基于16S rDNA测序技术研究痰湿质受试者肠道菌群的组成及丰度

目的探讨痰湿质体质人群肠道菌群的丰度及物种组成差异。方法收集痰湿质及平和质受试者各30例粪便样本,提取两组样本中细菌总DNA进行检测定量,构建Miseq文库并测序,Miseq测序得到的PE读长根据重叠区关系进行拼接,再根据不同的相似度水平,对所有序列进行分类单元(OTU)聚类分析,并分别在各个分类水平上统计各样本的群落组成。利用16S rDNA测序技术分析痰湿质及平和质肠道菌群结构的组成及丰度变化。结果在分类单元(OTU)水平上,偏最小二乘法-判别分析(PLS-DA)显示痰湿质与平和质在肠道菌群组成上具有明显差异;在门水平上,痰湿质肠道菌群中拟杆菌门/厚壁菌门的比值低于平和质;在属水平上,痰湿质相对丰度下降的菌属主要为拟杆菌属、罗氏菌属(P 0. 01)、粪栖杆菌属、巨单胞菌,痰湿质相对丰度上升的菌属主要为戴阿利斯特菌属、Lachnoclostridium、直肠真杆菌属、Dorea。结论痰湿质与平和质体质受试者的肠道菌群在丰度及物种组成方面均有差异,其中拟杆菌门/厚壁菌门的比值降低以及罗氏菌属相对丰度的下降是痰湿质肠道菌群的特征。     

基于16S rDNA基因测序技术分析不同身体质量指数人群的肠道菌群结构差异

目的:探究不同身体质量指数(BMI)人群肠道菌群的丰度及物种差异性。方法:将115例受试人群按BMI分为正常组、超重组和肥胖组,收集受试者粪便,运用16S rDNA基因测序技术结合生物信息分析,比较不同BMI受试者肠道菌群组成和丰度差异。结果:Alpha多样性分析可见超重组和肥胖组群落丰度和多样性较正常组低;不同分组的肠道菌群组成在OTU水平有明显差异;厚壁菌门、拟杆菌门、放线菌门、变形菌门是3组肠道菌群共有的优势菌门;埃希氏菌-志贺氏菌属和瘤胃球菌属为多组比较显著差异的菌属(P<0.05)。肥胖组和正常组相比,拟杆菌属、Lachnoclostridium菌属、柯林斯氏菌属差异有统计学意义(P<0.05,P<0.01)。结论:不同BMI人群肠道菌群结构组成有差异,肥胖和超重人群肠道菌群多样性明显降低。拟杆菌属、Lachnoclostridium菌属和柯林斯氏菌属等菌属丰度变化明显,提示其可能参与人体脂肪的积累过程。调节肠道菌群的多样性和丰度可能是预防和治疗肠道微生态相关疾病的有效途径之一。     

基于16S rDNA测序技术的自发性高血压大鼠肠道菌群结构变化及中药干预作用

目的分析自发性高血压大鼠(SHR)肠道菌群结构特征,初步探讨中药黄连解毒汤(HLJDD)干预作用影响。方法 12周龄雄性SHR随机分模型组(M组)、HLJDD组(H组),同周龄雄性Wistar大鼠为正常对照组(W组),每组各4只。空白对照组及模型组常规饲养,HLJDD组按0.027 g/(kg·d)灌胃给药,每天给药1次,连续给药6周。干预结束后,取出盲肠内容物(新鲜粪便),采用16S rDNA高通量测序并进行生物信息学分析。结果 3组大鼠肠道微生物测序覆盖度在0.997以上,从属水平分析3组大鼠物种丰度聚类分布于4个优势的细菌门:27个属于厚壁菌门类(Firmicutes)、4个属于拟杆菌门类(Bacteroidetes)、3个属于变形菌门类(Proteobacteria)和1个属于疣微菌门类(Verrucomicrobia)门类细菌;Simpson指数表明,模型组大鼠肠道菌群多样性降低,HLJDD组大鼠肠道菌群多样性高于模型组;3组大鼠肠道菌群微生物群落结构在门水平上主要由厚壁菌门(Firmicutes)、拟杆菌门(Bacteroidetes)和变形菌门(Proteobacteria)组成,其中模型组厚壁菌门(Firmicutes)相对丰度增加,HLJDD组大鼠肠道菌群厚壁菌门(Firmicutes)的相对丰度低于模型组;3组大鼠肠道菌群微生物群落结构在属水平上主要由乳酸杆菌属(Lactobacillus)、肠球菌属(Enterococcus)、大肠志贺氏杆菌属(Escherichia Shigella)组成,其中益生菌乳酸杆菌属(Lactobacillus)相对丰度在模型组明显降低,HLJDD组大鼠肠道菌群乳酸杆菌属相对丰度高于模型组。结论 SHR肠道菌群结构失于平衡状态,菌群多样性有一定程度下降,HLJDD可能通过增加SHR菌群多样性、降低SHR致病菌厚壁菌门(Firmicutes)的相对丰度、升高SHR益生菌乳酸杆菌属相对丰度达到对抗高血压的作用,尚需扩大样本量进一步进行验证。     

