白细胞介素1β基因单核苷酸多态性分析

目的 检测中国人白细胞介素1（interleukin-1，IL-1）β基因多态性，并初步预测调控区单核苷酸多态性（single nucleotide polymorphisms，SNPs）对IL-1β功能的影响。方法 对来自中国人群有代表性的10个民族27名个体的基因组DNA作为样本，采用直接测序的方法检测IL-1β基因的5’区、编码区、部分内含子区和3’区序列，以确定中国人群中IL-1β基因多态性的位置和类型，用生物信息学方法对5’区SNPs的功能进行初步预测。结果 在4610bp的测序片段中，共发现了6个SNPs，包括5’区3个，内含子区3个，其中5’区的-511T／C、-31C／TSNP国内外已有报道，而-1470G／CSNP未见相关报道。生物信息学分析其中5’区的3个SNP均不在5区的重复区，且3个位点都是与IL-1β转录有关的核因子结合的区域。结论 IL-1β调控区3个SNPs可能对IL-1B表达产生影响，有待进一步深入研究。     

浆细胞膜糖蛋白-1基因单核苷酸多态性与冠心病的相关性研究

 目的 探讨浆细胞膜糖蛋白-1(plasma cell membrane glycoprotein-1,PC-1)基因的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)与冠心病(coronary artery disease,CAD)的相关性.方法 提取192例CAD患者和189例健康对照者外周血有核细胞DNA,应用荧光标记单碱基延伸分型技术及寡核苷酸微阵列芯片杂交技术检测PC-1基因的5个标签SNP:rs12528076,rs858341,rs2021966,rs9398995和rs858345.结果 rs9398995基因型中CAD组的TT型频率显著高于对照组,CC型频率显著低于对照组,两组间T和C等位基因频率差异有统计学意义(P＜0.05).rs12528076基因型中CAD组的TC型频率显著高于对照组(P＜0.05).由rs12528076、rs9398995和rs2021966构建的单倍型中,CCC和CTC的单倍型频率在两组间具有统计学差异(P＜0.05).结论 PC-1基因的rs12528076、rs9398995和rs2021966多态性与CAD相关.     

Nrf2基因单核苷酸多态性与急性高原病相关性研究

目的：探讨中国汉族人群中Nrf2基因多态性与急性高原病（ AMS）易感性的关系。方法采用巢式病例研究方法,以603名急进3700 m高原的中国汉族青年男性为研究对象,根据路易斯湖评分系统（ LLSS）分为病例组（n＝369）和对照组（n＝234）,采用Sequenom Mass Array 质谱阵列技术检测两组人群Nrf2基因位点rs10497511和rs2364722的基因多态性。结果病例组与对照组中rs10497511和rs2364722位点分别检测出T、C和A、G等位基因;两位点等位基因频率在两组间差异无统计学意义（P＞0．05）。进一步对2个位点的基因型共显性模型、显性模型和隐性模型分析也未提示差异有统计学意义（P＞0．05）。结论 Nrf2基因rs10497511和rs2364722位点多态性与中国汉族男性人群AMS发病可能无相关性。     

云南不同地区绵羊血液蛋白多态性研究

本研究采用平板式淀粉胶蛋白电泳技术来自德钦县、巧家县、腾冲县的绵羊进行了34个同功酶及血液蛋白的研究，共检测36个遗传座位，其中有8个座位显示多态，德钦绵羊多态百分率P=0.1944，平均杂合度H=0.0647，平均等位基因数A=1.2222；昭通绵羊P=0.2222，H=0.0651;A=1.2222；腾冲绵羊P=0.1667,H=0.0608;A=1.1667。表明云南不同地区绵羊的在蛋白水平上遗传多样性较为丰富。运用Phylip3.5软件包中的“GENETDIST”计算标准遗传距离，再结合以往研究的数据，运用该软件包中的“NEIGHBOR”和“UPGMA”法进行聚类分析，结果表明，云南绵羊起源于同一共同祖先，云南棉羊与印度绵羊、尼泊尔绵羊关系较近，而与西藏绵羊关系较远。     

大鼠NR2B基因核心启动子区单核苷酸多态性研究

 目的:对大鼠NR2B基因核心启动子区进行单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)筛查及分析.方法:提取16只健康SD大鼠海马组织基因组DNA,聚合酶链式反应(PCR)扩增NR2B基因核心启动子区序列和SNP库已报道的rs8169392所在区域序列,结合DNA测序方法进行SNP筛查和验证.结果:在大鼠NR2B核心启动子区705bp中,发现1个新的SNP位点,为-217位C/T多态;本研究中未筛查到NCBI-SNP库报道的rs8169392.结论:-217位C/T多态的发现为NR2B基因多态性数据库提供了新信息.     

