分娩方式及性别对母乳喂养婴儿肠道菌群的影响

目的 旨在通过高通量测序技术(Illumina)对母乳喂养婴儿粪便样本的16S rDNA基因进行测序分析,以探索分娩方式和婴儿性别对健康足月婴儿出生后1个月内肠道菌群定植的影响.方法 本研究于2015年3至6月在北京市通州区妇幼保健院产科招募刚出生的健康足月新生儿10人.采用Illumina高通量测序技术对纯母乳喂养婴儿的胎粪(1d),15d和30d的粪便样本中所有微生物的16S rRNA V3+V4进行测序检测.结果 胎粪的菌群多样性最高,随着喂养时间的延长,又呈现先降低后升高的趋势;两种分娩方式对肠道菌群定植的影响差异显著:顺产组的肠道菌群多样性均高于剖宫产组;在科水平上拟杆菌科(Bacteroidaceae)在顺产组婴儿肠道菌群中长期存在,且相对丰度较高,而梭菌科(Clostridiaceae)在剖宫产组婴儿肠道中稳定存在;双歧杆菌科(Bifidobacteriaceae)于婴儿出生后15d即开始产生,但顺产组婴儿肠道中此菌群相对丰度远高于剖宫产组(15d和30d时该菌的相对丰度在顺产组和剖宫产组的比例分别为4:1和10:1);性别对婴儿肠道菌群多样性和丰度无显著影响,但可造成菌群在科水平上菌群构成的差异:到出生后30d时男婴组中丹毒丝菌科(Erysipelotrichaceae)相对丰度较高(该菌科相对丰度占总菌科的20%),女婴组中毛螺菌科(Lachnospiraceae)相对丰度较高(该菌科相对丰度占总菌科的18%),且这两种菌科在对方组中均为检测到.结论 分娩方式对婴儿出生后1月龄内肠道菌群定植规律产生显著影响,而婴儿性别不是肠道菌群定植的关键因素,但在婴儿生长发育过程中会对肠道菌群构成产生一定的影响.     

宫颈人乳头瘤病毒感染的转归与阴道微生物菌群相关性研究进展

高危型人乳头瘤病毒（HPV）持续感染是宫颈癌前病变及宫颈癌发生的必要条件,其感染与清除受到多种因素影响。阴道微生物菌群在女性下生殖道健康中发挥着重要作用,正常女性阴道微生物多样性低,仅由少数几种乳杆菌（Lactobacillus）构成。随着对细菌16S rRNA基因高通量测序技术的应用,阴道微生物群落结构被深入研究。越来越多的研究证据表明阴道微生物菌群多样性增加、乳杆菌相对丰度减少等阴道菌群组成变化与HPV感染的发生和持续以及宫颈病变的发生发展密切相关。重建以乳杆菌为主的阴道微生物群落结构、恢复阴道微生态平衡能够促进HPV的清除,是未来HPV感染及宫颈病变治疗的新方向。本文讨论宫颈HPV感染的转归与阴道微生物菌群间的相关性。     

基于高通量测序的输卵管妊娠患者生殖道菌群研究

目的 探讨输卵管妊娠术前后及正常妊娠者生殖道菌群的结构差异,以便了解生殖道菌群对输卵管妊娠及手术治疗的影响。方法 选取输卵管妊娠术前后及正常妊娠者共60例为本次研究对象,其中输卵管妊娠术前为BTP组（n=20）,输卵管妊娠术后为ATP组（n=20）,并选取同期在本院门诊产检的正常宫内早孕（孕6～7周）女性20例作为（EP组）。采用16S rDNA测序分析三组生殖道菌群的多样性和结构差异,并对肠道菌群功能进行预测。结果 三组OTU丰度聚类热图提示,三组研究对象的OTU具有明显的差别,但三组菌群的多样性差异无统计学意义（P>0.05）;三组研究对象生殖道菌群以乳酸杆菌内酯丰度最高,且BTP组丰度最高;其次是脆乳杆菌,以EP组丰度最高;LDA分析结果提示：三组研究对象生殖道菌群的种类不一致,提示输卵管妊娠及手术对研究对象生殖道菌群的种类有一定的影响;龙胆科、杆菌科、麻风科、细脉藻科、普雷沃特拉科等细菌群类与输卵管妊娠关系密切。结论 输卵管妊娠患者输卵管妊娠术前后和正常妊娠者生殖道菌群种类具有明显的差别,表明生殖道菌群对输卵管妊娠能产生重要的影响。     