内镜联合康复新液治疗对肝硬化食管胃底静脉曲张患者口腔和肠道菌群的影响

目的 探讨内镜联合康复新液治疗对肝硬化食管胃底静脉曲张患者口腔和肠道菌群的影响。方法 收集2021年6月—2022年9月在河北工程大学附属医院和邯郸市传染病医院治疗的17例肝硬化食管胃底静脉曲张患者内镜联合康复新液治疗前、治疗3 d后、治疗7 d后的唾液和粪便样本,提取样本的细菌DNA进行16S rDNA文库制备,结果进行OTU聚类、物种分析、差异性分析和多样性分析。结果 3个时间点口腔和肠道菌群具有137个相同的OTU,且每类标本都具有不同的OTU,治疗前后菌群的Alpha多样性指数具有上升的趋势,3个时间点粪便样本被聚类为三类肠型,每个时间点聚集的肠型可能与不同时期肠道的功能有关。口腔和肠道菌群门水平主要包括拟杆菌门、厚壁菌门和变形菌门,属水平口腔优势菌属为普氏菌属、韦荣球菌属等,肠道菌群丰度依次是拟杆菌属、粪杆菌属、埃希杆菌属等。口腔菌群中颗粒链菌属、巨球形菌属在内镜联合康复新治疗后丰度处于下降趋势,肠道菌群中的普氏菌属在内镜联合康复新液治疗前后丰度具有差异且治疗后巨球形菌属下降而布劳特菌属上升。结论 肝硬化食管胃底静脉曲张患者经内镜联合康复新液治疗后口腔和肠道菌群中的致病菌丰度...     

30例湿热蕴结型结肠癌患者的肠道菌群结构变化研究

目的探讨湿热蕴结型结肠癌患者与健康人群的肠道菌群的差异。方法30例湿热蕴结型结肠癌患者的粪便样本做为观察组,收集13名健康人体检粪便样本为对照组,分别提取两组样本中细菌总DNA,采用16S rDNA测序技术对各组的粪便样本进行分析。结果与对照组比较,观察组肠道菌群中拟杆菌门、放线菌门、变形杆菌门、拟杆菌属、大肠杆菌/志贺氏菌属丰度明显增加(P<0.01)。Ⅱ期患者的双歧杆菌属、柯林斯菌属明显高于Ⅲ期患者(P<0.05)。结论湿热蕴结型结肠癌与肠道菌群结构紊乱相关,关联度较高的为条件致病菌大肠杆菌相对丰度的升高,益生菌双歧杆菌相对丰度的减少。     

内生湿热证人群的肠道菌群特点研究

目的探讨内生湿热证人群与健康人群的肠道菌群差异性。方法选取2019年4—9月于江苏省第二中医院门诊就诊及住院的24例内生湿热证患者作为湿热组,选取同期8~14岁健康男童20例作为对照组,取2组粪便样本,通过Illumina MiSeq平台对肠道菌群进行16S rDNA基因V3~V4可变区检测,运用QIIME、STAMP及LEfSe进行Alpha、Beta多样性分析,鉴定差异性菌属。结果湿热组的Shannon指数、Evenness指数均明显低于对照组(P均<0.05)。主坐标分析显示2组样本菌群结构分布差异有统计学意义(P<0.05)。门分类水平上,湿热组拟杆菌门与厚壁菌门的相对丰度比值呈下降趋势,疣微菌门的相对丰度比值明显低于对照组(P均<0.05);属分类水平上,湿热组布劳特氏菌属、迟缓埃格特菌的相对丰度均明显高于对照组(P均<0.05);瘤胃球菌属、双歧杆菌属、Alistipes、颤螺菌属、Odoribacter、Anaerostipes、无色杆菌属的相对丰度均明显低于对照组(P均<0.05)。结论内生湿热证患者存在肠道菌群紊乱,其发病主要与拟杆菌门与厚壁菌门的相对丰度比值下调,迟缓埃格特菌属丰度上升,瘤胃球菌属、双歧杆菌属、颤螺菌属丰度下降相关。     