PON1基因rs854572单核苷酸多态性与氯吡格雷抵抗的相关性研究

目的 探讨对氧磷酶1(PON1)基因rs854572单核苷酸多态性与氯吡格雷抵抗(CR)发生的相关性.方法 采用病例-对照研究的方法,共人选850例沈阳军区总医院冠心病住院患者,采用光学比浊法测定20μmol/L二磷酸腺苷(ADP)诱导的残余血小板聚集率(RPA),当RPA≥70％时,即定义为CR.将入选患者分为CR组(n=215)和非氯吡格雷抵抗(NCR)组(n=635),采用焦磷酸测序法测定PON1基因rs854572单核苷酸多态性的基因型及等位基因分布频率.结果 PON1基因rs854572多态位点在两组间基凶型分布频率皆符合Hardy-Weinberg平衡定律,三种基凶型(CC、CG和GG)分布频率在CR组和NCR组分别为23.7％、49.3％、27.0％和24.1％、50.2％、25.7％,三种基因型在两组间分布频率差异无统计学意义(P=0.93).C、G等位基因分布频率在两组间差异亦无统计学意义(P=0.763).Logistic回归校正性别、年龄、体重指数、吸烟、高血压、高脂血症及糖尿病等冠心病易患因素后,PON1基因rs854572单核苷酸多态性仍与冠心病患者CR的发生无相关关系.结论 PON1基因单核苷酸多态位点rs854572与冠心病患者CR的发生无关.     

NMDA受体基因单核苷酸多态性与神经系统疾病的关联研究

 神经系统由其结构单位-神经元组成,这使得神经系统构成了人类组织器官中最为复杂的系统,其作用机制是受多种因素调节的复杂生理过程。神经系统疾病是神经系统发生的器质性疾病,除受外界环境因素影响外,还受遗传因素影响。已有大量的研究报道了神经递质与神经系统疾病之间的关系,其研究的深入可能为神经系统疾病的防诊治提供客观的预测和监测指标。     

hOGG1、XRCC1、XRCC3基因单核苷酸多态性与食管癌放疗预后关系的研究

食管癌是世界上最常见的恶性肿瘤之一,其发病率高,预后差,死亡率居癌症第6位[1],其病理类型90％以上为鳞状细胞癌,对射线较敏感,放射治疗在食管癌综合治疗中占重要地位.然而单纯放疗后5年生存率10％～30％,局部复发高达60％～80％.如何通过分子生物学手段达到改善食管癌的疗效及提高食管癌的预后已经成为目前研究的主要方向.hOGG1、XRCC1、XRCC3是DNA损伤修复的重要基因,这些基因的单核苷酸多态性可以改变修复蛋白的功能进一步改变DNA损伤修复能力,在肿瘤的发生、发展及治疗过程中发挥重要作用.本研究采用PCR-RFLP法研究hOGG1、XRCC1、XRCC3基因单核苷酸多态性与食管癌放射治疗预后的关系,旨在为食管癌治疗方案的选择提供参考依据.     

飞行人员代谢综合征患者脂联素基因+45和+276位点单核苷酸多态性研究

目的研究脂联素基因+45和+276位点单核苷酸多态性(SNP)与飞行人员代谢综合征(MS)的相关性。方法采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)方法检测38名飞行人员MS患者和50名正常健康飞行人员脂联素基因+45和+276位点SNP。结果 脂联素基因SNP+45和+276基因型和等位基因在飞行人员MS组和正常健康对照组差异无统计学意义。结论脂联素基因SNP+45和+276可能与飞行人员MS无相关性。     

系统性红斑狼疮肺间质病变TGF-β1基因单核苷酸多态性与肺HRCT表现相关性研究

目的 探讨转化生长因子-β1(TGF-β1)基因单核苷酸多态性(SNP)与系统性红斑狼疮肺间质病变(SLE-ILD)患者肺高分辨率计算机断层扫描(HRCT)影像学表现的关联.方法 搜集符合纳入标准的SLE-ILD患者共80例,按照HRCT影像学表现分为斑片状、磨玻璃影、网格状、条索状4类.采用Sequenom基因分型实...     

