基于网络药理学与分子对接技术研究淫羊藿治疗少弱精症的作用机制

目的 利用网络药理学、分子对接技术探究淫羊藿治疗少弱精症的有效成分及作用机制。方法 利用中药系统药理学数据库与分析平台（TCMSP）筛选出淫羊藿主要活性成分及对应靶点基因；通过GeneCards、在线人类孟德尔遗传数据库（OMIM）获得少弱精症靶点基因；利用UniProt对所有基因进行校正；利用Cytoscape 3.9.0软件构建药物-活性成分-关键靶点调控网络，根据度值筛选关键活性成分；将活性成分与疾病共同靶点上传至STRING 11.5数据库构建淫羊藿靶蛋白-少弱精症靶蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）网络，根据度值筛选关键蛋白靶点；利用DAVID数据库对关键靶点进行基因本体（GO）功能富集分析及京都基因与基因组百科（KEGG）通路富集分析；利用Protein Data Bank（PDB）数据库及TCMSP数据库获得靶蛋白和活性成分的分子结构，通过AutoDock Vina 1.1.2软件对活性成分及核心蛋白靶点进行分子对接；最后通过淫羊藿活性成分淫羊藿苷干预少弱精症模型大鼠，验证淫羊藿苷对蛋白靶点表达的影响。结果 从淫羊藿中筛选出23个活性成分，淫羊藿与少弱精症的共同关键靶点50个，核心靶点6个，包括肿瘤蛋白p53（TP53）、表皮生长因子受体（EGFR）、前列腺素G/H合酶2（PTGS2）、胱天蛋白酶（Caspase）-3、受体酪氨酸蛋白激酶erbB-2（ERBB2）、Caspase-9。GO功能富集与KEGG信号通路富集分析淫羊藿活性成分主要参与P53信号通路、癌症途径、细胞增殖和凋亡等。分子对接结果提示淫羊藿苷、槲皮素、8-异戊烯醇三个活性成分与靶蛋白结合能力较强。淫羊藿苷干预实验结果表明，与空白组比较，少弱精模型大鼠睾丸中靶蛋白表达显著下调；与少弱精症模型大鼠组比，淫羊藿苷可显著上调靶蛋白在淫羊藿苷组睾丸中靶蛋白的表达（P<0.05）。结论 淫羊藿主要通过淫羊藿苷、8-（3-甲基丁-2-烯基）-2-苯基色酮、8-异戊烯醇，调节P53信号通路、癌症途径、细胞增殖和凋亡等路径发挥治疗少弱精症的作用。     

基于网络药理学研究淫羊藿改善心肌重塑的有效成分和作用机制

目的运用网络药理学方法研究淫羊藿改善心肌重塑的有效成分和作用机制。方法利用中药系统药理学技术平台TCMSP数据库筛选出淫羊藿口服生物利用度≥30%和类药性≥0.18的主要活性成分及其靶点基因,通过GeneCards、OMIM等数据库获取心肌重塑靶点基因。将成分靶点与疾病靶点上传至String数据库,构建中药成分靶蛋白-疾病靶蛋白互作网络,并根据其度值筛选出关键靶点。借助DAVID分析平台对关键靶标进行基因本体(GO)分析和基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。结果共获取淫羊藿活性成分23个,与心肌重塑交集的关键靶标78个,包括白介素6(IL-6)、半胱氨酸蛋白酶(CASP)3、血管内皮生长因子A(VEGFA)、表皮生长因子受体(EGFR)、丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)8等基因,主要富集在恶性肿瘤途径(Pathways in cancer)、肿瘤坏死因子信号通路(TNF signaling pathway)、磷脂酰肌醇3激酶/蛋白激酶B信号通路(PI3K-Akt signaling pathway)、缺氧诱导因子1信号通路(HIF-1 signaling pathway)、促乳素信号通路(Prolactin signaling pathway)等。结论本研究结果初步验证和预测了淫羊藿改善心肌重塑的作用机制,为进一步深入揭示其分子机制提供了理论基础。     

