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1.
目的运用直接测序法和丙型肝炎病毒(HCV)基因分型试剂盒两种方法,诊断HCV基因型并比对它们的结果,以评价HCV基因分型试剂盒的临床使用效果。方法选取购买的2套商业HCV基因型血清盘和收集的45份HCV核糖核酸(RNA)阳性临床样本,用巢式聚合酶链反应(PCR)扩增HCV CORE区、NS5B区,对扩增的序列进行测序以确定基因型别;再通过HCV基因分型试剂盒检测样本以确定基因型,对所得结果进行统计分析。结果 HCV NS5B区、CORE区检测商业HCV基因型血清盘,分别检测出16例(16/19)、15例(15/19);对于HCV基因分型试剂盒检测中国常见的五种型别1b、2a、3a、3b、6a的样本,HCV基因分型试剂盒的准确性为7/7。45份HCV RNA阳性的临床样本中,所检测出的基因型有1a(4份)、1b(6份)、2a(5份)、3a(5份)、3b(14份)、6a(7份)、6n(4份),测序法结果属于五种亚型(1b、2a、3a、3b、6a)的有37份标本,试剂盒检测的结果与测序法一致的有29份,8份标本未检出,一致率为29/37。五种亚型以外的8份标本,测序法与试剂盒检测结果均不一致。结论通过此次对比结果可以看出,所用HCV基因分型试剂盒能够准确检测出国内常见的基因型,并且该方法操作简便,检测时间短,具有较大的临床应用价值。  相似文献   

2.
目的了解广西地区艾滋病病毒(HIV)和丙型肝炎病毒(HCV)感染人群HCV基因型的分布特征。方法收集广西地区51例HCV RNA阳性HIV感染者的血清,通过对反转录巢式聚合酶链反应(RT nested-PCR)扩增HCV NS5B区段,所得终产物直接测序进行HCV基因分型。结果在51例样本中,HCV基因型以3b和6a型为主,各占23.53%(12/51),其次为1a型,占19.61%(10/51);3a型、1b型、6d型分别占13.73%(7/51)、9.80%(5/51)、1.96%(1/51),2a型、6e型各占3.92%(2/51)。分析表明,HIV合并HCV感染者的HCV基因在性别、年龄、感染途径分布差异没有统计学意义(P0.05)。结论广西地区HIV合并HCV感染者流行的HCV基因亚型至少有1a、1b、2a、3a、3b、6a、6d、6e共8种,3b和6a可能为流行的主要基因亚型,1a型次之。初步说明广西地区HIV合并HCV感染人群流行的HCV基因亚型呈多样性,同时它们与性别、年龄及感染途径无明显相关性。  相似文献   

3.
目的了解河南部分地区艾滋病病毒(HIV)合并丙型肝炎病毒(HCV)感染者HCV基因型的分布特征。方法收集河南地区129例HIV/HCV共感染患者,119例单纯HCV感染患者,采取横断面调查的方法,收集研究对象的年龄、性别、职业、HIV传播途径等人口学资料,并进行HCV-核糖核酸(RNA)及HCV基因分型检测,结果录入数据库,用SPSS 23.0软件统计分析。结果该地区HIV/HCV合并感染者HCV基因亚型1b型最多,占54.3%(70例)。其次为2a型,占44.2%(57例)。单纯HCV感染者HCV基因亚型1b型最多,占70.6%(84例);其次为2a型,占26.1%(31例);3b和6a型各占0.8%(各1例)。两组患者间HCV基因型分布差异有统计学意义(χ2=10.578,P0.05),HIV/HCV合并感染者的HCV1b型所占百分比(54.3%)低于单纯HCV感染者(70.6%),而HCV 2a型所占百分比(44.2%)高于单纯HCV感染者(26.1%)。HIV/HCV合并感染者中,HCV1b型在经血感染中占92.9%(65/70),HCV2a型经血感染者中占98.2%(56/57)。结论河南部分地区HIV/HCV合并感染者的HCV基因分型以1b型为主,2a型次之,与单纯HCV感染者HCV基因型分布相似,经血感染是主要的传播途径。  相似文献   

