筛选CD4结合蛋白的酵母双杂交饵载体构建及功能鉴定

目的构建用于筛选人CD4结合蛋白的酵母双杂交饵载体,并对其功能进行鉴定.方法RT-PCR扩增编码CD4的cDNA.构建双杂交饵载体pAS2-1-CD4,并转化入宿主酵母菌Y190中.通过测定报告基因——β-半乳糖苷酶的活性,判断饵载体自激活报告基因能力.将CD4的已知HIV配体gp120构建入猎物载体pACT2,转入重组菌Y190/pAS2-1-CD4.检测其报告基因活性,鉴定pAS2-1-CD4是否具有筛选CD4结合蛋白的能力.结果DNA序列测定证实,获得了编码CD4蛋白的cDNA序列.β-半乳糖苷酶活性测定表明,pAS2-1-CD4单独无自激活能力,与猎物载体pACT2-gp120能够发生相互作用,激活报告基因表达.结论构建了酵母双杂交饵载体pAS2-1-CD4,为筛选CD4结合蛋白（尤其是筛选病毒编码的CD4配体）,提供了技术平台.     

甲型H3N2流感病毒截短型PB1-F2蛋白与宿主蛋白的相互作用的初步研究

目的利用酵母双杂交技术研究甲型H3N2流感病毒截短型PB1-F2蛋白与人类宿主蛋白的相互作用,为该病毒蛋白的功能研究和致病机制提供理论依据。方法以本实验室分离和鉴定的甲型H3N2流感病毒A／Guangdong／7028／2010为模版,构建pGBKT7-PB1-F2重组载体,利用Y2HGold酵母双杂交系统,从人类通用cDNA文库中筛选与其相互作用的蛋白。结果成功构建含诱饵蛋白基因的pGBKT7-PB1-F2重组载体,转化酵母自激活和毒性实验显示为阴性：酵母双杂交实验显示Y2HGold和Y187酵母的结合率为5．22％,符合实验要求;经筛选和验证后,得到3个与截短型PB1-F2蛋白有相互作用的阳性克隆,分别为钾／钠ATP酶B1亚基、热休克蛋白40和白介素-2受体1亚基。结论初步推断截短型H3N2流感病毒PB1-F2蛋白可能影响流感病毒在宿主细胞中的复制功能和凋亡调控。     

通过配体文库研究GIPC2 PDZ配体结合特点及其相互作用蛋白

目的通过验证性筛选配体文库,获得GIPC2 PDZ结构域的配体结合特点,进而找到GIPC2的相互作用蛋白。方法 1)利用酵母双杂交的方法从已有的PDZ配体库中寻找与GIPC2的PDZ结构域配体结合特性;2)根据GIPC2的亚细胞定位和肿瘤相关功能再结合PDZ结构域结合序列的共同特征在蛋白质数据库中预测GIPC2的天然潜在配体;3)将天然潜在配体的C末端序列依次与GIPC2 PDZ结构域或GIPC2全长进行验证反应,从而得到阳性蛋白。结果 1)GIPC2 PDZ结构域的配体结合特性是C末端最后4个氨基酸为-X-S/T-X-V/L/I,是Ⅰ类PDZ配体;2)综合GIPC2的生物学特征和GIPC2 PDZ结构域的配体结合特点,在蛋白质数据库中预测得到47个天然潜在配体;3)将天然潜在配体的C末端序列克隆至酵母双杂交系统进行验证,最后得到10个确定的阳性蛋白。结论获得10个GIPC2相互作用蛋白。     

应用酵母双杂交系统筛选人胃黏膜上皮组织SHIP2的相互作用蛋白

目的通过酵母双杂交系统筛选人胃黏膜上皮组织标准均一化cDNA文库,寻找与含Src同源蛋白2肌醇-5-磷酸酶2(SHIP2)相互作用的蛋白。方法利用酵母双杂交系统,以SHIP2的P1(SH2+5-Ptase)和P2(PRD+SAM)段作为诱饵蛋白,筛选出人胃黏膜上皮组织均一化cDNA文库中与SHIP2相互作用的蛋白,并通过免疫共沉淀法进行验证。结果挑选出39个阳性克隆,经测序比对分析,回复性杂交,免疫共沉淀试验验证,最终确定一个与SHIP2相互作用的蛋白抗增殖蛋白1(prohibitin1/PHB)。结论酵母双杂交系统筛选人胃黏膜上皮组织SHIP2的相互作用蛋白PHB。     

