大数据分析:利用R语言对乳腺癌HER-2免疫组化进行质量控制

目的利用R语言对乳腺癌HER-2免疫组化进行质量控制。方法收集武汉大学人民医院病理科2015年6月～2018年3月临床病理信息库中,同时行HER-2免疫组化和FISH检测的857例乳腺癌。利用R语言对数据信息进行提取,统计分析乳腺癌HER-2分布情况、乳腺癌病理组织分型的FISH分布、失控风险与检测时间的关系。结果基于R语言对数据进行提取、统计、分析,FISH检测结果:HER-2阳性率为29.7%,阴性率为68.7%,HER-2不确定率为1.6%;免疫组化HER-2(2+)的病例中,FISH阳性率为21.4%。免疫组化HER-2(3+)与FISH检测结果的一致率为98%。乳腺癌病理组织分型的FISH分布:乳腺浸润性导管癌阳性率为30.7%,阴性率为67.2%,不确定率为2.1%;乳腺导管原位癌+微小浸润的阳性率为73.7%,阴性率为26.3%;乳腺浸润性微乳头癌阳性率为53.3%,阴性率为46.7%。R语言还可统计失控风险与检测时间的关系,显示可能失控的病例,对病理医师具有警示作用。结论 R语言作为一种开源的统计分析语言,其提供了丰富的数据统计和字符串处理功能,运用R语言可对HER-2免疫组化染色进行质量控制,寻找可能的失控点,以便查找原因,杜绝失控。     

2019版乳腺癌HER-2检测指南对FISH可疑阳性病例判读及其预后分析

目的比较2014版与2019版乳腺癌HER-2检测指南的差异,探讨2014版指南免疫组化HER-2 2+、 FISH结果为可疑阳性病例的临床病理特征,及两版指南不同判读结果与患者预后的关系。方法收集浸润性乳腺癌(invasive breast cancer, IBC)3 483例,依据2014版指南免疫组化HER-2 2+、FISH检测诊断为可疑阳性93例,根据2019版指南进行重新判读。收集该93例患者临床病理资料并随访,分析不同指南判读对患者预后的影响。结果 3 483例IBC中,免疫组化HER-2 0为635例(18.23%),HER-2 1+为544例(15.62%),HER-2 2+为1 419例(40.74%),HER-2 3+为885例(25.41%)。1 419例HER-2 2+行FISH检测,2014版指南判读阳性212例,阴性1 114例,可疑93例。其中,2014版指南判读93例可疑病例经2019版指南重新判读改为阴性,两版指南判读结果差异有显著性(P0.05)。93例患者中行抗HER-2治疗7例(7.53%),出现复发转移1例(1.08%);未行抗HER-2治疗组86例(92.47%),出现复发转移3例(3.23%),Kaplan-Meier生存分析Log-rank检验显示差异无统计学意义(χ~2=1.471,P=0.225)。这类患者是否行抗HER-2治疗,其预后及生存时间差异无统计学意义(P0.05)。结论 2019版乳腺癌HER-2检测指南对可疑阳性病例进行重新分类,在临床实践应用中具有更好的适用性。     

新旧两版指南对浸润性乳腺癌HER-2基因扩增的判读影响

目的探讨2014版与2019版《乳腺癌HER-2检测指南》对浸润性乳腺癌HER-2基因扩增的判读影响。方法收集698例浸润性乳腺癌石蜡标本,采用免疫组化(immunohistochemistry, IHC)法和荧光原位杂交(fluorescence in situ hybridization, FISH)法对HER-2蛋白表达和基因扩增进行检测,并用2014和2019版指南分别对检测结果进行判读。结果根据2014版指南FISH判读法检测HER-2基因扩增的阳性检出率为40.7%(284/698),阴性检出率为52.1%(364/698),不确定为7.2%(50/698)。根据2019版指南FISH判读法检测HER-2基因扩增的阳性检出率为40.0%(279/698),阴性检出率为60.0%(419/698)。两版指南中IHC与FISH法检测HER-2蛋白表达与基因扩增的总一致率分别为54.7%、55.7%;两版检测结果具有一致性(Kappa=0.277,P0.001;Kappa=0.251,P0.001),且均呈正相关(r=0.608,P0.001;r=0.641,P0.001)。结论 2019版指南取消FISH法检测HER-2基因扩增的不确定结果,使其阴性率有所增加,更加明确了HER-2基因状态,为临床靶向治疗提供参考。     

