脑脊液Cystatin C改变与格林-巴利综合征关系的探讨

目的对格林-巴利综合征(GBS)患者和对照组脑脊液进行蛋白质组学分析，寻找改变最明显的蛋白质，初步探讨其与GBS的关系。方法分别取GBS疾病组和对照组的新鲜脑脊液，冰丙酮沉淀法提取总蛋白，进行第一向等电聚焦电泳(IEF)和第二向十二烷基磺酸钠聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS PAGE)分离蛋白质组，Image Master 2D图像分析软件对分析胶进行比较分析，识别差异表达明显的蛋白质点。抠取制备胶上相应的蛋白质点，应用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱（MALDI/TOF/MS）得到肽质量指纹图谱(PMF)，搜索SWISSPROT数据库鉴定蛋白质点。结果双向电泳图谱上有6个点在两组间存在明显差异， 4个蛋白质点在GBS疾病组中表达明显上调，2个降低。其中Cystatin C表达下调，是改变最明显的蛋白质点，为本实验首次发现。随后的酶联免疫吸附实验（ELISA）也证实GBS患者的脑脊液中Cystatin C的浓度明显低于对照组［（2.79±0.65）mg/L，（3.65±0.82）mg/L，P＜0.01］。结论Cystatin C浓度在GBS患者脑脊液中的浓度明显降低，可为研究格林-巴利综合征疾病机制提供线索。     

帕金森病患者脑脊液疾病特异蛋白的初步筛选及鉴定

目的:通过比较帕金森病与特发性震颤、头痛患者脑脊液蛋白质谱,筛选和鉴定与帕金森病密切相关的疾病特异性蛋白（disease-specific proteins, DSPs）,寻找帕金森病的生物学标志物。方法:以固相pH梯度等电聚焦(IPG-IEF)为第一向,垂直平板十二烷基硫酸钠-聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS-PAGE)为第二向进行脑脊液蛋白质分离;用图像分析软件PDQuest8.0 分析电泳图谱,寻找有意义的差异蛋白点;运用MALDI-TOF-MS质谱鉴定,并对其中差异显著蛋白采用酶联免疫吸附实验（ELISA）进行鉴定。结果:帕金森病与特发性震颤患者及头痛对照组患者脑脊液蛋白质谱的比较,发现3个有意义的差异蛋白质点,其中载脂蛋白E (apolipoprotein E,Apo E)差异显著。ELISA鉴定结果表明,与特发性震颤\[(3.59±1.07) mg/L\]、头痛患者\[(3.67±0.71) mg/L\]相比,PD组患者脑脊液Apo E水平\[(2.47±1.27) mg/L\]明显下调,差异有统计学意义（P＜0.05)。结论:帕金森病患者与特发性震颤患者、头痛对照组患者脑脊液蛋白表达存在差异,这些差异蛋白可能是帕金森病的DSPs,并有可能成为帕金森病诊断的分子标志物。     

血水草生物碱致钉螺肝脏蛋白质差异表达分析

目的 分析血水草生物碱 (ECA) 致钉螺肝脏蛋白质表达的变化。方法 10 mg/L ECA 浸泡钉螺 36 h 后,解剖活钉螺并收集肝脏,双向电泳分离 ECA 组和清水对照组钉螺肝脏蛋白质,ImageMaster 2D 5.0 软件分析图谱,筛选差异蛋白质,并用 MALDI-TOF-TOF 质谱进行鉴定。结果 ECA 组和清水对照组分别检出 (354±110)、(311±12) 个蛋白点;质谱鉴定获得假定蛋白、ENSANGP00000022175 蛋白、醛脱氢酶、未知蛋白、ENSANGP00000027067 蛋白、类似锚蛋白3的1亚型4亚亚型蛋白、相似A型肝炎病毒短型细胞受体1的蛋白、线粒体异柠檬酸脱氢酶2样蛋白、类似角蛋白的蛋白、角蛋白10、角蛋白1共11个蛋白质,这些蛋白质均为 ECA 处理后表达上调的蛋白质。结论 ECA 可引起钉螺肝脏蛋白质表达发生改变。     

