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1.
目的 采用生物信息学方法分析胶质母细胞瘤差异表达的铜死亡相关长链非编码RNA(lncRNA)并构建预后模型。方法 计算机检索TCGA数据库下载胶质母细胞瘤的RNA-seq数据及其临床信息,应用单因素Cox分析和LASSO回归筛选铜死亡相关lncRNA,并计算风险评分=基因系数×基因表达量,以风险评分中位数分为低风险组和高风险组;将胶质母细胞瘤样本随机分为测试组和训练组,再进行整合生物信息学分析。结果 共下载胶质母细胞瘤样本169例,对照样本5例,共表达分析发现791个铜死亡相关lncRNA,其中正相关lncRNA有753个,负相关lncRNA有38个。单因素Cox分析发现22个显著差异表达的lncRNA(P<0.05),LASSO回归分析筛选9个差异表达的lncRNA;多因素Cox回归分析显示风险评分增高是胶质母细胞瘤预后不良的独立危险因素(P<0.05)。生存曲线分析显示,无论是训练组,还是测试组,高风险组总体生存期和无进展生存期显著缩短(P<0.05)。ROC曲线分析显示模型对1、2、3年生存期具有良好的预测价值(P<0.05),而且风险评分预测效能显著优于...  相似文献   

2.
目的探讨长链非编码RNA重编程调节因子(lncRNA-ROR)在胶质母细胞瘤(GBM)中的表达情况及其与病人预后的关系。方法选取2015年6月~2019年6月手术切除的GBM组织145例,取同期颅脑损伤内减压术切除非肿瘤脑组织56例为对照,采用qRT-PCR法检测lncRNA-ROR的相对表达量,根据lncRNA-ROR平均表达水平分为高表达和低表达。术后随访24个月,记录无进展生存期和总生存期。结果 GBM组织lncRNA-ROR表达水平明显低于对照组(P<0.05)。多因素Cox回归分析显示lncRNA-ROR低表达是GBM生存预后不良的独立危险因素(P<0.05)。生存曲线分析显示,lncRNA-ROR高表达组2年累积无进展生存率(40.12%)与2年累积总生存率(48.56%)明显高于低表达组(分别为16.25%、19.85%;P<0.05)。结论 GBM组织lncRNA-ROR呈低表达,与病人不良生存预后密切相关。这提示检测lncRNA-ROR对GBM病人预后具有一定评估价值。  相似文献   

3.
胶质母细胞瘤(GBM)是中枢神经系统中一种高度侵袭性的恶性肿瘤,预后极差。这种致命疾病的发病机制尚不完全清楚,可能涉及数千个基因、信号和分子成分。大量研究表明,长链非编码RNA(lncRNAs)被选择性地包装、分泌和转移到参与肿瘤微环境中细胞间通信的细胞之间,并可以调节GBM的许多特征,如增殖、自噬、凋亡、侵袭和细胞干性。研究还发现lncRNAs被分泌到循环中,一部分自由循环,一部分被选择性地包装成外泌体,这为临床应用,包括诊断、疗效评价和判断预后提供了很大的希望。本文就lncRNAs在GBM中的研究进展进行综述。  相似文献   

4.
目的 分别构建由自噬相关基因(ATG)与自噬相关lncRNA(ATL)构成的预后模型,预测胶质母细胞瘤(GBM)患者的预后情况,为其个性化诊疗与基础研究提供依据。方法 利用TCGA数据库中GBM的测序与临床数据,通过单因素Cox回归分析筛选差异表达且具备预后价值的ATG与ATL,之后通过多因素Cox回归分析分别构建预后模型,根据模型计算患者风险值并验证其有效性。结果 GBM组织相较正常组织共筛选到72个差异表达的ATG(上调53个,下调19个)和170个ATL(上调102个;下调68个),单因素Cox回归分析筛选到16个与患者预后相关的ATG和22个ATL,多因素Cox回归分析分别纳入3个ATG与8个ATL构建预后模型。生存曲线显示在2个模型中高风险组生存率远低于低风险组,受试者工作特性曲线证明2个模型均具有较好的预测能力。结论 所构建的2个预后模型可有效预测患者生存情况,并提供个性化诊疗与基础研究参考。  相似文献   