4.
目的研究长春地区出入境人员感染丙型肝炎病毒(HCV)的基因型分布。方法收集42例丙型肝炎阳性者的血清标本,采用基因测序法进行HCV基因型检测和分析。结果 42份HCV阳性血清基因分型分别为1b、1a、2a,其中基因1型21份(占50%),1b亚型13份(占30.95%),1a亚型8份,2a亚型9份。HCV基因型性别、年龄分布差异无统计学意义(P0.05)。结论长春地区出入境人员感染的HCV以1b型为主,2a型次之。  相似文献   

5.
目的 了解红河州HIV/HCV合并感染者中HCV的基因型分布。方法 收集2018-2019年红河州HIV/HCV抗体阳性的血浆246份,进行HCV病毒载量检测,对有病毒载量的样品E1E2区和N55B区采用巢氏PCR扩增,扩增产物经基因序列测定,所得序列通过构建系统进化树确定HCV的分子亚型。结果 结合2个基因片段,最终120份样品获得了分型结果。3b为主要亚型,占30.8%(37/120),其他亚型按照比例依次为3a(21.7%,26/120)、6a(17.5%,21/120)、6n(16.7%,20/120)、其他亚型(13.3%,16/120)。各HCV亚型在民族分布上的差异有统计学意义(P<0.05)。分别计算各亚型在E1E2区和NS5B区的基因距离,结果显示在3a、3b、6a、1b、6n这5种亚型中,3a的基因距离最大,且3a、6a、1b、6n的基因距离均与3b的基因距离有显著性差异(P<0.05)。结论 在红河州HIV/HCV合并感染者中,3b是主要流行亚型,且在该人群中有较长的流行时间。  相似文献   

6.
目的 利用核心基因(core)、非结构基因5B(NS5B)序列与线性探针技术(LiPA)研究广东地区慢性丙型肝炎患者HCV的基因型分布,探讨LiPA基因分型的准确性.方法 分别采用core和NS5B片段序列和INNO-LiPA 2.0对广东地区110例慢性丙型肝炎患者进行基因分型.使用SPSS 10.0统计软件对数据进行分析,两样本间的比较采用x2检验.结果 110份HCV样本中有97份扩增到core区段序列,62份扩增到NS5B区段序列,同时扩增到core、NS5B序列的样本有57份.core与NS5B序列的分型结果一致,102份标本被分为1b、2a、3a、3b、6a 5个亚型,分别占61.8%、9.8%、3.9%、3.9%和20.6%.在基因型水平,除6型外,其他基因型均能通过INNO-LiPA2.0正确分型;在亚型水平,除1b和3b型,其他亚型未能被准确区分,其中81.5%的6a型被错分为1b型.结论 6a型已成为广东地区慢性丙型肝炎患者中第二大基因型,LiPA技术是否能准确区分6a型与1b型,有待进一步研究.  相似文献   

7.
目的研究四川地区丙型肝炎病毒(HCV)的基因型分布特点。方法收集成都市公共卫生临床医疗中心2016年1月至2017年12月收治的376例慢性丙型肝炎患者的HCV基因分型、HCV-RNA及肝功能结果,并对其进行回顾性分析。结果 376例患者共检测出5种基因型,包括1b型264例(70.21%)、2a型17例(4.52%)、3型72例(19.15%)、3b型55例(14.63%)和6a型23例(6.12%)。不同HCV基因亚型在性别、年龄、HCV-RNA及肝功能指标等方面比较,差异有统计学意义(P0.05)。3a型、3b和6a型以男性患者为主;2a型患者年龄最大,HCV RNA载量亦高于其他亚型;而6a型患者年龄最小,ALT、AST及TBil水平均低于其他亚型。结论四川地区HCV感染以基因1b型和3b型为主,不同基因亚型HCV感染者的病毒载量和肝功能具有一定差异。  相似文献   

