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目的 构建基于肿瘤基因组图谱(TCGA)数据库胶质母细胞瘤(GBM)患者预后铁死亡基因相关lncRNA预测模型。方法 通过TCGA数据库获取GBM的高通量测序数据,通过文献检索和搜查FerrDb数据库两种方式获取铁死亡基因,并基于GBM中铁死亡相关差异表达的lncRNA构建GBM预后的多lncRNA模型,分析预后lncRNA与铁死亡基因的共表达关系。结果 共获得与GBM相关的铁死亡基因246个,铁死亡相关lncRNA 2 624个,经差异分析和降维处理,最终得到102个与GBM显著相关的铁死亡基因,并构建了一个包含111个lncRNA的GBM预后模型,其中,69个差异有统计学意义的铁死亡基因与73个GBM预后相关的铁死亡lncRNA之间存在共表达关系。Kaplan-Meier生存曲线显示,在预后模型下,高危者和低危者的总生存率差异有统计学意义(P<0.01)。结论 基于TCGA数据库成功构建GBM患者预后铁死亡基因相关lncRNA预测模型,该模型可在一定程度上预测GBM患者的生存率。 相似文献
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铁死亡是一种铁依赖性的脂质过氧化介导的细胞死亡方式,主要特点是细胞内铁和脂质过氧化物的过度积累。铁死亡在肿瘤生长抑制及肿瘤免疫微环境中发挥重要作用。研究发现,铁死亡与膀胱癌的发生发展有关。增加细胞内铁离子、抑制SLC7A11表达、激活p53等可诱导膀胱癌细胞铁死亡,非编码RNA对铁死亡也有一定调控作用。靶向某些铁死亡相关基因或应用某些化合物,能诱导铁死亡,减轻膀胱癌对化疗药物的耐药。深入研究铁死亡作用机制及相关作用靶点,有望开发新的膀胱癌靶向治疗方法,提高治疗效果,改善患者预后。 相似文献
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铁死亡是由Dixon于2012年发现的一种新型的细胞死亡形式,其有异于目前发现的其他细胞死亡方式,并犹如一把双刃剑在不同疾病层面发挥着不同的生物学效应。越来越多研究表明,铁死亡发生在各类急慢性肝病的发病、转归、预后等各个方面,所以了解铁死亡有利于明晰更多肝脏疾病的发病机制,而靶向调控铁死亡将有望成为治疗各类肝脏疾病的奠基石。我们通过查阅中外文献数据库,概述铁死亡独特的细胞死亡机制及其相关影响信号和通路,并介绍在各类急慢性肝病中铁死亡可能性的切入机制和靶点,为铁死亡在肝脏疾病中的应用和研究提供科学依据。 相似文献
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目的 通过对TCGA测序数据库的挖掘,筛选肝细胞癌(hepatocellular carainoma, HCC)预后相关铁死亡基因并构建Signature预后风险评估模型。方法 从TCGA数据库获取HCC测序数据,采用R语言进行铁死亡相关基因表达差异性分析,采用Log Rank检验和单变量Cox比例风险回归进行K-M生存分析。基于time ROC分析及LASSO Cox回归,构建Signature预后模型。利用时间依赖ROC曲线与AUC对预后风险模型的预测能力进行评估。结果 初步筛选得到21个差异表达的铁死亡相关基因,经单变量Cox比例风险回归和K-M生存分析,进一步筛选得到7个预后相关的铁死亡相关基因。基于上述预后相关铁死亡差异性基因集进行Signature预后模型的构建,lambda.min=0.0317,Risk score=0.118×FANCD2+0.1514×SLC1A5+0.1632×SLC7A11。利用时间依赖ROC曲线与AUC对预后风险模型的预测能力进行评估,结果显示,1年预测效能AUC=0.773,3年AUC=0.667,5年AUC=0.658。结论 通过对TCGA... 相似文献
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铁死亡是一种新发现的铁依赖的调节性细胞死亡形式,其发生的核心在于脂质活性氧(L-ROS)的过量累积,而这一过程受多条分子通路的影响.既往结直肠疾病的相关研究发现,铁死亡通路被激活是非肿瘤性疾病中细胞死亡的重要机制,同时也能抑制结直肠肿瘤的发生与发展.靶向铁死亡治疗方式与传统治疗方式联合应用有望成为结直肠疾病治疗新方向. 相似文献
