云南省丙型肝炎病毒基因的分型

HCV基因型有地区差异，不同基因型与疾病进展，肝癌发生及IFN疗效有关，对散发性丙型肝炎的传播途径和疫苗研制等有重要意义。为了解云南省丙型肝炎患者HCV的基因型分布，采用邱国华等报道的HCV非编码区ABC程序酶切分型法对云南省不同人群128份HCV RNA阳性血清进行HCV基因分型研究，现报道如下。     

昆明地区丙型肝炎基因型分析

HCV是造成慢性肝炎、肝硬化及肝癌的重要原因之一。现研究已知HCV基因组高度的变异性是HCV持续感染及严重预后的重要因素,且HCV基因型与感染途径、临床病情及抗病毒治疗、疫苗制备等有明显的相互关系。根据HCV基因的遗传差异性可将HCV分为不同的基因型和亚型。根据HCV基因型可以明确病毒的种系发育和传播来源,了解不同基因型和亚型的地理分布,可能与HCV治疗的疗程及效果相关。因此,针对当地流行的HCV基因型进行检测鉴定,具有重要的临床意义。本研究即以型特异性探针杂交法对176例HCV感染者进行HCV基因型研究,以探讨昆明地区HCV感染基因型流行特征。     

合肥地区丙型肝炎病毒基因分型分布特征

目的了解合肥地区丙型肝炎病毒(HCV)基因型分布特点。方法收集251例HCV患者的临床流行病学资料和外周静脉血,采用sanger测序法检测HCV基因型。结果合肥地区HCV患者中共检出4种基因型,8种基因亚型,以1b型最多占68.12%,其次2a、2i型占12.75%、10.36%,3a、3b、6a、6n、6v均有分布。各基因型在不同性别中的比较差异无统计学意义(P0.05);不同年龄段基因型相比较,差异有统计学意义(P0.05),在30～60岁年龄组,基因型分布最为广泛;在时间分布上,早期HCV基因型较为单一,主要以1b和2a型为主,近年来基因1b型逐渐减少,2i、3a、3b、6a基因型逐渐增多,总的基因类型增多。经输血、血液透析、母婴传播感染患者基因型主要为1b、2a及2i型,性转播、其他途径(拔牙、纹身、纹眉、穿耳、职业暴露等)传播以基因1b型为主,2a、2i、3a、3b型均有分布,而静脉吸毒患者基因型分布较为广泛,1b、2a、2i、3a、3b、6a、6n、6v均有分布。结论合肥地区的HCV基因分型呈多样化,以1b型为主,其次为2a、2i型,同时存在3a、3b、6a、6n、6v基因型。     

山东地区慢性HCV感染者病毒的基因型分布

目的明确山东地区慢性丙型肝炎及丙肝肝硬化患者感染丙型肝炎病毒(HCV)的基因型分布,探讨HCV基因型与肝脏疾病严重程度及感染途径之间的关系。方法根据HCV 5′非编码区(NCR)设计基因芯片,对山东地区慢性HCV感染者(慢性丙型肝炎128例,丙肝肝硬化42例)应用基因芯片法检测HCV基因型,并对其中22份标本进行测序,比较慢性丙型肝炎、肝硬化病人HCV基因型分布以及不同途径感染的病HCV人基因型分布的差别。结果 168例患者标本可以分型,HCV基因型分别为:1b型106例,2a型48例,1a及3b型均为2例,1b+2a混合型9例,1a+1b混合型1例;对22例患者标本测序,1b型12例,2a型9例,3b型1例,与基因芯片法检测结果完全一致;肝硬化和慢性肝炎病人的HCV基因型分布差异无统计学意义(χ2=1.82,P>0.05),有输血史者和无输血史者HCV基因型分布差异无统计学意义(χ2=7.63,P>0.05)。结论山东地区HCV主要流行株是基因1b型,其次为2a型,同时有少量的1a、3b型以及混合感染,HCV基因型与疾病的进展及感染途径无关。     

丙型肝炎病毒高变区准种异质性与干扰素疗效的关系

丙型肝炎病毒(HCV)基因组具有高度的变异性，在机体内以准种的形式存在，尤其以E2／NS1区384～410和474～480位氨基酸变异程度最高，分别称为HVR1和HVR2。近年的研究发现，HCV准种感染除与引起HCV感染慢性化有关外，还与HCV对干扰素(IFN)治疗的抵抗作用关系密切。本研究采用克隆测序法对10例应用IFN治疗的1b型慢性丙型肝炎患者进行了HVR1和HVR2准种异质性检测，以探讨HCV准种感染与IFN疗效的关系。     

