导致氨基糖苷类药物双圈耐药型鲍曼不动杆菌的相关携带基因研究

目的 探讨在K-B法药物敏感试验中对氨基糖苷类抗菌药物双圈耐药的鲍曼不动杆菌耐药基因携带状况及药物诱导对耐药基因mRNA表达量的影响.方法 收集42株携带Ⅰ类整合子酶基因的鲍曼不动杆菌;PCR法扩增其整合子可变区;联合RFLP和DNA测序技术分析可变区耐药基因;用RT-PCR的方法分析药物诱导前后细菌耐药基因表达量.结...     

鲍曼不动杆菌的耐药性与Ⅰ类整盒子的相关研究

目的了解该院鲍曼不动杆菌的流行趋势以及鲍曼不动杆菌与Ⅰ类整合子的耐药关系。方法用该院临床常用22种抗菌药物来检测临床分离的鲍曼不动杆菌的敏感性。用PCR检测鲍曼不动杆菌Ⅰ类整合子酶基因,再扩增部分Ⅰ类整合子酶基因的可变区,对整合子可变区进行基因测序分析。结果鲍曼不动杆菌的耐药现象十分严重,呈多重耐药性。鲍曼不动杆菌对CPZ/SB耐药率为1.2%,对替加环素、左旋氧氟沙星、亚胺培南、比阿培南、阿米卡星等几种抗菌药物的耐药率为15.4%~69.5%,对其他抗菌药物均在71%以上。102株中有72株菌株含Ⅰ类整合子(阳性率为70.2%),Ⅰ类整合子阳性株的耐药性均高于阴性株,对Ⅰ类整合子可变区采用双酶切分析产生类似的酶切条带,说明该院鲍曼不动杆菌具有同源性。Ⅰ类整合子基因盒序列分析表明该院鲍曼不动杆菌Ⅰ类整合子携带aacA4、catB8和aadA1 3种耐药基因。结论该院2010~2013年,鲍曼不动杆菌对头孢菌素类、广谱青霉素、氨基糖苷类和氟喹诺酮类呈高度耐药及严重的多重耐药现状,说明治疗鲍曼不动杆菌所致感染的抗菌药物选择已十分有限。Ⅰ类整合子与鲍曼不动杆菌多重耐药性密切相关。     

Ⅰ类整合子与鲍曼不动杆菌耐药性相关性研究

目的 了解鲍曼不动杆菌整合子分布情况,探讨Ⅰ类整合子与其耐药性的关系.方法 琼脂稀释法检测65株鲍曼不动杆菌耐药率,聚合酶链反应(PCR)检测Ⅰ～Ⅲ类整合子基因;对Ⅰ类整合子阳性菌株进行可变区扩增及序列分析.结果 Ⅰ类整合子检出率为60%(39/65),未检出Ⅱ、Ⅲ类整合子;Ⅰ类整合子阳性菌株对14种抗菌药物的耐药率高于阴性菌株(P＜0.05);92%(36/39)的Ⅰ类整合子阳性菌株可变区扩增阳性,序列分析显示携带3种耐药基因aacA4、aadA1和catB8.结论 Ⅰ类整合子与鲍曼不动杆菌耐药性密切相关,在鲍曼不动杆菌多药耐药性形成机制中起重要作用.     

整合子在鲍曼不动杆菌耐药中的作用研究

目的调查本院鲍曼不动杆菌耐药谱并了解其整合子流行情况;检测鉴定整合子类型并分析其与耐药的相关性。方法收集本院2007年临床分离鲍曼不动杆菌85株,KB法测定其药敏结果。PCR法扩增整合子的整合酶基因,并进一步鉴定整合子种类。分析鲍曼不动杆菌整合子携带与其耐药之间的关系。PCR法扩增整合子开放阅读框,观测其多态性并挑选个别产物测序。结果 85株鲍曼不动杆菌除对亚胺培南、头孢哌酮/舒巴坦耐药率低于10%,其他15种常用抗菌药物的耐药率均超过30%。67.1%(57/85)的鲍曼不动杆菌中检出整合子;进一步鉴定结果显示均为Ⅰ类整合子,未检出Ⅱ类和Ⅲ类整合子。携带整合子鲍曼不动杆菌株对14种抗菌药物耐药率高于不携带整合子鲍曼不动杆菌株耐药率。开放阅读框可变区扩增产物为0.3～2.5 KB不等条带,测序结果证实含有多药耐药基因编码。结论本院鲍曼不动杆菌耐药率高,以多药耐药菌株为主,携带Ⅰ类整合子率较高;携带整合子鲍曼不动杆菌对14种抗菌药的耐药率明显增高,整合子与鲍曼不动杆菌的多重耐药性具有密切相关性。     

