咽拭子和肛拭子标本核酸检测对新型冠状病毒肺炎检测效果的比较

目的分析咽拭子和肛拭子标本核酸检测对新型冠状病毒肺炎检测效果的应用价值。方法选取2020年3月至2021年1月安阳地区医院收治的新型冠状病毒肺炎患者82例,收集患者咽拭子标本、肛拭子标本,均行核酸检测。比较不同标本的检出率,同一患者、同一时间、不同标本检测结果,咽拭子检出患者病毒核酸扩增循环阈值(Ct值)情况变化。结果肛拭子阳性检出率(24.39%,40/164)较咽拭子阳性检出率(38.41%,63/164)低,差异有统计学意义(χ^(2)=7.487,P<0.05)。同一患者、同一时间肛拭子阳性检出率(17.07%,28/82)较咽拭子(9.76%,16/82)高(χ^(2)=4.473,P<0.05)。检出组ORFlab基因、N基因与未检出组比较,差异未见统计学意义(P>0.05)。结论咽拭子和肛拭子标本核酸检测对新型冠状病毒肺炎病毒核酸扩增Ct值无明显影响,咽拭子阳性率高,但同一患者同一时间肛拭子阳性率高,临床可结合实际情况联合应用两种检测方法,以提高检验结果准确性。     

郑州市23例SARS-CoV-2核酸单靶标阳性标本的跟踪检测分析

目的对郑州市23例严重急性呼吸综合征冠状病毒2(SARS-CoV-2)核酸单靶标阳性标本进行跟踪检测分析,为实验室检测提供参考。方法按照《新型冠状病毒肺炎防控方案》采集新型冠状病毒肺炎(COVID-19)疑似患者的鼻拭子或咽拭子,提取SARS-CoV-2核酸并采用实时荧光逆转录聚合酶链反应(RTPCR)检测。对6例开放读码框1ab(ORF1ab)基因单靶标阳性和17例核壳蛋白(N)基因单靶标阳性患者进行重新采样检测。结果首检23例SARS-CoV-2核酸单靶标阳性的标本中有8例疑似病例在随后的重新采样检测中被确认为SARS-CoV-2核酸阳性,重新采样检测阳性率为34.78%。结论 COVID-19同种类型标本2次采样检测中均出现单靶标阳性的检测结果时,应该慎重对待,建议重新采样跟踪检测。     

道孚县新型冠状病毒肺炎患者口咽和粪便标本核酸检测结果分析

目的分析新型冠状病毒肺炎确诊患者住院和出院后集中隔离期间新型冠状病毒核酸检测结果。方法收集2020年2月四川省道孚县67例新型冠状病毒肺炎确诊病例核酸检测结果,统计分析一般资料、粪便标本核酸检测情况等。结果轻型、普通型病例组间性别差异无统计学意义(P=0.652),年龄分布有统计学意义(P=0.001);入院后口咽拭子核酸转阴平均天数为(7.4±6.2) d,轻型、普通型两组间差异无统计学意义(P=0.881)。16例患者出院后2周内粪便标本核酸检测呈阳性,阳性率为23.9%(16/67)。结论新型冠状病毒肺炎患者出院后2周内有部分患者粪便中能检出新型冠状病毒核酸,疾病防控部门应重视出院患者排泄物的消杀。     

