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中国汉族人群14号染色体上五个STR的遗传多态分析 总被引:3,自引:1,他引:2
目的 分析中国汉族人群14号染色体上5个STR的基因及基因型分布情况。方法 采用PCR扩增技术和聚丙烯酰胺凝胶电泳方法,对50名中国汉族人14号染色体上D14S742,D14S306,D14S606,D14S617和D14S611位点的遗传多态性进行分析。结果 在D14S742位点,共观察到5个等位片段和13种基因型,最常见的等位片段为407bp片段,频率为0.31;D14S306位点,共观察到5 相似文献
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中国人群9号染色体10个STR基因座的遗传多态性及其在法医学中的应用 总被引:20,自引:6,他引:14
目的:了解9号染色体10个STR基因座在中国汉族群体的遗传多态性及其法医学应用价值。方法:无血缘关系的83份个体样本采自甘肃省白银地区汉族群体。18个无关汉族家系共131份血样采自同一地区。PCR扩增9号染色体10个STR基因座。PCR产物由非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳分析。结果:10个STR基因座在中国汉族群体均具有遗传多态性。家系调查结果表明,10个STR基因座在世代传递中遵循孟德尔常染色体共显性遗传规律。结论:为人类群体遗传研究提供了9号染色体10个STR基因座的中国汉族群体数据。 相似文献
3.
北京汉族群体21号染色体上4个STR位点的遗传多态性 总被引:1,自引:0,他引:1
目的研究人类21号染色体上唐氏综合症关键区域内或附近的4个短串联重复序列(D21S1432、D21S2039、D21S1414、D21S1270)在中国汉族人群中的遗传多态性。方法应用Chelex法提取北京地区无血缘关系汉族253份个体血样DNA,聚合酶链式反应(PCR)扩增,非变性聚丙酰胺凝胶电泳或ABI鄄310电泳分型结合测序进行STR分型。结果得到4个STR基因座等位基因频率、各基因座的杂合度、个体识别率、多态信息含量等群体遗传学数据。4个位点基因型分布均符合Hardy鄄Weinberg平衡定律。结论21号染色体上4个STR位点多态性较好,基因型分布符合Hardy鄄Weinberg平衡定律,具有较高的个体识别率,在法医学及唐氏综合征的基因诊断和产前基因诊断研究中具有较高的应用价值。 相似文献
4.
目的研究浙南汉族人群18号染色体上三个STR位点D18S865、D18S1364和D18S535的遗传多态性分布,获得相应的群体遗传学数据.方法应用聚合酶链式反应(PCR)、聚丙烯酰胺凝胶电泳(PAGE)及银染显带技术对浙南地区汉族184名无关个体的D18S865、D18S1364和D18S535位点进行分型.结果D18S865观察到6个等位基因及17种基因型,D18S1364观察到9个等位基因及35种基因型,D18S535观察到8个等位基因及29种基因型,多态性分布都符合Hardy-Weinberg平衡.各基因座的杂合度(H)分别为:0.723、0.848、0.783;多态性信息含量(PIC):0.72、0.81、0.79.结论三个STR基因座具有较高杂合度和多态性信息含量,在遗传学研究和法医学应用中有较高的价值. 相似文献
5.
