前列腺癌等位基因失衡(英文)

目的 了解前列腺癌克隆演变(clonal evolution)过程中遗传学机制. 方法 采用激光显微切割技术从保存的石蜡包埋组织中获取基因组DNA;利用6个位于染色体8p12-21、8p22、17q21上的具有多态性的微卫星标记,对25例患者原发癌及相应转移灶中等位基因的缺失或保留进行分析. 结果 在24例可供信息的病例中,14例(58%)在原发癌及相应转移灶中所有位点均表现为相同的等位基因缺失或保留模式,而另外10例(42%)则显示不一致的等位基因缺失.这10例中有5例原发癌表现为等位基因保留而在相应转移灶则为缺失,另外5例在一个或一个以上的位点表现为原发癌等位基因缺失而在相应转移灶保留. 结论 前列腺癌在原发癌及相应转移灶遗传组成上的差异可能与其内在异质性、整体遗传不稳定性及克隆差异有关.     

膀胱癌演变过程中等位基因缺失研究(英文)

目的 探讨膀胱癌克隆演变(clonal evolution)过程中遗传学机制.方法 分别利用4个位于染色体9p21区和17p13区上的具有多态性的微卫星标记物分析18例膀胱癌病人原发癌及相应转移灶中等位基因的缺失或保留方式.利用显微切割技术在保存的石蜡包埋组织中获取基因组DNA.结果 在原发癌和转移灶中总的等位基因缺失频率分别为78%(14/18)和89%(16/18);原发癌和转移灶在各位点D9S161的缺失频率为86%和100%,D9S171为67%和67%,IFNA 71%和71%,TP53 80%和80%.在18病例中,16例(89%)在原发癌及相应转移灶中所有位点均表现为相同的等位基因缺失或保留模式,而另外2例(11%)则显示不一致的等位基因缺失.这2例原发癌表现为等位基因保留而在相应转移灶则为缺失.结论 膀胱癌在原发癌及相应转移灶遗传组成上有相当一致性;当转移癌的原发癌不能确定来源时,位点D9S161,D9S171,IFNA和TP53的杂合性缺失可能作为膀胱癌的标志物.     

膀胱癌等位基因缺失研究

目的了解膀胱癌克隆演变(clonal evolution)过程中的遗传学机制。方法分别利用4个位于染色体9p21区和17p13区上具有多态性的微卫星标记物,分析了18位膀胱癌病人原发癌及相应转移灶中等位基因的缺失或保留方式。利用显微切割技术在保存的石蜡包埋组织中获取基因组DNA。结果在原发癌和转移灶中总的等位基因缺失频率均为89%(16/18),而在原发癌中D9S161的缺失频率为86%,D9S171为67%,IFNA71%,TP5380%;在转移灶中各位点缺失频率分别为100%(D9S161),67%(D9S171),71%(IFNA),80%(TP53)。18例病例中,16例(89%)在原发癌及相应转移灶中所有位点均表现为相同的等位基因缺失或保留模式,而另外2例(11%)则显示不一致的等位基因缺失。这2例在原发癌灶表现为等位基因保留而在相应转移灶则为缺失。结论膀胱癌在原发癌及相应转移灶遗传组成上有相当一致性;当转移癌的原发癌不能确定来源时,这些位点的杂合性缺失(LOH)可作为膀胱癌的标志物。     

前列腺癌原发灶和淋巴转移灶成对标本的p53基因异常

目的 探寻人前列腺癌转移的分子机制。方法 以29例病人原发性前列腺癌和淋巴转移组织成对标本为研究对象，用免疫组织化学方法检测了p53和p21^WAF1/CIP1蛋白的表达，后采用切片显微微切割和聚合酶链式反应－单股构造多态性分析（PCR－SSCP）及DNA测序测定p53基因突变。结果 12例病人原发癌灶和淋巴转移灶中p53基因的点突变位相同，3例病人原发癌灶无p53异常但淋巴转移灶中有p53基因点突变，1例病人原发癌灶有2种位点的p53基因点突变，淋巴转移灶有1个位点的p53基因点突变并和原发癌灶中位点之一相同。非癌组织中均有p21^WAF1/CIP1表达，有p53基因异常的前列腺癌原发灶和转移灶中均未见有p21^WAF1/CIP1蛋白的表达。结论 人前列腺癌发生及转移和p53基因异常有关，可能人前列腺癌原发癌细胞是杂合性的，转移灶来源于其中克隆的扩展，p21^WAF1/CIP1蛋白的翻译表达是p53基因依赖性的。     