Clus-human蛋白在精神分裂症患者脑脊液中的差异表达

目的：分析精神分裂症患者脑脊液中蛋白质的差异表达。方法：选取精神分裂症及非精神分裂症患者各12例,抽取脑脊液,用蛋白质分离技术———二维聚丙烯酰氨凝胶技术和蛋白质识别与鉴定技术———生物质谱技术筛选脑脊液中标志性蛋白质。结果：精神分裂症组Clus-human蛋白含量为（2.560 6±0.319 2） μg/L,对照组Clus-human蛋白含量为（2.134 9±0.418 7） μg/L,精神分裂症蛋白Clus-human含量与对照组Clus-human含量具有统计学差异（t=2.801,P=0.010）。结论：精神分裂症患者脑脊液中发现Clus-human蛋白,对精神分裂症的诊断可能具有重要意义。     

中枢神经系统脱髓鞘疾病脑脊液蛋白质组学研究

目的建立中枢神经系统脱髓鞘疾病蛋白质组学技术体系，寻找并鉴定与中枢神经系统脱髓鞘疾病发生有关的生物标识物。方法以中枢神经系统脱髓鞘疾病患者的脑脊液为研究对象，分别采用固相pH梯度双向凝胶电泳分离总蛋白质,凝胶经银染显色后,用图像分析软件进行比较分析、识别差异表达的蛋白质，离线应用基质辅助激光解析电离飞行时间质谱得到相应的肽指纹图谱；同时用超高压液相色谱分离酶解肽段，在线采用电喷雾四极杆飞行时间质谱鉴定肽段氨基酸序列；搜索数据库鉴定部分蛋白质。结果分别获得中枢神经系统脱髓鞘疾病患者组和对照组的脑脊液双向电泳蛋白质组表达图谱，筛选并鉴定出表达有明显差异的蛋白质10个，其中在疾病组中血红蛋白有明显上调而前列腺素H2表达下调明显。结论这些差异蛋白可能成为具有临床诊断意义的中枢神经系统脱髓鞘疾病潜在标识物，从而为中枢神经系统脱髓鞘疾病的早期诊断和治疗提供理论和实验依据。     

结核病患者和正常人血清蛋白质双向凝胶电泳差异比较

目的 初步探讨结核病患者与正常人之间血清蛋白质的差异,以期筛选出新的结核病实验诊断标志物。 方法 对10例菌阳肺结核（+组）、10例菌阴肺结核（－组）、10例肺外结核（肺外组）及10例正常人（正常组）分组混合血清应用17cm pH4-7 IPG胶条进行双向凝胶电泳（two-dimensional electrophoresis, 2-DE）,每组平行电泳3块胶条。电泳结束后对2-DE胶条进行考马斯亮蓝染色,染色后用Umax powerlook2000扫描仪以投射方式、300dpi分辨率扫描获取2-DE图谱,然后用2-DE分析软件ImageMaster 2D Platium5.0进行分析。 结果 在正常组、＋组、-组、肺外组中,分别平均可以检测到310±64、307±33、296±54、267±23个清晰可见的蛋白质点。正常组与＋组、-组、肺外组的匹配率分别为(74±2)%、(76±2)%和(68±5)%。通过对4组2-DE图谱比较,＋组与正常组间有21个差异蛋白质点（其中9个上调）,-组与正常组间有18个差异蛋白质点（其中8个上调）,肺外组与正常组间有24个差异蛋白质点（其中7个上调）。将＋组、-组、肺外组合并为结核组与正常组比较有3个差异蛋白质点（其中2个上调）。 结论 结核病患者和正常人血清蛋白质存在差异,有望从血清中筛选出新的结核病实验诊断标志物。本研究建立了两者间血清蛋白质组差异蛋白质的初步模型,但有待进一步验证并进行差异蛋白质鉴定。     

γ射线照射前后IEC-6细胞蛋白质组的差异分析

目的　分析γ射线照射后肠上皮细胞系 (IEC 6)细胞蛋白质组的改变。方法　分别提取正常IEC 6细胞和经过 2 5Gy照射后细胞的蛋白样品 ,采用固相pH梯度双向凝胶电泳技术进行分离 ,考马斯亮蓝染色后经PDQuest软件分析双向电泳图谱 ,对部分差异的蛋白点进行胶内酶切、基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱 (MALDI TOF MS)测定其肽质量指纹图谱 ,在网上检索数据库鉴定差异蛋白 ,并采用RT PCR间接证实其变化。结果　获得了较好的双向电泳图谱。图像分析显示 :在正常IEC 6细胞中检测到 ( 60 8± 3 9)个蛋白质点 ,细胞照射后的样品中检测到 ( 5 95± 3 1)个蛋白质点 ,其中匹配的蛋白点为 3 96个。对表达差异的 16个蛋白质点进行肽质量指纹图谱分析 ,经数据库检索后初步鉴定为一些与代谢、自由基清除、细胞骨架相关的蛋白。RT PCR证实了ERP2 9基因在照射后增强。结论　电离辐射可以诱导IEC 6细胞蛋白质组发生改变。     

