实时荧光定量PCR技术进展

实时荧光定量PCR(real_time quantitative PCR)技术是一种新型的核酸定量检测、分析技术,它通过在PCR扩增反应过程中加入荧光物质,使得对反应过程的实时监控成为可能。它具有实时监测、定量准确、灵敏度高、反应速度快、重复性好及PCR反应后不需电泳检测等优点,已逐步成为分子生物学研究中的重要工具。     

实时荧光定量PCR法与常规PCR法检测沙门菌的比较

目的:比较实时荧光定量PCR法、常规PCR法检测沙门菌的灵敏度与特异性。方法:采用建立的实时荧光定量PCR、常规PCR方法,同时对沙门菌等细菌进行检测。结果:实时荧光定量PCR检测的灵敏度可达33 cfu/m l,且有很高的特异性,对金黄色葡萄球菌等10种相关细菌均无交叉反应,从细菌核酸提取至完成检测仅需3 h左右。结论:实时荧光定量PCR检测由于在密封环境中进行,避免了产物与环境间的交叉污染,且是2种方法中最为快速敏感的方法,适用于临床实验室的快速诊断。     

实时荧光定量PCR在血站核酸检测中的应用效果

目的：观察并分析在血站核酸检测中实时荧光定量聚合酶链反应（PCR）的应用效果。方法：选取2023年1月～2023年6月17564分无偿献血者样本,都是经过乙型肝炎病毒表面抗原、丙型肝炎病毒抗体、人类免疫缺陷病毒抗体初检和复检都合格的样本,对其进行实时荧光定量PCR的核酸检测。结果：在17564无偿献血者的血液样本中,经过实时荧光定量PCR技术检测,共有25例乙型肝炎病毒脱氧核糖核酸阳性,0例丙型肝炎病毒核糖核酸和人类免疫缺陷病毒（1型）核糖核酸阳性。在临检中心举行的室间质评中,所有检验结论均正确,得分为100分。结论：在血站核酸检测中采用实时荧光定量PCR技术,可有效减短病毒检测窗口期,有助于血液安全水平的提高。     

反转录实时荧光定量PCR用于检测白血病相关融合基因分型的性能及应用评价

目的评价反转录实时荧光定量PCR(RT-qPCR)检测白血病相关融合基因的性能,以确定临床使用该方法的可行性。方法采用RT-qPCR检测临床骨髓标本中的白血病相关融合基因BCR-ABL、PML-RARα及AML1-ETO的RNA,验证准确性、特异性、最低检出限、精密度、抗干扰和融合基因亚型检出能力等性能指标,并对其临床应用进行初步评价。结果RT-qPCR检测白血病相关融合基因BCR-ABL、PML-RARα及AML1-ETO的阴阳性符合率为100%,特异性和准确性得到验证;该方法检测下限为100 copies/每反应,其批内和批间精密度CV值均<10%;精密度符合实验要求;胆红素、甘油三酯和血红蛋白对该方法无明显干扰作用;均能检出融合基因亚型;白血病患者治疗前融合基因表达为阳性,完全缓解、巩固、维持各期的相关融合基因表达均为阴性,此结果与疾病进展关系一致。结论采用RT-qPCR检测白血病相关融合基因试剂盒符合规定的性能指标,该检测方法具有较高的灵敏度和较好的准确性和重复性等优势,适合应用于临床。     

实时荧光定量PCR技术及其在生命科学领域中的应用(二)

实时荧光定量PCR(real-time fluorescent quantitative PCR,FQ-PCR)技术是在PCR定性技术基础上诞生起来的用不同荧光定量核酸的技术,具有敏感性高、重复性好、速度快、操作简便和污染少等优点。本文综述了FQ-PCR技术的原理、特点、目前常用FQ-PCR仪、定量方法、实验条件及实验中的主要影响因素及FQ-PCR技术在生命科学领域中的应用和研究进展。     

实时荧光定量PCR技术及其在生命科学领域中的应用(一)

实时荧光定量PCR(real-time fluorescent quantitative PCR,FQ-PCR)技术是在PCR定性技术基础上发展起来的用不同荧光定量核酸的技术,具有敏感性高、重复性好、速度快、操作简便和污染少等优点。本文综述FQ-PCR技术的原理、特点、目前常用FQ-PCR仪、定量方法、实验条件及实验中的主要影响因素及FQ-PCR技术在生命科学领域中的应用和研究进展。     

