白介素12B基因rs6887695多态性与汉族人寻常性银屑病临床表型的相关性北大核心CSCD

目的探讨白介素12B（IL-12B）基因多态性位点rs6887695与汉族人寻常性银屑病临床表型（发病年龄、家族史、临床类型、性别）的相关性。方法采用ABITaqman探针荧光PCR技术,对575例寻常性银屑病患者和1403例健康对照的DNA样本进行IL-2B基因多态位点rs6887695的基因分型。使用SPSS14．0分析软件,妒检验比较患者组和健康对照组间、不同临床表型组间的基因型和等位基因频率分布的差异性。结果IL-12B基因多态性位点rs6887695三种基因型（GG、GC、CC）频率在寻常性银屑病患者组分别为42．61％、45．39％和12．0％,健康对照组分别为34．42％、47．83％和17．75％;等位基因频率（G、C）患者组分别为65．30％和34．70％,健康对照组分别为58．34％和41．66％,基因型和等位基因频率分布在患者组和健康对照组间差异均有统计学意义（r值分别为16．31和16．54,P值均〈0．01）,在慢性斑块状（543例）和急性滴状银屑病患者（32例）组间的差异均有统计学意义（r值分别为18．11和12．19,P值均〈0．01）。等位基因G和基因型GG在患者组中的频率明显高于健康对照组,等位基因G和基因型GG在斑块状患者中的频率高于滴状患者。少儿发病组（35例）与成人发病组（540例）、家族史阳性组（102例）与家族史阴性组（440例）、男性患者组（341例）与女性患者组（234例）的基因型和等位基因频率分布差异均无统计学意义（P值均〉0．05）。结论IL-12B（rs6887695）基因多态性与汉族人寻常性银屑病易感性相关联,特别是与斑块状银屑病相关．但与患者的发病年龄、家族史及性别可能无关联。     

ANXA6基因多态性与汉族人寻常型银屑病临床表型的相关性

目的:评价汉族人寻常型银屑病ANXA6基因多态性与临床表型的相关性.方法:选取7425例寻常型银屑病患者和11 208例正常对照的ANXA6基因多态性rs999556和rs3762999位点的基因分型资料和临床资料进行分析.结果:病例组与对照组间ANXA6基因多态性rs999556和rs3762999位点的基因型和等位基因分布频率均存在差异(P<0.05);在急性点滴状患者与慢性斑块状患者间,rs999556位点的基因型分布频率存在差异(P<0.05),等位基因分布频率无差异(P>0.05);在儿童期发病与成年发病患者间、有家族史与无家族史患者间,rs999556位点的基因型和等位基因分布频率均无差异(P>0.05).在上述临床表型间,rs3762999位点的基因型和等位基因分布频率均无差异(P>0.05).结论:ANXA6基因多态性rs999556和rs3762999与汉族人寻常型银屑病发病的易感性相关,rs999556与该病的临床类型相关,与发病年龄和家族史不相关;rs3762999与该病的发病年龄、家族史及临床类型均不相关.     

IL-12B和IL-23R基因多态性与中国汉族人银屑病易感性关联研究

目的 探讨中国汉族人群中IL-12B和IL-23R基因多态性与银屑病易感性的关系。方法 在217例银屑病患者和288例正常人对照中,采用DNA直接测序法对IL-12B和IL-23R基因的多态性位点进行基因分型,并将阳性结果在一个更大的包括578例银屑病患者和1422例正常人对照的整合样本群中,使用Taqman探针荧光PCR技术进行重复检验。实验数据进行Hardy-Weinberg平衡检验、卡方检验、单倍型分析和Logistic回归模型分析。结果 IL-12B rs6887695位点等位基因频率在病例组与对照组之间差异有统计学意义,OR = 1.33（95% CI 1.03 ~ 1.73）,P = 0.028;IL-23R rs11465817和rs1343152位点等位基因频率在病例组与对照组之间差异无统计学意义（P > 0.05）。连锁不平衡分析发现,rs11465817和rs1343152位点之间有一定的连锁不平衡（D′ = 0.744,r2 = 0.281）。对2个位点进行单倍型分析发现,A-A ∶ OR = 2.890,P = 0.0018,提示这一单倍型具有显著的发病风险。结论 IL-12B基因rs6887695多态性与中国汉族人群银屑病易感性相关;IL-23R基因rs11465817、IL-23R基因rs1343152位点多态性与中国汉族人群银屑病易感性无显著相关性,但是,IL-23R基因rs11465817-rs1343152位点A-A单倍型的中国汉族人具有更高的银屑病发病风险。     