检出3株携带新型基因盒组合形式Ⅰ类整合子的铜绿假单胞菌

目的 研究整合子介导铜绿假单胞菌耐药及多重耐药的机制。方法 整合子PCR法扩增整合子的可变区;联合限制性片段长度多态性分析（RFLP）和DNA测序技术分析整合子可变区的耐药基因。结果 98株南京地区铜绿假单胞菌中有35株（35．7％）整合子可变区扩增阳性,扩增片段大小1．0-4．0kb。共检出6种不同的可变区,含有编码对氨基糖苷类、β-内酰胺类和磺胺类抗菌药耐药的基因,其中有3例为新型基因盒组合形式,包括aadA6-orfD、aadB-blaP1和aadB-aac（6′）-Ⅱa-blaCARB-8,Genbank基因号分别为DQ 091179、DQ 141316和DQ 288251。结论 整合子参与了铜绿假单胞菌的耐药和多重耐药,主要携带氨基糖苷类耐药基因,首次报道了3种携带新型基因盒组合形式的Ⅰ类整合子。     

整合子介导大肠埃希菌和克雷伯菌多重耐药机制的研究

目的 研究整合子参与大肠埃希菌和克雷伯菌多重耐药的分子机制。方法 纸片扩散法测定61株临床分离的大肠埃希菌和克雷伯菌的药物敏感性；整合酶基因扩增法检测Ⅰ类、Ⅱ类和Ⅲ类整合子；整合子可变区扩增并测序。结果 73．8％（45／61）的菌株Ⅰ类整合子阳性，2株大肠埃希菌Ⅱ类整合子阳性，未检测到Ⅲ类整合子；88．9％（40／45）的Ⅰ类整合子阳性菌株可变区扩增阳性，扩增片段大小从150—2800bp不等，有1株Ⅱ类整合子阳性菌株可变区扩增阳性，大小为2200bp；整合子可变区含有编码对氨基糖苷类抗生素耐药的基因（aadA1、aadA2、aadA5、aadB、aacA4、aae6’-Ib）、编码对磺胺类抗生素耐药的基因（dfrA1、dfr2d、dfrⅤ、dfrⅦ、dfr17）、编码对氯霉素耐药的基因（cat、catB8、cmlA1-variant）、编码对β-内酰胺类抗生素耐药的基因（blaoxa10）和编码对链丝菌素耐药的基因（sat1）。结论 整合子在大肠埃希菌和克雷伯菌中广泛存在，参与了这两种菌多重耐药的形成。     

临床大肠埃希菌第Ⅰ类整合子检测及耐药基因盒分析

目的对来自临床腹泻患者大肠埃希菌的第Ⅰ类整合子分布及其耐药基因盒的结构特征进行分析。方法应用聚合酶链反应（PCR）方法检测第Ⅰ类整合酶基因intⅠ阳性菌株，并对其整合的耐药基因进行测序及序列分析。结果在40株大肠埃希菌中有28株（70％）第Ⅰ类整合酶基因阳性。耐药基因盒扩增结果，13株菌得到1664bp的扩增产物，10株得到1586bp的产物，3株得到1009bp的产物，2株得到1009bp和1586bp两种不同产物。序列分析结果表明，1664bp携带aadA5和dfr17，1586bp携带aadA1和dhfrⅠ，均为对氨基糖苷类抗生素壮观霉素、链霉素和磺胺类药物甲氧苄氨嘧啶产生耐药的基因盒；1009bp为aadA23b，为对氨基糖苷类抗生素壮观霉素、链霉素产生耐药的基因盒。结论测出的28株第Ⅰ类整合子阳性菌株携带耐氨基糖苷类抗生素的基因，应从基因水平上对细菌耐药及其传播进行监测。     

