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不同产地连翘的DNA指纹图谱构建与聚类分析 总被引:1,自引:0,他引:1
目的以不同产地的14批连翘Forsythia suspensa为材料,运用RAPD技术对其进行遗传多样性研究并构建DNA指纹图谱。方法采用RAPD技术,从45条RAPD随机引物中进行筛选,以14批连翘进行DNA指纹图谱的分析研究。结果从45条RAPD随机引物中筛选出11条多态性好的引物,利用这11条RAPD引物进行PCR扩增,共获得80条谱带,平均每个引物扩增出7.27条谱带,其中多态性谱带67条,多态性条带比率为83.8%,是连翘药材资源研究的一种有效分子标记。14批连翘药材间的遗传相似系数(genetic similarity,GS)在0.487 5~0.962 5,表明遗传多样性比较丰富。聚类结果显示遗传多样性与连翘药材来源地有明显的相关性,而且与其亲缘关系较近有关,符合植物种群分布的一般规律。结论以14批不同产地连翘药材资源的RAPD扩增谱带为基础,构建连翘药材资源的DNA指纹图谱并进行聚类分析。 相似文献
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为鉴别中药材黄芪的品种及其代用品,采用高盐低pH值法提取药材的基因组DNA,利用随机扩增多态DNA(RAPD)技术扩增药材基因组DNA样品。结果表明,高盐低pH值法较适用于黄芪类药材基因组DNA的提取,其中2个引物可作为高特异性引物,根据琼脂糖凝胶上显示的DNA带型差异准确鉴别黄芪和红芪。RAPD方法可以准确、快速地鉴定黄芪及其代用品。 相似文献
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罗汉果性别的RAPD标记研究 总被引:1,自引:0,他引:1
采用随机扩增多态性DNA(Random Amp lified Polymorph ism DNA,RAPD)技术,运用集群分离分析法(Bu lked SegregantAnalysis,BSA)研究与罗汉果性别连锁的分子标记。从90条随机引物的扩增产物中筛选出18条可能与性别连锁的RAPD标记。利用雌雄个体对这18条RAPD标记进行验证,发现引物S1431所扩增的约400bp谱带在8个雌性单株中都不出现,而在8个雄性单株中都出现,表明这是一条与雄性连锁的RAPD标记。 相似文献
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目的:分析不同产地满山红遗传背景与遗传关系,建立中药满山红的RAPD分析方法。方法:CTAB法提取不同产地满山红的基因组DNA;琼脂糖凝胶电泳法检测PCR扩增产物,SPSS17.0软件进行聚类分析,NTSYS2.10e软件进行遗传距离计算。结论:从100条随机引物中筛选出10个随机引物,其扩增产物谱带多,特征好,共扩增出806条条带,多态性条带数710条,多态性比例为88.1%。结论:不同产地间的满山红存在丰富的遗传多样性,RAPD分析技术可用于鉴定满山红。 相似文献
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基于RAPD的青天葵遗传多样性及鉴别研究 总被引:1,自引:0,他引:1
目的 建立及优化青天葵样品总DNA的提取方法及RAPD反应,探讨不同品种的青天葵及其替代品、伪品在DNA分子水平上的遗传多样性及其遗传关系.方法 使用高盐低pH值法提取总DNA,采用随机扩增多态性DNA,从49条随机引物中筛选能扩出清晰条带的引物,对22个青天葵样品及伪品进行RAPD分析.用统计分析软件对扩增出的条带进行聚类分析,以Shonnon's指数和Nei's指数对青天葵遗传多样性进行估算.结果 高盐低pH值法提取的新鲜样品纯度高,药材纯度低,但都能用于RAPD.选取能扩增出清晰条带的19条引物,把鲜品与干品分别聚类分析.干药材中小叶与中叶距离较近,与大叶及毛叶距离远.新鲜叶片中三种青天葵为一类,青天葵与其组培品、毛叶与红薯叶距离稍远,与车前草、积雪草距离最远.青天葵种群遗传多样性Shonnon's指数为0.463,Nei's指数为0.267,种群内遗传多样性较高,基因流为0.94.结论 不同品种青天葵间及伪品在分子水平上存在差异,可用此方法鉴别青天葵.青天葵的遗传多样性大多是由地理环境造成的. 相似文献
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DNA分子标记技术在龙胆鉴别与亲缘关系划分上的应用 总被引:5,自引:0,他引:5
研究东北产药材龙胆的鉴别方法及其亲缘关系,用分子生物学技术对东北产药材龙胆的3个不同品种进行了DNA提取和RAPD及ISSR分析。应用RAPD法从80个随机引物中找出了3种引物(S-76,S-69,S-64)来标记3种龙胆发现这3种引物能把供试的3种龙胆全部区分开。同时应用ISSR法从7个引物中筛选出4个引物能扩增出稳定遗传多态性引物,共扩增出44条DNA条片段,其中同源片段有22个,特异片段有12个,多态片段为10个。用这些引物扩增出的指纹图谱进行聚类分析,得出了相同的结论,即在3种龙胆中,条叶龙胆,龙胆亲缘关系较近,三花龙胆与二者亲缘关系较远。结果表明分子标记技术可用于龙胆的鉴别,亲缘关系划分。 相似文献