基于网络药理学和分子对接研究红花治疗阿尔茨海默病的作用机制

目的:运用网络药理学和分子对接的方法研究红花治疗阿尔茨海默病(AD)的作用机制。方法:通过查阅文献和数据库获取红花的有效药物成分,利用数据库预测红花的成分靶点与AD的靶点,并对红花靶标基因进行标准化。运用Cytoscape 3.7.2软件构建“红花-成分-靶点”网络,利用红花的靶标基因与AD的靶标基因的交集基因构建蛋白相互作用(PPI)网络。通过DAVID数据库进行GO分析和KEGG富集分析,最后利用Ledock软件对关键成分与核心靶点进行分子对接。结果:获得21种红花有效成分和391个作用靶点,AD的疾病靶点535个,其中红花与AD的共同作用靶点有94个。共得到535个GO分析,43个KEGG通路,主要涉及阿尔茨海默病信号通路、ErbB信号通路、5-羟色胺能突触、癌症中的蛋白多糖等;分子对接结果显示,核心成分与关键靶点具有良好的结合能力。结论:红花治疗由微循环障碍引起的AD的潜在作用机制,且具有多成分、多靶点、多通路的特点。     

基于网络药理学和分子对接研究淫羊藿治疗抑郁症的抗炎作用机制

目的:采用网络药理学方法预测淫羊藿治疗抑郁症的抗炎靶点及相关信号通路,探讨其抗抑郁作用的潜在机制。方法:通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)数据库搜集和筛选淫羊藿的活性成分;利用PharmMapper服务器,TCMSP数据库对蛋白靶点进行预测和筛选;利用OMIM数据库,CTD数据库和GeneCards数据库筛选抑郁症的相关靶点以及抗炎靶点;通过DAVID数据库对关键抗炎靶点进行基因本体(GO)功能富集和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析;利用Cytoscape 3.6.0软件构建淫羊藿"活性成分-作用靶点-信号通路"网络图,并对网络拓扑结构分析;采用GOLD分子对接软件对活性成分与关键抗炎靶点进行结果验证。结果:筛选得到淫羊藿与抑郁症相关的12个活性成分,30个作用靶点,5个关键抗炎靶点;GO功能富集得到生物过程65个,细胞组成4个,分子功能1个,KEGG通路富集分析得到41条,其中与炎症相关的信号通路9个;分子对接验证淫羊藿苷与关键抗炎靶点能够形成最佳复合体。结论:揭示了淫羊藿通过抗炎靶点及其相关信号通路网络作用于抑郁症的分子机制,为进一步研究淫羊藿抗抑郁作用提供了基础。     

基于网络药理学和分子对接的理肠四方治疗溃疡性结肠炎分子机制的比较研究

目的:通过网络药理学及分子对接技术探讨理肠四方(白头翁汤、参苓白术散、痛泻要方、乌梅丸)治疗溃疡性结肠炎的分子机制及比较作用。方法:从TCMSP、BATMAN-TCM、DisGeNET数据库中得出理肠四方治疗溃疡性结肠炎的作用靶标,对共有基因构建PPI网络。利用DAVID数据库进行KEGG Pathway富集并构建"活性成分-靶标-作用通路"图。将PPI中排名前5的靶标与君药进行分子对接。结果:网络药理学发现白头翁汤作用该病的靶基因147个,有效成分75个,通路4个。参苓白术散靶基因230个,有效成分306个,通路8个。痛泻要方靶基因193个,有效成分134个,通路28个。乌梅丸靶基因202个,有效成分331个,通路30个,且其作用Toll样受体、NF-κB信号通路最明显。分子对接表明靶标蛋白与君药结合性较好。结论:四方均有治疗溃疡性结肠炎的作用,从分子生物学层面比较乌梅丸效果更好。本研究为后续的研究提供了基础。     