3号染色体短臂上八个短串联重复序列位点的遗传多态性研究 总被引:1,自引:0,他引:1
目的 研究湖南汉族人群 8个位于染色体 3 p区域的短串联重复序列 (short tandem repeat,STR)位点 :D3 S12 97、D3 S14 89、D3 S12 66、D3 S1568、D3 S12 89、D3 S13 0 0、D3 S12 85和 D3 S3 681基因型及等位片段频率分布。方法 随机抽取 2 2 5名湖南汉族无关个体静脉血 ,抽提 DNA,复合 PCR技术扩增上述位点 ,ABI 3 77全自动测序仪进行基因分型。结果 共检出 91种等位基因 ,基因频率分布在 0 .0 0 2~ 0 .43 1之间 ,构成 3 12种基因型。 8个 STR位点基因型分布均符合 Hardy-Weinberg平衡 (P>0 .0 5) ,杂合度大于0 .72 9,个体识别力大于 0 .72 5,非父排除率大于 0 .596,多态信息含量大于 0 .682。民族比较结果显示 ,湖南汉族与非洲黑人及欧洲白人在大多数位点差异有显著性 (P<0 .0 0 1)。结论 研究结果对人类群体遗传学及法医学研究具有重要应用价值 相似文献
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藏族X染色体10个STR位点的遗传多态性 总被引:9,自引:2,他引:9
目的研究西藏藏族X染色体上的10个短串联重复序列(DXS7423,DXS8378,DXS6799,DXS7424,DXS7130,DXS7132,DXS6789,DXSl01,DXS6804,DXS7133)的基因及基因型频率分布。方法随机抽取101名西藏藏族无关个体静脉血,提取DNA,PCR扩增,变性聚丙烯酰胺凝胶电泳,银染检测结果。结果DXS7423,DXS8378,DXS6799,DXS7424,DXS7130,DXS7132,DXS6789,DXS101,DXS6804,DXS7133分别检出5种、5种、5种、9种、7种、7种、11种、9种、5种和4种等位基因;基因频率分别分布在0.0172~0.5610、0.0179~0.5595、0.0122~0.5614、0.0122—0.4024、0.0172—0.4828、0.0116~0.4035、0.0119~0.2857、0.0119-0.3774、0.0351-0.0.3929、0.0116~0.6786之间,此10个位点女性的基因型频率分布均符合Hardy-Weinberg平衡。结论此10个X染色体STR位点有较高的个体识别率,在个体识别和女孩亲权鉴定中有较高应用价值.对疾病相关研究有重要意义。 相似文献
7.
目的调查DXS6801,DXS6809,DXS7423,DXS7424,DXS9902五个基因座在河北汉族人群中的遗传多态性。方法用PCR和变性聚丙烯酰胺凝胶电泳及DNA序列分析河北汉族114名无关男性及118名无关女性个体DXS6801,DXS6809,DXS7423,DXS7424,DXS9902五个基因座的遗传多态性。结果5个基因座共发现了31个等位基因,男性个体共检出了101种单倍型,男性单倍型多样性为0.9975。论结5个基因座在河北汉族人群中有较高的多态信息含量,有潜在的法医学应用价值。并为X染色体短串联重复序列数据库的建立提供了河北汉族人群的遗传学数据。 相似文献
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成都汉族群体八个STR基因座遗传多态性研究 总被引:36,自引:11,他引:25
目的 了解中国人8个STR基因座等位自然结构特征,获得汉族群体的遗传数据。方法 EDTA抗凝血样采自成都地区无新缘关系汉族个体。Chelex法提取DNA,PCR护增,非变性聚丙烯酰胺凝胶不连续缓冲系统水平电泳分型,自动激光荧光测序仪测定DNA序列。结果 序列分析显示,成都汉族人8个STR基因座中,5个STR基因座具有简单重复序列,3个STR基因座具有复杂重复序列。8个STR基因座在成都汉族群体中均 相似文献
9.
中国汉族人群15个STR基因座遗传多态性研究及法医学应用 总被引:6,自引:0,他引:6
短串联重复序列(STRs)属微卫星DNA序列,重复单位为2-7bp。STR位点在人类基因组含量丰富,估计3~4核苷酸重复STR多态位点约有20万,平均每隔15~20kb就出现一个,是第二代遗传标记,已广泛应用于群体遗传学研究、亲权鉴定、个体识别,国内对Penta D和penta E两个基因座尚鲜见报道。 相似文献
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中国汉族群体五个STR基因座遗传多态性研究 总被引:56,自引:10,他引:46
目的了解中国人5个STR基因座等位片段结构特征,获得汉族群体FGA、D5S818、D7S820、D13S317和D16S539基因座的群体遗传数据。方法EDTA抗凝血样采自成都地区无血缘关系汉族个体。Chelex法提取DNA,PCR扩增,非变性聚丙烯酰胺凝胶不连续缓冲系统水平电泳分型,自动激光荧光测序仪测定DNA序列。结果序列分析显示,中国人D5S818、D7S820、D13S317和D16S539基因座具有简单重复序列,而FGA基因座具有复杂重复序列。5个STR基因座在成都汉族群体中均具有遗传多态性。结论揭示了我国汉族人群5个STR基因座的等位片段结构特征,为人类群体遗传研究提供了数据,建立的不连续缓冲系统水平电泳分型方法为检测这五个STR基因座提供了简便技术。 相似文献
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中国北方人群14个短串联重复序列位点的遗传多态性分析 总被引:1,自引:0,他引:1
