HLA新等位基因A*110202的发现

目的:用DNA测序的方法确定HLA新等位基因.方法:用SSO流式荧光微珠技术(LABMAS)进行常规HLA-A、B、DRB1中低分辨检测,用DNA 测序的方法鉴定HLA*A新等位基因.结果:应用3种常规的HLA检测试剂检测该标本,均无法得到确切的A位点的结果,合成特异性引物对A位点2、3外显子进行扩增测序,发现在HLA*A 的2外显子区域出现295 C＞A,该改变不引起氨基酸变化,无新的抗原产生.结论:该新的基因经WHO HLA因子命名委员会(IMGT)注册确认为A*110202,注册号为HWS 10003507-DQ354441.     

HLA新等位基因B*4086的确认及家系调查

 目的 识别和鉴定HLA新等位基因B*4086,调查分析该基因的遗传情况。方法 应用聚合酶反应-序列特异性寡核苷酸探针（PCR-sequence specific oligonucleotide primer,PCR-SSOP）技术对中华骨髓库志愿捐献者血样进行HLA分型,发现1例HLA-B疑似新等位基因,用DNA测序技术鉴定新等位基因并对该基因的携带者进行家系调查。结果 经DNA测序确定为HLA新基因序列,该基因与 HLA-B*40060101相比,第3外显子419位碱基由A→T,导致相应的140位密码子编码的氨基酸由酪氨酸（Tyr）→苯丙氨酸（Phe）。家系分析表明该新基因来自携带者母亲一方。结论 DNA测序表明被测样本含有HLA-B新等位基因,于2008年2月被世界卫生组织HLA因子命名委员会正式命名为HLA-B*4086,该新基因遗传于先证者母亲。     

HLA组特异性PCR及DNA测序确认新基因HLA-A*110202

目的:用HLA组特异性PCR扩增,DNA测序方法确认新等位基因。方法:用SSO(序列特异性寡核苷酸探针)反向流式荧光微珠法对标本62011550进行常规HL-A、B、DRB1分型检测,A位点反应格局清晰而无法给出确切分型结果,对该基因扩增2、3外显子,以此为模板采用组特异性引物区分杂合子,分别对杂合子2、3外显子测序,将测序结果与已知的基因序列进行比较。结果:测序得到A*1102v(1102的变异体)序列与已知序列比对发现,在第2对外显子215出现C>A,导致第75密码子GGA>AGA,未引起氨基酸改变(R>R),该序列为新的HLA序列,经向WHO HLA因子命名委员会申报确定为HLA-A 110202,注册号HWS.10003507-DQ3544411(www.ebi.ac.uk/imgt/hla)结论:DNA测序是HLA分型的最直接准确方法,常用于新基因的发现,用组特异性引物区分杂合子进而进行测序简便易行,避免了基因克隆操作。     

中华骨髓库河南省捐献者HLA-A、B、DRB1基因频率及单倍型检测

目的:调查分析河南省造血干细胞捐献者人类白细胞抗原(HLA)基因A、B、DRB1多态性和单倍型频率.方法:采用国际通用的4种DNA基因分型技术(聚合酶链反应-序列特异性引物(PCR-SSP)、SSO 杂交条技术、SSO荧光微珠流式分行法、SSO正向杂交DNA基因芯片)对24 930名干细胞捐献者的血样进行HLA基因频率及单倍型分析.结果与结论:共检出等位基因:A位点20个, B位点 35个,DRB1位点13个;较常见单倍型及频率为:A*30B*13DRB1*07(0.064 070)、A*02B46*DRB1*09(0.021 900)、A*33B*58DRB1*03(17)(0.012 767)、A*33B*44DRB1*13(0.011 318)、A*02B*13DRB1*12(0.011 021).     