8.
目的使用二代测序技术检测广州地区人类免疫缺陷病毒(HIV)/丙型肝炎病毒(HCV)混合感染者和HCV感染者HCV基因型,了解本地区HCV基因型的流行特点。方法在233例HCV感染者中,包括95例HIV/HCV混合感染者和138例HCV感染者,使用Illumina Miseq平台PE300模式对HCV Core和NS5B片段进行测序,采用生物信息学分析确定HCV基因型,对测序结果提示混合基因型感染的样本,使用NS5A基因型特异引物进行验证。结果 HIV/HCV混合感染者静脉吸毒感染构成比显著高于HCV感染者(77.7%对19.6%P0.001),HCV感染者输血感染的构成比显著高于HIV/HCV混合感染者(48.6%对3.2%P0.001);HIV/HCV混合感染者HCV Core基因片段平均数据量为(15456±6689) reads,HCV感染者为(14323±5321) reads,两组无显著差异(P0.05);HIV/HCV混合感染者HCV NS5B基因片段平均数据量为(16432±3467) reads,HCV感染者为(17611±5632) reads,也无显著差异(P0.05);本组228例(97.9%)HCV感染者为单一HCV基因型感染,HIV/HCV混合感染者HCV 6a型和3b型感染率显著高于HCV感染者(分别为47.4%对26.8%,P=0.001和13.7%对3.6%,P=0.005),HCV 1b型感染率显著低于HCV感染者(20.0%对59.4%,P0.001);在233例入组的HCV感染者中,发现5例(2.1%)为混合基因型感染,其中4例为HIV/HCV混合感染者,1例为HCV感染者。结论广州地区HIV/HCV混合感染者与HCV感染者感染HCV基因型构成比存在差异,其临床意义还需要探讨。  相似文献   

9.
目的 了解广东省人类免疫缺陷病毒(HW) /HCV共感染者与单纯HCV感染者的感染途径、HCV的基因亚型分布及其遗传特征,为丙型肝炎病毒感染的治疗与预防提供依据. 方法采用巢式逆转录-聚合酶链反应扩增广东省95例HIV/HCV共感染者及99例单纯HCV感染者HCVNS5B基因区域,扩增产物测序后进行HCV基因亚型分析,遗传分析利用MEGA4软件.不同种基因亚型型内基因距离以碱基置换率表示.结果 HIV/HCV共感染者HCV有5种基因亚型,其中6a型占53.7% (51/95)、3a型占17.9% (17/95)、1b型占15.8% (15/95)、3b型占11.6% (11/95)、1a型占1.0%(1/95);1b亚型内基因距离为6.30%±1.27%,高于其他基因亚型.HIV/HCV共感染者主要通过静脉注射毒品感染(75/95,78.9%),其基因亚型主要为6a型,占60.0% (45/75).单纯HCV感染者HCV有7种基因亚型,其中1b型占67.7% (67/99)、6a型占17.2%(17/99)、3a型占6.1% (6/99)、2a型占5.%(5/99)、3b型占2.0%(2/99)、4a型占1.0% (1/99)、5a型占1.0%(1/99);1b亚型内基因距离为5.17%±1.03%,高于其他基因亚型.单纯HCV感染者主要通过输血或血液制品感染(80/99,80.8%),其HCV基因亚型主要为1b型,占76.2% (61/80).结论 广东地区HIV/HCV共感染者及单纯HCV感染者HCV基因亚型呈现多样性,HIV/HCV共感染者与单纯HCV感染者主要感染途径不同,HCV主要基因亚型也不同.  相似文献   

10.
目的 对广州市吸毒人员丙型肝炎病毒(HCV)基因分型及其相关因素进行分析,为吸毒者丙型肝炎的诊断和治疗提供依据.方法 应用聚合酶链反应-反向点杂交技术检测100例HCV抗体初筛阳性吸毒者的基因型和基因亚型,并对HCV感染者的性别、年龄、藉贯、吸毒史等进行相关性分析.结果 采用酶联免疫方法(ELISA)在170名戒毒人员中初筛到HCV抗体阳性者100名,阳性率为58.8%;在100名初筛阳性的吸毒人员中检测到4种基因型,呈8种组合.大部分HCV感染者为年轻的广东籍(81名,占81.0%),采用静脉注射式吸毒80名(占80.0%),吸毒史为5~10年者68名(占68.0%),年龄19~35岁者69名(占69.0%).结论 广州市吸毒人员HCV感染者基因分型以6a型为优势株,其次为3a,且基因亚型呈现多样性.与静脉注射吸毒、吸毒史5年以上和以年纪较轻的广东籍男性为主等因素有关.  相似文献   