目的 分析中国北方汉族人群中染色体7p14—15区域内6个短串联重复序列(short tandem repeat,STR)位点和12q13区域内8个STR位点的遗传多态性。方法 采用荧光标记PCR扩增技术和毛细管电泳方法,对染色体7p14—15区域内D7S1808、D7S2250、D7S2251、D7S683、D7S656、D7S528位点和12q13区域内D12S1056、D12S1293、D12S83、D12S1655、D12S1662、D12S334、D12S137、D12S102位点在100名随机选取的无血缘关系的中国北方汉族人群中的遗传多态性进行分析。结果 在中国北方汉族人群中,染色体7p14-15区域的D7S1808、D7S2250、D7S2251、D7S683、D7S656和D7S528位点分别检测出7、8、7、4、6和5个等位基因,24、27、22、10、17和13种基因型,杂合度分别为86%、88%、83%、79%、85%和80%;染色体12q13区域的D12S1056、D12S1293、D12S83、D12S1655、D12S1662、D12S334、D12S137和D12S102位点分别检测出5、5、8、6、6、6、5和7个等位基因,15、15、29、17、17、19、13和24种基因型,杂合度分别为86%、84%、87%、82%、84%、85%、81%和89%。结论 染色体7p14—15区域的6个STR位点和12q13区域的8个STR位点基因频率分布符合Hardy—Weinberg平衡,并在中国北方汉族人群中呈现较好的遗传多态性。 相似文献
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目的从X染色体上筛选多态性较强的多态位点,为X连锁遗传病的连锁分析和基因定位奠定基础。方法利用BCMSearchLauncher程序从相关基因组序列中筛选短串联重复序列。利用Primer3设计扩增短串联重复序列的引物,采用PCR扩增技术和聚丙烯酰胺凝胶电泳方法,对所筛选出的短串联重复序列进行多态性分析。结果从X染色体相关区域中筛选出8个短串联重复序列,多态性分析表明,其中的5个短串联重复序列具有多态性,χ2检验表明,各位点的基因型分布符合Hardy-Weinberg平衡定律(P>0.05),且具有较高的杂合度。结论从X染色体上筛选出5个多态位点,可用于X染色体基因的连锁分析和基因定位。 相似文献
13.
宁夏回族人群X染色体10个短串联重复序列位点的遗传多态性调查 总被引:7,自引:2,他引:7
目的研究宁夏回族群体X染色体上的10个短串联重复序列(DXS101、DXS6789、DXS6799、DXS6804、DXS7130、DXS7132、DXS7133、DXS7423、HPRTB、DXS8378)的基因及基因型频率分布。方法随机抽取100名宁夏回族无关个体静脉血,提取DNA,PCR扩增,变性聚丙烯酰胺凝胶电泳,银染检测结果。结果DXS101、DXS6789、DXS6799、DXS6804、DXS7130、DXS7132、DXS7133、DXS7423、HPRTB、DXS8378分别检出9、8、4、6、6、6、4、4、5和5种等位基因;分别检出17、22、7、14、14、15、6、7、12和8种基因型;基因频率分别分布在0.0087~0.3130、0.0087~0.2696、0.0348~0.5826、0.0087~0.3044、0.0261~0.4348、0.0261~0.3217、0.0261~0.6783、0.0087~0.4870、0.0261~0.4783、0.0087~0.4870之间;此10个位点女性的基因型频率分布均符合Hardy-Weinberg平衡,多态信息量除DXS7133和DXS7423外均大于0.50;女性个体识别率从0.89(DXS7133,DXS7423)至0.99(DXS101,DXS6789,DXS7132)。结论这10个X染色体短串联重复序列位点有较高的个体识别率,在个体识别和女孩亲权鉴定中有较高应用价值,对疾病相关研究有重要意义。 相似文献
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目的 调查中国牡丹江地区朝鲜族群体CSFIPO,TPOX,TH01,D16S539.D7S820,D13S317,F13A01,FESFPS,vWA 9个短串联重复序列(short tandem repeats,STR)基因座的基因多态性.方法 应用扩增片段长度多态性分型技术,获得等位基因频率分布.结果 X2检验表明9个基因座基因型分布均符合Hardy.Weinberg平衡.总偶合率为5.43595E-09,总个体识别率达0.999999995,三联体累计非父排除率为0.9982,二联体累计非父排除率为0.9711.结论 9个基因座在牡丹江地区朝鲜族群体有较高的非父排除率和个人识别机率,可应用于法医学亲子鉴定和个体识别.中国牡丹江地区和中国延吉地区朝鲜族人群6个基因频率相比较,CSFIPO、TPOX和TP01 3个基因座的基因频率分布差异有统计学意义,D7S820、D17S317和vWA 3个基因座的基因频率分布差异无统计学意义. 相似文献
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Aim: Genetic polymorphisms and the mutation ratio of 19 autosomal short tandem repeat (STR) loci were analysed in 10,000 individuals and 7755 families from Jiangsu Province in Eastern China.Subjects and methods: Nineteen STR loci were amplified by a multiplex amplification system and genotyped on the ABI 3130 Genetic Analyser. Allele frequencies, forensic parameters and mutations for the 19 autosomal STR