酵母双杂交技术筛选NECL1胞内区的结合蛋白

目的 筛选人源膜表面黏附分子NECL1蛋白胞内区相互作用蛋白。 方法 构建含人NECL1蛋白胞内区氨基酸编码序列的诱饵质粒pGBKT7-NECL1C,对人胎脑cDNA文库进行酵母双杂交筛选。用GST pull down实验进行体外蛋白相互作用的验证。结果 酵母双杂交阳性克隆测序后显示共存在9段不同序列（存在重复克隆）。比对氨基酸序列得到5个可能相互作用蛋白。通过GST pull down 实验验证了其中两个蛋白与NECL1胞内区的相互作用。结论 应用酵母双杂交系统,获得了一些候选的NECL1胞内区相互作用蛋白。     

原癌基因LMO3相互作用蛋白的筛选及鉴定

目的 通过筛选LMO3的相互作用蛋白,进一步了解LMO3的作用及可能机制.方法:酵母双杂交方法 筛选LMO3相互作用蛋白,并通过酵母结合试验、免疫共沉淀及荧光共定位等进行验证.结果:在初步获得相互作用蛋白CIB的基础上,在酵母中证实了LMO3与CIB的相互作用,并通过酵母结合试验确定了CIB与LMO3的相互作用位点,发...     

酵母双杂交文库筛选及N型钙离子通道与BART相互作用的初步分析

目的应用酵母双杂交技术筛选N型钙离子通道相关蛋白,并对候选蛋白BART(binder of arltwo)进行初步分析。方法用N型钙离子通道α1亚基C端630个氨基酸残基肽段(Calcium channel630a-mino acids,CaCh630)作为探针,运用酵母双杂交技术筛选出与之相互作用的基因。通过PCR扩增并克隆候选基因BART,然后分别构建带有红色荧光蛋白标签的表达载体pDsRed-BART和带绿色荧光蛋白标签的pEGFP-CaCh630,共转染海马神经元后,用激光共聚焦扫描显微镜观察这两个外源蛋白在细胞中的定位情况。结果应用酵母双杂交技术筛选出6个相关基因,体外共转染试验发现BART和CaCh630分子在海马神经元内有共定位现象,进一步证明其可能存在相互作用。结论BART可能在维持钙离子通道细胞骨架中定位起重要作用。     

人类ZAKβ与YWHAZ蛋白相互作用的初步研究

目的研究ZAKβ与YWHAZ蛋白之间的相互作用。方法以ZAKβ为诱饵蛋白,利用酵母双杂交筛选人类肝脏cDNA文库,经GST Pull-down、免疫共沉淀和细胞共定位实验分别验证ZAKβ与猎物蛋白在体外和细胞内的相互作用,构建ZAKβ的截短体以确定相互作用的区域,用磷酸化抗体检测ZAKβ在相互作用中的磷酸化作用,并通过流式细胞仪检测这对蛋白相互作用对细胞周期的影响。结果利用酵母双杂交筛选到一个能与ZAKβ相互作用的蛋白YWHAZ,并在体外和细胞内都验证了这二者的相互作用,发现这两个蛋白都能共定位于293T细胞的胞质中,确定了ZAKβ的N端1~250氨基酸为与YWHAZ蛋白相互作用的区域。体外实验发现了这二者的相互作用涉及到磷酸化反应,发现这对蛋白的相互作用能提高293T细胞的G2期水平。结论首次发现并证实了ZAKβ和YWHAZ之间的相互作用,发现该相互作用涉及到磷酸化过程并能够对细胞周期产生影响。     

与14-3-3ζ相互作用的蛋白Polo样激酶1的筛选与鉴定

目的:应用酵母双杂交系统筛选与14-3-3ζ相互作用的蛋白,进一步鉴定其与Polo样激酶1(Plk1)相互作用。方法:构建pGBKT7-14-3-3ζ诱饵表达载体,筛选HeLa细胞cDNA文库中与14-3-3ζ相互作用蛋白,进一步通过共转酵母、免疫荧光以及外源性和内源性的细胞免疫共沉淀实验验证两者的相互作用。结果:通过酵母双杂交系统筛选出的阳性相互作用蛋白中包括Plk1,进一步通过共转酵母,外源性和内源性的细胞免疫共沉淀实验证实两者的相互作用,免疫荧光实验证实两者共定位于有丝分裂过程中胞质分裂期的中体。结论:Plk1是高度保守的丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶,在中体的成熟,有丝分裂期染色体的分离,胞质分裂以及DNA的损伤应答等环节发挥重要作用,其与14-3-3ζ的相互作用为14-3-3蛋白家族参与有丝分裂(M期)的调控提供了直接证据。     