16S rRNA基因测序技术分析肝阳上亢型脑出血患者的肠道菌群结构

目的:探讨肝阳上亢型急性脑出血患者与健康人群的肠道菌群差异。方法:选取2018年于广州中医药大学第一附属医院颅脑科病房收治的9例肝阳上亢型急性脑出血患者的粪便样本为观察组,同时,选取体检的6例健康人粪便样本为对照组,提取两组样本中细菌总DNA,根据16S rRNA V4区设计引物进行扩增,通过Illumina MiSeq平台进行双端测序(paired-end),通过生物信息分析软件对测序结果进行分析,比较两组样本菌群组成和结构。结果:操作分类单元(OTU)的韦恩图分析(Venn分析)显示观察组与对照组之间OTU数目存在明显差异。偏最小二乘法-判别分析(PLS-DA)显示肝阳上亢型急性脑出血患者与健康人在肠道菌群组成上具有明显差异。物种及其丰度分析上,门分类水平上观察组厚壁菌门与拟杆菌门的相对丰度比值(F/B)较正常组明显增加,其中疣微菌门的相对丰度明显低于对照组(P 0. 05)。属分类水平上,两组的普雷沃氏菌属、拟杆菌属、阿克曼氏菌属、布劳特氏菌属、氨基酸球菌属相对丰度差异有统计学意义(P 0. 05,P 0. 01),其中观察组拟杆菌属和普雷沃氏菌属的相对丰度比值(B/P)显著高于对照组。种分类水平上两组在普氏菌、阿克曼粘细菌、卵形拟杆菌、脆弱拟杆菌、伶俐瘤胃球菌上具有明显差异(P 0. 05,P 0. 01)。主坐标分析显示两组样本被显著分开,说明两组样本菌群结构存在显著差异。结论:肝阳上亢型急性脑出血与肠道菌群结构紊乱有关,其中普氏菌和阿克曼粘细菌的相对丰度下降是其发生的主要原因。     

糖尿病肾脏病湿热证患者肠道菌群临床特征的研究

目的 探究糖尿病肾脏病湿热证患者肠道菌群的结构特征。方法 将2018年10月—2019年11月就诊于北京中医药大学东直门医院的20例糖尿病肾脏病湿热证患者作为糖尿病肾病湿热组,20例健康体检者作为健康组,20例单纯2型糖尿病患者作为糖尿病组,20例糖尿病肾脏病非湿热证患者作为糖尿病肾病非湿热组。收集各组受检者粪便样本进行基因DNA提取,获取粪便样本的生物学信息,通过生物学分析方法比较各组肠道菌群的多样性、菌落组成、物种丰度。结果 糖尿病肾病湿热组肠道菌群物种的丰富度和均匀度较健康组、糖尿病组、糖尿病肾病非湿热组升高,4组间菌落组成未发现明显差异。与健康组比较,糖尿病肾病湿热组厚壁菌门(主要是布劳特氏菌属、毛螺旋菌属、梭菌属＿sensu＿stricto＿1、罗斯氏菌、韦荣球菌属含量降低)、拟杆菌门、梭杆菌门、变形菌门丰度降低,放线菌门(主要是双歧杆菌属)丰度升高。与糖尿病组比较,糖尿病肾病湿热组梭杆菌门、厚壁菌门(主要是布劳特氏菌属)丰度降低,放线菌门(主要是双歧杆菌属)丰度升高;与糖尿病肾病非湿热组比较,糖尿病肾病湿热组变形菌门(主要是肠杆菌属、克雷伯菌属、变形菌属)、拟杆菌门丰度降低...     