四川省丙型肝炎患者HCV基因分型及基线HCV NS5A耐药突变位点分析

目的检测四川省丙型肝炎患者HCV基因分型及HCV NS5A耐药突变位点的分布特征。方法收集2017年-2018年在四川省人民医院确诊的来自四川省的丙型肝炎患者160例,采集外周静脉血标本,使用Sanger测序法鉴定每一样本的HCV基因型及其亚型和HCV NS5A的基因序列。结果 160例丙型肝炎患者共测出1、2、3、6四种基因型和1b、2a、3a、3b、6a、6n六种基因亚型,其中以1b亚型检出率最高,占86.25%(138/160),其次为3b、6a亚型,均各占3.75%(6/160),余下6n型占2.50%(4/160),2a、3a型均各占1.875%(3/160)。在HCV 1b亚型丙型肝炎患者在中,HCV NS5A基因耐药突变检出率为18.84%(26/138),其中以Y93H耐药突变率较高,占17.39%(24/138),其次L31M耐药突变率为1.45%(2/138)。结论分析四川省丙型肝炎患者HCV基因型及HCV NS5A耐药突变位点的分布特点,可为该地区丙型肝炎患者基因型分布及耐药性研究和个体化抗病毒治疗提供指导依据。     

贵州地区HCV感染者基因型分布特征

目的 探讨贵州地区丙型肝炎患者HCV基因型分布特征,为HCV感染的防控和个体化治疗提供临床依据。方法 选取2011年9月-2018年10月贵阳市公共卫生救治中心1211例HCV RNA阳性的丙型肝炎患者,采用PCR直接测序法,与GenBank中已知的HCV序列进行对比,获得HCV基因型及亚型,并分析其分布与性别、年龄、民族、地区、感染途径等因素的关系。计数资料组间比较采用χ2检验或Fisher确切概率法。结果 1211例HCV感染者共检出4种基因型和11种基因亚型,其中以1b型(26.84%)、3b型(27.17%)和6a型(24.28%)为主。不同HCV基因型在男女感染者中分布差异有统计学意义(χ2=15.428,P=0.009),其中男性以3b型为主(29.34%),女性以1b型为主(32.21%)。不同HCV基因型分布在各年龄组中差异有统计学意义(χ2=67.439,P<0.001),≤18岁组与≥60岁组以1b型为主(分别为66.67%、58.93%),而19~39岁组以3b型(28.93%)、6型(29.29%)为主,40~59岁组以1b型(29.54%)、3b型(27.33%)和6型(24.28%)为主。各种感染途径的HCV基因型分布差异有统计学意义(χ2=153.916,P<0.001),感染方式以静脉药瘾为主(57.97%),其次是性接触和有创美容(均为8.42%);经静脉药瘾、有创美容感染HCV者均以3b型为主(分别为31.48%、32.35%),性接触感染者多为HCV 6型(36.27%)。不同民族、贵州地区间HCV基因型分布差异均无统计学意义(P值均>0.05)。结论 贵州地区HCV基因型分布呈多样性,3b、1b、6a型为主要流行株,存在HCV 6型中的多种少见基因亚型,且在不同的年龄、性别、感染途径方面HCV基因型分布存在差异。     

HIV/HCV混合感染者与HCV感染者感染HCV基因型分析*

目的 使用二代测序技术检测广州地区人类免疫缺陷病毒（HIV）/丙型肝炎病毒（HCV）混合感染者和HCV感染者HCV基因型,了解本地区HCV基因型的流行特点。方法 在233例HCV感染者中,包括95例HIV/HCV混合感染者和138例HCV感染者,使用Illumina Miseq平台PE300模式对HCV Core和NS5B片段进行测序,采用生物信息学分析确定HCV基因型,对测序结果提示混合基因型感染的样本,使用NS5A基因型特异引物进行验证。结果 HIV/HCV混合感染者静脉吸毒感染构成比显著高于HCV感染者（77.7%对19.6% P<0.001）,HCV感染者输血感染的构成比显著高于HIV/HCV混合感染者（48.6%对3.2% P<0.001）;HIV/HCV混合感染者HCV Core基因片段平均数据量为（15456±6689） reads,HCV感染者为（14323±5321） reads,两组无显著差异（P>0.05）;HIV/HCV混合感染者HCV NS5B基因片段平均数据量为（16432±3467） reads,HCV感染者为（17611±5632） reads,也无显著差异（P>0.05）;本组228例（97.9%）HCV感染者为单一HCV基因型感染,HIV/HCV混合感染者HCV 6a型和3b型感染率显著高于HCV感染者（分别为47.4%对26.8%,P=0.001和13.7%对3.6%,P=0.005）,HCV 1b型感染率显著低于HCV感染者（20.0%对59.4%,P<0.001）;在233例入组的HCV感染者中,发现5例（2.1%）为混合基因型感染,其中4例为HIV/HCV混合感染者,1例为HCV感染者。结论 广州地区HIV/HCV混合感染者与HCV感染者感染HCV基因型构成比存在差异,其临床意义还需要探讨。     

