胃癌BRCA1基因D17S579位点遗传不稳定性与临床病理关系的研究

研究表明基因的微卫星不稳定性（microsatelliteinstability,MSI）和杂合性缺失（loss of heterozygosity,LOH）可能是引起肿瘤发生的重要因素.中国人胃癌BRCA1基因.的遗传不稳定性研究鲜见报道.本实验对中国人胃癌患者17号染色体D17S579位点的MSI、LOH和BRCA1蛋白表达进行检测,为揭示BRCA1基因作用机制提供实验依据.     

应用激光捕获显微切割技术对肝细胞癌8号染色体短臂杂合性缺失的研究

目的探讨8p杂合性缺失（LOH）的特点及其与肝细胞癌（HCC）临床病理特征的相关性。方法选择8p上5个具有高度多态性的微卫星标记，对62例HCC组织利用激光捕获显微切割（LCM）技术进行LOH分析。结果有56．5％（35／62）的HCC患者在1个或多个基因位点发生LOH。LOH频率最高的3个位点依次为D8S298（51．1％，24／47）、D8S1771（48．8％，21／43）和D8S264（43．5％，20／46）。D8S298位点肝内转移者的LOH频率明显高于无转移者（P〈0．05）；在D8S1771位点，肿瘤直径〉3cm的LOH频率明显高于≤3cm组（P〈0．05）。结论HCC在染色体8p特定位点上LOH明显，在这些区域可能存在一个或多个与HCC发生发展相关的肿瘤抑制基因。8p上部分位点的LOH与临床病理特征有一定的相关性。     

乳腺癌及癌前病变3号染色体短臂杂合性缺失的研究

目的研究乳腺癌及癌前病变中3号染色体短臂（3p）杂合性缺失（loss of heterozygosity,LOH）的发生情况。方法采用聚合酶链式反应及硝酸银染色等方法检测41例原发性乳腺癌及12例癌前病变中3p的11个微卫星位点LOH发生情况;用免疫组化方法检测40例乳腺癌中雌激素受体（ER）、孕激素受体（PR）、脆性组氨酸三联体（fragile histidine triad,FHIT）及人类MutL基因的同源基因（human MutL homologue,hMLH1）的表达情况。结果97％乳腺癌患者发生3p的LOH,检出率较高的位点是D3S1295（53．1％）、D3S1029（43．6％）和D3S1038（52．5％）,分别位于3p14、3021-p22和3p25。D3S1038位点LOH及hMLH1蛋白表达与部分临床病理学参数相关（P〈0．05）。D3S1295的LOH与FHIT蛋白表达负相关（P〈0．05）。癌前病变患者3pLOH发生率为41．7％,检出率较高的位点是D3S1295（27．3％）和D3S1029（16．7％）。最小共同丢失区位于3p14-p25。结论3p14-p25区段可能有与乳腺癌发生发展相关并影响乳腺癌生物学行为的候选抑癌基因,基因的部分缺失可影响其蛋白的表达。     

散发性结直肠癌染色体4p15等位基因杂合缺失的精细定位研究

目的通过在染色体4p15精细定位高频杂合缺失区域的范围．为筛选高频杂合缺失区内存在的散发性结直肠癌相关肿瘤抑制基因提供依据。方法7个荧光标记的微卫星引物与83例散发性结直肠癌的肿瘤和正常组织进行聚合酶链反应。微卫星之间的的平均遗传距离是1．02cM（centi—Morgon，里摩）。产物进行电泳、扫描及杂合缺失分析，并与临床、病理因素进行相关性检验。结果染色体4p15的平均杂合缺失率为21，34％，最高的是D4S3103位点（35．62％）；最低的是D4S2933位点（12．50％）。可能的肿瘤抑制基因的范围在D4S3017-D4S2933之间约1．7cM的遗传距离内，该区域内有PPARGC1A和GBA3两个基因。D4S1546位点杂合缺失与肿瘤直径显著相关（P〈0．05），其余位点与临床病理因索均无显著相关（P〉0．05）。结论染色体4p15精细定位后高频杂合缺失区域的范围限定在D4S3017-D4S2933之间约1．7cM的范围内。该区域内PPARGC1A和GBA3两个基因可能是散发性结直肠癌相关的肿瘤抑制基因。     

