新型冠状病毒核酸检测分析

在新型冠状病毒具备较高的传染性和隐蔽性,在发作前会经历14天的潜伏期,新型冠状病毒的核酸检测中值得注意的是相当一部分疑似病例都是通过多次检测才确诊了结果,阳性患者的核酸检测阳性率不到五成,检测反馈效率不高,虽然检测仍然是有效途径,但这无疑对于检测的结果、效率和公共卫生安全问题有所影响,需要加以重视和改善。因此,本文对新型冠状病毒核酸检测进行简要分析,主要从假阴性、假阳性的引起因素出发去分析检测问题,并通过一定的实验结果对比来观察核酸检测问题,以期能够为医疗机构尤其是基层医院提供一些核酸检测工作上的帮助。     

新型冠状病毒检测系统性能验证分析

目的 验证新型冠状病毒核酸检测系统,分析是否满足口岸新型冠状病毒(SARS-CoV-2)快速检测要求。 方法 依据 《医学实验室质量和能力认可准则在分子诊断领域的应用说明》(CNAS-CL02-A009)要求,评估新型冠状病毒核酸检测系统(包括核酸提取试剂、核酸提取仪、PCR扩增试剂和 PCR 仪)检测性能,主要包括防污染情况、符合性、检出限、重复性和抗干扰能力等技术参数。 结果 在环境测试以及高浓度样本交叉污染的测试中, 阴性符合率和阳性符合率均为100%;灵敏度试验结果显示,该检测系统的灵敏度可以达到约 10² copies/ml,重复性 CV 值均在 4%以内; 抗干扰能力选择在咽拭子标本采集管中加入 5%的全血、5%的氯化钠、 布地奈德鼻喷雾剂(5%),结果符合率 100%。 结论 本次验证 SARS-CoV-2 的检测系统防污染措施、符合性、检出限、重复性和抗干扰能力等性能指标与试剂厂家声明一致,本检测系统可满足 SARS-CoV-2 实验室快速检测需求。     

新型冠状病毒实验室核酸检测方法及实践

目的研究新型冠状病毒(2019-nCoV)实验室核酸检测的原理方法,探讨实时荧光定量PCR方法在新型冠状病毒实验室检测中的价值与实验室注意事项。方法采用实时荧光定量PCR方法检测2020年1月23日-2020年2月2日就诊于解放军总医院海南医院发热门诊的患者以及筛查的湖北旅居者的咽拭子,采用实时荧光定量PCR的方法检测新型冠状病毒开放读码框1ab(ORF1ab)、核壳蛋白(N)基因。结果共检测的3 824例标本中,阳性病例35例,阳性率0.91%。结论疫情期间对发热门诊患者及湖北旅居者进行2019-nCoV核酸筛查是非常有必要的,实时荧光定量PCR是一种检测2019-nCoV科学可靠的方法,能快速准确地检测待检标本中的2019-nCoV核酸,对监测和控制疫情有重要意义。     

核酸快速检测系统在新型冠状病毒检测中的应用评价

目的:探讨核酸快速检测系统在新型冠状病毒（SARS-CoV-2）检测中的性能与应用评价。方法:收集北京市疾病预防控制中心和中日友好医院检验科2020年2至7月的临床样本,评价核酸快速检测系统对SARS-CoV-2检测的敏感度、特异度、抗干扰能力、精密度以及临床样本检测符合率。分析敏感度的评价通过检测浓度梯度稀释的SAR...     