KCNJ11基因单核苷酸多态性与2型糖尿病的相关性研究

目的 探讨钾离子内向整流通道蛋白J亚单位11号成员(KCNJ11)基因单核苷酸多态性与中国重庆地区汉族人群2型糖尿病(T2DM)的相关性.方法 选取中国重庆地区T2DM患者315例(病例组)、正常对照280例(对照组),采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)的方法,对KCNJ11单核苷酸多态性(SNPs)位点rs2285676(401C＞T)进行基因分型,同时测定体重指数(BMI)、腰围、臀围、血压、血脂、血糖、胰岛素、超敏C反应蛋白(hsCRP)及非酯化游离脂肪酸(NEFA)等指标,并分别用HomaIR、Homa-β、处置指数(DI)评估胰岛素抵抗和胰岛β细胞功能.结果 KCNJ11多态性位点rs2285676的3种基因型CC、CT、TT频率在病例组中分别为28.9%、51.4%、19.7%,在对照组中分别为28.9%、43.9%、27.1%,两组间差异无统计学意义(x2=5.298,P＞0.05);病例组和对照组等位基因频率分布差异也无统计学意义(X2=1.638,P＞0.05),各基因型间BMI、腰臀比、血压、血脂、血糖、胰岛素、hsCRP及NEFA、Homa-IR、Homa-β、DI差异均无统计学意义(P＞0.05).结论 中国重庆地区汉族人群KCNJ11基因多态性位点rs2285676可能与T2DM无关联.     

CRY2基因单核苷酸多态性与肝细胞肝癌预后分析

目的 探讨生物节律基因单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNPs)与肝动脉化疗栓塞治疗术(transcatheterarterial chemoembolization,TACE)后肝癌患者预后的关系.方法 采用Sequenom iPLEX分型技术进行基因分型(337例原发性肝细胞癌患者),并且分析其与肝癌患者预后相关性.结果 在分层分析中,本研究发现CRY2:rs2292910这一位点基因型在年龄＞52岁、肿瘤＜5 cm患者组与患者预后有着显著相关性.结论 CRY2基因单核苷酸多态性有可能作为肝动脉化疗栓塞治疗术后评估患者预后的独立标志物.     

我国部分地区HIV-1流行毒株亚型分布及gag基因变异特征研究

目的：分析我国4个地区的人免疫缺陷病毒1型（HIV-1）主要流行毒株的亚型分布,以及在宿主免疫压力下的基因变异和抗原表位的变化情况,初步探讨这些地区HIV-1gag基因的分子进化特征。方法：从来自河南、广东、四川、北京的HIV-1感染者血浆样本中提取基因组RNA,经逆转录-聚合酶链反应（RT-PCR）扩增部分gag基因,用扩增产物直接进行测序;使用Genotyping Tool软件进行亚型分析,使用MEGA4.1软件绘制系统进化树;用Distance工具计算各个亚型序列的基因离散率;用SNAP程序分析同义替换率与非同义替换率的比值（Ks/Ka）,并对各亚型中我国人群中较常见的HLA-Ⅰ型限制的CTL抗原表位的突变情况进行分析。结果：这些地区HIV-1主要流行毒株gag基因亚型主要是B′、CRF07_BC、CRF01_AE、B、CRF08_BC和CRF02_AG。各亚型内的基因离散率不同,由大到小排列为CRF01_AE〉B〉CRF08_BC〉CRF07_BC〉B′,Ks/Ka为CRF01_AE〉B〉CRF08_BC〉B′〉CRF07_BC。p17区段的CTL抗原表位变异远大于p24区段。各个亚型共享序列中存在的突变位点由多到少排列为CRFOI_AE〉B〉B＇〉CRF07-BC。结论：我国HIV-1流行毒株的gag基因序列中,CRF01-AE亚型受到的选择压力最大,基因离散率也最大,且CTL抗原表位的变异亦最大,其次是B和B’亚型,CRF07-BC亚型变异最小。各亚型间CTL抗原表位变异的差异明显。     

FTO基因单核苷酸多态性与肥胖及运动关系研究进展

遗传因素在个体肥胖的发生和发展中起到重要作用。FTO(fat mass and obesity-associated)基因是一个在不同人群得到广泛验证的肥胖易感基因,FTO基因单核苷酸突变与肥胖密切相关。研究显示,FTO基因在机体能量代谢的调控过程中发挥重要作用。本文综述FTO基因单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)与肥胖关系的最新研究进展,并探讨FTO基因SNP和体育活动对肥胖的交互影响作用。     

