基于网络药理学的枳术汤活性成分-靶点-通路研究

目的运用网络药理学研究枳术汤活性成分-靶点-通路,明确其药理机制。方法利用中药分子机制生物信息学分析平台获取枳术汤活性成分及对应靶点;利用STRING数据库构建PPI网络,依据度值和介数筛选关键靶蛋白;利用BiNGO和MCODE插件对靶基因进行GO生物过程富集和聚类分析;利用DAVID数据库分析靶点的KEGG信号通路。结果获得辛弗林、N-甲基酪胺、白术内酯III等16个主要活性成分及127个靶点,发现了MAPK1、DRD2、ADRB1、CHRM2、HTR、MAOB、DBH等30个关键靶点。聚类分析809个GO生物过程得到内环境、神经递质、中枢神经、心血管系统、炎症、激素、蛋白质代谢、核酸代谢等28个子簇。KEGG信号通路富集主要涉及神经递质、内分泌、信号转导、物质代谢及其他等5大类17条信号通路。结论枳术汤活性成分作用于乙酰胆碱、多巴胺、5-羟色胺、肾上腺素等神经递质的受体及代谢酶,参与神经递质调节、心肌信号转导、内分泌等信号通路和生物过程,主治胃肠动力障碍性疾病,对心血管、神经系统疾病也具有一定药理作用。     

芎附散作用机制的网络药理学分析

目的基于网络药理学方法分析芎附散活性成分、靶点、通路之间的关系,探讨其作用机制。方法依托BATMAN-TCM数据库和TCMSP平台筛选芎附散的活性成分及靶点;借助STRING平台构建靶蛋白相互作用网络;利用BiNGO和MCODE插件进行靶基因GO生物过程富集和聚类分析;通过DAVID数据库富集分析关键靶点的KEGG信号通路。结果从芎附散中筛选得到丁苯酞、(Z)-藁本内酯、α-香附酮、洋川芎内脂A、洋川芎内脂I等14种活性成分;作用于DRD5、HTR2A、ADR、MAOA、F2、VEGF、NOS3、ESR1、PGR等30个关键靶点;参与内皮细胞与血管形成、多巴胺受体信号通路等12个主要GO生物过程子簇;调控血小板活化、血管内皮生长因子、钙离子、雌激素信号通路,以及5-羟色胺、多巴胺、γ-氨基丁酸等神经递质通路。结论初步解释了芎附散治疗神经系统、心血管系统以及妇科疾病的药效物质基础及其作用机理。     

基于“成分-靶点-通路”的鹿茸网络药理学研究

目的:基于网络药理学研究鹿茸活性成分-靶点-通路及其药理机制。方法:利用网络药理学分析平台(BATMAN-TCM)获取鹿茸活性成分及其对应靶点;利用STRING平台构建蛋白互作网络(PPI),依据度值和介数筛选关键靶蛋白;利用ClueGO插件对关键靶基因进行基因本体(GO)生物过程富集;利用Metascape数据库分析靶点的(KEGG)信号通路。结果:获得17-β-雌二醇、α-雌二醇、视黄醇、雌酮等14个成分及306个靶点,发现了MED1、ADCY1、RXRA、CXCR4、ESR1、DRD2等26个关键靶点。ClueGO分析57个GO生物过程得到G蛋白耦合受体蛋白信号通路的负调节、一氧化氮生物合成、前列腺发育等7个子簇。KEGG信号通路富集主要涉及癌症、内分泌系统、癌症特定类型、抗肿瘤耐药性、免疫系统、物质依赖、信号转导等7大类68条信号通路。结论:鹿茸是通过多成分、多靶点、多信号通路协调发挥治疗疾病作用,其中在治疗骨质疏松症和抗肿瘤方面具有潜在的优势。     