中国广东汉族群体HLAⅡ类基因多态性的研究

为探讨中国广东汉族群体HLAⅡ类基因多态性，采用PCR／SSO方法，随机选择102名广东籍汉族人进行了HLAⅡ类基因的DNA分型。测定了包括HLA－DRB1，DRB3，DNB5，DQA1，DQB1和DPBI等6个基因座位的等位基因。结果：共检出23种DRB1，3种DRB3，4种DRB5，8种DQA1，12种DQB1和12种DPB1基因。该人群的HLAⅡ类等位基因多态性的典型性表现在HLA－DRB*1202的不寻常优势和DRB1*02单倍型的结构的高度复杂性。还发现了很高频率的一个近年才被正式命名的DP新型：HLA－DPB1*2101，并且此型具有极不寻常的DRB1*1202－DPB1*2101的连锁不平衡。为分子流行病学研究提供了资料。     

四川地区汉族人群HLA-DRB1位点的测序分型研究

目的调查四川地区人群HLA—DRB1位点等位基因多态性,获得完整准确的遗传学数据。方法采用单管PCR扩增方法建立高效的HLA—DRB1基因测序分型（SBT）技术对180名健康个体进行HLA-DRB1基因型检测。结果共检出39种HLA—DRB1等位基因,其中等位基因HLA-DRB1＊0901的频率最高,HLA—DRB1＊1101的频率次之。结论提供了四川地区汉族人群HLA—DRB1位点等位基因频率,证实了单管扩增测序分型方法快速准确的优点。     

新等位基因HLA-A*0323的认定

目的 认定一个人类白细胞抗原(HLA)新等位基因.方法 应用多聚酶链反应-序列特异性寡核苷酸技术(polymerase chain reaction-sequence specific oligonucleotide,PCR-SSO)基因分型发现可能的HLA新等位基因.用PCR直接测序及针对组特异性扩增产物测序.确认与最同源HL～等位基因序列的差异.结果 发现一个样本的HLA-A位点结果异常.其核苷酸序列与已知所有HLA-A位点等位基因序列不一致,与同源性最高的等位基因A*030103差异是在第2外显子区域的256位碱基发生了C→C的替换,257位碱基发生了A→C的替换.270位碱基发生了T→A的替换,导致相应的62位密码子由CAG→GGG,编码的氨基酸由谷氨酰胺(Gln)→甘氨酸(Gly),导致相应的66位密码子由AAT→AAA.编码的氨基酸由天冬氨酸(Asn)→赖氨酸(Lys).结论 该等位基因为HLA-A位点的一个新等位基因.2006年7月13日被WH0 HLA因子命名委员会正式命名为HLA-A*0323.     

新等位基因HLA-B*0740,DRB1*1609,DRB1*1449的血清学表型

目的:确认新等位基因HLA-B*0740、DRB1*1449;DRB1*1609的血清学表型。方法:应用标准NIH微量淋巴细胞毒试验进行新等位基因血清学分型。结果:新等位基因HLA-B*0740、DRB1*1449、DRB1*1609的核苷酸序列与它们相应的同源等位基因不同,造成相应编码氨基酸残基差异,但是它们的血清学特异性仍为B7、DR14和DR16。结论:上述HLA新等位基因具有免疫学表型。     

湖南汉族群体HLA-DR2等位基因多态性与系统性红斑狼疮的相关性研究

以HLA DRB基因类扩增为参照 ,通过HLA DR2组特异性扩增确定HLA DR2携带者 ,PCR/SSP作亚型分型 ,并用银染PCR/SSCP分析HLA DR2等位基因第二外显子单链构像 ,调查湖南地区汉族群体SLE(系统性红斑狼疮 )患者 5 8例和健康对照 5 9例HLA DR2等位基因分布。结果示 ,HLA DR2与SLE相关 (RR =2 .71,P <0 .0 1) ,HLA DRB1 15 0 1为疾病相关等位基因 (RR =3 .10 ,Pc <0 .0 5 ) ,该群体中检出的另外两种亚型DRB1 15 0 2 ,160 2在两组间频率分布差异无显著性。此外 ,PCR/SSCP分析表明湖南汉族HLA DR2等位基因在第二外显子内不存在其他序列变异。     