肥胖患者脂联素基因第45位点单核苷酸多态性与血浆脂联素水平及胰岛素抵抗的相关性研究

目的 研究福建省泉州地区汉族肥胖人群脂联素基因第45位点单核苷酸多态性(SNP45)与血浆脂联素水平及胰岛素抵抗的关系.方法 随机选择肥胖症患者248例,正常对照者223例,采用液相平衡竞争放射免疫分析法测定血浆中空腹胰岛素(FINS)水平;利用自动生化分析仪测定空腹血糖(FPG)、总胆固醇(TC)、甘油三酯(TG)、高密度脂蛋白胆固醇(HDL-C)、低密度脂蛋白胆固醇(LDL-C)水平;计算体重指数(BMI)、腰臀比、稳态模型胰岛素抵抗指数(HOMAIR);采用酶联免疫吸附试验测定空腹血浆脂联素水平;采用PCR限制性片段长度多态性技术检测脂联素基因SNP45.结果 ①肥胖症组和正常对照组脂联素基因SNP45的GT+GG基因型的分布分别为61％和44％(x2=14.182,P＜0.01),G等位基因频率分别为35％和25％(x2=10.708,P＜0.01).②肥胖症组中,脂联素基因SNP45的GG+GT型与TT型相比,前者的TG、LDL-C水平(t=2.604,P＜0.01;t=5.507,P＜0.01)升高,而脂联素和HDL-C水平(t=2.275,P＜0.05; t=10.100,P＜0.01)降低.③正常对照组中,脂联素基因SNP45的GG+GT型与TT型相比,前者的脂联素、TG、TC水平(t=2.510,P＜0.05;t=2.922,P＜0.01;t=3.272,P＜0.01)显著低于后者.④以脂联素基因SNP45为因变量进行Logistic回归分析,肥胖症组中脂联素基因SNP45的GG+GT型与TT型相比,GG+GT型血清脂联素水平减少(OR=0.810,95％CI:0.673～0.975,P＜0.05),胰岛素抵抗风险增加(OR=1.746,95％CI:1.060～2.875,P＜0.05);正常组中GG+GT型胰岛素抵抗风险增加(OR=3.962,95％CI:1.089～14.411,P＜0.05).结论 ①脂联素基因SNP45的基因型和等位基因频率在肥胖症组与正常对照组中的分布有显著性差异.②脂联素基因SNP45与肥胖症患者的胰岛素抵抗及血脂水平相关.③肥胖症组中脂联素基因SNP45与脂联素水平相关.     

维吾尔族和汉族人群RANTES基因多态性特征及其对HIV-1感染的意义

目的　分析RANTES启动子区等位基因在中国维吾尔族和汉族健康人和HIV 1感染者中的分布特点 ,以期阐明RANTES基因突变型和人类免疫缺陷病毒(HIV 1 )感染在不同民族人群的关系。方法　利用PCR RFLP法对维吾尔族和汉族HIV 1感染者和健康人群的 86 5份样品的RANTES 4 0 3、 2 8等位基因进行检测。结果　两个位点在维吾尔族和汉族人群均有较高的等位基因频率 ,分布基本一致 ;RANTES等位基因具有 6个基因表型 ,分别为AC/AC、AC/AG、AC/GC、AG/GC、GC/GC和AG/AG ;从单倍型看 ,汉族和维吾尔族均以GC为最高 ,占 6 2 7% ,AC分别为 2 8 7%和 30 4 % ,AG分别为 8 6 %和 6 8%。但是从单个位点看 ,HIV感染者和健康人、吸毒者差异均无统计学意义(P >0 0 5 ) ;从基因表型分析 ,与AC/AC比较 ,AC/AG、AC/GC、AG/GC、GC/GC的OR值显示都有不同程度的关联(OR =0 33～0 81 )。结论　汉族和维吾尔族中RANTES启动子区 4 0 3/ 2 8均有较高的突变频率 ;与AC/AC比较 ,AC/AG、AC/GC、AG/GC、GC/GC的OR值显示都有不同程度的保护作用     