COVID-19患者5种标本的SARS-CoV-2核酸与血浆IgM抗体检测结果分析

目的 分析不同标本类型与检测次数对新型冠状病毒(SARS-CoV-2)核酸检测结果的影响,评价SARS-CoV-2核酸与IgM抗体检测技术在新型冠状病毒肺炎(COVID-19)患者诊断中的应用.方法 连续3次(每天1次)采集患者的痰、咽拭子、血液、唾液和晨尿标本,实时荧光定量逆转录聚合酶链反应(qRT-PCR)检测SARS-CoV-2核酸,同时检测患者血浆SARS-CoV-2 IgM抗体.对检测结果进行以下分析:1次与连续3次(每天1次)检测5种标本的SARS-CoV-2核酸阳性率;1次与连续3次(每天1次)检测SARS-CoV-2 IgM抗体的阳性率;连续3次检测5种标本的SARS-CoV-2核酸阳性率与SARS-CoV-2 IgM抗体检测的阳性率比较,以及两者联合应用对COVID-19患者的检出情况.结果 1次检测5种标本SARS-CoV-2核酸,各标本的阳性率:痰46.66％,咽拭子40.00％,血浆13.33％,唾液33.33％,晨尿0;同种标本连续检测3次SARS-CoV-2核酸,各标本的阳性率:痰80.00％,咽拭子66.66％,血浆13.33％,唾液60.00％,晨尿0.1次与连续3次检测患者血浆SARS-CoV-2 IgM抗体的阳性率均为93.33％.血浆SARS-CoV-2 IgM抗体的阳性率明显高于SARS-CoV-2核酸技术,两种方法联合对COVID-19的检出率为100.00％.结论 SARS-CoV-2核酸检测阳性检出率与采集标本种类相关,多次多部位采集标本可明显提高SARS-CoV-2核酸阳性检出率.SARS-CoV-2 IgM抗体阳性检出率明显高于SARS-CoV-2核酸技术,两种方法联合可明显提高COVID-19的实验室检出率.     

江苏省扬州市新型冠状病毒肺炎患者核酸检测结果分析

目的分析江苏省扬州市报告的新型冠状病毒肺炎(COVID-19)确诊病例和无症状感染者的核酸检测结果。方法对COVID-19确诊病例和无症状感染者进行随访,连续6周采集咽拭子进行病毒核酸检测。结果暴露后第2、3、4周的病毒核酸检测结果显示,COVID-19确诊病例阳性率为100. 00%、61. 54%、8. 33%,平均核酸检测阳性时间为(24. 08±1. 17) d,无症状感染者阳性率依次为100. 00%、66. 67%、20. 00%,平均核酸检测阳性时间为(25. 21±1. 28) d,差异无统计学意义(P=0. 42)。确诊病例暴露后第2、3周核酸检测新型冠状病毒ORF1ab基因平均循环阈值(Ct值)为(31. 56±4. 98)、(34. 26±3. 16),N基因平均Ct值为(30. 88±4. 82)、(34. 40±2. 86),差异均无统计学意义(P=0. 25、0. 15)。从第4周开始,因咽拭子的核酸检测阳性例数较少(n≤1),未参与统计。无症状感染者暴露后第2、3、4周核酸检测新型冠状病毒ORF1ab基因平均Ct值为(31. 01±3. 68)、(32. 64±3. 74)、(29. 05±2. 96),N基因平均Ct值为(31. 37±3. 62)、(32. 9±3. 51)、(28. 40±4. 19),差异均无统计学意义(P=0. 23、0. 12)。从第5周开始,因咽拭子的核酸检测阳性例数较少(n≤1),不参与统计。确诊病例和无症状感染者中均有1例病例咽拭子核酸检测复检阳性。结论确诊病例和无症状感染者暴露后,第2周内呼吸道标本阳性检出率高,2组核酸检测阳性时间无显著差异,确诊病例和无症状感染者咽拭子标本连续2次核酸检测阴性存在复检阳性风险。     

新型冠状病毒核酸检测高循环阈值情况分析

目的探讨新型冠状病毒核酸检测出现高循环阈值(Ct值)情况的原因。方法用实时荧光RT-PCR法检测疑似新型冠状病毒肺炎患者鼻咽拭子、肛拭子样本新型冠状病毒核酸,回顾性分析Ct值处于33~38的高Ct值样本在同一患者重复采样检测、不同品牌基因扩增仪检测及不同实验室相同型号仪器检测情况下结果的一致性。结果8例单靶位高Ct值阳性患者次日重复采样检测结果双靶标均为阴性。7例高Ct值样本有6例同一样本核酸在LC480及ABI 75002台扩增仪上检测结果不一致,包括ORF1ab基因检测结果不一致4例,N基因不一致4例,其中ORF1ab基因和N基因均不一致2例。5例高Ct值样本不同实验室相同基因扩增仪结果均不一致。结论该病毒核酸检测高Ct值时结果重复性较差,需要其他检测方法同时进行补充检测。     

