例-对照研究方法,以200例鼻咽癌患者、200例对照人群为研究对象。选取p53基因SNP rs117562731位点作为遗传标记,用聚合酶链式反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)和测序方法检测rs117562731位点基因型频率和等位基因频率,比较两组不同基因型与鼻咽癌易感性的关系。结果通过对rs117562731位点多态基因型检测分型发现,在鼻咽癌组和对照组CC、CT、TT基因型频率分别为80.0%、17.0%、3.0%和93.0%、5.5%、1.5%。rs117562731位点等位基因及基因型频率在鼻咽癌组与对照组间分布有显著性差异(P0.05)。结论 p53基因SNP rs117562731位点多态性与鼻咽癌之间存在显著的相关性。     

microRNA-146a基因多态性与胃癌的相关性分析

目的分析microRNA-146a基因多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)及miR-146a表达水平与胃癌的关系。方法纳入胃癌患者86例设为胃癌组,取胃癌及自身正常胃癌旁组织,另取正常胃黏膜42例作对照设为对照组。使用基因测序方法确定单核苷酸多态性的等位基因,分析不同基因型与胃癌发生及转移的关系。使用RT-PCR方法检测并比较不同基因型胃黏膜组织中miR-146a表达量;对比癌组织与自身正常组织中miR-146表达量;同时比较转移患者以及未转移患者癌组织miR-146表达量。结果胃癌组与对照组miR-146a基因型分布不同,Logistic回归显示GG及GC是胃癌发病危险因素;对照组中GG及GC基因型携带者miR-146a表达量较胃癌基因型携带者低;胃癌患者中癌组织miR-146a水平较其自身正常组织低。转移患者及未转移患者基因型分布亦有所不同,前者GG基因型比例较高,miR-146a表达量则降低,显示GG是胃癌转移的危险因素之一。结论 miR-146a多态性中的G等位基因是胃癌发病和转移的危险因素之一,可能与其导致的较低miR-146a表达量有关。     

IL-17A基因多态性及血浆水平与病毒性心肌炎的相关性研究

目的:探讨白细胞介素17A(interleukin-17A,IL-17A)rs2275913(G-197A)位点单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,SNPs)及血浆水平与重庆汉族人群病毒性心肌炎(viral myocarditis,VMC)的关系。方法:收集VMC患者200例,根据病程将患者分为急性期组112例和恢复期组88例,并选择同期200例健康体检的正常人作为对照组,采用聚和酶链反应-限制性内切酶片断长度多态性(PCR-RFLP)、DNA测序等方法检测全部受试者IL-17A基因rs2275913(G-197A)位点SNP,采用酶联免疫吸附法(ELISA)测定两组血清IL-17水平。结果:VMC组IL-17A基因rs2275913(G-197A)多态位点AA基因型和A等位基因频率均显著高于对照组(P0.05),携带AA基因型及携带A等位基因(AA+AG基因型)可增加患VMC的易感性(矫正后ORAA=2.197,95%CIAA=1.208-4.279,PAA=0.003;矫正后ORAA+AG=2.051,95%CIAA+AG=1.134-3.995,PAA+AG=0.009)。VMC组血清IL-17水平明显高于对照组(P0.05),尤以急性期为著(P0.05)。不论是VMC组还是对照组,IL-17A基因rs2275913(G-197A)多态位点中含A等位基因(AA+AG)者血清IL-17水平均显著高于非A等位基因(GG)携带者(P0.01)。结论:IL-17A基因rs2275913位点SNP可能与中国重庆地区汉族人群VMC有关,A等位基因是VMC的易感基因。     

