Distinct serumal proteomic patterns between ascending and descending types of loco-regionally advanced nasopharyngeal carcinoma assessed by surface enhanced laser desorption ionization and artificial neural network analyses

Nacosoupnhtraierysn,geesaple cciaarllcyin oinm aEu (r oNpPeC a)nd is N roartrhe Ainm emriocsat(incidence rate below 1/100 000 people per year)·However, it has a high incidence in several southernareas in China, especially in the Cantonese region,including Guangzhou city, where the incidence rate isapproximately 30 -80/100 000 people per year·1Inthe high incidence areas, more than 95% NPCs arepoorly differentiated (WHO types 2 and 3), which aresensitive to radiotherapy and chemotherapy…     

应用SELDI-TOF-MS技术建立鼻咽癌诊断中的血清蛋白质指纹图谱模型

目的:检测鼻咽癌、耳鼻部良性疾病和正常人血清中蛋白质指纹图谱,筛选特异的蛋白质标志物,构建用于鼻咽癌诊断的分类树模型.方法:采用CM10芯片及SELDI-TOF-MS技术对30例鼻咽癌患者及24例对照组血清样本进行蛋白质指纹图谱检测分析,所得到的结果采用Biomarker Wizard和Biomarker Patterns System软件分析并建立用于鼻咽癌诊断的分类树模型,并用其余10例鼻咽癌患者和12例对照组标本进行双盲验证.同时用酶联免疫法(ELISA)检测两组的血清EB病毒VCA-IgA抗体,将诊断模型的判定结果通过与血清EB病毒VCA-IgA抗体检测结果相对比验证其对于临床的应用价值.结果:从两组血清中筛选出Mr为8559,15 115,15 836,15 937,16 089的5个差别有统计学意义(P<0.05)的标志蛋白,所建立的诊断模型对鼻咽癌诊断的准确率、灵敏度和特异度分别为98.1%(53/54),96.7%(29/30)和100%(24/24).双盲验证后的准确率、灵敏度和特异度分别86.4%(19/22),80.0%(8/10),和91.7%(11/12).灵敏度优于血清EB病毒VC...     

蛋白质组学方法识别nm23-H1为鼻咽癌的转移抑制蛋白和预后因子

目的:筛选鼻咽癌(NPC)转移相关蛋白质,为鼻咽癌防治提供科学依据。方法:采用二维电泳和质谱技术筛选不同转移潜能鼻咽癌细胞系(5-8F和6-10B)的差异表达蛋白质,并应用Western 印迹对部分差异蛋白质进行验证;使用siRNA抑制差异蛋白质nm23-H1的表达,分析nm23-H1表达水平对鼻咽癌细胞体外侵袭能力的影响; 应用免疫组织化学染色分析nm23-H1表达水平与鼻咽癌临床病理特征和预后的关系。结果:在不同转移潜能鼻咽癌细胞系中鉴定了15个差异表达的蛋白质,并选择性证实3个差异蛋白质;siRNA下调nm23-H1的表达能增强6-10B鼻咽癌细胞的体外侵袭能力;淋巴结转移鼻咽癌组织中nm23-H1的水平显著低于原发性鼻咽癌;nm23-H1的表达水平与鼻咽癌淋巴结和远处转移、临床分期和复发正相关;生存分析显示nm23-H1低表达的鼻咽癌患者预后差;多因素分析显示:nm23-H1表达水平是鼻咽癌患者独立的预后因子。结论:nm23-H1是鼻咽癌的转移抑制蛋白和预后因子。     

应用表面增强激光解吸附离子化飞行时间质谱技术筛检博莱霉素肺纤维化大鼠血清蛋白标志物

目的鉴定博莱霉素肺纤维化大鼠模型血清差异表达蛋白,寻找肺纤维化疾病早期诊断标志物。方法48只雄性大鼠随机分为博莱霉素组和对照组,每组24只,分别于建模后7、14、28 d各取8只动物处死,取肺组织制作石蜡切片,苏木精-伊红和天狼星红染色,普通光学显微镜和偏振光显微镜观察肺纤维化反应;表面增强激光解吸附离子化飞行时间质谱和弱阳离子蛋白芯片检测血清样本,生物信息学软件分析获得的蛋白指纹图谱,鉴定差异蛋白表达。结果在博莱霉素组大鼠血清中找到4个差异表达的蛋白质,用生物信息学分析软件产生1个肺纤维化动物诊断模型,由质荷比分别为3 530.7、7 043.5、8 332.6和9 068.0的蛋白质组成,与对照组比较,其峰强度均显著升高。结论博莱霉素诱导的肺纤维化血清蛋白表达谱发现的4个差异表达蛋白有可能成为早期诊断博莱霉素肺纤维化大鼠模型的特异血清生物标志物。     

应用表面加强激光解吸电离飞行时间质谱方法检测喉鳞状细胞癌及淋巴结转移的血清蛋白质标志物

目的 应用表面加强激光解吸电离飞行时间质谱（SELDI-TOF-MS）方法筛选喉鳞癌（LSCC）血清蛋白质标志物,建立喉癌诊断预测模型。并检测喉癌淋巴结转移相关的血清蛋白标志物。方法收集252例血清标本,其中喉癌患者血清142例,正常对照110例。其中89例喉癌血清,30例有淋巴结转移的喉癌血清和65例正常对照为试验组,53例喉癌血清及45例正常对照为盲法验证组。应用弱阳离子交换芯片（WCX2）经SELDI-TOF-MS测定得到蛋白质谱,通过Biomarker Wizard和Biomarker Pattern（BIaS）软件分析喉癌和正常人血清的蛋白质谱差异,建立喉癌诊断预测模型并进行盲法验证。寻找喉癌转移相关蛋白标志物。结果 在质荷比（M／Z）2000～50000范围内,弱阳离子（WCX2）芯片共检测出18个差异蛋白峰,可以鉴别喉癌和正常对照。BIaS自动选用其中一个差异蛋白质峰（4176）建立决策树模型,灵敏性为86．52％,特异性为84．62％（32／36）。盲法验证的灵敏性为84．91％,特异性为82．22％。伴或不伴淋巴结转移的喉癌患者之间检测到14个差异蛋白峰。结论应用SELDI-TOF-MS方法可以从血清中筛选出喉癌及淋巴结转移相关的标志蛋白。建立的喉癌诊断预测模型可能对早期发现早期诊断喉癌具有重要的临床意义。