东莞市一起社区诺如病毒腹泻爆发调查分析

目的 对东莞市某社区发生的一起腹泻爆发疫情进行调查和分析.方法 采用现场流行病学调查方法了解病例发生情况及可疑传播因素;采用ELISA、RT-PCR等方法对人体和外环境标本进行检测.结果 本次疫情从2007年2月11日开始至18日结束,共发生腹泻病例173例,罹患率2.40%.从4份病人粪便标本中均检测出诺如病毒核酸片段.疫情特点符合经水传播传染病特征.结论 本次疫情为一起由诺如病毒引起的社区腹泻爆发,可疑传播因素为被污染的水.     

诺如病毒疫情暴发的分子流行病学特征

目的了解深圳市光明新区诺如病毒疫情暴发的病原体基因分型情况和分子流行病学特征。方法收集2016年12月至2017年3月感染性腹泻暴发疫情患者的肛拭子标本,通过荧光定量聚合酶链反应(PCR)检测诺如病毒核酸,阳性标本采用巢式PCR扩增诺如病毒VP1基因区(ORF1-ORF2),PCR扩增产物经琼脂糖电泳鉴定后进行测序分析。结果 9起暴发疫情共检测标本101份,诺如病毒阳性标本共54份,总阳性率为53.47%,其中GⅡ型标本52份,GⅠ型标本1份,GⅠ和GⅡ型混合感染标本1份。测序成功获得48份阳性标本GⅡ型诺如病毒VP1基因序列,47份为GⅡ.P16/GⅡ.2亚型,其中45份与2016年中国香港株(KY771081)和中国广东株(KY485113)同源性最高,2份与2017年中国江苏株(KY806301)和2016年泰国清迈株(MF972308)同源性最高;1份为GⅡ.P7/GⅡ.6亚型,与2014年中国台湾株(KM267741)同源性最高。结论 2017年该区诺如病毒疫情暴发的主要型别为GⅡ型,优势流行株为GⅡ.P16/GⅡ.2亚型。     

广州市腹泻监测病例诺如病毒分子流行病学特征

目的 了解广州市腹泻监测病例中诺如病毒分子流行病学特征。方法 2014-2015年选取广州市两家医院的门诊科室作为监测哨点,每间哨点医院每周采集5岁以下和5岁及以上腹泻病例粪便样本各3份,将采集的标本送至广州市疾病预防控制中心检测诺如病毒。阳性标本进行基因序列测定并进行同源性分析。通过中国传染病疫情和突发公共卫生事件网络直报系统收集2014-2015年广州市报告的诺如病毒感染引起的暴发疫情数据,开展流行病学分析。结果 共收集腹泻标本732份,诺如病毒阳性136份,阳性率为18.58%。各年龄组诺如病毒阳性率不同（2=20.39,P=0.001）,其中5岁以下年龄组最高（24.21%）。基因分型结果显示GⅡ组133份（97.80%）,GⅠ组3份（2.20%）。分别对2014年（4份）及2015年（5份）阳性标本进行测序,结果提示,2014年诺如病毒流行株以GⅡ.4 Sydney_2012变异株（75.00%）为主,2015年以GⅡ.17变异株（55.60%）为主。2014-2015年共报告诺如病毒感染性腹泻暴发疫情23起,其中14（60.80%）起由GⅡ组引起。结论 广州市诺如病毒感染性腹泻流行毒株仍以GⅡ组为主,其中2014年优势毒株为GⅡ.4 Sydney_2012变异株,2015优势毒株为GⅡ.17变异株。     

一起高校多基因型诺如病毒感染暴发疫情的病原特征分析

目的 分析2020年一起急性胃肠炎暴发疫情中诺如病毒基因特征,为加强学校诺如病毒感染暴发疫情防控提供依据.方法 收集2020年9月2-10日甘肃省某高校一起诺如病毒感染暴发疫情中有呕吐腹泻症状在校人员的232份粪便标本,初步采用实时荧光PCR法进行初筛和基因组鉴定,随后采用反转录聚合酶链式反应(RT-PCR)对诺如病毒...     

