XRCC5基因多态性与肺癌遗传易感性的相关性

目的 探讨XRCC5 C74468A和G74582A单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,SNPs)与中国河北人群肺癌遗传易感性的关系,及其对肺癌TNM分期及淋巴结转移的影响.方法 应用引物引入限制性内切酶分析-聚合酶链反应(primer-introduced restriction analysis-polymerase chain reaction,PIRA-PCR)和聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(polymerase chain reaction-restriction fragment length polymorphism,PCR-RFLP)方法 检测352例肺癌患者和404例健康对照者XRCC5 C74468A和G74582A的基因型,并以非条件Logistic回归模型分析基因多态性与肺癌发病风险的关系,及其对肺癌TNM分期和淋巴结转移的影响.单体型分析采用EH软件.结果 吸烟可显著增加中国河北人群肺癌的发病风险,经性别、年龄校正后的相对风险度的比值(odds ratio,OR)为3.44[95%可信区间(confidence interval,CI)=2.37～4.98].XRCC5基因C74468A和G74582A 多态等位基因和基因型分布在肺癌组与健康对照组间差异无统计学意义(P>0.05);XRCC5 C74468A多态基因型分布在Ⅱ期肺癌患者组与健康对照组间差异有统计学意义(χ2=9.831,P<0.01).与C/C基因型相比,携带A等位基因(A/C+A/A基因型)可显著降低Ⅱ期肺癌的发病风险,经性别、年龄和吸烟校正后的OR值为0.46(95% CI=0.28～0.77).两个多态位点联合分析显示,单体型分布在肺癌组与健康对照组间差异无统计学意义(P>0.05).结论 XRCC5 G74582A多态可能与中国河北人群肺癌的发病风险无关.而XRCC5、C74468A多态A等位基因(A/C+A/A)可能降低河北人群Ⅱ期肺癌的发病风险.     

PSCA基因rs2294008多态性与胃癌的关系

目的了解前列腺干细胞抗原(PSCA)基因rs2294008位点多态性与胃癌的关系。方法收集196例汉族胃癌病人与246例无胃部疾病体检者的外周血样本,提取基因组DNA,采用DNA直接测序法进行PSCA基因rs2294008位点分型。结果胃癌组PSCA基因rs2294008位点3种基因型CC、CT、TT频率分别为43.40%、47.40%和9.20%,对照组分别为53.70%、39.00%和7.30%。与CC型比较,携带CT和TT型基因型者胃癌发生的危险性增加,OR值分别为1.50(95%CI 1.01~2.23)和1.55(95%CI 0.77~3.15)。结论汉族人群PSCA基因rs2294008位点为CT和TT基因型者胃癌发病风险增加。     

Fat-1基因多态性与脊柱结核易感关联性研究

目的　寻找和分析与脊柱结核易感性相关的新的候选基因。方法　收集2013年6月—2015年12月杭州市红十字会医院收治的脊柱结核患者193例为病例组,同时选取同时期本院体检健康者207例为对照组,采用全基因组外显子技术捕获6例脊柱结核患者外显子区DNA后,进行高通量测序,并结合现代生物信息学方法进行分析,结果初步筛选到Fat-1基因多态性（rs1280098,c.8798A>C,p.Q2933P）与脊柱结核的发生相关;随后,采用Sanger测序法对对照组和病例组患者做上述突变位点的验证。检测Fat-1基因型分布,采用实时荧光反转录聚合酶链式反应（RT-qPCR）法检测Fat-1基因相对表达水平,酶联免疫吸附试验（ELISA）法检测血清白介素（IL）-12和γ-干扰素（IFN-γ）含量,同时检测生化指标。结果　病例组AA基因型129例（66.8%）、AC基因型33例（17.1%）、CC基因型31例（16.1%）;对照组分别为157例（75.8%）、35例（16.9%）、15例（7.3%）。两组Fat-1基因型分布比较,差异有统计学意义（χ2=7.885,P=0.019）。不同遗传模型的Logistic回归分析结果显示：在相加模型中,CC纯合突变基因型与脊柱结核是否发病相关,AC杂合突变基因型与脊柱结核是否发病不相关（P>0.05）;在显性模型中,AC+CC突变基因型与脊柱结核是否发病相关（P<0.05）;在隐性模型中,CC纯合突变基因型与脊柱结核是否发病相关（P<0.05）;且该多态性位点最小等位基因C与脊柱结核是否发病相关（P<0.05）。病例组患者外周血Fat-1基因相对表达水平低于对照组,血清IL-12和IFN-γ含量高于对照组,脂蛋白A、C反应蛋白、红细胞沉降率和嗜酸粒细胞计数高于对照组,清蛋白水平低于对照组（P<0.05）。结论　Fat-1基因rs1280098位点多态性与脊柱结核的发病相关。此外,Fat-1基因该位点的突变导致Fat-1基因转录水平下调,以及血清炎性因子IL-12和IFN-γ水平上调,并最终导致脊柱结核易感性增加。这些检测结果为脊柱结核的早期诊断提供了分子依据。     

