四川骨髓库人群HLA-DQA1和DQB1等位基因及其单体型分布研究

目的探索四川骨髓库人群HLA-DQA1和DQB1等位基因及HLA-DQA1～DQB1单体型分布。方法 2018年2月—2019年2月,四川骨髓库收集664(人)份造血干细胞捐献志愿者样本,利用NGS技术对其进行基因测序,使用Type Stream~(TM )Visual 1.3.0软件对HLA-DQA1和DQB1进行高分辨率分型,使用Arlequin 3.1软件的EM算法计算HLA-DQA1和DQB1等位基因频率和HLA-DQA1～DQB1连锁不平衡参数。结果本组人群检测到16种HLA-DQA1和25种HLA-DQB1,DQA1~*01∶02、DQA1~*03∶02、DQB1~*03∶01∶01G、DQB1~*03∶03、DQB1~*05∶02和DQB1~*06∶01为高频等位基因。与美洲印第安人、非洲黑人和西班牙高加索人相比,四川骨髓库人群HLA-DQA1等位基因种类最多,高频等位基因频率差异较大(P0.05),DQA1~*05∶06、DQA1~*05∶08和DQA1 ~* 06∶01为其特有的等位基因。本研究检测24种可用于人群调查且连锁不平衡差异具有统计学意义的HLA-DQA1～DQB1单体型(P0.05)。结论四川骨髓库人群HLA-DQA1等位基因多态性程度高,高频等位基因分布相对集中,HLA-DQA1～DQB1单体型种类较多。     

四川骨髓库汉族人群HLA-DPB1与rs9277534等位基因频率及其连锁关系的分析

目的探讨四川骨髓库汉族人群HLA-DPB1和rs9277534等位基因分布及其之间的连锁关系。方法从四川骨髓库中随机选取200例无血缘关系的四川汉族志愿者标本,采用PCR-SBT方法对其HLA-DPB1等位基因分型,Taq Man探针法对其rs9277534等位基因分型并通过测序验证结果。利用Arlequin 3.1软件计算HLA-DPB1与rs9277534之间的连锁不平衡参数。结果本组四川骨髓库汉族人群中的DPB1等位基因:以DPB1*05∶01∶01G频率为最高:0.412 5(165/400);rs9277534等位基因:A和G的频率分别为0.4(160/400)和0.6(240/400),AA、GG、AG基因型频率分别为0.165(33/200)、0.375(75/200)和0.46(92/200)。有10种HLA-DPB1等位基因型与rs9277534等位基因A、G之间存在连锁不平衡,DPB1*04∶02∶01G、DPB1*02∶01∶02G、DPB1*02∶02∶01G和DPB1*17∶01∶01G与rs9277534A完全连锁,DPB1*05∶01∶01G、DPB1*03∶01∶01G、DPB1*13∶01∶01G、DPB1*14∶01∶01G和DPB1*21∶01与rs9277534G完全连锁。DPB1*04∶01∶01G与rs9277534A等位基因之间呈高度连锁不平衡(|D'|=0.95,P0.01)。结论四川骨髓库汉族人群的HLA-DPB1部分等位基因与rs9277534A/G等位基因连锁,对临床选择造血干细胞移植供者有参考价值。     

南方汉族人群HLA-DPA1和-DPB1基因多态性与鼻咽癌的关联研究

目的 探讨人类白细胞抗原(HLA)-DPA1和-DPB1基因多态性与中国南方汉族人群鼻咽癌的相关性.方法 选择2012年2月至7月于广西梧州市红十字会医院及深圳市武警医院经病理学检查确诊为鼻咽癌(NPC)病变的南方汉族患者74例为研究对象,纳入研究组;计算机随机选择同期于本中心献血的南方汉族健康志愿捐者160例,纳入对照组(本研究遵循的程序符合本院人体试验委员会所制定的伦理学标准,得到该伦理会批准,分组征得受试对象本人的知情同意,并与之签订临床研究知情同意书).采用测序分型方法对研究组和对照组的血液样本进行HLA-DPA1和-DPB1基因第2外显子双向测序,用Assign 3.5 SBT分析软件判定等位基因型.采用Wolf法进行x2检验并计算P值和相对危险度(RR),比较研究组和对照组HLA-DPA1和-DPB1等位基因频率的差异.结果 研究组和对照组中,均检出4个DPA1等位基因,即DPAl* 01:03,02:01,02:02和04:01.作为多态性丰富的HLA-DPB1位点,研究组中共检出14个等位基因,对照组中共检出18个等位基因.研究组与对照组的HLA-DPA1和-DPB1等位基因的基因检出率比较,差异均无统计学意义(x2＜3.84,P＞0.05).结论 本文的结果初步显示中国南方汉族人群中HLA-DPA1和-DPB1基因多态性与NPC无相关性.     

