单细胞转录组测序技术在非小细胞肺癌免疫微环境分析中应用的研究进展

非小细胞肺癌（non-small cell lung cancer,NSCLC）是最常见的癌症类型之一,也是导致癌症死亡的重要原因。虽然近年来免疫治疗的应用极大改善了NSCLC的预后,但NSCLC的治疗依然存在巨大挑战。免疫微环境在NSCLC发展、浸润和转移过程中发挥重要作用,二者可相互作用、相互影响,形成恶性循环。单细胞转录组测序可以对单个细胞进行高分辨率分析,在揭示免疫微环境中的细胞类型、细胞演变轨迹、细胞分化的分子机制以及细胞间相互调节中有重要价值。通过单细胞转录组测序有望发现更多有潜力的免疫治疗方法。本文综述了单细胞转录组测序在NSCLC免疫微环境中的重要研究及最新成果,旨在探讨应用单细胞转录组测序分析NSCLC免疫微环境的重要意义。     

单细胞测序和空间转录组技术在肝病研究中的应用进展

新兴的单细胞测序技术联合空间转录组技术,可以从细胞层面分析细胞的基因组、转录组和空间信息,这有助于人们探究细胞的基因表达水平和三维重建,了解细胞间的联系,进而促进探讨疾病的发生和发展机制。近年来,单细胞测序和空间转录组技术的联合运用已促进细胞和多种疾病研究,其在肝脏生理和疾病方面已取得部分成果。本文综述了单细胞测序和空...     

单细胞测序技术在膀胱癌研究中的应用

单细胞测序技术是在单细胞水平上, 对基因组、转录组、表观组进行高通量测序分析的一项新技术。目前, 单细胞测序技术已广泛应用于膀胱癌的研究, 通过识别不同的细胞亚群、免疫微环境, 开辟了解膀胱细微肿瘤生物学的新途径, 并且单细胞测序技术有望通过识别和使用新的生物标志物和靶向治疗, 对膀胱癌的诊断和治疗做出重要改变。本文总结单细胞测序技术在膀胱癌的异质性细胞亚群、发生发展规律、免疫微环境和耐药性等方面中最新的研究应用进展。     

单细胞测序技术在骨关节疾病方面的应用

在关节疾病的发病机制的研究上,目前最常针对的对象还是骨、软骨及滑膜组织,以及从这些组织的整个病理改变的方向去探索可能的发病过程及发病机制,所以存在很多局限性和不准确性,比如忽略了疾病组织内部的单个细胞的异质性在疾病当中所发挥的作用。单细胞测序技术(single-cell sequencing)是在单个细胞水平上对基因组、转录组及表观基因组进行测序的技术,能够从组织样本中获得不同细胞间的异质性信息和对珍贵微量样本进行测序,从而更深层次地反映生命规律与本质,本文就单细胞测序技术的基本方法及在关节疾病方面的应用进行概述。     

单细胞测序技术在膀胱癌研究中的应用进展

膀胱癌是泌尿系统最常见的恶性肿瘤之一, 其复杂的肿瘤微环境和极高的肿瘤内异质性, 导致膀胱癌早期诊断困难及治疗效果欠佳。新兴的单细胞测序技术是一项对单细胞进行基因组、转录组、代谢组及表观遗传学测序, 进而识别细胞间精细差异的强大技术, 对于揭示肿瘤内异质性及探讨肿瘤微环境中细胞间的复杂关系具有独特优势。本文中, 我们总结了单细胞测序技术在膀胱癌肿瘤内异质性、肿瘤微环境、治疗耐药性及治疗靶点等方面的研究, 以期为膀胱癌的诊疗及研究提供新的思路。     

