TSHR基因内含子1多态性与山东潍坊地区汉族人群Graves'眼病关系分析

目的 探讨山东潍坊地区汉族人群促甲状腺激素受体(TSHR)基因内含子1区的核苷酸多态性位点(SNP)rs179247多态性与Graves'眼病(GO)的关系.方法 收集2010年1月～2020年8月确诊的Graves'病(GD)患者278例,依据是否合并GO分为GO组与NGO组,收集患者相关临床数据(如发病年龄、甲状腺...     

CNTNAP2基因与汉族儿童孤独症的病例对照研究

目的：探讨CNTNAP2基因的3个单核苷酸多态性（SNPs）位点rs10244837、rs7794745、rs10500171与汉族儿童孤独症之间的相关性。方法：应用聚合酶链式反应-限制性片段长度多态性（PCR-RFLP）方法对汉族儿童孤独症患者及对照的rs10244837、rs7794745、rs10500171位点进行的基因分型,对所获分型数据进行病例对照关联分析。结果：孤独症病例和对照的CNTNAP2基因的3个SNPs的基因型频率分布均未偏离哈德温伯格平衡（P>0.05）;CNTNAP2基因的rs10244837、rs7794745、rs10500171位点的基因型频率和单体型频率在病例与对照间比较差异无统计学意义（P>0.05）。结论：CNTNAP2基因的rs10244837、rs7794745、rs10500171位点的单核苷酸多态性及其单体型与儿童孤独症不相关。     

IL-23受体基因多态性和Graves病的相关性研究

目的：探讨白介素23受体（IL-23R）基因rs10889677位点多态性与Graves病（简称GD）的关系。方法：从268例上海本地汉族GD患者（其中136例GD眼病患者）和208例正常对照者外周血标本中提取基因组DNA,用聚合酶链式反应-限制性片段长度多态（PCR-RFLP）技术检测IL-23R基因rs10889677位点变异情况,分析其基因表型、基因频率与GD及其相关眼病的关系。结果：IL-23R基因rs10889677位点基因型和等位基因频率在GD组和对照组中分布差异无显著性（P〉0.05）,且该位点多态性和GD发病年龄及性别均无相关。结论：IL-23R基因rs10889677位点多态性变异,可能不是中国南方汉族人群GD发病的危险因素。     

延边地区朝鲜族和汉族过氧化物酶体增殖物激活受体γ~2基因单核苷酸多态性与2型糖尿病的相关性

[目的]探讨延边地区朝鲜族和汉族过氧化物酶体增殖物激活受体γ2(PPAR-γ2)基因单核苷酸多态性(SNPs)与2型糖尿病(T2DM)的相关性.[方法]选择T2DM患者242人(朝鲜族93人,汉族149人)作为病例组,健康成人211人(朝鲜族103人,汉族108人)作为对照组进行病例对照研究.应用PCR-SSCP和直接序列测定方法对PPAR-γ2基因rs1801282和rs3856806位点基因型进行鉴定.[结果]病例组汉族(19.9%)PPAR-γ2基因rs3856806位点T等位基因频率显著高于朝鲜族(15.0%,P<0.05),病例组和对照组PPAR-γ2基因rs1801282和rs3856806基因型及等位基因频率分布间差异无统计学意义(P>0.05).病例组和对照组rs1801282位点多态性与临床表型间均无显著相关性(P>0.05).病例组汉族rs3856806位点多态性与腰围、高密度脂蛋白胆固醇间有显著相关性(P<0.05).单倍型Pro-T是T2DM的危险因素(P=0.048,OR=1.699,95%CI:1.000~2.888).[结论]rs1801282和rs3856806可能是延边地区朝鲜族T2DM的易感位点,两位点的Pro-T单倍型可能是T2DM的易感因素;rs1801282和rs3856806位点多态性存在民族差异.     

