新疆汉族SPRR2E基因单核苷酸多态性与寻常性银屑病的关系

目的通过测定中国新疆汉族非家系寻常性银屑病SPRR2E基因的外显子编码区序列,研究SPRR2E基因与新疆汉族银屑病发病的关系。方法从新疆汉族正常人和寻常性银屑病患者的外周血中提取基因组DNA,用自动测序的方法测定SPRR2E基因的外显子编码区序列,对结果进行统计学分析处理。结果SPRR2E基因编码区第156核苷酸(+156bp)处存在A或G二态性,可表现为AA纯合、GG纯合和AG杂合三种基因型,病例组AA基因型频率明显高于对照组,差异有统计学意义(P<0.05)。结论SPRR2E基因外显子编码区序列的第156核苷酸多态性与新疆汉族非家系寻常性银屑病的发病有关。     

寻常性银屑病患者与正常人SPRRs基因的研究

目的　探讨SPRRs基因的外显子编码区序列与银屑病发病的关系。方法　从正常人和寻常性银屑病患者的外周血中提取基因组DNA ,用自动测序的方法测定SPRRs基因的外显子编码区序列。结果　正常人和银屑病患者的SPRR2A ,SPRR2B及SPRR2D基因外显子编码区序列均相同 ;SPRR2EcDNA在 +15 6bp处存在A或G二态性 ,可表现为AA纯合、GG纯合和AG杂合三种基因型 ,但不改变蛋白质编码 ,其分布在银屑病患者和正常人之间差异无显著性。结论　SPRRs基因的外显子编码区序列与寻常性银屑病的发病无明显相关性     

寻常型银屑病患者及正常人S100A6、S100A8、S100A9基因的研究

目的：通过测定家族性寻常型银屑病患者和正常人中S100A6、S100A8和S100A9基因的外显子编码区序列，探索其与银屑病发病的关系。方法：从家族性寻常型银屑病患者和正常人的外周血中提取基因组DNA，用自动测序法测定S100A6、S100A8和S100A9基因的外显子编码区序列。结果：患者和正常对照组的S100A6、S100A8、S100A9基因外显子编码区序列均相同，未发现基因多态性。结论：S100A6、S100A8、S100A9基因的外显子编码区序列与家族性寻常型银屑病发病无相关性。     

新疆维吾尔族HCR基因多态性与寻常性银屑病的相关性研究

目的 检测新疆维吾尔族寻常性银屑病(PsV)患者外周血DNA中HCR基因第16外显子的1911位点多态性,探讨其与银屑病发病的相关性。方法 从128例患者及健康对照组132例的抗凝血中提取DNA,用PCR-限制性片段长度多态性法及PCR产物直接测序法鉴定基因类型,对结果进行统计学分析处理。结果 HCR基因第16外显子的1911位点核苷酸存在G、A二态性,可表现为GG纯合、AA纯合、GA杂合三种基因型。基因型和等位基因频率经卡方检验两组比较,差异无统计学意义(P>0.05)。其中Ⅰ型、Ⅱ型寻常性银屑病患者与对照组比较,差异无统计学意义(P>0.05),男女寻常性银屑病患者与对照组比较,差异无统计学意义(P>0.05)。结论 HCR基因第16外显子1911位点的多态性与新疆维吾尔族非家系寻常性银屑病在基因型和等位基因频率方面未发现相关性。     

无寻常性银屑病的疱疹样脓疱病、泛发性脓疱型银屑病1例及其家系IL-36RN基因的突变检测

目的检测1例无寻常性银屑病的中国汉族女性疱疹样脓疱病、泛发性脓疱型银屑病患者及其家系的IL-36RN基因突变情况。方法 1例42岁无寻常性银屑病病史的泛发性脓疱型银屑病女性患者,16年前曾患疱疹样脓疱病住院治疗。其父亲患寻常性银屑病30年。采集该家系6名成员和13名健康对照的血样,提取基因组DNA,PCR扩增IL-36RN基因的全部外显子编码区及其侧翼序列,并直接测序。结果泛发性脓疱型银屑病患者IL-36RN基因c.115+6TC位点检测到纯合突变,其父亲、母亲、女儿IL-36RN基因c.115+6TC位点均检测到杂合突变,健康对照、其弟弟和丈夫的相同基因位点未检测到突变。结论 IL-36RN基因c.115+6TC位点的纯合突变可能是该例泛发性脓疱型银屑病和疱疹样脓疱病的共同发病基础。本研究为国内首次报告的疱疹样脓疱病患者中检测到IL-36RN基因c.115+6TC位点纯合突变,进一步支持疱疹样脓疱病与不伴寻常性银屑病的泛发性脓疱型银屑病是由IL-36RN基因突变所致的相同疾病。     