产NDM-1弗劳地枸橼酸杆菌整合子和插入序列共同区1检测及分型

目的研究临床分离产NDM-1弗劳地枸橼酸杆菌中整合子和插入序列共同区1(ISCR1)移动元件的分布和携带耐药基因盒情况,以及菌株的同源性。方法收集昆明医科大学第一附属医院2012年6月-2014年10月产NDM-1弗劳地枸橼酸杆菌18株,采用VITEK 2全自动药敏鉴定仪进行菌种鉴定和药敏试验;PCR及测序法检测Ⅰ~Ⅲ类整合酶基因和ISCR1元件保守区,以及可变区携带的耐药基因盒;采用脉冲场凝胶电泳(PFGE)技术对菌株进行分型研究。结果检测菌株中77.8%(14/18)菌株Ⅰ类整合子保守区阳性,27.8%(5/18)菌株ISCR1元件保守区阳性,未检测到Ⅱ、Ⅲ类整合子;72.2%(13/18)菌株Ⅰ类整合子可变区阳性,未检测到ISCR1元件的可变区;整合子可变区含有编码对氨基糖苷类抗生素耐药的基因盒(aad A1、aad A5、aac(6')-Ib-cr)和编码对磺胺类抗菌药物耐药的基因盒(dfr A、dfr A15、dfr A17),可变区基因盒未检测到NDM-1耐药基因;PFGE分型将18株菌分成17种型。结论产NDM-1弗劳地枸橼酸杆菌克隆播散趋势不明显,Ⅰ类整合子广泛存在于此类菌中,ISCR1元件携带率较低,并且这两类移动元件与我院NDM-1基因的传播无关。     

多重耐药铜绿假单胞菌整合子中发现2种新基因盒组合形式

目的研究多重耐药铜绿假单胞菌携带整合子的类型及耐药基因组合。方法 PCR检测多重耐药铜绿假单胞菌整合酶基因intI 1、intI 2、intI 3,Ⅰ类整合子恒定区基因qacEΔ1-sul1及可变区基因,扩增产物经胶回收、限制性片段长度多态性(RFLP)分析及基因测序分析。结果 30株临床分离铜绿假单胞菌中16株(53.3%)Ⅰ类整合酶基因及恒定区qacEΔ1-sul1基因扩增阳性,未检出Ⅱ、Ⅲ类整合酶基因。Ⅰ类整合子可变区共检出5种不同的耐药基因组合形式,含有对氨基糖苷类、β-内酰胺类和喹诺酮类抗菌药耐药的基因,其中有2种为新型基因盒组合形式,包括aacA4-VIM2和aadA2-OXA10-aacA4-blaIMP-9-aatI1,GenBank登录号分别为GQ890658和GU122165,另外3种与GenBank登录号分别为FJ917747、FJ817423、GU367339的序列基本吻合。结论多重耐药铜绿假单胞菌携带的整合子主要为Ⅰ类整合子,在Ⅰ类整合子上首次发现2种新型基因盒组合形式。     

鲍曼不动杆菌整合子与耐药性的相关性研究

目的调查鲍曼不动杆菌中Ⅰ类、Ⅱ类和Ⅲ类整合子的存在情况,分析整合子与鲍曼不动杆菌耐药性的关系。方法测定93株鲍曼不动杆菌对抗菌药物的敏感性;应用简并引物PCR方法,同时扩增整合子5’保守区的I类、Ⅱ类和Ⅲ类整合酶基因,对阳性PCR产物用限制性内切酶Hinf I作限制片段长度多态性（RFLP）分析进行整合子分类。结果 22株鲍曼不动杆菌检测出Ⅰ类整合子,未检出Ⅱ类和Ⅲ类整合子。Ⅰ类整合子阳性的菌株对抗菌药物的耐药率普遍比整合子阴性的菌株高。结论鲍曼不动杆菌临床分离株的耐药性强,细菌的多重耐药性与Ⅰ类整合子的存在相关。     

Novel gene cassettes and integrons

An increase in multiresistant Enterobacteriaceae was observed at one of the departments of the University Medical Center Utrecht. Nine different integrons and 17 gene cassettes were found, including the new gene cassette aadA8. This cassette was highly related to aadA3 and aadA2. In addition, an unknown promoter sequence was found for two integrons.     