类固醇受体辅激活因子1基因多态性与2型糖尿病的关联性分析

目的：探讨中国北方汉族人群类固醇受体辅激活因子1（SRC-1）3个标签单核苷酸多态性(SNPs)(TagSNPs)位点基因多态性与2
型糖尿病（T2DM）的关系,阐明SRC-1基因是否为T2DM的易感基因。方法：选择190例T2DM患者（病例组）和193例正常对照者（对照组）,应用PCR和基质辅助
激光解吸附电离飞行时间质谱分析技术（MALI-TOF-MS）检测2组研究对象SRC-1基因上的rs3731628、rs4578807和rs11677500位点的基因型和等位基因频数分布;应用单倍型法分析3个位点形成的多位点的联合作用与T2DM的关系。结果：SRC-1基因的rs3731628和rs11677500位点在病例组和对照组中的基因型频数分布
符合Hardy-Weinberg 平衡定律（P>0.05）,rs4578807位点基因型在病例组与对照组中的频数分布不符合Hardy-Weinberg平衡定律（P<0.05）。病例组和对照组SRC-1基因的rs3731628、rs4578807和rs11677500位点的基因型和等位基因频数分布差异均无统计学意义（P>0.05）,SRC-1基因上的3个位点组成的rs11677500-rs4578807、rs4578807-rs3731628和rs11677500-rs4578807-rs3731628 3个单倍体型系统在病例组和对照组中的分布差异均无统计学意
义（P>0.05）。结论：在中国北方汉族人群中SRC-1基因的rs3731628和rs11677500位点的SNPs可能与T2DM
的发生无关联,SRC-1基因可能不是T2DM的易感基因。     

ACE基因单核苷酸多态性与冠心病易感性的关联性分析

目的: 探讨中国北方汉族人群血管紧张素转化酶(ACE)基因单核苷酸多态性(SNPs)与冠心病遗传易感性的关系,阐明ACE基因是否为冠心病的易感基因。方法: 采用病例对照的研究方法,选择246例冠状动脉造影证实的冠心病患者为病例组;以同期进行健康体检的正常人为对照组,共251名。利用聚合酶链式反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)方法,检测ACE基因上rs4267385和rs4316位点的多态性。采用 SPSS17.0 软件进行统计学处理,分析ACE基因多态性与冠心病的关联性。结果: 病例组和对照组人群的2个SNPs(rs4267385和rs4316)位点基因型频数分布均符合Hardy-Weinberg平衡定律(P>0.05);病例组和对照组rs4267385位点等位基因和基因型频数分布比较差异有统计学意义(P<0.05),rs4316位点等位基因和基因型频数分布差异无统计学意义(P>0.05)。结论: ACE基因可能是中国北方汉族人群冠心病的易感基因。     

中国汉族儿童TIRAP基因单核苷酸多态性分析未显示其与结核病的易感相关

目的 探讨中国汉族儿童TIRAP基因Tag SNP位点的多态性与结核病易感性相关关系,以明确TIRAP基因在儿童结核病发病中的作用。方法 本课题组收集339名汉族儿童结核病患者,以同期查体的392名儿童作为对照,采用病例对照研究,应用高通量MassARRAY技术对于TIRAP基因的SNP位点进行基因分型研究。使用的是改进的盐析法进行基因组DNA的提取。结果 TIRAP基因的5个Tag SNPs(rs563011、rs8177400、rs1786704、rs8177375、rs8177352),除了1个SNP位点(rs563011)等位基因检出率<95%及1个(rs8177400)AA基因型在人群中的分布为0,另外3个SNPs位点(rs1786704、rs8177375、rs8177352)的等位基因、基因型以及单体型在结核病组和对照组的分布差异均无统计学意义(P>0.05)。结论 TIRAP基因多态性与中国汉族儿童结核病易感不存在相关性。     

