甲型副伤寒沙门菌耐药监测分析

甲型副伤寒沙门菌为临床常见致病菌,致病具有一定的流行性,一旦流行爆发,危害极大.目前抗菌药物种类繁多、使用量大,导致细菌的耐药性日趋严重.因此对甲型副伤寒沙门菌的分布及耐药性的监控,及时掌握该致病菌的情况对临床抗感染治疗尤为重要.     

多重耐药甲型副伤寒沙门菌耐药基因的研究

目的提取贵阳地区1株甲型副伤寒沙门苗基因组,以确定其是否带有抗性基因。方法从30倒样本中筛选一例贵阳地区当前单簇耐药谱最广的菌株。选择一株含抗药性最多的甲型副伤寒沙门菌,提取其基因组,进行PCR扩增Ⅰ类整合子和相关耐药基因。结果通过对该菌Ⅰ类整合子和抗性基因的检测,发现Ⅰ类整合子并携带抗性基因sul2、tetA（G）、blaTEM1等,抗性基因应定位在染色体上。结论多药耐药的甲型副伤寒沙门菌为临床分离株,抗性基因定位在于染色体上,不在以往学者怀疑的3．6kb质粒上。结果显示,此株甲型副伤寒沙门菌的抗性基因应是以Ⅰ类整合子的形式存在染色体上。     

绍兴市甲型副伤寒沙门菌耐药性检测

甲型副伤寒沙门菌是绍兴地区几年来散发性传染病中最常见的病原菌之一 ,为了解本地区甲型副伤寒的耐药情况 ,我们对 1999年绍兴三家医院分离的 172株甲型副伤寒沙门菌进行抗生素敏感性测定 ,现将结果报告如下。1　材料与方法1.1　标本来源　来自绍兴市疾控中心 90份 ,绍兴二院 70份 ,绍兴市人民医院 12份。其中男 10 9例 ,女 6 3例 ,年龄6～ 6 9岁 ,平均年龄为 31.4岁 ,所有菌株均为血源株。1.2　材料　血液双相培养基及 API2 0 E由法国生物—梅里埃公司产品 ,沙门菌属诊断血清系卫生部兰洲生物制品研究所生产。1.3　菌种鉴定　经血液培养…     

82株甲型副伤寒沙门菌药敏试验分析

近年来甲型副伤寒已逐渐取代伤寒而成为沙门菌属感染的主要类型。 2 0 0 1年 4月～ 9月共收治甲型副伤寒 82例 ,均经细菌学检查证实。为了解甲型副伤寒沙门菌的药物敏感及耐药情况 ,将 82株甲型副伤寒沙门菌的药敏试验分析报告如下。1　资料与方法1 1　一般资料　 82株甲型副伤寒沙门菌均来自住院的 1 32例沙门菌感染患者 ,其中男性 5 2例 ,女性 30例 ,年龄 1 4～ 72岁 ,平均 31 3岁。全年均有发病 ,以夏、秋季居高。1 2　实验室检查　 1 32例沙门菌感染患者于入院当日或体温最高时抽血培养。血培养阳性 82例 ,同时作骨髓培养阳性 1 2例…     

甲型副伤寒沙门菌48例临床分析

目的探讨甲型副伤寒沙门菌的临床特点,以提高诊治水平。方法回顾性分析我科甲型副伤寒住院病例的药敏试验结果及临床特点,并与近年伤寒病例做对比。结果甲型副伤寒组消化道症状较伤寒组明显,更易并发肝脏损害,甲型副伤寒沙门菌对喹诺酮类,亚胺培南,三代头孢菌素敏感性好。结论甲型副伤寒早期临床症状不典型,易误诊,对临床常用抗生素的敏感性好。     

112株甲型副伤寒沙门菌药敏分析

目的了解本地区甲型副伤寒沙门菌对抗生素的药敏情况,以进一步指导临床医生合理用药,提高甲型副伤寒防治水平。方法对2002年8月至2004年8月我院分离112株甲型副伤寒沙门菌药敏结果进行回顾性分析。结果112株甲型副伤寒沙门菌中检出耐药菌株101株(90.1%),大多数菌株呈多重耐药。耐2种~4种抗生素有68株(67.3%),耐5种及5种以上抗生素有24株(23.8%)。甲型副伤寒沙门菌对环丙沙星的耐药率为4.5%,对亚胺培南和美罗培南的敏感率均为100%。结论2年内甲型副伤寒沙门菌耐药率呈上升趋势,建议临床医生在药敏检测结果指导下用药。氟喹诺酮类抗生素可作为本地区治疗甲型副伤寒沙门菌首选药物。     