HCR基因单核苷酸多态性与维吾尔族银屑病的相关性

目的 探讨HCR基因与银屑病发病的相关性.方法 测定118例新疆维吾尔族寻常性银屑病及127例正常人对照组的HCR基因第4外显子第307位点基因多态性.从抗凝血中抽提DNA,用PCR-RFLP法和PCR产物直接测序法鉴定基因型.对结果进行统计学分析处理.结果 HCR-307位点核苷酸存在C、T二态性,表现为CC纯合、TF纯合、CT杂合三种基因型,病例组TF基因型频率明显高于对照组,差异有统计学意义(P<0.01).结论 HCR-307位点的C→T多态性与新疆维吾尔族寻常性银屑病具有相关性.     

HCR-325多态性与汉族人寻常性银屑病的相关性

目的探讨HCR基因与银屑病发病的相关性。方法从抗凝血中抽提基因组DNA,用PCP-RFLP法检测HCR基因第4外显子325位点多态性。结果HCR-325位点核苷酸存在C,T多态性,表现为CC纯合、TT纯合、CT杂合三种基因型,病例组T等位基因频率明显高于对照组,差异有统计学意义(P<0.05)。结论HCR-325位点的C→T多态性与汉族人群寻常性银屑病具有一定的相关性。     

有汗性外胚叶发育不良一家系致病基因突变筛查

目的:寻找有汗性外胚叶发育不良家系GJB6、GJB2和CTSC突变基因.方法:抽提外周血DNA,PCR扩增GJB6、GJB2和CTSC基因编码区的所有外显子,扩增产物纯化后直接双向测序,并与基因组序列进行比对分析,查找有无突变.结果:候选基因编码区所有外显子均未发现突变.结论:GJB6、GJB2和CTSC基因编码区序列与本研究中有汗性外胚叶发育不良家系发病无关,致病基因待进一步研究.     

肠病性肢端皮炎SLC39A4基因突变

目的研究1例散发肠病性肢端皮炎(acrodermatitis enteropathica,AE)患者及其家系的SLC39A4基因突变情况,为完善该病的发病机制和产前咨询提供生物学依据。方法收集AE患者及其家系成员的临床资料和外周血,采用PCR技术对SLC39A4基因编码区及其侧翼进行扩增,并进行DNA测序。结果该患者SLC39A4基因发现c.948delC的纯合核苷酸变异,该变异导致从第317号氨基酸Val开始的氨基酸合成发生改变,并在改变后的第32个氨基酸终止,为移码突变。该患者的父亲和母亲均发现c.948delC杂合突变,其弟弟及与该家系无血缘关系的100例正常对照均未发现此突变。结论 SLC39A4基因c.948delC纯合突变是导致该AE患者发病的机制。此突变之前未有报道,有助于了解AE基因型与表现型的关系。     

播散性浅表性光化性汗孔角化症SLC17A9基因突变分析

目的：检测11例山东汉族播散性浅表性光化性汗孔角化症SLC17A9基因突变位点。方法：提取患者外周血DNA,采用PCR扩增患者SLC17A9基因的全部外显子及其侧翼序列,对PCR扩增产物直接测序检测。结果：11例DSAP患者的SLC17A9基因编码区的所有外显子均未发现突变。结论：本研究中11例DSAP患者的发病与SLC17A9基因的编码区序列无关。     

寻常性银屑病患者白介素20基因多态性研究

目的:选取位于1q32区域的白介素(IL)-20基因,通过检测基因序列研究基因多态性与银屑病的相关性.方法:提取银屑病患者(203例)和正常人(91名)基因组DNA并进行扩增,通过自动测序的方法测定IL-20基因及启动子区域的序列,检测其单核苷酸多态性(SNP)位点,并以SPSS软件进行统计学处理.结果:①IL-20启动子SNP位点-1723 C>G多态性的G等位基因频率,在以上呼吸道感染为发病诱因或加重因素的寻常性银屑病患者组和正常对照组间的频率分别为45.8%和32.4%,两组间差异有统计学意义(X2=5.539,P=0.019).结论:位于IL-20基因启动子区的SNP位点-1723C>G可能与以上呼吸道感染为发病诱因或加重因素的寻常性银屑病相关.     