年龄轨迹对细菌性阴道病女性阴道-宫颈宏基因组菌群的影响

目的 探索苏州高新区35～65岁妇女下生殖道菌群的分布情况,并分析细菌性阴道病(bacterial vaginosis, BV)与下生殖道菌群的相关性。方法 从苏州高新区2018年7月至2022年9月参与“两癌”筛查的女性中招募本项目受试者,并采集宫颈分泌物样本以及相关表型信息,从入组的女性中筛选出232名女性的样本进行分析,包括125名BV女性(BV组)和107名健康女性(对照组)。对分泌物样本进行宏基因组鸟枪法测序检测微生物菌群,并通过统计学方法分析宫颈微生物与BV的相关性。结果 232名女性的阴道-宫颈微生物在种水平的研究提示阴道-宫颈菌群聚类成7种类型,BV导致惰性乳杆菌型(Type 1)减少,而加德纳菌型(Type 3)增加。进一步探索与BV相关的微生物标志物,发现加德纳菌(Gardnerella vaginalis)、人型支原体(Mycoplasma hominis)、疱疹病毒(Cyprinid herpesvirus 3)以及解脲支原体(Ureaplasma urealyticum)在BV组女性中明显富集。进一步按<50岁和≥50岁将女性分为中年组和老年组,发现不同...     

过敏性紫癜患儿肠道菌群结构及多样性研究

目的 探讨过敏性紫癜(HSP)患儿的肠道菌群结构及多样性变化和粪便菌群与黏膜菌群结构及多样性的差异.方法 收集47例过敏性紫癜患儿粪便样本和其中7例腹型患儿的结肠黏膜样本,以11例健康儿童粪便样本为对照,采用试剂盒提取法提取样本DNA并进行高通量测序,对测序结果进行生物学信息分析.结果 HSP患儿与健康儿童粪便菌群存在结构差异,在门水平两组均以厚壁菌门(47.10%、57.75%),变形菌门(23.04%、10.13%),拟杆菌门(22.81%、21.74%)为主要优势菌群,在科水平,均以肠杆菌科(17.60%、8.72%)、拟杆菌科(18.90%、21.65%)、瘤胃菌科(16.44%、28.93%)、毛螺菌科(11.55%、10.74%)有较高的丰度.HSP患儿粪便菌群中变形菌门、欧文氏菌属(从目到属)、拟杆菌属-uniformis种、巨单胞菌属、肠球菌属(从科到属)丰度高于对照组健康儿童,而双歧杆菌属(从目到属)、链球菌属(从目到属)、普拉梭菌种(从科到种)丰度低于对照组健康儿童.腹型患儿粪便菌群多样性高于黏膜菌群;在门水平,粪便菌群以厚壁菌门(53.64%)、变形菌门(33.65%)、拟杆菌门(9.24%)丰度较高,黏膜菌群以变形菌门(88.13%)丰度最高,在科水平,粪便菌群以肠杆菌科(27.18%)、瘤胃菌科(15.58%)、毛螺菌科(12.31%)为优势菌科,黏膜菌群以肠杆菌科(87.19%)为优势菌科;粪便菌群以双歧杆菌属(从门到属)、链球菌属(从门到属)、动性球菌科(从门到科)、丹毒丝菌科(从门到科)、梭菌科(从门到科)、瘤胃菌科(从门到科)、毛螺菌科(从门到科)为主要特征差异细菌种类,结肠黏膜菌群以欧文氏菌属(从门到属)为主要特征差异细菌种类.结论 HSP患儿粪便菌群病原菌或机会致病菌增多而有益菌减少,腹型HSP患儿黏膜菌群与粪便菌群存在结构和多样性差异.     