骨保护素和RANKL基因单核苷酸多态性对类风湿关节炎易感性及其骨密度和疾病活动性的影响

目的 探讨骨保护素基因(TNFRSF11B) 1181G＞C(rs2073618)、163A＞G(rs3102735)位点和核因子κB活化因子受体配体(RANKL)基因(TNFRSF 11)401A＞G (rs2277438)位点单核苷酸多态性(SNP)对类风湿关节炎(RA)疾病易感性及其骨密度和疾病活动性的影响.方法 采用连接酶检测反应(LDR)聚合酶链反应(PCR)方法检测200例RA患者和201名健康对照组骨保护素基因rs2073618、rs3102735位点和RANKL基因rs2277438位点SNP;采用双能X线骨密度仪(DEXA)法测定其股骨和腰椎部位骨密度.比较其等位基因分布频率、基因型频率及单倍体型在2组中的分布,并比较不同基因型RA患者骨密度及疾病活动性的差别.统计学方法采用方差分析,t检验和x2检验.结果 ①骨保护素基因rs2073618位点、rs3102735位点和RANKL基因rs2277438位点各等位基因及基因型分布频率在RA组与对照组中差异均无统计学意义(P＞0.05).3个位点单倍体型研究表明:骨保护素和RANKL基因单倍体型(rs2073618G-rs2277438G-rs3102735G)携带者RA疾病易感性明显降低(1.5％与6.0％,OR:0.216,95％CI:0.081～0.575,P=0.0008),骨保护素和RANKL基因单倍体型(rs2073618G-rs2277438A-rs31 02735G)携带者RA易感性明显增加(14.5％与8.4％,OR:1.862,95％CI:1.179～2.943,P=0.007).②RANKL基因rs2277438位点表达为纯合型(AA和GG型)的RA患者(62例)腰椎3(1.05±0.22与0.93±0.26,t=2.314,P=0.023)、腰椎4(1.06±0.24与0.94±0.28,t=2.207,P=0.030)、腰椎2～4(1.04±0.21与0.89±0.28,t=2.788,P=0.007)部位骨密度均明显高于杂合型(AG型)RA患者(39例);骨保护素基因rs2073618和rs3102735位点不同基因型RA患者间骨密度差异无统计学意义(P＞0.05).③骨保护素基因rs2073618位点表达为纯合型(CC、GG型)的RA患者(60例)在以下疾病活动性指标上明显高于表达为杂合型(CG型)的RA患者(40例):压痛关节数(13±7与10±6,t=2.154,P=0.034)、压痛关节指数(19±11与13±9,t=2.318,P=0.023)、疼痛视觉模拟(VAS)评分(5.7±1.9与4.8±1.8,t=2.481,P=0.015).RANKL基因rs2277438位点、骨保护素基因rs3102735位点不同基因型RA患者间各疾病活动性指标差异无统计学意义(P＞0.05).结论 骨保护素基因rs2073618、rs3102735位点和RANKL基因rs2277438位点SNP与中国籍汉族RA患者易感性无关,但骨保护素和RANKL基因单倍体型(rs2073618G-rs2277438G-rs3102735G)为RA的保护性因素,而单倍体型(rs 2073618G-rs2277438A-rs31 02735G)是危险因素.RANKL基因rs2277438位点SNP与RA骨代谢相关;骨保护素基因rs2073618位点SNP与RA患者疾病活动性相关.     

OCTN1/OCTN2基因多态性与中国汉族人群炎症性肠病相关性的初步研究

近年研究证实OCTN1/OCTN2基因单核苷酸多态性（SNP）与西方白种人群克罗恩病（CD）明显相关,其中OCTN1基因rs1050152位点和OCTN2基因rs2631367位点SNP与CD的相关性尤为显著.目的：初步探讨OCTN1基因rs1050152位点和OCTN2基因rs2631367位点基因多态性与中国汉族人群炎症性肠病（IBD）的相关性.方法：KR联合直接测序法检测45例CD患者、45例溃疡性结肠炎（UC）患者和50名正常对照者OCTN1基因rs1050152位点和OCTN2基因rs2631367位点的基因型,比较各组基因型和等位基因频率.结果：CD,UC和正常对照组间OCTN1基因rs1050152位点基因型和等位基因频率差异均无统计学意义（R〉0.05）;三组OCTN2基因rs2631367位点均未发现突变基因型.结论：OCTN1基因rs1050152位点和OCTN2基因rs2631367位点基因多态性与中国汉族人群IBD不相关.     

Association analysis of genetic variants in microRNA networks and gastric cancer risk in a Chinese Han population

Purpose

To investigate associations between genetic variants involved in microRNA networks (microRNA biogenesis, microRNA and microRNA binding sites) and risk of gastric cancer.

Methods

We genotyped 19 SNPs of the microRNA-related genes in a case–control study of 311 gastric cancers and 425 cancer-free controls in a Chinese Han population.

Results

We found that two of the SNPs were significantly associated with gastric cancer. Inhibitory effect of minor allele T of rs2071504 SNP within the exon of POLR2A gene was significantly associated with gastric carcinogenesis (p?=?0.033, aOR?=?0.742, 95%CI?=?0.564–0.977) and the SNP rs895819 in the miR-27a gene with the minor allele C presented significantly reduced risk to gastric cancer (p?=?0.037, aOR?=?0.771, 95%CI?=?0.604–0.985). Further stratified analysis with regard to clinical pathological parameters of the patients indicated that the SNP rs2071504 was associated with lymph node metastasis (p?=?0.021, aOR?=?0.529, 95%CI?=?0.307–0.910) and TMN stage (p?=?0.021, aOR?=?0.532, 95%CI?=?0.311–0.908), respectively.

Conclusions

Our findings provided evidence that the SNP rs2071504 in the exon of POLR2A gene would not only confer a decreased risk of gastric cancer, but also influence lymph node metastasis and TMN stage of gastric cancer in the Chinese population.     