甘肃地区汉族HCV基因分型相关分析

目的调查甘肃地区汉族丙型肝炎病毒（HCV）基因分型分布情况及与其可能的传播途径、其他相关临床指标之间的关系。方法收集甘肃地区汉族220例患者完整数据,包括性别、年龄、可能的感染途径、病毒水平及生化检查。计量资料采用t检验以及秩和检验分析,计数资料采用卡方检验,采用多因素Logistic回归分析研究HCV基因型与临床的相关性。结果220例患者共检出1b型84例（38％）,2a型136例（62％）。对220例不同HCV基因型感染者的年龄、性别、感染途径、HCVRNA、ALT、AST、TBil、IBil、DBil、ALP、GGT等11项观察指标进行单因素分析结果表明,感染途径、HCVRNA及A¨与HCV基因型问存在相关性（Ⅳ0=23．947,P〈0．001;Z=一3．349,P=0．001;t=-2．325,P=0．021）,而年龄、性别、AST、TBil、IBil、DBil、ALP、GGT等指标均与HCV基因型无关（P〉0．05）。再经多因素Logistic回归分析显示,该3项均与HCV基因型有关（矿=3．993,P=0．046;矿=9．308,P=0．002;x^2=11．652,P=0．001）。Logistic回归分析结果显示HCVRNA高水平复制（≥10^6）患者中感染2a型较1b型患者多;ALT异常（〉49U／L）患者中感染2a型者较之感染1b型患者多;通过输血途径、口腔感染途径感染1b型的概率,较之其他途径高。结论甘肃地区汉族人群中HCV感染主要为基因1b型及2a型,且2a型较1b型更为常见。2a型患者更容易出现HCVRNA的高水平复制,且可能更容易出现肝脏损伤。输血途径感染是甘肃地区主要感染HCV的方式,其次为口腔感染,而通过以上2种感染方式感染HCV的患者1b型较2a型多。     

温州地区62例HCV感染者的基因型特征研究

目的：探讨温州地区丙型肝炎病毒（HCV）感染者的HCV的基因型特征。方法：采用RT巢式-PCR法,对62例HCV-IgG阳性者进行HCV-RNA的检测及基因分型。结果：62例研究者中,HCV基因型1b单阳性率为35．48％,基因型2a单阳性率为3．23％,1b和2a双阳性率为61．29％,1b总阳性率为96．77％,2a总阳性率为50％。结论：温州地区HCV的基因型以1b型占优势,并且基因型1b和2a混合感染率较高。     

干扰素联合利巴韦林治疗慢性丙型肝炎患者的疗效

目的 研究昆明地区HCV感染者的病毒基因型分布,观察干扰素和利巴韦林联合治疗慢性丙型肝炎的疗效。 方法 采集60例慢性丙型肝炎患者的血液样品,采用特异性探针杂交法进行HCV基因分型,根据基因分型结果将患者分为HCV 1b型感染的长效干扰素治疗组（皮下注射聚乙二醇干扰素α-2a 180μg,1次/周）和非1b型感染的普通干扰素治疗组（皮下注射普通干扰素α-1b50μg,隔日1次）,两组患者均口服利巴韦林,剂量为900 ～ 1200 mg/d。治疗前后和随访中检测患者血浆HCV RNA和ALT水平作为疗效评价的指标。用x2检验比较治疗结束后HCV 1b基因型与HCV非1b基因型感染患者肝功能异常率的差异。结果 60例患者的血液样本中,HCV 1b基因型感染患者13例(21.7％),HCV 2a基因型3例(5.0％),HCV 3a基因型10例(16.7％),HCV 3b基因型29例(48.3％),HCV 6a基因型5例(8.3％);60例患者均完成治疗48周,长效干扰素治疗组和普通干扰素治疗组获得持续病毒学应答率分别为46.1％、74.5％;获得早期病毒学应答的患者全部获得持续病毒学应答。长效干扰素治疗组和普通干扰素治疗组在治疗后肝功能仍异常的患者分别占15.4％、14.9％,两组比较,x2=0.01,P＞0.05,差异无统计学意义。结论 (1)昆明地区HCV感染基因型以3b和1b为主;(2)聚乙二醇干扰素α-2a联合利巴韦林治疗HCV 1b型感染患者的疗效不理想;(3)早期病毒学应答是获得持续病毒学应答的重要预测因素。     