散发性结直肠癌患者18号染色体高频杂合缺失的研究

目的：探讨散发性结直肠癌患者18号染色体上抑癌基因相关的杂合缺失（LOH）情况，并探索新的抑癌基因位点。方法：对83例散发性结直肠癌患者基因组DNA用14个不同荧光标记的高度多态性微卫生引物，扩增相应的微卫星位点，平均距离为10厘摩（centi-morgan,cM）。用ABI PRISM377测序仪进行基因扫描，统计各位点杂合缺失率。结果：在12个获得有效数据的微卫星位点中，平均杂合缺失率为36．78％,18p中最高为D18S53（38．09％），18q中最高为D18S474（55．74％）。4位患者的18号染色体所有杂合位点都存在缺失，30位患者的杂合缺失位点不少于50％（平均6个／人）；缺失位点少于50％的有53人（平均1个／人）。结论：结直肠癌患者18号染色体存在高频的LOH，并以整体缺失为特点。存在高频LOH的区域定位有转化生长因子（TGF）信号传导相关基因、结直肠癌缺失基因（DCC）、Rb结合蛋白8(RbBP8），特别是TGF信号传导相关基因MADH2、4、转化生长因子－β1反应元件（TGF－β1）等的缺失可能对结直肠癌的发生有重要影响。18p也有存在未知抑癌基因的可能。     

散发性结直肠癌4号染色体等位基因杂合缺失的研究

目的 通过在4号染色体寻找杂合缺失区域，为定位、筛选高频杂合缺失区存在的散发性结直肠癌相关肿瘤抑制基因提供依据。方法 20个荧光标记的微卫星引物与83例结、直肠癌的肿瘤和正常组织进行聚合酶链反应。微卫星的平均遗传距离是10．4里摩（cm01）。产物进行电泳、扫描及杂合缺失分析，并与临床、病理因素进行相关性检验。结果 短臂（4p）、长臂（4q）的平均杂合缺失率为24．25％、28．56％，可见3个最小的高频缺失区域（Region）：R1：在D4S405和D4s3013（4p14—15．2）之间；R2：在D4s3000和D4s2915位点之间（4q12—21．1）；R3：在D4S407和IMS2939位点之间（4q25—31．1）。D4S1534位点与肝脏转移有关（P〈0．05），其余位点与临床病理因素均无显著相关（P〉0．05）。结论 4号染色体的3个高频杂合缺失区域4p14—15．2、4q12—21．1、4q25—31．1存在散发性结直肠癌发生、发展相关的肿瘤抑制基因。     

胃癌表型与5p15.33位点等位基因丢失相关性研究

目的 探讨胃癌5p15．33区微卫星标记杂合性缺失（LOH）与临床病理学表型的相关性。方法 抽提80例胃癌标本及其配对正常胃黏膜中基因组DNA，应用4个微卫星标记对5p15．33区进行LOH检测并与Lauren分型等临床病理学指标分析。结果 有76例临床信息齐全病例纳入统计分析。5p15．33区4个微卫星标记平均信息性病例比例为71．05％。其中31．58％（24／76）病例至少一个位点检测到LOH，以D5S2849位点LOH频率最高（37．25％）。5p15．33位点LOH以肠型胃癌多见（P〈0．01），与年龄、性别、部位、肿瘤大小、TNM分期及有无淋巴结转移无明显关系。结论 5p15．33区可能存在控制胃癌形态学表型的候选抑癌基因，但该基因可能不是决定其他临床表型的主要基因。     