人类14-3-3ζ和GCH1蛋白相互作用的初步研究

目的 寻找人类14-3-3ζ蛋白的相互作用蛋白,为进一步揭示14-3-3ζ的作用机理提供线索.方法 以14-3-3ζ为"诱饵",利用酵母双杂交系统筛选人脑cDNA文库得到"猎物"蛋白,通过GST pulldown技术和哺乳动物细胞内免疫共沉淀技术验证14-3-3ζ和"猎物"蛋白的特异性结合.结果 首次利用酵母双杂交cDNA文库筛选技术发现了14-3-3ζ能够与GTP环化水解酶Ⅰ(GTP cyclohydrolase 1,GCH1)相互作用,并通过了体内和体外的蛋白质结合实验证实了这两个蛋白质之间的特异性相互作用.结论 发现并验证了14-3-3ζ与GCH1之间的蛋白质相互作用,为进一步深入研究这两种蛋白质的功能及所引起的相关疾病的发病机理提供了新的线索.     

酵母双杂交技术筛选NECL1胞内区的结合蛋白

目的 筛选人源膜表面黏附分子NECL1蛋白胞内区相互作用蛋白。 方法 构建含人NECL1蛋白胞内区氨基酸编码序列的诱饵质粒pGBKT7-NECL1C,对人胎脑cDNA文库进行酵母双杂交筛选。用GST pull down实验进行体外蛋白相互作用的验证。结果 酵母双杂交阳性克隆测序后显示共存在9段不同序列（存在重复克隆）。比对氨基酸序列得到5个可能相互作用蛋白。通过GST pull down 实验验证了其中两个蛋白与NECL1胞内区的相互作用。结论 应用酵母双杂交系统,获得了一些候选的NECL1胞内区相互作用蛋白。     

人血管内皮生长因子受体Flt-1胞外区2-3loop在Pichia.pastoris酵母中的表达、纯化及其生物学活性研究

目的研究人Flt-1胞外区2-3loopcDNA在Pichia.pastoris酵母中的表达,获得高效表达的具有生物学活性的重组Flt-1(2-3)。方法采用PCR扩增Flt-1(2-3)基因,经DNA序列分析后,插入含AOX1启动子和α分泌信号肽序列的Pichia.pastoris酵母表达载体中,构建重组质粒pPIC9K/Flt-1(2-3),转化酵母宿主菌GS115,筛选His     

抗人Flt-1单克隆抗体的制备和活性鉴定

目的:制备小鼠抗人血管内皮生长因子受体-1(Flt-1)的单克隆抗体(mAb),并鉴定其免疫学特性。方法:以重组人Flt-1胞外Ⅲ区蛋白为抗原,通过经典的杂交瘤制备和活性筛选方法建立能稳定分泌抗Flt-1蛋白的mAb杂交瘤细胞株。结果:经传统的小鼠腹水型抗体的制备和纯化方法获得了高纯度的抗人Flt-1胞外Ⅲ区蛋白的mAb。ELISA方法测定出该抗体的免疫球蛋白亚型为IgG1,轻链为κ链。West-ern blot结果显示该抗体能特异性地识别重组人Flt-1胞外Ⅲ区蛋白,FACS结果表明该抗体能结合到Flt-1阳性的脐静脉内皮细胞和K562/A02细胞表面,并呈现出抗体浓度依赖性。结论:成功建立了1株能够稳定分泌抗重组人Flt-1胞外Ⅲ区蛋白的mAb细胞株XA12,为今后进一步开展Flt-1及其胞外Ⅲ区蛋白的生物学功能研究以及基因工程抗体研究奠定了基础。     

整合素及其信号传导通路

整合素是位于细胞表面的重要黏附分子,通过其双向信号传导通路,介导细胞与细胞外基质及细胞与细胞间的黏附。整合素由胞外域、跨膜域和胞内域3部分组成。胞内域与细胞内信号分子结合,启动胞内-胞外信号传导激活整合素,提高与相应配体亲合力。而胞外域与相应配体结合后,通过胞外-胞内信号传导,调节细胞生存、增殖、黏附、分化功能。近年研究显示,整合素结构功能及信号传导通路异常与多种疾病有关。     