基于网络药理学和分子对接研究麻黄-五味子药对治疗肺纤维化的作用机制

目的：研究麻黄-五味子药对治疗肺纤维化的作用机制。方法：利用中药系统药理学数据库与分析平台及文献补充收集麻黄-五味子的化学成分，利用Swiss Target Prediction平台预测成分相关靶标；采用MalaCards、TTD、OMIM及PharmGKB数据库收集肺纤维化相关靶蛋白，并与成分靶标比对，筛选潜在治疗疾病的交集靶标，进行京都基因和基因组数据库代谢通路富集和基因本体论生物功能分析，构建成分-靶标-通路网络。采用分子对接法验证该药对潜在活性成分与核心靶蛋白的相互作用。结果：从麻黄-五味子中共筛选得到62个活性成分对应1 022个靶标；与肺纤维化疾病匹配后得到37个共有靶标，涉及趋化因子受体、肿瘤坏死因子、基质金属蛋白酶等靶标，以及肿瘤坏死因子信号通路、缺氧诱导因子1信号通路、松弛素信号通路等相关通路。分子对接结果表明麻黄-五味子药对中的活性成分与关键靶标蛋白具有较强的结合能力。结论：麻黄-五味子药对治疗肺纤维化具有多靶标、多通路协同作用的特点。     

基于网络药理学研究淫羊藿治疗多囊卵巢综合征的作用机制

目的:基于网络药理学探讨淫羊藿治疗多囊卵巢综合征的靶点和机制。方法:中药系统药理学分析平台(TCMSP)筛选淫羊藿活性成分及靶基因,GeneCards数据库获取多囊卵巢综合征相关基因,Venny将淫羊藿靶基因与PCOS相关基因映射,Cytoscape3.2.1软件构建淫羊藿-成分-靶点-疾病网络,STRING10.5软件构建PPI网络互作图和Origin9.1软件对PPI网络中的前30位蛋白绘制条形图,最后使用David v 6.8数据库将淫羊藿治疗多囊卵巢综合征的共同靶点做GO功能富集分析及KEGG通路富集分析。结果:共得到淫羊藿候选药效成分23个,涉及作用靶点106个,多囊卵巢综合征相关基因3739个,淫羊藿治疗多囊卵巢综合征的关键化合物21个,共同作用靶点67个。GO功能富集主要包含序列特异性DNA结合、转录因子结合、RNA聚合酶Ⅱ启动子转录的正调控等。KEGG富集通路主要有PI3K-AKt信号通路、TNF信号通路等72条。结论:筛选和分析淫羊藿治疗多囊卵巢综合征的作用机制,为后续进行深入研究提供了一定思路和参考。     

基于网络药理学及分子对接探讨杜仲叶防治骨质疏松的作用机制

目的：采用网络药理学-分子对接预测杜仲叶防治骨质疏松症的作用机制。方法：利用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)及SwissTargetPrediction分析平台对杜仲叶活性成分及作用靶点进行筛选,使用GeneCards、在线人类孟德尔遗传(OMIM)数据库、治疗靶点数据库(TTD)对骨质疏松症的对应靶标进行筛选,将中药靶基因与疾病靶基因相交集,将交集靶点导入Cytoscape软件构建成分靶点网络,使用STRING分析平台及Cytoscape软件构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络,筛选核心靶点。对中药-疾病共同靶标进行基因本体(GO)功能富集分析和京都基因和基因组百科全书(KEGG)功能富集分析,得出中药-疾病共同靶标相关的信号通路,最后运用AutoDock与Pymol软件对预测靶标与其对应的成分进行分子对接。结果：筛选后得到杜仲叶治疗防治骨质疏松症的有效成分7个,杜仲叶-骨质疏松症共同靶标231个,并推断其作用机制可能与动脉粥样硬化信号通路的下游核因子κB信号通路,MAPK信号通路、TNF、PI3K-AKT、IL-17及HIF-1信号通路等有关,且MAPK1、STAT...     