单细胞测序技术及其在结直肠癌中的研究进展

结肠直肠癌(CRC)是全球第三常见及第二位肿瘤致死癌症疾病, 由于基因突变的发生及肿瘤转移等事件造成CRC的预后不良。单细胞测序技术可以在单细胞水平上进行基因组、转录组、表观遗传学的高通量测序分析, 在肿瘤免疫微环境分析、肿瘤异质性检测、肿瘤转移机制探究及循环肿瘤细胞(CTCs)监测等有着特殊的技术优势。本文简要介绍了单细胞测序的技术流程及数据处理并回顾目前单细胞测序在CRC应用进展, 从而为了解CRC发生及肿瘤进展过程中的肿瘤内异质性、深入理解CTCs的应用与寻找新的药物作用靶点提供参考。     

单细胞测序技术在胰腺癌领域应用现状和展望

胰腺癌是预后极差的恶性肿瘤,其特征是癌细胞与肿瘤微环境中存在复杂的相互作用网络和极高的异质性,导致缺乏早期诊断和有效治疗的策略.新兴的单细胞测序技术从单细胞层面进行基因组、转录组或表观遗传学分析,揭示疾病内在的分子机制,相比于传统的研究方法,更有助于阐明肿瘤内异质性问题.目前,单细胞测序技术已广泛应用于胰腺癌领域的研究...     

单细胞转录组测序技术在颈动脉斑块稳定性研究中的应用现状与新方向

颈动脉斑块形成是脑卒中发生的重要危险因素。对颈动脉斑块的干预是预防卒中的关键, 但目前尚缺乏对其稳定性改变机制的明确阐述。单细胞转录组测序能够有效地检测整个组织中每一个细胞的基因序列, 从而充分分析细胞亚型的表达差异。本文对单细胞转录组测序技术在颈动脉斑块稳定性的研究中的应用现状进行综述并进一步分析其研究前景。     

单细胞RNA测序在肾脏领域的研究进展

肾脏是结构和功能高度复杂的器官,由多种细胞类型组成,明确各种类型及其亚型细胞在生理和病理状态下基因转录图谱及其变化对阐明肾脏结构、功能以及疾病的发病机制极为重要。单细胞RNA测序(single-cell RNA sequencing,scRNA-seq)的发展引起转录组学研究模式的转变,从对大量组织基因转录的平均水平的分析转向对特定器官(或组织)中单细胞基因转录的细胞水平的研究。本文在阐述scRNA-seq技术及其揭示的新发现的肾脏细胞亚型和功能的基础上,重点对常见的多种肾脏疾病肾组织中免疫细胞scRNA-seq的研究进展进行综述。     

lncRNAs靶向miR-34a在骨关节炎软骨破坏中的研究进展

骨关节炎病程中软骨细胞凋亡及细胞外基质降解引起关节软骨稳态失衡而形成的关节软骨破坏,是造成骨关节炎患者功能丧失甚至残疾的主要原因,但关节软骨破坏的具体分子机制尚未阐明。随着高通量测序技术的普及与完善,有研究者发现miR-34a在骨关节炎软骨破坏病程中发挥重要作用,其能够通过调控SIRT1/P53信号通路、PI3K/AKT信号通路、JNK信号通路等加快骨关节炎软骨破坏进程。近年来,lncRNAs与miR-34a相互作用的分子机制成为骨关节炎研究领域的热点之一,但在骨关节炎患者的基因表达谱中存在多种lncRNAs表达,不同lncRNAs与miR-34a在骨关节炎中的相互关系有待深入研究。探讨lncRNAs靶向miR-34a调控骨关节炎软骨破坏的相关分子机制,为进一步探索lncRNAs和miR-34a在骨关节炎治疗及诊断中的意义提供理论依据。     

MicroRNA基因调控在膝骨关节炎发生发展作用中的研究进展

MicroRNA(miRMA)是一种从哺乳动物细胞内发现的非编码小分子RNA,在基因的表达调控中起到了非常重要的作用,特别是转录后调节机制方面。近年来,miRNA在疾病发生发展过程中的作用已经成为研究热点。膝骨关节炎是一种常见的老年性疾病,其病因及发病机制至今尚未完全明确,目前细胞因子通过调节炎症反应,成骨破骨细胞增值、凋零、分化在膝骨关节炎发病机制中的作用越来越受到关注。而最新的研究表明,炎性介质、成骨破骨细胞增殖分化及各种细胞因子的转录表达都与miRNA有着密切的关联,这提示miRNA在膝骨关节炎的发生发展中起重要作用。由此可以想到,通过改变相关miRNA的表达可能会从更高的调节水平改变膝骨关节炎的表达,从而起到了治疗的目的。本文正是基于MicroRNA基因调控,探讨膝骨关节炎的发病机制,为临床提供更多的治疗思路。     

