佛山市南海区诺如病毒引起急性胃肠炎暴发的流行病学研究

目的 了解佛山市南海区暴发的急性胃肠炎中诺如病毒感染的流行特征.方法 对南海区 2006-2007 年暴发的2起急性病毒性胃肠炎疫情进行流行病学调查和分子流行病学研究,将收集到的患者的粪便、肛拭子标本,采用针对诺如病毒的特异性引物和逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)技术进行检测,再经过分析核酸序列分析病毒的基因型.结果 两起暴发流行的急性胃肠炎均由GⅡ.4亚型的诺如病毒引起.结论 诺如病毒是引起南海区秋冬季急性胃肠炎暴发流行的主要病原体,且引起暴发的流行病毒株属于GⅡ.4型.     

北京地区诺如病毒分子生物学特点初步研究

目的了解北京地区诺如病毒的分子生物学特点。方法收集北京市2007年1—3月非细菌性胃肠炎暴发和散发病例，采集患者粪便标本，使用逆转录聚合酶链反应（RT—PCR）对粪便标本进行诺如病毒RNA检测，对RT—PCR阳性标本的PCR产物进行克隆测序。结果检测38例粪便标本，共有27例阳性。随机选择其中4例PCR产物进行克隆测序，获得4株诺如病毒序列进行比对分析，结果显示，该4株病毒序列与诺如病毒GⅡ／4型参考株同源性最高，其中与荷兰和日本提交的诺如病毒GⅡ／4型变异株最为接近，同源性分别为97．8％～98．5％和95．2％～95．9％。系统发生树分析表明，该4株诺如病毒与荷兰、日本流行的GⅡ／4型变异株处于同一分支上。结论北京地区存在诺如病毒GⅡ／4型变异株流行，其与2006年荷兰和日本的诺如病毒流行株属同一类GⅡ／4型变异株。     

广州市1起诺如病毒急性胃肠炎暴发的实验室检测

目的确定1起学校急性胃肠炎暴发原因。方法采集病例粪便标本,直饮水标本,采用实时荧光定量(Real-time)PCR和RT-PCR方法检测病毒核酸,阳性标本测序分析。结果 5份粪便标本中3份呈诺如病毒阳性,2份直饮水标本均呈诺如病毒阳性。3份病例粪便标本病毒株核苷酸序列一致,均为GⅡ-4型,提示病毒同源。结论对诺如病毒进行核酸检测,证实该疫情为一起诺如病毒GⅡ-4型引起的急性胃肠炎暴发。     

一起诺如病毒引起的急性胃肠炎暴发的分子流行病学分析

目的了解青岛市某小学暴发的一起急性胃肠炎中诺如病毒感染的分子流行特征。方法将收集到的患者的粪便标本27份,采用RT-PCR方法进行诺如病毒检测,阳性标本进行核苷酸序列测定和遗传进化树分析,确定基因型。结果青岛市2012年12月份暴发的病毒性胃肠炎,27份粪便标本中检测出9株阳性毒株,阳性率为33.33%,其中7株测序成功,2株由于病毒浓度较低而测序失败。检测出的7株阳性毒株进行同源性分析,结果显示所测序列与诺如病毒参考株JX459908_GⅡ-4/Sydney\NSW0514\2012\AU的同源性均为100%,证实为诺如病毒GⅡ型,利用基因进化树分析得出是由GⅡ.4亚型的诺如病毒引起。结论诺如病毒是引起此次急性胃肠炎暴发流行的主要病原体,且引起暴发的流行病毒株属于GⅡ.4型。     

一起大学校园内由诺如病毒GⅡ型引起急性胃肠道疫情的病原分子生物学特征分析

目的分析长春市某大学一起胃肠道不适症状事件的诺如病毒分子生物学特征。方法将收集到的104份粪便标本,采用real-time PCR方法检测诺如病毒核酸。阳性标本再进行RT-PCR扩增,扩增产物经过凝胶电泳分析后,进行序列测定,确定基因型,并进行系统发生树分析。结果 104份粪便标本检出44株GⅡ组诺如毒株,22株测序成功,对测序成功的22株毒株进行同源性分析,结果这22株毒株与2016年韩国株Ⅱ.17|KX764738同源关系最近,证实这是一起由GⅡ.17感染引起的聚集性胃肠炎事件。结论此次胃肠炎事件是由诺如病毒引起,且为GⅡ.17毒株感染引起。     

