基于网络药理学与分子对接探讨青风藤干预膝骨关节炎的作用机制

目的：应用网络药理学与分子对接技术探讨青风藤治疗膝骨关节炎(KOA)的作用机制。方法：从TCMSP数据库中提取青风藤的化学成分,获得药物靶点及疾病相关基因,筛选交集靶点,获得青风藤治疗KOA的作用靶点。对交集靶点及相关信号通路利用数据库进行基因本体(GO)功能和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。通过分子对接平台进行分子对接。结果：获得青风藤化合物主要化学成分6种、疾病基因643个、药物与疾病交集靶点11个。网络分析结果显示,青风藤通过调控肿瘤信号通路、糖尿病并发症中的糖基化终末产及其受体信号通路(AGE-RAGE)、细胞凋亡信号通路、肿瘤抑制蛋白p53信号通路(p53)、血清素突触信号通路等作用于前列腺素G/H合酶1(PTGS1)、前列腺素-内过氧化物酶合酶2(PTGS2)、过氧化物酶体增殖物激活受体(PPARG)、B淋巴细胞瘤-2(Bcl-2)、转化生长因子β-1前蛋白(TGFB1)、胱天蛋白酶3(CASP3)等关键靶点,通过干预细胞凋亡、抑制炎症等发挥治疗KOA的作用。分子对接结果显示,青风藤核心成分β-谷甾醇(beta-sitosterol)、青藤碱(Sinome...     

基于网络药理学探讨灵仙活络汤治疗膝骨关节炎的作用机制

目的：使用网络药理学方法寻找及分析自拟方灵仙活络汤治疗膝骨关节炎（KOA）的主要化合物、靶点及有关通路。方法：通过中药系统药理学数据库与分析平台（TCMSP）获取灵仙活络汤中君药及用量最大的两味臣药（威灵仙、乳香、没药）的主要成分及靶点,再用SwissTargetPrediction预测靶点,保留P>0.5的有关靶点,使用Uniprot网站规范两次获得的靶点名称。使用GeneCards、DrugBank、OMIM数据库获取KOA的主要疾病靶点,利用Venny2.1得到药物-疾病重合靶点,即关键靶点,然后使用Cytoscape 3.7.2构建“疾病-药物-化合物-有效靶点”网络。利用String对关键靶点进行蛋白质相互作用分析,使用Cytoscape 3.7.2构建PPI网络,使用Metascape进行KEGG通路富集分析及Go富集分析。结果：得到槲皮素、鞣花酸、β-谷甾醇、豆甾醇等32种化合物,涉及TNF、IL6、AKT1、IL1B、TP53等112个靶点。GO富集分析显示,灵仙活络汤治疗KOA可能与细胞因子受体结合、DNA结合转录因子结合、细胞因子活性、磷酸酶结合等分子功能相关...     

膝骨汤熏洗治疗膝骨关节病

笔者运用膝骨汤熏洗治疗膝骨关节病100例,取得一定疗效,现报道如下。     

基于网络药理学研究当归挥发油治疗失眠的作用机制

目的 基于网络药理学方法探讨当归挥发油治疗失眠的作用机制.方法 通过GC-MS测定当归挥发油的化合物,利用TCMSP、PubChem以及SwissTargetPrediction数据库获取相关成分靶点,TTD、DrugBank、DisGeNET以及OMIM数据库筛选失眠相关靶点,STRING在线平台将当归挥发油的成分靶...     

基于网络药理学探讨二陈汤异病同治机制

目的 应用网络药理学对二陈汤治疗高血压、糖尿病、慢性心衰、肺炎、高血脂、冠心病、肾炎、关节病、脑卒中、哮喘十种病的主要活性成分的作用靶点、信号通路等进行探索,从而揭示二陈汤异病同治的分子机制.方法 基于网络药理学,通过TCMSP,CooLGeN,Venny 2.1,DAVID,NCBI,STRING,Cytoscape...     

基于网络药理学探讨四君子汤治疗克罗恩病的作用机制

目的:采用网络药理学方法探讨四君子汤治疗克罗恩病的作用靶点和信号通路.方法:通过美国国家生物技术信息中心(NCBI)预测克罗恩病的疾病靶点,中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)筛选四君子汤的主要活性成分和靶点信息.采用Cytoscape 3.7.2软件Bisogenet包构建蛋白质相互作用(PPI)网络,Clu...     