咽拭子新型冠状病毒核酸检测的临床价值

 目的 了解某院新型冠状病毒肺炎（COVID-19）患者的临床资料及咽拭子检查结果,评价咽拭子新型冠状病毒（SARS-CoV-2）核酸检测的临床价值,为临床诊断COVID-19提供参考。方法 回顾性收集中南大学湘雅医院2020年1月23日—2月18日经SARS-CoV-2核酸检测确诊COVID-19患者病历资料,分析患者临床资料、病毒核酸检测的取样次数、取样方法、标本类型、检测手段等信息。结果 28例确诊患者平均年龄（43.78±14.46）岁,男女比例为2.5∶1,46.42%的患者有武汉/湖北旅居史,14.29%的患者与确诊COVID-19患者有密切接触史。患者临床表现以发热（78.57%）、咳嗽（53.57%）为主,实验室检查可见白细胞计数正常（71.43%）,淋巴细胞计数下降（53.57%）,肺部CT呈多发磨玻璃影（92.59%）及斑片影（70.37%）。28例确诊病例中,发病至确诊的中位时间为5.5 d。首次采集标本SARS-CoV-2检测阳性者18例（64.29%）,首次可疑阳性1例;首次阴性（包括可疑阳性）,第二次采集阳性者5例（17.86%）;前两次采集阴性,第三次采集阳性者2例（7.14%）;经四次检测阳性者1例（3.57%）;经五次检测后阳性者2例（7.14%）。鼻/口咽拭子采样26例（92.86%）,诱导排痰2例（7.14%）,经鼻咽拭子、咽拭子、痰标本RT-PCR确诊27例（96.43%）,痰标本NGS测序确诊1例（3.57%）。结论 COVID-19临床常表现有发热及干咳,但无特异性,仍需依赖SARS-CoV-2核酸检测才能确诊。咽拭子作为发热门诊首选的SARS-CoV-2核酸采集方式具有简便易行的优势,但检测结果呈阴性并不能排除SARS-CoV-2感染。     

新型冠状病毒肺炎核酸检测采样技巧

正新型冠状病毒肺炎是一种急性感染性肺炎,是由2019新型冠状病毒(2019-n CoV)感染引起。患者初始症状为发热、乏力和干咳,并逐渐出现呼吸困难等严重表现。经呼吸道和密切接触传播是主要的传播途径。多数患者经过治疗预后良好,部分严重病例可出现急性呼吸窘迫综合征或脓毒血症休克,甚至死亡。随着疫情发展,国家鼓励三甲医院及县     

15种新型冠状病毒核酸检测试剂的检测性能比较

目的 比较15种新型冠状病毒(COVID-2019)核酸检测试剂的阳性率,为新冠核酸检测实验室选择检测试剂提供参考。方法 挑选2021—2022年四川新型冠状病毒阳性样本50份,选取15种新型冠状病毒核酸检测试剂(编号A～O),严格按照试剂说明书进行核酸检测,运用SPSS 22.0软件对实验结果进行卡方检验。评价15种试剂检测新型冠状病毒核酸阳性率和阴性率的差异是否具有统计学意义,检验水准α=0.05。结果 15种试剂的阳性检出率分别为试剂A 18.00%、试剂B 30.00%、试剂C 60.00%、试剂D 62.00%、试剂E 56.00%、试剂F 46.00%、试剂G 62.00%、试剂H 56.00%、试剂I50.00%、试剂J 30.00%、试剂K 54.00%、试剂L 60.00%、试剂M 32.00%、试剂N 68.00%和试剂O 40.00%,其中试剂N检出率最高(68.00%),差异具有统计学意义(χ²=62.464,P<0.001);试剂检测限试剂阳性率比较差异无统计学意义(χ²=7.808,P=0.099);模板占体...     

医疗机构新型冠状病毒核酸检测的生物安全管理实践

自2019年12月以来,以我国湖北省武汉市为中心暴发的新型冠状病毒肺炎成为重大突发公共卫生事件。新型冠状病毒核酸检测结果作为确诊依据,急需有条件的临床机构开展检测项目。通过对医疗机构快速开展新型冠状病毒核酸检测工作、做好生物安全管理实践的总结,文章认为严格执行各项规章制度、进行实地演练及培训、注重细节管理,是做好生物安全管理、避免在院内产生次生生物安全危害的有效手段。     

不同提取及扩增方法检测新型冠状病毒核酸的性能比较分析

目的 对磁珠法和释放剂法2种核酸提取方法及扩增时长不同的2种荧光PCR试剂盒检测新型冠状病毒的性能进行比较,为医疗机构对新冠核酸检测试剂盒以及核酸提取方法的选择提供参考依据.方法 将定值质控品稀释成1 000、500、250、125、62.5和31.25 copies/mL 6个不同梯度浓度,根据不同的提取方法与扩增试...     