针灸“足三里”对高尿酸血症小鼠肠道菌群的影响

目的：观察针刺及艾灸“足三里”对高尿酸血症模型小鼠尿酸及肠道菌群的影响。方法：选取56只雄性昆明小鼠，随机分为空白组和造模组，采用氧嗪酸钾联合次黄嘌呤灌胃构建高尿酸血症模型，造模成功后随机分为模型组、针刺组、艾灸组，每组14只。选择“足三里”穴进行针刺或艾灸治疗，治疗2周后检测小鼠血清尿酸，16SrDNA测序分析肠道菌群变化。结果：与空白组相比，模型组SUA水平显著升高(P<0.01),肠道菌群多样性下降，厚壁菌门/拟杆菌门比值升高，Lachnoclostridium菌属丰度升高，颤杆菌克属、罗斯氏菌属丰度下降(P<0.05)。与模型组相比，针刺组、艾灸组SUA水平均显著下降(P<0.05),厚壁菌门/拟杆菌门比值下调，针刺组另枝菌属丰度升高，Lachnoclostridium丰度下降(P<0.05),艾灸组副拟杆菌属丰度升高，Lachnoclostridium、肠杆菌属丰度下降(P<0.05),其中Lachnoclostridium菌属与SUA含量呈正相关(r=0.388,P=0.037),另枝菌属与SUA含量呈负相关(r=-0.387,P=0.038)...     

基于16S rRNA测序技术探究参苓白术药膳糊对功能性腹泻脾虚证大鼠肠道菌群的影响

目的 观察参苓白术药膳糊对功能性腹泻脾虚证大鼠肠道菌群的影响,探讨参苓白术药膳糊治疗功能性腹泻脾虚证的机制。方法 将30只SPF级Wistar大鼠按随机数字表法分别为正常组、模型组、蒙脱石散组、参苓白术汤剂组、参苓白术药膳糊组,每组6只,正常组大鼠正常饲养,余鼠以高乳糖联合水平台站立方法制作功能性腹泻脾虚证大鼠模型。造模成功后,对应给药治疗7d。治疗结束后采用16S rRNA基因测序技术分析大鼠粪便菌群变化。结果 造模后正常组大鼠体重显著重于其他组(P<0.05)且造模大鼠腹泻率为100%。治疗7d后,参苓白术药膳糊组大鼠体重显著重于其他造模组(P<0.05)。在门水平,参苓白术药膳糊可以显著增加厚壁菌门、变形菌门、放线菌门丰度,降低疣微菌门、拟杆菌门丰度;在属水平,参苓白术药膳糊可以增加乳杆菌属、异杆菌属、双歧杆菌属,降低拟杆菌属、瘤胃球菌属、阿克曼菌属、螺杆菌属、颤螺菌属、副拟杆菌。结论 参苓白术药膳糊可以改善功能性腹泻脾虚证,其作用机制可能与增加肠道中有益菌丰度,调节肠道菌群结构有关。     

基于16S rRNA测序分析肾虚证先兆流产的阴道菌群特征

目的：探讨肾虚证早期先兆流产的阴道菌群结构特征。方法：选取2018年5月至2020年12月就诊于广州中医药大学第一附属医院的肾虚证早期先兆流产患者（DK-TA组）31例、正常早孕女性（NP组）116例，收集两组人群的阴道分泌物，采用16S rRNA测序技术，对两组阴道菌群群落组成及差异菌进行分析。结果：与NP组比较，Alpha多样性显示DK-TA组阴道菌群丰富度及多样性显著增高。通过Binary jaccard及unweighted＿unifrac两种距离矩阵分析可知两组阴道菌群的相似性、分散性、丰度及进化关系存在明显差异。在门水平上，与NP组比较，DK-TA组的拟杆菌门、梭杆菌门相对丰度降低，而变形菌门及芽单胞菌门相对丰度明显增高；在属水平上，与NP组比较，DK-TA组纤毛菌属、双歧杆菌属相对丰度降低，而志贺氏菌属、卫星沙特尔沃思氏菌属明显升高。线性判别分析（LEfSe）拟杆菌门、梭杆菌门、双歧杆菌属为NP组阴道优势菌种。变形菌门、厚壁菌门是DK-TA组的阴道优势菌种。功能预测发现DK-TA组与环腺苷3’,5’-单磷酸信号通路、炎症介质对色氨酸通道的调节等38个功能路径密切相关，且两...     

