胃癌中P53诱导相关微小RNA靶基因预测及生物信息学分析

目的：利用生物信息学预测胃癌中 P53诱导相关微小 RNA（miRNA）的靶基因及功能。方法通过胃癌的限定,用在线数据库mir2disease、Gene Expression Atlas缩小目的基因范围。利用在线预测软件miRNA 靶基因数据库 miRGen（v3．0）预测目标miRNA的靶基因。通过在线软件DAVID和Pathway Miner对预测的靶基因数据集进行功能富集和信号转导通路分析。结果胃癌中P53诱导相关miRNA包括miR-21、miR-25、miR-103等,预测miR-21靶基因共1090个,其中在胃癌中下调共115个;Pathway Miner分析显示miR-21的靶基因涉及黏附连接、胰岛素信号转导通路、细胞凋亡、钙信号转导通路、JAK-STAT信号转导途径等。结论 miR-21靶基因涉及多个肿瘤发生、发展相关信号通路。     

miR-34a与心血管疾病关系的研究进展

MicroRNA（miRNA）是一类含19 ～25个核苷酸的非编码单链RNA分子,在进化中具有高度保守性,可通过与靶基因的3′端非翻译区上的相应靶位点结合,抑制编码蛋白靶基因的翻译和降解靶基因,从而参与炎症、发育、凋亡、肿瘤等多种生理病理过程.有关miRNA的研究现已迅速成为生命科学领域研究的热点.近年来研究发现,部分miRNA可通过多种途径参与心血管疾病相关信号转导网络的调控,广泛参与心血管疾病的发生、发展.其中,因miR-34a在许多心血管疾病状态下存在异常表达而受到越来越多的关注.     

心肌胰岛素抵抗微RNA机制研究进展

多种疾病可以导致心肌胰岛素抵抗,同时心肌胰岛素抵抗是多种心血管疾病的共同病理生理基础,但是,心肌胰岛素抵抗的早期干预仍旧是一个医学难题。在对心肌胰岛素抵抗发病机制的研究过程中发现,多条胰岛素相关信号通路参与了心肌胰岛素抵抗,而一些微RNA(microRNA,miRNA)分子,可以对信号通路中的部分信号分子产生影响,从而加速或者减缓疾病的进程,相关miRNA的研究,为心肌胰岛素抵抗乃至心血管疾病的早诊断、治疗提供了新靶点。     

微RNA在炎症相关疾病中的研究进展

微RNA(miRNA)是一类非编码单链小分子RNA,在转录后水平通过对靶基因信使RNA的降解或翻译抑制进而调节基因表达。miRNA在细胞增殖、分化、凋亡、炎症等生物学过程中发挥重要作用。研究发现,miRNA在炎症及相关疾病中表达异常,并通过调节多种基因表达及信号通路参与炎症及疾病的发生、发展过程。该文对miRNA与炎症及其相关疾病(如炎症性肠病、消化性溃疡、病毒性肝炎等)关系的研究进展予以综述。     

MiR-499与心血管疾病相关性的研究进展

近年来研究表明,微小RNA（microRNA,miRNA）是心血管疾病发生、发展过程中的一个重要调节因素,而miR-499是所有与心血管疾病具相关性的miRNA中最具有代表性之一,它与多种心肌细胞特异性基因如NKx2．5、GATA4和MEF2C等相关,通过对多种通路的调控影响心肌细胞的生理功能,本文以miRNA为研究对象,对其与心血管疾病进行综述,其中重点论述miR-499与心肌细胞生理功能及与心血管疾病的相关性。     

miR-29家族在心血管疾病中的作用机制研究进展

目的微小RNA(microRNA,miRNA,miR)为一类由20~26个核苷酸构成的高度保守的单链非编码RNA,在真核细胞中调控基因的表达。一种miRNA能同时调节多种基因或蛋白表达,且在不同组织细胞表达调控作用并不一致。众多miRNA逐渐被证实与心血管疾病相关,其中研究发现miR-29家族可通过不同机制参与心血管疾病的发生发展,文章对其作用机制进行综述。     

高尿酸血症患者外周血miRNA表达谱的分析及ceRNA网络构建

目的:探讨高尿酸血症(HUA)患者外周血miRNA表达谱及ceRNA网络构建。方法:对5例HUA患者及5名体检健康者外周血单个核细胞miRNA表达水平进行检测并测序,筛选出差异表达的miRNA分子。利用miRwalk、miRBD、miRTarBase和targetscan数据库预测miRNA的靶基因;circbank数据库预测circRNA-miRNA的靶向结合关系。通过DAVID和Metascape数据库对靶基因的基因功能和通路富集分析。利用Cytoscape构建主要信号通路的circRNA-miRNA-mRNA调控网络。结果:在HUA患者与体检健康者中,共发现47种已知miRNA和4种新miRNA差异表达,其中已知差异表达miRNA有25种上调,22种下调。差异表达miRNA的靶基因主要富集在癌症和细胞衰老相关信号通路。基于ceRNA理论构建的癌症相关信号通路circRNA-miRNA-mRNA调控网络,涉及96个circRNA节点、13个miRNA节点及212个mRNA节点。结论:HUA患者外周血miRNA表达谱与健康体检者存在差异,且差异表达miRNA靶基因与癌症的发生发展密切...     