北京某综合三甲医院对COVID-19疑似和非疑似患者进行SARS-CoV-2核酸筛查结果分析

目的 以北京综合三甲医院为例,对新型冠状病毒肺炎(COVID-19)疑似患者和非疑似患者的新型冠状病毒(SARS-CoV-2)核酸筛查结果进行分析,为COVID-19的实验室诊断提供实验依据.方法 SARS-CoV-2核酸检测的咽拭子标本来自2595例患者,COVID-19疑似患者81例,非疑似患者2514例.咽拭子标...     

海南省67例新型冠状病毒肺炎患者核酸检测结果回顾性分析

目的探讨海南省人民医院收治的67名新型冠状病毒肺炎患者于不同病程、不同类型样本中新型冠状病毒(SARS-CoV-2)的分布特点及核酸检测的临床意义。方法选取2020年1月24日至3月31日在海南省人民医院收治的新型冠状病毒肺炎患者67例,对其咽拭子、血液、尿液、粪便等标本SARS-CoV-2核酸检测结果及病历记录等资料进行回顾性分析。结果 67例确诊病例中有57例肺部CT出现病变并核酸阳性而确诊入院,其中31例在入院后多类样本核酸检测多次阳性;26例疾控中心核酸检测阳性而确诊入院,入院后多次咽拭子、血液、尿液、粪便核酸检测阴性,CT检测有典型的肺部病变;9例有武汉旅居及患者接触史并呈现肺部CT改变而收治入院;1例咽拭子核酸阳性,CT无改变。1例出院后复诊,粪便核酸检测阳性。咽拭子核酸阳性大多出现在住院早中期,粪便核酸阳性贯穿整个病程,尤其是病情恢复期,临床症状痊愈后只有粪便核酸检测阳性。结论不应以单次初次核酸检测结果是否阳性作为确诊依据,连续多次核酸检测阴性也不能排除感染SARS-CoV-2的可能性,应从多方面综合分析,避免在实际工作中漏诊。     

新型冠状病毒肺炎患者多类型样本SARS-CoV-2 核酸检测在临床诊疗中的意义

目的　探讨不同类型样本新冠核酸检测结果在新型冠状病毒肺炎（COVID-19）临床诊治和疫情防控中的意义。 方法　选取 2020 年1 月23 日~2 月22 日延安大学附属医院确诊的5 例COVID-19 患者,采集不同部位标本进行核酸 检测,并进行统计学分析。结果　采集的123 例标本严重急性呼吸综合征冠状病毒2（SARS-CoV-2）核酸检测结果表明, 咽拭子25 例,阳性率44.0％（11/25）; 鼻拭子40 例,阳性率25.0％（10/40); 肛拭子40 例, 阳性率70.0％（28/40);18 例血标本核酸检测均阴性,5 例患者符合出院标准时粪便核酸检测均阳性。截止3 月5 日对5 例患者出院后追踪发现, 出院2 周或更长时间粪便 SARS-CoV-2 核酸仍阳性。结论　多样本新冠核酸检测对于新冠感染患者的确诊有重要价值; 患者治愈出院后应加强随访、教育和复查,做好排泄物的管理,有利于巩固疫情防控效果,减少接触感染的发生。     

