构建编码基因-非编码RNA调控网络挖掘前列腺癌潜在致病因子

目的 基于前列腺癌的编码基因-非编码RNA调控网络识别潜在的生物标记物.方法 利用前列腺癌的lncRNA、miRNA和mRNA表达谱数据及它们与转录因子之间的靶向关系,构建编码基因-非编码RNA三维调控网络,挖掘ceRNA子网,识别潜在竞争性的lncRNA并筛选前列腺癌潜在的致病因子.结果 从ceRNA子网中识别出4个lncRNA竞争性的结合了5个miRNA间接调控了63个基因的表达,功能预测这些lncRNA参与了激素调节;基于网络拓扑属性,挖掘出一个包含了16个lncRNAs、2个miRNAs、4个mRNAs的生物标记物.结论 多种调控因子如TF、lncRNA、miRNA、mRNA共同作用影响前列腺癌的发生发展,其中有些lncRNA作为ceRNA来发挥基因表达调控的作用.     

恶性肿瘤中MNX1反义RNA 1的作用及机制研究进展

<正>长链非编码RNA (long non-coding RNA,lncRNA)是一类广泛存在于细胞核和细胞质内、长度在200 nt以上、缺少开放阅读框、不参与或很少参与蛋白质编码、主要从蛋白编码基因的反义链及间隔区转录出来的RNA^[1-6]。已有大量研究证实,lnc RNA涉及调控多种生物学功能,比如细胞增殖、凋亡及血管生成^[7-9]。表达异常的lnc RNA与诸多肿瘤的发生发展密切相关^[10-11]。     

长链非编码RNA与病毒和微小非编码RNA关系的研究进展

非编码RNA,包括以miRNA、siRNA和piRNA等为代表的短小RNA和长链非编码RNA.长链非编码RNA,有别于其他小分子非编码RNA,是目前非编码RNA研究的热点.随着研究的不断推进,人们发现lncRNA与物种进化、胚胎发育、物质代谢以及肿瘤发生等都有着密切的联系.microRNA是一类长度为19～ 23个核苷酸的内源性非编码RNA,可以在转录水平或转录后水平调节基因的表达.     

长链非编码RNA在成肌分化中的作用

人类基因组90％可以发生转录,但98％的转录产物为不具有蛋白编码能力的非编码 RNA （ noncoding RNA, ncRNA）。长链非编码RNA （ long noncoding RNA, lncRNA）是指转录本超过200 nt的非编码RNA,曾一度被认为是转录的“噪音”,不具有任何生物学功能。然而,近年报道lncRNA广泛参与成肌分化,可在RNA水平通过多种方式调控成肌分化进程,是成肌分化的重要调节因子。     

lncRNA与miRNA相互作用对疾病的影响

长链非编码RNA(lncRNA)与微小RNA(miRNA)之间存在相互调控关系。lncRNA可作为一种竞争性内源性RNA(ceRNA)与miRNA相互作用,参与靶基因的表达调控,反之,miRNA可通过RNA诱导沉默复合物(RISC)调控lncRNA发挥生物学功能,两者共同参与多种疾病的发生。     

长链非编码RNA在肺癌中的研究进展

长链非编码RNA（LncRNA）是一类转录本长度超过200nt的RNA,不编码蛋白,大多数位于细胞核,以RNA的形式在多层面上（表观遗传调控、转录调控以及转录后调控等）调控基因的表达水平。其广泛参与机体的生理和病理过程,在恶性肿瘤的发生和发展中起着重要作用。     

MicroRNA与癌症的相关性研究进展(文献综述)

MicroRNAs（miRNAs）是一类长约22 nt的非编码单链RNA分子,在转录后水平调控基因的表达。miRNA能特异性诱导靶基因mRNA降解及抑制靶基因mRNA的翻译,同时在细胞的发生、发展、增殖、分化和凋亡过程中发挥重要的调节作用[1]。目前,人类基因组中已确认的miRNAs约500个,     

长链非编码RNA与胃癌的关系研究新进展

长链非编码RNA（10ngnon—codingRNA,LncRNA）是调节性非编码RNA之一,转录本长度〉200nt,表达具有时空特异性,无明显可读框,不编码蛋白质。在细胞质,会影响RNA稳定性和miRNA活性;在细胞核,主要调控基因转录和mRNA剪接。根据与最近编码蛋白质基因的关系,LncRNA可分为五类：     

长链非编码RNA通过ceRNA在乳腺癌中的调控机制

长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)是一种长度大于200 nt的不具有编码蛋白质功能的RNA。lncRNA在多种肿瘤中存在差异性表达,通过转录调控、转录后调控等方式影响肿瘤的增殖、侵袭、转移、耐药等。多项研究表明,lncRNA可通过竞争性内源性RNA(competing endogenous RNA,ceRNA)机制与miRNA相互作用,并影响其它RNA、蛋白的表达,影响疾病进程;提示lncRNA可能是一种肿瘤标志物和潜在的治疗靶点。该文现就lncRNA通过ceRNA调控乳腺癌的研究进展进行综述。     

非编码RNA在肿瘤中对自噬的调控

非编码RNA（ncRNA）是不参与蛋白质编码的RNA的总称,包括微小RNA（miRNA）、siRNA、piRNA、长链非编码RNA（lncRNA）、转运RNA（tRNA）、核糖体RNA（rRNA）等。其在蛋白质转录与后转录过程中有重要的调节作用。自噬是细胞在异常环境中维持生存的一种方式。大量研究表明自噬与肿瘤也存在着密切的关系,而自噬对于肿瘤的影响具有“两面性”。许多研究探讨了非编码RNA在肿瘤细胞中对于自噬过程的调控．文章综述了miRNA与lncRNA这两种研究深入的非编码RNA。     

