利用基因参照品图谱分析克拉玛依地区HBV基因型

目的了解克拉玛依地区HBV基因型分布状况,比较其与GenBank HBV序列同源性以及进化树分析。方法通过对S基因区B、C、D型GenBank序列分析,研究MboⅠ酶和EarⅠ酶在不同型中具有独特的切点,利用限制性片段多态性分析(PCR_RFLP)区分各型,将各个基因型与GenBank序列进行1∶1同源性比对的进化树分析。结果272份样品有241份成功分型。C型44.8%,B型36.9%,D型4.1%,B C型10.8%,B D型3.3%。少数民族C型40.4%,B型30.7%,D型9.6%。B、C、D型的同源性分别是97.8%~98.7%,96.9%~99.3%,97.5%~99.0%。进化树分析发现,克拉玛依地区的2例D型与新疆哈密地区D型进化距离最近。结论克拉玛依地区HBV基因型B、C、D均有,以B、C型占优势,未检测到A型,D型与新疆哈密地区D型有较近的亲缘关系。     

长春地区乙型肝炎病毒基因分型与肝病发病关系的研究

目的了解长春地区乙型肝炎(乙肝)患者基因型特点及与肝炎严重程度、疾病转归的关系,以指导临床对疾病进展的判断和指导临床用药。方法选择216例乙肝病毒(HBV)阳性肝炎患者,年龄33-87岁,平均(60．5±11．4)岁。病变程度的判断根据2000年《病毒性肝炎防治方案》中的诊断标准。应用巢式聚合酶链反应方法(nPCR)扩增HBV S基因组序列,用第二轮PCR产物直接进行限制性片段长度多态性(RFLP)分析;然后用HBV S基因扩增产物采用Sanger双脱氧链终止法进行DNA测序,将所得到的核苷酸序列及推测的相应氨基酸序列通过DNASIS软件处理,并与GenBank中已发表的HBV中国株及国外株进行同源性比较以确定HBV的基因型,证明用S基因序列的RFLP法HBV分型结果与用全基因组序列的基因分析是一致的。表明S基因序列RFLP法的基因分型结果与S基因测序分型结果是一致的。结果216例HBV DNA阳性标本中单基因型分别检测出A、B、C、D四种,其中单基因型中A型有1例(0．46％),B型有19例(8．8％),C型有175例(81．02％),D型有21例(9．72％)。86例HBV DNA阳性住院患者标本中,C型为感染的主要基因型,69例(80．23％)。B型次之,9例(10．47％)。6例原发性肝癌均为C型;20例肝炎后肝硬化的患者中有17例(85．0％)为C型。结论长春地区HBV基因型仍以C型为主(81．02％),B、D型次之(分别是8．8％和9．72％)。同时结果显示长春地区HBV感染有基因多样性趋势,表现在检测出了A单基因型。肝癌、肝硬化与C基因型HBV的相关性最大。C基因型HBV DNA拷贝数较非C基因型高,提示与HBV DNA在C型患者体内长期存在有关。HBV病毒载量与肝脏病变严重程度的关系无统计学意义。     

浙东地区乙型肝炎病毒基因型分布及临床意义

目的：了解浙江东部地区乙型肝炎病毒（HBV）基因型的分布、优势型及其与临床的相关性。方法：选择浙江东部地区HBVDNA阳性的HBV感染者100例，应用基因芯片对其进行基因分型，其中对7例优势基因型进行S基因序列同源性测序复核。结果：100例HBV阳性的血清标本分型率为96．0％，其中B基因型36例（36．0％），C基因型47例（47．0％），BC混合基因型11例（11．0％）及BCD混合基因型2例（2．0％），未分出型的4例（4．0％）。基因芯片分型与S基因序列同源性测序分型结果一致，乙型肝炎感染者检出的基因型以C、B型为主；重型肝炎与肝癌组中c型检出率分别为60％和55％，明显高于其他基因型（P〈0．05），C、B基因型与HBVDNA拷贝数、丙氨酸氨基转移酶水平及总胆红素在统计学上无显著差异（P〉0．05）。结论：HBV的基因型存在地区性差异，浙江东部地区的优势基因型为c、B型，与以往报道的结论不太一致。不同临床肝炎型与基因型存在一定的相关性，主要表现为重型肝炎和肝癌患者检出的基因型多为C型，提示C基因型患者预后较差。基因芯片分型方法可应用于HBV基因的分型，方便、快速。     

