基于单细胞RNA测序的膀胱癌预后风险模型的构建与验证

目的基于单细胞RNA测序(scRNA-seq)生物信息学分析的预后相关的差异表达基因构建膀胱癌预后风险模型并验证。方法从基因表达综合(GEO)数据库中下载膀胱癌scRNA-seq数据集GSE135337、GSE129845, 数据更新时间分别为2022年、2019年;下载常规转录组数据集GSE13507(数据更新时间为2020年)中165例膀胱癌样本的表达谱及其生存信息。从癌症基因组图谱(TCGA)数据库中下载414例膀胱癌样本和19例癌旁样本的表达谱数据及405例膀胱癌患者的临床信息。采用R 4.1.2软件对GEO数据库中的10例膀胱癌单细胞样本进行质量控制及降维聚类并对其进行细胞注释;采用CellChat分析GEO数据库中单细胞数据的细胞间通信。采用单因素Cox比例风险模型分析筛选与膀胱癌预后相关的差异表达基因, 并使用LASSO-Cox回归分析构建预后风险模型, 计算风险评分。根据中位风险评分, 以TCGA数据集中膀胱癌患者为训练集, 将患者分为低风险组和高风险组;采用GEO数据库GSE13507数据集为验证集进行验证, 通过Kaplan-Meier分析比较训练集、验证集低风险组...     

肝细胞癌m6A相关免疫基因预后模型构建及DDX1在肝细胞癌中的作用

目的 筛选肝细胞癌中N6-甲基腺苷(m6A)相关免疫基因构建预后模型,并探讨其关键基因DDX1在肝癌细胞中的作用。方法 本研究选取癌症基因组图谱(TCGA)数据库中368例肝癌样本数据作为训练数据集,基因表达综合数据库(GEO)GSE 14520数据集中242例肝癌样本数据作为验证数据集,并基于表达相关性进行m6A相关的免疫基因筛选。通过LASSO Cox回归模型筛选与预后相关的m6A免疫基因,并构建风险评分(RS)模型。根据RS中位数值,分别将训练集和验证集中所有样本分为高与低风险组,Kaplan-Meier法评估高低风险组的生存预后差异。使用实时荧光定量PCR(RT-qPCR)检测肝癌细胞系(HuH-7、SK-HEP-1、PLC/PRF/5和SNU-449)以及人正常肝细胞系THLE-2中筛选的关键基因表达水平;挑选表达变化较显著的基因,运用功能加强和缺失实验对其功能进行细胞验证。one-way ANOVA法比较多组间统计学差异,其中两两比较采用Tukey法。结果 基于共表达分析共获得130个m6A相关免疫基因,最终筛选了5个基因(DDX1、HDAC1、HDAC2、NRAS和PLK...     

肾透明细胞癌M2型巨噬细胞新型预后预测模型的开发与验证

目的 建立一个共表达M2相关基因的预后风险评估模型并阐明M2巨噬细胞在肾透明细胞癌(ccRCC)免疫微环境中的作用。方法 转录组数据、临床数据和突变数据来自TCGA-KIRC。使用CIBERSORT计算539个样本中每个样本的M2巨噬细胞比例。通过共表达确定了TCGA-KIRC中与M2巨噬细胞相关的基因并建立共表达网络。使用LASSO回归构建预后模型并将结果显著的因素输入Cox回归分析。使用ArrayExpress数据库中的外部数据集E-MTAB-1980并建立风险评分及相应生存曲线。通过基质免疫浸润、GSEA、TMB和药物敏感性对相关模型风险评分进行评估。结果 获得TCGA-KIRC中与巨噬细胞M2相关性最强的前46个基因,富集于免疫受体活性、白细胞和单核细胞迁移等过程。建立了一个由12个巨噬细胞M2相关基因组成的模型,并证明该模型具有良好的预后能力。M2巨噬细胞浸润与肿瘤代谢密切相关且与ccRCC的风险评分成反比。结论 提出了一个ccRCC的M2型巨噬细胞相关的十二基因Cox比例危险回归模型,该模型可为生成ccRCC患者预后评分提供一种测量方法。     