关于非裔美国人对HCV反应较弱的另一项研究

据Medscape．com5月8日报道，一项新的研究表明，感染HCV基因型（GT）-2或-3的非裔美国人比感染相同基因型的白种人反应弱。然而，基因型如何影响非裔美国人样本、多中心的试验正有序进行。     

丙型肝炎病毒与其合并人类免疫缺陷病毒感染者的病毒基因型差异

HCV与HIV具有相似的传播途径,都可以通过使用污染的血制品、注射用具、性接触及母婴传播,因此,HIV与HCV混合感染较常见.HIV感染改变HCV的自然病程,加速肝纤维化、肝硬化及肝细胞癌的进程已达成共识;HCV基因型对肝病的进程和预后亦起到重要作用.那么HCV基因型的分布在HⅣ/HCV混合感染与HCV单纯感染之间是否存在差异?各自的感染途径有何不同?值得我们作进一步的探讨.我们对昆明市第三人民医院收治的昆明地区85例HCV感染住院患者采用PCR等分子生物学方法研究了HIV/HCV感染与HCV单纯感染患者HCV基因型分布的差异.     

丙型肝炎病毒5''-非编码区与NS 5b区酶切分型对比研究

探讨北京与河南地区丙型肝炎病毒(HCV)基因型分布情况以及HCV5’—NCR和HCV NS5b两区域分型结果之间的差异。对56例慢性丙型肝炎和80例有偿供血员的HCV RNA阳性血清，同时进行HCV5’—NCR和HCV NS5b酶切分型研究。HCV5’—NCR和HCV NS5b两区域的Ⅱ／1b型感染率北京地区分别占85．7％和87．5％，河南地区分别占68．8％和70．0％。HCV Ⅱ／1b型为北京和河南地区HCV感染的优势株，同时HCV5’—NCR和HCV NS5b区酶切分型结果问具有良好的相互对应关系。     

慢性丙型肝炎患者病毒基因分型与血清HCV RNA水平的关系探讨

目的研究HCV基因型的分布,以探讨不同基因型感染者血清HCV RNA载量的差异。方法采用PCR法检测218例慢性丙型肝炎患者血清HCV RNA;采用ELISA法检测抗-HCV抗体;使用全自动生化分析仪测定丙氨酸氨基转移酶;采用化学发光免疫分析法测定血清肝纤维化指标;采用基因芯片法进行HCV基因分型。结果在218例HCV RNA阳性血清中共检出9种基因型,分别是lb、2a、3a、3b、6型单基因型共208例和lb+2a、lb+3b、lb+6型、2a+3a共10例四种混合基因型,其中以lb型168例(77.1%)、2a型19例(8.7%)为主;在208例HCV单基因型感染患者中发现不同基因型感染者血清HCV RNA载量无统计学差异(F=0.932,P>0.05);在168例1b基因型和40例非lb基因型感染者,性别差异无统计学意义(x2=0.857,P>0.05),两型感染者之间肝纤维化指标差别比较也无统计学意义。结论我国HCV基因型以lb型为主,基因型与HCV RNA载量及ALT水平之间无相关性。     

慢性丙型肝炎患者病毒因素及宿主细胞免疫对干扰素治疗应答的影响

目的：探讨丙型肝炎病毒（HCV）因素及机体细胞免疫因素对干扰素疗效的影响。方法：对40例慢性丙型肝炎患者进行干扰素治疗，分析HCV基因型，准种多样性，血清HCV RNA水平及肝组织HCV特异性细胞毒T淋巴细胞（CTL）活性与干扰素应答的关系。结果：经过6个月的干扰素治疗，21例获得治疗终点应答，其中10例呈持续应答，19例无应答，HCV1型患者应答率（43．3％）明显低于非1型患者（80％，P＜0．05），应答患者中治疗前血清HCV准种数目及HCVRNA水平明显低于无应答患者（P＜0．05，P＜0．01），而其肝组织HCV特异性CTL活性阳性率则显著高于无应答者（P＜0．05），结论：病毒因素和宿主因素均是影响慢性丙型肝炎干扰素治疗效果的重要因素，非1型感染，低准种数目，低病毒血症水平及肝组织HCV特异性CTL活性阳性者预示对干扰素应答良好。     