乙型肝炎病毒基因型的研究

目的 研究常德市乙型肝炎病毒(HBV)基因型。方法 随机选择HBsAg阳性携带者65例，慢性乙型肝炎患者5例。应用FQ-PCR方法检测血清HBVDNA含量。采用微板核酸杂交-ELISA技术进行血清HBVA-F6种基因分型。结果 43例HBVDNA定量阳性血中B、D混合型占51．2％(22例)，B型占27．9％(12例)，C型占9．3％(4例)，C、D混合型占4．7％(2例)，B、C混合型占2．3％(1例)，未分型者2例，未发现A型、单纯D型、E型和F型。结论 常德市HBV基因型以B、D混合型为主，次为B型、C型，C、D混合型及B、C混合型。     

儿童乙型肝炎病毒携带者HBV基因型分析

目的检测温州地区儿童乙型肝炎病毒携带者HBV基因型和Ba／Bj亚型的分布，及其与病毒复制水平的关系。方法采用实时荧光PCR技术进行HBV基因分型和HBVDNA定量，对鉴定为B基因型标本，采用PCR-RFLP结合PCR产物直接序列测定其基因亚型（Ba／Bj）。结果温州地区儿童乙型肝炎病毒携带者HBV基因型B、C、B＋C混合型和D型分别占43．92％、53．44％、1．59％和1．06％；C基因型的HBVDNA含量与B基因型之间差异无统计学意义（P2〉0．05）；83例B基因型HBV均为Ba亚型，未发现Bj亚型。结论温州地区儿童乙型肝炎病毒携带者HBV基因型主要为c基因型和B基因型，B基因型HBV主要为Ba亚型。     

乙型肝炎病毒基因型临床意义研究

目的研究乙型肝炎病毒(HBV)基因型与肝脏损伤程度及病毒载量(HBV-DNA)的相关性。方法用微板核酸杂交-ELISA方法对108例慢性HBV感染者进行HBV基因分型,PCR 荧光定量检测血清HBV-DNA水平。结果基因型B型29例(26．9％),C型51例(47．2％),混合型(C D／B C)16例(14．8％),D型4例(3．7％),未分型8例(7．4％)。C型发展致慢性乙型肝炎 (CHB)、肝硬化(LC)和肝细胞癌(HCC)比例显著高于B型,分别为49．0％比41．4％(x2=3．91,P< 0．05);17．6％比6．9％(x2=4．90,P<0．05);13．7％比3．4％(x2=5．06,P<0．05)。C型和混合型 HBV-DNA水平高于B型(1．14×107比2,20×107比1．60×106拷贝／ml,P<0．05)。结论 C型 HBV感染较易引起严重肝脏损伤,同时,HBV基因型可能是影响HBV复制的重要因素之一。     

中国北方5城市慢性乙型肝炎患者的基因分型

目的　了解中国慢性乙型肝炎 (CHB)患者中的基因分型情况。方法　根据GenBank中 18株HBVS基因核苷酸序列 ,设计共同的外引物及其因型特异性内引物 ,对中国北方 5个城市 5 95例CHB患者血清进行基因分型 ,并对A、B、C及B、C混合型各一株进行测序。结果　 5 95例血清标本中 ,A型 8例 ,占 1 4 % ;B型 5 3例 ,占 8 9% ;C型 36 0例 ,占 6 0 5 % ;B、混合型 112例 ,占 18 8% ;A、C混合型 14例 ,占 2 4 % ;A、B混合型 15例 ,占 2 5 % ;A、B、C混合型 6例 ,占 1 0 % ;未分型者 2 7例 ,占 4 5 %。 5城市间在B、C及B、C混合型的分布上有显著性差异 (P <0 0 5 ) ,4份测序结果与PCR基因分型法一致。结论　在 5个城市CHB患者中HBV基因型以C型为主 ,B型次之 ,并见各种混合基因型感染 ,各地区在主要基因型分布上存在显著性差异。     