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目的 研究海风藤原植物风藤和山蒟的分子鉴定方法。方法 提取31份来自全国各地药材植物及不同医药企业生产饮片的基因组,对psbA-trnH、matK、petA-psbJ等叶绿体基因片段以及核糖体间隔序列ITS进行PCR扩增测序及进化树构建。从叶绿体基因组的简单重复序列中筛选4对特异性引物,对其扩增产物进行毛细管电泳分析。结果 所有样品的psbA-trnH序列高度一致,其它DNA条形码的序列均有一定差异。进化树的聚类分析结果 matK和petA-psbJ片段相近,且与SSR分子标记结果一致,但与ITS聚类结果有差异。结论 matK和petA-psbJ片段对风藤和山蒟的鉴别能力优于ITS和psbA-trnH,DNA条形码和SSR分子标记法均可为中药材海风藤的种质资源鉴定提供分子依据。 相似文献
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中药山茱萸SCAR标记的研究 总被引:1,自引:0,他引:1
目的:建立山茱萸的SCAR标记,为山茱萸药材分子鉴定提供科学依据.方法:用随机引物进行RAPD筛选,获取特异的RAPD标记条带,分离提取RAPD标记条带,进行克隆和测序,根据测定RAPD标记条带的两端序列设计1对特异引物进行常规PCR反应,获得SCAR标记.结果:根据RAPD标记条带的序列设计筛选了4对特异引物,其中YST38,YST43分别对7个山茱萸品种样本的DNA进行SCAR扩增,7个山茱萸栽培品种均能产生单一的PCR条带,可以用作山茱萸的鉴别;而YST38对圆柱形果型、长梨形果型还有1条特异性条带,可以做为这2个品种的鉴别依据;YST39对7个山茱萸品种进行扩增,纺锤形果型样本的谱带大小(350~400 bp)比其余6个果型的谱带大小(650~700 bp)短了300 bp左右,这条谱带可以做为纺锤形果型的鉴别依据;YST92对圆柱形果型、长梨形果型均产生了1条600~700 bp的条带,椭圆形果型、短圆柱形果型产生了1条200~300 bp的条带,长圆柱形果型、纺锤形果型、短梨形果型3个果型无扩增,YST92可用来筛选山茱萸的几种果型.结论:建立的SCAR标记,条带清晰明亮,结果稳定,可作为山茱萸品种选育和药材分子鉴定的依据. 相似文献
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RAPD技术在中药贝母类研究中的应用 总被引:8,自引:0,他引:8
目的 为了对贝母类药材的正确应用提供分子水平的资料。方法 采用RAPD技术对12个贝母样品进行了亲缘关系研究。结果 所有样品总DNA均为21Kb左右。从20个随机引物中筛选出5个扩增稳定且谱带清晰的引物,扩增产物共记录到27条谱带,多态性片段25条,扩增产物大小为450bp~1904bp。结论 种内相似性大于种间相似性,安徽贝母和蒲圻贝母的亲缘关系最远,渐贝母和蒲圻贝母的亲缘关系最近。 相似文献
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用RAPD技术鉴别湖南道地药材玉竹 总被引:3,自引:0,他引:3
目的:探讨湖南道地药材玉竹和不同产地玉竹及其混淆品黄精用RAPD技术进行鉴别的新方法,寻找玉竹的最佳检验体系.方法:采用RAPD技术对药材玉竹类基因组DNA的多态性进行分析,进行湖南道地玉竹及其混淆品的区分.结果:通过所选引物进行PCR扩增,可以获得特异性的谱带,确定了适合于玉竹的最佳RAPD反应体系,将湖南道地玉竹及其主要掺伪分开.结论:优化的RAPD反应体系是保证实验结果稳定可靠的重要因素之一,可应用于药材玉竹的鉴定,它突破了传统的鉴别方法,是玉竹鉴定的一个新的有益的尝试. 相似文献
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RAPD法鉴定射干类中药 总被引:21,自引:0,他引:21
目的:用RAPD技术对射干类药材射干Belamcanda chinensis及混淆品鸢尾属鸢尾Iris tectorum、野鸢尾I.dichotoma、蝴蝶花I.japonica、德国鸢尾I.germanica等5种药用植物进行分子水平的鉴定。方法:CTAB法和DNeasy^TM Plant Mini Kit法提取射干类药材5种原植物总DNA,以随机引物进行随机扩增。结果:用OPD-08(5’-gtgtgcccca-3‘)等作随机扩增引物进行随机扩增时,可得到识别这些物种基因组DNA的多态片段。结论:RAPD法能有效的鉴别射干类药材,把射干和鸢尾、野鸢尾、蝴蝶花、德国鸢尾等药用植物区分开。 相似文献
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随机扩增多态性DMA技术与简单序列重复标记法探讨部分黄精属药用植物亲缘关系的研究 总被引:1,自引:0,他引:1
目的 为黄精属部分药用植物建立聚类分析,对黄精属药用植物的分类进行研究.方法 采用原植物鉴定、随机扩增多态性DNA(RAPD)、简单序列重复(ISSR)手段,对随机引物进行筛选,通过1.8%琼脂糖凝胶电泳分离PCR产物.结果 筛选23种RAPD引物,5种ISSR引物,经PCR扩增产生足够的多态性谱带用于分析.结论 采集不同产地的玉竹、小玉竹、多花黄精出现了一定程度的变异.RAPD,ISSR方法可以从分子水平区分黄精属药用植物. 相似文献