散发性结直肠癌1号染色体等位基因杂合缺失精细定位研究

目的抑癌基因的杂合缺失（LOH）被认为是结直肠癌形成的通路之一。本实验通过对1号染色体1p36．33～36．31、1q31．1～32、1区域进行杂合缺失精细定位分析，以发现更精确的高频杂合缺失区域。方法在1p36．33～36．31、1q31．1～32．1区域分别选择7个、6个荧光标记微卫星引物与83例结直肠癌的肿瘤和正常组织进行聚合酶链反应（PCR）反应。产物在电泳后进行LOH分析。LOH结果与临床病理参数之间的关系比较采用X^2检验。结果1p36．33～36．31区域平均杂合缺失率是31．47％，以D1S243位点最高，为47．22％（34／72），最低是D1S1347，为7．35％（5／68）。存在两个高频杂合缺失区域：D1S243位点（1p36．33）以及D1S468-D1S2660区域（1p36．32～36．31）。1q31．1～32．1区域平均杂合缺失率是22．98％，以D1S2622位点最高，为36．73％（18／49），最低是D1S412，为16．42％（11／67）。更精确的缺失范围定位在D1S413和D1S2622之间（1q31．3—32．1），大约2cm的遗传距离范围内。1p36．33～36．31、1q31．1～32．1区域各位点的杂合缺失率与性别、年龄、肿瘤大小、生长方式以及Dukes分期无显著相关。提示该区域上的杂合缺失现象普遍存在于各种类型的散发性结直肠癌中。结论1号染色体上存在3个高频杂合缺失区域，D1S243位点（1cm）、D1S468和D1S2660位点之间（3cm）以及D1S413和D1S2622之间（2cm），提示在这些区域存在与结直肠癌相关的抑癌基因。     

应用染色体8p微卫星杂合性缺失标记观察同一肝细胞癌结节内部不同肿瘤细胞群克隆差异

目的用染色体8p微卫星的杂合性缺失（LOH）作为肿瘤的遗传性标记，对同一肝细胞癌结节内部不同肿瘤细胞群是否有克隆差异进行研究。方法在10例肝细胞癌患者，同一肿瘤结节内部不同颜色质地的部分作为不同的细胞群，手工辅助显微切割获取较纯的肿瘤细胞，抽提肿瘤细胞DNA；选取5个染色体8p微卫星位点D8S277、D8S254、D8S258、D8S298、D8S1771，进行微卫星LOH的检测。结果在10例肝细胞癌患者，7例检测出8p微卫星的LOH，3例未检测出8p微卫星的LOH。6例患者在同一肿瘤结节的内部不同肿瘤细胞群之间出现微卫星位点LOH类型的差异，1例患者3个肿瘤细胞群的LOH类型相同。结论在同一肝细胞癌结节的内部，不同的肿瘤细胞群之间存在克隆差异，这种差异说明不同的肿瘤细胞群可能有不同的克隆来源，从而为观察同一肿瘤内不同肿瘤细胞群的生物学特性提供依据。     

散发性大肠癌微卫星不稳定及hMSH2基因突变研究

目的了解散发性大肠癌微卫星不稳定及其hMSH2基因突变情况。方法用6个微卫星位点标记，PCR法检测微卫星不稳定性（microsatelliteinstabilty，MI），银集PCR－SSCP法检测hMSH2基因5、7、8、12、13、15外显子突变。结果60例大肠癌中，微卫星改变总的发生率为50％（30／60）；20例（3333％）表现微卫星不稳定性，其中4例同时有杂合性缺失（lossofheterozygosityLOH），DNA复制错误（RER）阳性11例（1833％）；14例（233％）检测到LOH。8例微卫星不稳定性大肠癌组织检测到第5外显子杂合性突变，而未发现胚系突变。结论散发性大肠癌中微卫星不稳定是一个常见的分子事件，与hMSH2基因胚系突变无关，可能为体细胞性突变或／和缺失所致。     

肝细胞癌微卫星不稳定和杂合性缺失分析

目的 通过检测肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)微卫星不稳定（microsatellite instability,MSI)和杂合性缺失（loss of heterozygosity,LOH)发生频率,探讨上述遗传学改变与HCC临床病理的关系。方法 选择5个微卫星多态性标记对32例HCC进行了MSI与LOH分析。结果 32例HCC中有14例出现MSI,其中有6例出现2个位点MSI,后者癌肿转移率明显低于其他的组（P＝0．001）,在所检5个位点中D1S484和TP53 MSI发生频率最高,而D9S1604昨D8S555遗传学改变多为LOH且发生频率较低。结论 MSI是部分HCC发生、发展进程中一个重要的遗传改变,尤其在在无癌肿转移的肿瘤中。D1S484和TP53是HCC中对MSI敏感的检测位点。     