基于二代测序分析血液透析水处理系统水样中微生物多样性

目的基于Illumina MiSeq测序平台,分析血液透析水处理系统水样中微生物多样性和丰度。方法采集血液透析水处理设备供水处自来水、活性碳罐后软化水、出水口反渗水水样各两份,分为Ⅰ、Ⅱ两个组别,Ⅰ组水样进行传统微生物培养;Ⅱ组水样进行二代测序。结果Ⅰ组经微生物培养细菌总数均不超标,质谱鉴定为假单胞菌种;Ⅱ组经二代测序,获取可操作分类单元(OTU)总数依次为3 957,3 245,4 880,分别来自428,494和369个微生物类群。反渗水水样在门、纲、目、科、属的OTU数均明显高于自来水和软化水水样;其Chao1和ACE丰富度估计指数最高,表明群落中实际存在的物种数最多。分类组成分析反渗水水样从科、属分类上约58.92%为假单胞菌科,58.90%为假单胞菌属;26.41%为莫拉菌科,26.23%为莫拉菌属;4.73%为普氏菌属。结论二代测序技术反映了血液透析水处理系统水样中微生物的多样性和丰度,传统微生物培养方法的局限性使其严重低估了反渗水中细菌数量及菌群结构,使透析用水污染引起透析患者微炎症反应被忽视。     

基于16S rRNA测序分析肺脾两虚型慢性阻塞性肺疾病大鼠模型肠道菌群的特点

目的 基于16S rRNA基因测序技术分析肺脾两虚型慢性阻塞性肺疾病(COPD)大鼠模型肠道菌群的特点。方法 Wistar大鼠30只,随机分为空白对照组、模型组,每组各15只。模型组以烟熏法+冰冷番泻叶浸液灌胃法建立肺脾两虚型COPD模型,造模后收集两组大鼠粪便,行肠道菌群16S rRNA测序,分析肠道菌群结构、多样性和丰度变化。结果 基于操作分类单位(OTU)的韦恩图结果显示,模型组较空白对照组的OTU数量下降;菌群结构分析显示,空白对照组以厚壁菌门为主,模型组以拟杆菌门为主;属水平上空白对照组以厚壁菌门中的乳杆菌数量最多,模型组拟杆菌数量最多,乳杆菌数量较空白对照组下降。主坐标分析(PCoA)分析表明两组在菌群组成上存在差异,在门水平上,与空白对照组比较,模型组放线菌门下降,变形菌门和脱硫菌门上升;在属水平上,与空白对照组比较,模型组拟杆菌属、罗姆布茨菌属、毛螺杆菌属及副拟杆菌属上升,普雷沃氏菌属、梭菌属、布氏菌属和瘤胃球菌下降。菌群扩增子α多样性分析显示,模型组香农(shannon)指数和丰富度实际观测值(sobs)指数均低于空白对照组。结论 肺脾两虚型COPD模型大鼠较正常大鼠...     

尘肺病患者下呼吸道菌群结构特征研究

目的探索尘肺病患者及接尘者下呼吸道菌群组成, 进一步比较分析两者菌群差异及菌群间的关联。方法于2020年5月至2021年1月, 通过前瞻性多中心横断面研究, 选取同期就诊于联勤保障部队第九二〇医院呼吸与危重症医学科和昆明市同仁医院呼吸内科, 行支气管肺泡灌洗治疗的尘肺病患者及接尘者人群。共纳入24例尘肺病患者(尘肺病组), 以16例接尘者(接尘组)为对照, 收集2组患者肺泡灌洗液, 利用16SrRNA基因V3-V4测序技术及生物信息分析平台, 测定并分析其微生物结构组成差异及菌群间的关联。结果与接尘组比较, 尘肺病组患者肺泡灌洗液门水平菌群丰度排名前5的菌门相同, 依次为:变形菌门、厚壁菌门、拟杆菌门、梭杆菌门、放线菌门。与接尘组比较, 尘肺病组患者属水平菌群丰度排名前5的菌属不同, 接尘组分别为:假单胞菌属、普氏菌属、链球菌属、无色杆菌属、奈瑟氏菌属, 尘肺病组分别为:假单胞菌属、无色杆菌属、链球菌属、罗尔斯通菌属、普氏菌属。Alpha多样性分析结果显示, 与接尘组比较, 尘肺病组患者菌群多样性有差异(P<0.05), 菌群均匀度差异无统计学意义(P>0.05);β多样性...     