天津市婴幼儿病毒性腹泻诺如病毒检测

目的研究天津市秋冬季婴幼儿腹泻患儿中诺如病毒感染的流行情况及其基因型别。方法 2008年10-12月收集天津市儿童医院住院部310例疑似病毒性腹泻的婴幼儿粪便标本,应用逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)法检测粪便中诺如病毒核酸,并将部分阳性株的PCR产物进行测序,采用序列分析软件分析测序结果 ,推断其毒株型别。结果 310份腹泻标本中,诺如病毒RT-PCR阳性37份(GII型37份,GI型0例),检出率为11.94%;23份PCR产物送往测序,经Genebank Blast及系统进化树分析,所有诺如病毒均为诺如病毒基因组Ⅱ型,其中GII-4/2006b占95.65%(22/23),GII-3占4.35%(1/23);感染诺如病毒的患儿多为1岁以下,且11月份检出率最高。结论诺如病毒是天津市秋冬季婴幼儿病毒性腹泻的重要病原体,2008年诺如病毒以GII-4/2006b型毒株流行为主。     

湖州市散发急性胃肠炎病例诺如病毒检测结果分析

目的分析湖州市散发急性胃肠炎病例诺如病毒感染的分子流行病学特征。方法选取2014年7月—2015年6月湖州市某哨点医院873例散发急性胃肠炎病例为研究对象,采用实时荧光定量RT-PCR方法对病例粪便标本进行诺如病毒核酸检测,选取部分阳性标本进行核苷酸序列测定,确定诺如病毒基因型并作流行病学分析。结果 873份腹泻粪便标本,检出诺如病毒核酸阳性256份,阳性率为29.32%;其中GⅠ型2份,GⅡ型254份。选取核酸浓度较高的169份PCR扩增阳性产物进行序列分析,结果显示:2株GⅠ型诺如病毒分属于GⅠ.7和GⅠ.Pb/GⅠ.6基因型;167株GⅡ型诺如病毒共存在10种基因亚型,以GⅡ.P17/GⅡ.17(65.27%)和GⅡ.Pe/GⅡ.4(28.74%)基因型为主,其他基因型有GⅡ.21、GⅡ.3、GⅡ.2、GⅡ.6、GⅡ.7、GⅡ.13、GⅡ.P7/GⅡ.6和GⅡ.P12/GⅡ.4,重组株出现频率高。诺如病毒感染的发病高峰为10月至次年3月。结论诺如病毒是湖州市散发急性胃肠炎病例的主要病原菌之一,其中GⅡ.P17/GⅡ.17型是流行的优势株。     

一起GⅡ.17型诺如病毒引起的聚集性腹泻疫情报告

目的调查一起GⅡ.17型诺如病毒感染引起的聚集性腹泻疫情。方法收集该起疫情患者粪便标本,采用实时荧光定量反转录PCR(RT-PCR)检测诺如病毒核酸,阳性标本进行核苷酸序列测定并进行同源性分析。结果该起感染性腹泻疫情共36例患者,采集13例临床表现典型患者的粪便标本进行检测,诺如病毒核酸阳性8份,阳性率为61.54%。将5株测序成功序列进行比对,确定诺如病毒基因型为GⅡ.17型。与2014年中国香港分离的诺如病毒GⅡ.17型参考株Norovirus HK GⅡ.17 2014在同一个进化分支上,核苷酸序列同源性为99.3%~99.7%。结论本次疫情是由GⅡ.17型诺如病毒感染引起的聚集性腹泻疫情,应加强对此毒株的监测工作。     