盘状红斑狼疮皮损角质形成细胞的蛋白组学初步分析

 【目的】建立盘状红斑狼疮皮损和正常皮肤角质形成细胞的双向电泳图谱，分析二者蛋白质的表达差异及特点。【方法】运用固相pH梯度双向凝胶电泳分离6例盘状红斑狼疮患者皮损及正常皮肤角质形成细胞总蛋白，考马斯亮蓝染色后用ImageMaster 2D图象软件比较分析，识别差异蛋白。【结果】盘状红斑狼疮皮损和正常对照电泳图谱平均蛋白点分别为1566±32和1682±38，平均匹配点数为1286±14 和1314±21，匹配率为82.12%和78.12%。分辨差异蛋白点共22个，11个在皮损高表达，2个在皮损组低表达，有5个点仅在病例组表达，4个点仅在正常对照组表达。【结论】成功获得分辨率高且重复性较好的蛋白质组双向电泳图谱，识别重复表达的差异蛋白，为后续蛋白功能研究奠定基础。     

稳定型心绞痛患者血浆差异蛋白的筛选及验证

目的 分析稳定型心绞痛(SAP)患者与健康对照组血浆中差异表达的蛋白质组,筛选可能与SAP诊断密切相关的血浆生物标记物.方法 采集南方医科大学第三附属医院SAP血浆标本60例,另收集体检科收集的血浆标本作为正常对照组(n=60).下面不变,做凝胶电泳是将各组的血混合的做实验的.取SAP患者组与健康对照组空腹血浆标本各20例(各100 mL),分别等量混合成2组样本,去除血浆高丰度蛋白后,利用双向凝胶电泳技术进行蛋白分离,经差异软件分析后,挖取变化2倍以上的差异蛋白质点,利用基质辅助激光解析电离-飞行时间/飞行时间质谱对差异蛋白点进行鉴定.每组随机各取40例样本,选取差异蛋白血红蛋白δ亚基进行酶联免疫吸附实验验证.结果 SAP患者与健康人血浆相比较,筛选出表达量差异2倍以上的差异蛋白共7种,表达上调的蛋白包括血清白蛋白、血红蛋白α亚基和血红蛋白δ亚基;表达下调的蛋白包括载脂蛋白L1、载脂蛋白C3、载脂蛋白E和补体C4-B.ELISA验证结果表明血红蛋白δ亚基在SAP组样本中表达上调,与双向凝胶电泳结果一致.结论 血浆血红蛋白δ亚基有可能成为稳定型心绞痛早期筛查及诊断的特异性生物标记物.     

原发性与复发性骨肉瘤差异蛋白质组学研究

目的 比较原发性与复发性骨肉瘤差异蛋白质,为寻找骨肉瘤复发的特异标记物提供依据.方法 分别对5例骨肉瘤标本和4例复发性骨肉瘤提取总蛋白,然后双向凝胶电泳,重复3次,银染后扫描用Image2 Master 2DE软件分析寻找差异蛋白,切除差异蛋白质点进行MS+MS/MS质谱鉴定,获取肽质指纹图谱并查询NCBI数据库寻找匹配蛋白质.结果 获得重复性较好的双向电泳银染图谱,原发性与复发性骨肉瘤组织蛋白质点数分别为(1 206±161)和(1 387±185),找到明显差异的蛋白质点42个,并成功鉴定出13个.与原发性骨肉瘤相比,5个蛋白质在复发性骨肉瘤中表达下降;8个蛋白质在复发性骨肉瘤表达水平升高,其中β2微球蛋白在原发性骨肉瘤中表达缺失.结论 原发性骨肉瘤与复发性骨肉瘤存在明显差异蛋白质,β2微球蛋白有可能成为诊断复发性骨肉瘤的分子标记物及检测指标.     