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铁死亡是一种以细胞内铁过载及脂质代谢异常为特征的程序性细胞死亡方式。关于铁死亡,除了铁代谢、脂质代谢、氧化-抗氧化失调等经典机制外,近年来研究发现,铁蛋白自噬、脂肪自噬、线粒体代谢障碍、核因子E2相关因子2(Nrf2)基因调控、内体分拣转运复合体Ⅲ(ESCRT-Ⅲ)介导的膜修复机制等也参与调控铁死亡;同时,铁死亡参与多种心血管疾病的发生。本文综述了铁死亡相关机制研究进展,分析了其与心肌缺血再灌注损伤、阿霉素的心肌毒性、心力衰竭、动脉粥样硬化和主动脉瓣膜钙化等心血管疾病的关系,并对其靶向治疗相关研究进行总结分析,指出铁死亡有望成为心血管疾病的重要干预靶点,可为心血管疾病的相关药物研究提供参考。 相似文献
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综述缺血性中风铁死亡的发生机制及中医药干预的研究进展,为缺血性中风的预防和治疗提供新的理论依据及策略。铁死亡是近年来研究发现的一种全新的细胞程序性死亡方式,是一种因铁依赖性的脂质过氧化物积累引起细胞死亡的调节形式。近年来,对铁死亡这一以铁依赖性脂质过氧化积累为特征的调节性细胞死亡与中风关系的研究越来越多,铁死亡的发生导致机体正常的组织器官损伤或功能丧失,这一过程直接参与疾病的发生、发展与转归。因此,针对缺血性中风,抑制铁死亡的发生可以有效地预防及延缓缺血导致的脑组织损伤。一些中药提取物及中药复方均可抑制铁死亡,起到神经保护作用。 相似文献
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目的 探讨构建基于铁死亡相关长链非编码RNA(lncRNA)的预后风险模型预测肝细胞癌(HCC)患者预后的价值。方法 自癌症基因组图谱TCGA数据库下载HCC患者RNA测序数据。基于HCC差异水平的铁死亡相关lncRNAs构建预后风险模型。结果 鉴定了5个基于HCC差异水平的铁死亡相关lncRNAs;Kaplan-Meier分析显示,高风险lncRNAs与HCC预后不良相关,预测3 a生存率的ROC曲线下面积(AUC)为0.873;单样本基因集富集分析(ssGSEA)发现低风险组与高风险组细胞溶解活性、MHCI类分子、I型INF反应、II型INF反应存在显著性差异(P<0.05);免疫检查点显示,两组CD44、TNFRSF4和CD276等水平也存在显著性差异(P<0.05)。结论 通过生物信息学方法筛选出5个基于HCC差异水平的铁死亡相关lncRNAs构建的预后风险模型为HCC防治研究奠定了一定的基础。 相似文献
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铜作为一种微量元素,在细胞代谢和生物过程中均扮演着重要的角色。正常情况下,细胞中铜的浓度较低,而铜的过度积累会导致细胞死亡。铜死亡是近期发现的一种新型调节性细胞死亡,这种死亡不同于细胞凋亡、铁死亡及坏死等氧化应激诱导的细胞死亡,是一种与线粒体呼吸相关的铜依赖性细胞死亡模式。铜通过与三羧酸循环中的脂质酰化成分直接结合,导致脂质化蛋白质聚集,铁硫簇蛋白质丢失,从而引起蛋白质毒性应激,导致细胞死亡。充足的铜是维持心脏正常生理功能所必需的,机体内铜水平异常可能会引发一系列心血管疾病。目前,铜诱导的细胞死亡在动脉粥样硬化、糖尿病心肌病及心力衰竭等心血管疾病的发病机制中可见报道。然而,铜死亡在心血管疾病中的研究还处于初步阶段,进一步研究铜调控的细胞死亡通路在心血管疾病发生发展中的作用机制,可为心血管疾病的预防和治疗提供新的思路。 相似文献
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目的 探讨非远处转移性胃癌预后相关的miRNA,并寻找其靶基因mRNA.方法 通过TCGA数据库下载胃癌患者的临床信息和miRNA表达信息,筛选出影响患者术后总体生存率的miRNA,然后使用多因素Cox回归分析方法筛选出独立预后的miRNA.利用miRNA数据库查找独立预后miRNA的靶基因mRNA,并构建miRNA-... 相似文献
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铁死亡被定义为一种由脂质过氧化驱动的铁依赖性细胞死亡的调节形式,并与神经退行性疾病、肿瘤、心血管等疾病密切相关。近年来发现铁死亡在动脉粥样硬化疾病过程中发挥重要作用,本文综述了铁死亡与动脉粥样硬化中血管内皮功能障碍、巨噬细胞极化、泡沫细胞形成及血管平滑肌细胞增殖迁移等多个病理过程之间的作用及分子机制,并总结了可能对动脉粥样硬化有治疗作用的铁死亡抑制剂及相关靶点,旨在从铁死亡角度为动脉粥样硬化的防治提供新的研究策略。 相似文献
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