5.
目的 探讨影响胶质母细胞瘤患者预后的临床因素.方法 回顾2008年1月至2013年1月于南方医科大学南方医院行显微手术治疗的198例原发胶质母细胞瘤患者的临床资料,对性别、年龄、起病至就诊时间、术前有无癫痫发作、术前KPS评分、肿瘤部位、肿瘤直径、肿瘤是否发生囊变、手术切除程度、术后是否行同步放化疗、术后是否存在颅内感染共11项因素进行生存分析.结果 单因素分析结果示术前有无癫痫发作、肿瘤部位、术前KPS评分、手术切除程度、术后是否同步放化疗、术后是否存在颅内感染对胶质母细胞瘤患者的预后有影响(P<0.05);多因素分析结果示手术切除程度、肿瘤部位、术前KPS评分、术后是否同步放化疗、术后是否颅内感染具有统计学意义(P<0.05).结论 手术切除程度、肿瘤部位、术前KPS评分、术后同步放化疗是影响胶质母细胞瘤患者的主要预后因素,其中手术切除程度是最重要的预后因素;而术后颅内感染的患者生存时间延长,可能与感染诱导的肿瘤免疫有关.  相似文献   

6.
目的采用生物信息分析技术探讨胶质母细胞瘤中和长链非编码RNA GAS5相关的m6A基因的筛选及临床特征分析。方法从开放的癌症基因图谱(TCGA)和基因型组织表达(GTEx)数据平台下载脑胶质瘤样本转录水平数据。根据TCGA胶质母细胞瘤患者GAS5基因的表达量做相关性分析,筛选出GAS5相关m6A基因。通过权重基因共表达网络分析(WGCNA)构建加权基因共表达网络,寻找协同表达的基因模块,筛选GAS5共表达的基因。GAS5共表达的基因和GAS5相关m6A基因取交集。CGGA数据库分析筛选出的基因与胶质瘤患者的临床特征及预后之间的关系。结果分析的13个m6A基因中,相关性系数> 0.4,P<0.001,7个基因(HNRNPC、FTO、KIAA1429、ALKBH5、YTHDF2、WTAP、YTHDC2)与GAS5相关,其中HNRNPC、KIAA1429、YTHDF2、WTAP呈正相关,FTO、ALKBH5、YTHDC2呈负相关。通过构建WGCNA网络,筛选GAS5共表达的基因,brown模块共1 292个基因与GAS5相关性最高(cor=0.84,P=1e-200)。HNRNP...  相似文献   

7.
目的 探讨多形性胶质母细胞瘤(GBM)预后相关的临床因素.方法 回顾性分析160例随访资料完整的GBM,采用Kaplan-Meier法计算生存率及进行单因素分析,Log-rank法进行生存率显著性检验,Cox比例风险回归模型作多因素分析.结果 本组病人术后1年、2年、5年生存率分别是65.3%、34.1%、9.1%.单因素分析显示年龄、肿瘤切除程度、治疗方式是影响GBM生存率的因素.多因素分析显示年龄、肿瘤部位、肿瘤切除程度及治疗方式是与GBM预后相关的独立因素.结论 年龄、肿瘤部位、肿瘤切除程度和治疗方式是影响GBM预后的主要因素,积极的手术治疗和规范化、个体化的综合治疗可有效提高GBM病人的生存率.  相似文献   

8.
目的确定热量限制(CR)和超低热量限制性(LCR)饮食辅助的治疗对胶质母细胞瘤(GBM)患者预后的影响。方法 50例GBM全切病例,术后均经放化疗。15例行热量限制饮食(5040-5 880 KJ/d)+心理引导+高压氧同步辅助化疗(CRPH);5例行超低热量限制饮食(2 091-2 509KJ/d)+心理引导+高压氧同步辅助化疗(LCRPH)。30例对照组病例自行设计饮食,不进行心理引导,行放化疗。随访一直持续到患者死亡。统计分析CRPH及LCRPH对GBM患者预后的改善作用,以及CRPH和LCRPH哪个作用更显著。结果 CRPH组及LCRPH组生存期均比对照组生存期长,且有显著性差异(P值分别0.000和0.000)。而CRPH组与LCRPH组生存期比较,无显著性差异(P=0.092)。结论 CRPH和LCRPH均可明显延长GBM患者的生存期;但CRPH和LCRPH对GBM预后的影响似乎无显著区别。  相似文献   