IL-1基因多态性与寻常型银屑病表型及患者皮损中NFκB表达的相关分析

目的:探讨IL-1基因多态性与寻常型银屑病表型及其NFκB表达的相关性。方法:选取2012年1月至2015年9月我院收治的寻常型银屑病患者112例为研究对象,分析其皮损中IL-1β和IL-1RA的基因多态性,统计银屑病表型,同时采用免疫组化法检测其皮损中NFκB表达水平,比较不同IL-1基因多态性患者的银屑病表型及其皮损中NFκB表达水平,并采用Logistic多元回归分析IL-1基因多态性与寻常型银屑病表型及其NFκB表达的相关性。结果:112例寻常型银屑病中,IL-1β的CC、CT和TT基因型比例分别为16.96%、68.75%和14.29%,IL-1RA的AA、AB和BB基因型比例分别为61.61%、31.25%和7.14%。IL-1RA的AA基因型中NFκB阳性表达率高于AB型,而AB基因型又高于BB基因型(P值均0.05)。IL-1β各基因型中NFκB阳性率无明显差异,斑块型和点滴型的患者比例亦无明显差异(P值均0.05)。IL-1RA的AA基因型中斑块型患者比例高于AB型,而AB型又高于BB基因型患者(P值均0.05)。Logistic多元回归分析结果显示,IL-1RA基因多态性与寻常型银屑病表型及NFκB表达均密切相关(P值均0.05)。结论:IL-1RA基因多态性与寻常型银屑病表型及NFκB表达水平均相关,NFκB和IL-1RA基因可能共同影响寻常型银屑病的发生发展。     

寻常性银屑病患者白介素20基因多态性研究

目的:选取位于1q32区域的白介素(IL)-20基因,通过检测基因序列研究基因多态性与银屑病的相关性.方法:提取银屑病患者(203例)和正常人(91名)基因组DNA并进行扩增,通过自动测序的方法测定IL-20基因及启动子区域的序列,检测其单核苷酸多态性(SNP)位点,并以SPSS软件进行统计学处理.结果:①IL-20启动子SNP位点-1723 C>G多态性的G等位基因频率,在以上呼吸道感染为发病诱因或加重因素的寻常性银屑病患者组和正常对照组间的频率分别为45.8%和32.4%,两组间差异有统计学意义(X2=5.539,P=0.019).结论:位于IL-20基因启动子区的SNP位点-1723C>G可能与以上呼吸道感染为发病诱因或加重因素的寻常性银屑病相关.     

单核苷酸多态性rs2236313与汉族人寻常型白癜风临床表型的相关性研究

目的:确定染色体6q27区域内一个单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)位点rs2236313与汉族人寻常型白癜风临床表型之间的相关性.方法:选取6458例寻常型白癜风患者和9766名正常对照的rs2236313的基因分型资料和临床资料,用χ2检验对各组间基因型和等位基因频率的分布进行比较.结果:rs2236313基因型频率和等位基因频率分布在病例组和对照组间存在统计学差异(P基因型=8.21×10-14,P等位基因=1.26×10-14).在早发和晚发患者、有伴发疾病和无伴发疾病患者之间,rs2236313等位基因频率分布存在统计学差异(P<0.05).在有和无家族史患者、轻与中重度患者之间其分布均无统计学差异(P>0.05).结论:rs2236313与汉族人寻常型白癜风发病易感性相关,且与发病年龄、伴发疾病相关,与家族史、病情严重程度无关.     