基于网络药理学探讨酸枣仁汤的作用机制

目的:采用网络药理学方法探讨酸枣仁汤的作用机制.方法:借助TCMSP平台预测酸枣仁汤中药成分的作用靶点与通路,利用Cytoscape软件分别构建成分-靶点网络、PPI网络,使用DIVID数据库进行GO富集分析和KEGG信号通路富集分析.结果:经筛选获得酸枣仁汤中五味中药酸枣仁、川芎、知母、茯苓、甘草含有的135种活性成分,332个相应靶点;PPI网络包括293个节点;GO条目146个,其中生物过程为94个,分子功能条目34个,细胞组成条目18个;KEGG通路22条.结论:酸枣仁汤不仅可以用于治疗失眠、焦虑等精神系统疾病,还可以用于治疗肿瘤、循环系统等疾病,同时参与5-羟色胺、氮素代谢等生物过程,揭示了酸枣仁汤多成分、多靶点、多通路的药理作用特点.     

基于网络药理学研究覆盆子活性成分抗肿瘤作用机制

目的?采用网络药理学挖掘覆盆子抗肿瘤主要活性成分的作用靶点，探讨其多成分、多靶点、多通路的作用机制。方法?通过TCMSP数据库，结合口服生物利用度（OB30%）和类药性（DL0.18）参数，筛选覆盆子的活性成分；登录PharmMapper服务器反向预测，利用Uniprot 数据库进行校正与转化，获得潜在作用靶点；比对CTD数据库筛选并整合得覆盆子抗肿瘤的潜在靶点；通过DAVID v6.8数据库进行GO富集和KEGG通路注释分析；采用Cytoscape 3.6.1软件构建“活性成分-靶点”网络图、“核心成分-核心靶点-核心通路”网络图。结果?经筛选后得到覆盆子7个活性成分，63个潜在靶点，其中26条重要信号通路关联32个核心靶点，聚焦在5个核心成分，即谷甾醇、β-谷甾醇、覆盆子酸、鞣花酸、欧前胡素可能是覆盆子抗肿瘤的主要活性成分，而PI3K-Akt 信号通路、癌症的途径、癌症中的蛋白多糖、原癌基因蛋白信号通路、胰岛素抵抗、Rap1信号通路可能是重要的通路。结论?覆盆子中富含的甾醇类、酚酸类、香豆素类等活性成分可能作用于PPP1CC、SHBG、MAP2K1、MAPK14、RXRB、ABL1、FABP7、SULT2B1、HPGDS等关键靶点，通过抑制肿瘤细胞增殖和分化、诱导肿瘤细胞凋亡，调节糖脂代谢、激素水平、炎症反应等发挥多成分-多靶点-多通路的抗肿瘤作用机制。     

基于网络药理学和分子对接法探讨乙字汤治疗痔病的作用机制

目的:应用网络药理学和分子对接法探究乙字汤治疗痔病的活性成分和作用机制.方法:利用Pubchem和TC-MSP数据库筛选乙字汤的有效活性成分并预测作用靶点,通过Genecards数据库获取痔病相关的疾病靶点,并用UniProt数据库标准化蛋白名称.取药物疾病共同靶点,以STRING平台进行蛋白互作(PPI),借助Cyt...     

手法治疗膝骨关节病对膝关节功能改善的研究

原发性膝骨关节病 (OA)是临床常见病 ,国内调查结果显示膝 OA发病率达 3 %～ 9% [1] ,该病的病情随增龄而加重 ,并以女性多见。笔者运用手法治疗本病 ,在减少膝关节体征的同时 ,使患膝的功能得以改善 ,取得满意疗效。本文将 5 2例膝OA患者按 X线进行分型 ,根据各型的特点采用手法治疗 ,对治疗前后膝关节的功能分别计分 ,并做统计分析。1　临床资料1 .1　一般资料　 1 997年 1 1月～ 1 999年 1 2月 ,收治病人 5 2例 ,共 88个膝关节 ,其中男 6例 ,女46例 ;年龄 3 5～ 74岁 ,平均年龄 5 4.5岁 ;病程最短 1周 ,最长 3 0年 ,其中 6个月以内 1 …     

基于网络药理学探讨伸膝汤治疗膝关节骨性关节炎的作用机制

目的:利用网络药理学方法从整体观念探讨中药复方伸膝汤治疗膝关节骨性关节炎(Knee Osteoarthritis,KOA)的作用机制.方法:通过BATMAN-TCM数据库,对伸膝汤所含活性成分进行筛选并预测作用靶点,利用GeneCards、OMIM和CTD数据库检索KOA相关基因,利用韦恩图筛选伸膝汤中活性成分治疗KO...     