拔牙后感染甲型副伤寒沙门菌败血症1例

1 临床病例 患者张××,女,25岁,公务员,因"发热伴畏寒4 d"于2006年8月8日19时来本院发热门诊就诊.在本院就诊前已在外院门诊就诊,查血常规正常,予抗感染治疗1 d效果不佳.查体:T 39.1℃,急性病容,心肺腹体查未见异常.     

甲型副伤寒沙门菌药物敏感试验及耐药性变迁

目的了解甲型副伤寒沙门菌的耐药及变迁情况,指导临床用药。方法对131株甲型副伤寒沙门菌药敏结果进行分析。结果131株甲型副伤寒沙门菌中对氨曲南、复方新诺明、哌拉西林及哌拉西林/他唑巴坦四种抗菌素均有较高的耐药性,且呈逐年上升趋势,对三代头孢菌素及环丙沙星有较强的抗菌活性。结论应根据甲型副伤寒沙门菌的药敏结果合理选用抗生素。     

甲型副伤寒沙门菌致乳腺脓肿1例报道

呈贡区人民医院近期收治1例非哺乳期右侧乳腺脓肿的病例成年女性,经乳腺脓液培养发现甲型副伤寒沙门菌,现报道如下.1临床资料患者女性,30岁,非哺乳期,1月余前感右侧乳房红肿、疼痛,有时出现发热,体温高达39.5℃,感畏寒、怕冷,伴头痛、头晕,无恶心、呕吐及腹泻,在院外反复多次输液治疗后,症状无明显缓解,现为求进一步诊治于2012年10月6日收住入院.查体:体温36.3℃,脉搏70次/min,呼吸19次/min,血压110/70 mmHg(1 mmHg=0.133 kPa),一般情况可,神清,表情淡漠,查体     

Genetic susceptibility to cancer: the role of polymorphisms in candidate genes

Linda M. Dong, MPH, PhD; John D. Potter, MD, PhD; Emily White, PhD; Cornelia M. Ulrich, PhD; Lon R. Cardon, PhD; Ulrike Peters, PhD, MPH

JAMA. 2008;299(20):2423-2436.

Context  Continuing advances in genotyping technologies and the inclusion of DNA collection in observational studies have resulted in an increasing number of genetic association studies.

Objective  To evaluate the overall progress and contribution of candidate gene association studies to current understanding of the genetic susceptibility to cancer.

Data Sources  We systematically examined the results of meta-analyses and pooled analyses for genetic polymorphisms and cancer risk published through March 2008.

Study Selection  We identified 161 meta-analyses and pooled analyses, encompassing 18 cancer sites and 99 genes. Analyses had to meet the following criteria: include at least 500 cases, have cancer risk as outcome, not be focused on HLA antigen genetic markers, and be published in English.

Data Extraction  Information on cancer site, gene name, variant, point estimate and 95% confidence interval (CI), allelic frequency, number of studies and cases, tests of study heterogeneity, and publication bias were extracted by 1 investigator and reviewed by other investigators.