柴归颗粒对慢性不可预知温和刺激抑郁大鼠模型肠道菌群的作用

目的利用16S rRNA高通量测序技术研究柴归颗粒对慢性不可预知温和刺激(chronic unpredicted mild stress,CUMS)抑郁大鼠模型肠道菌群的调节作用,探讨柴归颗粒的抗抑郁作用及机制。方法SD大鼠随机分为对照组、模型组和柴归颗粒(8.3 g/kg)组,给药1 h后造模,持续28 d。收集大鼠肠道内容物,提取总DNA,根据细菌16S rRNA V3~V4区设计引物进行扩增,利用Illumina Miseq平台进行高通量测序。结果与对照组比较,模型组大鼠肠道菌群栖热菌门(Thermi)、变形菌门(Proteobacteria)、拟杆菌门(Bacteroidetes)和放线菌门(Actinobacteria)相对丰度水平显著降低(P<0.05),乳酸杆菌属Lactobacillus相对丰度水平显著升高(P<0.05),栖热菌属Thermus、不动杆菌属Acinetobacter、甲基杆菌属Methylobacterium、青枯菌Ralstonia、纤毛菌属Leptothrix、假单胞菌属Pseudomonas、棒状杆菌属Corynebacterium和苍白杆菌属Ochrobactrum相对丰度水平显著降低(P<0.05)。与模型组比较,柴归颗粒可调节CUMS大鼠肠道菌群的构成,显著回调栖热菌门、变形菌门、拟杆菌门和放线菌门相对丰度水平(P<0.05、0.01),显著降低乳酸杆菌属相对丰度水平(P<0.01),显著升高栖热菌属、不动杆菌属、甲基杆菌属、青枯菌属、纤毛菌属和苍白杆菌属相对丰度水平(P<0.01)。结论柴归颗粒可能通过调节参与精氨酸代谢途径的肠道菌群发挥抗抑郁作用。     

矿物药青礞石对戊四唑点燃癫痫大鼠肠道菌群的影响

目的研究青礞石对戊四唑(pentylenetetrazol,PTZ)点燃癫痫大鼠肠道菌群的影响,从肠道微生态环境视角探讨青礞石治疗癫痫疾病可能的作用机制。方法以青礞石粉末为研究对象,用PTZ点燃法建立大鼠癫痫动物模型,实验分为对照组、模型组、卡马西平组和青礞石组(高剂量组为临床用量的20倍、低剂量组为临床用量的5倍)。给药4周后,取各组大鼠结肠内容物,通过16Sr RNA测序对各组大鼠肠道菌群的多样性进行分析,利用UPARSE、SPSS18.0等对结果进行生物信息学及统计学分析。结果α多样性分析可知,模型组大鼠肠道菌群的Chao 1、Ace丰富度指数与对照组相比没有显著性变化;与对照组、模型组相比,青礞石组尤其是高剂量组对细菌群落丰富度有显著影响(P0.05)。Shannon、Simpson群落多样性指数分析结果显示,模型组与对照组无显著性差异;青礞石组对群落多样性干预不明显。青礞石主要干预肠道菌群的丰富度、卡马西平主要干预肠道菌群的多样性。β多样性各组层级聚类均能较好地分开,其中青礞石高剂量组与低剂量组部分样本不能明显分开,2组样本可归为一类,对照组、模型组可归为一类,卡马西平组单独归为一类。3D-主成分分析(3D-principal component analysis,3D-PCA)、3D-主坐标分析(3D-principal co-ordinates analysis,3D-PCoA)结果显示,各组菌群结构轮廓均能明显分开,青礞石低剂量组介于对照组和模型组之间,菌群结构轮廓部分与模型组、对照组有重合交叉,且有偏向对照组的明显趋势。非度量多维尺度(nonmetric multidimensional scaling,NMDS)分析结果显示,对照组、模型组、青礞石组集中在一个区域,青礞石组与模型组、对照组有重合交叉,青礞石高剂量组、低剂量组对肠道菌群结构有相似的干预效果。物种组成门水平分析可知,各组大鼠的优势菌群主要有厚壁菌门(Firmicutes)、拟杆菌门(Bacteroidetes)、疣微菌门(Verrucomicrobia)、变形菌门(Proteobacteria)和放线菌门(Actinobacteria),其中厚壁菌门占比最大,其次是拟杆菌门。模型组疣微菌门相对丰度较对照组显著增加(P0.01),模型组变形菌门的相对丰度最高;青礞石干预后疣微菌门相对丰度下降,变形菌门相对丰度有不同程度降低。属水平分析可知,与对照组相比,模型组中norank_f__Muribaculaceae(P0.05)、Akkermansia菌属(P0.01)相对丰度显著增加,乳杆菌属显著减少(P0.05);青礞石干预后可降低Akkermansia菌属、升高乳杆菌属Lactobacillus的相对丰度。另外,线性判别分析效应大小(linear discriminant analysis effect size,LEfSe)分析可知厚壁菌门的瘤胃球菌科(Ruminococcaceae)在模型组中显著富集,给予青礞石干预后,瘤胃球菌科相对丰度显著降低。结论青礞石对PZT点燃癫痫大鼠肠道菌群物种组成的丰富度、多样性具有明显的调节作用,可有效干预肠道微生态的重建。     