咽拭子与支气管肺泡灌洗液荧光定量PCR检测儿童肺炎支原体感染分析

目的了解咽拭子标本以及支气管肺泡灌洗液(BALF)标本在肺炎支原体(MP)临床核酸检测、细菌定量以及实验室分离培养中的效果,初步评估咽拭子作为核酸检测及分离培养标本的意义,并评估MP肺炎患儿的同期咽拭子的MP核酸载量能否准确预测出BALF的MP核酸载量。方法采集29例MP肺炎住院患儿的同期咽拭子及BALF,利用人源性β-globin内参基因质控所有标本采集及核酸提取质量,合格标本使用MP荧光定量PCR对同一患儿同期咽拭子及BALF标本中MP进行定量分析,计算两种标本的MP核酸载量。并对所有标本进行MP培养,比较两类标本的MP阳性培养率、细菌污染率。结果标本的β-globin内参基因检测阳性率为100%,咽拭子和BALF标本荧光PCR检测阳性率均为86.2%(25/29),其中咽拭子MP核酸定量范围是3.2×10~2拷贝/ml～1.8×10~7拷贝/ml,BALF为6.8×10~2拷贝/ml～5.4×10~8拷贝/ml。两种方法检测结果一致率为93.1%(27/29)。按照BALF标本MP载量递增排序后,阳性标本的咽拭子载量没有显示出类似的伴随升高趋势。BALF标本培养阳性率为65.5%(19/29),标本污染率为6.9%(2/29);咽拭子标本的MP培养阳性率为51.7%(15/29),标本污染率为51.7%(15/29)。结论咽拭子可以作为MP荧光PCR定性检测标本使用,但其不适合用于MP的定量研究,这说明咽拭子的MP核酸载量与BALF中载量不存在明显的相关性;BALF相比咽拭子标本培养率高、污染率低,更适合MP分离培养研究。     

1844例新型冠状病毒核酸检测及生物安全防护实践

目的通过新型冠状病毒核酸检测实践,探讨实时荧光定量RT-PCR检测新型冠状病毒的质量管理和生物安全防护。方法采集2020年1月30日-2020年2月28日就诊于深圳中医院发热门诊的患者(包括发热患者、湖北旅居者以及密切接触者、外地返深人员)的咽拭子、痰液、肺泡灌洗液、肛拭子等样本,共1844例,采用实时荧光定量RT-PCR方法检测新型冠状病毒开放读码框1ab(ORF1ab)、核衣壳蛋白(N)基因。结果 1844例样本中,检测出阳性病例2例。结论严格的质量控制和有效的生物安全防护保证了新冠核酸检测安全高效的开展,及时准确的检测结果为新冠肺炎的早发现、早诊断、早治疗提供精准依据。     

新型冠状病毒肺炎痰标本2019-nCoV核酸阳性3例报道:对咽拭子检测假阴性问题的思考及建议

由新型冠状病毒2019-nCoV引起的肺炎(COVID-19)目前疫情仍十分严峻.2019-nCoV的核酸检测是COVID-19确诊的必要指标之一.临床对标本类型的选择影响2019-nCoV核酸检出率.本文报道3例COVID-19患者的确诊经过,分析采用咽拭子和痰标本检测2019-nCoV的效果,为临床诊断COVID-...     

新型冠状病毒肺炎病例的发现与报告

各级各类医疗机构的医务人员发现符合病例定义的疑似病例后,应当立即进行单人间隔离治疗,院内专家会诊或主诊医师会诊,仍考虑疑似病例,在2小时内进行网络直报,并采集标本进行新型冠状病毒核酸检测,同时在确保转运安全前提下立即将疑似病例转运至定点医院。与新型冠状病毒感染者有密切接触的患者,即便常见呼吸道病原检测阳性,也建议及时进行新型冠状病毒病原学检测。疑似病例连续两次新型冠状病毒核酸检测阴性(采样时间至少间隔24小时)且发病7天后新型冠状病毒特异性抗体Ig M和Ig G仍为阴性可排除疑似病例诊断。     

4例COVID-19患者不同类型标本的SARS-CoV-2核酸及抗体检测结果分析

目的选择合适的标本类型进行SARS-CoV-2检测,为新型冠状病毒肺炎(COVID-19)的早期诊断提供依据。方法采集咽拭子核酸检测阳性的4名COVID-19患者的鼻拭子、粪便、尿液、血液(分离血清)标本,用实时荧光RT-PCR进行SARS-CoV-2核酸检测,用化学发光法检测患者血清IgM和IgG。结果 4名患者咽拭子和3例粪便标本的SARS-CoV-2核酸检测阳性、2例鼻拭子核酸检测阳性;1例患者感染SARS-CoV-2一周内血清IgM及IgG出现,其余3例患者同期血清抗体检测阴性。结论 SARS-CoV2可以通过多种途径进行传播,选择多种类型标本联合检测可提高病毒的检出率;同时血清学抗体检测可以作为核酸检测的补充。     