GPx4基因rs4807542位点多态性与子痫前期遗传易感性的关系

目的探讨谷胱甘肽过氧化物酶4(GPx4)基因rs4807542位点单核苷酸多态性与子痫前期遗传易感性的关系。方法以山东地区1 007例确诊的子痫前期病人为病例组,1 392例正常分娩的孕妇为对照组,采用TaqMan探针实时荧光PCR技术扩增两组外周血DNA,对GPx4基因的rs4807542位点进行基因分型和等位基因频率分析。结果病例组和对照组GPx4基因rs4807542位点的基因型分布和等位基因频率差异无统计学意义(P>0.05)。轻度及重度子痫前期组与对照组比较,早发型及晚发型子痫前期组与对照组比较,该位点的基因型分布和等位基因频率差异均无显著性(P>0.05)。结论 GPx4基因rs4807542位点的单核苷酸多态性与子痫前期遗传易感性无相关性。     

DNA测序研究胃癌易感性相关基因多态性与CAG的关系

目的研究多种胃癌易感性相关细胞因子基因单核苷酸多态性（single nucleotide polymorphisms,SNPs）在慢性萎缩性胃炎（chronic atrophy gastritis,CAG）患者中的分布特征及两者的相关性。方法根据文献最新报道,选择胃癌易感性相关基因SNP位点：IL1-1B-311/-511、IFN-γ＋874、IL-8-251、IL-10-1082/-819/-592、TNF-α-308/-857、MIF-173等6个基因上10个SNP位点。采用PCR扩增基因组DNA,直接测序法对30例CAG及30例健康对照的各SNP进行分析。结果IL-10-592位点三种基因型在CAG和健康对照组间的分布差异有统计学意义,χ^2=6.83,P=0.03。其余9个SNP基因型、所有等位基因型在CAG和健康对照组间的分布差别均无统计学意义。结论CAG患者中携有多个胃癌易感性相关细胞因子基因SNP,但除IL-10-592CC基因型可能与CAG相关,其余SNP与CAG未见相关性。     

hOGG1 ser326cys基因多态性与宫颈癌遗传易感性的关系

目的探讨广东汉族妇女hOGG1 ser326cys基因多态性与宫颈癌关系,为宫颈癌的预防和治疗提供新的思路。方法利用聚合酶链式反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)分析技术,对86例宫颈癌患者和102名健康对照的hOGG1 ser326cys多态位点进行分型,采用非条件逻辑回归分析统计该多态位点与宫颈癌易感的相关性。结果ser/ser(CC)、ser/cys(CG)、cys/cys(GG)基因型在病例组中的频率分别为19.8%、52.3%和27.9%,在对照组中分别是23.5%、44.1%和32.4%,两组间基因型频率分布差异无统计学意义(2=1.26,P=0.532);携带hOGG1cys(G)变异等位基因与宫颈癌危险性无明显相关(OR=0.94,95%CI0.63～1.41,P=0.767)。结论hOGG1基因ser326cys多态位点与广东汉族妇女宫颈癌易感无相关性。     

TIM-3基因启动子区多态性与胃癌易感的相关性研究

目的探讨中国汉族人群中肿瘤免疫调节基因TIM-3启动子区单核苷酸多态性与胃癌的遗传易感性关联。方法提取190例胃癌患者及216例健康人群外周血基因组DNA,用PCR-RFLP方法检测2组人群中TIM-3基因启动子区-574G/T、-882C/T、-1516G/T3个多态性位点的基因型;各多态位点的基因型与胃癌风险之间的相关性以OR值(odds ratio)及其95%CI(confidence intervals)表示;OR值及其95%CI以非条件Logistic回归模型分析,均经各混杂因素校正后取得;所有的统计检验均为双侧概率检验,统计学分析使用SPSS11.5软件。结果 PCR-RFLP检测结果显示,TIM-3启动子区的3个多态性位点在检测人群中均存在,但3个位点的多态纯合形式在研究人群中几乎没有出现。190例胃癌患者与216例健康对照人群中3个多态性位点的基因率差异均有统计学意义(P<0.05)。经混杂因素的校正后,Logistic回归分析结果显示3个位点的基因型差异均有统计学意义,-574G/T位点:OR=3.92(95%CI:1.40-10.94);-882C/T位点:OR=3.20(95%CI:1.22-8.41);-1516G/T位点:OR=2.32(95%CI:1.23-4.40),P值均<0.05。结论 TIM-3启动子区的基因多态性对于胃癌的发生有着显著的易感关联,虽然该3个位点的多态性纯合基因型存在形式极低,但结果依然提示对于胃癌的发生,TIM-3启动子区的多态性仍是一个重要的易感危险因素。     