基于生物信息技术的薏苡附子散网络药理学研究

目的利用生物信息技术研究薏苡附子散网络药理学机制。方法依托BATMAN-TCM数据库对薏苡附子散进行成分筛选和靶点预测,利用STRING平台构建靶蛋白相互作用网络,利用BiNGO和MCODE插件对靶基因进行GO生物过程富集和聚类模块分析,通过DAVID服务器对薏苡附子散潜在靶基因进行KEGG信号通路富集。结果薏苡附子散中去甲乌药碱、薏苡素、苯甲酰乌头原碱、薏苡酯等14个活性成分,作用于5-羟色胺受体、多巴胺受体、M2胆碱受体、前列腺素受体E2、肾上腺素受体等66个靶点,涉及cAMP信号转导、钙离子调节、神经调节、细胞周期、细胞凋亡等多种生物过程,参与神经调节、内分泌调节、信号转导、糖类代谢、精神疾病、炎症及其他7大类19条信号通路。结论薏苡附子散不仅具有治疗胸痹急痛、强心、中枢止痛的作用,还可能具有抗癌、抗炎、抗抑郁及调节血糖等作用。     

基于整合药理学结合GEO数据集分析开心散防治阿尔茨海默病分子机制

目的基于整合药理学平台联合GEO芯片差异基因分析的方法, 分析开心散治疗AD的作用机制。方法通过检索中医药整合药理学研究平台(TCMIP)和Drugbank数据库, 获得开心散组方药物活性成分和相关分子靶点。通过GEO数据库获取GSE4757芯片数据, 使用R语言获取其差异基因, 绘制热图和火山图。通过Cytoscape 3.7.2构建开心散与AD的差异基因分子靶点图, 使用Bisogenet和CytoNCA绘制靶点拓扑网络, 并进行开心散与AD基因的GO功能富集和KEGG通路富集分析。结果获得开心散治疗AD的活性成分86个, 与GEO共有的差异基因29个, 构建PPI拓扑网络, 筛选出核心的候选基因6个, 与KEGG通路富集基因合并, 获得治疗疾病的重要基因为CHRM1、CHRM2、ACHE、CHRM3、CASP8、PTGS2、DRD1、CACN1S、ADRB1。GO功能条目获得375条, 主要涉及血管收缩、突触后膜可塑性, 神经递质传递等。KEGG富集分析主要涉及胆碱能突触信号通路、cAMP信号通路、钙信号通路、神经-配体-受体相互作用信号通路等。结论开心散治疗AD具有多成分、多靶...     

左金丸活性成分-靶点-多维作用机制

目的分析左金丸活性成分-靶点-多维作用机制。方法通过中药系统药理学分析平台(TCMSP)数据库获取左金丸活性成分及对应靶点,TTD数据库预测分析左金丸潜在治疗疾病,Cytoscape软件分别构建活性成分-靶点、靶点-疾病网络,STRING平台构建靶蛋白互作网络,BINGO和MCODE插件对靶基因进行GO生物过程富集和聚类分析,生物学信息注释数据库(DAVID)对靶点进行KEGG信号通路分析。结果左金丸中13种活性成分作用于49个潜在靶点,涉及炎症反应调节、突触传递、细胞分化、凋亡等19个生物子簇;KEGG富集得到消化液分泌、癌症、内分泌、神经递质、炎症、信号转导、心血管7大类22条信号通路,在消化、神经、心血管系统疾病以及炎症、癌症等方面具有治疗价值。结论本研究揭示了左金丸活性成分、靶点、多维作用机制,可为其临床治疗价值拓展提供新的线索。     

基于网络药理学方法分析小半夏汤药效物质及作用机制

目的:运用网络药理学方法研究小半夏汤活性成分、靶点、通路及生物过程,探讨其药效物质及作用机制。方法:通过TCMSP数据库及BATMAN-TCM分析平台获取小半夏汤活性成分及靶点;采用string数据库构建PPI网络,运用Cytoscape软件进行可视化展示;通过DAVID数据库富集靶点KEGG信号通路;利用BINGO、ClueGO插件进行GO生物过程富集和聚类分析。结果:发现小半夏汤16种活性成分作用于209个靶基因,主要富集在心血管、神经、癌症、炎症等7大类30条KEGG通路;SRC、MAPK1、FOS、JUN、CREB1、ESR1、 BCL2、TNF等43个关键靶基因,主要参与轴突再生、神经元投影再生等神经生物过程。结论:小半夏汤除了化痰散饮、和胃降逆的传统功效外,还可能在炎症、癌症以及心血管和神经系统方面具有药理作用。     