HIV-1 Tat蛋白对DNA修复基因及细胞周期相关基因表达的影响

目的:探讨HIV-1 Tat蛋白对DNA修复基因及细胞周期相关基因表达影响.方法:使用包含102个与DNA损伤修复和细胞周期相关的基因微阵列检测人横纹肌肉瘤细胞(TE671)及已转染tat基因的TE671细胞(TT2)基因表达谱的改变;使用半定量RT-PCR分析DNA-PKcs在mRNA水平表达;Western印迹法检测DNA-PKcs表达变化;荧光染色法检测电离辐射后细胞凋亡.结果:在基因芯片的检测中,发现与DNA损伤修复及细胞周期调控相关的6个基因CdC25C、KIF2C、CdC20、DNA-PKcs、CTS1、WEE1在转染tat基因的细胞中表达下调;DNA-PKcs的表达在表达Tat蛋白细胞中不论是在mRNA和蛋白水平均被抑制;接受电离辐射后,表达Tat蛋白的细胞凋亡增加.结论:HIV-1 Tat蛋白使细胞对电离辐射敏感,部分通过抑制DNA-PKcs表达来降低DNA双链断裂的修复能力,本研究为了解AIDS合并肿瘤患者对放射治疗敏感性提供了重要实验数据.     

中国北方汉族男子CKB基因单核苷酸多态性与耐力训练效果关联研究

目的:探讨中国北方平原地区汉族男子脑型肌酸激酶(CKB)基因多态性与耐力训练效果的关联性。方法:102名无训练史的健康男子进行18周有氧耐力训练,测试训练前后的最大摄氧量、跑节省化(RE)各指标。用PCR-RFLP法分析CKB基因启动子上rs3759582和rs3759584两位点的单核苷酸多态性。结果:二个多态位点均符合H-W平衡,不存在强的连锁关系;训练后rs3759582位点AA基因型最大摄氧量变化率、跑节省化变化率与AC基因型组间均无显著性差异(P>0.05);训练后rs3759584位点TT基因型△RE/VO2、△RE/rVO2、△RE/HR和△RE/VE显著低于CT和CC基因型(P<0.05),但是CC基因型频率仅为3%。结论:CKB基因的rs3759582多态性不是预测个体耐力训练敏感性的基因标记;rs3759584与个体的耐力训练敏感性相关,但需加大样本进一步确认。     

广东省汉族人群与西藏自治区夏尔巴人群SP—A基因单核苷酸多态性研究

本文通过对肺表面活性物质相关蛋白A(SP-A)基因单核苷酸多态性(SNP)在广东汉族人群和西藏夏尔巴人群中的分布特点的分析,探讨其与高原低氧环境适应性的关系。作者应用序列特异性引物-聚合酶链反应(SSP-PCR)方法,对90名广东汉族人和104例西藏夏尔巴人SP-A基因进行检测。结果在104例夏尔巴人和90名汉族人之间SP-A1基因1544位点各基因型和等位基因分布无统计学差别(P>0.05);在SP-A1基因3241位点C/C,C/T和T/T3种基因型的构成比在夏尔巴人分别75.0%,22.1%和2.9%,而广东汉族人群为50.0%,35.6%和14.4%,夏尔巴人等位基因C、T的分布频率…     

飞行员血清内脂素及其基因多态性与冠心病相关性研究

目的探讨飞行人员血清内脂素(visfatin)水平及其基因多态性与冠心病间的相关性。方法选取军事飞行人员477例、冠心病患者44例、对照组202例,采用酶联免疫吸附法(ELISA)测定受试者内脂素水平,聚合酶链反应-直接测序法(PCR-测序法)检测内脂素-1535CT位点多态性基因型及等位基因频率,同时测量身高、体重、血压等,并采集记录相应生化数据:总胆固醇(cholesterol,TC)、甘油三酯(triglyceride,TG)、空腹血糖(fasting blood glucose,FBG)、尿酸(uric acid,UA),应用SPSS17.0统计软件进行统计分析。结果冠心病组及飞行员组血清内脂素水平均明显高于对照组(P0.01);在21~30岁、31~40岁组中,飞行员组血清内脂素水平均高于对照组(P0.05),而在≥41岁组中,飞行员内脂素水平较对照组差异无统计学意义(P0.05);飞行员不同年龄及不同飞行时间组间血清内脂素水平比较无统计学意义(P0.05);三组间内脂素-1535CT位点多态性基因型及等位基因频率分布差异无统计学意义(P0.05)。结论飞行人员血清内脂素水平显著高于普通人群,可能是冠心病的风险因素。