浙江省2006-2007年暴发性胃肠炎中诺如病毒的分子流行病学分析

目的 分析浙江省2006-2007年暴发性病毒性胃肠炎中诺如病毒感染的分子流行病学特征.方法 收集监测期间暴发性病毒性胃肠炎疫情患者的粪便标本及相关流行病学资料.采用RT-PCR及荧光定量RT-PCR检测诺如病毒.随机选掸部分阳性标本扩增部分多聚酶区和衣壳蛋白片段,进行序列测定,结合诺如病毒I(GI)、Ⅱ(GⅡ)基因型参考株进行进化分析.结果 诺如病毒感染暴发性胃肠炎共5起,发生时间均集中于9-12月,送检标本63份,诺如病毒检测阳性45份.序列分析结果显示,浙江省诺如病毒序列与诺如病毒GⅡ/4型参考株同源性最高,其中与北京2006年、荷兰2006年诺如病毒GⅡ/4型变异株最为接近,核苷酸同源性分别为99.7%和98.5%～99.0%.诺如病毒与北京、荷兰流行的GⅡ/4型变异株处于同一分支.结论 诺如病毒是浙江省病毒性腹泻暴发疫情的重要病原体,流行时间集中于秋季,其流行株为GⅡ/4型变异病毒株.     

2008年广州市婴幼儿诺如病毒感染流行特征及基因型研究

目的了解广州市5岁以下婴幼儿诺如病毒感染状况及对诺如病毒阳性株进行基因型分析。方法收集广州市2008年5家病毒性腹泻监测点医院的门诊临床诊断为病毒性腹泻的5岁以下患儿临床资料及粪便标本692份,采用ELISA方法检测轮状病毒、腺病毒、星状病毒和诺如病毒抗原,将诺如病毒抗原阳性的标本用RT-PCR方法进行诺如病毒核酸扩增,阳性产物回收、纯化并测序,结合GenBank中的相关序列进行型别流行特点分析。结果 692份标本中,ELISA方法检测4种病毒的阳性率分别为轮状病毒31.9%(221/692)、诺如病毒21.2%(147/692)、腺病毒6.1%(42/692)、星状病毒1.2%(8/692),混合感染占6.8%(47/692)。诺如病毒腹泻病例发病高峰在9—11月份,占51.7%(76/147),2岁以下病例数占91.8%(135/147)。临床症状以腹泻、呕吐、发热、腹痛为主。147份诺如病毒ELISA阳性标本中RT-PCR方法检测诺如病毒核酸阳性率为84.4%(124/147),经测序及与GenBank中的相关序列比对,证实124份均属诺如病毒GⅡ遗传组,其中1份是GⅡ2型,其余均为GⅡ4型,GⅡ4型中又有不同分支。结论诺如病毒是广州市5岁以下儿童病毒性腹泻的常见病原之一,仅次于轮状病毒,常见于2岁以下婴幼儿,流行优势株基因型为GⅡ4型。     

一起急性胃肠炎暴发疫情中诺如病毒的分子流行病学分析

目的研究导致本次急性胃肠炎暴发疫情的诺如病毒的分子流行病学特征。方法对2015年2月7日北京市某旅行团急性胃肠炎暴发疫情病例标本进行实时荧光定量PCR(Real-time PCR)检测,并对感染病例的诺如病毒进行RNA依赖性RNA聚合酶基因(RNA-dependent RNA polymerase,RdRp)和VP1区基因序列的检测和分析。结果 18份便标本经Real-time PCR检出12份GⅡ型诺如病毒阳性标本,RdRp区和VP1区序列扩增各得到11条诺如病毒基因序列。根据RdRp区和VP1区系统进化分析证明感染病例的诺如病毒分型为GⅡ.17型。该病毒株与引起暴发疫情的诺如病毒GⅡ.17型新变异株珠海ZHITHC-12株高度同源,RdRp区和VP1区核苷酸差异分别为0%和0.1%,氨基酸差异均为0%。结论引发北京某旅行团旅客急性胃肠炎暴发疫情的病原体是引起中国2015年暴发流行的诺如病毒GⅡ.17型新变异株。     

青岛地区婴幼儿诺如病毒分子生物学特点初步研究

目的:了解青岛地区婴幼儿诺如病毒的分子生物学特点。方法:收集青岛市儿童医院2006年11~12月非细菌性腹泻大便样品48份,使用逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)对粪便标本进行诺如病毒RNA检测,对RT-PCR阳性标本的PCR产物进行测序。结果:48例粪便标本中共有6例阳性,测序分析确定,3株为GII/4型,1株为GII/1型,1株的序列变化较大,但其和GeneBank里编号为EU072349的序列同源性较高为94%,一株由于检测不到信号而终止反应。结论:青岛地区婴幼儿病毒性腹泻中存在诺如病毒感染,且感染毒株的基因型别不一。     

