职业人群生物样本数据库建立初探

目的 建立职业人群生物样本库,收集、保存生物样本,为今后对职业病的深入研究提供资源.方法 根据接触因素的不同,制定不同的生物样本采集方案,对职业接触人群进行样本采集;以计算机软件技术和数据库技术为基础,对职业接触人群的生物样本及其基本信息进行管理.结果 体系建立后收集并保存了1061例职业病病人及职业危害因素接触人群的生物样本及相关信息;建立了将标本相关信息与标本的储存、管理整合在同一平台上的数据管理系统.结论 建立的数据库能够对职业人群生物样本的采集、分离、储存和使用进行管理,可使生物样本资源得到更加科学合理的利用.     

建立综合性医院标准化、规范化重大疾病生物样本模式初探

目的 综合性医院疾病分布广泛,呈现地区性、多样性,单一病种样本库相互封闭、欠规范、缺乏信息化与安全保障.探讨适合在综合性医院建立标准化、规范化重大疾病生物样本库模式的意义.方法 重大疾病生物样本数据库的建设,旨在建设符合国际标准的山西省重大疾病资源库,将基础研究成果转化,加强基础研究和临床应用的结合,解决临床上早期诊断和早期治疗的问题,将有助于开发针对这些疾病的早期预警、早期预防、早期治疗的新技术、新方法以及个体化治疗.作为山西省最大的综合性三甲医院之一——山西省医科大学第二医院针对山西省重大疾病分布如恶性肿瘤、骨关节病、慢性肾病、心脑血管病、风湿病、血液病等各系统疾病建立标准化、系统化、规范化的生物样本数据库,并逐步建立疾病对照正常人群生物样本数据库,实现资源整合与共享.结果 医院是生物样本库的主体,山西医科大学第二医院在院领导的支持下,由科技处和病理科牵头,成立重大疾病生物样本库,逐步形成一总多分,由科技处统一分层管理的样本库模式,按照中国医药生物技术协会组织生物样本库分会《中国医药生物技术协会生物样本库建设指南（试行）》要求,建立我院重大疾病生物样本库总库（病理科为基地、科技处统一管理）.建立统一的SOP执行标准,信息管理体系,逐步完善生物样本库总分库的网络信息管理,将患者信息、随访信息等诸多信息实现院内网络化统一管理、资源共享.结论 综合性医院重大疾病生物样本库的建设是一个高度复杂、高度组织的系统化工程,需要多学科通力合作,行政管理和协调参与：标准化的信息化管理建立标准化生物样本库必要条件之一;高质量的样本和系统的临床随访资料;医学伦理、质量控制和安全保障;并充分发挥病理科及各合作科室在组织库建设中的作用.     

骨关节退行性病变临床数据和样本资源库的建立及管理

目的利用北京积水潭医院骨科医疗优势,建立骨关节退行性病变临床数据和样本资源库,为进一步开展科学研究做好资源准备。方法建立标准化操作流程及管理体系,收集2007年7月以来因骨关节退行性病变而行手术切除的患者的组织及血液标本,组织标本从离体到冻存控制在10rain以内,且标本尽量多管分装,分别按不同要求处理后放入-80℃超低温冰箱冷冻保存,同时收集相应患者的临床信息,进行数据库信息化管理。结果从2007年7月至2011年11月共收集了2605例骨关节退行性病变患者的临床信息及标本,共15188管份组织与血标本。向科研及临床工作者提供临床信息及组织标本165份,血标本2005管份,以及相应患者的临床信息,分别应用于分子生物学、流行病学等分析研究,并有相关文章发表。结论骨关节退行性病变样本资源库的建立,是开展相关疾病研究的重要的基础性工作,规范的样本收集操作流程及完善的管理体系是资源库质量的重要保证。     

昆山市第一人民医院生物样本库的建设和管理初探

目的：为了有效规范建立县域市级综合性医院生物样本库,使这些样本能符合临床科研课题需要。方法：通过院伦理委员会审核,制定生物样本库知情同意书,通过液氮和-80℃冰箱保存组织、血液样本以确保样本质量,为临床科研提供高质量样本。结果：建立一套适合县域市级综合性医院生物样本库的操作流程,到目前为止收集各科组织样本252例合计3 427管份,血液样本109例合计1 440管份。结论：对库内的样本随机抽取进行质量检测,对出库的样本收集反馈信息,90%样本质量均达到质控要求,基本满足临床科研需要。     

高标准建造生物样本库

正1生物样本库的类型与应用现状在医院及医学教学、科研单位为了医治、教学和科研任务,常建立有人体组织库及器官库。如血液、骨髓、正常细胞、遗传突变细胞、肿瘤细胞、细胞株库等多种人体组织细胞库。目前近80%医院的生物样本由相对应的科室及病理科保存与应用,以-80℃超低温水箱、-196℃液氮罐为主要保存容器。科室小范围保存样本成本高、资源不能共享,也不利于信息化、正规化管理。2国内生物样本库的发展趋势     