11.
目的了解珠三角地区吸毒人群丙型肝炎病毒(HCV)亚型的种类和组成。方法根据珠三角地区9个地级市艾滋病吸毒哨点的HCV患病率计算最低样本量,对吸毒哨点2014-2015年HCV抗体阳性样本进行系统抽样,得样本455份。通过提取样本RNA、PCR扩增、基因片段测序、构建不同片段进化树来确定亚型,并对其流行病学资料进行统计分析。结果 455份样本中,亚型及比重为1a(2.4%)、1b(7.0%)、2a(0.2%)、3a(16.9%)、3b(10.8%)、6a(61.5%)、6e(0.9%)、6k(0.2%)。亚型在年龄(χ2=30.798,P0.05)、户籍所在地(χ2=12.924,P0.05)、民族(χ2=21.432,P0.05)的分布差异有统计学意义。6e与广西参考株有78%可靠性。1b、3a、6a分支下有小型进化簇。结论珠三角的吸毒人群中,6a是主要亚型,6e由广西传入。各亚型感染来源一致,存在小范围跨市传播情况。  相似文献   

12.
目的 了解云南省HBV基因型分布情况和其特殊性.方法 对来自云南省7个地州市的55例HBV感染者,采集、分离其血清样本,核酸提取,套式PCR扩增前S1/前S2/部分S基因区段(877 bp),进行核酸序列测定与同源关系和重组位点分析.计量资料比较采用t检验,计数资料比较采用卡方检验.结果 建立更为准确的HBV基因分型方法,49份样本获得有效分型,13份(26.5%)为B2亚型;33份(67.3%)为C型,其中C1亚型7份,C2亚型19份,C5亚型3份,C7亚型4份;另有2份(4.1%)为Ⅰ基因型和1份为(2.0%)C/D重组型.B、C型感染者HBV DNA分别为(7.69±0.86)、(6.88±1.24) lg拷贝/mL,差异有统计学意义(t=1.621,P=0.016);B、C型感染者碱性磷酸酶分别为(78.6±28.8)、(124.0±46.8) U/L,差异有统计学意义(t=-1.534,P=0.028).结论 建立的HBV基因型/亚型分析方法可准确分型;云南地区HBV多基因型/亚型分布状况,可能为东南亚地区所流行HBV的传入所致,并可能影响中国HBV基因型的分布态势.  相似文献   

13.
山东地区丙型肝炎病毒的基因型及血清学分型的研究   总被引:6,自引:0,他引:6  
探索山东地区丙型肝炎病毒(HCV)的基因型及血清学分型的分布,了解HCV基因型与感染途径的关系.对96例抗HCV阳性患者的血清进行HCV RNA检测,HCV RNA阳性者,应用限制性片段长度多态性分析(RELP)进行基因分型;同时应用Murex Serotyping HCV 1-6血清学分型试剂进行血清学分型.基因非2(1b)型79例,占83.16%,2(2a)型为16例占16.84%,44份血清标本的血清学分型可分型率为90.91%,与基因分型的符合率为90.00%.不同的感染途径之间,基因型分布没有差异(P=0.15).山东地区丙型肝炎病毒流行株为基因非2(1b)和2(2a)型,非2(1b)型为优势株,基因分型与血清学分型结果基本一致,基因型与丙型肝炎的感染途径无关.  相似文献   

14.
目的了解静脉吸毒致获得性免疫缺陷病毒1型(HIV1)感染者混合HIV感染丙型肝炎病毒(HCV)亚型的分布情况。方法采用abbott公司的MurexHCVSerotyping16Assay检测12例单纯HCV感染者及25例静脉吸毒导致HIV1感染者(其中重叠HCV感染的患者12例)HCV不同亚型的抗体,确定HCV的基因亚型。结果12例单纯HCV感染者中HCV1型7例(58.3%),3型2例(25%),4 6型1例(8.33%),6型(包括重叠4型)2例(16.67%)。12例静脉吸毒者中HCV1型7(58.33%),6型4例(33.3%),1 3型1例(8.33%),3型(包括重叠1型)3例(25%)。结论单纯HCV感染者和合并HIV1感染的HCV感染者体内HCV以1型为主,并且均存在2种亚型共感染的现象。  相似文献   

