基于网络药理学探讨半夏厚朴汤作用机制

目的:基于网络药理学分析半夏厚朴汤的重要成分与作用机制,为半夏厚朴汤的临床应用、实验研究提供客观依据。方法:基于中药系统药理学分析平台检索半夏厚朴汤的化学成分,以口服生物利用度≥30%和类药性≥0.18为标准筛选主要活性成分;运用Swiss Target Prediction系统依次检索各活性成分的作用靶点,并构建半夏厚朴汤活性成分-靶点网络图、靶蛋白互作网络图;利用David平台进行KEGG信号通路以及GO生物过程富集分析。结果:通过筛选共挖掘出半夏厚朴汤主要活性成分44个,其相应的作用靶点218个,并筛选出100个关键作用靶点以及10条重要的信号通路。结论:本研究初步揭示了半夏厚朴汤的药效物质基础,并探讨了半夏厚朴汤的药理作用机制,为半夏厚朴汤的临床应用以及实验研究提供了重要参考依据。     

柴胡-黄芩药对防治新型冠状病毒肺炎网络药理学分子机制研究

目的 基于网络药理学研究柴胡-黄芩药对防治新型冠状病毒肺炎的药物成分,预测作用靶点,并探讨其潜在的作用机制.方法 通过中药系统药理学数据库(TCMSP)收集柴胡-黄芩药对的药物成分及相应作用靶点;运用STRING数据库与Cytoscape软件构建“药物成分-靶点”网络和蛋白相互作用网络;通过ClueGO对靶点的基因本体...     

柴胡多组分协同治疗乳腺癌作用机制的网络药理学研究

目的:运用网络药理学方法筛选柴胡治疗乳腺癌的有效成分和作用靶点,探究其成分-靶点-疾病的关系。方法:通过中药系统药理学数据库信息挖掘及文献检索收集筛选柴胡的活性成分;多个数据库联用筛选柴胡的作用靶点及乳腺癌疾病相关基因,构建成分靶点-疾病靶点的可视化网络拓扑关系图,筛选出核心靶点。进一步进行蛋白互作网络分析、GO生物学过程富集、信号通路富集分析。结果:柴胡的11个活性成分可通过调控PTGS2、NOS2、AR、ESR2等52个乳腺癌疾病靶点,影响类固醇激素受体活性等生物学过程及内分泌抵抗、铂耐药、乳腺癌相关信号通路,从而发挥治疗乳腺癌的作用。结论:本研究初步验证了柴胡治疗乳腺癌的靶点及作用方式,可为进一步揭示其作用机制奠定基础。     

基于网络药理学探讨加味柴胡疏肝散治疗冠心病伴焦虑/抑郁的作用机制

目的 运用网络药理学方法，探讨加味柴胡疏肝散治疗冠心病伴焦虑/抑郁的作用机制。方法 运用中药系统药理学数据库与分析平台获取加味柴胡疏肝散所含中药的有效活性成分及其作用靶点。通过GeneCards?、OMIM?、TTD数据库筛选冠心病及焦虑/抑郁的相关靶点，并对两类疾病相关靶点取交集。对有效活性成分的作用靶点与疾病相关靶点进行交集，获得交集靶点作为加味柴胡疏肝散治疗冠心病伴焦虑/抑郁的潜在作用靶点。使用CytoScape 3.8.0软件构建药物成分-疾病-靶点网络图。利用STRING数据库构建交集靶点的蛋白-蛋白相互作用(PPI)网络，并筛选加味柴胡疏肝散治疗冠心病伴焦虑/抑郁的核心靶点(度值≥30)。使用Metascape数据库对交集靶点进行基因本体论(GO)功能富集分析及京都基因和基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。结果 (1)共获得有效活性成分233个，有效活性成分的作用靶点161个，交集靶点106个。(2)药物成分-疾病-靶点网络的节点度值较高的前15个有效活性成分中，黄酮类成分共有7个，包括槲皮素、山柰酚、木犀草素、川陈皮素、柚皮素、美迪紫檀素、异鼠李素。(3)PPI网络中...     

基于网络药理学探讨"白术-白芍"药对治疗溃疡性结肠炎的作用机制

目的:基于网络药理学,构建"药物-成分-基因-疾病"网络图,探讨中药药对"白术-白芍"治疗溃疡性结肠炎(UC)的关键靶点及作用机制.方法:通过中药系统药理学技术平台,自定义筛选条件:OB≥30％,DL≥0.18,筛选出"白术-白芍"的有效成分及潜在靶点;在Genecards及OMIM数据库中搜集UC的疾病靶点,并制作venny图寻找共同靶点,结合Cytoscape软件构建层次分明的网络图,借助STRING数据库绘制蛋白相互作用(PPI)网络,并对关键靶点进行进行GO及KEGG富集分析.结果:分析共筛选出"白芍-白术"药对主要成分有9种,与溃疡性结肠炎相关的靶点44个,GO富集分析得到74个生物学过程,KEGG富集分析得到121条通路,即药对的主要成分可以直接或通过121条信号通路间接作用于UC的相关受体靶点,从而产生治疗作用.结论:"白术-白芍"药对对难治病UC具有潜在的治疗作用,且该作用具有是靶点多样、通路复杂、层次分明的特点.本次研究实现了中药药物有效成分与疾病基因的有效对接,为中医药在UC治疗作用中提供依据,提高了依据的可信度与科学性.     

