首页 | 本学科首页   官方微博 | 高级检索  
相似文献
 共查询到20条相似文献,搜索用时 484 毫秒
1.
采用网络药理学方法筛选石菖蒲、郁金的化学成分和作用靶点,分析石菖蒲配伍郁金治疗癫痫的作用机制。通过中药系统药理数据库(TCMSP)检索石菖蒲、郁金所有化学成分并筛选作用靶点,构建成分靶点PPI网络。通过PharmGkb数据库检索癫痫相关基因,采用Cytoscape软件绘制疾病靶点PPI网络。利用Cytoscape软件进行网络合并,筛选核心网络,进一步进行基因GO功能和KEGG通路富集分析,并通过实验研究验证。检索出石菖蒲105个化学成分、郁金222个化学成分,根据OB,DL值筛选出19个化合物作为有效成分候选化合物,其中石菖蒲4个化学成分、郁金15个化学成分。通过TCMSP共检索出88个靶点蛋白,构建成分靶点PPI网络。通过PharmGkb数据库检索出癫痫相关基因29个,建立疾病靶点网络。利用Cytoscape软件及插件进行网络合并和核心网络筛选,共筛选出69个基因。通过GO功能分析和KEGG通路分析,发现抗癫痫作用机制与催乳素信号通路、HTLV-Ⅰ感染信号通路、MAPK信号通路、单纯疱疹感染信号通路有关。通过进一步实验验证发现癫痫大鼠血清泌乳素水平明显升高,癫痫发作24 h大鼠海马CA1区神经元变性、坏死、脱失,部分神经元间隙水肿。石菖蒲配伍郁金的可能机制与催乳素血清水平、MAPK信号通路、HTLV-Ⅰ感染、单纯疱疹感染有关。分析可能与HTLV-Ⅰ病毒、单纯疱疹感染引起病毒性脑炎有关,损伤神经细胞,引起癫痫发作。  相似文献   

2.
目的采用网络药理学方法筛选百合-熟地黄药对治疗抑郁症的作用靶点,明确抗抑郁作用机制。方法通过中药系统药理数据库(TCMSP)检索百合、熟地黄的所有化学成分并筛选作用靶点,构建成分靶点PPI网络。通过PharmGkb数据库检索与抑郁症相关基因,采用Cytoscape软件绘制疾病靶点PPI网络。利用Cytoscape软件进行网络合并,筛选核心网络,进一步进行基因GO功能和KEGG通路富集分析。结果检索百合-熟地黄药对的所有化学成分,共检索出162个化学成分,根据OB、DL值筛选出9个化合物作为有效成分候选化合物。通过检索中药系统药理数据库(TCMSP)共检索出109个靶点蛋白,构建成分靶点PPI网络和疾病靶点PPI网络。利用Cytoscape软件及插件进行核心网络筛选。基因GO功能分析提示涉及生物过程、分子功能、细胞组成三方面。基因KEGG通路富集分析发现与细胞衰老负调控、组蛋白H2A单泛素化、分子伴侣介导的自噬相关。结论百合-熟地黄药对治疗抑郁症的可能机制是调节细胞衰老负调控、组蛋白H2A单泛素化、分子伴侣介导的自噬等机制。  相似文献   

3.
目的应用网络药理学方法预测何首乌-石菖蒲药对治疗阿尔茨海默病的作用靶点及相关信号通路,探讨其作用机制。方法通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)检索并筛选何首乌、石菖蒲的潜在活性成分,并查询活性成分作用靶点,采用DrugBank数据库和Pharmmapper服务器预测有效化学成分的作用靶点,采用Cytoscape3.7.1软件构建活性成分-靶点网络;通过DrugBank、DisGeNET、HPO数据库检索阿尔茨海默病相关基因;将活性成分作用靶点和阿尔茨海默病相关基因进行比对,得到交集靶点,利用STRING数据库构建蛋白相互作用网络;使用Cytoscape3.7.1软件根据度值、介数和紧密度筛选关键靶点,应用Metascape数据库分析关键靶点的KEGG信号通路和GO分子功能;通过MTT、ELISA和qPCR实验验证何首乌-石菖蒲对PC12细胞的保护作用。结果共筛选出何首乌-石菖蒲药对有效成分15个,对应靶点280个,与阿尔茨海默病交集靶点共123个,12个关键靶点的前10条KEGG通路和前20个GO分子功能涉及炎症反应和凋亡等。细胞实验表明,何首乌-石菖蒲药对能有效提高PC12细胞存活率,抑制细胞炎症反应,并抑制p38MAPK/NF-κB信号通路激活。结论何首乌-石菖蒲药对的多种有效成分以协同方式与多个靶点、多种途径相互作用,主要通过抑制炎症反应、抗凋亡等对阿尔茨海默病发挥重要治疗作用。  相似文献   