龟甲胶治疗围绝经期失眠症的网络药理学研究

目的:基于网络药理学方法分析龟甲胶治疗围绝经期失眠症的作用机制。方法:借助中药分子机制的生物信息学分析工具（BATMAN-TCM）检索龟甲胶所含中药的化学成分和作用靶基因,同时检索人类基因数据库（GeneCards）、人类孟德尔遗传综合数据库（OMIM）获得与围绝经期失眠症治疗相关的靶基因,借助Venny2.1平台对疾病靶基因与药物作用靶基因取交集,采用Cytoscape 3.7.2软件绘制疾病-靶基因-通路-中药成分网络图,利用String数据库构建靶基因蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）网络图,采用R语言对靶基因进行GO功能、KEGG通路富集分析。结果：根据网络药理学相关数据库检索及分析得到龟甲胶所含中药的6个活性成分与围绝经期失眠症相关的ASPA、MPO、PPIG、EDN1、GLRA1等21个关键靶基因相互作用。GO功能富集分析得到相关条目共592个,其中生物过程514个,细胞组分49个,分子功能29个。主要涉及茶酚胺代谢、神经递质水平调节、突触传递,多巴胺能、氨基酸结合、神经递质受体活性等信号通路,KEGG通路富集分析筛选得到11条信号通路,主要涉及多巴胺能突触、苯丙胺成瘾、cAMP信号通路、TNF信号通路等。结论:龟甲胶可通过多靶点、多通路达到治疗围绝经期失眠症的效果,这为进一步深入探讨其作用机制提供了参考。     

基于网络药理学探讨当归芍药散治疗复发性流产的作用机制

目的:利用网络药理学技术研究当归芍药散治疗复发性流产(RSA)的潜在作用机制。方法:通过TCMSP数据库寻找、筛选、预测当归芍药散中5味中药的化学活性成分和对应靶点,通过OMIM数据库、Gene Cards数据库获取与RSA相关的疾病靶点;利用Venny对当归芍药散药物靶点、RSA疾病靶点取交集、绘制韦恩图,从而预测当归芍药散-RSA潜在作用靶点;利用Cytoscape软件构建"当归芍药散—成分—RSA—靶点"网络;分别借助String平台、R软件对RSA药物-疾病潜在作用靶点构建蛋白相互作用网络、分析GO生物过程、分析KEGG通路。结果:当归芍药散主要通过芍药苷、芍药内酯苷、泽泻醇、儿茶素、川芎内酯A等30个活性成分作用于IL6、AKT1、JUN、TNF、PTGS2等84个与疾病相关的靶点。通过AGE-RAGE信号通路、肿瘤坏死因子信号通路(TNF)、白细胞介素(IL)-17信号通路、TOLL样受体信号通路、脂多糖反应等生物过程和代谢通路,调节MAPK信号通路和NF-κB信号通路,以达到平衡机体TNF、IL等炎性因子含量,避免了过度自身免疫的发生,从而改善妊娠结局。结论:本研究反应了当归芍药散具有多成分、多靶点、多通路的特点,为当归芍药散治疗复发性流产提供新思路和理论依据。     

基于网络药理学的麻黄-甘草药对治疗小儿哮喘作用机制

目的利用网络药理学技术,探索麻黄-甘草药对治疗小儿哮喘的作用机制。方法基于中药系统药理学技术平台(TCMSP)获取麻黄、甘草的化学成分及其作用靶点,UniProt数据库提取作用靶点的基因名称,通过OMIM数据库获取哮喘相关靶点,将疾病靶点与药物靶点进行交集,筛选得到疾病-药物成分共同靶蛋白。利用Cytoscape软件构建化合物-靶点网络,利用DAVID数据库进行GO和KEGG通路富集分析,通过Cytoscape软件构建"中药活性化合物-关键靶标-主要通路"多维网络关系图。结果筛选出115个活性成分,12个作用于小儿哮喘的蛋白靶点;GO富集(P0.01)提示有24个生物过程条目、3个分子功能条目、3个细胞组分条目,KEGG富集29条通路(P0.01),关键靶点包括TNFRSF1A、TNF、IKBKG、TP53、NFKBIA、IKBKB等,关键通路包括细胞凋亡、NF-κB信号通路、TNF信号通路、小细胞肺癌、脂肪细胞因子信号通路、RIG-I样受体信号通路、T细胞受体信号通路、Toll样受体信号通路等。结论该研究通过网络药理学初步揭示了麻黄-甘草药对治疗小儿哮喘的多维调控网络,从多角度探索了麻黄-甘草药对治疗小儿哮喘的潜在分子机制及药理作用,为其的临床应用提供了理论依据。     