GC-MS结合网络药理学与分子对接探讨乳香挥发油镇痛的活性成分及作用机制＊

目的 探讨乳香挥发油的活性成分及镇痛的作用机制。方法 气相色谱-质谱联用法（GC-MS）分析乳香挥发油化学成分，对化学成分进行结构鉴定。利用Swiss Target Prediction数据库收集化学成分对应的相关靶点、GeneCards数据库查询与镇痛相关的靶点，将成分靶点与疾病靶点取交集筛选出潜在靶点；再通过Cytoscape 3.7.2软件构建化合物-靶点网络、STRING 11.0在线平台构建蛋白相互作用（PPI）网络、OmicShare在线工具对潜在靶点进行基因本体（GO）功能富集分析和基于京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路富集分析，最后利用Schrodinger Maestro软件和在线工具，对核心靶点进行分子对接验证。结果 GC-MS法研究得到乙酸辛酯、正辛醇和萜品油烯等化学成分16个，通过数据库收集到236个化学成分靶点、12171个镇痛相关靶点，筛选出217个乳香挥发油镇痛潜在靶点，其主要富集于细胞、生物调节和刺激反应等生物过程；结合、催化活性和分子转导活性等分子功能；细胞组分、细胞和细胞器等细胞组成，主要涉及神经活动配体-受体相互作用通路、氮代谢通路和癌症等通路。分子对接结果表明，主要靶点与化学成分有较强的结合能。结论 乳香挥发油镇痛作用体现出中药多成分、多靶点、多途径的作用特点，推测乳香挥发油中萜品油烯、肉豆蔻酸和正辛醇等活性成分可能通过MAPK1、CNR1和CXCL8等潜在靶点，调节神经活动配体-受体相互作用通路、氮代谢通路和癌症通路等相关信号通路达到镇痛的作用，为后续实验验证提供理论基础。     

基于网络药理学探讨黄芪治疗缺血性中风的作用机制

目的:通过构建药物与疾病之间的网络关系探究黄芪对缺血性中风（IS）的治疗机制。方法:在中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)检索黄芪有效活性成分和相关靶点;以“Cerebral Ischemic Stroke”为关键词,在人类基因的综合数据库（GeneCards）和在线人类孟德尔遗传数据库（OMIM）检索IS疾病基因靶点;利用Perl脚本分析计算出黄芪-IS之间的共同基因,String网站用来构建黄芪-IS之间蛋白作用关系网络,黄芪-IS交集基因的GO功能富集分析、KEGG通路富集分析则借助R软件完成。结果:从黄芪中筛选出16个有效成分,作用于137个IS疾病靶点,黄芪治疗IS的核心基因主要有AKT1、IL6、VEGFA、CASP3、JUN等。中药-疾病靶点共有144条GO生物学过程,功能主要与细胞活性、特异性DNA的表达和酶反应有关。共获得164条KEGG信号通路,主要包括AGE-RAGE信号通路、乙型肝炎病毒通路、前列腺癌通路、TNF信号通路、人巨细胞病毒感染通路、膀胱癌通路、胰腺癌通路、丙型肝炎通路、内分泌抵抗通路等。结论:黄芪可通过多成分、多靶点和多通路治疗IS,为临床用药提供科学理论支撑。     

艾叶油雾化吸入对大鼠的长期毒性研究

目的:观察艾叶油雾化吸入对大鼠的长期毒性。方法:大鼠100只,随机分为4组,每组25只。艾叶油大、中、小剂量组分别按每日2.50、0.50、0.10mL/kg(相当于实验有效量的87.5、17.5、3.5倍)雾化吸入给药;对照组以等体积蒸馏水雾化吸入。给药周期6个月,每日观察一般状况,每星期测量体重和进食量1次。给药3个月后,每组处死9只动物进行血常规、血液生化和病理学检查。给药6个月后,每组再处死10只动物进行血常规、血液生化和病理学检查。每组剩余6只动物停药后继续观察1个月后处死,进行全面检查。结果:大鼠始终活动正常,未发现任何中毒症状或死亡;血液学、血液生化及病理学检查等结果表明,艾叶油连续给药3个月后各组白蛋白﹙ALB﹚含量明显升高,其他指标与对照组相比无显著性差异;连续给药6个月及停药1个月后,给药组各项检测指标与对照组比较无显著差异。结论:艾叶油长期雾化吸入给药无明显毒性,是安全的。     