4.
目的:基于网络药理学研究石菖蒲-郁金治疗阿尔兹海默症(AD)的作用机制。方法:通过TCMSP数据库筛选石菖蒲、郁金的有效成分,找出其所对应的相关靶点,利用UniProt数据库进行靶点蛋白与基因名的转换,在DisGeNET中寻找AD的基因信息,借助韦恩图找到石菖蒲-郁金与AD相关联的核心靶点基因,利用DAVID数据库对核心靶点基因进行基因本体(GO)功能、京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。使用Cytoscape 3.9.1、STRING软件构建可视化“疾病-通路-靶点-药物”网络图与蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络图,得到治疗AD的基因蛋白。结果:筛选获得石菖蒲-郁金有效成分19种,潜在靶点136个,关键靶点基因40个,其中以蛋白激酶1(AKT1)、肿瘤坏死因子-α(TNF-α)、半胱天冬酶3(CASP3)、一氧化氮合酶3(NOS3)、氧化物酶体增殖物激活受体(PPARG)、氧化氢酶(CAT)等靶点作用较为突出。GO功能富集分析显示,GO功能条目主要有血管生成正调节、细胞核、质膜组成成分、序列特异性DNA结合等。KEGG通路富集分析发现,脂质与动脉粥样硬化通路在所有相...  相似文献   

5.
目的:通过网络药理学和分子对接探究丹参-郁金治疗多囊卵巢综合征(PCOS)的作用机制。方法:获取丹参、郁金的中药活性成分及其作用靶点,检索PCOS疾病相关靶点,将二者取交集后利用Cytoscape 372构建“药物-成分-共同靶点”网络。并将共同靶点导入string数据库构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络图。再将共同靶点基因导入DAVID数据库进行基因本体(GO)富集分析和京都基因和基因组百科全书(KEGG)富集分析。最后根据活性成分、作用靶点的相关节点参数进行排序,使用AutoDock Tools将核心活性成分和筛选出的靶基因编码的蛋白进行分子对接。结果:丹参、郁金共筛选出潜在活性成分80个,其中木犀草素、丹参酮Ⅱa、β谷甾醇等19种为主要活性成分,活性成分的作用靶点共157个。PCOS疾病相关靶点1 847个,交集靶点为93个,PPI网络及拓扑学分析显示AKT1、TP53、IL6、VEGFA、MAPK3、MAPK1是丹参、郁金治疗PCOS的核心靶点。GO功能富集分析显示丹参-郁金主要参与RNA信号转导、酶的调控等生物过程,KEGG通路富集分析得到了癌症信号通路、PI3K/AKT、FoxO、HIF-1等20条相关性最高的通路。将核心靶点编码的蛋白作为靶点分别与对应的药物核心活性成分对接,结果良好。结论:通过网络药理学研究及分子对接验证,显示丹参-郁金可通过多靶点、多信号通路对PCOS的疾病发生及进展起到一定的治疗、干预作用。  相似文献   

6.
目的运用网络药理学技术, 从分子水平探讨远志-石菖蒲药对异病同治抑郁症和AD的作用机制。方法检索TCMSP、TCMID、ETCM数据库并结合文献分析, 获得远志-石菖蒲药对的有效成分;检索GeneCards、TTD、CTD数据库获得抑郁症和AD疾病靶点, 通过SwissTargetPrediction平台预测药对有效成分的作用靶点, 获得药对与疾病的交集靶点;采用Cytoscape 3.6.1构建远志-石菖蒲药对"成分-共有靶点-疾病"相互作用网络, 借助Metascape平台进行GO功能与KEGG通路富集分析, 并进行分子对接验证。结果通过检索数据库与文献分析, 获得远志-石菖蒲药对78个有效成分, 对应41个异病同治靶点, GO功能主要富集于对脂多糖的反应、细胞对氮化合物的反应, KEGG通路主要富集于脂质与动脉粥样硬化、钙信号通路、5-羟色胺能突触和胰岛素抵抗等, 核心靶点为PTGS2、ESR2等。分子对接显示, 大部分核心成分与核心靶点可形成稳定构象。结论远志-石菖蒲药对异病同治具有多成分、多靶点、多途径的特点, 可通过远志皂苷元、1-carbobutoxy-β-carboli...  相似文献   