基于蛋白质组学的胸腔积液蛋白标志物筛选与验证

目的 用蛋白质组学技术对比分析良、恶性胸腔积液标本,寻找蛋白标志物为其鉴别诊断提供帮助和新线索.方法 采用双向电泳分离、搜寻蛋白,基质辅助激光解吸飞行时间质谱(MALDI-TOF-MS)鉴定蛋白,ELISA验证蛋白在良恶性胸腔积液样本中具体含量.结果 恶性组胶图对比良性组共显示明显差异蛋白点(上调或下调≥2倍)43个,上调9个,下调34个;对其中7个显著差异点(上调或下调≥3倍)质谱鉴定明确了具体类型;挑选显著差异点中免疫球蛋白λ(Igλ)、结合珠蛋白(Hp)进行ELISA验证,结果表明Igλ在良、恶性胸腔积液中含量差异无统计学意义,Hp含量组间差异有统计学意义(P<0.05).进一步评估显示诊断标准为胸腔积液中Hp<389.02 μg/L时,诊断恶性胸腔积液灵敏度为75.00%,特异度为52.38%.结论 蛋白质组学技术的应用对胸腔积液蛋白标志物搜寻具有较大帮助,本研究搜寻到的标志物Hp对于良、恶性胸腔积液鉴别诊断具有一定价值,值得进一步研究.     

鼻息肉的2-DE图谱建立和蛋白质组学分析

目的:建立鼻息肉及鼻黏膜双向凝胶电泳(two-dimensional polyacrylamide gel electrophoresis,2-DE)图谱,鉴定差异表达蛋白质。方法:收集鼻息肉及鼻黏膜样本各7例,采用固相pH梯度2-DE,凝胶银染,扫描图像,ImageMaster2-DE软件比较分析等方法,识别差异表达蛋白质,通过质谱分析得到相应肽质指纹图谱(peptide mass fingerprint,PMF),采用PeptIdent软件查询Swiss-Protand TreMBL数据库,鉴定差异表达蛋白质。结果:建立了鼻息肉和鼻黏膜蛋白质的2-DE图谱。鼻息肉和鼻黏膜3块凝胶的平均蛋白质点数分别为825±78和936±62;平均匹配点数为682±96和821±78,匹配百分率为82.7%和87.7%;同一鼻息肉的3块胶在蛋白质点位置上有较好的重复性,不同胶间蛋白质点在等电聚焦(IEF)方向偏差为(1.06±0.14)mm,在SDS-PAGE方向偏差为(1.45±0.21)mm。比较分析两种组织各7例样本的2-DE图谱,鼻息肉和鼻黏膜蛋白质点数为1458个和1617个,平均匹配点数为1026个。质谱分析差异蛋白质点40个,获取34张PMF,查询数据库鉴定出蛋白质24个。结论:建立了分辨率高和重复性好的鼻息肉及鼻黏膜2-DE图谱,识别鉴定出一些与鼻息肉病变相关的蛋白质。     

蛋白质双向电泳技术分析志贺菌诱导耐多药相关蛋白

目的:利用双向电泳技术对志贺菌敏感株与诱导耐多药株全菌蛋白进行蛋白质组学比较,寻找耐多药相关蛋白。方法:采用四类抗生素的次抑菌浓度对临床分离鉴定志贺菌敏感株进行诱导耐多药试验;对志贺菌敏感株及诱导耐多药株全菌蛋白进行双向电泳;电泳图谱采用Image Master 2D Platinum软件分析。结果:成功获得志贺菌诱导耐多药株,在志贺菌敏感株与耐多药株全菌蛋白质图谱中分别检测出946±37个和1 096±189个蛋白质斑点;经分析共发现48个差异表达的蛋白点。结论:蛋白质双向电泳技术可以成功应用于志贺菌耐多药相关蛋白的筛选,此图谱为进一步研究细菌耐多药机理奠定基础。     

