SELDI-TOF-MS技术在肝癌诊断和介入治疗评价中的价值

目的:建立肝癌血清学诊断模型,探讨评估SELDI-TOF-MS技术在肝癌诊断和介入治疗评价中的价值.方法:用弱阳离子交换芯片(CM10芯片)和表面增强激光解吸电离飞行时间质谱仪(surface-enhanced laser desorption ionization time-of-flight mass spectrometry,SELDI-TOF-MS)技术,测定60例肝癌患者和60例正常对照者的血清蛋白质指纹图谱,应用BiomarkerWizard统计软件比较肝癌组和正常对照组血清蛋白质表达的差异性,采用Biomarker Pattern软件分析数据建立肝癌诊断模型,比较介入治疗前后血清蛋白质指纹图谱的差异性.结果:在质荷比(M/Z)为2000-10000范围内,和正常血清比较,肝癌的差异峰有3个(M/Z为4182Da、5710Da、6992Da;P<0.01),4182Da和5710Da下调,6992Da上调.用这3个差异蛋白峰建立肝癌诊断模型,诊断肝癌的灵敏度为93.3%(28/30),特异度为90.0%(27/30),正确率为91.7%(55/60),约登指数为0.833.差异蛋白峰(M/Z4182Da)在介入术后1mo明显上调(P<0.05).结论:应用SELDI-TOF-MS技术进行肝癌血清蛋白质指纹图谱分析,建立肝癌诊断树模型,对肝癌的诊断有一定的价值;筛选出的差异蛋白峰对肝癌的介入治疗评估有一定的应用价值.     

SELDI-TOF-MS技术在消化道肿瘤早期诊断中的应用

蛋白质组学技术的发展为发现新的生物标记物提供了机会.表面增强激光解析电离飞行时间质谱(Surface enhanced laser desorption/ionization time-of-flight mass spectrometry)就是一种新兴的有发展前途的蛋白质组技术.此文就其在消化道肿瘤早期诊断研究中的应用作一综述.     

应用SELDI-TOF-MS技术建立肝癌筛选血清蛋白质指纹图谱模型

目的:建立肝癌筛选血清蛋白质指纹图谱模型．方法:用表面加强激光解析电离飞行时间质谱技术(SELDI-TOF-MS)及WCX2蛋白芯片获得新发肝癌、肝硬化患者和正常人血清的蛋白质指纹图谱,用计算机软件进行比较分析,建立肝癌的筛选模型．结果:肝癌患者与健康对照组血清蛋白质指纹图谱之间有5个标志蛋白(4477,8943,5181, 8617,13 761 Da)在肝癌患者血清中高表达,肝癌患者与肝硬化患者血清蛋白质指纹图谱之间2个标志蛋白(4477,13 761 Da)在肝癌患者血清中高表达,1个标志蛋白(4097 Da)在肝癌患者血清中低表达．SELDI-TOF-MS技术的特异性(60／60,100％);敏感度(18／20,90％)．分析系统筛选出4477,8943,13 761,4097 Da标志蛋白建立的肝癌诊断模型．结论:建立的血清蛋白质指纹图谱模型能够区分肝癌与非肝癌患者,SELDI-TOF-MS在肝癌的诊断及肿瘤特异性蛋白质生物标志分子的筛选等方面具有一定价值．     

SELDI-TOF-MS联合蛋白质组学实验数据库对结直肠癌血清标志物的鉴定

目的:探讨表面增强激光解析离子化飞行时间质谱仪(SELDI-TOF-MS)联合蛋白质组学实验数据库方法研究结直肠癌患者血清标志物的可行性.方法:应用SELDI-TOF-MS对169例结直肠癌患者与83例正常人血清进行了蛋白质谱检测.通过Biomarker WizardTM与BiomarkerPatternsTM软件分析发现差异蛋白,建立结直肠癌诊断模型;用蛋白质组学实验数据库检索鉴定出有意义的差异蛋白,并用ELISA法对结直肠癌患者及正常人血清样本中差异蛋白表达进行验证.结果:发现34种差异蛋白,以质荷比(m/z)为2873,3163,6121,7778的4种差异蛋白组成的分类树诊断模型.在学习模式下其诊断结直肠癌的灵敏度为91.57%,特异度为90.53%:在测试模式下分别为82.25%.80.72%.其中m/z为7778的蛋白峰强度在结直肠癌患者血清中明显高于正常人(p<0.01),数据库检索结果提示该蛋白为血小板因子4(PF4).ELISA法测定结直肠癌患者血清PF4水平显著高于正常人(p<0.01),其灵敏度及特异度分别为61.1%,76.9%.结论:SELDI-TOF-MS联合蛋白质组学实验数据库的方法简便可行.可为蛋白芯片研究提供新思路;PF4(m/z=7778)在结直肠癌患者血清中明显升高,是结直肠癌患者新的血清学标志物.     