应用酵母双杂交技术筛选干扰素β结合蛋白的研究

目的 应用酵母双杂交技术筛选干扰素β（IFNp）结合蛋白。方法 用多聚酶链反应（PCR）技术扩增IFNB基因，连接酵母表达载体pGBKT7构建诱饵质粒，转化酵母细胞AH109，与含人肝细胞cDNA文库质粒的酵母细胞Y187进行配合，在营养缺陷型培养基（SD／-Trp-Leu-His-Ade）和X-α-半乳糖（X-α-gal列）上进行双重筛选阳性克隆，提取酵母质粒后转化大肠埃希菌（DH5α）并经氨苄西林抗性筛选，提取单克隆菌落质粒，进行酶切鉴定及序列测定，并进行生物信息学分析。结果 应用酵母双杂交技术筛选出阳性克隆29个，经生物信息学分析，排除读码框架不正确者，最后得到19个克隆基因，编码14种已知蛋白和一种未知功能蛋白。初步发现铁蛋白与IFNB具有结合作用。结论 应用酵母双杂交技术筛选出多种与IFNB具有结合作用的蛋白。     

人gp130结合分子与TLE1分子通过同源的Q结构域相互作用

目的：确定人gp130结合分子（GAM）与transducin lide enhancer of split 1(TLE1)分子间是否存在相互作用及相互作用的结构基础，以深入研究这两种分子的功能。方法：扩增编码GAM与TLE1分子不同结构域的cDNA，构建含有这些不同结构域的酵母双杂交载体，通过酵母双杂交系统分析和免疫共沉淀试验，研究这两种分子间的相互作用。结果：DNA序列测定证实成功构建了含GAM与TLE1分子不同结构域的酵母双杂交载体，酵母双杂交分析表明GAM与TLE1分子通过氨基端的Q结构域相互结合，免疫共沉淀试验证实了这一发现。结论：证实GAM与TLE1分子通过氨基端的Q结构域相互结合。     

人CASK/LIN-2下游信号分子的初步研究

目的：揭示人类新基因ＣＡＳＫ／ＬＩＮ－２的生物学功能,运用酵母要效ＬｅｘＡ系统寻找与ｈＣＡＳＫ的鸟苷酸激酶结构域（ｇｕａｎｙｌａｔｅ ｋｉｎａｓｅ ｄｏｍａｉｎ－ｌｉｋｅ,ＧＫ）相互作用的蛋白信号分子。方法：将ｈＣＡＳＫ的ＧＫＤＮＡ片段亚克隆ｐＬｅｘＡ融合表达质粒,得到的重组质粒ｐＬｅｘＡ－ＧＫ转化酵母ＥＧＹ４８。经证实该重组质粒无转录活性并能进入胞核,结合ＬｅｘＡ操纵基因。将人胎脑文库质粒转化ＥＧＹ４８（ｐＬｅｘＡ－ＧＫ,ｐ８０ｐ－ｌａｃＺ）,在Ｇａｌ／Ｒａｆ ｈｉｓ－ｔｒｐ－ｕｒａ－ｌｅｕ－和Ｇａｌ／Ｒａｆ ｈｉｓ－ｔｒｐ－ｕｒａ－Ｘ－ｇａｌ条件下筛选ｌｅｕ＋和ｌａｃＺ＋酵母克隆,提取上述阳性酵母质粒转化大肠杆菌ＫＣ８,分离出文库质粒;再将这些文库质粒转化ＥＧＹ４８（ｐＬｅｘＡ－ＧＫ,ｐ８０ｐ－ｌａｃＺ）,     

应用酵母双杂交系统筛选与乙型流感病毒BM2相互作用的蛋白质

目的　筛选与乙型流感病毒BM2蛋白相互作用的蛋白质。方法　应用酵母双杂交系统,以BM2 (2 6 10 9)插入载体pGBKT7作为诱铒,在四缺培养基上筛选人KidneyMATCHMAKERcDNA文库,寻找与BM2蛋白相互作用的宿主蛋白。结果　筛选得到6个阳性AD 文库质粒,并用酵母双杂交实验验证了阳性AD 文库质粒与BM2的相互作用。将阳性AD 文库质粒测序并对测序结果做BLAST分析,发现它们分别是N 乙酰神经氨酸酶丙酮酸裂解酶,Angiopoietin 3、锌指蛋白2 5 1、核糖体蛋白S2 0、蛋白精氨酸N 甲基转移酶1(PRMT)、转录因子样1(TCFL1)。结论　BM2能与这些转录翻译功能相关的蛋白质相互作用,表明BM2蛋白在病毒生活周期中发挥重要作用。     

