三种全血提取基因组DNA方法的比较及Genomix方法的改良

目的：选择一种高效、简便快速、价格合适的从全血中提取基因组DNA的方法。方法：分别采用3种不同的方法从全血中提取基因组DNA,比较了3种方法提取的DNA的质量,以及各种方法所需时间及其费用。对其中的一种方法进行了改良。结果：3种方法提取的DNA的质量都能达到相关分子生物学实验的要求,但在操作程序、价格等方面存在差别。结论：Genomix法操作简单、快速、灵活性好、价格便宜,适合于大样本的DNA提取。     

用Chelex-100快速提取微量血痕中的DNA

目的 观察用Chelex-100从微量血痕中提取DNA的效果。方法 40份血痕纱布,取血痕3 mm×3mm置于1.5 mL离心管中,采用5％Chelex-100加煮沸法,提取血痕纱布中的DNA。提取液经过紫外分光光法测定,测其A260/280的比值,计算提取液DNA的纯度和浓度;DNA提取液经微型琼脂糖凝胶电泳,检测其DNA电泳带。结果 Chelex-100能快速在1 h之内提取微量血痕中的DNA,其提取液DNA纯度:27.5％样品纯度A260/280比值大于1.6,72.5％样品纯度比值在1.08～1.54之间;提取液DNA浓度:80％样品小于100μg/mL,20％样品在100～166μg/mL之间。微型琼脂糖凝胶电泳未观察到DNA条带。结论 用Chelex-100法有助于快速提取微量血痕中的DNA。     

模式小鼠总DNA三种提取方法比较研究

目的: 建立简便、快捷、经济的模式小鼠基因型鉴定中总DNA提取方法,达到快速鉴定大批量模式小鼠的实验目的。方法：采用苯酚抽提法、异丙醇沉淀法、鼠耳煮沸法提取同种模式小鼠总DNA,对比DNA纯度和得率并通过PCR方法比较其鉴定结果。结果：DNA得率方面苯酚抽提法最好,异丙醇沉淀法最差;纯度则按照苯酚抽提法、异丙醇沉淀法、鼠耳煮沸法顺序呈现依次递减的趋势。三种总DNA均可作为PCR反应模板,进行基因型鉴定。鼠耳煮沸法实验时间明显低于另两种方法,且所得总DNA常规-20℃保存7天、30天后依然可作为PCR反应模板使用。结论：鼠耳煮沸法操作简单且成本最低,是一种切实可行的模式小鼠基因型鉴定中总DNA提取方法。     

冻存血与新鲜血的DNA抽提效果的比较研究

目的探讨一种简单便捷、可用于PCR扩增的人体外周血标本冷冻保存的方法。方法外周血标本冷藏于普通冰箱冷冻室2-4周,采用常规方法,提取28例新鲜血标本及31例冻存血标本的DNA,经2%琼脂糖凝胶电泳,凝胶分析软件半定量分析,比较冻存血和新鲜血的DNA抽提效果。采用PCR方法扩增抽提DNA标本的ABCB4基因外显子6,研究冻存血中提取的DNA能否用于PCR实验。结果新鲜血组的光强度值为24948.98±10246.97,冻存血组DNA标本的光强度值为22917.65±11545.63,两组间无显著性差异(P>0.05)。所有冻存血中提取的DNA标本,经PCR扩增均有目标带。结论简易冷冻保存的外周血标本中提取的DNA质量与新鲜血无明显差别。冻存血的DNA标本可以用于PCR实验。     

模式小鼠总DNA三种提取方法比较

目的建立简便、快捷、经济的模式小鼠总DNA提取方法,以快速鉴定大批量模式小鼠基因型。方法采用苯酚抽提法、异丙醇沉淀法、鼠耳煮沸法提取同种模式小鼠总DNA,对比DNA纯度、得率、耗费时间,并比较基因型鉴定结果。结果苯酚抽提法得率最高,异丙醇沉淀法最低;而纯度则按照苯酚抽提法、异丙醇沉淀法、鼠耳煮沸法顺序递减;在耗时上鼠耳煮沸法最短。三种方法提取的DNA均可做模版用于基因型鉴定。结论鼠耳煮沸法操作简单、成本最低,快速、基因型鉴定结果可靠,可用于规模化的基因型鉴定实验中。     