实时荧光定量PCR检测特殊人群中HCV-RNA的研究

[目的]探讨HCV在特殊人群中的流行和干扰素治疗效果对HCV-RNA含量的影响。[方法]收集223份抗-HCV阳性血清并跟踪观察和用荧光定量实时荧光定量PCR法检测HCV-RNA的含量。[结果]在141份抗-HCV阳性血清中,58份实时荧光定量PCR阳性,阳性符合率为41.13%,在86份有输血史患者中39份实时荧光定量PCR阳性,阳性率为45.35%,17份有家族遗传史患者中11份实时荧光定量PCR阳性符合率为64.70%。在38例不明原因感染者中有8份实时荧光定量PCR阳性,阳性率为21.05%（χ^2=16.21Р=0.000）。58例实时荧光定量PCR阳性的病人经治疗两年后,39份有输血史患者,转阴24例,转阴率61.53%。11份有家族遗传史患者中6例转阴,转阴率54.54%。在8例不明原因感染者中有5例转阴,转阴率62.24%。[结论]不同的传染途径在RNA的含量和治疗的预后有差异。     

ABI7900实时荧光PCR系统检测腺病毒DNA性能验证

目的:评估实时荧光聚合酶链反应(RT-PCR)方法检测腺病毒(ADV)DNA的性能。方法:采集16名健康者咽拭子标本(16例),选取其中10例阴性标本。阳性标本取自1例ADV4型培养液。采用RT-PCR法检测ADV DNA,并依次对检测试剂的准确性、重复性、检测下限、抗干扰能力和特异性等性能参数进行验证及评价。结果:RT-PCR试剂检测ADV DNA的准确性和重复性均为100%,检测下限为5×10^2 copies/ml。加入100 g/L血红蛋白,药物阿莫西林(5μg/ml)、对乙酰氨基酚(0.15μg/ml)和布地奈德混悬液(0.5 mg/ml)干扰物质后,ADV DNA的Ct均值小于未加入干扰物质的ADV DNA Ct均值的95%的置信区间(95%CI)上限25.51,加入干扰物质未对ADV DNA检测结果造成显著影响。该试剂检测甲型H1N1流感病毒、巨细胞病毒、肺炎链球菌、金黄色葡萄球菌、绿脓杆菌、流感嗜血杆菌和鼻病毒等常见的呼吸道病毒和细菌无交叉反应,具有较好的特异性。结论:RT-PCR法检测ADV DNA的准确性高、重复性好且灵敏度高,抗干扰能力和特异性均符合相关标准的要求,是临床检测ADV的首选方法。     

实时荧光定量PCR在手足口病原体检测中的应用探讨

目的：：对手足口病患儿施行病原体检测时运用荧光定量PCR实时测定法（FQ-PCR法）的效果及有关情况探析。方法：以2016年5月-7月因疑似感染手足口病进入本院施行病原体测定的患儿127例为评估对象,依据年龄段情况将其划分成A组（年龄不超3岁者）77例、B组（年龄间于3-6岁间者）50例,运用FQ-PCR法对疑似患儿的疱疹液、咽拭子实施相应指标值的测定;并以ELISA法对患儿血清展开检测,经比对两法的检出率数据情况,系统评估FQ-PCR医疗检测效果。结果：127例患儿咽拭子样本、疱疹液样本在FQ-PCR法测定下,EV检测有101例显阳性,占79.53%;当中A组有67例,占87.01%,B组有34例,占68.00%。A组患儿阳性检出率超出B组,差异明显（P＜0.05）。咽拭子样本检出阳性率是69.60%,疱疹液样本检出阳性率是81.97%。FQ-PCR法检出EV71阳性病例超出ELISA法,差异显著（P＜0.05）,检出COXA16阳性病例和ELISA法较接近,没有较大差异（P＞0.05）。结论：FQ-PCR 法践行于HFMD病原体测定及评估中,能强化病原学指标监控力度,以辅助当地HFMD疫情预测、防范工作的有效进行。     

