蛲虫核糖体DNA ITS1的PCR扩增及序列分析

目的 扩增人蛲虫（Enterobius vermicularis）核糖体DNA的第一内转录间隔区（ITS1）。方法提取人蛲虫的基因组DNA，PCR扩增rDNA的ITS1及部分5．8S片段，对该片段进行PCR—SSCP分析并测序。结果扩增的片段大小为334bp，包含Enterobius vermicularis全部的ITS-1（303bp）及部分5．8S（31bp）序列，ITS1种内序列一致。结论首次报道人蛲虫的ITS1序列，将为以ITS1作为遗传标记用于蛲虫鉴别诊断、系统发育等研究奠定基础。     

犬复孔绦虫ITS及5.8S rDNA的PCR扩增、克隆及序列分析

目的以从我国广东广州和湛江犬小肠中采集的2条犬复孔绦虫作为研究对象。以保守引物NC5及NC2扩增犬复孔绦虫的ITS-1，5．8S及ITS-2rDNA片段并进行序列分析。方法将PCR扩增出的片段纯化后克隆至pGEM-TEasy载体，重组质粒通过菌落PCR和酶切鉴定后，对阳性菌落进行序列测定。结果来自广州和湛江的2条犬复孔绦虫ITS及5．8 S rDNA序列总长分别为1536bp、1385bp，2条犬复孔绦虫的ITS-1、ITS-2序列相差较大，分别为20．80％、27．17％，而5．8S序列相差较小（1．49％）。结论由于犬复孔绦虫ITS序列复杂，种内存在的差异大，故不适于作为犬复孔绦虫种的遗传标记。     

眼蚤属（Ophthalmopsylla）两蚤种的rDNA ITS2序列研究

目的：研究伏河眼蚤异常亚种Ophthalmopsylla volgensis extrema（Ioffet Scalon,1953）和长突眼蚤Oph-thalmopsylla kiritschenkoi（Wagner,1930）rDNA ITS2序列,为蚤类分子系统发育的研究提供基础资料。方法：PCR扩增两蚤种rDNA ITS2片段并测序,比较两者差异。结果：伏河眼蚤异常亚种rDNA ITS2序列长372 bp,长突眼蚤长380 bp;两蚤种间共有30处碱基不同,包括16处缺失/插入、4处转换、10处颠换,种内无差异。结论：rDNA ITS2序列可用作两蚤种鉴别的分子标记。     

阳春砂的ITS序列分析

目的：用ITS全序列鉴别各地产阳春砂及常见伪品。方法：从各地产阳春砂及常见伪品绿壳砂和海南砂中提取总DNA，以核基因组通用引物ITS为引物进行扩增，扩增产物经纯化后，用PCR产物直接法进行测序。结果：各样品的ITS序列总长度均为626bp，其中ITS－1序列长度为248bp,5.8S序列长度为155bp，ITS－2序列长度为223bp；6个阳春砂和绿壳砂的ITS－2序列完全一致，各样品的5．8S序列完全一致，在ITS-1可各样品却有不同的碱基位点。结论：ITS－1序列可对阳春砂的道地性作出鉴别，明显区分其伪品。     

长江中下游地区菱属植物的DNA分子鉴别

目的 对野生菱和栽培菱种rDNA ITS片段进行分析，探讨该片段在两大群体中的系统学及鉴别研究意义。方法 对菱的rDNA ITS区进行了PCR扩增、测序，运用clustal、Mega 2．0等软件对ITs区进行序列分析鉴别。结果 获得rDNAI TS1、ITS2和5．8S rDNA完整序列，10个居群菱的ITS1与ITS2序列的长度分别为234～236 bp和220～221 bp，5．8S区均为164bp，不同居群的碱基差异为0．22％～2．94％。变异位点数为16个，信息位点数6个。用NJ法根据ITS序列数据构建系统发生树。结论 尽管菱属各居群间rDNA ITS的差异百分率较小，其亲缘关系较近，但根据ITS序列的特征可以很好地鉴别野生菱、栽培菱，菱属植物有可能都起源于同一种野生类居群。     