乳腺浸润性导管癌HER2免疫组化检测结果判定的重复性研究

目的 探讨病理医师对乳腺浸润性导管癌HER2免疫组化(immunohistochemistry,IHC)检测结果判定的重复性及其影响因素,寻求提高判读重复性和准确性的措施.方法 参照<乳腺癌HER2检测指南>,2位乳腺专科病理医师共同读片选取56例浸润性导管癌的HER2 IHC切片作为研究对象.4位非专科病理医师独立盲法完成对该组病例IHC切片的前后两轮结果判定.对第一轮4位观察者间的判读重复性和观察者自身的判读重复性进行Kappa分析.同时将2位专科医师共同确定的判读结果作为HER2判读参考分级,4位非专科医师第一轮的判读结果分别与之进行配对Kappa分析.结果 观察者间的判读重复性为中等(K=0.593 9),重复性最高的级别是HER2为0(K=0.811 4),最低的是HER2为2 (K=0.473 6).判读级别简化为阳性和阴性后,观察者间的重复性明显提高(K=0.723 0).4位观察者自身的判读重复性极好(Kw=0.821 9～0.916 5),判读的准确性则与经验有关.结论 采用标准化的检测手段、深入学习和实践现有的判读标准以及联合判读等措施应有助于提高HER2 IHC判读的重复性和准确性.     

超声内镜引导下细针穿刺传统涂片细胞学、液基细胞学及组织学结果对比及不一致原因分析

目的探讨超声内镜引导下细针穿刺(endoscopic ultrasound guided fine needle aspiration, EUS-FNA)传统涂片细胞学和液基细胞学的诊断价值,并分析与穿刺组织学结果不一致的原因。方法收集2016年1月～2018年9月武汉大学人民医院存档的193例EUS-FNA标本的传统涂片细胞学、液基细胞学及组织学结果。以组织学结果作为对照标准,分别对传统涂片细胞学与液基细胞学结果进行统计分析,并计算两种细胞学方法的准确性、特异性、敏感性、阳性预测值、阴性预测值、假阳性率及假阴性率。对细胞学与组织学不一致的病例重新阅片,并追踪临床随访情况,分析不一致原因。结果 193例EUS-FNA标本中,97例胰腺实性占位病灶穿刺、43例纵隔病灶及纵隔淋巴结穿刺、36例消化道管壁占位病灶穿刺、17例腹腔病灶及腹腔淋巴结穿刺。传统涂片细胞学与液基细胞学两种细胞学方法的准确性、特异性、敏感性、阳性预测值、阴性预测值、假阳性率及假阴性率差异均无显著性(分别为92.23%vs 88.60%,96.97%vs 96.21%,81.97%vs 72.13%,92.59%vs 89.80%,92.09%vs 88.19%,3.03%vs 3.79%,18.03%vs 27.87%;P均0.05)。传统涂片细胞学/液基细胞学结果与组织学结果不一致的病例共24例。分析不一致原因包括细胞学制片方式及诊断的局限性、穿刺取材所致组织学标本不满意或穿刺部位不准确、细胞病理医师判读有误。结论 EUS-FNA的传统涂片细胞学与液基细胞学两种评估方法的准确性、敏感性、特异性、阳性预测值、阴性预测值、假阳性率及假阴性率差异无显著性,但两种方法互为补充。联合使用EUS-FNA的细胞学和组织学评估,能提高诊断价值。     