实时荧光定量PCR检测痰标本中军团菌属

目的建立荧光定量PCR方法,用于检测军团菌属特异性16S rRNA基因,并探讨广州地区军团菌属感染状况。方法利用军团菌属特异性16S rRNA基因保守序列设计引物和探针,优化反应条件和反应体系,对嗜肺军团菌、非嗜肺军团菌及其他细菌进行检测,验证该方法的特异性、敏感性、重复性,对广东省中医院采集的532例肺部感染患者痰液标本进行检测。结果该方法检测军团菌属所有标准菌株均出现阳性信号,其他非军团菌属细菌检测结果均为阴性;检测灵敏度为102CFU/ml,临床检测532例肺部感染患者的痰液标本,荧光法检出军团菌阳性43例,阳性率为8.08%,16S rRNA PCR法加基因测序验证阳性率为7.71%,两者检测结果差异无统计学意义,表明其具有较好的符合性和等效性。结论 16S rRNA基因荧光定量PCR法检测患者痰液标本中军团菌属,具有快速、敏感、特异等特点,适用于临床军团菌属感染调查及快速检测。     

荧光实时定量PCR检测铜绿假单胞菌方法建立及价值

目的建立荧光实时定量PCR（FQ-PCR）定量测定铜绿假单胞菌的方法，检测该方法的灵敏度并与传统细菌培养比较其特异性吻合率。方法选择铜绿假单胞菌的oprI基因为目的基因设计探针引物，建立Taqman探针FQ-PCR体系定量检测5种标准菌株、3种病毒株、白色念珠菌、肺炎支原体、人基因组DNA及临床培养96株菌株。结果31株铜绿假单胞菌、铜绿假单胞菌与其它菌种或人全血的混合液均产生特异扩增信号，标准曲线的相关系数为0．997；其他菌种（76株）无扩增；乙肝病毒、巨细胞病毒及肺炎支原体及健康人全血均无扩增，与传统培养相比特异性吻合率达100％，铜绿假单胞菌标准株按等级浓度稀释后其拷贝数也呈等级梯度递减，实际可检测到的最小菌落数为100个／ml，全程检测〈4h。结论荧光实时定量法检测oprI基因可以运用于铜绿假单胞菌的快速检测。     

实时荧光定量PCR法与常规PCR法及细菌培养法检测单增李斯特菌的比较

目的：比较实时荧光定量PCR法、常规PCR法及细菌培养法检测单核细胞增生性李斯特菌的灵敏度与特异性。方法：采用建立的实时荧光定量PCR、常规PCR及传统细菌培养法3种方法,同时对单核细胞增生性李斯特菌等细菌进行检测。结果：实时荧光定量PCR检测的灵敏度可达19 cfu/ml,且有很高的特异性,对英诺克李斯特菌等10种相关细菌均无交叉反应,从细菌核酸提取至完成检测仅需3 h左右。结论：实时荧光定量PCR检测由于在密封环境中进行,避免了产物与环境间的交叉污染,且是3种方法中最为快速敏感的方法,适用于公共卫生应急疫情的实验室快速诊断。     

荧光定量PCR快速检测沙门菌方法的建立及应用

目的:建立沙门菌实时荧光PCR的快速检测方法,探讨其可行性和应用价值。方法:根据沙门菌的特异性DNA作为靶序列,以沙门菌菌株提取核酸DNA作为模板进行荧光检测。结果:本研究在7种相关菌株的检测中,除沙门菌出现很好的阳性外,其余菌株均为阴性;在纯菌条件下,定量检测低限为30 cfu/ml;同一样品检测3次Ct值的变异系数均小于5%;对模拟标本与分离培养对比,二者符合率为100%。结论:该方法的建立,不仅为食源性沙门菌污染及食物中毒的快速检测提供依据,而且还可直接用于临床粪便标本的检测。     

实时荧光PCR法检测乙型肝炎病毒基因型

目的:建立实时荧光PCR法检测乙型肝炎病毒(HBV)基因型。方法:根据乙肝病毒基因序列选取保守区域设计引物,结合不同基因型的差异设计各型的特异荧光探针检测乙型肝炎基因B、C型。结果:200例HBV感染者中基因B型70例占35%,基因C型120例占60%,基因B,C混合型10例占5%,未捡出基因型A、D、E、F,分别取B、C型基因标本10例进行测序结果一致。结论:实时荧光PCR检测乙型肝炎基因型操作简单、快速、适合临床常规检测。     