前列腺癌染色体8p22-8p12基因杂合性丢失研究

目的探讨中国人前列腺癌染色体8p22～8p12基因杂合性丢失的发生率及细胞生物的意义.方法采用PCR-变性聚丙烯酰胺凝胶电泳和硝酸银染色技术,对32例前列腺癌组织及癌旁组织进行8p22-8p12区域内的5个微卫星多态标志物等位基因杂合性丢失(LOH)分析.结果5个微卫星平均发生率为76.6%,其中LPL-3GT位点LOH发生率最高(88.9%),D8S87位点最低(59.1%);8p22-p12位点LOH发生率与肿瘤分化密切相关.其中D8S133和D8S135位点LOH发生率与肿瘤分化程度呈正相关(P＜0.01),LPL-3GT、NEFL和D8S87位点LOH与肿瘤细胞分化程度无统计学意义(P＞0.05).结论研究结果提示,前列腺癌p22-8p12是LOH的频发区域,该区域等位基因LOH与前列腺癌的发生密切相关.不同位点LOH的发生其细胞生物学意义不同,提示可能存在生物学功能不同的肿瘤抑制基因.     

p21、p73和PTEN蛋白表达联合检测在头颈部多原发癌诊断中的价值

目的:探讨联合检测p21、p73及PTEN的表达状况在头颈部多原发癌诊断与鉴别诊断的意义。方法:应用免疫组织化学方法检测12例头颈部多原发癌组织中的p21p、73和PTEN蛋白表达,比较先证癌与第二癌间指标的表达状况。结果:12例头颈部多原发癌的先证癌与第二癌组织中p21、p73或PTEN单一指标表达结果不一致的分别为7例、3例、8例;联合对比p21和p73、p21和PTEN或p73和PTEN两指标表达结果存在不一致的分别为8例9、例、9例;联合对比p21、p73及PTEN三指标表达结果存在不一致的为10例。结论:应用免疫组化方法联合检测p21、p73及PTEN蛋白表达可提高头颈部多原发癌诊断的敏感性。多种相关基因蛋白表达的联合检测可成为头颈部多原发癌临床诊断与鉴别诊断的方法之一。     

ABH及Lewis A组织-血型抗原表达与原发肺腺癌转移和预后的关系

目的探讨ABH及LewisA组织-血型抗原表达与原发肺腺癌转移、预后的关系。方法免疫组织化学S-P法检测30例正常肺组织、103例原发肺腺癌及相应41例转移灶中的ABH及LewisA血型抗原表达。结果癌组织中A、B、H抗原表达缺失,低分化组缺失明显高于中高分化组(P<0.001),正常肺组织、原发癌及转移灶表达缺失率逐步增加(P<0.001),原发癌转移组缺失明显高于未转移组(P=0.036),转移灶缺失表达高于其相应原发癌(P=0.008)。Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ+Ⅳ期间LewisA表达有显著性异性(P=0.001),中晚期(Ⅱ+Ⅲ+Ⅳ)期LewisA阳性表达率高于早期癌(Ⅰ期,P<0.001)。ABH阳性表达者5年生存率为25%,高于阴性表达组(P<0.0001);LewisA阳性表达者5年生存率7%,低于阴性表达组(P=0.0002)。结论ABH抗原表达缺失与腺癌发生转移有密切关系;ABH及LewisA抗原检测对预测患者预后有重要意义。     