南方汉族HLA-DQA1基因与糖尿病视网膜病变相关性的研究

目的研究南方汉族HLA-DQA1基因与糖尿病视网膜病变的相关性。方法实验组收集60名临床诊断为糖尿病视网膜病变(DRP)患者的血样,对照组为52名健康的志愿捐血者血样,采用rSSOHLA流式磁珠分型并辅以PCR-SSP方法进行HLA-DQA1基因定型,统计实验组和对照组HLA-DQA1的基因频率,采用Woolf法计算相对危险度值。结果在糖尿病视网膜病变的实验组和对照组中,均检出了10种DQA1等位基因,检出的等位基因频率最高的为DQA1*0102;实验组DQA1*0501的基因频率显著高于正常对照组,计算RR值为2.73。结论南方汉族中DQA1*0501的基因可能为DRP的易感性标志。     

江苏7地市汉族人群HLA-DQB1等位基因多态性分析

目的分析来自中华骨髓库江苏分库7地市汉族人群HLA-DQB1基因多态性。方法采用聚合酶联反应-直接测序分型(PCR-SBT)技术,对2010年1月—2017年12月中华骨髓库江苏分库4973名志愿者的HLA-DQB1位点进行基因分型,分别计算7地市DQB1基因频率并比较分析。结果江苏汉族人群共检测出24种DQB1等位基因,其中徐州16种,淮安18种,盐城19种,扬州19种,镇江20种,南京18种,常州13种。常见的DQB1等位基因分布在徐州为:DQB1~*06∶01、03∶01、06∶09等;淮安:DQB1~*03∶03、03∶01、06∶01等;盐城:DQB1~*02∶02、02∶01、06∶09等;扬州:DQB1~*02∶02、03∶03、06∶01等;镇江:DQB1~*03∶03、02∶02、03∶01等;南京:DQB1~*03∶03、03∶01、06∶01等;常州:DQB1~*03∶03、03∶01、06∶01等。结论徐州、淮安、盐城、扬州的DQB1基因多态性更偏向我国北方,常州的DQB1基因多态性更偏向我国南方,而镇江、南京介于南方、北方之间。由此为研究江苏汉族人群基因遗传学及DQB1与疾病相关性提供了重要的基础资料。     

1914名河北地区汉族人群HLA-DQB1基因多态性分析

目的探讨河北汉族人群人类白细胞抗原-DQB1(HLA-DQB1)基因型遗传特性。方法对1914名河北地区汉族人群献血者采用聚合酶链反应-基于测序的分型技术(PCR-SBT)进行HLA-DQB1位点高分辨基因分型,采用直接计数法计算等位基因频率,并与中国其他地区人群基因频率进行比较。结果 1914名河北汉族献血者中共检出21个HLADQB1等位基因,其中频率大于0.0500的常见等位基因共6个,分别为DQB1*03∶01、DQB1*03∶03、DQB1*06∶02、DQB1*02∶02、DQB1*06∶01和DQB1*05∶01。结论河北地区汉族人群DQB1具有丰富的多态性,基因分布有明显的地区特性,了解河北汉族人群HLA-DQB1的分布状况,有利于帮助临床寻找HLA匹配的造血干细胞无关供者,同时为我国人群群体遗传学研究等提供有价值的背景资料。     

HLA-B和-DRB1、HLA-DQB1和-DPB1座位基因重组的分析

目的：探讨2个家系人类白细胞抗原(HLA)座位的重组情况。方法：采集家系成员的外周血，提取基因组DNA，采用聚合酶链反应-序列特异性寡核苷酸探针技术(PCR-SSO)和二代测序技术检测HLA-A、-B、-C、-DRB1、-DQB1和-DPB1座位，通过家系遗传分析确定个体HLA单体型。结果：家系1中单体型HLA-A*11:01～C*03:04～B*13:01～DRB1*12:02～DQB1*03:01～DPB1*05:01:01G与HLA-A*03:01～C*04:01～B*35:03～DRB1*12:01～DQB1*03:01～DPB1*04:01:01G在HLA-B和HLA-DRB1座位间进行了交换，形成HLA-A*11:01～C*03:04～B*13:01～DRB1*12:01～DQB1*03:01～DPB1*04:01:01G。家系2中单体型HLA-A*02:06～C*03:03～B*35:01～DRB1*08:02～DQB1*04:02～DPB1*13:01:01G与HLA-A*11:01～C*07:02～B*38:02～DRB1*15:02～DQB1*05:01～DPB1*...     