基于网络药理学研究桃仁-红花治疗高脂血症的作用机制

目的:运用网络药理学方法研究桃仁-红花治疗高脂血症的作用靶点和信号通路,进一步分析其治疗高脂血症的物质基础和作用机制。方法:通过Drugbank、TTD数据库收集高脂血症作用靶点;通过中药系统学药理分析平台获得桃仁-红花所含化学成分及预测靶点;运用Cytoscape软件绘制“桃仁-红花活性成分-潜在靶点”网络;应用ClueGo对潜在靶点进行GO和KEGG富集分析。结果:桃仁-红花治疗高脂血症活性成分的潜在靶点网络中包含13个活性成分和16个潜在靶点,关键靶点涉及半胱氨酸天冬氨酸蛋白酶3、过氧化物酶体增殖物激活受体-γ、钠依赖去甲肾上腺素转运体、钠依赖5-羟色胺转运体、细胞色素P450、肿瘤坏死因子、胰岛素受体等;靶点基因功能偏于多巴胺、儿茶酚胺及含儿茶酚胺化合物的分解、甘油三酸酯隔绝、有机羟基化合物分解代谢等;KEGG通路涉及PPAR信号通路、药物代谢、可卡因成瘾、安非他明成瘾。结论:桃仁-红花通过增加靶基因转录、蛋白水解、神经递质转运的方式干预高脂血症的发生发展,其主要作用机制与药物代谢、PPAR信号通路相关。     

基于网络药理学预测二妙丸“一方多效”的分子机制

目的:基于网络药理学思路与方法,研究二妙丸中有效成分、靶点、通路之间的关系,预测其可能的"一方多效"药理机制。方法:依托中药分子机制的生物信息学分析工具服务器(BATMAN-TCM)对二妙丸进行成分-靶点的预测和筛选,借助检索相互作用的基因/蛋白质的搜索工具平台(STRING)构建靶蛋白互作网络,利用Bi NGO和MCODE插件对靶基因进行基因本体(GO)生物过程富集和聚类分析,通过注释、可视化和集成发现的数据库(DAVID)平台对关键靶点京都基因与基因组百科全书(KEGG)信号通路进行富集分析。结果:二妙丸活性成分作用于血清白蛋白(ALB),丝裂原活化蛋白激酶1(MAPK1),肿瘤坏死因子(TNF),前列腺素内环氧合酶2(PTGS2),5-羟色胺受体2A(HTR2A),腺苷脱氨酶(ADA),糖皮质激素受体(NR3C1)等37个关键靶点;参与炎症反应、神经传导、金属阳离子稳态平衡、氧化还原、脂质代谢、核苷酸代谢等GO生物过程;调控TNF,TRP通道炎症调控,FcεRI信号通路,Ⅱ型糖尿病,钙离子信号通路,5-羟色胺以及多种信号转导、肿瘤、细胞色素P450通路。结论:二妙丸除具有治疗痛风、关节炎、湿疹等炎症疾病外,还可能具有抗糖尿病周围神经病变、治疗神经系统、胃肠系统、心血管系统疾病的"一方多效"作用。     