中国汉族人群染色体1q21存在寻常性银屑病易感基因

目的　确定中国汉族人群染色体1q21上是否存在寻常性银屑病易感基因。方法　用覆盖染色体1q21-1q23.1的8个微卫星标记,对36个寻常性银屑病家系共190个个体（包括92例患者,98例正常人;年龄12 ~ 81岁,平均44岁）进行基因组扫描研究,并用ETDT及GENEHUNTER软件进行连锁不平衡分析。结果　GENEHUNTER示D1S2345与银屑病连锁,其非参数连锁（NPL）值为1.735（P = 0.0329）;扩大范围传递不平衡检验（ETDT）示D1S2346的97 bp等位基因与D1S484的283 bp等位基因分别优先传递给患病子代（P < 0.05）。结论 中国汉族人群染色体1q21区存在寻常性银屑病易感基因。     

山东汉族寻常性银屑病患者eIF4E、MMP-9基因多态性研究

目的 探讨真核细胞翻译起始因子（eIF4E ）、基质金属蛋白酶-9（MMP-9）基因内的单核苷酸多态性与山东汉族寻常性银屑病的关系。方法 基于群体的病例对照关联分析方法,利用Taqman分型方法对188例银屑病患者及280例正常对照人群MMP-9基因内的2个位点以及eIF4E基因内的1个位点进行分析,对基因型频率及等位基因频率采用PLINK软件进行统计学分析。结果 位于MMP-9基因上游调控区域的 rs4810482等位基因T在银屑病组中的频率显著低于对照组（OR = 1.49,95% CI = 1.12 ~ 1.99,P < 0.01）,在隐性与显性遗传模型分析中,差异具有统计学意义。生物信息学分析表明,该位点可能改变了转录因子的结合位点。在研究中分析的其余两个位点rs3918254和rs11723037与银屑病无相关性。结论 位于MMP-9基因上游调控区域的rs4810482与银屑病具有显著相关性,可能是银屑病的一个易感基因。     

Association of psoriasis to PGLYRP and SPRR genes at PSORS4 locus on 1q shows heterogeneity between Finnish, Swedish and Irish families

Abstract:  A susceptibility locus for psoriasis, PSORS4, has been mapped to chromosome 1q21 in the region of the epidermal differentiation complex. The region has been refined to a 115 kb interval around the loricrin (LOR) gene. However, no evidence of association between polymorphisms in the LOR gene and psoriasis has been found. Therefore, we have analysed association to three candidate gene clusters of the region, the S100, small proline-rich protein (SPRR) and PGLYRP (peptidoglycan recognition protein) genes, which all contain functionally interesting psoriasis candidate genes. In previous studies, the SPRR and S100 genes have shown altered expression in psoriasis. Also polymorphisms in the PGLYRP genes have shown to be associated with psoriasis. We genotyped altogether 29 single nucleotide polymorphisms (SNPs) in 255 Finnish psoriasis families and analysed association with psoriasis using transmission disequilibrium test. A five-SNP haplotype of PGLYRP SNPs associated significantly with psoriasis. There was also suggestive evidence of association to SPRR gene locus in Finnish families. To confirm the putative associations, selected SNPs were genotyped also in a family collection of Swedish and Irish patients. The families supported association to the two gene regions, but there was also evidence of allelic heterogeneity.     

白介素12B基因rs6887695多态性与汉族人寻常性银屑病临床表型的相关性

目的 探讨白介素12B（IL-12B）基因多态性位点rs6887695与汉族人寻常性银屑病临床表型（发病年龄、家族史、临床类型、性别）的相关性。 方法　采用ABI Taqman探针荧光PCR技术,对575例寻常性银屑病患者和1403例健康对照的DNA样本进行IL-12B基因多态位点rs6887695的基因分型。使用SPSS14.0分析软件,χ2检验比较患者组和健康对照组间、不同临床表型组间的基因型和等位基因频率分布的差异性。 结果 IL-12B基因多态性位点rs6887695三种基因型（GG、GC、CC）频率在寻常性银屑病患者组分别为42.61%、45.39%和12.0%,健康对照组分别为34.42%、47.83%和17.75%;等位基因频率（G、C）患者组分别为65.30%和34.70%,健康对照组分别为58.34%和41.66%,基因型和等位基因频率分布在患者组和健康对照组间差异均有统计学意义（χ2值分别为16.31和16.54,P值均 < 0.01）,在慢性斑块状（543例）和急性滴状银屑病患者（32例）组间的差异均有统计学意义（χ2值分别为18.11和12.19,P值均 < 0.01）。等位基因G和基因型GG在患者组中的频率明显高于健康对照组,等位基因G和基因型GG在斑块状患者中的频率高于滴状患者。少儿发病组（35例）与成人发病组（540例）、家族史阳性组（102例）与家族史阴性组（440例）、男性患者组（341例）与女性患者组（234例）的基因型和等位基因频率分布差异均无统计学意义（P值均 > 0.05）。 结论 IL-12B（rs6887695）基因多态性与汉族人寻常性银屑病易感性相关联,特别是与斑块状银屑病相关,但与患者的发病年龄、家族史及性别可能无关联。     