消化道肿瘤组织和血液标本库的建立及信息化管理

目的 探讨消化道肿瘤标本库的建库条件,标本的采集、保存和质量控制,以及肿瘤标本库的信息化管理.方法 外科手术采集的标本(包括肿瘤组织、瘤旁组织、远端正常组织和淋巴结)以及肿瘤患者的血清/血浆标本和从肿瘤组织中提取的核酸等肿瘤资源按规范要求分装处理后在一80℃深低温冷冻保存或液氮保存;并自主设计开发了一套标准化智能信息管理系统应用于标本库的管理,标本库系统结构包括标本资料数据库和出入库数据库及6大功能模块;标本实行条码扫描存储、分类、报警以及统计等功能;标本对应有国际疾病分类编号,可与国际接轨,广泛合作.结果 本标本库共收集消化道肿瘤和正常对照标本20余万份,包括特色肿瘤标本:双胞胎癌;双源癌;夫妻癌.已向各级研究机构和研究生提供标本279194份,用于DNA、RNA和蛋白质等的相关分子生物学研究,效果良好.结论 消化道肿瘤标本库的建立及完善的信息管理系统,可向研究者们随时提供经确诊的、合乎现代肿瘤学研究要求的各种肿瘤标本和正常对照标本,有利于与国内、国际各科研机构合作,有效地利用肿瘤资源.     

2型神经纤维瘤病标本库的建立及应用分析

目的初步建立2型神经纤维瘤病(NF2)患者的标本库,分析其临床应用及遗传学研究的价值。方法收集NF2患者病例资料并进行长期跟踪随访,绘制家族系谱图并建立信息资料库;采集NF2患者及家族高危成员外周静脉血,分离血浆、血清及淋巴细胞分别保存;术中获取新鲜肿瘤组织15min内存入液氮中,部分组织制作成石蜡标本;提取肿瘤及淋巴细胞标本中的DNA,质检并保存,采用PCR-DNA测序方法进行NF2基因突变分析。结果已将293例患者信息纳入资料库,并完成定期随访;收集肿瘤冰冻标本72例,肿瘤石蜡标本275例,血液样本80例;外周血及冰冻肿瘤组织提取DNA的OD260/280值在1.80～1.86之间,198例石蜡样本提取的DNA片段长度主要分布在1700～2500bp之间,能满足分子遗传学研究的需要。结论 NF2标本库的建立可为症状前基因筛查、遗传规律分析及发病机制研究提供标本来源。     

解放军总医院第五医学中心传染病特色生物样本库的标准化建立

为了建立具有传染病特色的规范化、标准化临床生物样本库,在前期通过文献检索和实地调研等方法,在转化医学理念的指导下,以前瞻性队列为牵引,标准化收集、保存本院艾滋病、肝病等特色临床传染病样本。从2015年7月至今,建立了库容量大于200万份的传染病样本库,制定了完整的各类样本(血液、组织等)收集、处理及保存等标准操作规程,制定了安全管理、样本管理、样本质控等相关管理制度,优化了样本库管理-样本信息-随访信息三位一体的运作流程。收集、保藏了血浆、全血、外周血单核细胞等样本近20万份,可为乙肝、艾滋病等传染病的综合防治与研究提供高质量样本及相关临床信息。     

前列腺癌标本库的初步建立及其应用价值

目的有计划地建立前列腺癌标本库,摸索科研标本库建立和管理的合理操作流程,为系统开展前列腺癌研究打好基础。方法采集前列腺癌患者初诊和治疗随访过程中及前列腺增生患者的静脉血及尿液标本,处理得到各类标本保存于一80℃冰箱。获取患者新鲜组织标本,保存于液氮,并收集肿瘤组织石蜡标本保存。结果标本库共计纳入184例病理确诊的前列腺癌患者、294例前列腺增生患者及3例PIN患者,各类标本均按预期方案处理及保存。以标本库工作为基础,课题组进行了大量的科研工作,取得了一定成果。结论前列腺癌标本库建立的流程已基本成熟,初步建立的标本库能为各项研究提供标本和相关资料来源。     

生物样本库建设管理现状与建议

系统梳理国外生物样本库建设模式、国内生物样本库管理建设情况,探讨疾病预防控制系统内建立公共卫生生物样本库的机遇、优势和挑战,为今后指导疾病预防控制系统生物样本库建设管理的实际工作提出政策建议和解决途径。     