子宫内膜异位症合并不孕与HLA—DQA1、DRB1的相关性

目的 探讨HLA-DQA1、DRB1等位基因与子宫内膜异位症患者不孕的相关性。方法 用聚合酶链反应-序列特异性引物（PCR-SSP）对102例经腹腔镜或外科手术证实的子宫内膜异位症患者（其中35名患者合并不孕）进行HLA-DQA1、DRB1等位基因的基因分型并与对照组进行比较。结果 子宫内膜异位症患者HLA1-DQA1*0401等位基因频率显著高于正常对照,HLA1*0301等位基因频率显著低于正常对照。其中,合并不孕者HLA1-DQA1*0301、DRB1*07、DRB1*08/12等位基因频率低于正常对照,HLA1-DRB1*07、DRB1*08/12等位基因频率低于无合并不孕者;而无合并孕者HLA-DQA1*0301,HLA-DRB1*07*08/12可能与子宫内膜异位症的不孕机制相关,HLA1*0401与子宫内膜异位症的发病机制相关,但不参与子宫内膜异位症的不孕机制。]     

内蒙古鄂温克族人群HLA-DRB1基因多态性与族源分析

目的：对内蒙古鄂温克族人群人类白细胞抗原（human leukocyte antigen,HLA）Ⅱ类基因DRB1位点进行基因型检测.方法：采用DNA序列测定的分型技术（sequencing based typing,SBT）,对94名鄂温克族个体进行分析.结果：DRB1等位基因中,共检出25种等位基因,内蒙古鄂温克族以DRB^1＊090102 （16.0%）的频率最高,其次为DRB1^＊030101 （13.3%）、 DRB1^＊040101（10.1%）、DRB1^＊070101 （7.4%）、DRB1^＊120101/1206（7.4%）;系统树上鄂温克族与同样是北方人群的北方汉族、沈阳汉族和蒙古族聚在一起.结论：鄂温克族人群中HLA-DRB1分布特征有其独特性,鄂温克族基因频率和系统树显示鄂温克族属于中国北方人群.     

原发性高血压与HLA-DRB等位基因相关的研究

目的：分析高血压患者的遗传易感性的遗传性背景。方法：采用PCR-SSP技术对病例组56例、正常对照组104例进行HLA-DRB等位基因分型。结果：HLA-DRB1*12等位基因频率显著高于正常组，并与发病年龄密切相关，即发病年龄越早，与DRB1*12的关联强度越大。HLA-DRB1*03也出现随发病年龄的提前，而显示出明显的关联趋势。结论：HLA－DRB*12是高血压病的相关基因，与该病的遗传易感性有较密切关系。     

广东汉族人群HLA-ABDR基因频率分析

目的　检测广东汉族人群HLA -A ,B ,DRB1基因频率 ,分析该人群HLA等位基因多态性及其特点。方法　肾移植、骨髓移植供者 4 0 4例 ,抗凝血提取DNA ,半量全自动PCR -RSSO分型检测HLA -A ,B ,DRB1基因型。结果　在中分辨水平检出HLA -A等位基因 15个 ,HLA -B等位基因 31个 ,HLA -DRB1等位基因 13个。广东汉族人群HLA -A 11(0 .3342 ) ,A 0 2 (0 . 30 87) ,A 2 4 (0 . 2 2 16 ) ;HLA -B 6 0 (0 16 81) ,B 4 6 (0 . 16 81) ;HLA-DRB1 0 9(0. 175 5 ) , DRB1 15 (0 .14 90 ) ,DRB1 12 (0 . 1192 ) ,DRB1 14 (0 1192 ) ,DRB1 0 4 (0 .10 6 7)具有较高的基因频率分布 (>0. 10 )。Hardy -Weinberg平衡检验 :HLA -A(χ2 =6 0 .35 ,υ =5 4 ,P >0 1) ,B(χ2 =173. 6 7,υ =4 6 5 ,P >0 . 1) ,DRB1(χ2 =78. 4 6 ,υ =78,P >0 . 5 ) ,期望值和观察值吻合良好。结论　广东汉族群体HLA基因具有较为丰富的多态性 ,该人群HLA -A、B、DRB1等位基因处于遗传平衡状态 ,其基因频率分布具有地区性遗传特征。     