树鼩部分信号转导通路的相关cDNA芯片的建立

目的：建立树鼩部分信号转导通路的相关cDNA芯片,从而进一步探讨肝细胞癌（HCC）发生的分子机制。方法：在基因库中找出人的信号转导通路相关基因mRNA序列,选取其中与大、小鼠高度同源的片段,设计出相关的引物序列,然后用树鼩正常肝组织的cDNA为模板经PCR扩增出树鼩相应基因的cDNA片段,将这些cDNA片段作为树鼩的特异性探针,进而建立起树鼩部分信号转导通路的相关cDNA芯片。结果：得到涉及信号转导通路相关基因的探针共有152个基因。结论：利用该芯片研究树鼩HCC发生过程中信号转导通路中的作用将有重要的实用价值,从而完善树鼩肝癌动物模型的研究。     

主动脉瓣钙化患者基因表达与microRNA调控研究

目的 通过microRNA (miRNA)-基因表达的联合分析,寻找主动脉瓣钙化(calcific aortic valve disease, CAVD)的关键基因、分子通路和miRNA,寻找潜在的疾病发生机制。方法 本研究在GEO数据库上挖掘了CAVD相关的基因表达及miRNA数据,筛选差异基因与miRNA。对差异表达的基因进行生物学过程与分子通路的聚类分析,并且分析了miRNA-基因调控网络。结果 CAVD患者的上调基因主要聚类到对外界刺激的反应、生物高分子代谢、免疫细胞激活上,而下调基因则集中在对外界刺激的反应、心肌细胞发育、离子稳态上。另外,多种CAVD病因的相关基因均有部分差异表达。同时,110个miRNA表达发生显著差异。在下调miRNA-上调基因模式中,找到了可调控HLA-DRB1和HLA-DRB5的3个miRNA以及5个可调控VCAM1的miRNA。上调miRNA-下调基因中,HAND2与hsa-miR-6081、ACTC1与hsa-miR-4793-5p存在相互作用。结论细胞对压力与外界刺激的应答过程发生紊乱、免疫反应的增强与心肌细胞发育相关基因的下调参与了CAVD的发生。而hsa-miR-1250-3p等10种miRNA的调控可能是CAVD发生的原因之一。     

基于多重生物信息学分析阿尔茨海默病的调控网络及相关机制

目的 基于多重生物信息学方法,分析与阿尔茨海默病(AD)相关的信号通路、关键基因、microRNA(miRNA)、转录因子(TF)等生物学信息,构建相关调控网络,以期阐释AD的内在机制。方法 根据纳入标准,从基因表达数据集(GEO)数据库中获取AD相关的高通量芯片数据集,并通过R软件对原始数据集进行预处理,应用limma数据包筛选差异表达基因(DEGs)。利用DOSE数据包对DEGs进行疾病本体(DO)富集分析,并通过可视化和集成发现数据库(DAVID)在线工具对DEGs进行功能注释和通路分析;随后使用STRING数据库和Cytoscape软件构建蛋白互作(PPI)网络并筛选出关键基因,使用mirTarBase等数据库预测相关miRNA,使用Enrichr数据库预测相关TF,并利用Cytoscape构建miRNA-TF-mRNA调控网络。结果 获得数据集GSE48350和GSE132903并且筛选得到109个DEGs。DO富集分析显示DEGs主要与AD等神经系统疾病显著相关,基因本体(GO)功能富集结果包括化学突触传递等21项条目,京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析结果包括GABA能突触等8条信号通路。miRNA-TF-mRNA调控网络显示关键基因的mRNA与相关miRNA、TF之间具有一对多和多对一的复杂调控关系。结论 文章通过多重生物信息学,分析了与AD相关的信号通路、关键基因、miRNA、以及TF等生物学信息,建立了AD调控网络,为进一步探究AD的发生、发展机制提供了借鉴与思考。     

miRNA在心血管疾病中的作用

微RNA(miRNA)是一类长度为21²5个核苷酸的小分子RNA。miRNA参与调控心血管系统的生长发育,对细胞分化、增殖、凋亡等有重要作用。目前对miRNA的发现及其生物功能的研究一直是医学领域的热点之一,已有一些研究证实miRNA是参与心血管疾病发生、发展的重要调控分子,在心脏发育、基因表达和调控中发挥重要的作用。该文将miRNA对心脏发育及其在心血管疾病中的作用予以综述,期望对深入了解miRNA的功能提供新的思路,为临床应用提供依据。     