Results  These 161 analyses evaluated 344 gene-variant cancer associations and included on average 7.3 studies and 3551 cases (range, 508-19 729 cases) per investigated association. The summary odds ratio (OR) for 98 (28%) statistically significant associations (P value <.05) were further evaluated by estimating the false-positive report probability (FPRP) at a given prior probability and statistical power. At a prior probability level of 0.001 and statistical power to detect an OR of 1.5, 13 gene-variant cancer associations remained noteworthy (FPRP <0.2). Assuming a very low prior probability of 0.000001, similar to a probability assumed for a randomly selected single-nucleotide polymorphism in a genome-wide association study, and statistical power to detect an OR of 1.5, 4 associations were considered noteworthy as denoted by an FPRP value <0.2: GSTM1 null and bladder cancer (OR, 1.5; 95% CI, 1.3-1.6; P = 1.9 x 10^–14), NAT2 slow acetylator and bladder cancer (OR, 1.46; 95% CI, 1.26-1.68; P = 2.5 x 10^–7), MTHFR C677T and gastric cancer (OR, 1.52; 95% CI, 1.31-1.77; P = 4.9 x 10^–8), and GSTM1 null and acute leukemia (OR, 1.20; 95% CI, 1.14-1.25; P = 8.6 x 10^–15). When the OR used to determine statistical power was lowered to 1.2, 2 of the 4 noteworthy associations remained so: GSTM1 null with bladder cancer and acute leukemia.

Conclusion  In this review of candidate gene association studies, nearly one-third of gene-variant cancer associations were statistically significant, with variants in genes encoding for metabolizing enzymes among the most consistent and highly significant associations.

     

肺炎克雷伯杆菌质粒介导喹诺酮耐药基因qnr的研究

目的 了解质粒介导喹诺酮耐药基因qnr在肺炎克雷伯杆菌中的流行情况并探讨其相关耐药机制.方法 纸片法和E-test法检测肺炎克雷伯杆菌对抗菌药物的敏感性;多重PCR方法检测菌株中qnr的携带情况;接合实验证实qnr的可转移性;肠道细菌基因间重复序列PCR(ERIC-PCR)分型检测qnr阳性菌株的同源性;变性高效液相色谱技术(DHPLC)检测qnr阳性菌株染色体旋转酶GyrA和拓扑异构酶ParC变异位点.结果 2006年首都医科大学附属北京朝阳医院临床分离的160株肺炎克雷伯杆菌中检出48株qnr阳性菌株,分别为1株qnrA阳性菌,21株qnrB阳性菌,22株qnrS阳性菌,4株同时携带qnrB和qnrS.25株qnrB阳性菌和7株qnrS阳性菌接合实验成功.同源性分析未发现qnr基因在院内有暴发流行.检测到GyrA亚基存在4种氨基酸突变类型,ParC亚基存在2种氨基酸突变类型.结论 本研究分离的肺炎克雷伯杆菌中qnrB和qnrS为流行亚型.qnr基因在不同菌株中可水平转移,与编码GyrA和ParC氨基酸位点突变同时存在时可导致高水平耐药.     

甲型流感易感基因单核苷酸多态性的研究进展

甲型流感病毒是造成季节性流感及历史上流感大流行的主要病毒类型,受到国内外研究者的广泛关注,中国也被公认为新型流感病毒的首发地、多发地,是世界流感监测的前哨,我国流感监测工作在全球起着举足轻重的作用。研究人员利用功能基因组学筛选及病例对照研究,发现多种基因通过不同致病机制影响人类感染流感病毒或加重流感患者病情,宿主基因变异会影响甲型流感的毒性及传播能力,对流感易感性有很大影响。开展甲型流感相关易感基因的研究,从宿主遗传水平探讨甲型流感的发病机制,有助于进一步探索流感病毒入侵宿主的致病机制,从而促进对流感的研究和防治工作的开展。     