新冠病毒核酸检测试剂盒的性能分析与评价

目的：对4种新型冠状病毒核酸检测试剂盒的性能包括敏感性与特异性、最低检出限、精密度和分析特异性进行评价,为实验室选择新冠病毒核酸检测试剂盒提供参考,促进新冠肺炎病毒核酸检测技术的创新改进。方法：以20例新冠病毒确诊阳性和10例确诊阴性的咽拭子作为研究样本,经提取得到RNA后根据4种新冠病毒核酸检测试剂盒说明书对其进行检测,分析扩增结果,评估各试剂盒的差异。结果：检测结果显示4种试剂盒对30例研究样本的阴阳性判定情况不尽相同,其中a试剂盒的敏感性和特异性最高,均达到100%;3例阳性样本稀释到100倍时,c试剂盒只能检出其中的1例,而其他三种试剂盒能检出其中的2例,表明c试剂盒的检测敏感性低于其他三种;4种试剂盒在精密度实验中检测样本得到的Ct值的CV值都较接近,且都<10%;加入了8种常见的高浓度干扰物质的临界阳性样本经4种试剂盒检测,结果依然为弱阳性,说明无干扰;4种试剂盒检测5例含非目标病毒的临床样本,检测结果为阴性,即未发生交叉反应。结论：新冠病毒核酸检测试剂盒对低浓度核酸样本的检测能力有所差异,各试剂盒不同的检出限也造成了总体上的敏感性和特异性的差异,实验室在选择新冠病毒...     

咽拭子新型冠状病毒核酸检测结果分析

目的:分析咽拭子新型冠状病毒(SARS-CoV-2)核酸检测结果,评价咽拭子SARS-CoV-2核酸检测的临床应用价值.方法:回顾性分析2020年1月23日至3月15日经SARS-CoV-2核酸检测确诊为COVID-19患者的病历资料,分析患者病历资料、SARS-CoV-2核酸检测的取样次数、方法等信息.结果:实验室检...     

初筛核酸阴性的新型冠状病毒肺炎1例

Detection of nucleic acid is a method to first confirm COVID-19 theoretically, but it may show false negative result in clinical practice. This study indicates that suspected patients with COVID-19 cannot be ruled out easily because of once or twice negative results of nucleic acid detection. The epidemiology and radiological findings should be closely monitored. Dynamic test for viral nucleic acid is needed to avoid missed diagnosis, thus causing the spread of disease and missing the best time for early treatment. Clinical epidemiology, radiological findings, sampling time and criteria have posed significance to diagnose the disease and judge the severity.     

驻马店市154例新型冠状病毒感染者核酸检测Ct值的动态变化分析

目的 回顾性分析新型冠状病毒(COVID-19)感染者临床特征及核酸检测Ct值的动态变化,为疫情防控提供依据.方法 收集驻马店市新冠肺炎确诊病例和无症状感染者背景信息及核酸检测结果,对不同样本类型、不同临床症状感染者样本检测Ct值进行比较,并探讨感染人群中核酸阳性率及Ct值的动态变化.结果 共有154例COVID-19感染者,确诊病例139例(占90.26％),无症状感染者占9.74％;以20～＜40岁为主(占69.48％),职业多为农民及民工(占57.79％),101例(占65.58％)有武汉暴露史.确诊病例和无症状感染者性别、年龄、武汉暴露史、治愈时间差异均无统计学差异(P值均＞0.05).首轮核酸检测的阳性率85.06％,3轮核酸检测阳性率为100.00％.确诊病例主要临床表现为发热(占82.01％)、干嗽(占97.41％)、咳痰(占25.90％)、乏力(占22.30％);不同临床症状、不同样本类型样本首轮核酸阳性检出率和检测Ct值差异均无统计学意义(P值均＞0.05).采取及时干预措施后2～3周感染者核酸检测结果均转为阴性.结论 COVID-19感染者存在一定比例的无症状感染者,需要加强筛查和管理;单轮核酸检测存在假阴性现象,需要结合流行病学史,多次核酸检测避免漏检或复阳现象.     