对鲍曼不动杆菌整合子相关的耐药基因分析

目的明确我院鲍曼不动杆菌中整合子的分布及基因盒结构。方法采用K-B法测定68株鲍曼不动杆菌对12种抗菌药物的敏感性,采用聚合酶链反应(PCR)分析其整合子。结果鲍曼不动杆菌对含舒巴坦制剂头孢哌酮/舒巴坦、氨苄西林/舒巴坦耐药率最低分别为20.6%和47.1%,亚胺培南、美洛培南的耐药率分别为77.9%、75%,对其他抗菌药物的耐药率均在70%以上。36株细菌整合子PCR阳性,片段长度为2939bp,携带有aacA4、catB8和aadA1基因。结论鲍曼不动杆菌整合子主要介导对氨基糖苷类及氯霉素的耐药性。     

整合子与多耐药铜绿假单胞菌的相关性研究

目的 研究分离自烧伤患者的铜绿假单胞菌(Pa)整合子携带情况及其与多药耐药的相关性.方法 对50株Pa采用K-B法进行药敏实验,简并引物扩增法扩增整合子,限制性片段长度多态性(RFLP)分析确定整合子类型.结果 50株Pa对22种抗菌药物的耐药率达90%以上;49株(98%)携带Ⅰ类整合子,未检出Ⅱ、Ⅲ类整合子.结论 该院Pa临床菌株对β-内酰胺类、氨基糖苷类、喹诺酮类等抗菌药物耐药率较高,多药耐药性可能与Ⅰ类整合子有关.     

耐亚胺培南铜绿假单胞菌整合子的鉴定与分析

目的 鉴定并分析耐亚胺培南铜绿假单胞菌(IRPa)中整合子及其携带耐药基因盒的特点。 方法 收集2003～2007年临床分离IRPa共74株,用PCR-RFLP筛查携带整合酶的菌株,并对整合子进行分类。整合酶阳性菌株用普通PCR扩增检测整合子的qacE△1sul1基因、整合子可变区及膜微孔蛋白基因oprD2,并对整合子可变区扩增产物测序分析。 结果 74株菌中有16株菌（21.6%）携带整合酶基因,均为Ⅰ类整合子;有14株检出整合子可变区,经测序共得到7种整合子耐药基因盒的组合形式,其中有4种为首次发现,在GenBank上的登录号分别为FJ917747、FJ817422、FJ655384和FJ817423;另携带IMP-9基因2株。16株IRPa中有8株oprD2基因检测为阳性,其余为阴性。 结论 在本地区临床分离的IRPa中,仅2株菌的Ⅰ类整合子中携带的IMP-9与亚胺培南的耐药有关,其他菌株的整合子中携带的基因盒主要是介导对氨基糖苷类与β内酰胺类抗生素的耐药。金属酶的产生并不是其对亚胺培南耐药的主要原因。     

鲍曼不动杆菌Ⅰ类整合子系统与其耐药性关系的研究

目的了解Ⅰ类整合子系统在鲍曼不动杆菌中的分布状况,探讨其与该菌耐药性之间的关系。方法用琼脂稀释法测定鲍曼不动杆菌对14种抗生素的敏感性。用PCR法检测Ⅰ类整合子系统。结果29.2%(21/72)的菌株检测出Ⅰ类整合子系统。含与不含Ⅰ类整合子系统的菌株在耐药性上存在显著性差异(P<0.05)。不同类型Ⅰ类整合子的耐药表型存在一定的差异。结论Ⅰ类整合子系统与鲍曼不动杆菌多重耐药性以及耐药表型之间有密切的关系。     

痰标本分离革兰阴性杆菌整合子分布及分型研究

目的研究临床痰标本分离革兰阴性杆菌中整合子的分布与分型。方法用Ⅰ类、Ⅱ类和Ⅲ类3种整合酶基因通用引物扩增398株痰标本分离革兰阴性杆菌的相应基因;用琼脂对倍稀释法检测临床菌株的MIC。结果Ⅰ类整合酶基因总阳性率为48.7%,Ⅱ类整合酶基因总阳性率为2.3%,未检出Ⅲ类整合酶基因阳性菌株,Ⅰ类和Ⅱ类整合子同时阳性率为1.5%。肠杆菌科细菌Ⅰ类整合酶基因阳性率为69%,Ⅱ类整合子阳性率为2.7%;非发酵菌中Ⅰ类整合子阳性率为34%,Ⅱ类整合子阳性率为1.8%。在肠杆菌科细菌中,Ⅰ类整合酶基因阳性菌株对多种抗菌药物的耐药率均明显高于阴性菌株。结论在痰标本分离的革兰阴性杆菌中,肠杆菌科细菌Ⅰ类整合子的携带率高于非发酵菌,Ⅱ类整合子则无明显区别。     