HCR-325多态性与汉族人寻常性银屑病的相关性

目的探讨HCR基因与银屑病发病的相关性。方法从抗凝血中抽提基因组DNA,用PCP-RFLP法检测HCR基因第4外显子325位点多态性。结果HCR-325位点核苷酸存在C,T多态性,表现为CC纯合、TT纯合、CT杂合三种基因型,病例组T等位基因频率明显高于对照组,差异有统计学意义(P<0.05)。结论HCR-325位点的C→T多态性与汉族人群寻常性银屑病具有一定的相关性。     

SYNE2基因多态性与汉族寻常性银屑病患者表型相关性研究北大核心CSCD

目的研究SYNE2基因多态性rs2781377与汉族人寻常性银屑病临床表型之间的相关性。方法基于本研究团队前期全外显子组芯片实验对16 786例银屑病患者及22 920例正常对照进行基因分型的结果,采用病例-对照、病例-病例研究,使用SPSS19.0统计软件分析银屑病患者与正常人基因型的分布频率,并比较该等位基因及基因型与临床表型之间的相关性。结果病例组与对照组之间SYNE2(rs2781377)等位基因及基因型频率分布差异均具有统计学意义(P均<0.05);分层分析结果表明rs2781377等位基因频率分布与早发型寻常性银屑病相关(P<0.05),家族史(阳性/阴性)、皮损临床类型(点滴型/斑块型)以及病情严重程度分级(轻/中/重度)几个临床表型与rs2781377无显著相关(P均>0.05)。结论 SYNE2(rs2781377)与汉族人寻常性银屑病发病易感性相关,与早发型寻常型银屑病显著相关,但与汉族人寻常性银屑病的家族史、皮损临床类型及病情严重程度无显著相关。     

银屑病与白介素-23和白介素-12

白介素-23是一种新发现的细胞因子,与白介素-12在结构上有高度相关性,白介素-23由活化的抗原递呈细胞,主要是树突状细胞分泌,通过IL-23、IL-17途径介导免疫炎症反应.现认为IL-23参与多种自身免疫性疾病,包括银屑病的发生和发展,IL-12p40抗体可能是治疗银屑病的有效药物.     

汉族人银屑病患者IL-23R单核苷酸多态性的研究

目的:探讨白细胞介素-23受体(IL-23R)基因多态性与中国汉族人群银屑病易感性的关系。方法:在NCBI数据库上检索IL-23R的7个SNP位点(rs11209026、rs1004819、rs10489629、rs1343151、rs10889677、rs11209032、rs1495965)。从门诊病人中收集银屑病患者93例,选择健康献血员108例作为正常对照,检测共201例样品中7个SNP位点突变情况。多态性及其单倍型与银屑病相对危险度等数据处理均采用SPSS软件系统进行。结果:7个Tag SNP位点中有4个等位基因(rs1004819、rs1343151、rs10889677、rs1495965)频率在病例组和对照组之间的差异有统计学意义(P<0.01)。结论:IL-23R基因多态性与汉族人银屑病易感性有关联。其中4个SNP位点(rs1004819、rs1343151、rs10889677、rs1495965)与银屑病发病明显相关。     

Association of IL-12B gene rs6887695 polymorphism with hereditary susceptibility and clinical characterization of psoriasis vulgaris in the Chinese Han population

We aimed to investigate the role of IL-12B gene polymorphism (rs6887695) in the disease susceptibility and clinical phenotypes of psoriasis vulgaris patients in the Chinese Han population. The genotype data of the IL-12B gene polymorphism (rs6887695) in 575 psoriasis patients and 1,403 normal controls were investigated using TaqMan technology. The Chi-square test was used to compare the genotype and allele frequency distribution among the groups. The genotypic and allelic frequencies of rs6887695 in the IL-12B gene between the cases and controls, as well as between the guttate and plaque psoriasis cases, were statistically significant (P _genotype <0.01, P _allele <0.01). However, the differences between the pediatric and adult onset psoriasis patients, between familial and sporadic cases, and between female and male cases were not statistically significant (P > 0.05). The genetic polymorphism of the IL-12B gene (rs6887695) may be associated with the psoriasis susceptibility in the Chinese Han population, especially for the plaque cases, but not associated with the age at onset, family history, or sex.     