临时新型冠状病毒核酸实验室核酸污染监测及生物安全风险评估

目的对某新型冠状病毒定点医院临时新型冠状病毒核酸实验室进行核酸污染监测及生物安全风险评估。方法于2022年3月14日至5月16日每周一对某新型冠状病毒定点医院临时新型冠状病毒核酸实验室实验过程中以及消毒后各高风险实验活动区域及实验室工作人员防护物品表面进行新型冠状病毒核酸采样, 采用实时荧光定量PCR技术对样本进行检测。结果各高风险实验活动区域及实验室工作人员防护物品表面共40处采样点采集760份样本。样本处理区有8个采样点检出阳性, 阳性率为27%(27/100), 其中以生物安全柜、转运箱外表面和编号样本架阳性检出率最高, 分别为5/10、4/10和6/10。核酸检测区有7个采样点检出阳性, 全部出现在PCR综合实验间, 阳性率为7.1%(10/140), 其中以样本传递窗和核酸检测区门把手阳性检出率最高, 均为4/20。来自样本处理区的阳性样本靶基因Ct值显著高于核酸检测区。实验人员防护物品表面的检出阳性率为20%(16/80), 部分实验人员在实验过程中外层手套阳性检出率最高可达9/10。消毒后新型冠状病毒核酸实验室各区域及实验人员防护物品表面的核酸残留能够被有效清除。结论实验...     

西安地区新型冠状病毒肺炎患者康复期2019-nCoV 核酸检测复阳结果分析

目的 研究西安地区新型冠状病毒肺炎（corona virus disease 2019,COVID-19）患者康复期新型冠状病毒（2019-nCoV）核酸检测复阳情况。方法 对2021 年12 月~2022 年2 月在西安秦皇医院的873 例COVID-19 患者康复期采集口咽和鼻咽拭子,应用实时荧光定量PCR 进行2019-nCoV 核酸检测,核酸复阳结果按性别、年龄、标本类型、靶标基因和Ct 值与转阴时间分别进行分组比较。结果 核酸检测复阳患者共201 例,阳性率为23.02%。不同性别（21.58%vs 24.81%）和年龄组（24.70 % vs 25.90%）核酸复阳率之间差异无统计学意义（χ2=1.272,3.223,均P>0.05）。双拭子（鼻咽+ 口咽）联合检测复阳率明显高于单鼻咽或单口咽拭子（23.02% vs 19.01%,5.84%）,且鼻咽拭子核酸复阳率明显高于口咽拭子,差异均有统计学意义（χ2=8.699,121.5,69.59 ,均P<0.05）。双靶标基因阳性标本数明显高于单靶标N 或ORF1ab 基因(55.30% vs 28.57%,16.13%),且单靶标N 基因阳性标本数明显高于ORF1ab 基因,差异均有统计学意义（χ2=31.83,72.51,9.679,均P<0.05）。不同区间Ct 值组间核酸转阴时间差异有统计学意义（F=16.66,P<0.001）,且转阴时间与复阳时的Ct 值呈显著负相关性（r= -0.539,P<0.05）。结论 COVID-19 患者康复期核酸复阳率仍较高,机制和原因尚不明确,仍需加强隔离管理和健康监测。     

肺炎支原体快速培养法在呼吸道疾病中的应用

目的探讨呼吸系统肺炎支原体感染的早期诊断。方法采用肺炎支原体快速液体培养法对320例临床拟诊为呼吸道感染患儿咽拭子及340例呼吸道感染的成人痰及咽拭子进行培养,并对320例呼吸道感染患儿作血清冷凝集试验及血清特异性抗体IgG检测。对检测结果和临床诊断进行分析。结果患儿肺炎支原体快速液体培养法阳性157例,阳性率49.1%;成人呼吸道感染咽拭子阳性112例,阳性率为32.9%,痰阳性28例,阳性率为8.2%;血清肺炎支原体IgG抗体阳性率为62.8%(201/320),冷凝集试验阳性率为35.6%(114/320)。结论肺炎支原体快速液体培养法快速、简便、敏感、特异,对肺炎支原体感染的早期诊断具有重要的参考价值,适合基层实验室开展应用。     