三种全血基因组DNA提取方法的比较

目的：比较三种不同的DNA提取方法提取人全血基因组DNA对DNA提取效率、纯度以及PCR扩增的效果影响。方法：分别应用中山医科大学达安公司：DNA提取液，珠海黑马医学仪器有限公司DNA提取液，胍盐酸法三种不同的方法提取人全血基因组DNA。结果：三种方法提取的DNA纯度平均分别为：1．48，1．51，1．56，各组间差异无显著性。200μL全血中所提取DNA总量平均分别为1．6μg，2．3μg，4．1μg。用0．8％琼脂糖凝胶电泳鉴定胍盐酸法制备的DNA效果较其它两种方法好，PCR扩增效果差异不明显。结论：胍盐酸法提取的DNA总量明显高于其它两种方法，提取效率高，为三种全血基因组DNA提取方法中之首诜。     

三种DNA抽提方法对新鲜血细胞及冻血细胞DNA抽提效能的比较

目的 比较3种血细胞DNA提取方法（进口试剂盒、国产试剂盒和改良苯酚抽提方法）对新鲜血细胞及冻血细胞DNA的提取效率及差异。 方法 收集20例胰腺癌患者5 mL外周血标本,经低速离心获得血细胞沉淀后分装,根据保存方式分为新鲜血细胞和冻血细胞。新鲜血细胞不经冻存,在12 h内迅速抽提DNA;冻血细胞在-40℃保存72 h后,室温解冻后抽提DNA。抽提方法分别采用进口试剂盒（Qiagen公司）、国产试剂盒（天根生化科技有限公司）和改良苯酚方法。琼脂糖电泳检测DNA片段的完整性,核酸蛋白检测仪测定DNA纯度和浓度,计算不同抽提方法的DNA得率。 结果 在获得的DNA完整性方面,改良苯酚方法抽提的基因组DNA断裂和降解较少,而进口和国产试剂盒抽提的DNA均有一定程度的降解小片段。在获得DNA的纯度方面,部分冻存血细胞无论应用进口试剂盒、国产试剂盒和改良苯酚方法,均表现出一定的污染杂峰。在DNA得率方面,无论新鲜血细胞和冻存血细胞,均是进口试剂盒得率最高,其次为国产试剂盒;冻血细胞的改良苯酚法DNA得率与国产试剂盒相当,新鲜血细胞的改良苯酚法DNA得率最低。在耗时和成本分析中,试剂盒较快但成本较高。 结论 改良苯酚抽提法可获得较进口和国产试剂盒片段更长、更完整的基因组DNA,虽然在得率和耗时方面稍逊色,但其成本较低,可推荐用于大规模、分批次、低成本冻存血细胞的基因组DNA抽提。     

4种古DNA抽提方法效果比较

目的：寻找到一种简便、快速、可靠、有效的古DNA抽提方法。方法：选择基于硅粒法和硅离心柱法的四种抽提方法(方法A：Modified Silica Particles Method;方法B：Ceneclean Method;方法C：QIAamp Method;方法D：Modified QIAquick method))分别抽提5个距今约4 000年的古绵羊线粒体DNA (mtDNA),并进行PCR扩增,通过琼脂糖凝胶电泳观察扩增成功与否,根据扩增成功率判断抽提方法的优劣。结果：4种方法的扩增成功率从20%～100%, 基于硅离心柱法的抽提效果 (60%,100%) 明显的优于基于硅粒法 (20%,40%),其中Modified Silica Particles Method 的效果最差 (20%),Modified QIAquick Method的效果最好 (100%)。　结论：Modified QIAquick Method方法使用Centricon○[KG-*4/5]〖HT7”〗R 超滤管浓缩DNA抽提裂解液,结合硅离心柱进行DNA纯化,能有效去除PCR抑制物,同时得到较好的古DNA模板。     

PRC技术鉴定毛发,陈旧血痕的性别

本文作者用ＰＣＲ技术对３例保存３年半的血痕及新鲜毛发标本进行性别鉴定，其方法是从陈旧血痕及新鲜毛发标本中提取ＤＮＡ，用蛋白酶Ｋ进行消化，然后用两组引起Ｙ１．１与Ｙ１．２和Ａｕｌ９．１、Ａｕｌ９．２及国产ＦＤ耐热ＤＮＡ聚合酶进行聚合酶链反应扩增ＤＮＡ，电泳分析Ｙ及Ａｕｌ重复序列，从而判断血痕及毛发性别。     

存放全血温度及时间对提取DNA质量的影响

采用ＰＣＲ扩增评估提取ＤＮＡ的质量,研究在不同温度、时间条件下存放全血对提取ＤＮＡ的影响,结果：不同温度（４℃１￣４ｄ,－２０℃３个月,－８５℃３个月）条件下存放的全血,４０℃存放１￣４ｄ与－８５℃存放３个月无显著差异,４℃存放１￣４ｄ与－２０℃存放３个月,－２０℃与－８５℃存放３个月呈显著差异。结论：４℃１￣４ｄ及－８５℃３个月,能获得较高质量的ＤＮＡ样品。     