胸腺鳞癌微卫星不稳定和杂合性缺失的初步探讨

目的 检测胸腺鳞癌微卫星不稳定(MSI)和杂合性缺失(LOH)发生频率,以探讨胸腺鳞癌MSI现象的合适微卫星(MS)位点.方法 选择5个微卫星多态性标记,从石蜡包埋的存档标本中选取9例肿瘤组织和其对应的自身正常组织,提取DNA后用PCR扩增,6%聚丙稀酰胺凝胶电泳,银染显色后进行MSI和LOH分析.结果 9例胸腺鳞癌均出现MSI或LOH.在所检5个位点中D6S1708、TP53、DM、D11S988和D8S136微卫星不平衡发生率分别为66.7%(6/9)、33.3%(3/9)、33.3%(3/9)、33.3%(3/9)和0%(0/9).D6S1708遗传学改变多为LOH(5/6),D11S988位点仅见于LOH.结论 D6S1708、TP53、DM和D11S988可以作为研究胸腺鳞癌微卫星的位点;微卫星不平衡可能在胸腺鳞癌的发生中起一定作用,其与胸腺鳞癌临床病理特点的关系尚需进一步探讨.     

散发性结直肠癌微卫星不稳定性与Mt-p53及bcl-2蛋白表达的研究

目的 探讨散发性结直肠癌微卫星不稳定性民Mt-p53及bcl-2蛋白表达的关系。方法 应用聚合酶链式反应（PCR）技术检测了48例散发性结白肠癌中四个位点的微卫星不稳定性,同时应用免疫组织化学技术对癌基因bcl-2、抑癌基因Mt-p53蛋白的表达。结果 ①48例散发性结直肠癌中四个微卫星位点D2S123、BAT-26、D17S261、D16S799的微卫垦不稳定性检出率分别为12.5％、18.8％、10.4％、8.3％;②Mt-p53蛋白和bcl-2蛋白阳性个分别为66.7％和77.1％;③微卫星不稳定性与mt-p53和bcl-2蛋白的表达均相差个显著（P>0.05）。结论 微卫星不稳定性引起散发性结直肠癌的RER途径是不同于由抑癌基因p53失活及癌基因bcl-2的激活引起的LOH途径的新致癌机制。     

Loss of heterozygosity and microsatellite instability at chromosomal sites 1Q and 10Q in morphologically distinct regions of late stage prostate lesions

PURPOSE: We investigated the incidence of loss of heterozygosity (LOH) and microsatellite instability in sporadic prostate cancer and surrounding tissue at loci encompassing the HPC1 and PTEN genes. MATERIALS AND METHODS: Surgical specimens from 63 patients with sporadic stage T3 or T4 prostatic adenocarcinoma were analyzed for LOH and microsatellite instability. Microdissected tissue included morphologically normal foci, benign prostatic hyperplasia (BPH) and prostatic adenocarcinoma. LOH analysis was performed using 4 microsatellite markers that map in the region of the 1q24 to 25 locus of the putative prostate cancer susceptibility gene HPC1 and 4 that map in the region of the 10q23 locus of the PTEN gene. RESULTS: The incidence of LOH on 10q was consistent with that previously reported in prostatic tumors. LOH associated with the PTEN locus was recorded in morphologically normal foci, BPH and adenocarcinoma. Sequence analysis of PTEN in a limited number of lesions revealed mutations in nontumor and tumor tissue. Analysis of the DS10215 locus showed significant LOH in tumor but not in benign tissue, suggestive of a tumor suppressor gene in this region associated with prostatic neoplastic progression. In contrast, no significant LOH was observed in the same tissues at 4 loci on chromosome 1q. In this study we recorded elevated levels of microsatellite instability in benign prostatic tissue with an additional increase associated with prostatic adenocarcinoma. CONCLUSIONS: The low incidence of LOH in the region of the HPC1 locus in all prostate lesions studied suggests that this putative hereditary prostate cancer susceptibility locus does not appear to have a role in sporadic prostate cancer, at least not in the context of LOH. In contrast, analysis of the same tissues for LOH at chromosome 10q confirmed frequent alterations in this region linked to late stage prostate cancer. PTEN mutations in microdissected morphologically normal and BPH tissue showed alterations in nontumor tissue surrounding adenocarcinoma. Microsatellite instability was increased in adenocarcinomas over an elevated background recorded in surrounding tissues.     