复发性流产患者生殖道菌群特征的初步研究

目的：分析和比较正常早孕女性和复发性流产（recurrent spontaneous abortion,RSA）患者的生殖道菌群特征。方法：选取2021年3—9月在我院拟行清宫术的37例RSA患者为RSA组,同期拟行人工流产术的25例正常早孕女性为正常早孕组。对其阴道分泌物及子宫蜕膜组织进行16S rRNA测序,比较2组阴道和宫腔菌群的特征及差异。结果：与正常早孕女性相比,RSA患者阴道菌群多样性显著增多（P<0.05）,个体间菌群结构相似度较低,但优势菌未改变,仍为乳杆菌属,而乳杆菌属丰度显著降低（P<0.05）,且加德纳菌属、普雷沃菌属、巨型球菌属、李斯特菌属和厌氧球菌属丰度显著增加（P<0.05）;RSA患者宫腔菌群多样性及个体间菌群结构相似度无显著变化（P>0.05）,但优势菌种发生改变,正常早孕女性宫腔优势菌种为卷曲乳杆菌,RSA患者宫腔优势菌种为惰性乳杆菌,RSA患者宫腔菌群中两歧双歧杆菌和不能培养的不动杆菌丰度显著减少（P<0.05）,而拟杆菌属、大肠埃希菌/志贺菌属和瘤胃菌属团显著增加（P<0.05）。结论：正常的阴道和宫腔存在微生物菌群,宫腔比阴道的菌群多样性更高,但宫腔优势菌丰度较低。阴道细菌的上行定植可能与宫腔菌群的形成存在一定的相关性。而宫腔特有菌群的存在,尤其是宫腔优势菌种的改变和致病菌的出现,可能与RSA的发生相关。     

基于16SrDNA测序的肥胖儿童肠道菌群变化分析

目的 通过16SrDNA测序研究肥胖儿童肠道微生物的组成及变化特点,为后期相关研究奠定基础。方法 于2017年4月-2018年4月选取肥胖儿童及正常体重儿童共59例,收集粪便,采用16SrDNA扩增子测序的方法检测儿童肠道菌群组成。结果 肥胖组儿童和正常体重组儿童的肠道微生物多样性差异无统计学意义(P>0.05),但分布规律和数量差异有统计学意义(P<0.05)。在门水平中厚壁菌门、拟杆菌门、放线菌门是儿童肠道微生物群落中最丰富的菌群。其中疣微菌门数量在正常体重组显著高于肥胖组儿童。在属水平,发现多尔氏菌数量在肥胖组儿童肠道内显著高于正常体重组儿童,嗜黏蛋白阿克曼氏菌数量在正常体重组儿童显著高于肥胖组儿童。结论 肠道菌群分布规律和数量的改变与肥胖的发生有密切联系。     