15.
目的了解合肥地区丙型肝炎病毒(HCV)基因型分布特点。方法收集251例HCV患者的临床流行病学资料和外周静脉血,采用sanger测序法检测HCV基因型。结果合肥地区HCV患者中共检出4种基因型,8种基因亚型,以1b型最多占68.12%,其次2a、2i型占12.75%、10.36%,3a、3b、6a、6n、6v均有分布。各基因型在不同性别中的比较差异无统计学意义(P0.05);不同年龄段基因型相比较,差异有统计学意义(P0.05),在30~60岁年龄组,基因型分布最为广泛;在时间分布上,早期HCV基因型较为单一,主要以1b和2a型为主,近年来基因1b型逐渐减少,2i、3a、3b、6a基因型逐渐增多,总的基因类型增多。经输血、血液透析、母婴传播感染患者基因型主要为1b、2a及2i型,性转播、其他途径(拔牙、纹身、纹眉、穿耳、职业暴露等)传播以基因1b型为主,2a、2i、3a、3b型均有分布,而静脉吸毒患者基因型分布较为广泛,1b、2a、2i、3a、3b、6a、6n、6v均有分布。结论合肥地区的HCV基因分型呈多样化,以1b型为主,其次为2a、2i型,同时存在3a、3b、6a、6n、6v基因型。  相似文献   

16.
目的 使用二代测序技术检测广州地区人类免疫缺陷病毒(HIV)/丙型肝炎病毒(HCV)混合感染者和HCV感染者HCV基因型,了解本地区HCV基因型的流行特点。方法 在233例HCV感染者中,包括95例HIV/HCV混合感染者和138例HCV感染者,使用Illumina Miseq平台PE300模式对HCV Core和NS5B片段进行测序,采用生物信息学分析确定HCV基因型,对测序结果提示混合基因型感染的样本,使用NS5A基因型特异引物进行验证。结果 HIV/HCV混合感染者静脉吸毒感染构成比显著高于HCV感染者(77.7%对19.6% P<0.001),HCV感染者输血感染的构成比显著高于HIV/HCV混合感染者(48.6%对3.2% P<0.001);HIV/HCV混合感染者HCV Core基因片段平均数据量为(15456±6689) reads,HCV感染者为(14323±5321) reads,两组无显著差异(P>0.05);HIV/HCV混合感染者HCV NS5B基因片段平均数据量为(16432±3467) reads,HCV感染者为(17611±5632) reads,也无显著差异(P>0.05);本组228例(97.9%)HCV感染者为单一HCV基因型感染,HIV/HCV混合感染者HCV 6a型和3b型感染率显著高于HCV感染者(分别为47.4%对26.8%,P=0.001和13.7%对3.6%,P=0.005),HCV 1b型感染率显著低于HCV感染者(20.0%对59.4%,P<0.001);在233例入组的HCV感染者中,发现5例(2.1%)为混合基因型感染,其中4例为HIV/HCV混合感染者,1例为HCV感染者。结论 广州地区HIV/HCV混合感染者与HCV感染者感染HCV基因型构成比存在差异,其临床意义还需要探讨。  相似文献   

17.
目的了解新疆地区通过静脉吸毒途径HCV感染者体内HCV基因型特点、病毒载量以及二者相关性。方法收集317例有明确静脉吸毒史的丙肝患者血清,提取病毒RNA,荧光定量PCR检测血清HCV载量,并用逆转录—巢式PCR扩增HCV RNA阳性血清病毒cDNA片段进行酶切分析,测定基因型。结果本组114例血清HCVRNA阳性,其中基因1型90例,HCV RNA含量1×10(6.90±1.26)IU/ml;基因2型22例,HCV RNA含量1×10(5.12±0.77)IU/ml;2例未能分型。1型患者比例及病毒载量均高于2型(P均〈0.05)。结论新疆地区通过静脉吸毒途径HCV感染者体内病毒载量与其基因型有关,HCV1型病毒载量明显高于2型。  相似文献   