loci were statistically analysed.Results: In total, 344 genotypes were discovered. No significant deviation from Hardy-Weinberg equilibrium was observed. The combined power of discrimination reached 0.9999999999999999984341, and the combined probability of paternity exclusion was 0.999999989. The pairwise genetic distance and p-values between the Jiangsu and 17 published populations depended on the FST value calculation and are shown by the neighbour-joining evolutionary tree. No statistically significant differences were found, except for the Xinjiang Altay Han (p?=?0.01802) population. The average mutation rate of the Jiangsu population across all 19 loci was 1.4?×?10?3. The average mutation rate of the 13 core CODIS STR loci remained below 2?×?10?3 and there was no difference and relatively high consistency (p?<?0.001) by correlation coefficient analysis among the six groups.Conclusions: Allelic genetic polymorphisms and mutation data were obtained from a large number of samples, which indicated that the amplification kit is suitable for forensic application and that the Jiangsu population has its own genetic characteristics that are different from those of other ethnic populations. 相似文献
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目的调查DXS6800、DXS6797、GATA172D05、DXS9864个基因座在河北汉族人群中的遗传多态性。方法无关个体样本基因组DNA的提取采用酚-氯仿法,家系和腐败降解检材基因组DNA的提取采用Chelex-100法。用PCR和变性聚丙烯酰胺凝胶电泳及DNA序列分析河北汉族150名无关男性及150名无关女性个体DXS6800、DXS6797、GATA172D05、DXS9864个基因座的遗传多态性。结果4个基因座共检测到25个等位基因,男性个体共检出138种单倍型,男性单倍型多样性为0.9986。结论DXS6800、DXS6797、GATA172D05、DXS9864个基因座的多态性数据为X染色体短串联重复序列数据库的建立提供了河北汉族人群的群体遗传学资料。 相似文献
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目的研究陕西西安汉族人群6个位于X染色体上的短串联重复序列:DXS7130、DXS1214、DXS6799、DXS6804、DXS7424和DXS7133等位基因及基因型频率分布。方法随机抽取陕西西安汉族118名女性和90名男性无关个体静脉血,提取DNA,PCR扩增,变性聚丙烯酰胺凝胶电泳,银染检测结果。结果在6个基因座中,DXS7130、DXS6799、DXS6804、DXS7424和DXS7133分别检出9个、6个、6个、7个和7个等位基因;SY别检出21、14、15、17和12种基因型;基因频率分别分布在0.0112~0.4101、0.0160~0.4840、0.0050~0.3713、0.0053—0.3632和0.0059~0.5235之间,DXS1214检出8个等位基因,基因频率分布在0.0104~0.3161之间;此6个位点女性的基因型频率分布均符合Hardy—Weinberg平衡。结论此6个X染色体短串联重复序列位点有较高的个体识别率,在个体识别和女孩的亲权鉴定中有应用价值,对疾病相关研究有实际意义。 相似文献
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为了解中国汉族人短串联重复序列(STR)位点的遗传多态性分布,选取了8个STR位点:vWA31A、THOI、TPOX、F13AO1、FES、D5S818、D7S820和D13S317,采用Chelex法从102名无血缘关系的汉族个体血液中提取DNA,应用STR—聚合酶链反应(polymerase chain reaction,PCR)扩增,变性聚丙烯酰胺凝胶电泳分离,银染法显影技术,对汉族人群上述8个位点进行遗传多态性调查。结果:8个STR位点基因型观察数12—21个,等位片段数6—8个,多态信息含量介于0.5520—0.7855之间,个人识别概率介于0.7905—0.9318之间,其中6个SIR位点在中国汉族人群中的等位基因频率分布与白色人种、黑色人种之间均具有显著差异。结果表明:8个观位点的基因型分布均符合Hady—Weinbrg平衡,所得到的基因频率等结果为人类群体遗传研究提供了数据。 相似文献