基于16S rRNA高通量测序技术的妊娠期和非妊娠期妇女口腔菌群差异研究

目的使用16S rRNA基因高通量测序技术分析妊娠期和非妊娠期妇女口腔菌群的差异。方法选择2019年11月—2020年11月定期在新疆医科大学第一附属医院产科就诊的10例25~35岁妊娠晚期(孕29~39周)妇女(妊娠期组)和10名非妊娠期女性健康志愿者(非妊娠期组)为研究对象,采集所有研究对象的牙菌斑样本,提取牙菌斑菌群总DNA,进行扩增,并采用16S rRNA基因高通量测序技术分析菌群多样性和菌群丰度。结果妊娠期组的Chao1指数、Observed-species指数、PD-whole-tree指数、Shannon指数分别为(5.50±0.36)、(5.70±0.48)、(5.50±0.36)、(12.35±3.78);非妊娠期组的Chao1指数、Observed-species指数、PD-whole-tree指数、Shannon指数分别为(15.50±4.63)、(15.30±4.42)、(15.50±4.63)、(8.65±1.57)。妊娠期组的Chao1指数、Observed-species指数、PD-whole-tree指数均低于非妊娠期组,差异均有统计学意义(均P<0.05);妊娠期组的Shannon指数高于非妊娠期组,但差异无统计学意义(P>0.05)。不同分组的口腔菌群组成在操作分类单元(OTU)水平有明显差异。梭杆菌门、拟杆菌门、厚壁菌门、变形菌门及放线菌门是两组口腔菌群共有的优势菌门。链球菌属、奈瑟菌属及卟啉单胞菌属在非妊娠期组表现出丰度高于妊娠期组的趋势,而妊娠期组普雷沃菌属的相对丰度高于非妊娠期组,罗氏菌属及放线菌属在两样本中表现出较低的丰度值。结论妊娠晚期妇女口腔菌群物种丰度和物种均匀度呈现降低的趋势,可为后期深入研究与妊娠相关的口腔微生态失调的病因学提供依据,并为预测妊娠期并发症的危险因素提供一种潜在的非侵入性指标。     

加氏乳杆菌Y20对高胆固醇大鼠模型的降胆固醇效果及对肠道菌群和肝脏代谢的影响

目的评价加氏乳杆菌Y20对高胆固醇大鼠模型的降胆固醇效果,并探究其潜在机制。方法 30只SPF级SD雄性大鼠按体重随机分为3组:空白对照组、高胆固醇模型组和加氏乳杆菌Y20干预组,空白对照组饲喂基础饲料,高胆固醇模型组和Y20干预组饲喂高胆固醇饲料,2周后Y20干预组在饮水中添加3×10~8 CFU/mL加氏乳杆菌Y20,干预5周。实验结束后,采集血清,使用酶联免疫吸附法检测血脂指标。采集大鼠粪便,提取DNA进行16S rRNA扩增子测序分析。采集大鼠肝脏,使用高效液相色谱法进行非靶向代谢物分析。结果加氏乳杆菌Y20干预组大鼠血清甘油三酯(P0.05)和低密度脂蛋白(P0.01)的浓度低于高胆固醇模型组,高密度脂蛋白浓度高于高胆固醇模型组(P0.05)。高胆固醇饲料会引起大鼠肠道菌群多样性(P0.01)和丰富度降低,而Y20干预可以部分恢复高胆固醇大鼠的肠道菌群多样性(P0.05或P0.01)。高胆固醇饲料引起的肠道菌群改变主要集中在厚壁菌门、脱铁杆菌门、疣微菌门和变形菌门,增加阿克曼菌属、梭状芽孢杆菌_III属和梭状芽孢杆菌_XIVb属的相对丰度(P0.05),降低Intestinimonas属的相对丰度(P0.05),Y20的干预能够逆转这些细菌的相对丰度(P0.05),使之接近正常水平。3组大鼠肝脏代谢谱分为3群,高胆固醇模型组与空白对照组相比,胆汁酸代谢物(如牛磺胆酸、牛磺去氧胆酸等)的相对丰度,以及芥酸酰胺和2,6-二氧(4-14-C)-1,2,3,6-四氢-4-嘧啶羧酸等代谢物的相对丰度,差异有统计学意义。Y20干预组与模型组相比,只有芥酸酰胺和2,6-二氧(4-14-C)-1,2,3,6-四氢-4-嘧啶羧酸的相对丰度差异有统计学意义,且相对丰度的水平接近空白对照组。结论加氏乳杆菌Y20可以有效降低高胆固醇大鼠模型的血脂水平,改善高胆固醇大鼠肠道菌群的多样性和菌群结构,影响大鼠的肝脏代谢水平。     