基于高通量测序技术的胰腺癌湿热证患者肠道菌群结构差异与功能变异研究

目的研究基于高通量测序技术的胰腺癌湿热证患者肠道菌群结构与功能的变化情况,探讨肠道菌群与胰腺癌发病的关联,以期为临床诊治提供新思路。方法将2018年1月至2018年12月期间复旦大学附属肿瘤医院和上海中医药大学附属岳阳中西医结合医院收治的31例胰腺癌湿热证患者作为观察组,另选择同期接受健康体检的8例正常人员作为对照组。采集两组人员的粪便样本,提取DNA,建库,经Illumina HiSeq PE150平台实施高通量测序,获得样本的生物学信息,对组间样本进行物种注释分析比较及功能注释分析比较。结果①经去冗余后,得到328 787条线粒体开放阅读框(ORFs);两组共有基因为137 849个,观察组独有基因为114 439个,对照组独有基因为60 473个。②在门水平及属水平上,两组间的物种丰度均存在明显差异。在门水平上,观察组菌群丰度中变形菌门(Proteobacteria)、放线菌门(Actinobacteria)、疣微菌门(Verrucomicrobia)、互养菌门(Synergistetes)、纤维杆菌门(Fibrobacteres)的丰度高于对照组,而拟杆菌门(Bacteroidetes)、厚壁菌门(Firmicutes)、螺旋体门(Spirochaetes)、念珠菌门(Candidatus)、衣原体门(Chlamydiae)的丰度低于对照组。在属水平上,观察组菌群丰度中艾克曼菌(Akkermansia)、柯林斯氏菌(Collinsella)、链球菌(Streptococcus)、沃氏嗜胆菌(Bilophila)的丰度高于对照组,而双歧杆菌(Bifidobacterium)、普氏菌(Prevotella)、拟杆菌(Bacteroides)、粪杆菌(Faecalibacterium)、梭状杆菌(Clostridium)、罗斯氏菌(Roseburia)的丰度低于对照组。③基于距离矩阵的主坐标分析(PCoA)显示,两组样本的菌群组成结构差异明显。④KEGG数据库功能注释及分析结果显示,观察组在新陈代谢、环境信息处理、细胞加工相关通路上的基因表达水平高于对照组;观察组与对照组的功能丰度分布可以明显区分开。结论相较于正常人,胰腺癌湿热证患者体内存在肠道菌群结构失调及功能变异,故监测肠道菌群变化可为临床防治胰腺癌提供有价值的信息。     

中风星蒌通腑胶囊对急性缺血性中风痰热腑实证患者肠道菌群的影响及肠道菌群与痰热腑实证的相关性探讨北大核心CSCD

目的:探讨中风星蒌通腑胶囊对急性缺血性中风痰热腑实证患者肠道菌群的影响及肠菌与痰热腑实证证候间的内在联系。方法:本研究采用随机对照的试验方法,将符合纳排标准的急性缺血性中风痰热腑实证的患者67例按随机数字表法分为对照组35例和治疗组32例,对照组给予指南规范化治疗,治疗组在对照组的基础上给予中风星蒌通腑胶囊。在入院48 h和证候转变的24 h内对两组患者进行中医证候评价和粪便采集,在入院当天和14 d进行疗效观察和生活能力评定。运用16SrDNA高通量测序对采集的样本进行肠道菌群结构和多样性分析,比较两组治疗前后肠道菌群的特征。结果:治疗组临床有效率明显高于对照组(P>0.05),与治疗前比较,两组用药后NIHSS、mRS评分、临床症状中舌质、便秘、咯痰、积分、痰热腑实证证候积分明显降低,BI总体水平明显升高(P<0.05或P<0.01)。与对照组比较,治疗组临床症状中的舌质、舌苔、脉象积分,NHISS评分和痰热腑实证证候积分明显降低(P<0.05或P<0.01)。治疗组平均(5.0±1.4)d证候转变,对照组平均(7.5±3.8)d转变(P<0.05)。在门水平上,治疗组拟杆菌门、放线菌门丰度升高,厚壁菌门、变形菌门、梭杆菌门丰度明显降低(P>0.05)。在属水平上,治疗组拟杆菌属近持平,普雷沃氏菌属、粪栖杆菌属、乳酸杆菌等益生菌丰度提高,另枝菌属、副拟杆菌属、埃希氏-志贺氏菌属等条件致病菌丰度明显降低(P>0.05)。肠菌与痰热腑实证证候的相关性分析得出粪栖杆菌属丰度与咳痰、普雷沃菌属与便干便秘呈负相关,厚壁菌门与舌质,变形菌门和咳痰,梭杆菌门与咳痰、舌质之间均成正相关(P<0.05)。结论:中风星蒌通腑胶囊治疗急性缺血性中风痰热腑实证患者临床疗效显著,该药可能通过调节肠道菌群结构,增加益生菌,减少有害菌和条件致病菌来改善中医证候,减轻神经功能缺损,从而提高卒中患者日常生活能力。     