新型冠状病毒感染核酸和抗体检测方法比较

  目的  对高速卡口货运司乘人员新型冠状病毒抗原与核酸双检测措施效果评估。  方法   对2022年3月20日 — 4月17日在宁波市北仑区8个高速卡口48734名有浙江省外旅居史货运的司乘人员进行新型冠状病毒抗原与核酸双检测,并对检测结果进行描述性统计分析。  结果  共检出9例Omicron变异株感染者,其中确诊病例6例（均为轻型）,无症状感染者3例,未发现阳性感染者续发病例;抗原检测试剂的灵敏度和特异度分别为55.5 %（5/9）和99.9 %（48717/48725）,阳性预测值和阴性预测值分别为38.5 %（5/13）和99.9 %（48717/48721）;阳性感染者中抗原阳性组ORF1ab和N基因Ct值M（P₂₅,P₇₅）分别为19.0（17.1,21.5）、19.0（16.6,22.5）,抗原阴性组Ct值均显著高于抗原阳性组（P < 0.05）。  结论  抗原检测试剂灵敏度较低但特异度高。建议在高速卡口对货运司乘人员实施抗原与核酸双检测策略,既保障物流畅通,又有效降低输入性病例引起本土疫情风险。     

郑州市新型冠状病毒核酸检测室间质量评价分析

目的 利用室间质量评价（EQA）评估2020年郑州市实验室新型冠状病毒核酸检测项目的检测能力。方法 对EQA样本采用实时荧光RT-PCR法进行验证,要求参评实验室领取样本2天内完成核酸检测及结果回报,对回报结果按说明书判读条件进行EQA分析。结果 EQA样本可进行实验室间的检测能力评价。31家参评实验室有效回报率为100.00%,29家实验室回报结果完全正确,合格率为93.54%;2家第三方医学检验所成绩为不合格。疾控机构合格率100.00%高于第三方医学检验所89.47%。1个样本检测合格率为93.54%,其他4个样本检测合格率为100.00%。2家不合格检验所整改后成绩合格。结论 郑州市参评实验室新型冠状病毒核酸检测质量整体较好,但个别实验室检测能力尚需提高。     

采样液与核酸提取试剂的匹配性对新型冠状病毒核酸检测结果的影响

目的 分析采样液对新型冠状病毒核酸提取效率的影响,为完善实验室质控措施提供依据。方法 对两批不同品牌采样管（A/B）采集的新型冠状病毒待测标本,分别用两种不同厂家生产的提取试剂（甲/乙）进行核酸提取,用同一品牌的扩增试剂和扩增仪器进行实时荧光RT-PCR检测,分析其检测结果。结果 两种提取试剂对于A采样管的提取效率差异有统计学意义（P<0.05）,乙提取试剂阳性检出率高于甲试剂（66.67%vs 20.83%）,ORF1ab平均Ct值低于甲试剂（31.1 vs 38.2）,N基因平均Ct值低于甲试剂（29.9 vs 35.2）。两种提取试剂对于B采样管的提取效率差异不明显（P>0.05）。结论 不同采样管与不同提取试剂匹配效果不同,实验室质量控制中性能验证应加强采样管（液）与提取试剂的匹配性验证。     

新型冠状病毒灭活样品混合进行核酸检测效果分析

目的了解新型冠状病毒灭活样本混合检测对结果的影响,为大人群样本的新型冠状病毒核酸筛查提供科学检测的方案。方法将新型冠状病毒阳性咽拭子样本和阴性咽拭子样本于56℃30min灭活后,按照阳性样本1份、阴性样本4、9、19份的比例进行混合,用实时荧光RT-PCR技术检测原液和混合液的ORF-lab和N基因。结果20组灭活样品原液核酸检测结果全部为阳性,1∶5混合液和1∶10混合液核酸检测结果也均是阳性,1∶20混合液有1组样品ORF-lab阴性,N基因阳性。各组间核酸检测Ct值均显著相关。不同样本组组间阳性率差异无统计学意义。20组样品ORF-lab基因1∶5混合液、1∶10混合液、1∶20混合液相比原液Ct值分别平均增加1.73、2.86、4.05,N基因1∶5混合液、1∶10混合液、1∶20混合液相比原液Ct值分别平均增加1.69、2.79、3.25。结论当开展大人群样本的新型冠状病毒核酸筛查时,选择<10份灭活样品混合检测,大部分情况下不影响定性结果,但弱阳性样本结果可能会受到影响。     