基于免疫核心基因的喉鳞状细胞癌风险评分模型的建立

目的筛选喉鳞状细胞癌(laryngeal squamous cell carcinoma,LSCC)预后相关免疫核心基因并构建预后风险评分模型。方法利用癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)数据库中LSCC转录组测序信息,筛选差异表达基因,并与已知免疫相关基因取交集,筛选LSCC中预后相关免疫核心基因。利用单因素Cox回归构建风险评分模型并采用Kaplan-Meier法验证风险评分模型与LSCC患者预后的关系,同时绘制受试者工作特征(receiver operating characteristic,ROC)曲线验证该模型准确度。结果 LSCC组织和癌旁组织中共有6 800个差异表达基因,通过单因素Cox分析并与已知免疫相关基因取交集,从差异表达基因中筛选出34个预后枢纽基因。基于免疫核心基因构建风险评分模型,高危险组患者总生存期短于低危险组患者(P<0.01),风险评分模型预测LSCC患者预后的ROC曲线下面积为0.930。结合临床病理学参数分析发现,患者性别是LSCC预后的保护因素,N分期晚期和高风险评分为LSCC预后的危险因素(均P<0.05),而患者年龄和T分期与LSCC预后无关(均P>0.05)。结论 LSCC中存在多个免疫核心基因异常表达,且与患者预后相关,基于其构建的风险评分模型可较好预测患者预后。     

基于基因表达谱数据分析弥漫大B细胞淋巴瘤肿瘤相关巨噬细胞浸润情况及其与患者预后的相关性

目的基于弥漫大B细胞淋巴瘤(DLBCL)基因芯片表达数据库, 分析肿瘤相关巨噬细胞及亚型浸润情况, 探讨其与患者预后的相关性。方法数据来源于PubMed基因表达数据库(GEO)中的DLBCL患者微阵列(Affymetrix U133 plus 2.0)数据库(编号GSE10846)。该数据库共包含414例患者, 其中306例有完整的临床、细胞起源分型(COO分型)及治疗随访信息。通过基于评估RNA转录本相对占比进行细胞类型识别(CIBERSORT)的在线计算机程序进行数据分析;从生成的分析结果文件中识别出GSE10846数据库中所有患者包含各亚型巨噬细胞在内的免疫细胞在微环境中所有可识别免疫细胞中的比例。以巨噬细胞亚群占微环境所有免疫细胞比例中位值为临界值:≥临界值为高浸润。基于GSE10846数据库中所有414例DLBCL患者的myc、bcl-2、程序性死亡受体配体1(PD-L1)及程序性死亡受体配体2(PD-L2)基因表达量的中位值为临界值, ≥临界值者为高表达。分析各型及总体巨噬细胞水平与临床因素、一些基因表达及生存的相关性, 采用Cox比例风险模型对DLBCL患者预后进行多因素...     

整合多数据库分析NFKBIA在SKCM预后和免疫浸润中的价值

目的：探讨核因子κB抑制因子a(NFKBIA)表达与皮肤黑色素瘤(SKCM)患者预后及其与肿瘤微环境免疫浸润的相关性。方法：利用GEPIA2数据库分析正常皮肤和SKCM组织中NFKBIA的表达差异,GEPIA2和Ualcan数据库分析NFKBIA与SKCM预后关系,TIMER和TISIDB数据库分析NFKBIA与SKCM中TIL和免疫调节基因的关系。选用TISCH和CancerSEA数据库从单细胞水平分析NFKBIA与SKCM细胞亚群及其相关的功能状态关联性。选取湖北省荆门市第二人民医院保存的14例SKCM患者的石蜡组织标本,通过免疫组织化学染色法验证SKCM组织和癌旁组织中NFKBIA蛋白的表达水平。结果：NFKBIA在SKCM组织中呈低表达,并且低表达的SKCM患者预后差(P<0.05)。NFKBIA表达与B细胞、CD8⁺T细胞、CD4⁺T细胞、巨噬细胞、中性粒细胞和DC浸润水平呈正相关关系(均P<0.01)。NFKBIA表达与SKCM中TIL丰度和免疫调节基因呈正相关关系(均P<0.01)。NFKBIA在SKCM单细胞...     