基于二代测序的HLA-Ⅱ类等位基因多态性研究及等位基因丢失防范策略

目的：研究二代测序技术（NGS）检测深圳地区随机健康无关汉族人群HLA-DRB1、DQB1、DQA1、DRB3、DRB4、DRB5、DPA1、DPB1等位基因多态性的精确性,探讨HLA-DRB1等位基因丢失的原因及室内关键质控体系建立策略。方法：采用Mi Seq DxTM NGS平台对1 012例样本完成HLA-II类等位基因分型。对质控体系软件提示的疑难样本和HLA-DRB1纯合子样本采用PCR-SSOP法或PCR-SBT法进行确认。结果：检出HLA-DRB1、DRB3、DRB4、DRB5、DQA1、DQB1、DPA1、DPB1等位基因分别有45、7、5、7、17、21、10、27种。常见等位基因（频率>10%）有HLA-DRB1*09:01(17.09%)、15:01(10.72%);DRB3*02:02(25.99%)、03:01(10.18%);DRB4*01:03(36.46%);DRB5*01:01(15.42%);DQA1*01:02(20.01%)、03:02(17.19%);DQB1*03:01(19.47%)、03:03(17.98%)、05:02(11.66...     

HLA-DRB1,-DQB1,-DPB1等位基因及单体型多态性与北方汉族急性髓系白血病(非M_3型)的关联性研究

目的探讨HLAⅡ类(-DRB1,-DQB1,-DPB1)等位基因及单体型多态性与北方汉族急性髓系白血病(acute myeloid leukemia, AML)的易感相关性。方法以824名正常非亲缘造血干细胞捐献者(2016年1月—2019年9月)为对照,应用聚合酶链反应-测序分型(PCR-SBT)、下一代测序(NGS-ION S5~(TM))技术、基于LABScan~? 3D平台的聚合酶链反应-序列特异寡核苷酸探针技术(PCR-SSO)等方法对308例AML(非M_3型)患者进行HLAⅡ类(-DRB1,-DQB1,-DPB1)基因高分辨分型,用Arlequin 3.5.2.2软件计算HLA基因频率和单体型频率,计算疾病优势比(odds ratio,OR)进行病例对照研究。结果经χ~2检验、连续校正显示非M_3型AML患者的HLA-DRB1~*07∶01(14.61%vs 9.53%,P0.01)、HLA-DQB1~*02∶02(12.82%vs 8.31%,P0.01)、HLA-DQB1~*06∶02(11.53%vs 8.74%,P0.05)和HLA-DPB1~*17∶01(5.84%vs 3.16%,P0.01)基因频率显著高于对照组,经Bonferroni校正后HLA-DRB1~*07∶01(Pc0.05)、HLA-DQB1~*02∶02(Pc0.05)和HLA-DPB1~*17∶01(Pc0.05)频率仍高于对照组,与AML呈强相关,OR分别为1.62(95%CI=1.23～2.14)、1.62(95%CI=1.21～2.18)和1.91(95%CI=1.23～2.94);AML患者的2座位单体型HLA-DRB1~*07∶01-DQB1~*02∶02频率经Bonferroni校正后仍高于对照组(12.66%vs 8.19%,Pc0.05);3座位单体型HLA-DRB1~*07∶01-DQB1~*02∶02-DPB1~*17∶01频率高于对照组,与AML呈强相关,是AML的易感单体型。结论本研究首次获得HLAⅡ(-DRB1,-DQB1,-DPB1)基因及单体型多态性与北方汉族AML相关性的资料,HLA-DRB1~*07∶01、HLA-DQB1~*02∶02、HLA-DPB1~*17∶01及单体型HLA-DRB1~*07∶01-DQB1~*02∶02-DPB1~*17∶01是北方汉族发生AML的风险基因及易感单体型,基于HLA单体型的风险预测可能比基于单个等位基因的风险计算更为精确。     