天津地区住院腹泻儿童轮状病毒的检测及其毒株型别分析

目的 了解天津地区5岁以下住院腹泻患儿A组RV的感染情况及其型别特点.方法 收集天津市儿童医院2008年5月至2009年4月837份住院腹泻患儿的粪便标本,用胶体金免疫层析法快速检测A组RV抗原,将检测阳性的标本进行细胞培养,产生细胞病变(CPE)后,提取病毒RNA,RT-PCR扩增病毒VP7基因,并将PCR产物阳性标本测序,证实其VP7(G)血清型.同时收集其临床相关资料.结果 837份标本RV抗原阳性率为26.3%(220/837);90.5%(199/220)的RV腹泻发生在24月龄以下患儿;发病高峰时间主要集中在2008年10月至2009年4月;208份接种的RV抗原阳性标本中,病毒分离后用PCR鉴定阳性95份,对其中35份电泳较好的PCR产物阳性标本作序列分析,除1份为G9型、2份为G3型外,其余均为RV G1型.结论 RV是天津地区婴幼儿腹泻的重要病原,流行的基因型以G1为主.     

一起甲型副伤寒沙门菌污染水源所致腹泻暴发疫情的病原学调查

目的对一起腹泻暴发疫情进行病原学调查,以便明确病因、进行有效的预防控制。方法采用荧光PCR快速检测、常规病原学分离培养、噬菌体裂解试验、ATB微生物自动鉴定系统等方法对疑似患者、环境水源水和饮用水采样,进行病原学的检测和鉴定。结果经荧光PCR检测与病原分离培养鉴定,来自患者粪便、血液、水源水和饮用水共12份疑似标本中,10份为甲型副伤寒沙门菌阳性,检出率为83.33%,其中4份来自粪便标本,4份来自血,1份来自水源水,1份来自饮用水。10株不同来源甲型副伤寒沙门菌的血清学分型、生化反应、药物敏感性、噬菌体裂解试验均相同。结论这是一起由甲型副伤寒沙门菌水源污染所致的腹泻暴发疫情。该菌的检出为本地区腹泻病原谱增加了一种新的病原菌。     

2016年福建省永安及南平监测点五种致泻性大肠埃希菌监测分析

目的 对福建永安及南平两个检测哨点2016年的281份腹泻病例进行5种致泻性大肠埃希菌病原检测,为病例的确诊及致泻性大肠埃希菌流行病学的提供实验数据.方法 收集281份其他感染性腹泻病例(排除霍乱、菌痢、伤寒副伤寒)的粪便标本,接种麦康凯平板,选取初步生化符合大肠杆菌的菌落,然后用致泻性大肠埃希菌多重PCR和单重PCR检测方法确定其致病型别.结果 281份腹泻病例粪便标本共检出致泻性大肠埃希菌17株,检出率6.05%,其中aEPEC 4株,ETEC 6株,EAEC 7株,其他型别未检出.结论 福建地区致泻性大肠埃希菌致病型别以aEPEC,ETEC,EAEC为主,多重PCR检测方法能有效的对致泻性大肠埃希菌病进行确诊及了解菌株的毒力基因携带情况,并为我省的致泻性大肠埃希菌的流行病学资料的积累及疾病防控提供快速客观的依据.     