白细胞介素1A基因3′-UTR插入/缺失多态与中国汉族前列腺癌的相关性研究

目的 研究白细胞介素1A基因（IL1A）3′-UTR区"TTCA"插入（I）/缺失（D）多态性位点与中国汉族男性前列腺癌之间的关系。方法 采用聚合酶链反应-聚丙烯酰胺凝胶电泳（PCR-PAGE）方法,在131例前列腺癌患者和229例正常对照者样本中对IL1A基因3′-UTR区"TTCA"插入/缺失多态性位点（rs3783553）进行基因分型,分析比较两组样本间等位基因频率及基因型频率分布差异,探讨该位点与前列腺癌的相关性。结果 基因分型结果显示,两组样本中rs3783553位点基因型频率分布均符合Hardy-Weinberg平衡;统计结果显示,与D/D基因型相比,基因型为 D/I 或 I/I的个体罹患前列腺癌的风险降低（P=0.48,95%CI:0.31~0.74）;相对于等位基因D,等位基因I罹患前列腺的风险降低（P=0.001,OR=0.56,95%CI:0.40~0.79）。结论 IL1A基因3′-UTR区"TTCA"四碱基插入/缺失多态性可能与中国汉族男性前列腺癌的发病相关。     

X染色体失活和微卫星分析确定多发性子宫平滑肌瘤的独立克隆来源

目的:本研究分析了来自14例多发性子宫平滑肌瘤患者的43份样本的15个微卫星标志物的等位基因状态,并进行X染色体灭活分析,探讨子宫平滑肌瘤的肿瘤发生中的克隆性和遗传的关系。研究设计:本研究对定位于3q、7p、11及15q的15个微卫星多态性标志物进行自动性分析。通过X-连锁雄激素受体基因的甲基化状态来评估X染色体的失活。结果:15个微卫星标志物中至少有1个发生等位基因缺失,8例中有7例的杂合性缺失类型不同,在同一患者的3份样本同时监测到7p22-15存在杂合性缺失。X染色体失活分析显示12例患者中有9例患者的所有肿瘤样本中均出现了同样的…     

膀胱癌的克隆起源分析

目的探究多灶性、复发性、表浅性膀胱移行细胞癌的克隆起源。方法收集经手术切除或膀胱镜活检并经病理证实的20例患者的多灶性膀胱癌、原发癌及其相应的复发癌，病理分级Gl或G2的石蜡组织标本66块。所有标本均以10％福尔马林液固定后石蜡包埋。采用免疫组织化学染色S-P法检测p16、Rb、cyclinD1基因表达。采用二项式分布对结果进行统计学分析。结果16例病人多发、原发和复发膀胱肿瘤p16、Rb、cyclinD1表达完全一致；4例表达不一致。采用二项式分布计算分析认为此16例膀胱移行细胞癌均为单克隆起源，其余4例为多克隆起源。结论多灶性、复发性、表浅性膀胱癌可为单克隆起源，也可为多克隆起源，以单克隆起源为主。     

人肺腺癌染色体8p21～p22杂合性缺失精细作图

目的　在染色体 8p2 1 8p2 2界定发生于中国人肺腺癌的杂合性缺失 (LOH)的最小区域 ,为定位克隆肺腺癌相关抑癌基因提供线索。方法　利用 32例肺腺癌患者肿瘤组织检测位于 8p2 1～p2 2的 17个微卫星多态性标记的LOH频率 ,并且探讨各位点LOH与病理分级和临床分期的关系。结果　在 32例肺腺癌患者组织中有 31例 (96 6 7% )存在至少 1个位点的LOH ;主要集中于 3个区域 :位于 8p2 2的D8S2 5 4～ 2 6 1、D8S182 7～ 1731以及D8S1135。所检测位点中仅D8S2 6 1位点的LOH发生频率与肺腺癌分期呈正相关 (P <0 0 5 )。结论　 8p2 2区域可能存在位于D8S2 5 4～ 2 6 1,D8S1135和D8S182 7～ 1731的、与中国人肺腺癌相关的抑癌基因     

Chromosome 6q deletion mapping in human ovarian tumor, a common deletion region between D6S1649 and D6S311