Psoriasis vulgaris in Chinese individuals is associated with PSORS1C3 and CDSN genes

BACKGROUND: Besides the HLA-Cw*0602 allele, the psoriasis susceptibility 1 candidate 3 (PSORS1C3) and corneodesmosin (CDSN) genes are two probable psoriasis susceptibility genes in the PSORS1 locus. The -79C, -26C and +246A alleles of the PSORS1C3 gene, the CDSN*971T allele, CDSN*TTC (619T-1236T-1243C) and CDSN*5 (619T-1240G-1243C) are strongly associated with psoriasis in the caucasian population. Until now, no haplotype study of the PSORS1C3 and CDSN genes has been documented in Chinese patients with psoriasis vulgaris. OBJECTIVES: We aimed to determine whether genetic polymorphisms of the PSORS1C3 and CDSN genes were associated with an increased risk of psoriasis vulgaris in Chinese patients in Taiwan. METHODS: We investigated the PSORS1C3 and CDSN genes for disease association by direct sequencing in 178 patients with psoriasis vulgaris and 203 control subjects. Genotyping for HLA-Cw*0602, alpha-helix coiled-coil rod homologue (HCR) gene and single nucleotide polymorphism (SNP) n.9 was also carried out using a sequence-based typing method. RESULTS: The PSORS1C3*582A allele, an SNP in the 3'-untranslated region of the PSORS1C3 gene, was a major psoriasis vulgaris susceptibility allele in the Chinese population, and the association was much stronger in patients with early-onset psoriasis vulgaris (22.3% vs. 6.9%, odds ratio = 3.87, P(c) =0.0000072). The frequencies of CDSN*TTC and CDSN*971T were also significantly increased in patients with early-onset psoriasis vulgaris. Moreover, PSORS1C3*582A, SNP n.9*C, Cw*0602 and HCR*WWCC were in near complete linkage disequilibrium (LD) with each other; in contrast, the LD with the CDSN gene was not so strong. SNP n.9*C-Cw*0602-PSORS1C3*582A-HCR*WWCC was a major susceptibility haplotype in patients with early-onset psoriasis vulgaris (P < 10(-7)) and this risk haplotype also carried CDSN*TTC and CDSN*971T. CONCLUSIONS: The PSORS1C3 and CDSN genes are important psoriasis susceptibility genes in Chinese patients with psoriasis vulgaris.     

寻常性银屑病患者HAX-1基因多态性的研究

目的通过检测HAX-1基因序列研究基因多态性与银屑病的相关性。方法提取银屑病患者(247例)和正常人(102例)基因组DNA并进行扩增,通过自动测序的方法测定HAX-1基因及启动子区域的序列,检测其SNP位点,并以SPSS软件进行统计处理。结果①测序结果:测序总长度5313bp,发现1个位于5’UTR的高频SNP。②病例-对照关联分析结果:5’UTR区的SNP位点-104T>G多态性的T等位基因频率在寻常性银屑病患者组和正常对照组间的频率分别为53.4%和48.5%,在两组间无显著性差异(P>0.05)。结论银屑病患者与正常人HAX-1基因5’UTR区的SNP位点-104T>G基因频率无显著差异。     

AP1S3基因突变与泛发性脓疱型银屑病的相关性研究

目的：检测107例中国汉族泛发性脓疱型银屑病患者衔接蛋白复合体1-σ1亚单位异构体基因（AP1S3）的突变。方法：提取全部107例GPP患者外周血DNA,采用聚合酶链反应（PCR）技术扩增AP1S3基因全部外显子,并进行测序。结果：107例GPP患者均未发现AP1S3基因突变以及单核苷酸多态性（SNP）位点。结论：本组GPP患者发病与AP1S3基因可能无关。