环境条件对蕲艾叶品质影响的研究＊

目的 研究环境条件对蕲艾叶有效物质含量以及出绒率的影响。方法 采用国家行业标准分别测定土壤水分、pH值及有机质的含量；采用紫外-可见分光光度法测定蕲艾叶总黄酮含量；参照中国药典（2015年版）方法测定蕲艾叶挥发油和鞣质含量；采用HPLC法比较样品70%甲醇提取液的峰谱特征；采用自拟的经过方法学验证的方法检测蕲艾叶出绒率。结果 蕲艾叶品质与土壤水分、pH、日照长短及施化肥与否有关。施用化肥（含N、P、K）后所产蕲艾叶的挥发油平均含量比未施化肥的高17.6%，而总黄酮和鞣质的平均含量分别降低28.5%、30.5%，且施用化肥者5种有机酸的总含量显著降低；日照时数较短的蕲艾叶的挥发油的平均含量比日照时数长的高12.6%，但总黄酮和鞣质的平均含量分别降低23.5%、19.1%，5种有机酸的含量也显著降低，且出绒率整体较低；土壤水分较少的蕲艾叶的挥发油的平均含量比土壤水分充足的高5.5%，但总黄酮和鞣质的平均含量分别降低21.4%、34.6%，5种有机酸的含量也显著降低。蕲艾叶总黄酮和鞣质的含量在土壤酸性范围内随pH的升高而升高。结论 蕲艾的栽培应选择日照充分、土壤偏酸性且水分较充足的环境，避免施用化学肥料。     

基于网络药理学探讨桂枝汤解热作用机制及药效物质基础

目的:基于网络药理学探讨桂枝汤解热作用的机制及药效物质基础;方法:利用Chem Draw绘制预测桂枝汤中化合物的结构,使用Swiss Target Prediction数据库搜索以上成分对应的靶点。使用Ingenuity Pathway Analysis(IPA)软件,寻找发热相关的基因。使用IPA软件分析桂枝汤中成分、发热相应靶点共同的通路。利用Cytoscape建立成分-靶点-通路网络,寻找主要药效成分。结果:建立了桂枝汤中主要成分与其靶点的网络图。使用IPA软件发现桂枝汤发热作用与以下6个通路相关:G蛋白偶联的受体信号,环磷腺苷(c AMP)介导的信号传导,Gαs信号,Gαi信号,腺苷酸活化水蛋白激酶(AMPK)信号,褪黑激素降解通路。桂枝汤中芍药苷代谢物Ⅰ,环磷酸腺苷与解热作用相关。结论:基于网络药理学探讨了桂枝汤解热作用的相关通路,预测了桂枝汤入血成分中芍药苷代谢物Ⅰ,环磷酸腺苷可能与解热作用相关。研究结果主要基于化学预测,还需要进一步实验验证。     

基于网络药理学预测大蓟治疗高血压的作用机制

目的：基于网络药理学方法研究中药大蓟治疗高血压的潜在作用机制。方法：利用TCMSP数据库收集大蓟的所有化学成分及作用靶点,通过Cytoscape3.6.1软件构建“成分-靶点”核心网络,利用CluGO插件对关键靶点进行GO功能和通路富集分析并构建“靶点-信号通路”网络,利用Merge功能进一步构建“成分-靶点-信号通路”网络。结果：筛选得到11种药效成分和29个关键靶点,GO功能富集分析涉及21项生物过程和6项分子功能相关条目,KEGG通路富集分析发现13条信号通路。结论：大蓟可能通过油酸、豆甾醇、刺五加苷等药效成分,作用于PTGS2、PTGS1、NCOA2、CHRM3、ADRβ2、CHRM1等关键靶点,参与调控精氨酸和脯氨酸代谢、脂肪细胞中的脂肪分解、钙信号通路等发挥抗高血压效应。     