乙型肝炎病毒A～D基因型及B1、B2、C1和C2基因亚型巢式聚合酶链反应分型法的建立

目的 建立检测乙型肝炎病毒(HBV)基因型和亚型特异性巢式聚合酶链反应(nPCR)分型法.方法 用DNAStar软件比较分析GenBank中登录的A～H 8种基因型HBV全基因组序列,用Primer Premier 5.0软件进行引物设计,建立nPCR分型法.该法在第一轮扩增基础上,第二轮分为3步扩增:第一步用Mix A扩增,检测B、D基因型和C1、C2亚型;第二步用Mix B扩增,检测A基因型;第三步用Mix C扩增,检测B1和B2亚型.应用该法检测68份慢性HBV感染者的血清样本,并从中随机选取15份样本的PCR产物直接测序,以验证该法的准确性.结果 该法检测68份慢性HBV感染者血清样本中,23.53%(16/68)为B2亚型,11.76%(8/68)为C1亚型,48.53%(33/68)为C2亚型,1.47%(1/68)为D型,11.76%(8/68)为B2C2混合型,1.47%(1/68)为C2D混合型,1.47%(1/68)为B2C1D混合型.随机选取15份样本测序分型,结果 与PCR法一致.结论 nPCR分型法简单快速,具有较高的灵敏度和特异度,可检测A～D基因型和B1、B2、C1、C2亚型.     

贵州省四城市乙型肝炎病毒感染者病毒基因型调查研究

目的 调查贵州省4城市乙型肝炎病毒（HBV）感染者的病毒基因型及其与临床的关系。方法 选择贵阳、遵义、凯里、都匀4城市慢性HBV感染患者共786例，其中无症状携带者（ASC）346例，慢性肝炎（CH）313例，肝硬化（LC）77例，肝细胞肝癌（HCC）50例。用S基因限制性片段长度多态性确定基因型，直接测序分析B基因亚型，比较主要基因型地区分布及临床特征。结果 786例中，B基因型497例（63．23％），C型275例（34．99％），A型7例（0．89％），D型7例（0．89％），未发现E、F型。B型的分布：凯里市最高（96．04％），遵义、都匀市其次（78．79％、64．52％），贵阳市最低（53．14％）。C型的分布，贵阳（45．84％）高于都匀（34．41％）、遵义（13．13％）及凯里市（3．96％），差异有统计学意义（P〈0．05或P〈0．01）。94例B型感染者中，93例为Ba（98．94％）、1例为目亚型。从ASC、CH、LC到HCC组，B型的分布逐渐降低，而C型在各组的分布逐渐增高。与B型相比，C型感染者年龄较大；ALT水平较高（P〈0．05）；HBeAg阳性较低（P〈0．025）。结论 贵州省存在A、B、C、D4种HBV基因型，但以B型为主，C型其次，A、D型极少。B型中又以Ba亚型为主。B、C基因型在贵州省4城市的分布有一定差异。     

HBV基因型与耐药变异的关系

目的探讨乙型肝炎病毒（HBV）基因型与核苷（酸）类似物耐药变异的关系。方法湖南省衡阳地区122例慢性乙型肝炎患者接受拉米夫定治疗（100mg／d）48-96周,发生耐药变异者改用阿德福韦酯治疗（10mg／d）96周。采用直接测序法进行HBV基因分型,同时检测拉米夫定、阿德福韦酯和恩替卡韦耐药变异位点。结果122例慢性乙型肝炎患者中,B基因型86例（70．49%）,C基因型24例（19．67％）,未分型12例（9．84％）。42例检出拉米夫定变异株,其中B基因型32例,C基因型10例,B、C基因型拉米夫定耐药变异率分别为37．21％（32／86）和41．67％（10／24）,差异无显著性（x^2=0．16,P=0．69）;42例经阿德福韦酯治疗48周和96周的变异发生率分别为0．00％（0／42）和2．38％（1／42）,B、C基因型阿德福韦酯耐药变异率分别为3．13％（1／32）和0．00％（0／10）。拉米夫定耐药变异类型主要为rtM204V＋rtL180M（35．71％）和rtM204I（38．10％）;B、C基因型比较,拉米夫定耐药变异类型差异无显著性（x^2=17．44,P=0．23）。结论湖南省衡阳地区HBV基因型以B型为主,C型次之;HBV基因型对拉米夫定耐药变异发生率及变异类型无明显影响。     

Hepatitis B virus (HBV) genotypes in the Czech Republic

Hepatitis B virus (HBV) was genotyped based on sequencing and analysis of nucleotide sequences of HBV S gene in sera samples from 176 patients with viral hepatitis B from all over the Czech Republic. The most frequent genotype A was detected in 118 (67.1%) of the patients, followed by genotype D found in 50 (28.4%) of the patients. Genotypes B and C were identified in 6 (3.4%) and 2 (1.1%) of the patients, respectively. The incidence of genotype A statistically significantly increases with age. There is no statistically significant correlation between genotypes A and D and gender or locality (region). Genotypes B and C, found mainly in South East Asia, were first detected in the Czech Republic. Detection of these genotypes in both foreigners and Czech population is suggestive not only of import but also of transmission of these genotypes in the Czech Republic. Fylogenetic analysis documents dissimilarity levels between HBV isolates. Based on the amino sequence derived, the percentages of HBV subtype determinants d (68.6%) and y (31.4%) were established. The gene S sequencing analysis proved suitable for HBV genotyping.     