新型肿瘤检测仪临床试验报告

目的：对手术中的肿瘤组织标本快速定性做出诊断。方法：术中同步应用2种技术方法：Na＋微电流检测法和冰冻切片法对80例新鲜病变组织标本进行定性诊断。将检测组织放入37℃恒温水浴锅中复温3min．取出后吸净表面水分,置探头于组织上,同时仪器荧屏上出现与红线并行的黑色微电流曲线。Na＋微电流曲线值〈0μA为良性,〉0μA为恶性,检测后标本分别编号进行常规病理检查。结果：Na＋微电流检测法与冰冻切片法诊断符合率为96．25％．与石蜡切片诊断符合率为93．75％。结论：Na＋微电流检测法能在几分钟内对病变组织快速定性判断．若与冰冻切片法同时应用可以互相印证,提高准确性。该方法不能对肿瘤进行分型、分类．尚不能代替病理诊断．     

恶性肿瘤生物样本信息数据库的构建及应用

目的生物样本库对临床转化性研究具有重要的推动作用,随着生物样品数量的日益增加和研究需求的多样性,传统的电子表格管理模式已不能满足庞大样品量及其临床信息高效、集中管理的需求。因此迫切需要对生物样本实行信息化管理,构建恶性肿瘤生物样本及临床信息的信息化管理体系,以实现生物样本信息的系统化、规范化、高效化管理。 方法以恶性肿瘤生物样本信息数据库为依托,对恶性肿瘤样品源及样品信息进行结构化设计,通过恶性肿瘤样品组、样品源组、虚拟医用冰箱的构建,整合恶性肿瘤患者基本信息、临床信息等相关信息,并实现查询统计功能。 结果成功构建了恶性肿瘤生物样本数据库,包含样品组、样品源组、虚拟医用冰箱组,实现了生物样本的查询统计应用,包括各癌种的样品量统计、各科室血液样品和组织样品的采集量统计,以及对样品管出库管理的应用。 结论构建的恶性肿瘤生物样本信息数据库,数据信息完整、结构设计合理,样品组信息具有可扩展性。该数据库满足了我院当前生物样本数据信息化管理的需求,实现了多项查询统计应用和出库应用,为相关恶性肿瘤疾病的研究提供了可靠保障。     

Evaluations of surgically removed breast tumors from the pathologist's viewpoint, with special emphasis on benign lesions

The surgical management of malignant breast tumours has considerably changed in the last decade, and breast conservation is often favoured over mastectomy. As a consequence of screening and use of preoperative diagnostic tools some unequivocal lesions are removed for diagnostic purposes. In the present study, the author addressed some of the quality control issues of breast operations that pathologists could monitor. Breast specimens from patients operated on in 1999 formed the basis of this work. The benign to malignant ratio of the 187 assessed cases (0.6) was favourable, and the diagnostic intraoperative frozen section rate (25%) also showed a favourable decrease when compared with previous years. The weight of breast tissue (mean: 31.9 grams) removed during surgery for benign conditions was high. Possibilities for (further) decreasing the three monitored parameters are highlighted. It seems that the parameter than can be improved the most is the mass of benign breast tissue removed for diagnostic purposes. This could be achieved with a better segregation between diagnostic and therapeutic indications of operations. As benign tissue is generally removed from patients who are young, cosmetic results should particularly be taken into consideration in this group.     

Light sheds light on cancer--distinguishing malignant tumors from benign tissues and tumors.

Difference in fluorescence spectra from human malignant and benign tumors, benign and normal breast tissues were measured. Spectral histograms from 40 samples show the diagnostic possibilities of this optical technology. Fluorescence from model fluorophores (nucleotides, amino acids, and proteins) were used to speculate on the sources of marked features of the tissue fluorescence.     

Identification of neoplasias of breast tissues using a powder diffractometer

An investigation was carried out to study the potential use of the angular distribution of scattered photons by human breast samples for a rapid identification of neoplasias of breast tissues. This technique has possible applications as diagnostic aid for breast cancer. In this work, a commercial powder diffractometer was used to obtain the scattering profiles from breast tissues histopathologically classified as normal breast tissues, fibroadenomas (benign breast diseases) and carcinomas (malignant breast diseases), in the interval 0.02A(-1) < x < 0.62A(-1). The experimental methods and data corrections are discussed in detail, and they included background subtraction, polarization, self-attenuation and geometric effects. The validation of the experimental procedure was achieved through an analysis of water sample. The results showed that the scattering profile is a unique impression of each type of tissue, being correlated with their microscopic morphological features. Multivariate analysis was applied to these profiles in order to verify if the information carried by these scattering profiles allow the differentiation between normal, benign and malignant breast tissues. The statistical analysis results showed that a correct identification of 75% of the analyzed samples is accomplished. The values of sensibility and specificity of this method in correctly differentiating between normal and neoplastic samples were 95.6% and 82.3%, respectively, while the values for differentiation between benign and malignant neoplasias were 78.6% and 62.5%. These initial results indicate the feasible use of commercial powder diffractometer to provide a rapid diagnostic with a high sensitivity.     