淫羊藿治疗类风湿关节炎作用机制的网络药理学分析

目的运用网络药理学方法探讨淫羊藿治疗类风湿关节炎(RA)的作用机制。方法利用中药系统药理学技术平台(TCMSP)数据库收集淫羊藿的主要活性成分及其作用靶点;通过GeneCards、OMIM等数据库获取RA相关疾病靶点。取淫羊藿活性成分靶点与RA疾病靶点的交集基因(共同靶点),作为淫羊藿对RA作用的潜在关键靶点基因。将交集基因上传至String数据库,构建淫羊藿活性成分与RA疾病的共同靶点蛋白互作(PPI)网络,并根据其度值筛选出核心靶点。借助DAVID分析平台对共同靶点进行基因本体(GO)分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。结果共获得淫羊藿活性成分23个,共同靶蛋白即关键靶标72个。重要活性成分包括槲皮素(Quercetin)、木犀草素(Luteolin)、山萘酚(Kaempferol)等;核心靶点包括白细胞介素6(IL-6)、血管内皮生长因子A(VEGFA)、半胱氨酸蛋白酶3(CASP3)、表皮生长因子受体(EGFR)、丝裂原活化蛋白激酶8(MAPK8)等;KEGG主要通路富集在肿瘤坏死因子(TNF)信号通路、磷脂酰肌醇3激酶/蛋白激酶B(PI3K-Akt)信号通路、促乳素(Prolactin)信号通路、甲状腺激素(Thyroid hormone)信号通路、缺氧诱导因子1(HIF-1)信号通路等。结论淫羊藿可能主要通过多成分、多靶点、多通路,从调节炎症、免疫等多方面发挥对类风湿关节炎的治疗作用。     

基于网络药理学探寻淫羊藿治疗哮喘的关键靶标及作用机制

目的:基于网络药理学与分子对接方法,系统挖掘淫羊藿治疗哮喘的关键靶标及作用机制。方法:利用多种数据库寻找淫羊藿的活性成分与作用靶标,建立预测模型并利用分子对接技术对靶标进行筛选与验证;查找疾病数据库得到哮喘相关靶标;构建靶标互作网络筛选关键靶标;利用数据库进行GO功能富集分析与KEGG通路富集分析;构建生物网络并进行拓扑分析。结果:通过筛选得到白细胞介素(Interleukin,IL)-6、肿瘤坏死因子(Tumor Necrosis Factor,TNF)、血管内皮生长因子A(Vascular Endothelial Growth Factor A,VEGFA)等10个关键靶标,富集的通路有IL-17信号通路、TNF信号通路、缺氧诱导因子(Hypoxia-inducible Factor,HIF)-1信号通路等66条,功能信息共得到446条,包括参与炎症反应、调控细胞增殖与细胞凋亡等。结论:淫羊藿中的活性成分靶标及作用通路在对抗炎症反应、逆转气道重塑方面均表现出显著富集,与治疗哮喘的作用机制相符合,在哮喘防治方面具有广阔的发展前景。     

基于网络药理学及分子对接研究六味醒神颗粒治疗肝性脑病的分子作用机制

目的:通过网络药理学及分子对接技术探讨六味醒神颗粒治疗肝性脑病的具体分子机制。方法:从中国知网、TCMSP、TCMID、BATMAN-TCM 4个数据库对六味醒神颗粒主要成分及潜在作用靶点进行收集,并与肝性脑病相关基因进行映射,得出其治疗该病最终作用靶标,构建PPI网络并进行可视化。利用DAVID数据库进行KEGG Pathway富集并构建"活性成分-靶标-作用通路"图。将PPI中排名前5的靶标与君药进行分子对接,以验证其治疗作用。结果:研究得到243个有效成分,241个靶基因及34个信号通路。分子对接表明5个靶标蛋白与君药结合性较好。结论:从分子对接技术揭示了六味醒神颗粒有直接治疗肝性脑病的作用,从网络药理学角度初步揭示了其治疗肝性脑病的分子机制,为后续的研究提供了基础。     