一起诺如病毒胃肠炎暴发疫情的流行病学调查

目的了解2018年河北省一起诺如病毒暴发疫情的流行特点及暴发原因，探讨疫情处置经验。方法采用现场流行病学方法，收集2018年河北省一起疫情发生学校的基本情况，搜索病例并进行回顾性问卷调查，描述疾病流行特征，开展病例对照研究及危险因素探索，同时采集患者粪便或肛拭子、食物和水等环境标本进行肠道病毒及肠道致病菌的检测。结果本次疫情持续6 d，累计发病55例，涉及16个班级，罹患率为1.60%。 其中男性34例，女性21例，男女性别比为1.62∶1，年龄为6～37岁，平均年龄9.13岁。 患者症状以呕吐（92.73%）、腹泻（65.45%）为主，无重症死亡病例，病程1～2 d。 危险因素调查显示，高发病班级与无病例班级学生饮食及饮水构成比差异无统计学意义。 本次调查共采集病例标本19份，11份标本GⅡ组诺如病毒阳性，1份标本星状病毒阳性。 采集食品及水样本41份，检测肠道病毒均阴性，细菌学指标亦在正常范围内。结论该起暴发疫情由GⅡ组诺如病毒感染引起，人–人接触或呕吐物形成的气溶胶传播在疫情中起关键作用，首发病例发现、隔离不及时及呕吐物处理消毒不规范是导致疫情扩展蔓延并最终暴发的促发因素。     

杭州市下城区一起学校发生的诺如病毒感染性腹泻疫情调查

2011年3月8日, 杭州市下城区一实验小学二(2)班多名学生发生不明原因呕吐、腹泻、腹痛、头晕等症状, 采用现场流行病学调查方法,搜索病例进行个案调查,采集患者粪便和饮用水进行病原菌、腹泻病毒核酸检测。结果 7份患者粪便中6份为G Ⅱ型诺如病毒阳性;6份饮用水样中4份为G Ⅱ型诺如病毒阳性,6份饮用水样菌落总数均超标,5份大肠菌群超标,13份标本均未检出致病菌。确定此次学校感染性腹泻暴发疫情是由诺如病毒污染桶装饮用水引起。     

甘肃省一起幼儿札如病毒GⅠ.2型感染聚集性疫情调查分析

目的 通过对2021年6月甘肃省兰州市某幼儿园发生一起以呕吐、腹泻为主症的聚集性疫情,确定引起本次疫情的病原体。方法 采集发病幼儿肛拭子、食堂、教室等环境标本共44份（17份患儿肛拭子标本和27份环境标本）,运用聚合酶链式反应检测轮状病毒、诺如病毒、肠道腺病毒及札如病毒核酸,肛拭子进行致泻菌分离培养。结果 44份标本未分离到致泻性大肠埃希菌、沙门菌、志贺菌、小肠结肠炎耶尔森菌等致病菌,轮状病毒、诺如病毒、星状病毒及肠道腺病毒核酸检测均为阴性,札如病毒核酸检测到患儿肛拭子阳性11份,其余标本均为阴性。选取其中2份强阳性标本进行全基因组测序,为札如病毒GⅠ.2型,基本局部比对搜索工具（BLAST）结果与2016年深圳市发现的札如病毒全序列相似度在98.96%～98.98%。结论 此次聚集性疫情由札如病毒GⅠ.2型引起,是甘肃首次发现札如病毒引起的暴发疫情,提示应加强病毒性腹泻的监测和防控。     

一起GⅡ.4 ［P16］ 型诺如病毒感染暴发疫情调查

  目的   分析2021年山东省某小区一起诺如病毒感染暴发疫情流行因素,为制定有效的防控措施提供科学依据。  方法   采用现场流行病学方法调查、分析疾病的流行情况,采集水样本、典型病例的粪便或呕吐物、密切接触者的肛拭子标本进行胃肠炎病毒检测,对阳性样本进行基因分型。  结果   搜索到病例69例（9例为小区内幼儿园儿童,60例为社区居民）, 临床表现主要为呕吐（76.81%）,腹泻（69.57%）。 0～5岁儿童罹患率最高（21.18%）。 17份病例标本和2份密切接触者标本GⅡ组诺如病毒阳性,基因型均为GⅡ.4［P16］。  结论   本次事件是由GⅡ.4［P16］型诺如病毒引起的暴发疫情,是由患病儿童呕吐物造成环境污染,社区人员密切接触导致,及时识别和妥善处置是疫情防控的关键。     