9.
多形性胶质母细胞瘤(glioblastoma multiforme,GBM),按Kernohan分类属于星形细胞瘤Ⅲ~Ⅳ级,WHO2007年中枢神经系统肿瘤分类标准将其归类为星形细胞瘤Ⅳ级,占中枢神经系统恶性肿瘤的25%。该病男性发病率高于女性,具有家族聚集倾向。以往研究认为该病平均发病年龄为60岁,但近些年患者呈现出年轻化的趋势。  相似文献   

10.
目的 探讨人胶质母细胞瘤(GBM)组织微小核糖核酸-4516(miR-4516)的表达情况及其与病人预后的关系。方法选取2015年1月~2019年5月手术切除的GBM组织89例和颅脑损伤内减压术切除的非肿瘤脑组织35例为对照组,采用qRTPCR检测miR-4516的表达水平,根据miR-4516表达水平的中位数分为高表达和低表达。GBM病人术后随访2年,记录生存情况。结果 GBM组织miR-4516表达水平[(5.32±1.75)]明显高于对照组[(1.13±0.45);P<0.01]。术后2年随访,42例(47.19%)生存,47例47(52.81%)死亡。多因素Cox回归分析显示,miR-4516高表达是GBM生存预后病例的独立危险因素(P<0.05)。生存曲线分析显示miR-4516高表达组2年累积生存率(27.45%)明显低于低表达组(73.68%;P<0.001)。结论 GBM组织miR-4516表达增高,其高表达是病人预后不良的危险因素。  相似文献   

11.
目的 探讨复发性多发胶质母细胞瘤(GBM)预后的影响因素。方法 2005年1月至2012年12月手术切除并获得完整随访的复发性GBM 106例,其中单发78例,多发28例(多发组);根据患者年龄、性别、肿瘤部位、手术切除程度、术后是否放化疗、术前KPS评分从单发GBM中选取与多发GBM相匹配的病例28例作为对照(单发组);多发组根据肿瘤切除程度进一步分为全切组和部分切除组。结果 本组复发性多发GBM占26.4%。多发组中位生存期(4.5个月)明显短于单发组(8.5个月;P <0.05)。多发患者中,全切组中位生存期(7.9个月)明显长于部分切除组(3.7个月;P <0.05)。结论 复发性多发GBM预后较单发患者差;肿瘤切除程度越高,患者预后也越好,建议术中在保证重要功能的基础上尽量多切除肿瘤。  相似文献   

12.
目的探讨长链非编码RNA(Long noncoding RNAs,LncRNAs)H19在人多形性胶质母细胞瘤((glioblastoma mutliforme,GBM)中的表达及其对U87-GBM生物学功能的影响及作用机理。方法实时荧光定量核酸扩增检测系统(Realtime Quantitative PCR Detecting System,qPCR)检测H19在GBM表达;CCK-8试剂盒(Cell Counting Kit-8,CCK-8)检测U87细胞增殖;流式细胞技术(Flow Cytometry,FCM)检测U87细胞凋亡及细胞周期;侵袭小室(transwell)检测U87细胞迁移和侵袭.蛋白质印迹法(Western blot)法检测P53表达。结果 H19在GBM中高表达,上调H19促进GBM的增殖、侵袭、迁移;抑制凋亡;增加了细胞周期S期比例;抑制了P53的表达。结论 H19促进GBM的致癌性。  相似文献   