癌基因TRE17与肌钙蛋白C2相互作用的鉴定

目的：寻找癌基因TRE17的结合蛋白。 方法： 分别构建了TRE17/pGBKT7和TRE17(447)/pGBKT7诱饵质粒，用酵母双杂交技术筛选了人骨骼肌cDNA表达文库，并用GST-Pulldown分析进一步观察了癌基因TRE17与其结合蛋白之间的作用。 结果： 酵母双杂交分析提示，癌基因TRE17可能结合6种靶蛋白，包括pur alpha、肌球蛋白轻链2、乳酸脱氢酶A和肌钙蛋白C2等，其中，仅肌钙蛋白C2能够既结合全长的癌基因TRE17，又结合仅编码TRE17氨基端447个氨基酸的TRE17(447)。GST-Pulldown分析表明TRE17(447)明显结合肌钙蛋白C2，而不是阴性对照GST。 结论： 肌钙蛋白C2能特异性结合癌基因TRE17，为进一步研究TRE17的恶性转化机制提供了新的线索。     

HBV Pre S1蛋白在酵母细胞中的转录激活功能

目的 探索应用双杂交体系统克隆与乙型肝炎病毒（HBV）Pre S1蛋白结合的肝细胞受体的可行性。方法 构建编码HBV Pre S1全序列或部分序列与酵母蛋白GAL 4 DNA结合区域融合蛋白的酵母表达质粒，应用这些质粒转化酵母报道菌株SFY526，检测β－半乳糖苷酶活性作为酵母中转录激活的指标。构建编码Pre S1全序列与GAL4 DNA结合区域融合蛋白的哺乳动物细胞表达质粒，与CAT报道质粒共转染肝癌细胞系Huh-7，使用薄层层析法检测细胞提取物的氯霉素乙酰转移酶活性。结果 全序列Pre S1蛋白与GAL4 DNA结合区域的融合蛋白在酵母细胞中呈现转录激活功能，其转录激活序列被定位于Pre S1第21－47氨基酸之间。全序列Pre S1蛋白与GAL 4 DNA结合区域的融合蛋白在哺乳动物细胞中未呈现转录激活功能。结论 HBV Pre S1蛋白在酵母细胞中的转录激活功能，限制了研究人员应用酵母双杂交体系统克隆与Pre S1结合的HBV受体。然而，Pre S1蛋白在哺乳动物细胞未呈现转录激活功能。哺乳动物细胞双杂交体系统可能是克隆与Pre S1蛋白作用的肝细胞受体的可行途径。     

HCV核心蛋白结合蛋白基因6的克隆

目的：克隆与丙型肝炎病毒（HCV）核心蛋白结合的肝细胞中的未知蛋白基因。方法：应用酶母双杂交系统，构建丙型肝炎病毒核心蛋白诱铒质粒，转化酵母AH109后与含文库质粒的酵母Y187进行配合，在营养缺陷培养基上进行双杂交筛选。筛选出30个克隆，既能在四缺营养缺陷培养基上生长(SD/Trp-Leu-Ade-His）又能在涂有x-α-gal的四缺培养平皿上长出蓝色菌落，提取此酵母克隆的质粒，转化大肠埃希菌后进行测序，进行生物信息学分析。结果：分析结果显示，其中6号克隆的测序结果与Genbank中的2个未知功能序列有98％的同源性，初步证明了此基因与丙型肝炎病毒核心蛋白有结合性。结论：丙型肝炎病毒核心蛋白结合蛋白肝基因克隆成功。     

Structural and functional analysis of the origin of replication of mitochondrial DNA from Paramecium aurelia

Summary Replication of mitochondrial DNA in Paramecium aurelia involves the formation of a covalent crosslink at one end of this linear molecule and proceeds unidirectionally, producing a dimer consisting of two head to head monomers. The initiation regions within the dimer molecules have been sequenced and shown to be palindromic except for a central nonpalindromic A+T rich sequence, arranged in direct tandem repeats. This nonpalindromic region (see accompanying paper) has been identified as the cross-link which converts the initiation terminus into a continuous sequence. In this study, yeast transformation was used to assay the dimer initiation regions of P. aurelia mtDNA for the presence of autonomously replicating sequences. P. aurelia mtDNA fragments from species 1 and 4 were cloned into the yeast vector YIP5 and the hybrid plasmids (YPaM) were used to transform yeast. The dimer initiation regions from both species promoted high frequency transformation and extrachromosomal maintenance of YPaM plasmids. Subcloning analysis of the ARS-containing mtDNA fragments indicates, specifically, that the nonpalindrome, repetitive sequences are responsible for the autonomously replicating properties of YPaM plasmids.     