一起GⅡ.7型诺如病毒暴发疫情的调查分析

对北京市某小学一起急性胃肠炎疫情进行调查,采集粪便标本和环境样本检测诺如病毒并进行基因测序。本次疫情涉及8个班级,发生病例51例,流行历时3天,罹患率为13.5%。9份患者粪便标本中8份检出诺如病毒,阳性率达88.9%,在首发病例家中洗手池和坐便池涂抹标本检出诺如病毒。选择阳性标本进行序列分析结果为诺如病毒GⅡ.7型。     

应用TaqMan实时荧光-聚合酶链反应方法快速检测粪便标本空肠弯曲菌的研究

目的建立空肠弯曲菌TaqMan实时荧光-PCR方法,用于粪便标本的直接检测。方法根据空肠弯曲菌特异性基因hipO和mapA分别设计引物和探针,在对2组引物和探针进行灵敏度、特异性和重复性评价的基础上,对45例临床腹泻患者粪便标本提取DNA之后,荧光PCR检测,同时进行分离培养。 结果两组引物和探针能准确检测空肠弯曲菌菌株2株,检测限可达到10~20 cfu/ml,并与其他肠道致病菌无交叉反应。检测45份腹泻病例粪便标本,该方法检测到3份为阳性,同时进行的传统培养方法仅从该3份标本中的两份中分离到空肠弯曲菌。 结论本研究建立的TaqMan荧光PCR检测粪便标本中所携带的空肠弯曲菌灵敏度高,特异性好,能够提高粪便中空肠弯曲菌的阳性检出率和缩短检测时限。     

一起由斯坦利沙门菌引起食源性疾病暴发疫情的调查研究

对3起聚集性腹泻、1起疑似食物中毒事件进行调查,并采集部分病例及从业人员生物标本、涉事单位食品和加工场所环境样品共19份进行沙门菌分离鉴定和基因分型。10份样品检出斯坦利沙门菌, 4株食品样品分离株和5株病例粪便、1株从业人员肛拭分离株的PFGE带型完全一致,由此证实本起事件为一起由斯坦利沙门菌引起的食源性疾病暴发疫情。     

2011-2015年北京市海淀区其他感染性腹泻监测分析

目的 分析2011-2015年北京市海淀区其他感染性腹泻病例流行特征,为制定预防控制措施提供参考依据。方法 采用描述流行病学方法,病例信息来源于中国疾病预防控制信息系统。在海淀区1家哨点监测医院,采集2011-2015年肠道门诊腹泻患者的粪便标本,用实时荧光定量PCR方法对常见腹泻病毒（轮状病毒、诺如病毒）进行检测。结果 2011-2015年海淀区共报告其他感染性腹泻病例25 230例,年报告发病率范围为107.18/10万～188.63/10万,呈逐年下降趋势。 5、5～和60～岁年龄组发病率居前3位。散居儿童报告病例数最多,占全部病例数的26.59%。主要以夏季发病为主,每年6-8月报告病例数最多,流动人口较多的地区发病率较高。共采集腹泻病例标本572份进行轮状病毒和诺如病毒检测,阳性144份,阳性率为25.17%。结论 2011-2015年北京市海淀区散居儿童为其他感染性腹泻高发人群,夏季是高发季节;采样对象为16岁人群,仅开展病毒性病原学监测,不利于指导防控,需要调整监测策略。     

PCR与DIG标记探针对产志贺样毒素大肠杆菌鉴定技术的评价

肠出血性大肠杆菌(EHEC)携带产志贺样毒素(SLT)遗传因子,也称SLTEC,EHEC感染除非可能引起严重的毒血症,其它散发病例不易诊断,因此,非常需要一种直接从临床标本中鉴别出产生SLT菌株的检测方法。本文作者采用95株SLTEC和5株产生志贺氏毒素(STX)、SLT-Ⅰ和SLT-Ⅱ的痢疾志贺菌1型的分离菌株,利用PCR对全部细菌菌落的slt基因进行扩增,使用DIG标记DNA探针斑点杂交法对PCR产物进行检测,对这种无放射性的PCR技术的实用性进行了评价,同时对实验条件进行了最佳化改进。     