7.
目的:基于网络药理学与分子对接,探讨丹参-石菖蒲-丁公藤治疗排卵障碍性不孕症的作用机制。方法:采用TCMSP筛选出丹参、石菖蒲、丁公藤的有效活性成分及对应靶点,通过GeneCards数据库找出疾病靶点,并在UniProt数据库中将靶点基因名称标准化。通过韦恩图的绘制寻找出药物-疾病的潜在靶点基因,运用STRING数据库和Cytoscape构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络。利用Cytoscape选出关键靶点,导入DAVID数据库进行基因本体(GO)功能和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。通过AutoDock与Pymol将关键活性成分和核心靶点进行分子对接验证。结果:共获得丹参-石菖蒲-丁公藤的70种有效活性成分,1071个潜在靶点。共得到GO功能富集条目376个,其中生物过程234个、细胞组分68个、分子功能74个。KEGG通路富集分析共得到通路93条。分子对接结果显示,药物主要活性成分与疾病关键靶点均有较好的结合活性。结论:丹参-石菖蒲-丁公藤的多种有效成分通过不同的通路发挥其治疗排卵障碍性不孕症的作用,具有良好的临床运用前景。  相似文献   

8.
目的:采用网络药理学和分子对接技术深入研究逍遥散抗抑郁的机制,为临床诊断与治疗提供理论上的依据。方法:首先使用TCMSP检索柴胡、当归、白芍、白术、茯苓、甘草、干姜、薄荷的主要活性成分,并筛选出口服生物利用度≥30%、类药性≥0.18的中药作用靶点,再使用GeneCards、Pharm Gkb、TTD、DrugBank等数据库系统筛选出抑郁症的有关靶点,并获取交集基因,将抑郁症的相关基因与逍遥散的有效活性成分进行交集,最后使用STRING构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络,使用Cytoscape 3.8.0应用软件查找PPI网络系统核心,构建“中药-疾病-靶点”通路,进行基因本体(GO)功能和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。最后运用Pymol软件对逍遥散的有效活性成分与抑郁症疾病靶点进行分子对接。结果:获得逍遥散有效活性成分161种;逍遥散抗抑郁靶点2588个,其中核心靶点6个;GO生物过程2247条,KEGG通路179条。分子对接结果显示,逍遥散中柚皮素、利可查尔酮、木犀草素、槲皮素均能较好地与抑郁症靶蛋白结合。结论:逍遥散抗抑郁的潜在药理学机制及其活性化合物...  相似文献   

9.
目的:利用网络药理学方法探讨红花防治动脉粥样硬化的潜在靶点及作用机制。方法:通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)筛选红花中口服生物利用度≥30%和类药性≥0.18的活性成分及作用靶点。采用DisGeNet平台检索动脉粥样硬化疾病相关靶点。获取红花有效成分的靶点和动脉粥样硬化疾病相关靶点的共同靶点基因。通过STRING平台构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络,采用Cytoscape软件构建可视化的“化合物-靶点-通路”网络,并进行基因本体(GO)功能富集分析和京都基因与基因库百科全书(KEGG)通路富集分析。结果:筛选得到22种潜在的红花药效成分及103个药物有效成分作用靶点、67个动脉粥样硬化相关靶点基因;利用Venny 2.1.0软件获得药物成分及疾病相关的15个共同靶点基因,并获得Venny图。PPI网络获得自由度较高的节点为白介素-6(IL-6)、血管内皮生长因子-A(VEGF-A)、过氧化物酶体增殖物激活受体γ(PPARG)。GO富集分析得到63条GO条目,KEGG分析通路富集分析获得16条信号通路。结论:红花可能通过调节IL6、VEGF-A、PPARG等靶点,...  相似文献   

10.
目的:探讨额力根-7抗肝纤维化的作用机制。方法:通过网络药理学平台(TCMSP)对额力根-7的化学成分及作用靶点进行检索,并通过Uniprot、Genecards数据库确定基因,采用Cytoscape3.7.1软件构建成分-靶点网络。通过OMIM数据库查询与肝纤维化相关的靶点,通过蛋白质相互作用(PPI),获得核心靶点,通过生物信息注释数据库(DAVID)进行基因本体(GO)功能富集和基于京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。结果:PPI核心网络有19个节点,关键蛋白涉及IGF1、EGFR、TNF、TGFB1等。GO功能富集分析按P0.05筛选到GO条目110个,KEGG通路富集分析按P0.05筛选到通路30条。结论:初步探索了额力根-7抗肝纤维化可能的作用机制,为额力根-7进一步的研究提供参考。  相似文献   