下咽癌相关血浆肿瘤标志物的蛋白质组学筛选

目的分析下咽癌患者与健康人血浆中差异表达的蛋白质组,筛选潜在的与下咽癌诊断密切相关的血浆肿瘤标志物。方
法取下咽癌患者与健康人空腹血浆标本各6 例分别等量混合成2 组样本,去除血浆高丰度蛋白后,利用双向电泳（2-DE）进行分
离,经软件分析后找出表达量变化2倍以上的差异蛋白点,接着利用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱（MALDI-TOF/TOF）
进行差异蛋白质鉴定,然后利用Western blotting 对α2-HS-糖蛋白的表达量进行验证。结果下咽癌患者与健康人血浆相比较,
筛选出表达量差异2倍以上的差异蛋白点共11 个,其中表达上调的有5个,表达下调的有6个,进行质谱分析后,表达上调的蛋
白有α2-HS-糖蛋白、结合珠蛋白;表达下调的蛋白有免疫球蛋白κ链C结构域、载脂蛋白A1。Western blotting结果表明,α-2-HS-
糖蛋白的表达上调,与双向电泳结果一致。结论下咽癌患者与健康人血浆的蛋白质表达谱表现出一定差异,这些差异蛋白有可
能成为下咽癌患者早期诊断的特异性血浆肿瘤标志物。
     

蛋白质组学方法筛选维甲酸耐药相关蛋白

目的比较维甲酸耐药细胞与敏感细胞的差异蛋白表达谱,分析、筛选维甲酸耐药相关蛋白。方法双向凝胶电泳分离维甲酸耐药细胞株MR2及维甲酸敏感细胞株NB4的全蛋白,经PDQuestv 7．1分析软件筛选出差异表达的蛋白质点,质谱分析获得差异蛋白质的肽质量指纹图谱,以此通过Mascot软件查询SWISS-PROT蛋白数据库,进行差异蛋白质的鉴定,获得候选维甲酸耐药相关蛋白。采用蛋白质印迹试验及半定量RT-PCR在蛋白水平和mRNA水平对差异蛋白质进行验证。结果获得了分辨率高、重复性好的APL细胞的双向电泳图谱,维甲酸耐药细胞株MR2及维甲酸敏感细胞株NB4的pH4-7双向凝胶电泳图谱显示平均蛋白点分别为890±45和912±56。在二者间分析到57个差异蛋白点,23个蛋白点在RA耐药细胞株MR2中上调,34个蛋白点下调。25个差异蛋白点经质谱鉴定,17个获得成功鉴定,对应于13个不同分子,其中一个是未知功能的新蛋白FLJ00279,其余分属于癌蛋白（DJ-1）,转录相关蛋白（MYC启动子结合蛋白1）,分子伴侣[热应激蛋白（HSP）HSPT0、HSP60及蛋白质二硫键异构酶],代谢类蛋白（抑制素、磷酸丙糖异构酶1及钙网蛋白）和信号转导（Rho GDP dissociation inhibitor beta）以及细胞骨架蛋白（ACTG1蛋白、β-5-微管蛋白抑制素及角蛋白10）。癌蛋白DJ-1、calreticulin、HSP60及ACTG1在RA耐药细胞株MR2中为高表达,其余为低表达。蛋白印迹试验结果与双向电泳结果一致且展现了DJ-1和calreticulin在多个异构体上有差异表达。但半定量RT-PCR显示HSP70和HSP60的蛋白质表达差异与其mRNA水平变化无相关一致性。两种实验结果提示翻译后蛋白的修饰或剪切介导了蛋白的表达差异。结论应用双向凝胶电泳连接质谱的蛋白质组学方法筛选到新蛋白FLJ00279以及功能已知的DJ-1、calreticulin、HSP70、HSP60、抑制素及MYC启动子结合蛋白1等维甲酸耐药相关蛋白,虽然它们与维甲酸耐药的直接关系还需进一步证实,但为从多因素角度上认识维甲酸耐药机制提供了新的线索。     

双向电泳技术分析大鼠快慢肌蛋白的表达差异

目的：建立骨骼肌蛋白分离的双向电泳（2-DE）技术体系，分析趾长伸肌与比目鱼肌中快慢肌蛋白的表达。方法：提取大鼠趾长伸肌和比目鱼肌的总蛋白，定量，然后进行第一向等电聚焦0EF）和第二向十二烷基硫酸钠-聚丙烯酰胺凝胶电泳（SDS-PAGE）技术分离总蛋白，GS-800获得凝胶图像，并测量不同凝胶间蛋白斑点在IEF和SDS-PAGE方向上的位置偏差，使用PDQuest7．3软件对凝胶图像进行分析，找出趾长伸肌与比目鱼肌蛋白表达的差异。结果：在趾长伸肌和比目鱼肌组织的蛋白表达谱上，分别检测到680±19和660±27个蛋白点，平均匹配点数为590±13和580±17，匹配率达86．7％和87．8％，不同凝胶间蛋白质点在IEF方向的偏差为（0．51±0．48）mm，在SDS-PAGE方向上的偏差为（0．53±0．42）mm，对比分析趾长伸肌和比目鱼肌组织的2-DE图谱，发现有27个点存在明显的表达差异，在比目鱼肌中高表达的点有12个，在趾长伸肌中高表达的点有15个。结论：建立了骨骼肌蛋白分离的双向电泳技术体系，发现成年大鼠趾长伸肌和比目鱼肌的双向电泳图谱相似，但是有部分蛋白质点存在表达差异．这些差异表达的蛋白，可能与快慢肌本身的生理特性相关。     