基于网络药理学及体外实验探讨淫羊藿及其活性成分治疗肝癌的作用机制

目的 通过网络药理学、分子对接技术和体外实验验证研究淫羊藿及其活性成分治疗肝癌的作用机制。方法通过中药系统药理学分析平台（TCMSP）筛选淫羊藿的活性成分和作用靶点,利用GeneCards、DrugBank等5个数据库筛选肝癌相关靶点。筛选二者共同的潜在功能靶位,运用Cytoscape 3.9. 0软件构建肝癌-淫羊藿活性成分-靶点网络图,使用R语言进行基因本体（GO）功能及京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路富集分析。结合STRING数据库和Cytoscape3.9. 0对交集靶点构建蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）网络,筛选核心靶点。运用AutoDock、Vina和PyMOL软件对淫羊藿关键成分与核心靶点进行分子对接验证。最后通过体外细胞实验验证网络药理学结果。结果 分析获得19个淫羊藿主要活性成分,淫羊藿与肝癌共同靶点139个,靶点经富集分析得到2 347个GO生物学功能和171条信号通路;分子对接结果显示核心成分与关键靶点均有较高的结合能力。体外实验结果表明核心成分淫羊藿素能显著抑制肝癌细胞系MHCC97H和MHCC97L的增殖,并抑制Bcl-2凋亡调节因子（Bcl-2）和...     

淫羊藿治疗骨质疏松骨折的网络药理学分析

目的 利用网络药理学原理探讨淫羊藿治疗骨质疏松骨折的分子作用机制。方法 利用中药系统药理学分析平台（TCMSP数据库）筛选淫羊藿的主要活性成分和作用靶点,应用GeneCards数据库、OMIM数据库、PharmGkb数据库、TTD数据库、DrugBank数据库预测骨质疏松骨折的相关靶点,制作维恩图获取淫羊藿与骨质疏松骨折的共同靶点,运用Cytoscape软件绘制中药-成分-疾病-靶点调控网络,利用STRING数据库进行蛋白相互作用网络的构建与分析。最后,使用R语言和Bioconductor平台进行基因本体富集分析（GO）和基因相互作用通路分析（KEGG）。结果淫羊藿主要是通过23种活性成分、121个作用靶点及155个生物学通路发挥作用治疗骨质疏松骨折。其中主要活性成分为槲皮素、山奈酚和木犀草素;主要核心靶点有AKT1、TP53、Jun、HSP90AA1和CASP3等;关键通路为脂质和动脉粥样硬化信号通路。结论 通过网络药理学揭示了淫羊藿通过多成分、多靶点、多通路治疗骨质疏松骨折的作用特点,为进一步的研究和实验工作提供了基础。     

基于网络药理学及分子对接研究健脾化浊调脂颗粒治疗非酒精性脂肪肝的分子作用机制

目的通过网络药理学及分子对接技术探讨健脾化浊调脂颗粒(国家专利号ZL 201510430075.8)治疗非酒精性脂肪肝的具体分子机制。方法通过中国知网、TCMSP、BATMAN-TCM 3个数据库对健脾化浊调脂颗粒主要成分及潜在作用靶点进行收集。从DisGeNET数据库中寻找与非酒精性脂肪肝相关的疾病基因与潜在靶点进行映射,得出健脾化浊调脂颗粒治疗非酒精性脂肪肝最终作用靶标。将最终靶标输入STRING数据库得出"蛋白-蛋白"相互作用关系,并用Cytoscape软件进行可视化。输入DAVID数据库进行KEGG PATHWAY富集,得出其可能作用的分子机制并构建"活性成分-靶标-作用通路"网络图。将"蛋白-蛋白"互作图中排名前5位靶标蛋白与君药进行分子对接,以验证其治疗作用。结果通过网络药理学预测后发现,健脾化浊调脂颗粒中有117个有效成分可用于治疗NAFLD,其中涉及113个靶基因及包括AMPK、PPAR、FOXO、胰岛素抵抗等18个信号通路。通过分子对接发现,5个靶标蛋白与君药结合性较好。结论从分子对接技术揭示了健脾化浊调脂颗粒有直接治疗非酒精性脂肪肝的作用,从网络药理学角度初步揭示了其治疗非酒精性脂肪的分子机制,为后续的研究提供了基础。     

淫羊藿和石菖蒲及其有效成分防治阿尔茨海默病研究进展

阿尔茨海默病(AD)是一种严重危害人类健康、表现为认知功能障碍的大脑退行性疾病。近年来,中药及其有效成分在防治AD的实验和临床方面取得了巨大的突出成就。中医认为肾虚痰阻是AD发病的重要病机之一。淫羊藿、石菖蒲为临床上治疗AD的常用补肾化痰益智药物,淫羊藿、石菖蒲及其有效成分在中枢神经系统能发挥多种药理作用。淫羊藿的主要有效成分有淫羊藿苷、淫羊藿次苷等,石菖蒲的主要有效成分为α-细辛醚、β-细辛醚、丁香酚等。近年来它们在防治AD方面报道颇多。在查阅相关国内外文献的基础上,本文综述了淫羊藿、石菖蒲及其有效成分对AD的不同药效作用及其作用机制的研究进展。     