11.
目的 基于数据挖掘和网络药理学方法,研究中药治疗卒中后认知障碍的组方用药规律及潜在机制。方法 以中国知网、万方、维普等数据库检索建库至2020年9月13日中医药治疗卒中后认知障碍文献为数据源,采用频次统计、关联规则等方法进行数据挖掘;利用网络药理学分析置信度最高的药对治疗卒中后认知障碍的潜在机制。结果 筛选符合条件处方51首,药物120味,总用药频次565次;主要药物为石菖蒲、川芎、远志、甘草、丹参、当归、茯苓、地龙、郁金、黄芪等,置信度最高的药对为石菖蒲-郁金;Cytoscape 3.7.0软件筛选石菖蒲-郁金治疗卒中后认知障碍的核心靶点12个;对核心靶点进行GO生物过程、KEGG通路富集分析,得到28条生物过程条目,24条通路。结论 益气活血、开窍醒神是治疗卒中后认知障碍的主要方法,核心药对为石菖蒲-郁金,潜在机制涉及免疫炎症反应、细胞凋亡、能量代谢等。  相似文献   

12.
目的运用网络药理学探讨黄芪-党参药对治疗胃癌的作用机制。方法通过DisGeNET数据库检索胃癌的相关靶点。使用中药系统药理学分析平台(TCMSP)检索黄芪、党参的潜在活性成分和作用靶点,借助PubChem数据库,预测黄芪-党参药对活性成分的所有潜在靶点,并将活性成分预测的靶点与疾病靶点取交集,获取黄芪-党参药对治疗胃癌的靶点集。使用Auto Dockt Vina对筛选所得的主要活性成分及主要相关靶点进行分子对接验证。通过DAVID进行基因本体(GO)功能富集分析和基于京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。运用Cytoscape 3.7.1构建"药物-化合物-靶点-通路-疾病"网络及蛋白相互作用(PPI)网络,研究其作用机制。结果"药物-化合物-靶点-通路-疾病"网络包括52个活性化合物、62个作用靶点以及34条通路,关键化合物为3-β-Hydroxymethyllenetanshiquinone、黄芪皂苷Ⅰ、咖啡酸、异阿魏酸等,关键靶点涉及MAPK、PI3Ks、EGFR、NF-κB1等;PPI网络关键靶点主要为STAT3、PIK3CA、MAPK1、HRAS等。GO富集分析共涉及264个生物过程(BP),38个细胞组分(CC)以及57个分子功能(MF);KEGG通路富集分析筛选得到34条与胃癌相关的通路,主要为癌症通路、PI3K-Akt信号通路等。结论黄芪-党参药对可能是通过介导PI3K-Akt等信号通路调控肿瘤细胞的增殖、凋亡、迁移、失巢凋亡及血管生成等生物过程进而达到治疗胃癌的目的。  相似文献   

13.
目的:研究"远志-石菖蒲"药对治疗阿尔茨海默病的网络药理学作用机制。方法:采用网络药理学方法筛选远志、石菖蒲中的活性成分,并获取药物活性成分靶点与阿尔茨海默病的靶标蛋白。构建药物活性成分-阿尔茨海默病靶标网络,对靶点进行基因本体(GO)富集分析及基因组百科全书(KEGG)通路分析。结果:远志-石菖蒲药对中共筛选出有效成分12个,相关靶标40个;筛选得到阿尔茨海默病相关靶点14个;富集分析结果筛选通路得到KEGG分析5条,GO分析2条。通路分析结果结合参考文献表明,远志-石菖蒲治疗阿尔茨海默病主要通过PI3K-Akt信号通路、ErbB信号通路、雌激素信号通路等发挥作用。结论:"远志-石菖蒲"药对治疗阿尔茨海默病具有多成分、多靶点、多途径的特点。该研究结果可为该药对的临床应用和进一步应用提供参考,并为进一步研究其治疗阿尔茨海默氏病(AD)的机理奠定基础。  相似文献   