不同月龄、性别、分娩方式对婴儿肠道菌群差异性分析

目的探讨不同因素(月龄、性别、分娩方式)对婴幼儿肠道菌群初期构建(前1000d)的影响,为婴幼儿科学喂养提供依据。方法采集陕西地区健康婴幼儿36份粪便样本,利用高通量测序技术进行16Sr DNA测序检测,分析主要菌群差异性。结果 (1)随着月龄增加,菌群丰度增加,0～6月龄组婴儿肠道菌群中门水平Actinobacteria和Firmicutes相对丰度之和均大于82%,0～6、6～12月龄组在门水平相对丰度最高的均是Actinobacteria,对应的丰度分别为56.58%、59.00%,无显著性差异,而12～36月龄组中相对丰度最高的是Firmicutes,占60.66%;(2)相同性别、不同分娩方式的婴幼儿在0～6、6～12月龄组中菌群构成在门水平上无差异,而在12～36月龄组存在显著差异,女性幼儿肠道菌群在门水平上存在显著性差异的菌群是拟杆菌门,且其在顺产组丰度显著高于剖腹产组;(3)性别对0～6、6～12月龄组婴幼儿肠道菌群影响不明显,但对12～36月龄组有显著影响,代表菌群是拟杆菌门,且在女婴组丰度显著高于男婴组。结论受试婴儿在属水平上已显示出丰富的菌群多样性,不同月龄对婴幼儿肠道菌群初期构建影响明显,在0～6、6～12月龄组中分娩方式、性别因素对婴幼儿肠道菌群构建影响不明显。[营养学报,2019,41(4):352-357,362]     

妊娠期高血压患者肠道菌群分布及其与血清HtrA3、25(OH)D水平的关系

目的 探讨妊娠期高血压患者肠道菌群分布特征及其与血清丝氨酸蛋白酶A3(HtrA3)、25羟基维生素D[25(OH)D]水平的相关性。方法 选取2021年5月至2023年5月期间在本院就诊的106例妊娠期高血压患者作为研究组,选取同期体检健康的妊娠孕妇98例作为对照组;同时收集整理其临床特征资料。采用16s rDNA测序技术检测两组肠道菌群,并比较两组肠道菌群多样性及其相对丰度;采用ELISA法检测两组血清HtrA3、25(OH)D水平;采用Pearson法分析妊娠期高血压患者肠道菌群与血清HtrA3、25(OH)D水平的相关性。结果 与对照组相比,研究组Chao1指数、Ace指数、Shannon指数明显降低,Simpson指数明显升高(Z值介于2.462～5.163之间,均P<0.05)。门水平上,与对照组相比,研究组厚壁菌门、拟杆菌门、放线菌门菌群相对丰度明显降低(t值介于2.976～10.722之间),变形菌门相对丰度明显升高(t=2.569);属水平上,乳杆菌属、双歧杆菌属、毛螺菌属、Rikenellaceae属、真杆菌属相对丰度明显降低(t值介于2.344～11.277之...     

正常人群乙状结肠组织和粪便中菌群分布格局

目的研究正常人群粪便和乙状结肠样本中的菌群种属分布特点。方法采用16sDNA测序技术对13例新鲜粪便样本及10例乙状结肠黏膜样本菌群分布进行鉴定,并对其差异及特定的菌群进行分析。结果粪便样本中的菌群多样性和丰度均高于乙状结肠黏膜组织,差异有统计学意义（P〈0．001,P〈0．001,P=0．042,P=0．006）。门水平菌群类别相同,包括厚壁菌门、拟杆菌们、变形菌门和放线菌门,但含量不同,粪便样本厚壁菌门和拟杆菌们显著高于乙状结肠黏膜组织,而变形菌门则显著低于乙状结肠黏膜组织,差异有统计学意义（P〈0．001,P=0．025,P〈0．001）。在属水平,粪便菌群以Faecalibacterium菌和拟杆菌属为主,乙状结肠黏膜组织以假单胞菌属、乳球菌属、不动杆菌属和黄杆菌属为主。两组中双歧杆菌、乳酸杆菌等益生菌数量均较低。结论粪便样本和乙状结肠黏膜组织中菌群分布差异明显。     