从石蜡包埋的组织中提取DNA的研究

我们将Ｓｈｉｂａｔａ制备ＤＮＡ的方法加以改进，采用二甲苯脱蜡、酚—氯仿—异戊醇抽提、乙醇沉淀等步骤，成功地从经甲醛固定、石蜡包埋的食管癌组织中提取出ＤＮＡ，用于聚合酶链式反应（ｐｏｌｙｍｅｒａｓｅｃｈａｉｎｒｅａｃｔｉｏｎ，ＰＣＲ）。结果与从新鲜冷冻组织提取的ＤＮＡ结果相似，解决了分子生物学研究中在短时间内难以得到大量新鲜肿瘤组织标本的难题。     

简便快速的PCR产物回收方法

目的分析比较几种PCR产物回收方法的回收效果.方法针对PCR DNA的回收效果及回收特点,采用内皮素(Endothelin)基因PCR反应产物,分别利用本室建立的二种新方法--速冻-快速离心法、凝胶浸泡法和传统方法--玻璃珠试剂盒回收法对PCR产物DNA进行回收,用琼脂糖凝胶电泳鉴定3种方法回收PCR产物的效果.结果发现两种新方法回收DNA带的亮度强,与传统方法相比,差异无显著性(P＞0.10).结论说明速冻-快速离心法与凝胶浸泡法不仅具有玻璃珠试剂盒回收PCR 产物的效果,而且经济、方便、可靠,是两种可行的PCR产物回收方法.     

全血基因组DNA快速提取法

目的　建立一种简便、快速、有效、微量外周血基因组DNA的提取方法。方法　采用NaI作细胞裂解剂裂解细胞和细胞核 ,用氯仿∶异戊醇 ( 2 4∶1 )直接提取基因组DNA。结果　该方法提取外周血基因组DNA的纯度高 ,A2 60nm/A2 80nm=1 .83± 0 .1 3,每毫升外周血可得DNA 33± 3.5 2 μg。结论　本法简便、快速、有效 ,适用于批量临床标本的处理。     

全血基因组DNA快速提取法

目的　建立一种简便、快速、有效、微量外周血基因组DNA的提取方法。方法　采用NaI作细胞裂解剂裂解细胞和细胞核,用氯仿:异戊醇(2 4 :1)直接提取基因组DNA。结果　该方法提取外周血基因组DNA的纯度高,提取效率每毫升外周血可得DNA 33±3.5 2 μg。结论　本法简便、快速、有效,适应于批量临床标本的处理。     

结核分枝杆菌DNA两种提取方法比较

目的 :比较能够满足内切酶分析的结核分枝杆菌染色体DNA提取的两种方法 ,并结合实验室条件加以改进。方法 :称取结核分枝杆菌培养物 ,灭活后以溶菌酶和蛋白酶K消化后 ,分别以CTAB/NaCl和酚 /氯仿 /异戊醇 (2 5∶2 4∶1)抽提 ,无水乙醇沉淀 ,紫外分光光度计测定DNA的含量。结果 :酚抽提法和CTAB抽提法提取的基因组DNA的得率分别为0 47± 0 0 71,0 41± 0 10 (‰ ,W/W )。A2 60 /A2 80 的值分别为 1 83± 0 12 ,1 89± 0 0 72。结论 :用CTAB/NaCl抽提结核分枝杆菌基因组DNA均能满足内切酶及杂交操作的要求 ,酚抽提法得率稍高 ,但无统计学意义。CTAB法污染少 ,省时省材 ,可代替酚抽提DNA。     

三种病原体PCR检测方法与血清学检测方法的比较

目的分析和比较PCR方法与血清学方法对三种病原体的检测应用结果。方法用已建立的检测弓形虫、布氏杆菌、轮状病毒核酸的PCR方法分别对ICR小鼠的肝组织、Beagle犬的粪便和阴道拭子,猕猴的粪便进行了相关病原体的核酸检测。同时用血清学抗体检测方法对ICR小鼠、Beagle及猕猴血清进行了相关病原体抗体检测。结果核酸检测结果和用血清学方法所得的检测结果,以及用不同血清学方法所得的检测结果相一致。结论作者所建立的三种病原体的PCR检测方法具有较好的特异性、敏感性和操作简便的优点,可以和血清学方法一起使用于实验动物的微生物质量检测,并弥补血清学方法的不足。