Cloning and characterization of cDNAs for two distinct tumor necrosis factor receptor superfamily genes from Japanese flounder Paralichthys olivaceus

Tumor necrosis factor receptor (TNFR) superfamily regulates diverse biologic functions, including cell proliferation, differentiation, and survival, in addition to providing costimulatory signals for programmed cell death or apoptosis. In this study, cDNA fragments for two distinct TNFR homologues were obtained from a Japanese flounder, Paralichthys olivaceus, cDNA library. Full-length cDNAs of TNFR-1 and TNFR-2 homologues were obtained by using these cDNA fragments as probes. The cDNA for the Japanese flounder TNFR-1 homologue predicts a peptide of 395 amino acids that is 35% identical to the extracellular region of mouse TNFR-1, whereas the cDNA of the Japanese flounder TNFR-2 homologue predicts a peptide of 483 amino acids that is 40% identical to the extracellular region of human TNFR-2. The cytoplasmic domain contains a sequence that has the consensus motif of the death domain of the Japanese flounder TNFR-1 homologue. In a healthy fish, the mRNAs of both TNFR homologues were predominantly expressed in leukocytes, kidney, gill, and spleen. Expression of the Japanese flounder TNFR-1 homologue was induced in peripheral blood lymphocytes (PBLs) after stimulation with LPS (500 microg/ml) for 1 h, and TNFR-2 homologue was strongly induced in PBLs after stimulation with Con A (50 microg/ml) and PMA (0.35 microg/ml) for 3 h. The different expression patterns of the two distinct TNFR homologues may be critical in determining whether binding with TNF-alpha or TNF-beta have activating, proliferative, or apoptotic effects on target cells.     

Multiple interactions among proteins encoded by the mite-transmitted wheat streak mosaic tritimovirus

The genome organization of the mite-transmitted wheat streak mosaic virus (WSMV) appears to parallel that of members of the Potyviridae with monopartite genomes, but there are substantial amino acid dissimilarities with other potyviral polyproteins. To initiate studies on the functions of WSMV-encoded proteins, a protein interaction map was generated using a yeast two-hybrid system. Because the pathway of proteolytic maturation of the WSMV polyprotein has not been experimentally determined, random libraries of WSMV cDNA were made both in DNA-binding domain and activation domain plasmid vectors and introduced into yeast. Sequence analysis of multiple interacting pairs revealed that interactions largely occurred between domains within two groups of proteins. The first involved interactions among nuclear inclusion protein a, nuclear inclusion protein b, and coat protein (CP), and the second involved helper component-proteinase (HC-Pro) and cylindrical inclusion protein (CI). Further immunoblot and deletion mapping analyses of the interactions suggest that subdomains of CI, HC-Pro, and P1 interact with one another. The two-hybrid assay was then performed using full-length genes of CI, HC-Pro, P1, P3, and CP, but no heterologous interactions were detected. In vitro binding assay using glutathione-S-transferase fusion proteins and in vitro translation products, however, revealed mutual interactions among CI, HC-Pro, P1, and P3. The failure to detect interactions between full-length proteins by the two-hybrid assay might be due to adverse effects of expression of viral proteins in yeast cells. The capacity to participate in multiple homomeric and heteromeric molecular interactions is consistent with the pleiotropic nature of many potyviral gene mutants and suggests mechanisms for regulation of various viral processes via a network of viral protein complexes.     

Tec家族蛋白酪氨酸激酶ItkPH结构域的克隆鉴定及其在酵母双杂交系统中自激活作用的检测

Tec家族蛋白酪氨酸激酶Itk特异地表达于T细胞 ,对T细胞的成熟与活化等具有很大影响 ,因而可能在T细胞的信号转导过程中处于重要位置。我们利用PCR的方法从含Itk基因全长cDNA的pME18S EMT质粒中扩增出其PH结构域基因片段 ,并将其克隆入酵母双杂交载体pLexA ,经测序鉴定正确 ,转化酵母细胞EGY48(p8op lacZ ) ,挑取阳性克隆 ,利用液相法和平板法检测 ,证实PH结构域无自激活作用 ,且对宿主菌无毒性作用 ,可用于T细胞cDNA文库的筛选 ,捕捉与之相互作用的蛋白。