微小核糖核酸在甲状腺癌发展中的作用

微小核糖核酸(miRNA)是一类非编码RNAs,通过与mRNA非编码的靶区域结合对靶基因的表达进行负性调节,包括分解mRNA或者阻断蛋白质翻译。它们在复杂的生物和代谢过程中起着重要的作用,包括发育周期、信号转导及细胞维持和分化。此外,miRNA的负性调节可以增强甲状腺疾病和甲状腺癌的易患性。miRNA的表达与许多类型的人类肿瘤的负性调节相关,包括甲状腺癌,并且与肿瘤的发生、发展息息相关。现总结miRNA对不同甲状腺癌负性调节的现有文献资料,阐述miRNA在甲状腺癌发展中的作用。     

微RNA在动脉粥样硬化中的研究新进展

近年来,不同的微RNA(miRNA)在心血管系统中的关键作用得到广泛认识。miRNA是在转录后水平调控基因表达的一种内源性RNA序列,通过调控编码基因的表达,实现对机体不同阶段基因表达的调控。是可相对稳定存在于循环血液中的新生物标志物,检测其表达谱可明确其与动脉粥样硬化(AS)的相关性。通过研究相关miRNA的组成及其在AS中的作用机制,将对AS的诊断、治疗及心血管疾病的风险预测等方面提供新的方向。     

TLR2、TLR3和TLR4的表达与变应性鼻炎

Toll样受体是近年发现的一组天然受体,其不仅能识别病原微生物和激活天然免疫,而且调节获得性免疫和诱导免疫耐受,与变应性鼻炎密切相关。宿主通过Toll样受体识别大量病原体相关结构,利用细胞信号转导途径激活机体免疫细胞,一方面参与早期的宿主防御,在天然免疫应答中发挥重要作用;另一方面通过分泌细胞因子、趋化因子、黏附分子等参与炎性反应,最终激活获得性免疫系统。     

MicroRNA和肿瘤

microRNA（miRNA）是近年来发现的一种大小21~25个碱基的、非蛋白编码单链小分子RNA,它主要通过与靶标基因3′UTR的完全或不完全配对,下调参与许多重要细胞活动（包括发育、增殖、分化、凋亡）基因的表达。近年来关于miRNA在肿瘤领域的研究一直比较热门,它的发现为肿瘤发病机制的研究提供了新的思路,为肿瘤诊断和治疗提供了新的策略,具有重要的实际意义。     

灯盏花素的抗细胞凋亡作用

细胞凋亡是一种调节机体结构与功能稳定的重要机制,研究发现许多神经系统疾病、心血管疾病均与细胞凋亡有关。灯盏花素能调节Bax/Bcl-2、能抑制细胞凋亡,临床研究也发现它对上述疾病有一定疗效。     

miR-340在膀胱尿路上皮癌中的表达及其靶基因预测的生物信息学分析

目的探讨miR-340在膀胱尿路上皮癌中的表达,并对其预测的靶基因进行生物信息学分析,为miR-340在膀胱尿路上皮癌发生中的作用机制研究提供理论基础。方法采用miRNA芯片技术检测膀胱尿路上皮癌及正常膀胱黏膜组织中miRNA表达谱,用实时定量PCR法进行验证,挑选具有显著表达差异的miR-340为进一步研究对象,利用生物信息学方法,对miR-340的靶基因进行预测,并对其靶基因进行基因本体（GO）功能富集分析及KEGG信号转导通路富集分析。结果miRNA表达谱芯片、实时定量PCR法均提示miR-340在膀胱尿路上皮癌中较癌旁正常膀胱组织中表达明显降低。miR-340预测靶基因集合功能富集于细胞黏附（celladhesion）、生物黏附（biologicaladhesion）和细胞间黏附（cell-celladhesion）等,KEGG通路分析涉及癌通路（pathwaysincancer）和细胞周期通路（pathwaysincellcycle）等。结论miR-340在膀胱尿路上皮癌中呈低表达,miR-340预测靶基因集合显著富集在与肿瘤发生相关的信号通路中。     

微小RNA与子宫颈癌

子宫颈癌是妇科最常见的恶性肿瘤之一。微小RNA(miRNA)是一类小分子非编码调控的单链RNA。近年来,关于miRNA与子宫颈癌关系的研究成为热点。大量的研究表明,miRNA在细胞增殖、凋亡和肿瘤形成等方面广泛而精确地调控蛋白质的合成。miRNA的异常表达被认为与宫颈癌的发生与发展密切相关。现就miRNA与子宫颈癌的发生、发展及治疗和预后等方面予以综述。     

他汀类药物多效性研究新进展

他汀类药物显著降低血清胆固醇浓度,预防心血管病的发生和死亡,是心血管病最有效的治疗药物之一。在应用他汀类药物治疗心血管疾病的临床试验中发现,他汀类药物尚有其他的非降脂作用,这种非降脂作用称为他汀类药物的多效性。他汀类药物的多效性是近年心血管领域争论和探索的热点。尽可能地从最新的临床证据中审视他汀类药物的多效性。