基于GEO数据库的多发性骨髓瘤细胞焦亡预后分析

目的 采用生物信息学分析技术筛选多发性骨髓瘤(multiple myeloma,MM)细胞焦亡差异表达基因,并进行预后分析。方法 在基因表达谱数据库(GEO)中选取MM细胞焦亡相关基因表达谱芯片数据,采用R软件筛选MM患者肿瘤组织和健康对照组中细胞焦亡差异表达基因。对筛选出的差异表达基因通过Cox回归分析识别预后相关基因,进行预后分析。结果 以GSE6477基因表达谱数据集为分析对象,选取与焦亡相关基因匹配共获得焦亡相关基因。将29个差异基因进行预后分析,14个基因(INAVA、P2RY2、NES、NFIX、SPATA17、NLRP2、INHBC、GZMB、CCDC74A、TNF、SNHG28、MUC1、NANOS1、CD6)纳入风险模型构建,生存分析显示年龄、肿瘤分期、风险评分与MM患者预后显著相关。结论 通过生物信息学方法,构建了14个细胞焦亡相关基因的MM预后模型,可能为MM患者的个体化治疗和评估提供参考。MM细胞焦亡基因通过生物学过程影响预后。     

基于TCGA数据库分析FOXO1在肝癌中的表达及预后意义

目的 基于TCGA及HPA数据库探讨FOXO1在肝癌中的表达及预后相关性。方法 下载TCGA数据库中肝癌RNA-seq数据,R软件分析FOXO1基因在肝癌和癌旁组织中的表达差异。临床相关性分析揭示其与肝癌临床病理特征的相关性。生存分析评价其表达水平与患者预后的关系;单、多因素Cox分析寻找预后因子。CIBERSORT评估其表达水平与肿瘤微环境中TIICs相关性。KEGG信号通路富集分析FOXO1在肝癌中的潜在功能。结果 与癌旁组织比较,FOXO1在肝癌组织中低表达（P=1.321E-15）。生存分析表明FOXO1高表达组肝癌患者总体生存率高于低表达组（P<0.05）;临床分期、T分期和M分期为预后因子,但FOXO1尚不能视为独立预后因子。在肝癌TME中,FOXO1表达水平与静息CD4记忆性T细胞和幼稚B细胞成正相关关系,而与活化的CD4记忆性T细胞和巨噬细胞M2成负相关关系。FOXO1参与多条肿瘤相关信号通路。结论 FOXO1基因在肝癌中低表达,且其表达水平与肝癌患者总体预后有关。FOXO1可作为肝癌预后相关的生物标志物,有望成为肝癌诊断和治疗的靶点。     

基于生物信息学分析METTL7B在胶质瘤组织中的表达及其临床意义

目的：探讨甲基转移酶样蛋白7B(METTL7B)在胶质瘤组织中的表达及其与患者临床病理特征和预后的相关性。方法：基于CGGA数据库胶质瘤数据和GTEx数据库正常脑组织数据,分析METTL7B基因在胶质瘤与正常脑组织中的表达差异,并用GEPIA数据库数据和免疫组织化学染色法进行验证。用Kaplan-Meier生存分析、单因素Cox分析、多因素Cox分析及ROC曲线分析等评估METTL7B在胶质瘤患者预后中的价值,用CGGA数据库数据分析METTL7B表达与胶质瘤患者临床病理特征的相关性,用CIBERSORT及TIMER数据库进行肿瘤免疫细胞浸润分析,进行KEGG通路富集分析及GO功能富集分析,通过基因共表达分析确定与METTL7B相关的基因。结果：METTL7B在胶质瘤组织中明显上调（均P<0.05）,METTL7B表达是胶质瘤患者独立的不良预后因素。METTL7B高表达与高龄（>41岁）、肿瘤分级增加、肿瘤复发或继发性肿瘤、IDH野生型、1p19q非共缺失以及肿瘤的恶性病理学有关联（均P<0.01）;METTL7B表达与B细胞、CD4+T细胞、CD8+T细胞、单核细胞...     

基于TCGA数据库构建胃癌免疫相关基因的预后风险模型

目的 基于癌症基因组图谱(TCGA)数据库,通过分析差异表达的免疫相关基因构建胃癌患者的预后风险模型。方法 从TCGA数据库下载胃癌及癌旁组织的RNA测序数据和配对的患者临床资料,从Imm Port数据库中下载免疫相关基因的数据。通过比较肿瘤组织和癌旁组织,筛选出差异表达的免疫相关基因,采用Cox风险比例回归模型构建差异表达免疫相关基因的预后风险模型,通过Kaplan-Meier生存曲线和受试者工作特征(ROC)曲线下面积(AUC)评价模型的预测性能,再对模型风险评分进行独立预后分析。结果 从TCGA数据库下载了包括375例胃癌组织和32例癌旁组织的RNA测序数据,共筛选出349个差异表达的免疫相关基因,通过多因素Cox回归分析得到9个(IL1A、APOH、CGB5、GRP、TNFSF18、LGR6、MC1R、NPR1、CTLA4)与胃癌预后相关的免疫相关基因,并以此构建预后风险模型。根据模型风险评分的中位值将所有样本分为高、低风险两组,Kaplan-Meier生存分析结果显示,低风险组的总生存率高于高风险组,差异有统计学意义(P<0.001)。ROC曲线下面积为0.719,独立...     