Birth and clinical pregnancy from fresh and frozen oocytes fertilized with cryopreserved testicular spermatozoa

This is the first report showing a second clinical pregnancy of a couple who already have a baby from a previous frozen embryo transfer cycle when the embryos were generated from fresh oocytes that were fertilized by intracytoplasmic sperm injection (ICSI) using frozen testicular spermatozoa (the couple have unsuccessful fresh and frozen embryo transfer cycles). Fifty-two months after the first IVF/ICSI cycle the couple had their second IVF/ICSI cycle, but the collected oocytes (n=8) were frozen because no spermatozoa was obtained from the frozen testicular tissue samples which were cryopreserved prior to the first IVF/ICSI cycle. New testicular tissue samples were obtained and frozen. Finally, 58 months after the first IVF/ICSI cycle all of the 8 frozen oocytes of the couple were thawed and fertilized by ICSI using frozen testicular spermatozoa obtained from the newly cryopreserved testicular tissue. Three embryos were transferred and the couple has an ongoing pregnancy, which is in the 20(th) week of pregnancy. Our case report shows that: 1) developmentally competent embryos can be generated by ICSI of frozen-thawed testicular spermatozoa into both fresh and frozen human oocytes, and 2) clinical pregnancy and a healthy baby can be conceived from both frozen and fresh oocytes fertilized with cryopreserved testicular spermatozoa.     

BRG1在人脑胶质瘤组织中的表达及临床意义

目的：研究BRG1在人脑胶质瘤中的表达情况,并探讨其表达水平与胶质瘤的恶性程度及发生、发展的关系。方法：采用组织芯片及免疫组化技术,评估BRG1在120例良性胶质瘤组织（I~II级）、70例恶性胶质瘤组织（III–IV级）、8例正常脑组织和8例癌旁组织中的染色情况。结果：免疫组化结果显示：BRG1在正常脑组织中阳性表达率为25%（2/8）,在癌旁组织中阳性表达率为25%（2/8）,在良性胶质瘤组织中阳性表达率为80.8%（97/120）,在恶性胶质瘤组织中为82.9%（58/70）。在癌旁组织与良性胶质瘤之间、癌旁组织与恶性胶质瘤之间差异均有统计学意义（P=0.000）,但是在良性和恶性之间差异无统计学意义（P=0.847）。BRG1的表达与临床病理参数之间也没有相关性。结论：BRG1在人脑胶质瘤中的表达明显高于正常脑组织和癌旁组织,并与胶质瘤的发生具有一定的相关性。BRG1在胶质瘤的发生过程中可能有重要作用。     

基于闵行社区卫生信息化的慢性病研究平台标本库的建设

目的:建立一个与国际接轨的标本化的标本资源库和现代化的标本信息管理平台,为人类慢性疾病的基础和临床研究提供材料。方法:现场采集社区60岁以上老年人的血液、尿液标本,按分子生物学实验要求分装处理,于-80℃低温冷冻保存;建立标本及其相关临床资料信息化管理系统,可随时查询与分析。结果:通过对上海闵行江川社区60岁以上老年人样本收集和信息采集,共招募到6586人,标本数共108691份。对所收集标本的流行病学及临床资料信息通过信息化手段进入软件管理系统。结论:初步建立了具有高质量样本和系统临床随访资料的慢性病研究平台标本库,有利于慢性病研究的深入和开展,有利于资源有效合理利用。     

子宫内膜癌组织中PTEN及PI3K的表达及临床意义

目的:应用组织芯片技术探讨PTEN及PI3K表达与子宫内膜癌临床病理特征之间的关系及其表达相关性。方法:收集62例子宫内膜病理标本,应用组织芯片技术及免疫组化法检测PTEN及PI3K的表达。结果:PTEN和PI3K在子宫内膜良、恶性组织中阳性表达率相比,差异有统计学意义;在子宫内膜癌高中分化组与低分化组中阳性表达率相比,差异有统计学意义;在无肌层浸润或浸润深度≤1/2组与浸润深度>1/2组中阳性表达率相比,差异有统计学意义;PI3K在无淋巴结转移的子宫内膜癌中及有转移者中阳性表达率相比,差异有统计学意义;PTEN阳性表达率与PI3K阳性表达率呈负相关(γ=-0.631,P<0.05)。结论:PTEN阳性表达与子宫内膜癌组织学分级及肿瘤侵袭性呈负相关;PI3K阳性表达与子宫内膜癌组织学分级、肿瘤侵袭性及淋巴结转移呈正相关;二者在子宫内膜癌发生和发展中呈拮抗作用,表达呈负相关。组织芯片用于多因素比较研究具有高效率、质控好的优点,是一种可靠、快速、经济的高通量分析工具。监测PTEN和PI3K表达,对判断肿瘤恶性程度有重要意义。