DNMT3b基因多态性及其在胃癌组织中的表达水平与胃癌的关联性分析

目的:探讨中国北方汉族人群DNA甲基转移酶3b(DNMT3b)基因单核苷酸多态性(SNPs)和胃癌发病风险之间的关联性,阐明DNMT3b基因是否为胃癌的易感基因。方法:选择447例胃癌患者作为病例组,961名健康对照者作为对照组,采用TaqMan技术检测2组研究对象DNMT3b基因的rs1569686、rs6119954、rs4911107、rs4911259和rs8118663位点的基因型分布。免疫组织化学技术检测病例组(104例)胃癌患者胃癌组织和85例患者的癌旁对照组织中DNMT3b蛋白的表达水平。结果:在病例组和对照组研究对象中5个SNPs位点基因型分布频率相近,未发现5个SNPs位点的多态性与胃癌的发生有关联(P>0.05)。与癌旁组织比较,胃癌组织中DNMT3b蛋白的表达水平升高(P<0.05)。5个SNPs的不同基因型与胃癌组织中DNMT3b蛋白的表达水平均无关联(P>0.05)。结论:中国北方汉族人群中DNMT3b基因多态性与胃癌的发生无关联,DNMT3b基因可能不是胃癌的易感基因。     

Shank3基因多态性与汉族儿童孤独症的关联研究

目的 研究Shank3基因的单核苷酸多态性（SNPs）与汉族儿童孤独症的相关性。 方法 采用Illumina CNV 370-Duo芯片对280个汉族人群孤独症核心家系的Shank3基因单核苷酸多态性位点rs9616816、rs736334、rs2040487、rs6009951、rs715586、rs8137951进行基因分型检测,对基因分型数据采用haploview4.1软件进行连锁不平衡检测和家系为基础的关联分析（FBAT）。 结果 家系为基础的关联分析结果显示Shank3基因的rs715586、rs6009951位点的等位基因和rs715586-rs8137951的G-A,A-G单体型在孤独症中的传递差异具有统计学意义（P＜0.05）,但经1000次模拟的置换检验后不再具有统计学意义（P＞0.05）。 结论 Shank3基因可能不是汉族儿童孤独症的致病基因,至少不是其致病的主效基因。     

雌激素受体α基因多态性与子宫肌瘤的关联性分析

目的：探讨雌激素受体α基因多态性与中国北方汉族人群子宫肌瘤的关系。方法：采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性（PCR-RFLP）方法,检测167例子宫肌瘤患者和170例健康女性的雌激素受体α基因rs722209和rs9322346 SNPs位点的基因型,应用SPSS 12.0分析基因多态性与子宫肌瘤的关联性。结果：病例组与对照组人群2个SNPs的基因型分布均符合Hardy-Weinberg平衡定律;病例组rs722209和rs9322346的等位基因及基因型的频数分布与对照组比较差异均无显著性(P>0.05)。结论：雌激素受体α基因rs722209和rs9322346基因多态性可能与中国北方汉族人群子宫肌瘤发病无关。     

慢白激酶Cζ亚型基因及Urotensin Ⅱ基因中各有一个单核苷酸位点与中国北方汉族人群2型糖尿病相关

目的 采用单核苷酸多态性（single mucleotide polymorphism,SNP)标记,在以往中国北方汉族人群2型糖尿病相关基因定位区域（1p36.33-p36.23)内寻找疾病易感基因位点。方法 通过生物信息学方法在公共SNP数据库中查找定位区域内10个候选基因中的23个SNP位点,用单碱基延伸反应（single base extension,SBE)法对北方汉族人群散发2型糖尿病患者（192例）及对照组（172例）进行分型及病例－对照关联分析。结果 23个SNP位点中有8个为中国北方人群常见SNP位点;对病例组和对照组分型分析显示,位于蛋白激酶Cζ亚型（PRKCZ）基因中的一个位点（rs436045)及urotensin Ⅱ（UTS2）基因中的一个位点（rs228648),其等位基因频率在两组的差异具有统计学意义9P＜0．05）。结论 上述两个SNP位点可能和中国北方汉族人群2型糖尿病相关,以上结果为进一步研究上述两个位点所在的基因与2型糖尿病的关系提供了理论依据。     