恶性血液病患者造血干细胞移植前PRA、MICA抗体水平分析

目的分析恶性血液病患者造血干细胞移植前PRA-Ⅰ、Ⅱ类及MICA抗体阳性率和特异性频率。方法应用LSA方法检测恶性血液病患者PRA-Ⅰ、Ⅱ类及MICA抗体,并以已发表文献天然抗体阳性率及特异性频率作为参考,比较分析。结果男性恶性血液病患者抗体阳性率分别为Ⅰ类(56.1%,37/66)、Ⅱ类(45.5%,30/66)、MICA(12.1%,8/66);女性患者阳性率分别为Ⅰ类(77.6%,52/67)、Ⅱ类(53.7%,36/67)、MICA(16.5%,11/67)。恶性血液病患者抗体特异性频率与天然抗体相比明显升高的分别为:A~*23∶01,A~*68∶02,B~*44∶03,B~*57∶01,B~*58∶01,C~*03∶04,DRB1~*16∶01,DRB1~*16∶02,DRB1~*04∶03,DRB1~*04∶01,DQA1~*02∶01,DQB1~*03∶01,DQA1~*03∶02,DQB1~*03∶03,DPA1~*02∶02,DPB1~*05∶01,DPA1~*01∶03和DPB1~*01∶01。结论恶性血液病男性患者PRA-Ⅱ类、MICA抗体阳性率显著高于天然抗体组;女性患者PRA-Ⅰ、Ⅱ类、MICA抗体阳性率均显著高于天然抗体组。从抗体特异性来看,恶性血液病患者既存在天然抗体,也存在非天然抗体,而后者更容易成为DSA。因此,恶性血液病患者在造血干细胞移植前检测PRA-Ⅰ、Ⅱ类和MICA抗体有重要意义。     

Genetic polymorphism of cytochrome P450 1A1 (Cyp1A1) and glutathione transferases (M1, T1 and P1) among Africans.

The co-ordinate expression and regulation of the drug metabolising enzymes, cytochrome P4501A1 (CYPlAl) and glutathione transferases (GSTM1, GSTT1 and GSTP1), and their metabolic balance in the cells of target organs may determine whether exposure to carcinogens results in cancer. Besides showing variability in activity due to induction and inhibition, these enzymes also exhibit genetic polymorphism that alter enzyme levels and activity. We determined frequencies of common allelic variants of CYP1A1 and glutathione (M1, T1 and P1) among Tanzanians, South African Venda and Zimbabweans using PCR/restriction fragment length polymorphism techniques. The CYP1A1 Val462 mutant variant was found at a frequency of 1.3% among 114 subjects. The GSTM1*0 genotype was found at a frequency of 29% and 33% among Tanzanian psychiatric patients and healthy volunteers, respectively. Similarly, the GSTT1*0 polymorphism was present with a frequency of 25% in both the psychiatric patients and healthy controls. The frequency of GSTP1 Val105 variant was 16%, 12% and 21% among Tanzanians, South African Venda and Zimbabweans, respectively. We conclude here that CYP1A1 Val462 polymorphism is very rare among Africans. This is the first report of the GSTP1 Val105 variant frequency in African populations. We show here that there are no differences in frequencies of the variant alleles for CYP1A1, GSTM1, GSTT1 and GSTP1 in the three African populations.     

高频超声对急性肠系膜淋巴结炎的诊断价值

我院超声室于１９９７年以来用高频超声显像在对急腹症的鉴别诊断中,诊断肠系膜淋巴结炎１３例,全部病例经非手术治疗痊愈,超声随访肿大的淋巴结消失或缩小至５ｍｍ以下。１资料与方法本组１３例,男７例、女６例,年龄５～２１岁。患者均以腹痛就诊。使用Ｐｅｒｆｏｒ...     

乳腺摄影选用钼、铑滤光器滤过技术的临床效果

乳腺摄影是利用钼靶低千伏Ｘ线对女性乳房进行摄影的方法。本文采用钼滤光器和铑滤光器二种不同的滤过方式,对不同类型的乳房进行摄影,增加乳腺影像的层次,提高了影像的清晰度,大大地提高了乳房摄影的质量。１滤过技术原理Ｘ线滤过通常分为固有滤过和附加滤过二种,滤...     

彩色多普勒对椎动脉和颈动脉病变的分析

本文应用彩色多普勒血流技术对２０例对照组,３６例眩晕组及１６例脑梗组病人的椎动脉和颈动脉进行了观察,对比,分析。对晕眩症及脑梗塞的诊断和治疗提供了客观的依据。１资料与方法本文２０例对照组均为症状性眩晕,临床上排除脑血管病变。眩晕组３６例,临床上排除颈...     

重视磁共振扫描前的准备

我院自开展磁共振检查以来,迄今已有３５００多的病例。通过对各个部位的扫描检查,我们发现,扫描前的准备工作看似简单而又与整个检查过程紧密相关,是保证扫描质量的前提与基础,不容忽视,在实际的工作中,我们有如下几点体会。１提高接诊质量１１仔细审阅申请单重...