基于TCGA数据库构建肝癌铜死亡的预后模型

目的 构建肝细胞癌（HCC）患者铜死亡相关基因（CRGs）的预后模型。方法 基于TCGA数据库HCC患者的mRNA数据集，分析CRGs在HCC患者中的表达，对CRGs及相关基因进行GO和KEGG富集分析。Kaplan-Meier生存分析曲线评估CRGs的生存预后价值，分析其与免疫细胞浸润的相关性。单因素Cox回归分析筛选出与HCC患者生存预后显著相关的CRGs,Lasso回归和多因素Cox回归分析构建预后模型。根据风险值对患者进行分组并进行生存分析，ROC曲线评估预后模型，单因素和多因素Cox回归分析风险评分及临床因素与预后的关系。结果 分析得到HCC中差异表达CRGs共11个，CRGs及其相关基因主要富集的GO条目为氧化还原酶活性，作用于供体的醛基或氧基，主要富集的KEGG信号通路为碳代谢。CRGs的表达水平与浆细胞样滤泡树突细胞、T辅助细胞等免疫细胞的浸润显著相关（P<0.05）。筛选并构建3个CRGs的预后模型，包括CDKN2A、DLAT和LIPT1。高风险组和低风险组的生存时间存在显著差异（P<0.001）。风险评分是预后不良的独立危险因素（P<0.001）。...     

肝癌中铜死亡相关基因的表达及其预后价值

目的探讨铜死亡相关基因与肝癌生存预后的关系。方法通过收集TCGA数据库中肝癌患者的临床信息和相应的RNA-seq数据,分析10个铜死亡相关基因在肝癌组织和正常组织中的差异表达。进一步使用一致性聚类以确定新的肝癌亚型,比较两个亚型之间总体生存率和临床特征的差异。单因素Cox回归分析筛选与预后相关的铜死亡基因,并利用LASSO回归分析构建风险模型。结果与正常组织相比,肝癌组织中FDX1表现下调,其余9个基因表现上调。聚类分析示,Cluster1的预后较差。基于单因素Cox回归分析和LASSO回归分析筛选出5个预后相关基因(LIPT1、DLAT、MTF1、GLS、CDKN2A)并构建风险模型。与其他临床特征相比,该预后模型的风险评分被确认为独立的预后因素。结论通过生物信息学分析构建了5个铜死亡相关基因的肝癌预后模型,有可能作为肿瘤诊断分子标志物和潜在的治疗靶点。     

基于细胞焦亡的结肠癌预后预测模式

目的：采用生物信息学方法探索结肠癌组织中与焦亡相关的基因,并探讨其与预后的关系,为结肠癌患者提供新的治疗靶点。方法：分别从TCGA数据库、GEO数据库中下载结肠癌患者的基因表达、转录数据及临床数据。利用R软件提取出TCGA转录数据中细胞焦亡基因的表达量,并找到差异表达基因,构建差异表达基因的蛋白互作网络。采用单因素分析、聚类分析将基因进行分型,比较两种亚型之间生存差异,得到预后相关基因。然后通过Lasso回归分析、交叉验证及优化,得到基因系数（Coef系数）,构建一种结肠癌预后的预测模型。根据该预测模型计算出TCGA样本的中位风险得分,将样本分为高、低风险组。以GEO样本作为验证组,分别对TCGA、GEO样本进行生存分析（Kaplan-Meier分析）、绘制ROC曲线、绘制风险曲线、PCA和t-SNE分析。结合模型中的风险评分,分别采用单因素及多因素分析来寻找结肠癌患者的独立预后因素。对高、低风险组进行GO和KEGG分析。最后行ssGSEA分析,对每个样本进行免疫细胞及免疫相关功能打分,得到高、低风险组之间免疫细胞及免疫细胞相关功能的差异。结果：共鉴定了52个焦亡基因在结肠癌及正常结肠...     