内质网氨基肽酶1基因rs27044、rs30187和rs26653多态性与汉族寻常性银屑病相关性研究

目的 探讨内质网氨基肽酶1（ERAP1）基因多态性与汉族人寻常性银屑病的遗传关联性。 方法 收集寻常性银屑病患者289例,对照组292例,知情同意后采集外周静脉血5 ml。选择位于ERAP1基因编码区域的3个单核苷酸多态性（SNP）,利用连接酶检测反应进行基因分型（rs27044、rs30187和rs26653）。利用PLINK1.07软件进行统计分析,χ2检验比较患者组与对照组等位基因频率及基因型频率,计算等位基因的相对危险度估计值比值比（OR）及其95%可信区间（95% CI）。利用Haploview软件进行单倍型分析。 结果 rs30187等位基因C及rs26653等位基因G在患者组的频率（分别为0.460 2和0.430 8）、尤其是早发型组中的频率（0.448 5和0.422 7）均明显低于对照组（0.534 2和0.501 7）,差异均有统计学意义（均P < 0.05）。rs27044、rs30187及rs26653这3个SNP两两间均存在强连锁不平衡（r2 ≥ 0.717,D′ ≥ 0.962）。基因型分析结果显示,在隐性遗传模式下,rs30187在患者组及早发型组的基因型频率均显著低于对照组,差异均有统计学意义（P值分别 < 0.05和 < 0.016 7）。单倍型分析发现,单倍型（H4：CTC）在患者组的频率（0.050）、尤其是早发型组的频率（0.052）均明显高于对照组（0.022）,差异均有统计学意义（P值分别 < 0.05、 < 0.016 7）。 结论 ERAP1基因多态性与汉族人寻常性银屑病可能相关,特别是早发型患者。危险单倍型（H4：CTC）可能是寻常性银屑病一个重要的易感因素。     

HCR基因单核苷酸多态性与维吾尔族银屑病的相关性

目的 探讨HCR基因与银屑病发病的相关性.方法 测定118例新疆维吾尔族寻常性银屑病及127例正常人对照组的HCR基因第4外显子第307位点基因多态性.从抗凝血中抽提DNA,用PCR-RFLP法和PCR产物直接测序法鉴定基因型.对结果进行统计学分析处理.结果 HCR-307位点核苷酸存在C、T二态性,表现为CC纯合、TF纯合、CT杂合三种基因型,病例组TF基因型频率明显高于对照组,差异有统计学意义(P<0.01).结论 HCR-307位点的C→T多态性与新疆维吾尔族寻常性银屑病具有相关性.     