广州动物园鸬鹚鲁道夫对盲囊线虫的分子鉴定

目的以核糖体DNA(rDNA)的第一与第二内转录间隔区序列(ITS-1及ITS-2)鉴定从广州动物园鸬鹚体内分离出来的鲁道夫对盲囊线虫种类。方法将鲁道夫对盲囊线虫样品GZ1、GZ2、GZ3和GZ4的ITS-1、5.8S、ITS-2进行PCR扩增及序列分析,并与GenBankTM公布的Contracaecum rudolphii A、B种相应序列进行比较。结果来自鸬鹚体内的4条鲁道夫对盲囊线虫具有相同长度的ITS序列,其ITS-1、5.8S、ITS-2分别为451、157和268bp,与GenBankTM公布的鲁道夫对盲囊线虫B种(C.rudolphii B)序列几乎完全一致,但在第108位缺失T。结论来自广州动物园鸬鹚体内的对盲囊线虫是C.rudolphii B。     

菟丝子rDNA ITS序列的测定及分析

目的研究菟丝子rDNA-ITS序列特征。方法分别采用PCR产物直接测序法和克隆测序法,对菟丝子属7个种rDNA的ITS区(包括ITS-1,5.8S rDNA和ITS-2)进行序列测定。结果菟丝子属植物ITS序列总长度约为612 bp,GC含量分别为:ITS-1区53%~63%,5.8S rDNA 48%~55%,ITS-2区46%~56%;苜蓿菟丝子种内的3个地理种发现了3个变异位点。用NJ法构建系统发育树显示:含日本菟丝子Cuscuta.japonica的分支处于系统树靠近基部位置,与之亲缘关系较近的依次为中国菟丝子C.chinensis和杯花菟丝子C.cupulata;余下5个种的分支中田野菟丝子C.campestris和五角菟丝子C.pentagona合为一支,南方菟丝子C.australis和苜蓿菟丝子C.approximata合为一支。结论NJ法建立的发育树与形态学分类基本相符,为菟丝子属植物分类鉴定提供了重要的分子依据。     

9种柴胡属植物的核糖体ITS序列及其在药材鉴定中的应用

目的 研究9种柴胡属药用植物rDNA ITS序列的差异和规律,寻找可准确鉴定柴胡类药材的分子性状。方法 PCR扩增ITS序列,测序,DNAssist version 2．2软件进行序列比对,并计算同源性。结果 柴胡属植物ITS序列与外类群ITS序列比对同源性均小于75％,序列间两两比对同源性均大于88％,同种植物则大于99％。结论 ITS序列作为柴胡类药材鉴定依据具有一定实用性和可靠性。     

不同产地何首乌的ITS序列研究

目的研究不同产地何首乌的ITS片段遗传差异性,分析该片段在何首乌道地性的DNA分子鉴别和野生资源品种的鉴定及种质资源研究中的意义。方法从来自不同原产地的何首乌中提取总DNA,以核基因组ITS通用引物为引物进行扩增,扩增产物经纯化后,用PCR产物直接测序法进行测序。结果各样品rDNA的ITS及5.8S rDNA完全序列,18S和26S rDNA部分序列,共约648bp,其中ITS1长度为195bp,5.8S长度为164bp,ITS2长度为189bp。序列间共有17个变异位点。结论ITS序列可对何首乌的道地性做出鉴别,对野生资源品种的鉴定具有较好的分辨性。     

湛江南药场引种檀香rDNAITS序列系统发育分析

目的研究广东湛江南药场引种檀香与檀香科内植物rDNA ITS序列系统发育的关系。方法采用改良CTAB法提取檀香总DNA,分别对样品rDNA ITS区进行PCR扩增和测序,通过rDNA ITS序列进行分类鉴定及系统发育分析。结果 11个样品rDNA ITS序列间的遗传距离为0.000%-0.144%,邻接法和最大简约法构建的系统发育树显示国内引种自印度和印度尼西亚的檀香与印度檀香聚为一亚支（支持率为84%和95%）。结论基于rDNA ITS序列的测序分析和构建系统发育树的分子生物学方法,可为檀香药材的种类鉴定提供科学依据。     