Pattern and molecular epidemiology of Hepatitis B virus genotypes circulating in Pakistan

The continuously mutating nature of Hepatitis B virus (HBV) is responsible for the emergence of varying genotypes in different regions of the world affecting the disease outcome. The objective of the current study was to find out the pattern of HBV genotypes circulating in Pakistan. HBV genotypes were determined in HBV chronic patients of different age and gender from all the four different geographical regions (provinces) of Pakistan for a period of 2 years (2007–2009). Out of the total 3137 consecutive patients, 300 (175; 58.3% males and 125; 41.7% females) were randomly selected for HBV genotype A through H determination using molecular genotyping methods. Total 269 (89.6%) isolates were successfully genotyped where as 31 (10.3%) samples failed to generate a type-specific PCR band and were found untypable. Out of the successfully genotyped samples, 43 (14.3%) were with type A, 54 (18%) were with type B, 83 (27.6%) were with type C, 39 (13%) were with type D, 2 (0.6%) were with type E, 4 (1.3%) were with genotype F and total 44 (14.6%) were with mixed HBV infections. Of the mixed genotype infection cases, 16 were with genotypes A/D, 9 were B/C, six were A/D/F, five were with genotypes A/F, two were with A/B/D and B/E and one each for A/C as well as A/E genotypes. Four common genotypes of HBV found worldwide (A, B, C & D) were isolated from Pakistan along with uncommon genotypes E and F for the first time in Pakistan. Overall Genotype C is the most prevalent genotype. Genotypes B and C are predominant in Punjab & Balochistan and Khyber Pakhtoonkhwa, respectively whereas genotype A in Sindh.     

100例乙型肝炎病毒基因分型的探讨

目的:为了解宁波及毗邻地区乙型肝炎患者HBV基因型分布、优势型与临床的相关性。方法:选择宁波及毗邻地区HBV DNA阳性的HBV感染者100例,应用基因芯片对其进行基因分型,其中7例优势基因型进行S基因序列同源性测序复核。结果:100例HBV阳性的血清标本分型率为96.0%,其中B基因型36例(37.5%),C基因型47例(48.9%),BC混合基因型11例(11.5%)及BCD混合基因型2例(2.1%),未分出型的4例。乙型肝炎感染者检出的基因型以B、C型为主;重型肝炎与肝癌组中C型检出率分别为60%和55%,明显高于其他基因型(P<0.05),B、C基因型与HBV DNA拷贝数、丙氨酸氨基转移酶水平及总胆红素在统计学上无显著差异(P>0.05)。结论:基因芯片分型方法可应用于HBV基因的分型。宁波及毗邻地区的HBV基因型以B、C为优势基因型,重型肝炎和肝癌患者检出的基因型多为C型,提示C基因型患者预后较差。     

内蒙古部分地区乙肝病毒基因型分布特点研究

目的研究内蒙古部分地区HBV基因型的分布特点,为推测内蒙古地区乙肝的流行趋势提供数据资料。方法对内蒙古地区46份乙肝大三阳血样进行HBVDNA提取,之后用PCR法扩增HBV DNA的S基因片段,再对PCR体系进行基因测序,之后基因分型。结果B型1例(2.17%),C型43例(93.48%),D型2例(4.35%)。结论我区HBV DNA基因型分布以C型为主。     

乙型肝炎病毒(HBV)耐药基因突变检测研究

目的 建立HBV基因分型、耐药变异以及前C区/BC P区突变检测技术,为乙型病毒性肝炎诊断及监测提供依据.方法 选取某院2010年1月～2011年1月收治的54例乙型病毒性肝炎患者的血清样本,利用MassARRAY Assay 和PCR技术对样本进行耐药基因检测.结果 ① 54例患者中B基因型28例(51.85％)；C基因型22例(40.74％)；B,C混合基因型2例(3.70％)；无D基因型；B,C,D以外的其他基因型1例(1.85％).②54例患者中,37例对拉米夫定耐药,37例患者对拉米夫定耐药的患者中,突变基因型均为B和C基因型.突变基因型主要是180M型(56.76％),无207I型,而且突变基因多见于C基因型,比例为72.97％,高于B基因型(27.03％),比较差异有统计学意义(P＜0.05).结论 对拉米夫定耐药的患者中,HBV-DNA突变基因型主要是180M型,而且多见于C基因型,MassARRAYAssay技术可以准确检测HBV基因型及耐药基因突变位点,可以为临床诊断治疗提供依据.     