hEXO1A238G基因多态性与宫颈癌的易感相关性研究

目的 探讨hEXO1基因多态性与广东汉族妇女宫颈癌易感的相关性.方法 采用分子流行病学研究方法,收集123例经病理学确诊为宫颈癌的新发患者为病例组,274例年龄相匹配的健康妇女作为对照组;采用聚合酶链式反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)分析技术,对hEXO1基因A238G多态位点进行分型,采用非条件logistic回归分析统计该多态位点与宫颈癌易感的相关性.结果 病例组与对照组间基因型频率分布差异无统计学意义(2=0.318,P=0.85);以GG基因型作为参照,AG、AA基因型均没有显著增加个体患宫颈癌的风险(OR分别为0.80和0.79,95% CI分别为0.342～1.873和0.347～1.802).结论 hEXO1基因A238G多态性与广东汉族妇女宫颈癌易感性无关.     

侵袭性牙周炎易感基因遗传多态性分析

侵袭性牙周炎（aggressiveperiodontitis,AgP）是一类有家族聚集性、进展迅速、不同于慢性牙周炎的牙周组织破坏性疾病,根据病变累及范围可分为局限型（10calizedAgP,LAgP）和广泛型AgP（generalizedAgP,GAgP）,包括了青春前期牙周炎、青少年牙周炎,快速进展性牙周炎。     

躁声性听力损失遗传易感基因多态性研究进展

噪声是一种普遍存在于作业场所的有害因素,噪声性听力损失（NIHL）是危害相关作业人员身体健康的主要职业性疾病之一,随着社会工业化的进程,不断增长的噪声作业,NIHI。发生率呈现上升趋势,是职业病防治的研究重点方向。NIHL是由遗传和环境因素相互作用的结果,既往对NIHL的研究多集中在环境危险因素方面,而在遗传因素知之甚少,近来研究表明,NIHL的发生风险存在个体易感性,而这种差异与一些敏感基因单核苷酸多态性有关。     

MMP-1中单核苷酸多态性与贵州汉族人的非小细胞肺癌易感性

目的:研究基质金属蛋白酶1(metal matrix proteinase-1,MMP-1)启动子区-1607 bp处1G或2G单核苷酸多态性(single nucleotide epolymorphism,SNP)与贵州汉族人非小细胞肺癌(non-small cell lung carcinoma,NSCLC)遗传易感性的关系.方法:采用聚合酶链反应 - 限制性片段长度多态性(polymerase chain reaction-restriction fragment length polymorphism,PCR-RFLP)方法分析71名NSCLC患者和75名健康对照者的MMP-1启动子区SNP的基因型,比较不同基因型与NSCLC发生风险的关系.结果:2G/2G基因型在NSCLC组中分布频率高于健康对照组.2G/2G基因型较1G/1G及2G/2G 1G/2G基因型患NSCLC风险率增加,OR(95%CI)值分别为3.082(1.620～5.862),2.517(1.283～4.936),吸烟可增加2G/2G基因型患NSCLC风险率.结论:贵州汉族人群MMP-1启动子区SNP(1G/2G)基因型与NSCLC易感性有关,2G/2G基因型的NSCLC发生风险增加.     

APEX1单核苷酸多态性与肝癌易感性关系的研究

目的 探讨中国福建人群APEX1单核苷酸多态性(SNP)与肝细胞癌(HCC)易感性的关系. 方法 应用连接酶检测反应(LDR)及直接测序法检测APEX1 rs2307486、rs1130409及rs33956927 3个SNP位点,并进行连锁不平衡及单倍型分析,探讨3个SNP在福建HCC人群中的分布情况,并分析其与该人群HCC易感性的关系. 结果 相对于GG基因型,rs33956927位点的GA基因型增加了患HCC的风险(P=0.002),而rs2307486和rs1130409多态性与HCC易感性无关(P＞0.05). 结论 APEX1 rs33956927多态位点携带GA基因型人群可能对HCC更易感,APEX1 rs33956927多态性可作为筛查HCC好发的危险因素;rs2307486和rs1130409多态性与HCC的发生无关.     