妊娠期母体使用抗生素和益生菌对后代小鼠肠道发育和肠道菌群的影响

目的 探究妊娠晚期使用头孢曲松和两歧双歧杆菌TMC3115对断乳期小鼠肠道上皮组织发育及肠道菌群构建的影响。方法 24只妊娠10～13 d BALB/C小鼠随机分为对照组、头孢曲松组和TMC3115组(n=8)。妊娠期小鼠分别每日用生理盐水、头孢曲松(30 mg/d)、TMC31115菌悬液（含菌量为109 CFU/d）灌胃至分娩，新生小鼠由母鼠母乳喂养至断乳期（PND21）。采用HE染色观察小鼠结肠绒毛和隐窝深度；RT-PCR法检测各组小鼠肠道上皮组织发育相关蛋白(Ki67、Muc2)和紧密连接蛋白（ZO-1、Claudin-1、Claudin-2、Occludin）表达;二代测序法分析小鼠肠道菌群组成。结果 和对照组和头孢曲松组相比，TMC3115组小鼠的结肠隐窝深度、KI67 mRNA表达量显著(P<0.05)升高。TMC3115组小鼠紧密连接蛋白Occludin mRNA表达量也显著高于对照组(P<0.05)。对照组和TMC3115组肠道菌群中厚壁菌门相对丰度，头孢曲松组拟杆菌门相对丰度最高。和头孢曲松组相比，TMC3115组厚壁菌门和乳杆菌属相对丰度显著升高(P&...     

反复种植失败患者阴道菌群特征研究

目的：探讨反复种植失败（repeated implantation failure,RIF）患者的阴道菌群特征。方法：纳入49例接受冻融胚胎移植（frozen-thawed embryo transfer,FET）患者。其中观察组患者（n=29）有RIF病史且本次FET周期妊娠失败;对照组患者（n=20）首次行FET且成功妊娠。2组均采取人工周期准备内膜、移植第5天优质囊胚。于FET日收集患者阴道分泌物,通过16S rRNA测序对2组阴道菌群多样性、群落组成以及差异菌属进行分析。用受试者工作特征（receiver operating characteristic,ROC）曲线评估阴道乳杆菌属丰度诊断RIF的效能。结果：α多样性分析显示,观察组阴道菌群多样性（Shannon指数：P=0.049 8）和丰富度（Chao指数：P=0.0471）均显著高于对照组。β多样性分析显示,2组阴道菌群结构差异有统计学意义（P=0.016）。在属水平上,2组阴道的优势菌均为乳杆菌属,与对照组相比,观察组乳杆菌属丰度显著降低,而不动杆菌属和假单胞菌属丰度显著增加（LDA>3,P<0.05）。阴...     

复发性流产患者阴道菌群特征

目的：分析复发性流产（recurrent spontaneous abortion,RSA）患者阴道菌群特征。方法：采集2020年12月—2021年9月就诊于山西省妇幼保健院的20例不明原因RSA患者（RSA组）和20例正常早孕人工流产患者（对照组）的阴道分泌物,采用16S rRNA高通量测序技术分析2组患者阴道菌群的差异。结果：α多样性分析显示,2组Chao1指数、Shannon指数、Observed_OTU指数比较,差异无统计学意义（均P>0.05）。β多样性分析显示,2组阴道细菌群落结构显著不同（P<0.05）。分类学分析显示,在门、科、属水平,2组共同的优势菌为假单胞菌（变形菌门）,假单胞菌在RSA组中门、科、属水平的丰度分别为22.8%、21.9%、21.9%,在对照组中的丰度分别为17.9%、17.3%、17.3%,RSA组假单胞菌的丰度明显增加。结论：RSA患者存在阴道菌群失衡,特定菌属（如假单胞菌）可能与RSA发生、发展有关。     