下呼吸道分离白色假丝酵母菌基因型、药敏试验和临床相关因素分析

目的了解医院近两年来下呼吸道分离白色假丝酵母菌的基因分型和不同基因型药敏试验结果与临床相关因素的关系。方法以随机扩增PCR对60例下呼吸道分离白色假丝酵母菌进行基因分型和药敏试验,分析感染患者的临床资料。结果下呼吸道分离的60株白色假丝酵母菌基因型可分为5型:A型30株(50.0%),B型13株(21.7%),C型10株(16.7%),D型5株(8.0%),E型2株(3.0%);方差分析表明,前3种基因型白色假丝酵母菌对氟康唑、5-氟胞嘧啶敏感性差异有统计学意义(P<0.05);A型白色假丝酵母菌与B型和C型对氟康唑的敏感性差异有统计学意义(P<0.05);B型对5-氟胞嘧啶的敏感性与A型和C型差异有统计学意义(P<0.05);感染C型白色假丝酵母菌的患者死亡率与A、B型比较差异有统计学意义。结论随机扩增PCR法简捷、特异性强、重复性好,可作为白色假丝酵母菌的分型研究;白色假丝酵母菌对不同的药物敏感性可能与特定基因型有一定相关性,其毒力也可能有所不同。     

江苏省宜兴地区丙型肝炎病毒基因分型研究

目的了解江苏省宜兴地区丙型肝炎病毒（HCV）基因型分布特征和病毒变异情况。方法对宜兴市人民医院收治的158例HCV抗体阳性患者血清进行HCV RNA检测，对阳性标本进行Simmonds分型，采用5’非编码区（5’NCR）1、2、3、1b型特异性引物进行PCR扩增，并对1b型和2型各1株的PCR产物测序验证。分析不同性别、临床类型的丙型肝炎患者基因型分布差异。结果158份血清中，有95份为HCV RNA阳性，其中1b型80份（84．2％），2型5份（5．3％），1b／2型的混合感染5份（5．3％），不能分型的5份（5．3％），1b型的序列与GenBank J-4株的同源性为99．2％，2型与GenBank J-6株的同源性为97．7％。男性和女性在基因型总体分布上存在差异（P〈0．05），并且在单一型感染和混合型感染的分布上差异亦有统计学意义，不同临床类型的丙型肝炎中HCV基因型分布未显示差异。结论江苏省宜兴地区HCV以1b型为主，男女患者HCV基因型分布差异有统计学意义，而不同临床类型的HCV基因型分布无显著差异，基本反映了本地区HCV感染的特点。     

中国11城市乙型肝炎病毒慢性感染者中乙型肝炎病毒基因型分布

目的了解中国乙型肝炎病毒（HBV）慢性感染者中HBV基因型的分布情况。方法收集北京、清远、深圳、石家庄、汉川、南京、长春、济南、聊城、宁波和温州市共1214份HBV DNA阳性的慢性HBV感染者血清样本,用型特异性引物聚合酶链反应法（PCR）进行基因型测定,并对其中部分样本以PCR产物直接测序验证。结果在1214份血清中,检测到A基因型9例,占0．7%;B基因型345例,占28．4%;C基因型709例,占58．4%;B、C混合基因型（B＋C）151例,占12．4%。未检测到其他基因型。北方地区（长春、北京、石家庄市等）慢性HBV感染者中,C基因型比例较高,分别为58．2%、67．5%和63．6%,山东省聊城和济南市的C基因型比例分别高达90．2%和87．9%。随地理位置南移,B基因型比例逐渐增加,广东省清远和深圳市的B基因型比例分别为71．4%和63．6%。结论HBV基因型分布有明显地区差异。在中国慢性HBV感染者中,HBV C和B基因型为主要流行株。北方地区以C基因型为优势株,而南方地区则B基因型较为多见。