广东汉族人群HLA-Cw多态性及单体型分析

目的检测广东汉族人群HLA．Cw及HLA-A、B、DRB1基因频率，分析该人群HLA-Cw等位基因多态性及其单体型特点。方法骨髓移植供者185例，抗凝血提取DNA，半量全自动PCR-RSSO分型检测HLA-A、B、Cw、DRB1基因型。结果在分辨水平检出Cw等位基因11个，其中分布频率较高的依次为：Cw*03(0．2580)、Cw*07(0．1887)、Cw*01(0．1732)、Cw*08(0．1070)。统计分析呈现显著连锁不平衡的HLA-Cw．A单体型7个，HLA-Cw-B单体型20个，HLA—Cw．DRB1单体型10个。结论广东汉族群体HLA-Cw基因具有较为丰富的多态性，其与HLA-A、B、DRB1间连锁不平衡单体型具有地区性遗传特征。     

HLA-DRB1 genes in 5 rheumatic disease multi-case families

OBJECTIVE: To detect HLA-DRB1 (DR1-10) alleles in 5 families with multi-case rheumatic diseases, and to study the possible influence of DRB1 genes in the pathogenesis of rheumatic diseases. METHODS: Sequence-Specific Primer PCR (PCR-SSP) method was used to examine HLA-DRB1 alleles. Totally 36 members of 5 families and 166 healthy people were involved in this study. The results were assessed by Chi-square test. RESULTS: The HLA-DRB1 allele frequency in the patients and their relatives was similar. No significant difference was found. But DR4 allele frequency in the patients (90.9%) and their relatives (68%) was much higher than that in normal controls (16.8%) and the difference was statistically significant (P < 0.0001). In family 4, two RA patients have different DRB1 alleles, while in family 5, two patients have the same DRB1 alleles, one developed SLE and the other developed RA. CONCLUSIONS: DR4 is closely related to rheumatoid arthritis. The nelatives of RA patients may be at greater risk to develop RA than individuals without family history. Some patients had the same DRB1 allele but developed different rheumatic diseases. This suggested that there might be some common pathways in genetic predisposing of rheumatic diseases. On the other hand, only a few patients with the same DRB1 allele developed rheumatic diseases during their life, so other factors besides DRB1 gene might also be involved in the pathogenesis of rheumatic diseases.     

广东汉族人群HLA-Cw多态性及单体型分析

目的 检测广东汉族人群HLA-Cw及HLA-A、B、DRB1基因频率,分析该人群HLA-Cw等位基因多态性及其单体型特点。方法 骨髓移植供者185例,抗凝血提取DNA,半量全自动PCR-RSSO分型检测HLA-A、B、Cw、DRB1基因型。结果 在分辨水平检出Cw等位基因11个,其中分布频率较高的依次为Cw^*03(0.2580)、Cw^*07(0.1887)、Cw^*01(0.1732)、Cw^*08(0.1070)。统计分析呈现显著连锁不平衡的HLA-Cw-A单体型7个,HLA-Cw-B单体型20个,HLA-Cw-DRB1单体型10个。结论 广东汉族群体HLA-Cw基因具有较为丰富的多态性,其与HLA-A、B、DRB1间连锁不平衡单体型具有地区性遗传特征。     

HLA-DRB1基因芯片与PCR-SSP分型的比较

目的：比较基因芯片和PCR-SSP用于汉族南方人群HLA-DRB1基因分型的结果，评价分型芯片的准确性。方法：77份待分型样本，分别用等位基因特异的PCR-SSP和基因分型芯片对DRB1分型。芯片分型通过组间特异引物扩增基因组DNA，扩增用荧光标记。扩增标记后的产物与分型芯片的探针杂交，通过杂交产生的荧光信号确定样品的HLA-DRB1基因亚型，比较两种方法分型所获得的结果，不吻合的样本全部经第三方验证或测序。结果：77份样本，两种方法分型全部成功。分型结果的吻合率为93％。不吻合样本6份，其中SSP定型纯合子4份，芯片分型全部为杂合子。经第三方验证，证实芯片对纯合子和杂合子的分型全部正确。另外2份不吻合的样本经测序，证实SSP分型错误1份，芯片分型错误1份。芯片的重复率为96％。结论：基因芯片是一种理想的分型方法，具有特异性高、重复性好、操作简便、所需样本量少、一次可作多份样本的优点。