13.
目的 探讨长链非编码RNA(lncRNA)RGMB-AS1在脑胶质瘤病人预后评估中的作用。方法 选取2014年9月~2017年6月经术后病理检查证实的脑胶质瘤140例(低级别64例,高级别76例),另选取颅脑损伤内减压术中切取正常脑组织25例为对照。实时荧光定量PCR法检测lncRNA RGMB-AS1的表达水平,以RGMB-AS1表达量的中位数为截断值,分为高表达组和低表达组。用Kaplan-Meier法比较总体生存期(OS)和无进展生存期(PFS),用Cox比例回归风险模型分析影响胶质瘤病人预后的因素。结果 140例胶质瘤中,lncRNA RGMB-AS1高表达70例,低表达70例。胶质瘤组织lncRNA RGMB-AS1的相对表达量明显高于对照组(P<0.05)。多因素Cox比例回归风险模型分析结果显示年龄≥50岁、术前KPS评分<80分、WHO分级Ⅲ~Ⅳ级、lncRNA RGMB-AS1高表达是胶质瘤病人PFS和OS的独立影响因素(P<0.05)。lncRNA RGMB-AS1高表达胶质瘤病人PFS和OS较低表达病人均明显缩短(P<0.05)。无论是高级别胶质瘤,还是低级别胶质瘤,lncRNA RGMB-AS1高表达病人PFS和OS较低表达病人均明显缩短(P<0.05)。结论 lncRNA RGMB-AS1表达水平与脑胶质瘤病例级别呈正相关,lncRNA RGMB-AS1高表达脑胶质瘤病人生存期较低表达病人明显缩短。这提示lncRNA RGMB-AS1表达水平可作为脑胶质瘤病人预后评估指标。  相似文献   

14.
目的 探讨长链非编码RNA(lncRNA)SNHG16在人脑胶质瘤组织中的表达及其与病人预后的关系。方法 实时荧光定量PCR检测104例2013年9月至2015年1月本院病理科冻存的胶质瘤组织和2018年4月至2019年1月颅脑损伤内减压术中切除的40例正常脑组织lncRNA SNHG16的相对表达量。以SNHG16表达量的中位数为截断值,将胶质瘤病人分为高表达组和低表达组。随访截止时间为2019年6月,记录总生存期(OS)和无进展生存期(PFS)。结果 胶质瘤组织SNHG16相对表达量明显高于正常脑组织(P<0.001);高级别胶质瘤组织SNHG16相对表达量明显高于低级别胶质瘤组织(P<0.001)。多因素Cox比例回归风险模型分析结果显示,SNHG16高表达是胶质瘤病人OS和PFS缩短的独立危险因素(P<0.05)。生存曲线分析显示高表达组OS(中位数25个月,四分位数18~34个月)和PFS(中位数15个月,四分位数9~18个月)较低表达组(OS中位数35个月,四分位数20~42个月;PFS中位数19个月,四分位数12~20个月)明显缩短(P<0.05)。结论 人脑胶质瘤SNHG16呈高表达,与病人不良生存预后和肿瘤进展有关。  相似文献   

15.
目的 探讨长链非编码核糖核酸(lncRNA)NEAT1在人脑胶质瘤中的表达水平及其临床意义。方法 收集武汉大学人民医院神经外科2008年4月到2013年4月收治的65例脑胶质瘤标本及同期因颅脑手术切除的正常脑组织27例。65例胶质瘤中,WHO Ⅰ~Ⅱ级26例,Ⅲ~Ⅳ级39例。根据胶质瘤组织lncRNA NEAT1表达水平,将65例胶质瘤分成lncRNA NEAT1高表达组(n=38)和低表达组(n=27)。应用RT-PCR检测lncRNA NEAT1的表达水平,用Kaplan-Meier法进行生存分析,用多因素Cox比例风险回归模型分析lncRNA NEAT1的表达水平与病人预后关系。结果 胶质瘤组织lncRNA NEAT1的表达水平(2.893±0.296)显著高于正常人脑组织(1.000±0.297;P=0.001)。WHO Ⅰ~Ⅱ级胶质瘤lncRNA NEAT1的表达水平(2.160±0.270)显著低于WHO Ⅲ~Ⅳ级胶质瘤(3.627±0.312;P=0.005)。lncRNA NEAT1高表达组病人术后生存期明显缩短(P=0.033),术后5年累积生存率显著低于lncRNA NEAT1低表达组(P=0.033)。lncRNA NEAT1表达水平高、病理级别高、KPS评分<80分以及复发时间<3个月是影响胶质瘤病人术后预后的独立危险因素(P<0.05)。结论 lncRNA NEAT1在人脑胶质瘤组织中表达水平明显增高,其表达水平与胶质瘤病人预后显著相关。  相似文献   