双向电泳分析失神经支配大鼠腓肠肌蛋白的表达变化

目的:建立骨骼肌蛋白分离的双向电泳(2-DE)技术体系,寻找失神经支配骨骼肌与正常骨骼肌蛋白的表达差异。方法:建立失神经腓肠肌模型,提取腓肠肌总蛋白,进行第一向等电聚焦(IEF)和第二向十二烷基硫酸钠聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS-PAGE)技术分离总蛋白,使用PDQuest软件对凝胶图像进行分析,并测量了凝胶蛋白斑点在IEF和SDS-PAGE方向上的位置偏差。结果:失神经组和正常组腓肠肌组织3块凝胶的平均蛋白质点数分别为560±16和545±13,平均匹配点数分别为471±19和447±17,匹配率达84.1%和82.1%。对比分析了两种腓肠肌组织的双向电泳图谱发现,平均匹配点数为445±8;发现在失神经支配后有80个点发生了明显而稳定的质和量(大于10倍或小于0.1倍)的改变。不同凝胶间蛋白质点在IEF方向的偏差为(1.203±0.763)mm,在SDS-PAGE方向上的偏差为(1.062±0.529)mm。结论:失神经组和正常组腓肠肌的双向电泳图谱存在明显差异,失神经后表达下调的蛋白可能与维持肌肉正常功能相关,而表达上调的蛋白则可能与肌萎缩的发生过程相关。     

鼻咽癌血清比较蛋白质组学研究

目的 采用双向电泳-质谱技术优化肿瘤抗原筛选方法,筛选鼻咽癌肿瘤抗原.方法 鼻咽癌转移组、鼻咽癌未转移组和正常对照组血清先采用高丰度蛋白去除、脱盐预处理等以优化双向电泳,图像分析3组血清图谱寻找差异蛋白质点,基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱对差异蛋白质点进行鉴定.结果 通过调整、优化各个阶段的实验条件,实验结果比较稳定,重复性也比较好,分辨率得到一定的提高.图谱比较所得29个差异蛋白质点,成功鉴定了23种蛋白质.与正常组比较,转铁蛋白、锌指蛋白544、甲状腺激素结合蛋白、NM23-H1蛋白和FAD合成酶在两组鼻咽癌患者中低表达,12-脂氧合酶、血清淀粉样蛋白A1前体、细胞色素P450、sICAM-1、组织蛋白酶G和组蛋白赖氨酸特异性脱甲基酶1等在两组鼻咽癌中均高表达.其中12-脂氧合酶、sICAM-1、组织蛋白酶G和组蛋白赖氨酸特异性脱甲基酶1在鼻咽癌转移组中比未转移组中表达增高,而热休克蛋白70则只在鼻咽癌转移组表达.结论 双向电泳-质谱技术可发现鼻咽癌发生发展过程中血清蛋白表达谱质或量的变化,从而为鼻咽癌的早期诊断和治疗奠定基础.     

外周血单个核细胞二维凝胶电泳图谱的建立

目的:利用蛋白质组学方法建立肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)及正常人外周血单个核细胞(peripheral blood mononuclear cells,PBMC)的双向凝胶电泳图谱. 方法:利用固相pH梯度双向凝胶电泳分离HCC及正常人PBMC的总蛋白质,凝胶经蓝银显色后,采用PDQuest图像分析软件进行比较分析. 结果:得到了分辨率较高、重复性较好的HCC及正常人PBMC双向凝胶电泳图谱,平均蛋白质点数分别为1206±48及1123±37;组内的平均匹配率分别为90.8%及92.6%.结论:建立了分辨率高且重复性较好的HCC及正常人PBMC双向凝胶电泳图谱,为寻找恶性肿瘤早期诊断、治疗及预后监测的有效指标提供了一条新的途径.