14.
目的:基于网络药理学分析人参-黄芪治疗肺癌潜在靶点和机制。方法:通过传统中药系统药理学数据库和分析平台(TCMSP)筛选人参、黄芪活性成分和靶基因。使用人类基因数据库(Gene Cards)获得肺癌相关基因。使用Cytoscape构建"药物-成分-靶点-疾病"网络。使用STRING下载蛋白与蛋白相互作用(PPI)数据,利用插件Centi Scape筛选PPI核心基因。使用R软件进行关键靶基因基因本体(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析。结果:共筛选17个人参,16个黄芪活性成分,50个人参,95个黄芪治疗肺癌的靶基因,构建"药物-成分-靶点-疾病"网络。筛选出38个PPI核心基因。GO功能富集显示人参-黄芪生物学过程和功能集中在核受体功能、转录相关功能、泛素化、细胞凋亡等。KEGG通路富集显示,人参-黄芪治疗肺癌主要涉及磷脂酰肌醇3-激酶/蛋白激酶B(PI3K/Akt),细胞凋亡、肿瘤坏死因子(TNF)等信号通路。结论:通过构建"药物-成分-靶点-疾病"网络,从多成分、多靶点、多通路阐释人参-黄芪作为对药治疗肺癌的作用机制,为后续深入研究提供一定参考。  相似文献   

15.
目的:运用网络药理学及分子对接探究山药-陈皮治疗孤独症谱系障碍(ASD)的分子机制。方法:检索中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)并筛选山药-陈皮活性成分及靶点,检索Genecards、DisGenet、TTD数据库并筛选ASD疾病相关靶点。运用Cytoscape 3.7.2软件建立山药-陈皮靶点基因蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络及ASD疾病基因PPI网络,提取Hithubs网络,即山药-陈皮治疗ASD的关键靶点。运用DAVID数据库对关键靶点进行基因本体(GO)富集分析和京都基因和基因组百科全书(KEGG)富集分析。运用Autodock软件对山药-陈皮活性成分与关键靶点进行分子对接。结果:筛选山药-陈皮活性成分21个及对应靶点109个,检索ASD相关靶点476个,提取山药-陈皮治疗ASD的关键靶点141个,GO分析结果显示91个生物过程,68个细胞组分和77个分子功能相关过程,KEGG通路富集条目10条(P<0.05)。这些关键靶点涉及rRNA加工、核转录基因分解代谢过程、翻译起始、靶向膜的SRP依赖性共转运蛋白、病毒转录、核糖核酸聚合酶Ⅱ启动子转录正调控、凋亡过程负调控、细胞周期、拼接体、核苷酸切除修复等。分子对接结果显示山药-陈皮活性成分与关键靶点结合构象稳定。结论:山药-陈皮治疗ASD可能通过脑神经网络连接、基因表达、信号转导、炎症反应、病毒转录等途径起效。  相似文献   

16.
李文静  王艳萍  洪博 《世界中医药》2022,(10):1371-1376
目的:构建红花药材-成分-靶点-通路网络,探讨红花治疗心肌缺血的作用机制。方法:以红花中符合口服生物利用度(OB)≥30%、类药性(DL)≥0.18的化合物作为研究对象,通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)对进行检索并得到靶点,并在UniProt数据库靶点检索基因名,通过GeneCards数据库对心肌缺血进行检索,得到心肌缺血靶点。将心肌缺血与红花靶点取交集。将所得到交集靶点进行蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)分析、基因本体(GO)富集分析和京都基因和基因组百科全书(KEGG)富集分析。利用Cytoscape 3.8.0软件绘制药材-化合物-靶点-通路网络图。结果:得到红花16个活性成分,192个靶点,在GeneCards数据库搜索并筛选得到335个心肌缺血靶点。得到红花靶点与心肌缺血交集靶点58个。交集靶点PPI度值排名前3位为IL6、TNF、VEGFA。GO与KEGG通路富集分析分别选取前5个条目绘制气泡图。药材-化合物-靶点-通路网络中有89个节点,338条边。节点前三的化合物为:槲皮素、山柰酚与木犀草素。结论:红花可能通过多种化学成分、多靶点与多途径起到治疗心肌缺血...  相似文献   