湿疹儿童肠道菌群特征及与病情的相关性

目的探讨湿疹儿童肠道菌群特征及其与病情的相关性。方法选取2021年8月—2023年2月杭州市第三人民医院收治的湿疹患儿90例为观察组,同时选取同期健康体检的90例儿童为对照组,采集受试者新鲜成形粪便通过16S rDNA基因测序测定肠道菌群,对比两组肠道菌群特征(物种组成、菌落多样性)。采用湿疹面积和严重程度评分(EASI)评价观察组病情情况,采用Spearman相关性分析湿疹儿童肠道菌群特征与病情的相关性。结果采用16S rDNA基因测序对180例粪便菌群样本分析,最终得到有效数据1868163条。根据OTU聚类结果,以97%相似度下导出两组共有OTU 1967个,观察组特有836个,对照组特有667个。观察组Alpha多样性包括Shannon指数(5.72±0.33)、Simpson指数(0.95±0.03)、Chao1指数(2421.26±500.26)、ACE指数(1635.26±325.74)与对照组(5.78±0.31)、(5.78±0.31)、(2515.26±400.25)、(1706.68±334.68)比较差异无统计学意义(P>0.05),观察组Unweighted Unifrac距离(0.31±0.10)与对照组(0.46±0.13)比较差异有统计学意义(P<0.05);物种组成分析显示:观察组和对照组在门水平上以厚壁菌门占28.89%、拟杆菌门占26.67%、变形菌门占22.22%、放线菌门占11.11%为主,属水平上以布劳特氏菌占25.00%、拟杆菌占23.89%、粪杆菌占21.67%和双歧杆菌占14.44%为主,门水平和属水平相对丰度差异无统计学意义(P>0.05);LEfSe分析显示,观察组和对照组共芽孢杆菌纲(Bacilli)、乳杆菌目(Lactobacillales)、粪芽孢菌属(Coprobacillus)3个显著差异物种;相关性分析显示:粪杆菌、瘤胃球菌相对丰度与湿疹儿童EASI评分呈正相关(P<0.05)。结论湿疹儿童与健康儿童在肠道菌群构成上具有差异,芽孢杆菌纲、乳杆菌目及粪芽孢菌属可能参与儿童湿疹发病机制,且瘤胃球菌、粪杆菌相对丰度与湿疹儿童病情有关。     

结直肠癌发生与肠道菌群的相关性研究

目的 探索结直肠癌发生与肠道菌群的相关性。方法 分别收集在四川地区长期生活的33例结直肠癌患者（结直肠癌组）和33例健康人群（对照组）的粪便，采用16S rRNA测序分析比较两组人群粪便肠道菌群差异。结果 结直肠癌组患者Shannon指数较健康人低（P<0.05），而ACE指数、Chao指数、Observed species指数和Simpson指数均无统计学差异（P>0.05）。在门水平上结直肠癌组患者厚壁菌门（P<0.001）、放线菌门（P<0.01）降低，梭杆菌门（P<0.01）、疣状菌门（P<0.01）升高。在属水平上结直肠癌组患者毛螺菌属、瘤胃球菌、粪球菌、霍氏真杆菌等相对丰度降低（P<0.01或0.05）,UBA1819、毛螺菌科UCG.010、副拟杆菌属、另枝菌属等相对丰度升高（P<0.01或0.05）。属水平肠道菌群与血红蛋白的相关性分析显示，结直肠癌组患者多尔菌属与血红蛋白呈负相关。结论 四川地区结直肠癌患者肠道菌群多样性减少，呈现有益菌较少、有害菌增多的特征，其发生可能与副拟杆菌属、另枝菌属、颤螺科UCG.002等有关。...