基于生物信息学筛选的结肠癌细胞焦亡相关基因的分析及预后模型的构建

目的探讨应用生物信息学筛选的结肠癌细胞焦亡相关基因特点, 对基于差异表达的细胞焦亡相关基因构建的结肠癌预后模型予以验证。方法从癌症基因组图谱(TCGA)数据库下载结肠癌患者RNA测序的基因数据和临床数据。通过检索文献确定52个与细胞焦亡相关基因, 将其与TCGA数据库中获得的结肠癌和正常结肠组织的RNA测序基因数据集进行对比, 获取差异表达的临床样本细胞焦亡基因, 应用STRING网站和R软件分析这些基因蛋白质互作网络。依据TCGA数据库临床样本中细胞焦亡基因的差异表达情况, 将TCGA数据库中结肠癌患者分为焦亡组和未焦亡组, 根据基因表达量, 以P<0.05筛选两组间差异表达明显的基因;基于这些差异表达基因, 采用LASSO Cox回归构建细胞焦亡相关的结肠癌预后模型。按照模型计算的风险评分的中位值将从TCGA数据库中收集的患者分为高风险(≥中位值)和低风险(<中位值)两组, 通过Kaplan-Meier生存函数分析两组总生存, 采用R软件的timeROC程序包分析应用风险评分预测TCGA数据库结肠癌患者生存不同时间的效能。采用多因素Cox回归分析临床病理因素及模型风险评...     

铜死亡相关基因在甲状腺乳头状癌组织中的表达和临床意义

目的 探讨铜死亡相关基因(CRGs)在甲状腺乳头状癌(PTC)组织中的表达,并探索其在PTC预后中的潜在价值。方法 UCSC数据库下载来源于癌症基因组图谱数据库(TCGA)中TCGA-THCA数据集的转录组数据及对应临床信息,并结合TCGA泛癌临床资料数据集的随访信息。通过基因差异性分析和Cox回归分析筛选出与PTC疾病无进展生存期(PFS)相关的CRGs。采用Wilcoxon秩和检验分析该基因在PTC组织和癌旁组织之间的差异表达和该基因与临床特征的关系,进一步使用Cox回归分析该基因与PTC患者PFS的相关性。最后对该基因进行基因集富集分析(GSEA)。结果 本研究从UCSC数据库筛选纳入PTC患者424例。最终识别出在PTC中2个上调的CRGs基因(赖氨酰氧化酶样蛋白和周期蛋白依赖激酶抑制因子2A基因)和3个下调的CRGs基因[铜蓝蛋白、血管内皮生长因子A和铁氧还蛋白1 (FDX1)基因]。Cox单因素分析筛选出与PFS相关的1个CRGs基因FDX1。FDX1在PTC组织中显著低表达(P<0.001),表达水平与伴有腺体外侵犯(P<0.001)、较高的T分期(P<...     

胃癌内质网应激特征相关基因的筛选及预后风险模型的构建

目的基于生物信息学方法筛选胃癌内质网应激(ERS)特征相关差异表达基因并构建预后风险模型。方法从癌症基因组图谱(TCGA)数据库中获取375例胃癌和32例癌旁组织样本的转录组测序数据(RNA-seq)及相应临床信息作为训练集样本;从基因表达综合(GEO)数据库中下载387例胃癌患者数据(GSE84437)作为验证集样本;数据获取时间均为2021年12月25日。从GeneCards数据库中获取785个ERS特征相关基因(ERS-RG)。分析TCGA数据库中胃癌组织与癌旁组织之间差异表达基因。将鉴定出的胃癌差异表达基因与GeneCards数据库中ERS-RG取交集, 得到胃癌ERS特征相关差异表达基因, 对其进行基因本体功能(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析。采用单因素Cox比例风险模型筛选具有预后价值的胃癌ERS特征相关差异表达基因, 进行LASSO回归分析, 构建多基因预后风险模型, 计算预后风险评分。根据预后风险评分的中位数(2.369), 将训练集和验证集中患者分别分为高风险组与低风险组;采用Kaplan-Meier生存分析比较两组患者总生存(OS), 并绘制时...     