17.
目的 基于网络药理学方法探析生血补髓汤预测骨质疏松症的分子作用机制。方法 通过TCMSP和TCMID数据库检索生血补髓汤的活性成分和对应靶点;通过GEO DataSets数据库获取骨质疏松症GSE84500和GSE35958疾病芯片并合并数据;将生血补髓汤对应靶点与疾病差异基因取交集,获得生血补髓汤防治骨质疏松症预测靶点;利用Cytoscape 3.8.1软件构建“中药-疾病”可视化调控网络。交集基因导入STRING 11.0平台获得PPI网络,利用CytoNCA进行PPI拓扑分析。利用R语言对交集基因进行GO和KEGG富集分析。利用Dycharts平台绘制KEGG通路分类占比饼图。利用Cytoscape 3.8.1软件构建“成分-靶点-通路”可视化调控网络。结果 筛选得到生血补髓汤活性成分87个,包括槲皮素、木犀草素、山奈酚等;交集基因97个,PPI拓扑分析核心基因17个,包括血管内皮生长因子A(VEGFA)、白细胞介素-6(IL-6)、转录因子AP-1(JUN)、丝裂原活化蛋白激酶1(MAPK1)等。GO富集分析共得到条目1 645条;KEGG富集分析得到通路115条,主要涉及脂质...  相似文献   

18.
目的:采用网络药理学方法筛选三仁汤君药药对(SRJMP)的活性成分及核心靶点,探讨三仁汤君药药对治疗肺癌的作用机制。方法:依托中药系统药理学分析平台(TCMSP),检索三仁汤 3 味中药相关的所有化学成分及预测作用靶点,采用STRING 数据库与 Cytoscape 软件构建“药物-活性成分-靶点”网络和蛋白互作网络,通过 ClusterProfiler、ClueGO、DAVID 数据库对核心靶点进行基因本体(GO)分析及京都基因和基因组百科全书(KEGG)通路富集。把候选作用靶点映射在 KEGG 通路图上分析结果,最后应用 AutoDock 软件进行分子对接。结果:共筛选出 40 个活性成分和 222 个相应蛋白靶点。首要分析核心靶点47 个,GO 分析共包含 117 条富集结果,KEGG 通路富集筛选出 30 条通路。结论:通过网络药理学验证了 SRJMP 多成分、多靶点、多通路的特点,其可能是通过调控免疫细胞分化,肿瘤相关信号通路以及干预细胞代谢过程,达到抗肿瘤作用。  相似文献   

19.
目的:基于网络药理学探讨山慈菇-浙贝母药对治疗乳腺癌的作用机制。方法:采用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)收集山慈菇、浙贝母的活性成分和靶点,并通过Uniprot数据库选择对应的药物作用蛋白质名称对应基因名,通过Cytoscape 3.7.2构建“药物-活性成分-靶点”网络图,同时检索疾病数据库(GeneCards)和在线人类孟德尔遗传数据库(OMIM)获得乳腺癌相关靶点。使用Cytoscape 3.7.2构建“活性成分与乳腺癌交集靶点”蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络,并对PPI网络节点进行筛选,得出关键靶点;运用Metascape数据库对关键靶点进行基因本体(GO)功能分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。结果:研究从山慈菇-浙贝母药对中筛选获得10个重要活性成分,包括β-谷固醇,豆甾醇,2-甲氧基-9,10-二氢菲-4,5-二醇,哲贝瑞醇等,作用于FUS和RPL24等71个关键靶点。GO富集分析共鉴定出31个条目,包括细胞组分3项、分子功能8项、生物学过程20项。此外,KEGG富集通路分析共确定了14条富集通路。结论:山慈菇-浙贝母药对治疗乳腺癌的作用体现了中药多成分、多靶点、多通路的特点,其作用机制可能是通过调控癌症途径、调控信号通路途径、调控介导细胞成熟和改变细胞周期等多个方面发挥治疗乳腺癌的作用。本研究为后续进一步研究提供思路和借鉴。  相似文献   

20.
目的:通过网络药理学探讨淫羊藿增强免疫功能可能的作用机制。方法:通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)检索淫羊藿的活性成分和靶点。利用Cytoscape 3.7.1软件构建“药物-活性成分-靶点”网络图。通过人类基因数据库(GeneCards)检索免疫抑制的相关靶点,利用STRING数据库进行蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络分析,利用DAVID平台进行基因本体(GO)富集分析和京都基因和基因组百科全书(KEGG)富集通路分析。结果:筛选出淫羊藿21个有效活性成分,179个潜在靶点。GO生物过程共562条,包括信号转导、炎症反应、凋亡过程等;KEGG信号通路共120条,主要涉及癌症途径、MAPK信号通路、PI3K-AKT信号通路、TNF信号通路等。结论:淫羊藿的活性成分通过作用于AKT1、TP53、IL6、VEGFA等靶点,参与信号转导等生物过程,调控癌症途径、TNF信号通路等多个途径发挥增强免疫功能的作用。  相似文献   

设为首页 | 免责声明 | 关于勤云 | 加入收藏

Copyright©北京勤云科技发展有限公司  京ICP备09084417号