养阴益气活血方对干燥综合征非肥胖糖尿病小鼠肠道菌群的影响

目的?利用16S rRNA高通量测序研究养阴益气活血方对干燥综合征非肥胖糖尿病（NOD）小鼠肠道菌群的影响。方法?选取NOD小鼠24只，6只同龄Balb/c小鼠作为对照组，NOD小鼠随机分为中药组、中西药组、西药组及模型组，每组6只。中药组灌服中药养阴益气活血煎剂0.4 mL（含生药量1.125 g/mL）；西药组灌服羟氯喹0.4 mL（3 mg/mL）；中西药组灌服中药、羟氯喹各0.4 mL；模型组和对照组每只灌服去离子水0.4 mL。给药8周后取各组小鼠粪便，进行16S rRNA高通量测序检测肠道菌群。结果?经16S rRNA测序后共得到3 867个操作分类单元，10个门，69个属。与对照组比较，模型组的Chao、Ace、Shannon指数明显降低，Simpson指数增加（P<0.05）；与模型组比较，中西药组Chao、Ace、Shannon指数明显升高，Simpson指数减少（P<0.05）。在门水平，拟杆菌门与厚壁菌门为优势菌群（分别占总样本的47.29%、41.17%），拟杆菌门水平各组间无明显统计学差异；中药组与对照组厚壁杆菌门水平均高于其他组（P<0.05）。在属水平，中药组的乳酸杆菌属、Incertae属和Candidatus Saccharimonas属的物种丰度明显高于模型组，且拟杆菌属丰度明显降低（P<0.05）。结论?养阴益气活血方能提高肠道微生物多样性及物种丰度，增加NOD小鼠肠道益生菌，抑制优势有害菌生长，提示其可能通过调节肠道的微生态结构发挥治疗干燥综合证的作用。     

结肠癌患者舌苔类型与肠道菌群相关性研究

目的：本研究旨在探讨结肠癌患者常见舌苔类型与肠道菌群的相关性。方法：选取2019年3月至2019年9月哈尔滨医科大学附属第一医院收治的4种常见舌苔类型的结肠癌患者78例作为研究对象,采用高通量16S rDNA测序方法分析各组患者菌群的生物多样性及物种组成。结果：患者中薄白苔18例、薄黄苔12例、白腻苔22例、黄腻苔26例。4种舌苔类型结肠癌患者肠道菌群多样性差异有统计学意义（均P<0.05）。在门分类水平上,各组丰度最高的5个菌门为厚壁菌门（Fimicutes）、变形菌门（Proteobacteria）、拟杆菌门（Bacteroidetes）、放线菌门（Actinobacteria）、疣微菌门（Verrucomicrobia）。属分类水平上,各组排前10名的菌属丰度主要集中在肠球菌属（Enterococcus）、大肠埃希菌/志贺菌属（Escherichia/Shigella）、链球菌属（Streptococcus）、克雷伯氏菌属（Klebsiella）、阿克曼氏菌属（Akkermansia）、毛螺菌属（Lachnospiracea-incertae-sedis）、布劳特氏菌属（Blautia）、拟杆菌属（Bacteroides）、丹毒丝菌科未命名属（Erysipelotrichaceae-incertae-sedis）、双歧杆菌属（Bifidobacterium）。结论:结肠癌患者不同舌苔类型的肠道菌群在生物多样性与物种组成方面均具有显著的差异性,为进一步研究以舌象变化为主要辨证依据的结肠癌诊疗提供实验依据。     