基于GC-MS和网络药理学预测生姜炮制前后挥发性成分中的质量标志物

目的：基于气相色谱-质谱法（GC-MS）和网络药理学分析预测生姜炮制前后挥发性成分的质量标志物（Q-marker）。方法：基于GC-MS鉴定生姜和干姜的挥发油中化学成分,应用SIMCA软件进行主成分分析与正交偏最小二乘法-判别分析,并在此基础上探究3个不同产地的生姜炮制前后挥发性成分的差异,通过网络药理学分析差异成分作用靶点及通路,探讨生姜、干姜产生功效差异的作用机制。基于Q-marker筛选原则和网络药理学研究结果预测生姜、干姜挥发油的Q-marker。结果：通过GC-MS从生姜挥发油中鉴定出44个化合物,从干姜挥发油中鉴定出43个化合物,以差异成分作为Q-marker候选成分进行网络药理学分析,发现生姜挥发油中化学成分作用于核心靶点过氧化物酶体增殖激活受体γ (PPARG)、雌激素受体1 (ESR1)、缺氧诱导因子-1α (HIF1A)、前列腺素内过氧化物合酶2 (PTGS2)等,通过过氧化物酶体增殖剂激活受体（PPAR）信号通路、酪氨酸激酶-信号转导子和转录激活子（JAK-STAT）信号通路和钙信号通路等发挥作用;干姜挥发油中化学成分作用于核心靶点单胺氧化酶B(MAOB)、MAO...     

基于网络药理学探讨国医大师张磊运脾汤治疗高脂血症的分子机制＊

目的 基于网络药理学探讨运脾汤治疗高脂血症的分子作用机制。方法 通过TCMSP、Pharm Mapper、GeneCards、DisGeNET等多个数据库检索，预测并收集运脾汤的有效化学成分和对应的靶蛋白以及高脂血症的相关疾病基因，筛选关键靶点，对关键靶点及相关有效化学成分做分子对接验证，利用DAVID数据库的富集分析功能，得到运脾汤的有效化学成分干预高脂血症的过程中涉及的相关功能和通路，并构建“中药材-有效化学成分-靶点-通路”综合网络。结果 运脾汤干预高脂血症的核心成分为木犀草素、槲皮素、山奈酚、柚皮素等；核心靶点PPARG、NOS3、EGFR、APOB和ESR1，分子对接验证，大部分靶点与化合物有结合活性较好；DAVID富集分析，运脾汤可能通过细胞内外刺激、脂多糖反应和调节凋亡等生物过程和HIF-1信号通路、AGE-RAGE信号通路、胰岛素信号通路、TNF信号通路等途径干预高脂血症。结论 本研究初步预测了运脾汤干预高脂血症的多成分、多靶点、多通路的作用机制，为进一步实验研究提供理论依据。     

基于数据挖掘和网络药理学的肝肾亏虚型膝骨关节炎的用药规律及机制分析

目的：基于数据挖掘和网络药理学探讨治疗肝肾亏虚型膝骨关节炎的用药规律及其作用机制。方法：通过检索国家知识基础设施数据库（CNKI）近10年治疗肝肾亏虚型膝骨关节炎的方剂,运用中医传承辅助平台建立数据库,利用该软件的熵聚类等算法,总结出治疗肝肾亏虚型膝骨关节炎方剂中的用药频率、核心组合、核心药物模式及归经频率以及得出新方组合。再运用中药系统药理学数据库与分析平台（TCMSP）、基因表达综合（GEO）、STRING、Metascape等数据库及Cytoscape软件对其核心药物靶点与差异表达基因交集进行蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）、京都基因和基因组百科全书（KEGG）分析,并构建药物-成分-靶点关系网络图。结果：筛选符合纳入标准的72首方剂所含药物进行频次统计分析,得出频次≥10次的药物有25味,其中使用频次较高的有牛膝、当归、熟地黄;药物的归经以肝、肾、脾经为主;通过系统熵聚类的层次聚类分析挖掘出核心组合药物16个及新处方8首;对核心药物牛膝、当归与熟地黄进行网络药理学分析得到槲皮素、豆甾醇、β-谷甾醇等关键活性成分及靶点176个;膝骨关节炎差异表达基因258个;核心Hub基因为IL-6、MMP9、CXCL8、JUN、VEGFA;KEGG富集分析主要在IL-17、TNF、Toll样受体、核因子κB等信号通路上。结论：治疗肝肾亏虚型膝骨关节炎以补益肝肾、通络止痛为主,其机制可能通过作用IL-6、MMP9等靶点及对IL-17、TNF、Toll样受体、核因子κB等复杂通路的共同干预实现。