膀胱癌染色体微卫星不稳定性及杂合性丢失

目的　探讨染色体微卫星不稳定性（ ＭＳＩ） 及杂合性丢失（ＬＯＨ） 在膀胱癌早期诊断中的意义。　方法　运用位于４ 、５ 、９ 、２１ 号染色体上的四对微卫星标志,结合ＰＣＲ 银染技术,分别检测２２例膀胱癌患者肿瘤组织及尿脱落细胞染色体ＭＳＩ及ＬＯＨ。　结果　肿瘤及尿液标本ＭＳＩ的发生率分别为２３ ％ 、１９ ％ ,ＬＯＨ 发生率分别为４１ ％ 、１８ ％ ,至少有一个位点出现ＭＳＩ或ＬＯＨ 分别为５９ ％ 及３２ ％ 。不同年龄、性别、临床分期、肿瘤组织分级的患者ＭＳＩ与ＬＯＨ 的发生率差异均无显著性（ Ｐ＞０ ．０５） 。　结论　检查尿液中肿瘤脱落细胞的ＭＳＩ及ＬＯＨ 可能成为膀胱癌筛选及监测复发的辅助方法。     

睾丸肿瘤染色体杂合性丢失及微卫星不稳定性研究

目的　探讨睾丸肿瘤的发生、发展与微卫星不稳定性（ ＭＳＩ） 及染色体杂合性丢失（ＬＯＨ）的关系。　方法　利用ＰＣＲＭＩＡ技术,选用８ 种微卫星标记位点,分析２２ 例睾丸肿瘤ＬＯＨ及ＭＳＩ的变化。　结果　２２ 例中１４ 例出现ＬＯＨ（６４％ ）。定位于第９ 号染色体上的Ｄ９Ｓ６３ 位点的ＬＯＨ 发生率最高为４５％ ,次为第５ 号染色体上的ＡＰＣ位点（４３ ％） 及第１８ 号染色体上的ＤＣＣ位点（２５ ％） ;８ 例表现为ＭＳＩ（３６ ％） ,１７ 例表现为ＬＯＨ 或（ 和）ＭＳＩ,总阳性率为７７％ 。　结论　染色体９ｑ 及５ｑ 上存在的抑癌基因的失活以及微卫星不稳定性改变可能在睾丸肿瘤的发生发展中起重要作用。     

散发性结肠直肠癌肿瘤分化及转移相关基因杂合缺失分析

目的：探讨散发性结肠直肠癌患者2号染色体上可能的肿瘤转移相关基因位点。方法：以2号染色体上30个不同荧光标记的高度多态性微卫星引物对83例散发性结肠直肠癌患者基因组DNA扩增相应的微卫星位点,用ABI PRISM 377测序仪进行基因扫描,检测各位点杂合缺失率,比较与肿瘤分期、分化的关系。结果：24个位点获得有效数据,平均遗传距离为11厘摩（cM),杂合缺失率平均为15．16％,较高的有2个们点：D2S206（2q33-37)的32．08％和D2S364（2q24.2)、31．03％,其余位点的杂合缺失率均小于20．00％;D2S142（2q24.1)、D2S126（2q35)、D2S2211（2q24.2)、D2S305（2q23.3)的杂合缺失率随着肿瘤恶性程度的增加而增高,后2个位点间的缺失有相关性。结论：已知几个错配修复基因位点附近的微卫星位点并无高频杂合缺失发生,D2S2305（2q23.3)到D2S2211（2q24.2)之间区域为整体性缺失,此区域和D2S142（2q24.1)、D2S126（2q35)2个位点与肿瘤的恶性程度相关,提示存在未知的肿瘤分化和转换相关基因的可能。     