基于网络药理学分析白芍药理作用机制

目的:通过网络药理学研究白芍主要有效成分及其药理作用机制,为白芍新药研究和开发提供参考。方法:通过中药系统药理学数据库分析平台(TCMSP)收集白芍的化学成分信息,以口服生物利用度(OB)≥30%和类药性(DL)≥0.18为标准筛选活性成分,并找出活性成分对应靶点。通过UniProt数据库提取作用靶点基因,运用Cytoscape 3.6.1构建化合物-靶点网络、靶点-疾病网络图,通过蛋白相互作用(PPI)网络筛选出核心靶点,通过生物学信息注释数据库(DAVID)对靶点进行基因本体(GO)功能富集分析和基于京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,预测其作用机制。结果:获得山奈酚、儿茶素、芍药苷、β-谷甾醇、苯甲酰芍药苷等18个主要活性成分及与其相关的94个靶点,关键靶点有AKT1、PTGS2、TNF、JUN、VCAM1、CASP3、ICAM1、IL-6、MAPK8、MAPK1等,GO功能富集分析表明关键基因主要参与分子功能正调节、细胞凋亡调控、程序性细胞死亡调控、细胞死亡调控、细胞增殖调控等生物过程;KEGG关键通路包括癌症通路,Toll样受体信号通路,细胞凋亡、神经活性配体-受体相互作用、NOD样受体信号通路,前列腺癌、肌萎缩侧索硬化症(ALS)、小细胞肺癌、Ⅱ型糖尿病等信号通路。结论:该研究初步揭示了白芍药效物质基础及多维药理作用机制,体现了白芍多成分-多靶点-多途径的作用特点,为白芍再开发利用提供了新思路和新方法。     

基于网络药理学探讨芍药甘草汤治疗类风湿关节炎的作用机制

目的 采用网络药理学方法,对芍药甘草汤治疗类风湿关节炎的作用机制进行研究。方法 通过中药系统药理学数据库和分析平台（TCMSP）对芍药甘草汤进行活性成分的收集和筛选,在Swiss Target Prediction和TCMSP数据库中查找活性成分对应的人类靶蛋白;在Drugbank和Therapeutic Target Database数据库中获取类风湿关节炎的疾病靶点;构建韦恩图,得到芍药甘草汤治疗类风湿关节炎的关键靶点,依据STRING数据库得到关键蛋白的蛋白互作网络;采用DAVID数据库对关键靶点进行基因本体论（GO）和通路富集分析,使用Image GP平台制作富集结果气泡图;相关结果采用Cytoscape 3.7.2进行可视化研究及网络拓扑结构分析。结果 筛选得到芍药甘草汤中102种活性成分,对应310个潜在靶点,其中涉及类风湿关节炎靶点68个。药物-成分-关键靶点-信号通路网络图显示山柰酚、槲皮素、柚皮素、芒柄花黄素、异鼠李素等是芍药甘草汤治疗类风湿关节炎的关键成分,前列腺素内环氧化物合成酶2、一氧化氮合酶2、丝裂原活化蛋白激酶14、过氧化物酶体增殖物激活受体γ、白细胞介素-6、肿瘤坏死因子、白细胞介素-1β等是该方治疗类风湿关节炎的关键靶点。GO富集分析显示与生物过程相关的条目28个,与细胞组成相关的条目2个,与分子功能相关的条目13个。通路富集分析显示与40条通路相关,涉及肿瘤坏死因子信号通路、破骨细胞分化、T细胞受体信号通路、MAPK信号通路、类固醇激素生物合成、Toll样受体信号通路等。结论 从网络药理学角度阐明了芍药甘草汤多成分、多靶点、多途径的整体调节特点,初步揭示了芍药甘草汤治疗类风湿关节炎的物质基础和作用机制,为后续研究提供思路与依据。     