慢性丙型肝炎患者病毒基因型与IL-28B基因型分布

目的：了解慢性丙型肝炎患者白细胞介素-28B（IL-28B）基因型多态性分布的特点及其临床意义。方法在27例慢性丙型肝炎患者,分离外周血细胞DNA,采用IPLEX Gold法检测宿主IL-28B基因多态性;分析患者IL-28B基因型与血清丙型肝炎病毒（HCV）基因型、HCV RNA载量和肝功能指标的相关性。结果在27例慢性丙型肝炎患者中,感染HCV基因1型1例（3.7%）,1b基因型7例（25.9%）,其它基因型19例（19/27,70.4%）;在IL-28B基因型中,rs12979860 CC基因型、rs12980275 AA基因型及rs8099917 TT基因型共24例（88.9%）,而IL28B rs12979860 CT基因型、rs12980275 GA基因型和rs8099917 GT基因型共3例（11.1%）;在HCV基因1型或1b型感染者中,IL28B rs12979860 CC基因型、rs12980275 AA基因型和rs8099917 TT基因型占62.5%（5/8）,而HCV其他基因型感染者IL28B rs12979860 CC基因型、rs12980275 AA基因型和rs8099917 TT基因型占100%（19/19）;HCV基因1型或1b型感染者与HCV其他基因型感染者比,其IL28B rs12979860位点、rs12980275位点和rs8099917位点基因型分布有显著性差异（P＆lt;0.01）;IL-28B基因多态性分布与患者血清HCV RNA载量或肝功能指标的变化无显著性相关。结论本组慢性丙型肝炎患者HCV基因型大多为非1型;大多数感染者IL-28B基因为rs12979860 CC、rs12980275 AA和rs8099917 TT基因型。     

慢性丙型肝炎患者HCV基因型分析

目的研究慢性丙型肝炎患者HCV基因型概况。方法采用基因芯片法检测HCV基因分型;采用PCR法测定HCV RNA定量。结果在570例患者中,HCV RNA阳性552例（95%）,其中1b型400例（72.4%）,2a型63例（11.4%）,3a型20例（3.6%）,3b型20例（3.6%）,1b＋2a型12例（2.1%）,1a型2例（0.4%）,6型7例（1.26%）,1b＋3a型1例（0.18%）,2a＋1b型3例（0.5%）,未定型24例（4.3%）;不同HCV基因型感染者血清HCVRNA水平无统计学差异（P〉0.05）。结论本组患者HCV基因型以1b型为主,2a型次之,多种混合型的出现提示HCV基因型呈现多样化趋势。     

湖北省汉族人类免疫缺陷病毒感染人群白细胞介素28B的基因多态性

目的 了解湖北省汉族HIV、HCV合并感染人群IL28B基因型的分布.方法 纳入100例抗HIV、抗-HCV均阳性的汉族人群,荧光定量PCR检测HCV RNA,基因测序法对IL28B进行基因分型.数据行x2检验.结果 目标人群IL-28B基因型中,95例为C/C基因型,C/C基因型频率为96.0％,其中,HCV RNA阴性20例,占21.1％;5例C/T和T/T基因型患者中,无HCV RNA阴性病例(x2=1.043,P-0.588).结论 湖北省汉族HIV、HCV合并感染人群IL-28B 基因型中C/C基因型所占比例较高.     

不同基因型慢性丙型肝炎患者血清HCV-RNA与载脂蛋白B的关系

目的研究慢性丙型肝炎基因1型和非基因1型患者血清HCV—RNA水平和血清载脂蛋白B（ApoB）的关系。方法临床确诊为慢性丙型肝炎的53例患者，采用干扰素联合利巴韦林抗病毒治疗至少24周，Simmonds酶切分型方法进行HCV基因分型，荧光定量聚合酶链反应法（FQ—PCR）定量检测HCV—RNA，全自动生化分析仪检测血清载脂蛋白B，对不同基因型患者血清HCV-RNA水平和载脂蛋白B的关系进行研究分析。结果基因1型和非基因1型慢性丙型肝炎患者的血清HCV-RNA及载脂蛋白B水平差异无统计学意义（P〉0．05）；基因1型患者血清载脂蛋白B水平与HCV—RNA载量无明显相关（P〉0．05）；非基因1型患者血清载脂蛋白B水平随着HCV-RNA载量的降低呈升高趋势（P〈0．05）。结论不同基因型HCV对干扰素产生不同的应答反应，感染HCV基因1型的患者对干扰素治疗应答率显著低于基因2型和3型。不同基因型HCV感染者血清载脂蛋白B无显著差异，血清ApoB水平在非基因1型患者与干扰素抗HCV应答密切相关。