胃癌中HER-2表达异质性的病理学分析

目的检测胃癌组织中HER-2蛋白表达水平和基因扩增情况,定量分析HER-2表达和分布特征的异质性,探讨其在判读中的影响。方法应用免疫组化检测并观察胃癌组织中HER-2蛋白表达水平及分布特征,应用荧光原位杂交(fluorescence in situ hybridization,FISH)技术检测HER-2基因扩增情况,并运用欧式距离等进行统计学处理。结果 373例胃癌手术切除标本中HER-2蛋白阳性率(3+)为12.33%,与基因扩增情况显著相关(P0.001)。98例有HER-2蛋白表达的标本总异质性、组内异质性及组间异质性大小差异均有统计学意义(P值分别为0.025、0.001、0.040);组内异质性大小明显低于组间异质性。根据标准判读为HER-2蛋白为2+及3+的病例异质性最大,1+病例最小。HER-2蛋白表达分布较均一的病例近乎为零,而同时具有阴阳脸及花斑样特征的病例最多。根据标准判读HER-2蛋白为0的病例中,有7例具有明显异质性。结论胃癌组织中HER-2蛋白表达的异质性较大且类型多样,判读时首先要增加观察视野,选择至少2个组织块进行HER-2蛋白检测;其次无论HER-2蛋白表达水平高低,均需同时检测基因扩增情况,以确保判读结果的准确性,更好的指导临床用药。     

河北省乳腺癌HER-2检测及判读问卷调查分析

目的 了解河北省乳腺癌HER-2检测及判读现状,发现潜在问题,提升市县级医院HER-2检测及判读水平.方法 使用网络问卷对河北省多家医院中乳腺癌HER-2检测及判读问题进行调查,并进行统计分析.结果 全国10余省市169位医师参加了调查,67.5％(114/169)为河北省病理医师,74.0％(125/169)的医院为...     

进展期乳腺浸润性导管癌HER-2/neu蛋白表达的稳定性分析

目的探讨HER-2/neu蛋白在进展期乳腺浸润性导管癌原发灶和同期腋窝淋巴结转移灶中的表达,指导临床检测标本的选择以及检测报告的分析与应用。方法收集进展期乳腺浸润性导管癌标本100例制备全信息组织芯片,采用免疫组化法检测HER-2/neu蛋白表达,FISH法检测HER-2/neu基因扩增状态,分析其特点、稳定性及其相互关系。结果 69%病例HER-2/neu蛋白呈均质性表达,与同期腋窝淋巴结转移灶相比,原发灶蛋白均质阴性病例一致性最强,均质阳性病例次之,均质不确定病例最差;三者相比差异有统计学意义(P0.000 1)。36例HER-2/neu蛋白不确定和异质性病例的FISH检测显示20例为基因均质扩增,13例为基因均质非扩增,3例为基因异质性,其中31.65%的蛋白阴性位点HER-2/neu基因扩增。结论乳腺浸润性导管癌HER-2/neu蛋白表达在肿瘤原发灶和同期腋窝淋巴结转移灶之间稳定性较高,尤以阴性病例最稳定;免疫组化与FISH同步检测及对比分析可能为乳腺癌患者的治疗及预后提供更为精准的信息;应用全信息组织芯片更能全面检测HER-2/neu蛋白表达及基因状态,并可用于深入分析乳腺癌基因分型及其它相关指标在肿瘤进展中的变化。     

免疫组化法与双色银染原位杂交法用于乳腺癌HER-2检测诊断中的应用价值分析

目的 探讨免疫组化法与双色银染原位杂交(DISH)法用于乳腺癌HER-2检测诊断中的价值情况.方法 选取本院收治的乳腺癌患者242例,单侧肿瘤患者201例,双侧肿瘤患者41例,比较分析免疫组化法与双色银染原位杂交对肿瘤组织HER-2检测诊断的阳性率情况等,完成比较评价.结果 本研究中共纳入242例,均为女性,平均年龄43.7±5.4岁;单侧肿瘤患者201例,平均年龄42.3±5.9岁,淋巴转移患者23例,占11.44%;双侧肿瘤患者41例,平均年龄41.9±5.8岁,6例淋巴转移(14.63%).使用DISH法检测HER-2的阳性率为83.06%,略低于免疫组化法的检出阳性率87.19%, P<0.05.进一步分析DISH和免疫组化检测HER-2阳性情况,发现DISH和IHC检测方法检测HER-2阴性的一致率为100%,IHC(+)与DISH检测一致率为83.72%,IHC(++)与DISH检测一致率为97.37%,IHC(+++)与DISH检测一致率为98.91%.结论 原位杂交法和免疫组化方法两种不同方法在检测乳腺癌HER-2表达中检出阳性率均良好,IHC检出HER-2表达越高,DISH检测的阳性率与其一致性也越高.作为新方法的DISH法值得临床推广.     