RT-LAMP法对Ⅱ型诺如病毒的检测

目的在本实验室建立适合于基层使用的Ⅱ型诺如病毒快速检测方法 RT-LAMP法,并将其应用于临床病毒性腹泻的检测,为了解诺如病毒导致的病毒性腹泻在南京市的流行状况提供方法和数据。方法用实验室保存的诺如病毒阳性标本进行方法学建立,并收集南京地区某医院2011年秋冬因腹泻就诊并临床诊断为病毒性腹泻的57例成年人患者的粪便进行Ⅱ型诺如病毒检测,包括荧光定量PCR法及基于环的等温扩增(LAMP)法,并对检测为阳性标本核酸进行测序分析。结果所建立的Ⅱ型诺如病毒RT-LAMP法和荧光定量检测法均可以检测到稀释到10 000倍的阳性标本,即两种方法具有相同的敏感度。对于诺如病毒I型、甲肝病毒及乙肝病毒没有扩增,即对诺如病毒Ⅱ型的扩增具有特异性。57例临床粪便标本,荧光定量PCR法与RT-LAMP法均检测到6例Ⅱ型诺如病毒阳性病例,两种方法符合率为100%,经测序分析,5例为诺如病毒GⅡ.4亚型,1例为诺如病毒GⅡ.6亚型。5例GⅡ.4亚型分别来源于4个不同的流行株,3个国家和地区,巴西、俄罗斯和北京。结论南京地区2011年诺如病毒腹泻病例以GⅡ.4亚型为主要感染亚型,也有GⅡ.6亚型。结果提示该病毒传播范围的广泛性和流行病学防控的艰巨性。荧光定量PCR与RT-LAMP法都可以快速进行病原检测,但RT-LAMP法因其方法简易、不需要特殊仪器、结果直接肉眼观察而更适合基层使用。     

2006-2007年杭州市余杭区诺如病毒性腹泻分子流行病学研究

目的研究杭州市余杭区群发性腹泻中诺如病毒的分子流行病学特点。方法采集2006-2007年6起余杭区群发性腹泻疫情患者的粪便和肛拭子标本,采用荧光定量PCR技术进行诺如病毒检测,然后对病毒的N/S区域进行序列测定。结果6起群发性腹泻疫情都是由诺如病毒引起的,基因分析显示这些病毒都属基因Ⅱ型4组。结论诺如病毒是余杭区群发性非细菌性胃肠炎的重要病原体之一,在现阶段存在优势毒株是GII.4型,正在发生变异。     

2011年-2013年珠海市诺如病毒胃肠炎暴发的病毒分子流行病学分析

目的研究珠海市诺如病毒胃肠炎暴发的分子流行病学特征及流行株基因型的演化情况。方法收集珠海市2011年-2013年28起胃肠炎暴发疫情患者肛拭子标本619份,采用荧光逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)定性检测诺如病毒RNA,按要求选取部分诺如病毒RNA阳性标本扩增诺如病毒衣壳蛋白,进行测序及同源性分析。结果其中17起疫情由诺如病毒感染引发,检测阳性率为19.55%(121/619);选取诺如病毒RNA阳性标本57份进行测序分型,成功分型的标本为47份,全部为No V GⅡ,14株为GⅡ.4型(其中5株为GⅡ.4 2006b,另外9株为GⅡ.4/Sydney_2012);12株属于GⅡ.3型;3株属于GⅡ.5型;18株属于GⅡ.6型。结论珠海市诺如病毒引起的食物中毒流行株属于GⅡ组,但基因亚型存在多样性,并且在短时间内造成多处暴发疫情,提示该状况将是今后防控监测的重点。     

一起学校内诺如病毒GⅡ型急性胃肠炎暴发调查

目的调查一起学校内腹泻相关暴发疫情的病原和传播危险因素,为采取有效针对性防控措施提供依据。方法根据《诺如病毒急性胃肠炎的诊断治疗和疑似暴发疫情的判定》制定病例定义,并进行现场流行病学调查。采集疑似病例、食品相关标本进行PCR核酸检测。结果本次暴发疫情共发现疑似病例110例,罹患率为5.74%。发病以住宿学生为主,性别无统计学差异。病例集中于高二年级,其居住的宿舍无明显聚集性分布。现场采集标本检测结果显示为诺如病毒GⅡ核酸阳性。结论本次疫情为一起诺如病毒GⅡ型引起的急性胃肠炎暴发疫情。学校、托幼机构等集体单位诺如病毒感染性腹泻的防控工作需引起重视。     