18.
目的研究北京佑安医院收治患者的丙型肝炎病毒(hepatitis C virus,HCV)基因型及临床特征。方法选取2015年5月至2017年11月北京佑安医院诊治的患者,通过对病历号及身份证号识别排除重复病例,明确HCV感染及HCV基因型者共计5 339例,并对其临床资料进行统计分析。结果 5 339例感染者共检测到HCV的5个基因亚型:1b、2a、3a、3b、6a,占比分别为65.1%(3 478例)、28.5%(1 521例)、1.9%(101例)、3.2%(168例)、1.3%(71例);1b和2a型男女无显著差异,42.5%(2 126例)有单采浆献血史,27.4%(1 368例)有明确接受输血史;340例3a、3b和6a型感染者中,94.1%(320例)年龄30~60岁,70.6%(240例)为男性,75.3%(256例)有静脉药瘾史。临床分期依次为慢型肝炎、分期不明、肝硬化、肝癌等,占比分别为76.8%(4 099例)、15.1%(808例)、6.7%(358例)、1.4%(74例)。结论北京地区HCV基因型的分布以1b型和2a型为主,3型和6型主要分布在30~60岁静脉吸毒男性人群中;绝大多数HCV感染者的临床症状轻微或无,但具有传染性,主动筛查至关重要。  相似文献   

19.
目的调查云南省红河州静脉吸毒人群中艾滋病病毒(HIV)感染者的丙型肝炎病毒(HCV)合并感染率、HCV感染状况。方法采集600份红河州静脉吸毒人群中HIV感染者的血浆样本,用HCV抗体酶联免疫吸附试验在基层实验室初筛、在艾滋病参比实验室复检,初复检至少有一个为反应性结果的样本做核酸检测。结果基层实验室和艾滋病参比实验室的初复检一致率为99.3%(596/600)。HCV合并感染率53.6%(319/595),多因素分析:年龄30~40和40~50岁、退休或失业及其他职业是危险因素,比值比(OR)值分别为5.970、7.709、10.821、4.151;年龄≥60、女性、已婚(含分居)、大学及以上的学历是保护因素,OR值分别为0.036、0.224、0.474、0.082。281份核酸阳性,其中57.65%病毒载量大于106IU/mL。HCV病毒载量的分布在未服用和服用抗反转录病毒药物间差异有统计学意义(P0.05)。319份HCV合并感染样本中,11.91%核酸清除,多因素分析:服用抗反转录病毒药物是核酸清除的保护因素,OR值为0.295。结论云南省红河州静脉吸毒人群中HIV/HCV合并感染严重,中年男性、单身或离异等、低学历者、退休人员或失业者是合并感染的独立影响因素;合并感染者的HCV病毒载量较高,但服用抗反转录病毒药物可降低HCV病毒载量,使HCV核酸清除。  相似文献   

20.
目的对大理地区HIV感染合并丙型肝炎患者进行丙型肝炎病毒(HCV)基因分型研究。方法采集患者血液,提取RNA,采用HCV特异性引物进行巢式RT-PCR扩增,PCR产物直接测序,采用生物信息学软件进行序列分析。结果在大理州人民医院共采集疑似丙型肝炎病人血清13份,HCV核酸检测4份(24~27号)阳性。序列分析显示4株病毒之间核苷酸同源性在80.4%~95.8%之间;24号与1b型HCV核苷酸同源性在98.6%以上,而其他基因型病毒核苷酸同源性在90.2%以下;25、27号与3b型HCV核苷酸同源性在92.1%~98.6%之间,而与其他基因型核苷酸同源性均在87.4%以下;26号与3a型HCV核苷酸同源性在94.4%~94.9%之间,而与其他基因型病毒核苷酸同源性在84.6%以下。遗传进化分析显示25、27号病例为3bHCV感染,26号病例为3aHCV感染,24号为1bHCV感染。结论大理地区HIV感染人群中存在HCV基因1和基因3两个基因型,3a、3b和1b3个基因亚型HCV感染。  相似文献   

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