雌激素受体低表达乳腺癌免疫组织化学结果判读影响因素探讨

目的探讨雌激素受体(ER)低表达乳腺癌免疫组织化学结果判读的影响因素。方法收集昆明医科大学第一附属医院2018—2021年病理档案中报告为ER低表达的乳腺癌病例, 重新判读结果并分析与原结果不一致的原因及影响同一患者穿刺标本与根治标本之间ER结果差异的因素, 并进行不同医师间判读重复性分析。结果 ER低表达病例误判率为15.94%(11/69), 原因包括正常乳腺组织的卷入、接近阈值和染色微弱情况下的判读困难。穿刺与根治标本ER检测结果18例(18/35, 51.43%)显示出差异, 其原因包括组织固定、肿瘤异质性、染色微弱、新辅助治疗。重复性判读乳腺病理专科医师间具有中、高度的可重复性;非专科医师与专科医师、非专科医师间可重复性差。结论组织固定、肿瘤异质性、染色微弱的判断、观察者的经验和判读重复性均是导致ER免疫组织化学出现差异的因素。严格规范检测和判读流程、加强病理医师培训有助于提高ER低表达乳腺癌的检测和判读准确性。     

胃癌单、双蜡块中HER-2的表达及其临床意义

目的探讨免疫组化双蜡块法检测胃癌中HER-2蛋白的实用性,分析HER-2过表达与胃癌临床病理特征的相关性。方法采用免疫组化法检测胃癌中HER-2表达,将2 500例胃癌标本分为两组:(1)单蜡块组956例标本使用1个组织蜡块,(2)双蜡块组中1 544例使用2个组织蜡块。在双蜡块组中,将HER-2评分较高者作为最终判读结果,并对两组数据相应的临床病理特征进行综合分析。结果单蜡块组:HER-2评分为0、1+、2+、3+的患者分别为582例(60.9%)、158例(16.5%)、122例(12.8%)、94例(9.8%);双蜡块组:HER-2评分为0、1+、2+、3+的患者分别为815例(52.8%)、377例(24.4%)、160例(10.4%)、192例(12.4%),其中有412例(26.7%)双蜡块出现不一致结果。双蜡块组检测胃癌HER-2阳性率(3+)高于单蜡块组。胃癌HER-2表达与肿瘤部位、组织学类型和分化程度相关(P0.05);与患者性别、年龄、肿瘤大小、浸润深度、淋巴结转移及远处转移等无明显相关(P0.05)。结论双蜡块法HER-2阳性率高于单蜡块法,免疫组化双蜡块法是一种更加高效、经济、实用的胃癌HER-2检测法。HER-2过表达与肿瘤部位、组织学类型和分化程度密切相关。     

宫颈/阴道液基细胞学假阴性诊断的影响因素分析

目的探讨宫颈/阴道液基细胞学假阴性诊断的可能影响因素, 进一步提高宫颈/阴道细胞学检测的灵敏度。方法回顾性分析2015年7月至2018年12月北京大学第一医院妇产科门诊及住院患者的宫颈/阴道细胞学标本检测结果, 将6个月内活检病理诊断为宫颈上皮内瘤变(CIN)2或阴道上皮内瘤变(VAIN)2及以上病变, 且细胞学检测结果为未见上皮内细胞病变及恶性(NILM)视为细胞学假阴性。细胞学假阴性涂片的复阅, 由2位高年资(主治以上)细胞学医师共同完成。采用二分类Logistic回归评估年龄、病变位点、病变程度3个因素对细胞学检测假阴性诊断的影响, 并结合复阅结果分析假阴性诊断不一致的原因。结果 1 009例CIN2+和VAIN2+病变中, 180例(17.8%)细胞学结果为NILM。复阅涂片后, 123例(68.3%)判读为NILM;57例(31.7%)判读为细胞学异常。患者年龄≤30岁组的假阴性率最高(20.8%), 其风险是31～60岁年龄组的8.85倍(P<0.001), 是年龄≥60岁组的9.26倍(P<0.001)。以宫颈多点病变为参照, 宫颈息肉或宫颈管内病变的细胞学假...     