酵母双杂交筛选与单剪接型2.2 kb乙型肝炎病毒剪接特异性新蛋白相互作用的肝细胞蛋白

目的 筛选与单剪接型2.2 kb乙型肝炎病毒(HBV)剪接特异性新蛋白相互作用的肝细胞蛋白.方法 PCR扩增单剪接型2.2 kb HBV剪接特异性新基因TPss并克隆于诱饵载体pGBKT7,在证实TPss蛋白不具有自激活作用的前提下,以酵母双杂交系统筛查与TPss蛋白相互作用的肝细胞蛋白,进而通过哺乳动物细胞双杂交实验验证候选肝细胞蛋白与TPss蛋白在Huh7和HepG2肝细胞中的相互作用.结果 构建酵母双杂交诱饵载体pGBKT7-TPss,Western blot显示其在酵母中表达TPss蛋白.酵母双杂交筛选及哺乳动物细胞双杂交证实TPss蛋白可与4种肝细胞蛋白相互作用,即组织蛋白酶B、微粒体环氧化物水解酶、组织蛋白酶D与纤维蛋白原γ链.结论 TPss可与多种肝细胞蛋白相互作用.     

ATPase 抑制因子1是与HCMV pUL23蛋白相作用的宿主蛋白分子-酵母双杂交技术筛选与鉴定

目的： 利用酵母双杂交技术筛选与人巨细胞病毒相互作用的宿主蛋白分子,为探讨人巨细胞病毒pUL23蛋白在HCMV生活周期中的作用机制提供依据。方法: 利用GAL4酵母双杂交系统筛选人胚肾cDNA文库,以获得与人巨细胞病毒pUL23蛋白相互作用的宿主蛋白分子,再通过回交试验和体外GST-pulldown试验验证两者之间的相互作用。结果: 酵母双杂交筛选得到宿主蛋白分子ATPase inhibitory factor 1（ATIF1）,回交试验和体外GST-pulldown试验再次确认ATIF1能够与人巨细胞病毒pUL23蛋白相互作用。结论: pUL23确实能够与ATIF1相互作用,它们之间的相互作用可能为研究pUL23在病毒生活周期发挥的功能提供依据。     

NMDA受体亚单位NR2D与MOCA相互作用的鉴定

目的:寻找N-甲基-D-天冬氨酸(N-methyl-D-aspartate,NMDA)受体亚单位NR2D的结合蛋白,为探讨NR2D在视网膜兴奋性毒性损伤中的作用提供依据。方法:构建了包含NR2D细胞内C末端的cDNA片段为诱饵质粒,应用酵母双杂交技术筛选小鼠脑cDNA文库,并用免疫共沉淀实验进一步验证NR2D与其结合蛋白之间的相互作用,免疫荧光显微镜观察NR2D和目的蛋白在视网膜中的共表达。结果:酵母双杂交筛选到细胞黏附修饰因子(modifier of cell adhesion,MOCA)为NR2D可能的相互作用蛋白,两者在视网膜有共定位。结论:MOCA能特异结合谷氨酸受体NR2D,这为进一步研究谷氨酸的兴奋性毒性参与视网膜退行性变的机制奠定了实验基础。     

hCDC14A与BRAP2相互作用的初步研究

目的： 筛选hCDC14A(human cell division cycle gene 14A)的相互作用蛋白，探索功能联系。方法： 酵母双杂交筛选hCDC14A的可能相互作用蛋白，Pulldown实验和免疫共沉淀实验验证蛋白质间相互作用，免疫荧光显微镜观察目的基因在细胞中的表达和定位，体内泛素化实验提示可能的相互作用机制。结果： 酵母双杂交筛查到BRAP2(BRCA1 associated protein 2)为hCDC14A的可能相互作用蛋白，两者有共同定位，BRAP2可以增强hCDC14A的泛素化修饰。结论： BRAP2可以与hCDC14A相互作用，可能是hCDC14A的泛素连接酶。     

Klotho:与FPC蛋白相互作用的蛋白质分子

目的:利用酵母双杂交技术筛选与纤囊素相互作用的蛋白质,为进一步探讨纤囊素(FPC)在常染色体隐性遗传多囊肾病(ARPKD)发生、发展中的作用机制提供依据。方法:利用酵母双杂交系统以质粒pG-BKT7-FPC为"诱饵",在人类胚肾cDNA文库中筛选与FPC蛋白C末端相互作用宿主蛋白的基因,再通过一对一回交试验验证两者之间的相互作用。结果:酵母双杂交筛选得到相互作用的蛋白分子Klotho(后简称KL),回交试验再次确认KL能够与FPC蛋白相互作用。结论:FPC的C末端能够与KL相互作用,它们之间的相互作用可能为研究FPC在ARPKD发病中的功能及作用机制提供新途径。     