16.
目的 探讨原发性脊髓胶质母细胞瘤的临床特点及其预后影响因素.方法 回顾性纳入2008年1月至2015年12月四川大学华西医院神经外科行手术治疗的14例原发性脊髓胶质母细胞瘤患者,总结其临床特征并分析影响患者预后的因素.结果 14例患者中,近全切除4例,部分切除5例,活检5例.9例术后接受放、化疗,3例仅行化疗,2例未行放、化疗.中位随访时间为15个月(5-26个月),1年和2年生存率分别为79% (11/14)和7%(1/14).中位总生存期(OS)为15个月,中位无进展生存期(PFS)为8个月.单因素Log-rank分析显示,年龄以及是否进行术后放疗均为OS和PFS的影响因素(均P〈0.05);术前Karnofsky功能状态评分(KPS)为OS的影响因素(P=0.033),但并非PFS的影响因素(P=0.106);性别、肿瘤切除程度以及病理学结果均非OS及PFS的影响因素(均P〉0.05).单因素Cox回归分析显示,年龄、术后是否放疗均影响OS和PFS(均P〈0.05);而术前KPS仅影响OS(P=0.046).多因素Cox逐步回归分析显示,术后是否放疗为影响OS和PFS的惟一因素(均P 〈0.05),放疗者较未放疗者的生存期长.结论 原发性脊髓胶质母细胞瘤临床罕见且预后极差.肿瘤切除程度与患者的预后无关,术后联合放疗能在一定程度上延长患者的生存期.  相似文献   

17.
目的 探讨苏氨酸/酪氨酸激酶(TTK)在胶质母细胞瘤(GBM)中的表达变化及其作用。方法 计算机检索TCGA数据库,利用生物信息学技术分析GBM组织TTK的表达水平及其与病人生存预后的关系。免疫组化染色分析我院生物样本库中60例脑胶质瘤组织的TTK表达水平。体外培养U251细胞,慢病毒转染构建TTK低表达细胞系,利用Alarma blue试剂盒测定细胞增殖能力,细胞克隆形成实验检测细胞克隆形成能力,流式细胞技术检测细胞凋亡和细胞周期。将不同TTK表达水平的U251细胞接种裸鼠构建移植瘤模型,分析TTK表达水平与移植瘤模型生存期的关系。结果 生信分析结果显示,GBM组织TTK表达水平明显高于低级别胶质瘤及正常脑组织(P<0.05),TTK低表达GBM病人的总生存期更长(P<0.05)。我院60例胶质瘤中,高级别胶质瘤TTK高表达率(69.0%,29/42)明显高于低级别胶质瘤(16.7%,3/18;P<0.05)。下调TTK表达明显抑制U251细胞增殖、促进细胞凋亡(P<0.05)。TTK低表达裸鼠移植瘤模型的生存期明显延长(P<0.05)。结论 GBM组织...  相似文献   

18.
目的 探讨急性脑梗死患者外周血lncRNA SNHG14和miR-145-5p表达水平变化及其与疾病发生风险的关系。方法 选取本院治疗的135例急性脑梗死患者作为研究对象,另选择同期健康志愿者108例作为对照组; 荧光定量反应(qRT-PCR)检测外周血lncRNA SNHG14和miR-145-5p表达水平; Pearson相关性分析lncRNA SNHG14和miR-145-5p表达水平与病情严重程度的关系; 受试者工作特征(ROC)评估 lncRNA SNHG14和miR-145-5p表达水平对急性脑梗死的诊断价值; Logistic回归分析lncRNA SNHG14和miR-145-5p表达水平与急性脑梗死发生风险的关系。结果 与对照组比较,急性脑梗死患者血清lncRNA SNHG14表达水平升高,miR-145-5p表达水平降低; 随着病情程度的增加,lncRNA SNHG14表达水平逐渐升高,miR-145-5p表达水平逐渐降低(P<0.05)。SNHG14表达水平与患者NIHSS评分呈显著正相关(r=0.416,P=0.000),miR-145-5p表达水平与患者NIHSS评分、SNHG14表达水平均呈显著负相关(r=-0.318,P=0.029; r=-0.487,P=0.000)。lncRNA SNHG14和miR-145-5p表达水平与患者OCSP分型、脑梗死面积、血脂异常有关(P<0.05),lncRNA SNHG14对急性脑梗死诊断的AUC为0.708,敏感性为80.74%,特异性为57.78%; miR-145-5p对急性脑梗死诊断的AUC为0.632,敏感性为77.78%,特异性为50.37%。Logistic多因素回归分析显示血脂异常,lncRNA SNHG14,miR-145-5p表达水平是影响急性脑梗死发生的独立危险因素。结论 急性脑梗死患者外周血lncRNA SNHG14表达水平升高,miR-145-5p表达水平降低,并与患者病情有关,可能是急性脑梗死患者潜在诊断标志物,且是疾病的独立预测因子。  相似文献   