晚期非小细胞肺癌中ALK的表达及检测方法的比较

目的探讨晚期非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)中ALK蛋白表达及与临床病理特征的关系,旨在开展易普及的筛查方法。方法采用Ventana全自动免疫组化技术检测421例晚期NSCLC患者中ALK的表达,并采用FISH法验证免疫组化检测的准确性,分析ALK表达与NSCLC临床病理特征的关系。结果免疫组化检测421例NSCLC中Ventana ALK表达,阳性率为7.6%(32/421)。免疫组化检测阳性病例经FISH验证,ALK的阳性率为7.36%(31/421)。Ventana ALK的免疫组化检测与FISH检测结果吻合率达96.88%,两者具有较高的一致性(P0.05)。ALK表达在女性及腺癌中阳性率明显升高(PO.05);与患者年龄、取材部位、吸烟情况无关(P0.05)。结论 Ventana ALK全自动免疫组化检测准确性较高,实际操作流程更简便、易判读,可作为可靠的ALK筛查手段。     

乳腺浸润性导管癌穿刺标本与配对的手术标本HER-2受体蛋白表达的比较

目的探讨乳腺浸润性导管癌穿刺标本与对应的手术标本HER-2受体蛋白表达的一致性。方法收集既有穿刺标本又有手术标本的乳腺浸润性导管癌46例,对每例标本进行HER-2受体蛋白的免疫组化染色,并比较二者的一致性。结果 46例配对标本中,40例穿刺标本与手术标本HER-2受体蛋白的表达一致率为87.0%。结论乳腺浸润性导管癌穿刺标本与手术标本HER-2受体蛋白表达,具有极高的一致性。     

采用双蜡块检测胃癌中HER-2蛋白的表达

目的探讨双蜡块检测胃癌中HER-2蛋白的表达,分析该方法的实用性。方法收集259例胃癌手术标本,每个病例用2个蜡块检测HER-2蛋白表达,统计学分析双蜡块和单蜡块免疫表型的差异。结果所有病例1号蜡块中HER-2呈1+、2+和3+分别为64例(24.7%)、100例(38.6%)、29例(11.2%)。2号蜡块中HER-2呈1+、2+、和3+分别为54例(20.8%)、106例(40.9%)、38例(14.7%)。联合1号和2号蜡块,HER-2呈1+、2+和3+分别为45例(17.4%)、122例(47.1%)、40例(15.4%)。1号和2号蜡块检测结果不一致为75例,占29.0%。结论在胃癌手术切除标本中,用双蜡块检测HER-2蛋白表达,能提高HER-2的阳性率,减少肿瘤异质性造成的假阴性。     

基于人工智能辅助乳腺癌新辅助治疗后肿瘤浸润淋巴细胞评估及可重复性分析

目的 对比分析人工智能(artificial intelligence, AI)显微镜辅助和显微镜下视觉评估判读乳腺癌新辅助治疗后肿瘤浸润淋巴细胞(tumor infiltrating lymphocytes, TILs),探讨利用AI结合病理医师判读新辅助治疗后TILs的临床适用性。方法 收集行新辅助治疗乳腺癌且未获得完全缓解病例50例，由9名不同级别的病理医师通过视觉评估和AI显微镜辅助评估TILs。采用组内相关系数(intra-group correlation coefficient, ICC)和Bland-Altman散点图进行一致性分析。结果 视觉评估组9名病理医师间TILs判读结果差异有统计学意义(P<0.05,ICC=0.741,95%CI=0.656～0.821),仅高级病理医师对TILs判读结果差异较小，中级及初级病理医师的TILs判读结果差异有显著性(P<0.05)。通过AI显微镜辅助判读，不同级别病理医师对TILs判读结果差异无显著(ICC=0.955,95%CI=0.931～0.971),判读结果达到优等一致性。同时，通过对比AI辅助组与视觉评估组...     

乳腺核芯针穿刺病理诊断的准确性

目的 提高乳腺核芯针穿刺病理诊断的准确性.方法 回顾性观察解放军总医院病理科2004年1月至2007年6月667例超声引导下乳腺核芯针穿刺连续病例,主要以先行核芯针穿刺活检,随后切除病变的患者为研究对象,对比核芯针穿刺与手术切除标本的病理形态,分析诊断差异的原因.结果 382例核芯针穿刺后行局部病变切除、保乳手术和乳房切除术,切除手术后病理诊断为恶性者281例,其中假阴性4例,假阴性率为1.4%.无假阳性病例.低估者28例,导管原位癌低估者为6/11,高估者2例.核芯针穿刺诊断的准确率为94.7%(266/281).结论 了解乳腺核芯针穿刺取材的局限性,善用免疫组织化学指标,掌握少见病变,才能减少低估和高估病例、杜绝假阳性病例.病理医师应在保证诊断准确的前提下,尽可能细化诊断.     