基于网络药理学研究紫草治疗放射性皮炎的作用机制

目的:基于网络药理学方法研究紫草治疗放射性皮炎的作用机制。方法:依托TCMSP数据库和查阅文献获得紫草的活性成分,通过BATMAN-TCM数据库获得紫草活性成分的相关基因,通过Pubmed2ensembl数据库和Digsee数据库获取放射性皮炎的相关基因,筛选两者共有的基因作为紫草治疗放射性皮炎的潜在靶点。通过String平台及Cytoscape软件分别构建紫草和放射性皮炎的蛋白互作网络(PPI),将共有靶点基因提交至WebGestalt数据库进行GO聚类分析和KEGG通路富集分析,并构建"靶点-通路"网络。采用i GEMDOCK软件进行关键靶点基因与紫草活性成分之间的分子对接,评估两者之间的结合活性。结果:共筛选出18个活性成分,373个紫草相关基因,425个放射性皮炎相关基因;筛选出29个共有靶点,基因富集分析显示,共有靶点基因涉及46个GO生物功能条目,包括生物过程条目12个、细胞组成条目19个、分子功能条目15个,主要涉及炎症反应的调节、激素代谢过程等;涉及KEGG信号通路共76条,主要包括AGE-RAGE信号通路、IL-17信号通路、癌症通路等。通过构建蛋白互作网络筛选出6个关键靶点蛋白后,分子对接结果显示大多数紫草活性成分与关键靶点之间具有良好的结合活性。结论:紫草可能通过作用于VEGFA、TNF、PTGS2、IL1B、MMP9、IFNG等靶分子发挥抗氧化、抗炎、抗菌、促进血管再生、调节激素水平的效应,从而防治放射性皮炎。     

基于网络药理学分析藿朴夏苓汤作用机制以探讨新型冠状病毒肺炎的治疗

目的:通过网络药理学分析藿朴夏苓汤的成分、靶点及其潜在的作用机制,探讨其对新型冠状病毒肺炎的治疗作用。方法:通过TCMSP搜集藿朴夏苓汤组方的活性成分及靶点,运用STRING数据库进行蛋白质-蛋白质相互作用分析,使用Cytoscape 3.6.0软件构建网络,并进行模块化、拓扑学分析筛选关键靶点,将筛选到的关键靶点导入DAVID数据库,进行GO功能富集分析和KEGG通路富集分析。结果:藿朴夏苓汤的11味中药含71个活性成分235个靶点,蛋白质-蛋白质相互作用网络具有4个模块,筛选出41个关键靶点,GO功能富集分析涉及72个条目,KEGG通路富集分析涉及73个通路。结论:藿朴夏苓汤的成分具有抗炎、免疫调节、抗肺纤维化的作用,可能通过调控肿瘤坏死因子信号通路、Toll样受体信号通路、NOD样受体信号通路、HIF-1信号通路等发挥对新型冠状病毒肺炎的治疗作用。     

小承气汤“成分-靶点-通路”的网络药理学研究＊

目的 基于网络药理学分析小承气汤活性成分-靶点-通路，研究其药理机制。方法 利用中药系统药理学数据库和分析平台（TCMSP）和中药综合数据库（TCMID）获取小承气汤化合物成分；利用Swiss Target Prediction数据库和STITCH数据库预测中药活性成分作用靶点；利用STRING平台构建蛋白互作网络（PPI），依据度值和介数筛选关键靶点；利用DAVID数据库对关键靶点进行GO/KEGG功能富集；将小承气汤部分核心成分与肿瘤坏死因子α进行分子对接分析。结果 获得小承气汤有效活性成分62个，主要是蒽醌衍生物、酚类和黄酮类成分；筛选出50个关键靶点，包括炎症相关酶EGFR、EGF、TNF-α、MMP9、PTGS2等，神经递质转运、代谢等相关的SLC6A4、MAOA、MAOB、CASP3等；对关键靶点的ontology（GO）分析结果共27条，涉及细胞对白介素1的反应、细胞对脂多糖的反应以及一氧化氮生物合成过程的正反馈等炎症介质代谢相关的生物过程等；KEGG通路富集分析结果共63条，作用于TNF信号通路、MAPK信号通路、Toll样受体信号通路、HIF-1信号通路、PI3K-Akt信号通路、炎症性肠病、色氨酸代谢和VEGF信号通路等；分子对接显示芦荟大黄素、β-谷甾醇、儿茶素、木犀草素、厚朴酚与肿瘤坏死因子α的对接结果良好。结论 采用网络药理学方法初步阐明了小承气汤的药效物质基础、作用的关键靶点和主要作用途径，为该方进一步的药理学研究和机制研究提供理论依据。     