应用SELDI-TOF-MS技术初步建立结直肠癌分类树模型

目的:分析结直肠癌期患者血清蛋白质组变化, 初步建立结直肠癌期分类树模型.方法:将335例血清样本(其中结直肠癌患者169例, 健康人166例)随机分为训练组和测试组, 将血清样本加至IMAC30-Cu2+蛋白芯片,利用SELDI-TOF-MS得到血清蛋白质谱, 利用Biomarker Wizard软件进行蛋白峰值鉴定和聚类. 利用Biomarker Pattern以训练组建立由1个差异蛋白组成的结直肠癌期分类树模型, 以测试组进行独立样本的双盲验证. 另外, 应用电化学发光免疫测定法检测测试组血清样本CEA.结果:软件识别了59个质峰, 其中由质荷比为5765的蛋白构成的分类树模型可以有效鉴别结直肠癌患者与正常人, 灵敏度和特异度分别是98.81%及100.00%, 经双盲验证其灵敏度,特异度及阳性预测值分别是97.65%, 98.80%及98.81%. CEA的灵敏度及特异度低于SELDI分类树模型( P<0.05).结论:SELDI-TOF-MS检测得到的血清蛋白质组分类树模型可以准确的鉴别结直肠癌患者与正常人, 对结直肠癌的筛查有重要的意义.     

表面增强的激光解析电离飞行时间质谱技术在肝细胞癌血清学诊断中的应用

目的:检测HBV感染携带者与肝细胞癌(HCC)患者血清蛋白质的差异性表达,以发现HCC的肿瘤诊断标志物.方法:用表面增强的激光解析电离飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)技术检测27例HCC患者,27例HBV感染携带者,25例健康对照血清中的蛋白质谱,并用Biomarker Patterns System 5．0软件分析,建立诊断模型．结果:检测HCC患者与HBV感染携带者。正常对照与HCC患者,正常对照与HBV感染携带者的差异性蛋白分子,据此构建分类模型,得到的灵敏度和特异度分别为93％,85％; 96％,96％;84％,89％．其中相对分子质量为8141 Da的蛋白峰在HCC组明显高于HBV感染组(p<10-5);相对分子质量为3448 Da的蛋白峰在HCC及HBV感染携带组表达均较正常组显著增高(P<10-5),而在HCC-HBV组无明显差异(P>0．05),提示其可能为HBV感染的一种标志蛋白;相对分子质量为777) Da的蛋白峰在3组中均有差异性表达．结论:SELDI蛋白芯片技术检测血清蛋白质谱法诊断HCC具有较高的灵敏度和特异度,操作简单快捷,临床应用前景广阔,为HCC诊断提供了新的血清学方法．     

SELDI-TOF MS技术在胰腺癌早期诊断中的应用

胰腺癌是目前预后最差的恶性肿瘤,早期诊断被认为是改善胰腺癌预后的重要出路之一.表面增强激光解吸电离飞行时间质谱(SELDI- TOF MS)技术,是近年来发展起来一种新的高通量蛋白质组学研究方法,本文就SELDI-TOF MS技术相关的原理、特点,在胰腺癌早期诊断中的应用新进展和未来的发展趋势作一综述.     

SELDI-TOF-MS技术在结直肠腺瘤血清蛋白质指纹图谱筛查模型建立中的应用

目的应用表面增强激光解吸/离子化飞行时间质谱（SELDI-TOF-MS）技术建立结直肠腺瘤（CRA）患者血清蛋白质指纹图谱筛查模型。方法随机选取CRA 42例、结直肠良性疾病（CBD）36例及正常人（HC）44例的血清标本组成建模组,应用SELDI-TOF-MS检测其蛋白质指纹谱,采用Biomarker Wizard及Biomarker Patterns软件分析建模组中各类人群血清中的差异蛋白后,建立CRA筛查最优分类树模型;另随机抽取血清标本70例（CRA及CBD各20例、HC 30例）组成测试组,盲法验证该模型对CRA的筛查效能。结果成功建立了结直肠腺瘤筛查分类树模型。测试模式下,该模型的诊断准确率87.70%、灵敏度71.43%、总特异度96.25%、阳性预测值90.91%。盲法验证该模型诊断准确率88.57%,灵敏度60.0%,总特异度100.0%,阳性预测值100.0%。结论应用SELDI-TOF-MS技术成功建立了CRA筛查模型,该模型敏感性与特异性较高。     