基于网络药理学与分子对接探讨“黄芪-当归”治疗年龄相关性黄斑变性的作用机制

目的：通过网络药理学和分子对接方法探讨中药“黄芪-当归”治疗年龄相关性黄斑变性(AMD)的作用机制。方法：借助中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)获取中药黄芪、当归的有效成分与作用靶点,使用Uniport数据库进行基因ID的注释,在GeneCards、OMIM数据库中查找AMD的相关基因。使用Cytoscape 3.7.2将药物-关键有效成分-疾病靶点网络可视化,在String数据库平台构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络,再利用Metascape基因本体(GO)富集分析和京都基因和基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,使用AutoDock4.2.6软件对关键靶点蛋白及有效成分进行分子对接验证。结果：通过筛选,得到黄芪-当归有效成分22个,与AMD相关的关键有效成分14个,黄芪-当归与AMD的共同基因靶点52个;PPI中核心基因依次为CASP3、IL6、VEGFA、EGFR、ESR1等;GO功能富集得到1 064个条目,生物学过程主要涉及细胞凋亡、对类固醇激素的反应、活性氧代谢、对脂多糖的反应等;KEGG富集分析后得到119条信号通路,与癌症的通路、流体剪切力与动脉粥样硬...     

淫羊藿治疗股骨头坏死的分子机制分析

目的:基于网络药理学和生物信息学研究淫羊藿治疗股骨头坏死可能的分子机制。方法:通过中药系统药理学数据库和分析平台对淫羊藿可能的活性成分和靶点进行筛选和预测,针对TTD,Drug Bank,OMIM,GAD,Pharm GKB等数据库与股骨头坏死相关的作用靶点进行挖掘,结合生物信息学手段,明确淫羊藿防治股骨头坏死的特异性靶点,采用Clue GO进行信号通路富集分析,以进一步分析其可能的分子机制。结果:在中药系统药理学数据库和分析平台中共检索出与淫羊藿相关成分130个,根据口服生物利用度(OB)和药物相似性(DL)参数筛选获得入血活性成分23个,利用相关靶点预测技术预测可能的靶点102个;通过上述疾病基因相关数据库共检索到与股骨头坏死发生,发展密切相关的已知靶点72个。利用Cytoscape软件构建活性成分及疾病的蛋白质-蛋白质相互作用关系网络图,合并网络图并行拓扑分析筛选出关键基因135个;采用Clue GO信号通路富集分析显示,淫羊藿作用于股骨头坏死的关键节点涉及的信号通路主要被富集在细胞增殖、细胞凋亡、炎症、应激及癌症相关等80条信号通路。结论:淫羊藿治疗股骨头坏死具有多成分,多靶点的特点;其主要通路不仅直接参与骨重建的细胞增殖、凋亡及分化,调节成骨、破骨代谢平衡,还通过调节免疫、炎症及应激反应等干预和影响骨微环境以达到控制疾病发生发展的目的,与目前治疗股骨头坏死的作用机制相符合。     

淫羊藿、三七及其有效成分防治阿尔茨海默病的研究概况

阿尔茨海默病(Alzheimer's disease AD)是一种以记忆功能和认知功能渐进性减退为主要表现的中枢性退行性疾病。近年来,中药及其有效成分在防治AD动物实验和临床研究方面取得了举世瞩目的突破。大多数中医学者认为肾虚血瘀是AD的重要病机之一,淫羊藿、三七为临床上治疗AD的常用补肾化瘀益智药物,淫羊藿主要有效成分为淫羊藿苷、淫羊藿次苷等,三七的主要有效成分为三七皂苷、人参皂苷等。近年来,关于淫羊藿、三七及其有效成分在防治AD方面的功效研究,取得了巨大突破,这些功效主要包括改善胆碱能系统、调节β淀粉样蛋白(Aβ)代谢、抗氧化应激及清除自由基、抗神经元凋亡、抗炎症、改善突触可塑性等方面。通过对近年来关于淫羊藿、三七及其有效成分防治AD的研究成果进行总结,为有效防治AD提供实验和临床依据。     