基于网络药理学的仙鹤草-鸡血藤治疗原发免疫性血小板减少症的作用机制研究

目的：基于网络药理学方法研究仙鹤草-鸡血藤治疗原发免疫性血小板减少症(ITP)的作用机制。方法：通过TCMSP平台筛选仙鹤草-鸡血藤的活性成分及其对应的靶基因,搜索疾病靶点、仙鹤草-鸡血藤治疗ITP的共同靶标基因,构建仙鹤草-鸡血藤活性成分-ITP靶标基因关系网络图、蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络,进行基因本体(GO)功能和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。结果：获得仙鹤草-鸡血藤活性成分29种,作用靶点663个,疾病相关靶点1001个,成分-疾病-靶点47个。PPI网络显示,肿瘤坏死因子、白介素-6、白介素-1β、信号转导及转录激活蛋白3等靶点与仙鹤草-鸡血藤治疗ITP的关系最为密切。GO功能富集分析中,生物过程主要集中在对炎症反应、细胞对有机化合物的反应、对脂多糖的反应等;分子功能主要集中在蛋白结合、细胞因子活性、相同的蛋白质结合等;细胞组分主要集中在细胞外间隙、等离子膜外侧、细胞外区域等。KEGG通路富集分析主要包括肿瘤坏死因子信号通路、趋化因子信号通路、Toll样受体信号通路、磷脂酰肌醇3-激酶-丝氨酸-苏氨酸激酶信号通路等。结论：仙鹤草-鸡血藤可通过多靶...     

基于网络药理学探究三物白散治疗胃癌的机制

目的基于网络药理学的方法,探讨三物白散治疗胃癌的作用机制。方法分别利用TCMSP、 BATMAN-TCM数据库结合文献筛选,获得三物白散的活性成分及相关靶点;利用Cytoscape构建成分-靶点网络图;利用GEO、Genecards、OMIM数据库获得胃癌相关靶点;在线分析工具制作韦恩图获得三物白散作用于胃癌的靶基因;利用String网站构建靶基因的PPI网络;利用R软件获得PPI网络中的关键基因。将三物白散中主要活性成分与PPI中的关键靶基因进行分子对接。利用Metascape在线工具对靶基因进行GO(基因本体论富集)、KEGG(通路富集)分析、蛋白互作网络构建及模块分析。结果筛选得到三物白散的活性成分46个,相关靶点387个,作用于胃癌的靶点289个,基因富集分析结果涉及激素水平调节、血液循环的正调节、脂质代谢调节等过程,涉及通路包括癌症通路、脂肪细胞因子信号通路、PPAR信号通路、cAMP信号通路、细胞凋亡、HIF-1信号通路、TNF信号通路等。结论三物白散可能通过调节缺氧、炎症与代谢相关因子、通路,改善肿瘤微环境,从而发挥治疗胃癌作用。     

探讨药对金银花-连翘干预痤疮的网络药理学机制

目的：基于网络药理学原理探讨药对金银花-连翘干预痤疮的分子通路及作用机制。方法：应用中药系统药理学数据库与分析平台（TCMSP）检索金银花、连翘化学成分、作用靶点;通过GeneCards数据库获取痤疮差异性靶点基因,预测中药中痤疮相关的作用靶点;通过STRING平台构建蛋白质-蛋白质相互作用网络,构建“中药-成分-关键靶标-主要通路”的可视化网络图。运用DAVID数据库对筛选出的靶点基因进行基因富集分析,从而获得基因本体论（GO）生物功能及京都基因和基因组百科全书（KEGG）信号通路注释结果,进而探究中药干预痤疮的分子作用机制。结果：药对金银花-连翘干预痤疮共预测得到活性成分29个,涉及核心靶点基因97个、GO生物功能103个、KEGG信号通路119个。结论：药对金银花-连翘主要活性成分通过多靶点、多通路干预痤疮,主要涉及核受体的活性、转录因子活性等功能,以及白细胞介素（Interleukin,IL）-17信号通路、肿瘤坏死因子（Tumor Necrosis Factor,TNF）信号通路和磷脂酰肌醇3激酶（Phosphatidylinositol 3-kinase,PI3K）-丝氨酸...