SELDI-TOF-MS技术及其在糖尿病研究中的应用

表面加强激光解吸电离-飞行时间-质谱（SELDI-TOF-MS）技术是蛋白质组学的重要检测技术之一，不同性质的芯片能捕获各种不同性质的蛋白质。该技术具有高通量、高灵敏度、自动化等特点，可直接应用于临床，在基础研究和临床应用方面发展迅速。但是，在糖尿病及其并发症的研究中应用不多。本文就其技术原理和目前在糖尿病研究中应用的现状作一介绍。SELDI-TOF-MS技术将为糖尿病及其并发症的研究和防治提供新的平台。     

SELDI-TOF-MS技术诊断贲门癌高发区慢性萎缩性贲门炎及贲门黏膜不典型增生

目的探讨贲门癌高发区人群贲门黏膜不典型增生(DYS)、慢性萎缩性贲门炎(CAG)的血清学诊断方法,为贲门癌高危人群的筛查提供新手段。方法采用弱阳离子结合芯片(WCX2)及表面增强激光解吸/电离飞行时间质谱仪(SELDI-TOF-MS)检测食管癌高发区无症状普查人群143人(其中活检组织诊断为正常63人,CAG57人,DYS23人)的血清蛋白质质谱,对原始信号的总离子强度及相对分子质量做均一化校正及噪声滤过,并对同一质荷比蛋白质质谱峰平均强度值做组间t检验。应用BiomarkerPattern软件建立决策树分类模型,经10倍交叉验证得到该分类模型对测试组病变人群的诊断率和排除率。结果采用DYS和正常组质荷比为M3894·0的一种蛋白质建立的决策树分类模型,其对测试组DYS诊断率为87%,排除率为86%;CAG和正常组则有质荷比为M2942·15和M33316·6的2种蛋白质建立决策树分类模型,对测试组CAG诊断率为93%,排除率为92%。结论SELDI-TOF-MS蛋白质芯片技术检测血清蛋白质质谱法诊断贲门癌高发区DYS和CAG有较高的敏感性和特异性,为贲门癌高危人群筛查提供了新的血清学手段。     

联合检测血清人附睾分泌蛋白4和癌抗原125对卵巢癌的诊断价值

目的：探讨血清人附睾上皮分泌蛋白4（HE4）和癌抗原（CA125）单独或联合检测对卵巢癌的诊断价值。方法：分别应用酶联免疫吸附试验和电化学发光技术测定经病理确诊的卵巢癌患者112例、盆腔良性疾病患者68例及健康对照者80例血清肿瘤标志物HE4、CA125的含量水平,并计算各项目的灵敏性、特异性、准确性、阳性及阴性预测值等诊断性能指标。结果：①卵巢癌组HE4和CA125水平明显高于其他2组,差异有统计学意义（P〈0.01）;健康对照组和良性疾病组比较HE4差异无统计学意义（P〉0.05）;CA1252组差异有统计学意义（P〈0.01）。②以卵巢良性疾病作参照,单独检测血清HE4水平对卵巢癌诊断的敏感性为57.8%,低于单独检测CA125的75.3%;但其特异性为97.0%,高于CA125的85.5%。以二者其中之一高于参考值即视为阳性时,联合检测HE4和CA125对卵巢癌诊断的敏感性为94.6%,特异性可达85.0%。结论：HE4单项检测诊断卵巢癌的特异性优于CA125单项检测,两者联合检测可以提高诊断。     

Identification of differentially expressed proteins in ovarian cancer using high-density protein microarrays

Ovarian cancer is a leading cause of deaths, yet many aspects of the biology of the disease and a routine means of its detection are lacking. We have used protein microarrays and autoantibodies from cancer patients to identify proteins that are aberrantly expressed in ovarian tissue. Sera from 30 cancer patients and 30 healthy individuals were used to probe microarrays containing 5,005 human proteins. Ninety-four antigens were identified that exhibited enhanced reactivity from sera in cancer patients relative to control sera. The differential reactivity of four antigens was tested by using immunoblot analysis and tissue microarrays. Lamin A/C, SSRP1, and RALBP1 were found to exhibit increased expression in the cancer tissue relative to controls. The combined signals from multiple antigens proved to be a robust test to identify cancerous ovarian tissue. These antigens were also reactive with tissue from other types of cancer and thus are not specific to ovarian cancer. Overall our studies identified candidate tissue marker proteins for ovarian cancer and demonstrate that protein microarrays provide a powerful approach to identify proteins aberrantly expressed in disease states.     