Objective： To explore the loss of heterozygosity（LOH） on chromosome 6q in ovarian cancer, and localize a minimum area in deletion region. Methods： 93 ovarian tumors were analyzed for LOH studies with 10 microsatellite markers spanning chromosome 6q. To further localize a minimum area in deletion region. Nineteen microsatellite markers were used to refined a minimum area. Results： Forty three tumors （46%） were demonstrated allelic losses, which spanned less than two megabase areas, franked by a distal marker D6S311 and a proximal marker D6S1649, and likely harbored ovarian tumor suppressor gene （s）. With analysis of density of LOH, increased DNA copy number at loci of 6q was demonstrated between D6S1649 and D6S311. Conclusion： It is possible that duplication after the allelic loss might be a main mechanism that leads to carcinogenesis in ovarian tumor. The refinement of these candidate tumor suppressor genes loci might facilitate future loss of heterozygosity studies and enable the isolation of candidate genes from this region.     

Detailed deletion mapping on chromosome region 9p21 in human periampullary neoplasms

目的　进一步限定壶腹周围肿瘤染色体 9p2 1区域缺失范围。方法　选择染色体 9p2 1区域 5个微卫星多态性标记 ,通过聚合酶链反应、聚丙烯酰胺凝胶电泳和银染法 ,检测 35例壶腹周围肿瘤组织及其外周血杂合性丢失 (LOH)状况。结果　 50 % ( 4 /8)胰腺癌有至少一个微卫星位点的LOH ,其中D9S974 ( 37 5% )和D9S94 2 ( 2 8 6% )丢失频率较高 ,并且有连续性丢失现象。 62 5% ( 5/8)壶腹癌在部分或全部位点出现LOH ,其中D9S94 2 ( 4 2 9% )丢失频率最高 ,其次为IFNA( 37 5% )和D9S171( 37 5% )。 14 2 % ( 1/7)胰岛素瘤有一个位点LOH。结论　壶腹周围肿瘤染色体 9p2 1最小共同缺失区位于D9S974和D9S94 2位点之间 ,距离小于 15kb ,其中可能存在一个新的涉及该肿瘤发生的相关抑癌基因。     

“Different trend” in multiple primary lung cancer and intrapulmonary metastasis

Background

The distinguishing of intrapulmonary metastatic tumors from multiple primary lung cancers is difficult but of great importance for the therapeutic management and prognosis of these patients.

Methods

We used genomic DNA analyzed by six microsatellites (D7S1824, D15S822, D2S1363, D10S1239, D6S1056, and D22S689) with PCR to identify discordant allelic variation from 12 patients. There are five patients with multiple primary lung cancers and seven patients who were diagnosed with intrapulmonary metastases from 850 patients with primary lung cancer in our hospital. The experiments were approved by the West China Hospital Ethics committee (No. 2013 (33)) and all patients agreed to participate in the study and signed an informed consent form.

Results

In the group of metachronous lung tumor, three of five patients have different histological types and one of five patients have the same histological type which showed “contradictory trend”. The other one showed “unique trend”. In the second group (intrapulmonary metastasis lung tumor), one patient showed “contradictory trend” and the others showed “unique trend”.

Conclusions

“Different trends” are useful in discrimination of intrapulmonary metastasis lung cancer and multiple primary lung cancer even diagnosed with the histopathological evaluation.     

视网膜母细胞瘤中基因杂合缺失现象的研究

目的：由于Rb1基因的失活可能不是引发视网膜母细胞瘤（RB）的唯一因素。因此，此项课题中我们通过探索第13号染色体上基因杂合缺失（LOH）现象发生的机率以及通过家系分析确定标记位点缺失的遗传学源，试图探明其它可能参与RB发生发展的基因存在的位点，并试图寻找和确定具有诊断及预后价值的LOH检测指标。方法：16个RB患者成对的肿瘤与其相应血清标本在13号染色体上14个微卫星标记处通过荧光PCR进行扩增，分别测定LOH；并通过对患者家庭进行分析确定标记位点缺失的遗传学来源。结果：16个RB患者上，12个在13号染色体上一个或一个以上位点发生LOH，其中三个位点，D13S265，D13S263和D13S153（位于Rb1基因内），LOH发生机率最高，分别是8个，8个和9个，12个LOH阳性标本中有10个标记位点的缺失被确定发生在父系来源的染色体中，LOH阳性及阴性组肿瘤的发生时间分别为504d和1086d。结论：在位点D13S263（13q14.1-14.2)和D13S265（13q31-32)处可能含有某些未知基因参与RB的发生发展，在我们的实验群体中标记位点缺失大多选择性地发生在父系来源的染色体中，此外，LOH阳性组的患者RB确诊时间早于LOH阴性组，其中D13S263和D13S265两个位点的LOH现象可能对RB的早期诊断具有一定提示作用。     