抑癌基因PTEN单核苷酸多态性与胃癌的关联性分析

目的：探讨抑癌基因PTEN的两个单核苷酸多态性（SNP）位点rs2735343和rs701848与中国北方汉族人群胃癌的关系,阐明二者是否是胃癌发生的易感位点。方法：应用PCR-RFLP法检测58例胃癌患者（病例组）与104例健康者（对照组）的PTEN的SNP位点rs2735343和rs701848的基因型,应用SPSS 10.0分析PTEN的基因多态性与胃癌的关联性。结果：rs2735343位点的PCR扩增目的片段长度为272 bp,经酶切后呈现GG、GC、CC　3种基因型;rs701848位点的PCR扩增目的片段长度为394 bp,经酶切后呈现TT、TC、CC　3种基因型; rs2735343与rs701848两个SNPs基因型分布在病例组（P=0.062;P=0.055）和对照组（P=0.246;P=0.692）均符合Hardy-Weinberg平衡;这两个SNPs在病例组的等位基因及基因型频数分布与对照组比较差异均无显著性（P>0.05）。结论：PTEN的SNP位点rs2735343和rs701848与中国北方汉族人群胃癌无关联性,可能不是此人群胃癌的易感位点。
     

色氨酸羟化酶2基因多态性与重症抑郁发作和治疗反应的关系分析

目的分析中国汉族人群中色氨酸羟化酶2（TPH-2）基因单核苷酸多态性（SNP）rs4570625和rs7305115位点与重症抑郁发作（MDD）和抗抑郁药物治疗反应的关系。方法设立病例组（汉族MDD患者,n=346）和对照组（汉族正常人,n=347）;根据对治疗的反应,病例组患者再分为难治性抑郁症组（TRD组,n=72）和非TRD组（NTRD组,n=274）。通过Taqm an探针SNP基因分型技术对TPH-2基因的rs4570625和rs7305115位点进行基因分型,分析等位基因和基因型频率在各组间的分布差异。结果病例组TPH-2基因rs4570625位点的基因型及等位基因分布的频率与对照组比较,差异有统计学意义（P〈0.05）。按性别分层后,男性TRD组与男性NTRD组SNPs rs4570625和rs7305115位点的基因型和等位基因分布频率比较,差异有统计学意义（P〈0.05）。结论 TPH-2基因rs4570625位点可能与抑郁症的发病有关;男性患者rs4570625和rs7305115位点的多态可能可用于预测对治疗的反应。     

色氨酸羟化酶2基因多态性与重症抑郁发作和治疗反应的关系分析

目的 分析中国汉族人群中色氨酸羟化酶2(TPH-2)基因单核苷酸多态性(SNP)rs4570625 和rs7305115位点与重症抑郁发作(MDD)和抗抑郁药物治疗反应的关系.方法 设立病例组(汉族MDD患者,n=346)和对照组(汉族正常人,n=347);根据对治疗的反应,病例组患者再分为难治性抑郁症组(TRD组,n=72)和非TRD组(NTRD组,n=274).通过Taqman探针SNP基因分型技术对TPH-2基因的 rs4570625和rs7305115位点进行基因分型,分析等位基因和基因型频率在各组间的分布差异.结果 病例组TPH-2基因rs4570625位点的基因型及等位基因分布的频率与对照组比较,差异有统计学意义(P<0.05).按性别分层后,男性TRD组与男性NTRD组SNPs rs4570625和rs7305115位点的基因型和等位基因分布频率比较,差异有统计学意义(P<0.05).结论 TPH-2基因rs4570625位点可能与抑郁症的发病有关;男性患者rs4570625和rs7305115位点的多态可能可用于预测对治疗的反应.     