高通量转录组测序在人类配子发生及植入前胚胎发育研究中的应用进展

辅助生殖技术的成熟运用为不孕不育患者带来了福音。配子发生和胚胎早期发育是辅助生殖的核心,对配子及胚胎研究的生物手段层出不穷,其中,高通量转录组测序技术为解决这种问题提供了新的思路。转录组研究可以帮助我们研究基因的表达及调控方式,也可以帮助我们发掘相关功能基因。在此基础上,可以分析这些差异基因的功能、信号通路和调控网络,为解析不孕不育病理机制提供理论基础。因此,本文综述了高通量转录组测序在卵母细胞成熟、精子发生以及植入前胚胎发育方面的相关研究进展,探讨了该技术在辅助生殖方向的应用价值,以期对临床提供分子层面的线索。     

LC-MS联合单细胞测序分析探讨参苓白术散治疗原发性骨质疏松症的作用机制

目的 利用液质联用技术（LC-MS）以及单细胞转录组分析，研究参苓白术散作用于原发性骨质疏松症（primary osteoporosis，POP）的潜在分子机制。方法 采用LC-MS鉴定参苓白术散的化学成分，并预测其作用靶点。同时，获取POP相关的转录谱以及单细胞测序数据，分析其差异表达基因（differentially expressed genes，DEGs）和细胞亚群，进一步对DEGs进行加权基因共表达网络分析（WGCNA），得到POP的枢纽基因，并构建参苓白术散-POP核心靶点网络。最后，对化学成分及其核心靶点进行虚拟分子对接验证。结果 LC-MS鉴定筛选后共得到10个化学成分，并得到414个潜在作用靶点。差异化及WGCNA分析分别得到843个POP-DEGs和1 976个枢纽靶点，联合分析后得到19个核心靶点。此外，POP骨髓血样本中存在巨噬细胞、单核细胞、T细胞、B细胞等免疫细胞。富集结果表明核心靶点涉及细胞衰老、破骨细胞分化、MAPK信号通路等。最后，虚拟分子对接结果显示鉴定成分与POP核心靶点能形成稳定对接。结论 参苓白术散能通过多成分、多靶点、多细胞及多通路调控细胞衰老、免疫功能及破骨分化等作用治疗POP。     

高通量转录组测序初步研究结肠直肠癌新辅助治疗敏感性

目的 采用高通量转录组测序技术,通过生物信息学手段,初步筛选并鉴定结肠直肠癌病人术前新辅助治疗效果相关基因,并进行差异表达分析,为进一步阐明结肠直肠癌新辅助治疗敏感性的分子机制提供基础。方法 22例接受标准术前新辅助治疗的结肠直肠癌病人,根据肿瘤消退评级分为敏感组9例,不敏感组13例。提取肿瘤组织RNA,构建转录组文库,采用高通量测序平台进行测序。结合生物信息学等相关手段,筛除错误发生率（<0.05）的基因后对比组装,对得到的转录组样本进行分类和注释。对差异表达基因特征进行分析。结果 初步建立结肠直肠癌新辅助治疗敏感性基因数据库。从22例转录组标本中,发现89个基因表达出现显著上调,112个基因出现显著下调。结论 高通量测序分析提示,这些基因表达变化可能与结肠直肠癌新辅助治疗敏感性密切相关。     

单细胞转录组测序在肿瘤浸润免疫细胞中的研究进展

免疫细胞与肿瘤进展及治疗密切相关。单细胞转录组测序(single-cell RNA sequencing, scRNA-seq)已广泛应用于解析肿瘤浸润免疫细胞的生物学行为、机制及其与机体的关系。scRNA-seq能全面剖析肿瘤浸润免疫细胞并促进临床个体化精准治疗。     