整合铁死亡和免疫相关基因建立胃癌预后风险评估模型

目的 探讨铁死亡相关基因(FRGs)和免疫相关基因(IRGs)在胃癌中的预后价值并构建预后风险模型预测患者总生存期(OS)。方法 从癌症基因组图谱(TCGA)和基因表达综合(GEO)数据库中下载胃癌转录组数据和临床数据，从FerrDb和Immport数据库中提取FRGs和IRGs。将TCGA表达谱基因与FRGs和IRGs取交集获得胃癌FRGs和IRGs,使用差异分析和预后相关性分析进行筛选并通过Venn图取交集获得具有预后价值的差异FRGs和IRGs,使用LASSO-Cox回归进一步筛选构建铁死亡相关基因风险评分(FRG risk-score)和免疫相关基因风险评分(IRG risk-score)模型，运用Kaplan-Meier生存分析、受试者工作特征曲线(ROC)、主成分分析(PCA)和t-分布领域嵌入算法(t-SNE)、单变量与多变量Cox回归分析评估FRG risk-score和IRG risk-score模型，并构建结合临床病理学特征和FRG risk-score、IRG risk-score的列线图和校准曲线。同时，GSE84437数据集用于验证模型。运用CIBERSORT...     

基于铁死亡相关基因骨肉瘤预后模型的构建与验证

目的 基于铁死亡相关基因（FRG）构建骨肉瘤（OS）预后模型,探讨FRG在OS中的表达及与患者预后的关系。方法 通过生物信息学方法从UCSC Xena数据库中获取88例OS患者的转录组测序数据和其中85例患者的临床资料,与基因型-组织表达（GTEx）数据库中获取的396例正常骨组织样本合并,从FerrDb数据库中获取FRG,从合并后的数据中进行差异分析并提取差异表达的FRG。采用基因本体（GO）和京都基因与基因组百科全书（KEGG）富集分析探索OS中FRG的生物学功能。采用单因素Cox与Lasso回归模型筛选预后相关基因并构建预后预测模型。采用受试者工作特征（ROC）曲线分析预后模型的预测价值。采用单因素及多因素Cox回归模型分析OS患者预后的独立影响因素。采用实时荧光定量聚合酶链反应（qPCR）检测预后相关FRG在人成骨细胞hFOB1.19与OS细胞系U2OS、MG63中的表达情况。结果 共获得57个差异表达的FRG。GO与KEGG富集分析发现这些差异基因主要富集在缺氧反应、线粒体外膜、铁离子结合等生物学反应和线粒体自噬、化学致癌-活性氧以及铁死亡等途径。应用单因素Cox及Lasso...     

基于TCGA数据库代谢相关基因构建乳腺癌预后模型

目的 基于TCGA数据库构建乳腺癌代谢相关预后模型,揭示代谢与乳腺癌预后之间的关系.方法 代谢相关基因从KEGG数据库中获取,limma包用于去筛选TCGA数据库中1109例乳腺癌样本和113例正常对照的代谢相关差异基因,随机抽取70％样本作为训练集,剩余30％样本作为验证集,单因素Cox回归用于筛选预后相关基因,基于...     

肺腺癌相关基因的生物信息学分析

[摘要] 目的：通过生物信息学分析基因表达谱,获取肺腺癌相关基因及信号通路。方法：从GEO数据库下载GSE40791、GSE68571、GSE43458 和GSE18842 表达数据,将4 个微阵列数据集整合获得肺腺癌相关差异表达基因,利用STRING数据库为差异表达基因构建肺腺癌蛋白-蛋白互相作用网络,并挖掘肺腺癌网络中基因模块及关键基因。通过DAVID对各基因模块进行基因富集分析,发掘基因模块在肺腺癌细胞中所执行的调控功能及模块中关键基因与患者的预后关系。结果：初步筛查获得肺腺癌相关37 个上调基因、120 个下调基因,并成功构建蛋白-蛋白相互作用网络,通过MCODE算法在蛋白-蛋白相互作用网络中构建基因模块以及计算关键基因(KIF14,SEPP1,SPP1,RBP4),最终获得的4 个模块分别参与细胞周期、血凝变化、细胞黏附和细胞代谢的调控。经验证4 个关键基因在肺腺癌和正常组织中有明显表达差异(P<0.05)。生存分析显示KIF14 的表达对肺腺癌的预后有显著影响(P<0.01),SEPP1、SPP1 对患者生存率有显著影响(P<0.05),RBP4 对患者的生存率影响无统计学意义(P>0.05)。结论：通过生物信息方法分析肺腺癌和癌旁正常组织的差异基因表达,最终筛选出3 个差异表达非常显著且对患者预后影响明显的基因,对肺腺癌的诊断和预后治疗提供了新思路,提高肺腺癌机制的研究效率。