应用SELDI-TOF-MS技术筛选肺鳞癌和肺腺癌患者差异蛋白的研究

目的 应用表面增强激光解析电离飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)技术筛选出不同病理类型肺癌患者血清、支气管肺泡灌洗液(BALF)和肺癌组织中的差异蛋白,并探讨其临床意义.方法 选用WCX-2芯片、SELDI-TOF-MS技术检测20例肺鳞癌、20例肺腺癌和20例肺良性病变患者血清、BALF和肺组织匀浆的蛋白质谱,用Biomarker Pattern软件分析肺鳞癌和肺腺癌的差异蛋白并初步建立诊断模型.结果 ①肺鳞癌组与肺良性病变组:在血清、BALF、肺组织匀浆中发现存在2、9、8个差异蛋白峰(P＜0.05),分别选用其中质荷比为5 124.24、7 967.29联合10 843.45、7914.59联合8709.66的差异蛋白波峰建立分类树模型,其诊断肺鳞癌的灵敏度分别为85％、80％、75％,特异度分别为65％、80％、90％,正确率分别为75％、80％、83％,阳性预测值分别为71％、80％、88％,阴性预测值分别为81％、80％、78％,其相对应ROC曲线下面积分别为0.750、0.916、0.930.②肺腺癌组与肺良性病变组:在血清、BALF、肺组织匀浆中发现存在8、9、7个差异蛋白峰(P＜0.05),分别选用其中质荷比为9295.79、7923.01、2452.49的差异蛋白波峰建立分类树模型,其诊断肺腺癌的灵敏度分别为75％、80％、70％,特异度分别为65％、90％、85％,正确率分别为70％、85％、78％,阳性预测值分别为68％、89％,82％,阴性预测值分别为72％、82％、71％,其相对应ROC曲线下面积分别为0.844、0.933、0.825.结论 肺鳞癌和肺腺癌BALF及肺组织匀浆中的差异蛋白较血清多,诊断效率比血清高,肺鳞癌BALF中质荷比为7967.29和10843.45的差异蛋白峰联合、肺组织匀浆中质荷比为7914.59和8709.66的差异蛋白峰联合建模及肺腺癌BALF中质荷比为7923.01的差异蛋白峰建立分类树诊断模型,其诊断的灵敏度、特异度和正确率可达到75％～90％,有可能作为诊断肺鳞癌和肺腺癌的标志蛋白.     

New serum biomarkers for detection of HBV-induced liver cirrhosis using SELDI protein chip technology

AIM: To find new serum biomarkers for liver cirrhosis (LC) in chronic carriers of hepatitis B virus (HBV). METHODS: Surface enhanced laser desorption/ionization time-of-flight (SELDI-TOF) mass spectrometry was used to discover biomarkers for differentiating HBV induced LC from non-cirrhotic cohorts. A training population of 25 patients with HBV-induced LC, 20 patients with HCC, and 25 closely age-matched healthy men, was studied. RESULTS: Two biomarkers with M(r) 7 772 and 3 933 were detected in sera of non-cirrhotic cohorts, but not in patients with HBV-induced LC. A sensitivity of 80% for all LC patients, a specificity of 81.8% for all non-cirrhotic cohorts and a positive predictive value of 75% for the study population were obtained. CONCLUSION: These two serum biomarkers for HBV-induced LC might be used for diagnosis and assessment of disease progression.     

基因芯片技术在胰腺癌中的应用进展

基因芯片技术是近几年发展起来的一项生物技术,可同时对大量基因的表达、突变和多态性进行快速、准确的检测。基因芯片技术为研究肿瘤发生、发展中基因功能分析,提供了强有力的工具。胰腺癌在我国的发病率逐年增长,利用基因芯片技术,为胰腺癌的分子病理诊断、临床预后判断及治疗方案的选择提供理论指导。这必将加速对胰腺癌发生、发展机制的了解,为进一步诊断和治疗提供理论基础。     