CYFRA21-1基因多态性与肺癌临床特征的相关性

目的探讨细胞角蛋白19片段(Cytokeratin 19 Fragment Antigen,Cyfra21-1)基因多态性与肺癌临床特征的相关性。方法选取肺癌患者78例作为肺癌组与健康人群78例作为健康组。检测两组入选者的血清Cyfra21-1基因多态性,调查患者的临床特征。结果两组人群的Cyfra21-1 rs17561基因分布均符合Hardy-Weinberg平衡定律,Cyfra21-1 rs17561基因型分布差异具有统计学意义(P<0.05),肺癌组的Cyfra21-1 rs17561基因CC基因型比例显著高于健康组(P<0.05),肺癌组等位基因C频率显著高于健康组(P<0.05)。在肺癌组78例患者中,不同肿瘤最大直径、临床分期、淋巴结转移患者的CC基因型比例对比差异具有统计学意义(P<0.05)。Logistic回归分析显示肿瘤最大直径、临床分期、淋巴结转移为影响Cyfra21-1 rs17561基因CC基因型的主要因素(P<0.05)。结论Cyfra21-1 rs17561基因在肺癌患者中呈多态性分布,Cyfra21-1 rs17561基因CC基因型与患者的临床特征显著相关。     

环氧化酶-2基因启动子区多态性与结直肠癌的易感性

目的:探讨环氧化酶-2(cyclooxygenase-2,COX-2)基因启动子区的-1195(G/A,rs689466)及3’非翻译区的8473(T/C,rs5275)2个位点的基因多态性与结直肠癌(colorectal cancer,CRC)发病风险的相关性.方法:采用病例-对照研究,利用聚合酶链式反应和限制性片段长度多态性(polymerase chain reaction-restrictive fragment length polymorphism,PCR-RFLP)分析方法,对343例CRC患者和340例健康人的COX-2基因的2个位点的多态性进行检测,采用SPSS11.0软件包统计分析各位点的基因型分布和等位基因频率.结果:COX-2-8473位点多态性的各基因型频率在病例组及对照组中分布均无显著差异(P>0.05),但COX-2-1195位点多态性的基因型频率在二组中分布有显著性差异(P<0.001),结果显示CRC患者COX-2-1195AG基因型在病例组的频率较对照组显著增高(校正后OR=2.23;95%CI:1.50-3.32),AA基因型在病例组中的频率亦较对照组高(校正后OR=2.46;95%CI:1.51-4.02),A等位基因携带者在病例组中的频率高于对照组(校正后OR=2.27;95%CI:1.55-3.34).各基因型分布在结肠癌及直肠癌中的分布无显著性差异(P>0.05).COX-2-1195A等位基因与淋巴结转移及TNM分期有显著相关性.结论:COX-2-1195位点AG/AA基因型是CRC的风险因素,且与CRC的淋巴结转移及TNM分期相关.     

IL-28B基因变异与丙型肝炎的易感性及其自然清除的关系

目的探讨IL-28B基因变异与丙型肝炎的易感性和丙型肝炎病毒（HCV）自然清除之间的关系。方法利用焦磷酸测序的方法对411例HCV感染者（男性225人,女性186人）及100例健康对照人群进行了IL-28B基因变异位点rs12979860的多态性检测;对HCV感染者进行病毒定量的检测,比较HCV感染人群和健康对照人群,慢性丙型肝炎（CHC）人群和丙型肝炎自愈人群IL-28B基因变异位点的差异以及不同基因型的携带者病毒定量的差异。结果中国健康人群IL-28B基因变异位点rs12979860的最小等位基因频率为6%,与日本人相近,与欧洲人群相差较大。SNP（rs12979860）位点的等位基因频率和基因型频率在HCV感染人群和健康对照人群之间差异无统计学意义（P=0.066;P=0.072）,C/C基因型CHC人群病毒定量水平高于C/T基因型,二者之间差异有统计学意义（P=0.02）;丙型肝炎自愈人群中C/C基因型和C/T基因型差异无统计学意义（P=0.64）。结论 CHC人群rs12979860 SNP基因型与健康人群表达无明显差别,该基因型（rs12979860）不是HCV的易感基因,其CC基因型并不能预测丙型肝炎发生自愈的病程。     

Multi-drug resistance 1 polymorphism is associated with reduced risk of gastric cancer in the Japanese population