乳腺核芯针穿刺病理诊断的准确性

目的 提高乳腺核芯针穿刺病理诊断的准确性.方法 回顾性观察解放军总医院病理科2004年1月至2007年6月667例超声引导下乳腺核芯针穿刺连续病例,主要以先行核芯针穿刺活检,随后切除病变的患者为研究对象,对比核芯针穿刺与手术切除标本的病理形态,分析诊断差异的原因.结果 382例核芯针穿刺后行局部病变切除、保乳手术和乳房切除术,切除手术后病理诊断为恶性者281例,其中假阴性4例,假阴性率为1.4%.无假阳性病例.低估者28例,导管原位癌低估者为6/11,高估者2例.核芯针穿刺诊断的准确率为94.7%(266/281).结论 了解乳腺核芯针穿刺取材的局限性,善用免疫组织化学指标,掌握少见病变,才能减少低估和高估病例、杜绝假阳性病例.病理医师应在保证诊断准确的前提下,尽可能细化诊断.     

FISH检测在乳腺癌的非典型扩增和不确定病例中的应用价值

目的探讨乳腺癌HER-2 FISH检测中"非典型"扩增组和"不确定"组病例的相关临床病理特征,并分析其临床病理价值及相关性。方法收集2014年6月～2017年8月原发性浸润性乳腺癌336例,收集指标包括HER-2 FISH、HER-2免疫组化、ER表达、组织学分级以及患者年龄,并根据2013年美国临床肿瘤学会和美国病理学家协会更新后的检测指南对FISH检测结果进行分类。结果非典型扩增可分为以下几类:(1)单倍体组(比率≥2. 0,HER-2平均拷贝数/细胞4. 0);(2)双倍体/多倍体组(比率2. 0,HER-2平均拷贝数/细胞≥6. 0);(3)低水平扩增组(比率≥2. 0,HER-2平均拷贝数/细胞为4. 0～5. 9);(4)有成簇的HER-2阳性细胞聚集的"异质性"病例组。在336例患者中,32例为不确定病例(9. 52%),15例为非典型HER-2扩增病例(4. 46%),其中非典型扩增组中4例为单倍体扩增(1. 19%),6例为双倍体/多倍体扩增(1. 79%),2例为低水平扩增(0. 59%),3例为"异质性簇状扩增"病例(0. 89%)。非典型扩增和不确定的病例均有典型的ER阳性。双倍体/多倍体的病例更具有侵略性,而单倍体病例往往有着更低的风险特征。结论行FISH检测为乳腺癌中非典型扩增和不确定病例的分类提供支持,也为评估是否为非典型扩增的病例进行HER-2靶向疗法提供依据。     

乳腺癌原发肿瘤和复发肿瘤间ER、PR和HER-2表达不一致及其对患者生存的影响

目的探讨乳腺癌原发肿瘤和复发肿瘤组织中ER、PR和HER-2表达不一致与临床病理特征的关系及对预后的影响。方法采用免疫组化和荧光原位杂交法检测62例乳腺癌原发肿瘤和复发肿瘤组织中ER、PR和HER-2的表达,分析乳腺癌原发肿瘤和复发肿瘤组织中ER、PR和HER-2表达不一致与临床病理特征的关系及与患者生存的关系。结果在62例乳腺癌原发肿瘤和复发肿瘤组织中ER、PR和HER-2表达不一致分别为6例(9. 7%)、9例(14. 5%)和3例(4. 8%)。ER表达不一致患者的中位总生存期和中位复发后生存期分别为29个月和6个月,而ER表达一致患者的中位总生存期和中位复发后生存期分别为44个月和15个月(P=0. 021,P=0. 027)。PR及HER-2表达不一致患者与PR及HER-2表达一致患者总生存期和复发后生存期差异均无统计学意义(P均 0. 05)。结论乳腺癌原发肿瘤和复发肿瘤组织之间ER、PR和HER-2表达状态显著改变。乳腺癌ER状态不稳定提示患者预后较差。