新疆维吾尔族人群结核病易感基因的多态性分析

目的 探讨人类自然抵抗相关巨噬细胞蛋白(NRAMP1)基因和维生素D受体(VDR)基因与新疆维吾尔族人群结核病易感性的关联.方法 采用病例对照研究方法,选取224例新疆维吾尔族活动性肺结核患者为病例组,225例新疆维吾尔族健康人为对照组,应用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)方法检测VDR基因VDR-TaqI T/C、FokI C/T位点和NRAMPI基因3’-UTR多态性位点基因型,采用x 2检验分析3个位点多态性与新疆维吾尔族结核病易感性的关联.结果 ①新疆维吾尔族病例组中,NRAMP1基因的3’-UTR位点TGTG/TGTG基因型159例(71.0％),TGTG/del基因型56例(25.0％),TGTGdel/del基因型9例(4.0％);正常对照TGTG/TGTG基因型则为185例(82.2％),TGTG/del基因型36例(16.0％),TGT-Gdel/del基因型4例(1.8％).TGTG/del基因型携带者患结核病的危险性是TGTG/TGTG基因型携带者的1.810倍.TGTGdel等位基因组间分布差异有显著性(P＜0.05).②在病例组中FF、Ff与ff3种基因型分别为81例(36.2％)、127例(56.7％)、16例(7.1％);对照组的相应基因型为91例(40.4％)、120例(53.3％)、14例(6.2％).Fokl位点FF、Ff和ff口基因型组间分布差异无显著性;等位基因F和f组间分布差异无显著性(P＞0.05).病例组中TT、Tt、tt3种基因型分别为154例(68.8％)、66例(29.5％)、4例(1.8％);对照组的相应基因型则为170例(75.6％)、50例(22.2％)、5例(2.2％).TaqI位点TT、Tt和tt基因型组间分布差异无显著性(P＞0.05),等位基因T和t组间分布差异无显著性(P＞0.05).D'=0.017,r2=0.00,两位点不存在连锁不平衡.结论 ①TGTG/del基因型可能是新疆维吾尔族人群结核病易感基因型;TGTG缺失等位基因可能是新疆维吾尔族人群结核病易感基因.②VDR基因Fokl与TaqI位点多态性与新疆维吾尔族人群结核病易感性无关联,FokI和TaqI两位点间不存在连锁不平衡.     

伤寒和甲、乙、丙型副伤寒沙门菌多重PCR及荧光PCR分型方法的建立与评价

目的建立伤寒和甲、乙、丙型副伤寒沙门菌的快速和特异的检测方法,用于沙门菌属内的分型鉴定。方法根据GenBank公布的伤寒和甲、乙、丙型副伤寒沙门菌的保守序列设计引物和改良分子信标探针,建立多重PCR检测方法和实时荧光PCR检测方法。结果采用所建立的多重PCR方法可分别检测到伤寒的3条特异性条带、甲型副伤寒沙门菌的2条特异性条带和丙型副伤寒沙门菌的1条特异性条带,但是乙型副伤寒沙门菌未出现特异性条带。建立的实时荧光PCR方法可以快速、特异、灵敏地检测出伤寒和甲、乙、丙型副伤寒沙门菌,纯DNA和菌液的最低检出限分别可达10 fg/reaction和20 CFU/reaction;对77株细菌的检测正确率达100%。结论建立的实时荧光PCR检测方法比多重PCR方法更能快速、特异、灵敏地检测伤寒和甲、乙、丙型副伤寒沙门菌。     

深圳市甲型副伤寒PulseNet数据库的建立与应用

目的建立深圳市甲型副伤寒PulseNet数据库,用于甲型副伤寒的实时监测和分子流行病学调查。方法采用脉冲场凝胶电泳（PFGE）技术,对深圳市2002-2007年散发和爆发的243株甲型副伤寒沙门菌的染色体DNA进行酶切电泳,用BioNumerics软件对PFGE分型图谱电子化数据分析,建立分子分型数据库。结果深圳市甲型副伤寒菌株各年间差异较小,用Xba酶切仅呈现6种PFGE图谱。同一起甲副暴发的临床分离株具有相同的PFGE图谱。各区和各年代的分离株都存在有相同的PFGE带型。结论深圳市甲型副伤寒沙门菌变异较小,呈长期流行趋势,甲型副伤寒PulseNet数据库的初步建立,对直观地分析各起疫情之间的相互关系,对疫情的控制和传染来源的追踪具有重要意义。     

金黄色葡萄球菌在皮肤病医院对苯唑西林敏感性降低并无性系蔓延

2000年11月，作者得知从Aarhus大学医院皮肤科患者分离到的金黄色葡萄球菌对苯唑西林出现界线耐药（BORSA）。本文旨在描述其表型和基因型，并评估可能的传播途径以干预和阻止进一步蔓延。菌株由脉冲场凝胶电泳鉴定。几个感染控制方案的缺口显示患者间可直接或间接传播。皮肤屏障缺陷、皮肤病患者金黄色葡萄球菌的高携带率和院内双氯西林的高消耗率可促使传播。改善普通感染控制措施和重新评价院内抗生素政策后，该菌的暴发感染消失。