雌激素受体β及ABCC11基因单核苷酸多态性与腋臭发病的相关性

目的：研究激素受体基因及其他相关基因的单核苷酸多态性与腋臭发病之间的相关性。方法：收集219名腋臭患者及159名正常人全血,提取全基因组DNA,使用基质辅助激光解析电离飞行时间质谱等相关技术对49个候选基因位点的单核苷酸多态性进行检测并分析。结果：雌激素受体β基因rs1256061位点及ABCC11基因的rs17822931,rs16945916和rs62058521三个位点的单核苷酸基因多态性在腋臭患者和正常人中的差异有统计学意义(均P<0.01)。81.1%的腋臭患者携带rs1256061位点G等位基因,而正常人只有63.2%携带了该位点的G等位基因;96.3%的腋臭患者携带 rs17822931位点G等位基因,而正常人只有4.4%携带该位点的G等位基因;28.6%的腋臭患者携带rs16945916位点G等位基因,而正常人组只有0.6%携带该位点的G等位基因;28.0%的腋臭患者携带rs62058521位点G等位基因,而正常人组只有0.6%携带该位点的G等位基因。结论：雌激素受体β基因位点rs1256061的单核苷酸多态性与腋臭的发病有关;ABCC11基因多个位点的单核苷酸多态性均与腋臭的发病相关,它们分别是rs16945916,rs62058521和rs17822931。     

Lack of association between three single nucleotide polymorphisms in the PARK9, PARK15, and BST1 genes and Parkinson’s disease in the northern Han Chinese population

Background  Parkinson’s disease (PD) is an autosomally inherited neurodegenerative disease in elderly people. The etiology of PD has long been thought to be associated with both
genetic and environmental factors. To explore potential genetic risk factors for PD in the northern Han Chinese population, we investigated three single nucleotide polymorphisms (SNPs) (rs4538475, rs11107 and rs12564040) in the BST1, PARK15 and PARK9 genes.

Methods  Genomic DNA from 215 PD patients and 212 matched controls was amplified in two independent PCR systems and subsequently genotyped by digestion with the endonuclease PstI. Genetic parameter and association studies were carried out with SPSS 13.0 and PLINK 1.07 software.

Results  We could accurately detect all genotypes in the three loci with the PCR-RFLP or mismatched PCR-RFLP techniques. The observed heterozygosities of the rs4538475 and rs11107 loci in PD and control groups ranged from 0.460–0.481 and 0.410–0.441, in BST1, PARK15 respectively, while we detected no heterozygosity at the rs12564040 locus in PARK9. The similar distributions of genotypic frequency between both groups suggest that the three SNPs investigated in this study are unlikely to play roles as common risk factors or pathogenic mutations for PD in northern Han Chinese.

Conclusion  The SNPs investigated in the BST1, PARK15 and PARK9 genes associated with PD susceptibility are not associated with PD in the northern Han Chinese population.

     

12个单核苷酸多态性位点与儿童急性淋巴细胞白血病易感性的关系

目的：鉴定国外全基因组关联分析（GWAS）报道的13 个儿童急性淋巴细胞白血病（ALL）易感性单核苷酸多态性（SNPs）位点与中国人群的关系,为我国儿童ALL预测及诊治提供新策略。方法：采用微流体动态芯片（IFC）,通过Fluidigm的JunoTM分析系统,对191例ALL患儿和191例健康志愿者的13个ALL易感性相关候选SNPs位点进行基因分型。对照组进行Hardy-Weinberg遗传平衡检验后采用χ2检验及logistic回归分析。结果：rs10849033 位点不满足Hardy-Weinberg遗传平衡,将该位点剔除。病例组与对照组风险等位基因频率存在明显差异的位点有位于ARID5B 基因的rs10821936（风险等位基因C频率为0.489,P ＜0.001,OR =1.692,95%CI =1.265～2.264）、rs10994982（风险等位基因A频率为0.598,P =0.016,OR =1.425,95%CI =1.068～1.901）,位于ZNF230 基因的rs7554607（风险等位基因A频率为0.721,P =0.002,OR =1.599,95%CI =1.179～2.169）,位于IKZF1 基因的rs11978267（风险等位基因G频率为0.191,P =0.001,OR =1.965,95%CI =1.301～2.968）、rs4132601（风险等位基因G频率为0.175,P =0.003,OR =1.871,95%CI =1.225～2.857）。结论：ARID5B 基因的rs10821936与rs10994982、ZNF230 基因的rs7554607位点多态性与我国儿童ALL发病相关,IKZF1 基因的rs11978267及rs4132601为我国儿童ALL潜在易感性位点。     