深圳市罗湖区2018年1月——2021年10月诺如病毒流行病学分析

目的 分析深圳市罗湖区2018年1月—2021年10月诺如病毒的病原学型别及流行状况,初步预测流行趋势,为诺如病毒防控提供有效依据。方法 采用real-time PCR技术对采集的标本进行病毒鉴定,利用基因测序对诺如病毒阳性样本进行序列分析。结果 2018年1月—2021年10月共监测散发病毒性腹泻440例,其中诺如病毒引发的占17.27%,同期聚集性腹泻疫情一共54宗,诺如病毒引发占比85.19%,主要流行的基因亚型为GⅡ．2、GⅡ．4、GⅡ．17。结论 诺如病毒是病毒性腹泻的主要病原体,聚集性腹泻基本由其引发。辖区流行的诺如病毒仍以GⅡ为主,但基因亚型中GⅡ．2占比增多,需加大对其监测,防止大规模疫情暴发。     

一起老年病区诺如病毒医院感染暴发的调查

目的对北京某所三甲医院老年病区暴发的一起诺如胃肠炎医院感染进行调查。方法根据统一设计的流行病学调查表,逐一对腹泻、呕吐患者进行个案调查;收集感染者的人口统计学等信息,同时采集便标本,使用实时RT-PCR检测诺如病毒,对第二轮产物进行测序,并通过BLAST进行诺如病毒基因库比较。结果 2007年10月31日-11月12日共发生24例诺如病毒胃肠炎医院感染,包括17例住院患者,5名医务工作者及2名其他人员;该病区68.0%的患者被感染;对收集到的13份便标本进行诺如病毒检测,其中9份结果阳性,均属于GⅡ-4基因型。结论此次急性胃肠炎医院感染暴发是由诺如病毒引起的,涉及患者、医务工作者及其家属,于暴发3周后得到控制。     

佛山市南海区病毒性胃肠炎的病原体监测分析

[目的]了解病毒性胃肠炎患者中轮状病毒及诺如病毒感染情况。[方法]收集佛山市南海区2009年3月1日～2010年2月28日共计426例病毒性胃肠炎患者的粪便标本,轮状病毒以A群轮状病毒胶体金试剂盒进行筛查,诺如病毒以荧光定量PCR的方法进行检测。[结果]426例病毒性胃肠炎患者的粪便标本中,111例(26.1%)轮状病毒筛查阳性,22例(5.2%)诺如病毒阳性。轮状病毒引起胃肠炎在全年度均有发生,发病率曲线不规则,以冬春季多见;诺如病毒发病率较低。[结论]轮状病毒是2009年南海区病毒性胃肠炎的主要病原。     

北京地区诺如病毒感染的流行病学调查

目的调查北京地区诺如病毒感染的流行情况。方法对暴发疫情的急性胃肠炎患者和散发诺如病毒阳性患者全部进行现场问卷式调查，并采集患者粪便标本，应用ELISA和RT—PCR方法检测诺如病毒，选择阳性PCR产物进行克隆测序。结果2006年11月至2007年3月，北京市共计报告急性诺如病毒胃肠炎暴发疫情8起，经现场流行病学调查全部确认为院内感染暴发。在报告的409例急性散发病毒性胃肠炎病例中，共检出诺如病毒阳性患者158例，检出率38．63％。其中40～44岁年龄组检出率最高，为55．00％，55～59岁年龄组检出率最低，为21．74％。阳性患者中年龄最大者91岁，最小者仅6个月，平均年龄为40岁。男性患者84例，女性74例。序列分析结果显示，北京地区诺如病毒流行株与2006年荷兰和日本的诺如病毒流行株最为接近，为GⅡ／4型变异株。结论诺如病毒是2006—2007年北京地区冬季病毒性腹泻的一个重要病原体，北京地区诺如病毒流行株与2006年荷兰和日本的诺如病毒流行株属同一类GⅡ／4型变异株。