长链非编码RNA MEG3对肿瘤细胞调控作用的研究进展

长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)是一类长度超过200 nt的不编码蛋白的RNA分子。lncRNA最初被认为是转录噪音,在近年的研究中发现越来越多功能性的lncRNA,其重要性才渐渐被阐述。母系表达基因3(materally expressed gene 3,MEG3)是一种由母系印记基因编码的lncRNA,在对其功能的研究中发现MEG3几乎参与了所有的生理和病理过程,其在多种肿瘤中表现出抑制作用。本文就lnc RNA MEG3对肿瘤细胞调控的作用机制作一综述。     

miRNA与lncRNA的相互调控作用在肿瘤中的研究进展

miRNA是一类具有介导基因转录后表达调控功能的非编码小分子RNA,lncRNA是碱基数大于200个核苷酸的非翻译转录本,通过基因印迹、染色质重塑、细胞周期调控等多种机制发挥其生物学功能。miRNA与lncRNA之间存在着相互调控关系,对肿瘤的发生发展以及治疗具有重要作用。     

长链非编码RNA对能量代谢和相关疾病发生发展的作用

<正>随着高通量测序技术的发展和ENCODE计划揭示,曾一度被认为是无功能的"转录噪音"的非编码RNA(noncoding RNA,ncRNA),近年来被证实在细胞分化、生物发育及疾病发生发展过程中发挥巨大作用[1]。其中长链非编码RNA(long noncoding RNA,lncRNA)是一类转录本长度超过200 nt的非编码RNA,在哺乳动物基因组中,有4%~9%的序     

长链非编码RNA与结直肠癌

长链非编码RNA(lncRNA)是一类长度大于200 nt的非蛋白编码RNA分子,能同时与DNA、RNA和蛋白质分子相互作用,通过转录和转录后调控等多种作用机制在结直肠癌中发挥促癌或抑癌的双重作用。lncRNA表达异常或突变在结直肠癌的发生、发展、侵袭和转移过程中扮演着重要角色,且与患者预后密切相关。lncRNA有望为成为结直肠癌新的诊断和治疗靶点。     

神经疾病关联的长链非编码RNA的生物标记物作用

<正>转录组分析显示,只有1%~2%人类基因能编码蛋白质,其余约98%的大部分基因是非编码RNA(non-coding RNAs,ncRNAs)。ncRNA是一类不编码蛋白质但具有生物学功能的RNA分子,根据其长度可将其分为小非编码RNA[包括微小RNA(microRNAs,miRNA)、小干扰RNA(small interfering RNAs,siRNA)等]和长链非编码RNA(long non-cod-     

微小RNA与器官纤维化研究进展

微小RNA（miRNA）是一类长21～25个核苷酸的内源性非编码小RNA,在转录后水平调控靶基因的表达。近年来研究发现,miRNA也参与了机体多个器官如心脏、肺脏、肾脏、肝脏、皮肤的纤维化过程。本文对miRNA生物学特征及其在脏器纤维化过程中的作用的相关研究进展进行综述。     

microRNA在脊髓损伤修复机制中的研究进展

微小RNA（miRNA）通常指大小为22 nt左右的单链非编码RNA,其生物学功能主要表现在RNA沉默和基因表达转录后调节中发挥作用。随着对其研究的不断深入,越来越多的证据表明miRNA在生物体内发挥着包括转录调控、生长繁育、肿瘤、炎症免疫及修复损伤等在内的多种生物学功能。近年来研究结果发现,mRNA参与了脊髓损伤（S...     

长链非编码RNA在自身免疫性疾病中的研究进展

长链非编码RNA(lncRNA)是一类长度超过200 nt的非编码RNA。lncRNA可在生命活动的多个水平调控基因表达从而影响生物学过程。lncRNA与免疫细胞活动密切相关,能够通过调控免疫细胞分化发育以及免疫细胞效应功能参与自身免疫性疾病的发生发展。     

长链非编码RNA的功能及与心血管病的研究进展

真核基因组经转录产生了上万种无或少有蛋白编码能力的长链非编码RNA（longnon—codingRNA,lncRNA）。lncRNA是一类转录本长度超过200个核苷酸的功能性RNA分子,它们参与表遗传学的调控,转录及转录后的修饰等,还有一部分lncRNA是小RNA产生的前体。虽然lncRNAs的功能和作用机制尚不完全清楚,但是已有一些研究显示lncRNAs参与心血管疾病的发展,其表达水平的改变可能成为一种新的诊断标志。此文就lncRNA的功能及其在心血管病方面的最新研究进展作一综述。     

长链非编码RNA在表观遗传学中的研究进展

表观遗传学是基于遗传学基础之上发展起来的生物学分支,研究发现人类很多疾病与表观遗传调控相关,其主要机制包括:染色质重塑、组蛋白修饰,基因组印记及非编码RNA(ncRNA)调控.而长链非编码RNA(lncRNA)是非编码RNA中的一类,不仅可以通过与靶基因直接结合调控靶基因的转录,还能募集调控因子,参与基因的沉默,在表观遗传调控中起着重要作用.