地黄饮子“异病同治”阿尔茨海默病和帕金森病网络药理学及分子对接研究

目的采用网络药理学方法及分子对接技术探究地黄饮子治疗阿尔茨海默病(AD)和帕金森病(PD)的共同药效物质基础及作用机制,为其"异病同治"提供依据。方法通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)和中国知识资源总库(CNKI)检索地黄饮子组方药物有效成分,并通过SwissADME进行筛选,结合Swiss TargetPrediction、UniProt数据库得到药物靶点,利用GeneCards、OMIM、TTD数据库分别得到AD、PD相关疾病靶点,使用Cytoscape3.8.0构建疾病-药物-成分-靶点网络;将药物靶点与疾病靶点的交集靶点通过STRING数据库构建蛋白相互作用(PPI)网络,利用Cytoscape3.8.0的Bi NGO、Clue GO插件进行GO富集分析和KEGG通路富集分析;将疾病-药物-成分-靶点网络的关键成分与交集靶点PPI网络关键靶点进行分子对接。结果筛选得到地黄饮子有效成分127种(重复成分10种),相关药物靶点926个;AD疾病靶点4 523个,PD疾病靶点3 733个;药物与AD、PD直接相关的交集靶点分别为653、466个;地黄饮子治疗AD的信号通路主要有TNF信号通路、神经营养信号通路、雌激素信号通路等,治疗PD的信号通路主要有TNF信号通路、神经营养信号通路、甲状腺激素信号通路等;关键靶点与关键成分分子对接大多可形成稳定结构。结论地黄饮子主要通过干预TNF信号通路和神经营养信号通路治疗AD/PD,地黄饮子"异病同治"AD和PD有其共同作用机制。     

基于网络药理学探讨藿朴夏苓汤“培土生金”治疗新型冠状病毒肺炎的潜在作用机制

目的:采用网络药理学探索藿朴夏苓汤治疗新型冠状病毒肺炎(COVID-19)的作用机制。方法 :首先从《雷公炮制药性解》《本草汇言》《中药大辞典》等书中对藿朴夏苓汤的药物归经规律进行挖掘。其次,运用中药系统药理学数据库与分析(TCMSP)平台检索该复方各味药的有效成分和作用靶点。并将经过Uniprot数据库检索的靶基因及TCMSP检索出的相应中药成分、中药名称输入Cyoscape3.7.1软件,使"药物-有效成分-靶点"网络可视化。然后运用GeneCards平台筛选疾病基因,并将该基因与药物靶蛋白取交集,通过STRING平台对交集靶点的相互作用关系进行探索,找寻藿朴夏苓汤治疗COVID-19的关键靶点,通过Cyoscape3.7.1软件构建PPI网络图。最后进行GO功能富集分析和KEGG通路富集分析,预测其作用机制及核心靶标,并绘制气泡图及柱状图以使结果可视化。结果:藿朴夏苓汤各药的归经以肺、脾、胃为主,并涉及心、肝、肾、三焦、大肠、小肠、膀胱等多个脏腑;"药物-有效成分-靶点"网络涉及10味中药、68个有效药物成分,217个靶基因;将药物基因与疾病基因取交集,根据基因相互作用关系获取65个关键基因。按照P<0.05的标准,GO富集到1 739条生物过程,39条细胞组成,110条分子过程,KEGG富集到PI3K-Akt信号通路、小细胞肺癌、乙型肝炎等与之密切相关的136条信号通路。结论:本文预测具有"培土生金"多脏腑治疗作用的藿朴夏苓汤,其主要化合物成分槲皮素、木犀草素、黄芩素等可能通过作用AKT1、MAPK1、RELA、CDKN1A、CCND1、CASP8等关键靶点调节多条信号通路,从而发挥对COVID-19的治疗作用。