Investigation of tumor suppressor genes apart from VHL on 3p by deletion mapping in sporadic clear cell renal cell carcinoma (cRCC)

ObjectivesTo investigate the most recurrent deletion loci on 3p12-p26 by deletion mapping studies by PCR-LOH and BAC array-FISH in sporadic conventional renal cell carcinoma (cRCC) and further, to evaluate the their clinicopathologic significance in cRCC. Comparative allelotyping studies in cRCC and major epithelial carcinomas (MEC) such as lung, breast, and bladder tumors were also carried out to investigate the specificity of the targeted loci in cRCC.Subjects and methodsA total of 40 c-RCC patients were enrolled in this study, categorized in to 2 groups: group I comprises of patients of stages I and II and group II includes patients at stages III and IV. Loss of heterozygosity (LOH) studies were performed by PCR using 15 microsatellite markers of region 3p12-p26 on paired normal-tumor tissues. The recurrent LOH loci found in 27 cRCC tumors were further validated by BAC array-FISH using 23 serially mapped BAC clones. Simultaneously, the allelic deletion status of fragile histidine triad (FHIT) gene was studied by FISH in cRCC and major epithelial carcinoma (MEC) tumors. The numerical aberrations of chromosome 3 were also studied using the centromere enumeration probe (CEP) probe for chromosome 3 to validate the observed allelic losses by BAC array-FISH in cRCC as well as MECs.ResultsOur study revealed 3 affected regions of LOH on 3p in cRCC: 3p12.2-p14.1, 3p14.2-p21.1, and 3p24.2-p26.1 in both group I (stages I and II) and group II (stage III and IV). Comparative allelotyping studies revealed that except for LOH loci D3S2406 (20%), D3S1766 (14%), and D3S1560 (20%), remaining affected loci revealed retention of heterozygosity (ROH) in breast carcinomas. Lung and bladder tumors revealed ROH at all affected LOH loci. FISH with FHIT gene probe revealed deletions in cRCC (88%), breast (30%), and lung tumors (10%). FHIT gene deletions frequency was almost equal in both groups I and II (>70%), whereas a locus 3p13 (D3S2454) revealed the highest LOH in group II (83%) patients in comparison to group I (16%). BAC array-FISH studies in cRCC identified 15 recurrent deletion loci at crucial regions, 3p12.2, 3p14.2, 3p21.3, and 3p24.2-p26 with long continuous deletion of 3p14.1-p26.1 exclusively in patients of stages III and IV. Validation of LOH loci in breast carcinomas by BAC array-FISH with BAC clones mapped at these loci revealed comparatively lower deletion frequency for RP11-59E22 (3p12.2) (30%), RP11-759B7(3p21.1) (12%), and RP11-57D6 (3p25.2, proximal to VHL) (15%) than cRCC.ConclusionMolecular cytogenetic studies by BAC array-FISH was found to be more sensitive over LOH. Deletion patterns on 3p explored that deletion of FHIT and flanking loci may occur as an initiating event followed by deletions at 3p12.2, 3p21.31–3p21.32, and 3p24.2–3p26.1 in the initial stage of development of disease, while continuous large deletions of 3p21.3–3p26.1 and 3p14.1–3p26.1 occur as progressive deletion due to genetic instability. Lack of VHL along with flanking loci in 50% cRCC patients that included both groups I and II supported the hypothesis of both VHL dependent and VHL independent pathways in cRCC tumorigenesis. Comparative allelotyping studies in cRCC and MECs indicated association of specific targeted loci including VHL in cRCC. Further expansion of these studies with characterization of the genes at targeted loci and correlation with clinical outcome will explore the prognostic significance and also provide an insight into the mechanisms of tumor suppressive pathways in genitourinary cancers such as CRCC.