中国上海及其周边省份汉族人群XRCC3基因Thr241Met多态与脑胶质瘤遗传易感性关联研究

目的:分析上海及其周边省份汉族人群中脑胶质瘤患者X线交叉互补修复基因3(X-ray repair cross-complementing group 3,XRCC3)Thr241Met单核苷酸多态性(single-nucleotide polymorphism,SNP),探讨其与脑胶质瘤遗传易感性的相关性.方法:应用TaqMan技术检测我国上海及其周边省份(江苏、浙江、安徽等)汉族人群中771例脑胶质瘤患者(病例组)和752例非肿瘤对照受试者(对照组)XRCC3基因Thr241Met多态性;应用统计学方法对TaqMan技术成功检测分型结果进行处理,分析该位点多态性与脑胶质瘤遗传易感性的相关性.结果:1 468例受试者(病例组760例,对照组708例)应用TaqMan技术成功进行了目标基因检测及分型,基因分型成功率为96.4%.统计学分析发现:对照组C和T等位基因频率以及TC、TT基因型频率与病例组无显著差异.经年龄和性别因素校正,TC基因型(P=0.909;OR=0.981;95%CI=0.701～1.371)或TT基因型(P=0.642; OR=0.7; 95%CI=0.156～3.146)与CC基因型相比并不增加脑胶质瘤的发生风险.结论:我国上海及其周边省份汉族人群XRCC3基因Thr241Met的变异基因型TC和TT可能不是脑胶质瘤的遗传高危因素.     

增殖细胞核抗原及nm23在胃癌中的表达及意义

目的 :探讨增殖细胞核抗原 (PCNA)及nm2 3基因在胃癌中的表达及其与生物学行为的关系。方法 :应用免疫组化SP法研究 85例胃癌手术标本中PCNA及nm2 3基因的表达。结果 :在 85例胃癌中PCNA、nm2 3的总阳性表达率分别为 5 2 9% (4 4 / 85例 )和 4 4 .7% (38/ 85例 ) ,PCNA及nm2 3在胃癌中的表达与其淋巴结转移、浸润深度、分化程度有关 (P <0 0 5 ,P <0 0 1 ) ;PCNA与分化程度无关 ,P >0 0 5。结论 :PCNA及nm2 3参与了胃癌的发生、发展、浸润及转移     

miRNA基因单核苷酸多态性与非小细胞肺癌易感性的关联研究

目的 探讨微小RNA(microRNA,miRNA)基因单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)与非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)发生风险的关系.方法 通过生物信息学方法筛选出13个位于miRNA基因序列上的潜在功能性的SNPs位点.采用病例-对照研究设计,纳入新发NSCLC患者626例,对照为736例同期门诊体检人群.提取研究对象外周血细胞基因组DNA,采用SNPscanTM对筛选的13个SNPs位点进行基因分型,多因素Logistic回归分析SNPs与肺癌发生风险的关联性和关联强度.结果 发现3个SNPs,即rs62085660(位于miRNA AC145343.1)、rs11597888(位于miRNA AL391839.1)和rs16867808(位于miRNA AL021918.2)与NSCLC发生风险显著相关,但此种关联只限于特定的亚组人群.rs62085660 (C/G)位点与肺鳞癌的发生风险相关(加性模型,校正OR =0.79,95％CI=0.62 ～ 1.00,P=0.049;显性模型,校正OR=0.72,95％ CI =0.53 ～0.98,P=0.035).rs11597888(G/A)和rs16867808 (T/C)位点只在吸烟人群中与肺癌易感性相关(rs11597888:显性模型,校正OR=1.42,95％CI=1.03 ～ 1.96,P=0.033;rs16867808:加性模型,校正OR =0.58,95％ CI=0.40 ～0.84,P=0.004,显性模型,校正OR =0.53,95％ CI =0.35～0.81,P=0.004).结论 rs62085660位点与肺鳞癌发生风险相关,rs11597888位点和rs16867808位点与吸烟相关性肺癌发生风险相关.     