鲍曼不动杆菌整合子相关耐药基因研究

目的了解我院鲍曼不动杆菌整合子流行情况，证实整合子与鲍曼不动杆菌多重耐药性的关系，建立一种快速简便的整合酶聚合酶链反应（PCR）检测方法。方法收集我院2005年9月至2006年2月临床分离的鲍曼不动杆菌共52株，用纸片扩散法检测鲍曼不动杆菌耐药性及用整合酶PCR检测其整合子基因。结果在52株鲍曼不动杆菌中，整合酶PCR检测出Ⅰ类整合子33株（63％），未检测出Ⅱ类整合子。统计学分析结果显示，整合子阴性和阳性的鲍曼不动杆菌对各种抗生素的耐药率存在明显差异，前者仅对几种抗生素耐药而后者对多种抗生素耐药。结论我院多重耐药鲍曼不动杆菌中主要为Ⅰ类整合子，整合酶PCR是一种快速、简便、易在临床开展的检测方法，同时也是控制医院感染的有效检测手段。     

耐亚胺培南鲍曼不动杆菌碳青霉烯酶及整合子分布

Objective To investigate the carbapenemases and integrons in imipenem-resistant Acinetobacter baumannii. Methods One hundred and three Acinetobacter baumannii were collected from Janurary 2008 to March 2010 in Tianjin Medical University General Hospital. The identification of strains and antimicrobial susceptibility test were performed by using Vitek-2 compact automatic system. Isolates of imipenem-resistant A. baumannii were screened for carbapenemases by modified Hodge test, improved threedimensional test and 2-mercaptopropionic acid synergy test. Isolates were then subjected to the multiplex PCR targeting genes encoding for OXA type carbapenemases, metallo-β-lactamases (MBLs) and integrases. The variable regions of integrons were amplificated and sequenced. Results Among the 103 isolates, 75 (72. 8% ) demonstrated positive in the modified Hodge test, 80 (77.7%)were positive in the improved three-dimensional test. No MBLs was found in the 2-mercaptopropionic acid synergy test. Eightyfour isolates were positive for blaOXA-51-like, blaOXA-23-like, and intI1; five were positive for blaOXA-51-like and blaOXA-23-like ;eight were positive for blaOXA-51-like and int11 ;two were positive for blaOXA-51-like and blaOXA-24-like ;four were only found positive for blaOXA-51-like. The blaOXA-58-like, IMP-1, VIM-2 and intI2 genes were all negative. Eighty-nine(96. 7% )of the intI1 positive strains owned the variable region. Two different cassettes arrangements were identified within class 1 integrons:81 isolates harbored aacA4-catB8-aadAI (2 300 bp) and 8 harbored aacCl-orX-orfX-orX'-aadAla (3 000 bp ) . Conclusion The presence of OXA-23 carbapenermase and class Ⅰ integrons are correlated with Acinetobacter baumannii resistant to carbapenems and multi-drug resistance.     

Molecular characterization of class 1 integrons from Irish thermophilic Campylobacter spp

OBJECTIVES: In this study a large random collection (n = 378) of Irish thermophilic Campylobacter isolates were investigated for the presence of integrons, genetic elements associated with the dissemination of antimicrobial resistance. METHODS: Purified genomic DNA from each isolate was analysed by PCR for the presence of class 1 integrons. Four gene cassette-associated amplicons were completely characterized. RESULTS: Sixty-two of the isolates possessed a complete class 1 integron with a recombined gene cassette located within a 1.0 kb amplicon containing an aadA2 gene. This cassette was present in both Campylobacter jejuni and Campylobacter coli isolates and following sequence analysis was shown to be similar to sequences recently reported in Salmonella enterica Hadar and on an 85 kb plasmid conferring quinolone resistance in Escherichia coli. CONCLUSIONS: Aminoglycoside aadA2-encoding class 1 integrons were identified among unrelated Campylobacter spp. Amino acid sequence comparisons revealed identical structures in both Salmonella and E. coli. The presence of class 1 integrons in Campylobacter spp. may be significant should these organisms enter the food chain and especially when antimicrobial treatment for severe infections is being considered.