SLC1A1基因多态性与中国汉族人群强迫症的相关性

目的：探讨谷氨酸转运体基因（SLC1A1）与中国汉族人群强迫症（OCD）的关系。方法：采用病例对照研究,以125例患者（OCD组）和125例正常人（对照组）作为研究对象,检测SLC1A1基因的3个位点（rs301430、rs301434、rs301979）,分析这些位点等位基因、基因型分布,以及单倍体与OCD之间的关系。结果：3个位点的等位基因和基因型频率分布在OCD组和对照组中的差异无统计学意义（P＞0.05）。经性别分层分析,相较于对照组,女性患者rs301979位点等位基因和基因型频率分布与对照组差异有统计学意义（χ2=7.875,P=0.019;χ2=7.331,P=0.007）,而男性患者中所有位点的等位基因和基因型频率分布差异均无统计学意义（P＞0.05）。三位点单倍体T-A-G在2组中的差异有统计学意义（χ2=6.206,P=0.013）。结论：SLC1A1基因rs301979位点可能是女性OCD的易感基因位点,rs301430、rs301434、rs301979的单倍体T-A-G可能与中国汉族人群OCD发病相关。     

中国儿童内皮细胞蛋白C受体基因多态性与川崎病易感性的关系

目的：调查中国儿童人群内皮细胞蛋白C受体(endothelial protein C receptor,EPCR)基因的单核苷酸多态 性是否与川崎病(Kawasaki disease,KD)相关。方法：招募103名KD患者(其中23名患者出现冠状动脉病变)和158名对 照组。选择EPCR基因的7个标记单核苷酸多态性(rs6088738,rs2069940,rs2069945,rs2069952,rs867186,rs9574和 rs1415774)进行TaqMan等位基因鉴别分析。采用酶联免疫吸附试验(ELISA)检测53名KD和52名健康儿童血浆可溶性 EPCR(soluble EPCR,sEPCR)水平。结果：rs2069952,rs9574,rs1415774与KD的发生显著相关,但与冠状动脉病变的 发生无关。具有rs2069952,rs9574,rs1415774和rs2069945单核苷酸多态性的男性比女性具有更大的KD风险。KD患儿 血浆sEPCR水平不能预测冠状动脉病变的形成,而KD患者rs867186等位基因G与血浆sEPCR水平升高有关。结论：中 国汉族儿童EPCR的单核苷酸多态性与KD易感性有关。     

组织因子途径抑制物2 (TFPI-2)基因多态性与急性冠脉综合征的关联性

 目的 探讨在中国汉族人群中基因多态性与急性冠脉综合征的关系。方法 采用病例对照研究设计,选择急性冠脉综合征(acute coronary syndrome,ACS)患者140例,其中包括不稳定型心绞痛患者(unstable angina,UA)68例、急性心肌梗死患者(acute myocardium infarction,AMI)72例;另有稳定型心绞痛患者(stable angina,SA)273例;以及正常对照306例。采用聚合酶链反应产物直接测序的方法对所有纳入对象进行组织因子途径抑制物2 (tissue factor pathway inhibitor 2,TFPI-2)基因多态性分析和关联分析。 结果 在所有对象的TFPI-2基因中共检测出8个单核苷酸多态性位点,其中rs59805398和rs34489123位点基因型频率和等位基因频率分布在ACS组和SA组,与对照组间差异有统计学意义。rs3763473、rs59999573、rs59740167、rs34489123位点在ACS组中存在连锁不平衡,与rs59805398位点关联分析提示主要有C-C-G-G-G和T-C-G-G-G两种单倍型。rs59999573、rs59740167、rs34489123位点在SA组中存在连锁不平衡,与rs59805398位点进行关联分析,主要有C-G-G-G和G-A-A-A两种单倍型。ACS组与SA组之间未见明显差异。结论 TFPI-2基因rs59805398位点C等位基因和rs34489123位点A等位基因与冠心病(coronary heart disease,CHD)发病存在关联性,其变异可能是中国人群冠心病发病的危险因子之一。TFPI-2基因SNP在冠心病患者中存在连锁不平衡。