转基因成分实时荧光PCR定量分析数学方程的理论研究

目的：根据TaqMan荧光探针实时荧光PCR的技术原理，建立实时荧光PCR循环次数与荧光强度问的动力学方程、样品中转基因成分含量与Xo及Cr的定量关系和定量分析数学方程。方法：采用数学推导和理论测算的方法，研究数学方程中各参数的意义、影响因素、变化特点和规律。结果：转基因成分含量的定义、定量分析模式、样品DNA提取效率、PCR扩增效率、反应管中初始模板数、荧光分子形成效率、荧光测量阈值、PCR测量的系统和偶然误差，是导致定量关系发生偏离及测定灵敏度发生变化的重要原因。结论：数学方程中各项参数可用于评估定量关系的偏离程度及变化趋势，还可作为选择、优化定量分析条件和校正、降低定量方法系统误差的技术指标。     

多聚酶链反应临床应用970例分析

目的探讨多聚酶链反应（PCR）检测患者淋球菌（NG）、人乳头病毒（HPV）、结核杆菌（TB）、乙肝病毒（HBV）、肺炎支原体（PM）、疱疹病毒（HSV）、非淋菌性尿道炎（NGU）的沙眼衣原体（CT）和解脲支原体（MU）的临床意义。方法采用FQ-PCR方法检测临床上拟诊断为淋球菌感染（淋病）、尖锐湿疣、结核、支原体肺炎、非淋菌性尿道炎患者的沙眼衣原体（CT）和解脲支原体（MU）的970例患者，判断其阳性率。结果NG阳性率38．2％（240／627），HPV阳性率66．O％（70／106），TB阳性率27．7％（20／72），HBV阳性率35．1％（33／94），PM阳性率33．3％（2／6），HSV阳性率20．O％（1／5），MU阳性率12．0％（4／33），CT阳性率22．0％（6／27）。结论FQ-PCR方法具有简便、快速、准确、特异性强等优点，可应用于常见细菌、病毒、衣原体、支原体等疾病的诊断、治疗及疗效观察。     

PCR检测食品中单核细胞增生性李斯特菌毒力基因

目的 检测食品中分离的单核细胞增生性李斯特茵毒力基因携带率。方法 应用GB4789．30-94单核细胞增生性李斯特菌的检验方法分离菌株，采用PCR检测李斯特菌的两种致病因子。结果 从2000．2001年我省采集的272份食品中分离出35株单核细胞增生性李斯特菌。其中11株含有内化素基因(Internalin，Inl)和李斯特菌溶血素O基因(Listerialysin0，Hly)，1株仅含有内化素基因；其它23株两种基因均为阴性。结论 我省存在发生李斯特菌食物中毒的潜在危险。建立PCR方法检测李斯特菌毒力基因对快速诊断单核细胞增生性李斯特菌有现实意义。     

实时荧光定量PCR检测EV71肠道病毒在不同类型样本中检测率的分析

目的 探讨肠道病毒71型(EV 71)检测方法和样本收集对检测结果的影响.方法 采集疑拟患者鼻咽拭子和大便样本,应用实时荧光定量PCR方法检测.结果 结果EV71型肠道病毒大便检出率为46.2％,鼻咽拭子为5.61％,大便的检出率明显高于鼻咽拭子;差异有统计学意义(x2=61.51＞x20.01.1,P＜0.01).结论 对HFMD的诊断建议首选采集粪便标本,应用实时荧光定量PCR方法进行检测,可减少漏诊率,提高灵敏度.     

基孔肯雅病毒的纳米金实时荧光PCR方法的建立

目的建立一种检测基孔肯雅病毒纳米金实时荧光定量PCR的方法。方法以课题组建立的普通实时荧光PCR方法为基础,在PCR体系中添加不同大小粒径的纳米金进行体系优化,评价优化后的体系。结果添加纳米金的实时荧光PCR较不添加的扩增效率高;优化后的纳米金实时荧光PCR产物的Ct值与模板稀释浓度存在良好的线性关系,回归方程:y=-3.31x+41.78,R2=0.9997,PCR扩增效率为99.5%。结论纳米金能提高实时荧光PCR的反应效率。