天麻ITS序列的聚合酶链反应扩增

目的:为天麻核糖体DNA中的内转录间隔区(internal transcribed spacer ,ITS)序列分析提供可靠、特异的聚合酶链反应(PCR)条件.方法:选择ITS序列通用引物对天麻ITS序列进行PCR扩增,对一系列PCR条件参数进行摸索,同时对PCR产物进行纯化后直接测序.结果:天麻ITS序列PCR扩增产物约为750 bp,不同来源样本存在有一定的差异.经测序后与Genebank中相关序列比对,天麻ITS序列总长度为598 bp,其中ITS1为235 bp,ITS2为209 bp,5.8S为154 bp,G C(%)为52%.结论:扩增天麻ITS序列的PCR反应条件可以得到可靠、特异的结果.     

正杂交西蜂——松丹一号与反杂交西蜂——松丹二号DNA基因组的多态性研究

目的：区别松丹一号与松丹二号的DNA基因组的多态性。方法：采用随机引物－聚合酶链反应。结果：松丹一号保留了它母本平湖、老美意西蜂在994bp和695bp之间的1条区带，而松丹二号则丢失了此条区带；松丹一号保留了它母本平湖、老美意西蜂在377bp入237bp之间的1条区带，而松丹二号此条区带并不清楚，松丹二号只保留母本墨环西蜂的237bp以下的1条带。结论：松丹一号与松丹二号的基因组发生了明显的变异。     

战备消毒包内细菌来源分析

[目的]探讨高原地区自然环境中战备消毒包内细菌来源.[方法]根据战备消毒包内金黄色葡萄球菌、木糖葡萄球菌、蜡样芽胞杆菌和人葡萄球菌筛选战备仓库空气同种细菌不同菌株,提取基因组DNA,以其为模板,对16SrRNA和23SrRNA的转录间隔区(internal transcribled spacer,ITS)序列进行PCR扩增,将扩增产物回收测序,结果用Blast进行比对.[结果]金黄色葡萄球菌、木糖葡萄球菌、蜡样芽胞杆菌和人葡萄球菌DNA PCR扩增产物分别在1000 bp、1100bp、850 bp、1000 bp左右显现单一特异性条带;ITS序列相似性约为99％～100％.[结论]战备消毒包内细菌来源于空气细菌.     

金银花、吴茱萸的传统饮片和超微饮片ITS序列的比较

目的:应用现代分子生物学技术获取中药材及其超微饮片的ITS序列,通过分析比较,为超微饮片的质量控制提供可靠方法。方法:以金银花、吴茱萸的干药材和超微饮片为实验材料,提取总DNA,克隆和测定其rDNA的转录间隔区(internal transcribed spacer,ITS)序列。结果:获得了样品中药材的rDNA的ITS1,ITS2,5．8S,18S和28S序列,金银花、吴茱萸的传统饮片和超微饮片的ITS序列的相似度在99％以上。结论:利用ITS序列分析可以科学有效地对超微饮片进行鉴定。     

益母草类中药原植物的核核糖体内转录间隔区序列分析

目的分析益母草属4种植物nrDNAITS序列,探讨其在益母草药材DNA分子鉴别中的作用。方法对4种益母草属植物分别进行ITS序列的PCR扩增和测序,并运用CLUSTRALX和MEGA软件进行分析。结果测得4种植物的ITS序列,包括ITS1、5.8S和ITS2全长序列以及18S、26S部分序列;益母草及其易混淆的3种植物ITS1、ITS2序列的差异性分别为7.2%～18.8%和14.2%～27%。根据ITS序列特征所构建的系统树与传统分类有所不同。结论ITS序列特征可作为益母草种间鉴别的有效分子标记。