内蒙古蒙古族和汉族人群白细胞介素12通路相关基因多态性与寻常型银屑病相关性及与HLA-Cw*0602交互作用研究

【摘要】 目的 探讨白细胞介素12（IL-12）通路相关基因多态性与内蒙古蒙古族和汉族寻常型银屑病患者的遗传相关性及与HLA-Cw*0602的交互作用。方法 收集2012年12月至2018年3月于内蒙古医科大学附属医院住院的寻常型银屑病患者1 409例为病例组,其中汉族1 030例,蒙古族379例,健康对照组1 483例,其中汉族965例,蒙古族518例。采集受试者外周静脉血5 ml提取DNA,选择位于IL-12B（rs2082412、rs2288831、rs3212227、rs3213094、rs7709212）、IL-23R（rs11209026、rs2201841、rs7530511）、IL-28RA（rs4649203）基因区域的9个单核苷酸多态性（SNP）,利用二代测序法进行基因多态性检测,利用序列特异性引物PCR对HLA-Cw*0602进行基因分型。利用PLINK1.07软件进行统计分析,χ2检验比较两组等位基因频率,并计算等位基因的相对危险度估计值比值比（OR）,R × C列联表卡方检验进行单倍型分析。结果 IL-12B基因rs2082412、rs2288831、rs3212227、rs3213094、rs7709212等位基因频率在汉族病例组显著低于汉族对照组（P < 0.005）;IL-12B基因rs3213094等位基因频率在蒙古族病例组显著低于蒙古族对照组（P < 0.005）。汉族和蒙古族病例组HLA-Cw*0602阳性率均显著高于相应民族对照组（P < 0.005）。分层分析显示,汉族HLA-Cw*0602阳性病例组IL-12B基因rs2082412、rs2288831、rs3212227、rs3213094、rs7709212等位基因频率显著低于汉族对照组（P < 0.005）,而阴性病例组与汉族对照组各等位基因频率差异无统计学意义（P > 0.05）。蒙古族HLA-Cw*0602阳性或阴性病例组各等位基因频率与相应对照组差异均无统计学意义（P > 0.005）。分析IL-12B基因区域的5个SNP构建单倍型,在汉族、蒙古族病例组和对照组中6个单倍型分析差异均无统计学意义（P > 0.005）。基于HLA-Cw*0602分层的IL-12B基因多态性单倍型分析,蒙古族、汉族7个单倍型无论HLA-Cw*0602阳性和阴性病例组及对照组中的频率差异无统计学意义（P > 0.005）。HLA-Cw*0602阳性和阴性蒙古族病例组和对照组,单倍型GATGT频率在两组间差异均无统计学意义（P > 0.05）。结论 IL-12通路相关基因多态性与内蒙古蒙古族、汉族人群寻常型银屑病具有相关性,且IL-12B与HLA-Cw*0602在寻常型银屑病发病过程中可能存在交互作用。     

寻常型银屑病与载脂蛋白相关性研究

目的探讨我国汉族人寻常型银屑病(PV)与载脂蛋白E(ApoE)等位基因ε2的相关性。方法采用聚合酶链反应限制性长度多态性(PCR-RPLP)方法分析汉族人群中100名健康者和101例PV患者的ApoE基因型,其中,包括Ⅰ型银屑病患者83例,Ⅱ型18例。又按严重程度分为三度(其中轻度31例,中度29例、重度41例)进行探讨。结果在PV组ε3/2基因型和ε2等位基因频率显著高于健康对照组,且ε2等位基因与PV密切关联(RR=2.9096,x2=5.263,P<0.05)。ε3/2基因和ε2等位基因频率还在Ⅰ型银屑病组和中、重度组中分别明显高于Ⅱ型银屑病和轻度组,但无统计学意义。结论:ApoE分子可能在银屑病发病过程中起着重要作用。ε2等位基因可能是PV的-个危险因素,并可能与PV的发病年龄和严重程度有关。PV患者的脂蛋白代谢异常可能是PV病理机制的部分。     

寻常性银屑病皮损及非皮损中IL-23(p19/p40)和IL-12(p35/p40)mRNA的表达

目的检测寻常性银屑病患者皮损及非皮损处IL-23(p19/p40)和IL-12(p35/p40)mRNA表达,探讨其临床意义。方法采用逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)检测寻常性银屑病患者皮损、非皮损处及正常人皮肤中IL-23(p19/p40)和IL-12(p35/p40)mRNA的表达水平。结果寻常性银屑病患者皮损中IL-23p19及p40(IL-23/IL-12)mRNA的表达均高于非皮损组织和正常皮肤组织(P<0.05),且非皮损处高于正常对照组,差异有显著性(P<0.05);IL-12p35mRNA在银屑病皮损处、非皮损处和正常对照中表达水平差异无显著性(P>0.05)。结论在寻常性银屑病发病过程中,IL-23可能发挥较IL-12更重要的作用。     