BACKGROUND AND AIMS: Host genetic factors play a key role in gastric carcinogenesis, but the mechanism has not been clarified. The multi-drug resistance 1 (MDR1) gene mediates the expression of P-glycoprotein, which has a role in active transport of various substrates, including xenobiotics, and thus has a protective function in various tissues and organs like gastrointestinal epithelial cells. C3435T polymorphism in exon 26 of the MDR1 gene influences P-glycoprotein expression and activity in the gastrointestinal tract. We investigated the influences of MDR1 gene polymorphism on the risk of gastric cancer. METHOD: The study was performed on 157 patients with gastric cancer (GC) and 104 patients without GC as the control group. C3435T polymorphism of MDR1 was investigated by PCR-RFLP in all of the patients. RESULTS: The MDR1 3435 TT genotype showed a significantly higher frequency in controls than in GC patients (OR = 0.43; 95% CI = 0.23-0.79). There were no significant differences of the CT and CC genotype frequencies between GC patients and controls. We also found that the 3435TT genotype of MDR1 was associated with a lower risk of non-cardiac cancer (OR = 0.42; 95% CI = 0.23-0.79), middle-third cancer (OR = 0.36; 95% CI = 0.17-0.77), advanced cancer (OR = 0.31; 95% CI = 0.13-0.73), venous invasion (OR = 0.30; 95% CI = 0.10-0.91), and lymph node metastasis (OR = 0.28; 95% CI = 0.13-0.65). CONCLUSION: Our data suggest that 3435T/T polymorphism of MDR1 is associated with a reduced risk of gastric cancer in the Japanese population.     

白细胞介素-1F7基因单核苷酸多态性对强直性脊柱炎易感性与病情的影响

目的 探讨白细胞介素(IL)-1F7基因rs3811047位点单核苷酸多态性(SNP)对强直性脊柱炎(AS)易感性和临床表现型的影响.方法 收集AS患者158例和同期健康献血人群181名,采用连接酶检测反应(LDR-PCR)方法检测IL-1F7基因rs3811047位点SNP,分析其等位基因频率及基因型频率在AS和对照组中的分布,并比较不同基因型AS患者间临床表现型的差别.结果 AS患者和对照人群中rs3811047位点A等位基因频率(12.03%,17.68%)和G等位基因频率(87.97%,82.32%)的分布差异有统计学意义(x2=4.2204,P=0.0399);AA,AG,GG基因型频率在AS中分别为0,24.05%,75.95%,与对照组分布(2.76%,29.83%,67.41%)相比,差异亦有统计学意义(x2=6.2675,P=0.043).AG基因型的AS患者中人类白细胞抗原(HLA)-B27阳性率为70.27%(26/37),明显低于GG基因型AS中HLA-B27的阳性率94.23%(98/104),差异有统计学意义(x2=2.168,P=0.030);其红细胞沉降率和C反应蛋白水平明显亦低于GG基因型组(t=2.971,P=0.013;t=3.300,P=0.001).结论 安徽籍汉族人群AS易感性与IL-1F7基因rs3811047位点SNP有关,其基因型对AS的临床表现型有影响,携带A等位基因患者的炎症表现轻于不携带A等位基因的患者.     

NKX3.1基因rs1512268单核苷酸多态性与前列腺癌风险关系的初步研究

目的 探讨NKX3.1基因的常见变异rs1512268单核苷酸多态性与中国人前列腺癌发生的关系及相关危险因素的相互作用. 方法 选取122例前列腺癌患者和年龄匹配的105例男性(前列腺癌特异抗原＜4μg/L,且无前列腺癌家族史者)作为对照,采用聚合酶链反应-高分辨熔解曲线(PCR-HRM)技术结合测序验证法检测NKX3.1基因rs1512268单核苷酸多态性的分布. 结果 前列腺癌组中GG、AG和AA基因型分布分别为42例(33.4％)、66例(54.1％)和14例(11.5％);正常对照组中三种基因型分布分别为45例(42.9％)、51例(48.6％)和9例(8.6％);两组间基因型频率(x2=1.70,0.69,0.52)和等位基因频率(x2=1.575)的分布差异无统计学意义(P＞0.05).NKX3.1基因rs1512268单核苷酸多态性的不同基因型与前列腺癌患者的年龄、Gleason评分和PSA浓度以及临床分期等指标间均无相关性(P＞0.05). 结论 NKX3.1基因rs1512268单核苷酸多态性与中国人前列腺癌的发生无明显相关性,可能不是中国人前列腺癌发病的遗传危险因素.     

脂联素基因多态性与2型糖尿病的相关性研究

目的探讨脂联素基因（apM1）2号外显子＋45位点T/G多态性与滨州地区汉族人群2型糖尿病（T2DM）的关系。方法采用聚合酶链反应—限制性片段长度多态性方法 ,检测100例T2DM患者及100例健康者的apM1 2号外显子＋45位点T/G多态性。结果与健康者比较,T2DM患者G/G基因型分布、G等位基因频率明显升高,T等位基因频率明显降低（P均〈0.01）。结论 apM1可能是滨州地区汉族人群T2DM的易感基因。