PCR技术在流脑诊断中的应用

目的 比较传统病原分离方法与PCR技术在流脑诊断中的作用.方法 采集医院疑似流脑病例的脑脊液(CSF)或血液标本,进行流脑病原菌的分离培养、鉴定与聚合酶链反应(PCR).结果 46例疑似流脑病例标本用传统的培养方法 检出11株流脑菌株,用PCR方法检出23个标本含有脑膜炎奈瑟菌特异性核酸片断(其中包含11份病原分离阳性的标本).结论 PCR方法在流脑实验室诊断中其阳性率比传统的病原分离方法高,PCR方法可用于流脑早期辅助诊断方法之一.     

应用免疫磁珠集菌法首次从漯河市动物粪便中检出O157∶H7大肠杆菌

近年来,O157:H7大肠杆菌在许多国家发生暴发流行,我国自1986年先后在江苏、山东等地分离到此菌,并出现散发病例.自1999年以来,河南有个别县市相继不断出现EHEC感染病例.为了解我市是否有O157:H7流行疫情,采集动物粪便96份,用O157大肠杆菌病原体快检金卡预检阳性者进行免疫磁珠分离,阴性者不再进行检测,现将结果报告如下.     

引起一起发热疫情的人腺病毒4a型基因特征分析

目的了解引起一起发热疫情的人腺病毒4a型基因特征。方法2019年10月,北京市通州区某小学出现发热疫情,采集病例的咽拭子标本,提取标本核酸作为模板,利用实时荧光PCR方法检测32种呼吸道病毒和细菌。 对于腺病毒检测阳性的标本核酸,利用腺病毒特异性引物扩增3个基因（Fiber、Hexon和Penton）的片段并测序,采用局部序列比对基本检索工具（BLAST）比对序列,进行进化关系分析。结果采集的6份病例标本中,腺病毒全部阳性,其他检测的呼吸道病毒和细菌均为阴性。 Fiber、Hexon和Penton基因序列比对结果显示,6份标本中的腺病毒均为4a基因型。进化分析显示,该病毒与近年来美国流行的4a型腺病毒高度同源。结论人腺病毒4a型在北京市可以引起呼吸道发热疫情。     

感染性腹泻患者弯曲菌感染的实验室检测及监测

目的了解我国腹泻患者弯曲菌的感染现状。方法采用体外分离培养以及特异核苷酸检测法对某医院腹泻患者粪便标本进行持续8个月的弯曲菌感染的监测。2013年4-11月持续收集北京某医院感染性腹泻门诊患者粪便标本278份,分别采用直接划线培养、增菌培养以及实时荧光定量聚合酶链反应(real-time PCR)的方法检测感染性腹泻患者弯曲菌的感染现状。结果 278份感染性腹泻患者粪便标本使用分离培养和特异核苷酸检测共有16份标本为空肠弯曲菌阳性。其中直接划线培养分离到6株空肠弯曲菌,阳性率为2.2%(6/278),增菌培养分离到2株空肠弯曲菌,阳性率为0.7%(2/278);特异核苷酸检测获得14份阳性标本,阳性率为5.0%(14/278)。分离培养、real-time PCR方法检测感染性腹泻患者粪便标本中弯曲菌的阳性率差异有统计学意义(χ2=36.425,P=0.039)。结论本次检测结果表明感染性腹泻患者中弯曲菌的检出率显著低于国内最新报道7.1%。与直接分离培养相比,增菌培养法检测粪便中弯曲菌的灵敏度显著降低。real-time PCR法能够快速检测腹泻患者弯曲菌的感染情况,其灵敏度(14/16,87.5%)高于分离培养(6/16,37.5%)。