IGF2R基因多态性与结直肠癌和肝癌遗传易感性的相关性研究

目的:探讨IGF2R基因第2020密码子多态(Asn2020Ser)与结直肠癌(CRC)和肝细胞癌(HCC)遗传易感性的关系.方法:采用TaqMan方法检测345例CRC与670名对照以及469例HCC与558名对照的IGF2R Asn2020Ser基因型分布及差异.结果:IGF2R Asn2020Ser基因型分布在CRC-对照和HCC-对照人群间均有显著性差异(P<0.05).与Asn/Asn基因型相比,Asn/Ser、Ser/Ser和Ser携带者(Asn/Ser和Ser/Ser基因型)的CRC风险分别显著降至0.71倍(95%CI=0.54～0.94,P=0.017)、0.64倍(95%CI=0.42～0.97,P=0.036)和0.69倍(95%CI=0.53～0.90,P=0.008).类似的,Asn/Ser、Ser/Ser和Ser携带者的HCC风险分别降至0.68倍(95%CI=0.52～0.89,P=0.005)、0.78倍(95%CI=0.52～1.16,P=0.212)和0.70倍(95%CI=0.54～0.90,P=0.006).结论:IGF2R 2020Ser携带可能对中国人群罹患CRC和HCC具有保护作用.     

细胞色素P4501A1基因多态与肾癌遗传易感性的关系

目的:探讨细胞色素P4501A1(CYP1A1)酶的基因多态与肾癌易感性的关系.方法:采用病例对照设计,以175名肾癌患者为病例组,200名未患任何肿瘤的健康人为对照组.应用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)技术,检测CYP1A1基因A4889G(M2)、C4887A(M4)的多态性.结果:病例组M2、M4各基因型分布与对照组相比无统计学差异.携带M2/M2基因型者与肾癌的发生呈正相关(OR=2.225,95%CI:1.134～4.365,P=0.020).结论:CYP1A1基因M2/M2基因型可能是肾癌的遗传危险因素.     

IL-10-1082位点单核苷酸多态性与我国胃癌的关系

目的 研究白细胞介素10(ID-10)基因-1082位点单核苷酸多态性在我国胃癌高发区和低发区普通人群和胃癌患者中的分布,并探讨该位点基因多态性与我国胃癌的关系.方法 用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)检测年龄和性别匹配的广东省104例普通人群及104例胃癌患者和陕西省普通人群和胃癌患者各102例的IL-10-1082位点单核苷酸多态性.采用ELISA检测血清幽门螺杆菌(Hp)IgG.结果 IL-10-1082位点A/A、A/G、G/G三种基因型在本研究人群中的分布频率为86.7%、10.7%和2.4%.在胃癌低发区,胃癌患者携带IL-10-1082 G·的频率明显高于普通人群(14.4% vs 7.7%,X2=4.02,P＜0.05,OR=1.01,95%CI=1.08～3.10),IL-10.1082 G*基因型增加Hp感染后胃癌发生的危险性(X2=5.36,P＜0.05,OR=6.0,95% CI=1.23～17.52);在胃癌高发区,胃癌患者IL-10-1082 G·基因型频率与对照组无明显差异(12.7% vs 16.6%,P＞0.05).两地区胃癌人群ID-10-1082 G·基因型频率无显著差异(12.7% vs 14.4%,X2=0.13,P＞0.05);两地区普通人群中,高发区IL-10-1082 G·基因型频率明显高于低发区(16.6% vs 7.7%,X2=4.27,P＜0.05,OR=1.29,95% CI=I.12～6.11).结论 IL-10.1082 G等位基因增加Hp感染后胃癌发生的危险性,IL-10-1082位点单核苷酸多态性可能与我国汉族人群胃癌发生有关.     

中国人群MEGSIN基因单核苷酸多态性的检测

【目的】研究中国人群MEGSIN基因多态性及其分布特征，并与国外数据库进行比较。【方法】随机选取208例广东地区汉族个体，提取基因组DNA。对包含外显子、外显子-内含子交界区及5’UTR区、3’UTR区的PCR产物进行直接测序。综合正反向结果识别和鉴定基因内SNPs。所得结果在美国国立生物技术信息中心（NCBI）的SNP数据库（dbSNP）中进行查询和比较。【结果】在所有研究对象中共发现24个SNPs，主要位于非编码区；22个为替换型SNP，1个为插入型SNT，另一个为缺失型SNP；其中有6个SNPs在数据库中未报道，有4个数据库已报道的SNPs，在本次研究未能证实在中国人群中存在多态性。【结论】中国汉族人群MEGSIN基因的多态性分布与美国数据库中基于高加索人群的资料存在差异。本研究不仅有利于了解MEGSIN基因结构，且为在中国人群中研究MEGSIN基因相关疾病并最终找到致病位点提供可靠数据。