人巨细胞病毒皮层蛋白pUL23与宿主蛋白IGFBP4相互作用的鉴定

目的:利用蛋白质相互作用的技术筛选与pUL23相互作用宿主蛋白,为研究pUL23蛋白对人巨细胞病毒繁殖的影响提供线索。方法:通过酵母双杂交系统从人胚肾cDNA文库筛选与pUL23相互作用的宿主蛋白;通过GST-pu ll-down技术研究二者体外物理性相互作用;免疫共沉淀技术进一步研究二者在胞内相互作用。结果:Pu ll-down技术、免疫共沉淀技术确定了宿主蛋白IGFBP4与pUL23具有相互作用。结论:上述结果为研究pUL23蛋白调节病毒自身繁殖功能提供重要依据。     

Multiple interactions among proteins encoded by the mite-transmitted wheat streak mosaic tritimovirus

The genome organization of the mite-transmitted wheat streak mosaic virus (WSMV) appears to parallel that of members of the Potyviridae with monopartite genomes, but there are substantial amino acid dissimilarities with other potyviral polyproteins. To initiate studies on the functions of WSMV-encoded proteins, a protein interaction map was generated using a yeast two-hybrid system. Because the pathway of proteolytic maturation of the WSMV polyprotein has not been experimentally determined, random libraries of WSMV cDNA were made both in DNA-binding domain and activation domain plasmid vectors and introduced into yeast. Sequence analysis of multiple interacting pairs revealed that interactions largely occurred between domains within two groups of proteins. The first involved interactions among nuclear inclusion protein a, nuclear inclusion protein b, and coat protein (CP), and the second involved helper component-proteinase (HC-Pro) and cylindrical inclusion protein (CI). Further immunoblot and deletion mapping analyses of the interactions suggest that subdomains of CI, HC-Pro, and P1 interact with one another. The two-hybrid assay was then performed using full-length genes of CI, HC-Pro, P1, P3, and CP, but no heterologous interactions were detected. In vitro binding assay using glutathione-S-transferase fusion proteins and in vitro translation products, however, revealed mutual interactions among CI, HC-Pro, P1, and P3. The failure to detect interactions between full-length proteins by the two-hybrid assay might be due to adverse effects of expression of viral proteins in yeast cells. The capacity to participate in multiple homomeric and heteromeric molecular interactions is consistent with the pleiotropic nature of many potyviral gene mutants and suggests mechanisms for regulation of various viral processes via a network of viral protein complexes.     

Alzheimer's disease-associated presenilin 2 interacts with DRAL, an LIM-domain protein

Using the yeast two-hybrid system, we screened for proteins interacting with presenilin 2 (PS2) and cloned DRAL. DRAL is an LIM-only protein containing four LIM domains and an N-terminal half LIM domain. Previously DRAL has been cloned as a co-activator of the androgen receptor and as a protein interacting with a DNA replication regulatory protein, hCDC47. Our yeast two-hybrid assay showed that DRAL interacted with a hydrophilic loop region (amino acids 269-298) in the endoproteolytic N-terminal fragment of PS2, but not that of PS1, although the region 269-298 of PS2 and the corresponding PS1 sequence differ by only three amino acids. Each point mutation within this region, R275A, T280A, Q282A, R284A, N285A, P287T, I288L, F289A and S296A, in PS2 abolished the binding. This suggests that DRAL recognizes the PS2 structure specifically. The in vitro interaction was confirmed by affinity column assay and the physiological interactions between endogenous PS2 and DRAL by co-immunoprecipitation from human lung fibroblast MRC5 cells. Furthermore, in PS2-overexpressing HEK293 cells, we found an increase in the amount of DRAL in the membrane fraction and an increase in the amount of DRAL that was co-immunoprecipitated with PS2. The potential role of DRAL in the cellular signaling suggests that DRAL functions as an adaptor protein that links PS2 to an intracellular signaling.     

酵母双杂交技术筛选乙型肝炎病毒DNA聚合酶TP结合蛋白的研究

目的　筛选与乙型肝炎病毒 (HBV)DNA聚合酶-N末端蛋白 (TP)相互结合的肝细胞蛋白 ,进一步探讨TP的生物学功能。方法　用聚合酶链反应 (PCR)技术扩增TP片段 ,连接入酵母表达载体pGBKT7中构建诱饵质粒 ,转化酵母细胞AH 10 9并在其内表达 ,然后与转化了人肝cDNA文库质粒pACT2的酵母细胞Y187进行配合 ,在营养缺陷型培养基和X-α-半乳糖苷酶 (X-α-gel)上进行双重筛选阳性菌落 ,DNA序列测定并进行生物信息学分析。结果　成功获得了 4 7个与TP特异性结合的阳性克隆 ,包括人类固醇调节元件结合蛋白 1(SREBP1)、RNA聚合酶Ⅱ亚单位 (hsRPB7)、血浆铜蓝蛋白(CP)等 2 1种已知功能蛋白质基因和 19个假设蛋白基因。结论　HBVDNA聚合酶-TP可以与某些已知和未知功能蛋白相互结合 ,提示其具有较广泛的生物学功能