8-羟鸟嘌呤DNA转葡糖基酶1基因多态性位点rs1052133与汉族人群白癜风的相关性研究

目的 探讨中国汉族人群8-羟鸟嘌呤DNA转葡糖基酶1（OGG1）基因功能性单核苷酸多态性（SNP） rs1052133（C/G）位点与白癜风的相关性。方法 白癜风患者800例和健康对照组800例,采用PCR及限制性片段长度多态性方法（PCR-RFLP）检测OGG1基因rs1052133位点多态性分布,χ2检验和非条件Logistic回归分析评估该位点多态性与白癜风罹患危险的相关性。白癜风患者83例和健康对照组83例,采用8-羟基脱氧鸟苷（8-OHdG） ELISA检测试剂盒检测外周血血清中8-OHdG的水平,采用t检验分析两组之间的差异。结果 白癜风组rs1052133位点CC、CG和GG基因型频率分别为16.8%、54.0%、29.2%,健康对照组为21.4%、52.8%、25.8%,两组间差异有统计学意义（χ2 = 6.26,P < 0.05）。白癜风组rs1052133位点G等位基因携带者显著高于健康对照组（56.2%比52.2%,χ2 = 5.16,P < 0.05）。携带有rs1052133位点CG或GG基因型的个体罹患白癜风的危险性显著增加［CG基因型χ2 = 3.98,P < 0.05,校正OR值 = 1.31 （1.01 ～ 1.70）;CG基因型χ2 = 6.01,P < 0.05,校正OR值 = 1.45 （1.08 ～ 1.94）］,尤其是女性患者、非节段型、病情活动、病程较长、有家族史、无伴发自身免疫性疾病的患者。携带有rs1052133位点CG或GG基因型的白癜风患者外周血血清中8-OHdG的水平显著高于携带CC基因型的患者,8-OHdG水平分别为（838.23 ± 294.11） ?滋g/L和（593.84 ± 190.14） ?滋g/L,两组比较,t = 3.63,P < 0.01。结论 OGG1基因功能性SNP rs1052133位点的多态性与白癜风的发病紧密相关,可能由其修复能力降低所致。 【关键词】 白癜风; 多态性,单核苷酸; OGG1基因; 8-羟基脱氧鸟苷     

A single nucleotide polymorphism rs9468925 of MHC region is associated with clinical features of generalized vitiligo in Chinese Han population

Background Vitiligo has been found to be associated with different HLA antigens in different ethnic groups. In our previous genome‐wide association study (GWAS), we identified independent association signal of rs9468925 (P = 2.21 × 10^?33, OR = 0.74) within HLA‐C‐HLA‐B region. Objectives To explore the association between rs9468925 polymorphism within MHC and the clinical features of generalized vitiligo. Methods The study, using 5566 cases and 6462 controls from previous GWA study investigated the single and combined (GA + GG) genotypic distribution of rs9468925 in subsets of vitiligo patients having different clinical features. We performed a QTL analysis (quantitative trait locus) for age of onset with genotype of rs9468925. Results The GA + GG genotypic distribution of SNP rs9468925 tested with an additive model was found to be significantly different in subgroups of patients of >20 vs. <20 years old (genotypic P = 2.57 × 10^?4, combined P = 3.0 × 10^?3, OR = 0.77, 95% CI: 0.64–0.92), and in patients with different clinical subtypes of vitiligo (genotypic P = 0.03, combined P = 5.0 × 10^?3). However, there was no statistical significance for familial history, halo nevi involvement and autoimmune disease involvement. Conclusions Allele G of rs9468925 on HLA‐C‐HLA‐B may be associated with a higher risk of vitiligo. Our study showed a significant genotypic variation between patients with age of onset ≤20 years and age of onset >20 years. Obvious clinical differences of generalized vitiligo related to genotypic variation found in the Chinese Han population were confirmed in this study.