褪黑激素治疗骨关节炎的作用研究探析

骨关节炎是一种常见的退行性全关节疾病,其发病机制为软骨细胞密度降低、细胞外基质合成与分解代谢失衡、异常炎症信号转导和过度氧化应激反应。褪黑激素及其衍生物是一种高效的自由基解毒剂和广谱抗氧化剂,具有抗氧化、抗炎症反应和抗衰老作用,通过调节多种分子信号,能够针对骨关节炎的发病机制发挥保护作用。总结褪黑激素介导其作用对骨关节炎发病机制的影响,旨在为褪黑激素临床治疗骨关节炎提供支持。     

miRNA与骨关节炎软骨基质降解的研究进展

目的针对mi RNA与骨关节炎(osteoarthritis,OA)软骨基质降解的研究进展进行综述。方法查阅国内外有关mi RNA与OA软骨基质降解的文献,对其进行总结分析。结果 OA是一类常见的以软骨退行性病变为主要特征的慢性关节性疾病,其病因和发病机制尚不明确。mi RNA是一种非蛋白编码小分子RNA,与OA软骨基质降解过程中的炎性介质及各种细胞因子密切相关,在细胞和分子水平调控软骨细胞基因表达中发挥重要作用。结论 miRNA可作为潜在分子靶标,为OA临床诊断和治疗提供新的方向。     

PI3K/AKT/mTOR信号通路在骨关节炎中的研究进展

骨关节炎是临床常见退行性关节疾病,是世界范围内疼痛和残疾的重要原因之一,发病机制复杂,目前尚无根治药物,深入研究骨关节炎的发病机制显得尤为重要。已有研究证实,PI3K/AKT/mTOR信号通路在细胞内广泛存在,参与细胞增殖、存活、侵袭、迁移、凋亡、代谢,及DNA修复,在骨关节炎的病理过程中发挥重要作用。近年来,miRNA被证明参与骨关节炎软骨细胞的合成和分解代谢平衡。就PI3K/AKT/mTOR信号通路对骨关节炎的关节软骨、软骨下骨、滑膜等影响的分子机制及该通路与miRNA相关的研究进展进行综述,以期为今后骨关节炎的治疗提供新的思路和研究方向。     

骨关节炎中软骨细胞铁死亡的研究进展

细胞铁死亡以细胞铁代谢异常和细胞膜脂质过氧化为主要特征,细胞铁死亡在骨关节炎软骨退变中发挥重要作用,这一观点已在骨关节炎患者及骨关节炎动物模型中得到证实。对细胞铁死亡发生机制的研究发现,谷胱甘肽过氧化酶4在发挥核心调节作用的同时也被其他众多分子调控,此外,铁死亡抑制蛋白1可能存在与谷胱甘肽过氧化酶4相互平行且同等重要的调节作用。骨关节炎软骨细胞铁死亡的具体机制仍待进一步研究,其在疾病预防和治疗方面具有较大潜力。     

独活寄生汤通过miRNAs调控炎症性骨关节炎软骨细胞功能改变的机制探讨

软骨细胞功能改变在骨关节炎病理过程中发挥重要的调控作用。炎症因子是介导骨关节炎软骨退变的主要因素,其表达与Micro RNAs(mi RNAs)密切相关。mi RNAs是一类在转录后水平调控基因表达的非编码蛋白的RNA分子,参与了软骨细胞增殖、分化,以及合成与分解代谢等生物学过程。中医药治疗骨关节炎独具特色,能够靶向调节mi RNAs介导的炎症反应,独活寄生汤长期运用于临床,能有效抑制关节炎症,其药效机制可能是通过调节骨关节炎软骨细胞中mi RNAs的表达,以及改变mi RNAs和炎症因子之间的相互协调作用而发挥对炎症性骨关节炎的治疗作用。多层次、多角度地探讨独活寄生汤的作用机制及药效物质基础,可为阐明独活寄生汤治疗炎症性骨关节炎提供新的研究思路。