应用多种肿瘤标志物蛋白芯片检测肺癌的价值探讨

目的探讨多种肿瘤标志物蛋白芯片检测系统对肺癌的诊断价值。方法用该检测系统测定130例肺癌患者,78例肺良性病变患者血清中12种肿瘤标志物（CD199,NSE,CEA,CA242,CA125,CA153,AFP,fertitin,free—PSA,PSA,β—HCG及HCG）的水平。结果肺癌组的阳性率显著高于良性肺病组（66．15％VS32．05％,x^2=22．78,P〈0．01）;肺癌组中CEA的阳性率最高为47．7％。结论多肿瘤标志物蛋白芯片检测系统在肺良、恶性病变的鉴别诊断中有较高的应用价值。     

hSp17真核表达载体构建及其在卵巢癌细胞中的表达

目的构建人精子蛋白17（hSp17）基因的真核表达载体pcDNA3.1（＋）/hSp17,为其临床应用奠定基础。方法用PCR方法获取hSp17基因片段,NheⅠ、KpnⅠ双酶切、粘端连接的方法构建含有hSp17基因的pcD-NA3.1（＋）/hSp17真核表达载体。将该载体行脂质体介导转染卵巢癌细胞HO8910,免疫细胞化学方法检测转染细胞hSp17蛋白表达,G418筛选稳定表达hSp17蛋白的细胞株。结果酶切和测序结果均证实pcDNA3.1（＋）/hSp17重组质粒的构建完全正确。免疫细胞化学方法证实外源性hSp17基因能够在卵巢癌HO8910细胞瞬时表达。经G418连续筛选,得到阳性克隆细胞株,并证实了外源性hSp17基因在卵巢癌HO8910细胞中稳定表达。结论成功构建了稳定表达外源性hSp17蛋白的卵巢癌细胞株;其可为卵巢癌的免疫治疗奠定基础。     

紫杉醇耐药卵巢癌细胞SKOV3／TAX基因表达谱的变化

目的比较紫杉醇耐药卵巢癌细胞SKOV3／TAX及敏感细胞SKOV3基因表达谱的差异,筛查获得性紫杉醇卵巢癌耐药的相关基因。方法取对数生长期SKOV3、SKOV3／TAX细胞,抽提细胞总RNA,合成双链eDNA,生物素标记,用高通量Affymetfix人类基因组U133A基因芯片检测其基因谱。结果与SKOV3相比,SKOV3／TAX有111条基因表达发生变化（45条基因表达上调,66条基因表达下调）。结论SKOV3／TAX的部分基因表达发生变化,与卵巢癌化疗耐药有关。     

TRAIL基因多态性与卵巢癌的相关性探讨

目的探讨肿瘤坏死因子相关凋亡诱导配体(TRAIL)基因第五外显子3’-UTR区多态性与卵巢癌发生的相关性。方法选择175例上皮性卵巢癌患者(观察组)和170例健康体检者(对照组),采用PCR-RFLP法分析两组TRAIL基因第五外显子3’-UTR区1525G/A、1595C/T位点的基因型,比较观察组和对照组及观察组中高分化、中分化、低分化卵巢癌患者基因型和等位基因频率。结果观察组GG/CC、GA/CT基因型频率明显高于对照组,AA/TT频率明显低于对照组,P均<0.05;观察组G/C等位基因频率明显高于对照组,A/T频率明显低于对照组,P均<0.05。观察组高分化、中分化、低分化基因型频率及等位基因频率两两比较均有统计学差异,P均<0.05。结论 TRAIL基因第五外显子3’-UTR区1525G/A、1595C/T位点基因多态与卵巢癌的遗传易感性相关,携带1525G、1595C基因者卵巢癌发病风险增加。     

蛋白芯片技术对自身免疫性抗体的检测及评价

目的 探讨蛋白芯片技术检测自身抗体的临床价值。方法 用酶联免疫吸附试验（ELISA）、蛋白芯片法检测抗dsDNA、抗Ro-60／SSA、抗Ro-52／SSA、抗SSB、抗Jo-1、抗磷脂IgG抗体．用间接免疫荧光法（IIF）、蛋白芯片法检测抗核抗体（ANA）,分别统计两种方法检测均阳性、均阴性和单阳性的标本数目．并进行评价。结果 芯片法检测ANA的灵敏度为89％、特异度为60％．芯片法对其他6种自身抗体检测的灵敏度为70．0%～87．5%、特异度为92．7％～98．9％。结论 蛋白芯片法检测自身抗体与常规方法比较,特异度较高,有待进一步改善技术提高其灵敏度。