19.
目的 探讨lncRNA PIK3CD-AS2 在人脑胶质瘤中的表达及临床意义。方法 计算机检索TCGA和GTEx数据库关于PIK3CD-AS2在胶质瘤和正常脑组织中表达的RNA数据,应用生物信息学方法分析PIK3CD-AS2表达与胶质瘤病人预后的关系。收集2010年9月至2015年6月我院手术切除的胶质瘤组织127例以及2018年1月至2019年10月颅脑损伤内减压术中切除的正常脑组织38例,qRT-PCR检测PIK3CD-AS2表达量。127例胶质瘤病人随访至2020年6月或病人死亡,分析PIK3CD-AS2表达与胶质瘤病人预后的关系。结果 生信分析和临床病例分析结果显示,与正常脑组织相比,胶质瘤组织PIK3CD-AS2表达显著升高(P<0.05);胶质瘤WHO分级越高,PIK3CD-AS2的表达水平也越高(P<0.05);PIK3CD-AS2高表达是胶质瘤病人预后不佳的独立预测因子(P<0.05),PIK3CD-AS2高表达病人总生存期显著低于PIK3CD-AS2低表达病人(P<0.05)。结论 PIK3CD-AS2在胶质瘤中高表达,可作为胶质瘤病人的预后标志物。  相似文献   

20.
目的 研究THBS1在胶质母细胞瘤(GBM)中的表达水平及功能。方法 在癌症基因组 图谱计划(TCGA)和中国脑胶质瘤基因组图谱计划(CGGA)_693、CGGA_325 和 CGGA_301 数据集中提取 数据,对基因表达数据进行标准化处理后,分析THBS1在低级别胶质瘤和 GBM 中的表达差异以及与异 柠檬酸脱氢酶(IDH)突变、1p/19q 共缺失状态和生存预后的关系。基于单细胞测序数据、空间转录组数 据,分析THBS1在胶质瘤组织中的主要分布。采用 CellCall 算法和 MAGIC 算法进一步分析THBS1在细 胞相互作用网络之中的功能和THBS1相关基因及其功能,采用 CIBERSORTx 算法分析THBS1与免疫细 胞浸润的关系。结果 THBS1在 GBM 组织中的表达水平高于正常组织,差异有统计学意义(P< 0.05)。 在 CGGA 和 TCGA 数据集中,THBS1在 GBM 患者中的表达水平高于低级别胶质瘤,差异有统计学意义 (P< 0.01);THBS1在IDH野生型和非 1p/19q 共缺失型患者中的表达水平分别高于IDH突变型和 1p/19q 共缺失型,差异均有统计学意义(均P< 0.01)。在 CGGA_693 和 CGGA_325 数据集中,THBS1基因高表 达患者的生存率低于低表达患者,差异有统计学意义(P< 0.01)。单细胞测序数据分析显示,THBS1主 要在胶质瘤组织的单核 / 巨噬细胞中表达。空间转录组数据分析显示,表达THBS1的单核/巨噬细胞在 空间方面与星形胶质细胞、肿瘤细胞、神经元、少突细胞、少突胶质细胞前体细胞存在共定位。THBS1 阴性的单核/巨噬细胞和THBS1阳性的单核 / 巨噬细胞与肿瘤细胞、神经元之间细胞通信的通路活性及 所依赖的配体 - 受体途径不同。功能富集分析显示,THBS1相关基因参与囊泡介导的转运、自噬、DNA 结合转录因子活性的调节等生物过程。在 4 个数据集中,THBS1高表达组的巨噬细胞 M0 丰度高于低表 达组,差异有统计学意义(P< 0.05)。结论 THBS1在GBM中高表达,与患者较差的预后相关;THBS1 调控巨噬细胞M0浸润,表达THBS1的单核/巨噬细胞可能调控GBM的微环境,进而调控肿瘤发生。  相似文献   

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