我国重庆市1例尼泊尔输入Delta变异株新型冠状病毒肺炎病例的流行病学调查

  目的  分析我国重庆市1例尼泊尔输入新型冠状病毒肺炎（COVID-19）病例的流行病学特征,为制定境外输入防控策略提供参考。   方法  对病例和密切接触者开展现场流行病学调查,采集咽拭子、鼻咽拭子等呼吸道标本,采用实时荧光RT-PCR方法检测新型冠状病毒（SARS-CoV-2）核酸,开展SARS-CoV-2全基因组测序,采用化学发光法检测SARS-CoV-2特异性IgM和IgG抗体。   结果  该病例为COVID-19普通型,尼泊尔输入,病例回国前72 h内2次SARS-CoV-2核酸检测和2次IgM抗体检测均为阴性,回国入境在机场海关上述检测均为阴性,集中隔离第5天SARS-CoV-2核酸检测阳性,基因测序为B.1.617.2进化分支,为Delta变异株,与近期印度流行的SARS-CoV-2变异株属同一进化分支。 病例入院后第1天IgM抗体阴性、IgG抗体阳性。  结论  Delta变异株传播快,外防输入不能松懈,国家及地区应分级精准防控。 在入境、转运、集中隔离等闭环管理环节做好个人防护,集中隔离要做好院感防护、医学观察及病毒核酸及抗体检测,疫苗需及时完成全程接种,同时针对入境人员选择采集鼻咽拭子标本。     

不同标本类型检测新型冠状病毒核酸的临床研究

目的 探究不同标本类型检测新型冠状病毒核酸的阳性检出率,从而选择该实验室检测系统下新型冠状病毒核酸检测的最适合标本,以提高新型冠状病毒肺炎(COVID-19)的诊断率.方法 对川北医学院附属医院2020年1月28日至3月4日1851例不同新型冠状病毒核酸检测结果进行统计分析,同时对已确诊的10例COVID-19患者的核...     

新型冠状病毒肺炎14例临床特征分析

目的分析14例新型冠状病毒肺炎患者的临床特征。方法收集2020年1月21日-2月21日渭南市中心医院收治的14例新型冠状病毒肺炎确诊患者的临床资料。回顾性分析患者的一般资料、流行病学史、临床症状、实验室检查、影像学表现及部分预后和转归。结果 14例新型冠状病毒肺炎患者中男女比例相同,年龄14～68岁,中位年龄41岁。可推算潜伏期者7例,为7～18 d,有3组家族聚集性发病,共10人。发病至确诊时间最长11 d,最短1 d。临床表现以发热、咽部不适、干咳为主要症状,仅1例患者有明显消化道症状。轻型4例,普通型7例,重型3例,无危重型病例。早期外周血白细胞和淋巴细胞计数多数正常,病程中观察到4例患者外周血淋巴细胞计数呈逐渐下降趋势,伴随持续发热或肺部影像学进展。6例患者血清C反应蛋白升高(包括3例重型新型冠状病毒肺炎)。14例患者降钙素原检查均未见升高。RT-PCR检测新型冠状病毒核酸,1例为第2次检测阳性、2例为第3次检测阳性。4例轻型患者胸部CT无明显改变,10例患者肺部存在多发病灶,均有磨玻璃影,病灶为单侧1例、双侧9例,均位于胸膜下或肺外带,合并有实变4例、结节影1例,无坏死灶出现,未见胸腔积液。目前14例患者中6例连续2次鼻咽拭子新型冠状病毒核酸检测转阴,病程6～27 d,中位时间22.5 d。结论新型冠状病毒肺炎在临床表现、实验室及影像学检查等方面均不具有特异性,确诊需新型冠状病毒核酸检测阳性,但部分患者需多次检测才能得到阳性结果,故新型冠状病毒肺炎的诊断仍需全面结合流行病学史、临床症状、辅助检测及病情进展等方面综合判断。