不同人群新型冠状病毒核酸检测的临床价值

 目的 探讨新型冠状病毒（SARS-CoV-2）核酸检测在发热门诊、隔离病房、易感人群以及大规模筛查等不同人群中的应用价值,为SARS-CoV-2实验室检测提供参考依据。方法 采集2020年2月1日-3月22日郑州人民医院不同人群的咽拭子,包括发热门诊、隔离病房患者,一线疫情防控医护人员,以及无新型冠状病毒肺炎（COVID-19）症状的住院患者、陪护家属和复工人员。采用逆转录聚合酶链反应（RT-PCR）方法,使用A、B两种国产检测试剂盒对发热门诊、隔离病房的患者进行SARS-CoV-2核酸检测。结果 共检测15 497份咽拭子标本,SARS-CoV-2核酸阳性24份,核酸阳性病例均来自发热门诊和隔离病房。24例咽拭子SARS-CoV-2核酸阳性患者同时送检的血标本核酸结果均呈阴性。A、B两种试剂首次咽拭子核酸检测结果一致,2例确诊COVID-19患者治疗后复查咽拭子标本,A组试剂检测为阳性,B组试剂检测为阴性。该院疫情防控一线医护人员、未出现COVID-19症状的住院患者、陪护家属和复工体检人员核酸检测均为阴性。结论 复工人员、住院患者、陪护家属和一线疫情防控人员SARS-CoV-2核酸筛查均未发现阳性,咽拭子标本SARS-CoV-2核酸检测阳性率高于血标本,不同核酸检测试剂检测阳性率稍有差异。     

口腔液在新型冠状病毒核酸和抗体检测中的应用

为探讨新型生物标本口腔液在新型冠状病毒（SARS-CoV-2）核酸和抗体检测中的应用价值,采集2021年10—11月北京两起新型冠状病毒肺炎（简称“新冠肺炎”）聚集性疫情的7例确诊病例的口腔液及配对的呼吸道和血液样本。采用荧光定量PCR和血清抗体检测试剂盒分别检测SARS-CoV-2核酸和IgG抗体,同时采用新建的磁微...     

新标准下17种新型冠状病毒核酸检测试剂性能比对研究

目的 参照新型冠状病毒肺炎诊疗方案（试行第九版）中解除集中隔离和出院核酸检测标准比较17种新型冠状病毒核酸检测试剂的检测性能,为实验室核酸检测选择试剂提供参考。方法 选取2021-08/2022-03新型冠状病毒肺炎疑似病例呼吸道样本50份,经数字聚合酶链式反应（dPCR）检测确定样本阴阳性并对病毒核酸载量定量,再分别对17种检测试剂（编号为A～Q）进行评价。以Ct值35为限值判定检出数和检出率,利用各试剂的检测值做试剂间两两比对分析,对各试剂检检测值和dPCR检测值比对分析Ct值与核酸量的关系,以P<0.05为差异有统计学意义。结果 17种核酸检测试剂中15种试剂检测正常,阴性样本检出率在0%～35%之间,阳性样本检出率在39%～96%之间,各试剂间检出率和检测值均有一定差异且与检测靶标数、试剂检测最低限以及检测模板加入量没有相关性;核酸量在57 360 copies/ml以上各试剂均能检出,且检出能力随核酸量减少出现差异。结论 若检测结果不按照试剂盒说明书中Cut-off值而是按照Ct值35为限值判定,则15种试剂对较高病毒载量的样本均能有效检出,但各试剂的检测性能有一定差异...