Genomic instability within tumor stroma and clinicopathological characteristics of sporadic primary invasive breast carcinoma

Context  That genomic alterations occur in both the epithelium and stroma of sporadic breast cancers has been documented by several groups. However, whether these microenvironmental alterations relate to clinicopathological features is unknown. Objective  To analyze the relationship between stromal genomic alterations and presenting clinicopathological features in sporadic breast cancer. Design, Setting, and Participants  A retrospective cross-sectional analysis of DNA from the epithelium and stroma of 220 primary sporadic invasive breast carcinomas for global genomic alterations manifested by loss of heterozygosity/allelic imbalance with 386 microsatellite markers. Data were collected from October 2003 through June 2006 from samples at Brigham and Women's Hospital, Boston, Mass. Main Outcome Measures  Association of the loss of heterozygosity/allelic imbalance, in both the stroma and epithelium, with presenting clinicopathological features, such as tumor grade, expression status of estrogen receptor and progesterone receptor, human epidermal growth factor receptor 2, clinical stage, and regional lymph node metastasis status. Associations were assessed in regression models and tested with Fisher exact test. Bonferroni correction was applied to P values, with significance set at P<.0022. Results  We found significant associations between loss of heterozygosity/allelic imbalance on chromosome 11 in the stroma and tumor grade (P = .0013), on chromosomes 1, 2, 5, 18, 20, and 22 in the stroma and regional lymph node metastasis (P = .0002-.0016), and on chromosome 14 in the epithelium and progesterone-receptor expression status (P = .002). Specific markers contributing to the loss of heterozygosity/allelic imbalance on chromosome 11 in the stroma associated with tumor grade were D11S1999 (P = .00055) and D11S1986 (P = .042). The loss of heterozygosity/allelic imbalance at various markers in the stroma was significantly associated with regional lymph node metastasis: ATA42G12 (chromosome 1, P = .00095), D5S1457 (P = .00095), D5S1501 (P = .0011), D5S816 (P = .0008), D18S858 (P = .0026), D20S103 (P = .0027), D20S851 (P = .0045), D22S683 (P = .00033), and D22S1045 (P = .0013). Conclusions  There were more correlations between clinicopathological features and the loss of heterozygosity/allelic imbalance in the stroma than in the epithelium, suggesting that stromal genomic alterations may help account for clinical diversity. Future research is necessary to validate these results and investigate their significance for prognosis and outcome.      

19号染色体微卫星杂合性缺失与原发性胃癌的临床关系

目的:研究19号染色体短臂微卫星不稳定性(microsatellite instability,MSI)及杂合性缺失(loss of heterozygosity,LOH)与胃癌临床病理特征之间的关系,探讨19号染色体短臂微卫星MSI和LOH的主要临床意义.方法:采用PCR-SSLP-银染方法扩增79例原发性胃癌及正常组织标本中19号染色体短臂不同位置的7个点,PCR产物经聚丙烯酰胺凝胶电泳分离,运用Genescan软件和Genotyper软件分析MSI和LOH,然后进一步分析微卫星LOH与原发性胃癌的临床关系.结果:79例胃癌患者中,至少有1种微卫星发生LOH,其频率为31.18%(27/79),在所有微卫星中,D19S591和D19S565的LOH发生率分别为60.32%(38/63)和48.15%(26/54),高于其他微卫星的LOH.LOH高频率与原发性胃癌的临床分期及远处转移相关,且随着恶性程度增加LOH频率也增加(P＜0.05),而MSI与胃癌临床病理之间相关性不大.结论:19p高频率的LOH与原发性胃癌的临床分期和远处转移相关,且LOH高频率提示在该区域可能存在肿瘤抑癌基因,其与胃癌的发生及进展相关.