基于调节肠道菌群失衡的四君子汤干预心力衰竭大鼠机制研究

目的从调节肠道菌群角度探讨四君子汤对心力衰竭大鼠的作用机制。方法 40只雄性Wistar大鼠分为假手术组、模型组、四君子汤组及益生菌组,每组10只。采用冠状动脉左前降支结扎法制备心力衰竭大鼠模型,心电图及TTC、HE染色确定心肌梗死情况,HE染色检测肠黏膜结构变化,治疗前后超声评估心功能,并于治疗后行高通量测序检测肠道菌群的变化。结果心肌HE染色显示,模型组心肌细胞较假手术组数量减少,细胞形态萎缩,肌纤维疏松;结肠HE染色显示,模型组大鼠肠黏膜结构破坏,细胞排列紊乱,绒毛萎缩、粘连,隐窝减少、排列不规则,腺体正常结构消失、呈空泡状。超声结果显示,治疗前与假手术组比较,模型组大鼠心肌明显变薄,心腔增大,左心室舒张末期内径(LVEDd)、左心室收缩末期内径(LVESd)显著增加,左心室射血分数(LVEF)显著减少(P0.001);治疗后与模型组比较,四君子汤组大鼠LVEDd、LVESd显著减少(P0.001),LVEF显著增加(P0.001)。测序结果显示,与假手术组比较,模型组大鼠出现肠道菌群失衡:在门分类水平,表现为厚壁菌门丰度显著减少(P0.001),拟杆菌门及疣微菌门丰度显著增加(P0.001,P0.05);在属分类水平,表现为乳杆菌属、厌氧芽孢杆菌属丰度显著减少(P0.001,P0.05),Muribaculaceae_norank菌属、艾克曼菌属丰度显著增加(P0.001,P0.05)。与模型组比较,四君子汤组大鼠肠道菌群失衡显著改善:在门分类水平,厚壁菌门丰度显著增加,拟杆菌门丰度显著减少(P0.05);在属分类水平,乳杆菌属、厌氧芽孢杆菌属丰度显著增加,Muribaculaceae_norank菌属丰度显著减少(P0.05)。结论四君子汤通过调节肠道菌群失衡,对大鼠心肌梗死后心力衰竭有一定的治疗作用。     

泄泻患者腻苔与平人薄白苔舌面菌群差异性研究

目的：利用Illumina Miseq高通量测序技术探究泄泻患者黄腻苔和白腻苔的舌面菌群特征及与平人薄白苔的差异。方法：采集黄腻苔和白腻苔泄泻患者及健康薄白苔志愿者舌苔样本各60例提取DNA,采用Illumina Miseq测序平台进行16S rRNA高通量测序并对测序结果进行处理与分析。结果：经过严格的质检和筛选后每组各保留40份优质序列,对这120份测序序列进行分析后发现,泄泻患者的黄腻苔和白腻苔与平人薄白苔的舌面菌群存在明显差异,其中变形菌门下的根瘤菌科、拟杆菌门下的capnocytophaga丰度在泄泻黄腻苔组中显著升高,梭杆菌门及其门下的梭菌、蓝细菌门及其门下的叶绿体、拟杆菌门下的卟啉单胞菌属及厚壁菌门下的孪生菌属丰度在泄泻白腻苔组中显著升高,拟杆菌门下的普氏菌属及变形菌门下的嗜血杆菌属丰度在健康薄白苔组中显著升高,上述差异均有统计学意义(P<0.05)。结论：根瘤菌科、capnocytophaga丰度显著升高可能是泄泻黄腻苔患者的特征表现,梭杆菌门及其门下的梭菌、蓝细菌门及其门下的叶绿体、卟啉单胞菌属及孪生菌属丰度显著升高可能是泄泻白腻苔患者的特征表现。同时出现上述2...     

高温环境下蚂蟥病害病原初探

该文以健康蚂蟥为对照利用高通量测序对高温环境下患病蚂蟥病变肌肉、肠道、发病蚂蟥养殖水体环境与沉积物的细菌进行16S rDNA序列测定,分析细菌多样性,分析高温环境下患病蚂蟥细菌性疾病的致病菌。结果表明,各处理原始序列达83 000以上,并且有效序列占比在87%以上,GC量在52%~54%,细菌多样性丰富。细菌相对丰度分析表明各处理中均以变形菌门、拟杆菌门、厚壁菌门细菌含量最为丰富。与健康蚂蟥肌肉、肠道相比,发病蚂蟥肌肉、肠道中拟杆菌属、假单胞菌属、脱硫弧菌属细菌相对丰度显著升高,且在发病蚂蟥养殖水体和沉积物中具有丰富的含量,推测诱发蚂蟥夏季高温细菌性疾病的致病菌为拟杆菌属、假单胞菌属、脱硫弧菌属细菌。