基于网络药理学的大柴胡汤治疗2型糖尿病机制探讨

目的运用网络药理学研究大柴胡汤治疗2型糖尿病的作用机制。方法通过中药系统药理数据库及分析平台(TCMSP)筛选大柴胡汤主要化学成分和靶点,通过Gene Cards获得2型糖尿病相关靶点基因,将药物靶点基因和疾病靶点映射而得到大柴胡汤治疗2型糖尿病的预测靶点。利用Cytoscape 3.6.0软件构建中药化合物-靶点网络与蛋白互作网络(PPI)。利用DAVID 6.8数据库进行交集基因的基因本体论(GO)分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。结果大柴胡汤治疗2型糖尿病有效成分98个,相关靶点260个,关键靶点35个。GO分析包括生物学进程625个,细胞组分71个和分子功能129个。KEGG通路富集分析包括134条信号通路,主要与TNF信号通路、PI3K-Akt信号通路、p53信号通路、细胞凋亡信号通路等密切相关。结论大柴胡汤主要通过作用于炎症反应、胰岛素抵抗、胰岛β细胞凋亡、血管增生等多方面治疗2型糖尿病。     

基于网络药理学探讨柴胡治疗卒中后抑郁的作用机制

目的 基于网络药理学探讨柴胡治疗卒中后抑郁(PSD)的潜在靶点及作用机制。方法 采用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)检索柴胡的有效成分及对应靶点,采用在线人类孟德尔遗传(OMIM)、疗效药靶(TTD)、Drugbank、Genecards数据库检索PSD的疾病靶点,二者靶点取交集后获得柴胡治疗PSD的潜在作用靶点;采用Cytoscape 3.7.1软件绘制中药-成分-疾病-靶点调控网络图;运用STRING数据库构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络并分析其核心靶点;采用DAVID数据库对潜在靶点进行基因本体(GO)功能富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)信号通路分析。结果 柴胡治疗PSD的核心成分为异鼠李素、曲克芦丁、豆甾醇等,潜在靶点为蛋白激酶B(AKT1)、白细胞介素-6(IL-6)、内皮型一氧化氮合酶(NOS3)、肿瘤坏死因子(TNF)等,柴胡活性成分可以参与RNA聚合酶II启动子对转录的正调控、细胞间信号传递、对药物的反应、对凋亡过程的负调控、老化等生物过程,涉及的信号通路包括神经活性配体-受体相互作用、钙信号通路、癌症通路、磷脂酰肌醇-3激酶蛋白激酶B...     

基于网络药理学探讨加减补肺化瘀汤治疗非小细胞肺癌的作用机制

目的 采用网络药理学方法探索加减补肺化瘀汤治疗非小细胞肺癌(NSCLC)的作用机制.方法 利用中药系统药理学分析平台获得加减补肺化瘀汤14味中药的有效活性成分及其作用靶点.通过GeneCards数据库筛选NSCLC的相关靶点;利用Venny平台将有效活性成分的作用靶点与NSCLC相关靶点取交集获得共同靶点,即加减补肺化...     

基于网络药理学探讨苇茎汤治疗哮喘急性发作的作用机制

目的 通过网络药理学探究苇茎汤治疗哮喘急性发作的潜在作用机制.方法 使用TCMSP数据库筛选苇茎汤药物活性成分,使用Uniprot及TCMSP数据库查找药物活性成分及潜在靶点,运用Cytoscape构建"中药-活性成分-靶点"网络图.在DrugBank、GeneCards、TTD等数据库中搜索哮喘急性发作的疾病靶点,将...     

基于网络药理学的大建中汤治疗胃癌的作用机制分析

目的 运用网络药理学的方法探讨大建中汤治疗胃癌的作用机制,为后期实验研究提供理论依据.方法 通过中药系统药理学分析平台(TCMSP)对大建中汤的活性成分和靶点进行筛选;利用GeneCards、OMIM、PharmGKB和Therapeutic Target Database数据库获取胃癌靶点.利用R语言将药物与疾病靶点...     

基于网络药理学探讨四神煎治疗类风湿关节炎的作用机制

目的:基于网络药理学探讨四神煎治疗类风湿关节炎(rheumatoid arthritis, RA)的作用机制。方法:通过中药系统药理数据库和分析平台(traditional chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform, TCMSP)、中医药百科全书数据库(encyclopedia of traditional chinese medicine, ETCM)检索四神煎组方中药的主要化学成分,并结合文献进行筛选、补充;通过Pubchem有机小分子生物活性数据库检索化学成分的SMILES结构式及2D结构,经Swiss ADME数据库筛选后将符合标准的化学成分上传至Swiss Target Prediction数据库预测药物活性靶点;通过人类基因数据库(Gencards)、在线人类孟德尔遗传数据库(online mendelian inheritance in man, OMIM)、治疗靶标数据库(therapeutic target database, TTD)、DrugBank数据库获取RA疾病相...     

基于网络药理学的炙甘草汤治疗原发性低血压机制研究

目的 运用网络药理学的研究方法,分析炙甘草汤治疗原发性低血压的作用靶点和潜在机制.方法 使用TCMSP,TCMID,BAT-MAN等数据库获取炙甘草汤的化学成分和对应的靶点,在OMIM,Genecards疾病数据库以hypotension为关键词检索低血压的疾病靶点,在string网站对炙甘草汤和低血压的靶点分别进行蛋...     

基于网络药理学探讨益气凉血生肌方预防冠心病PCI术后复发心绞痛机制

目的 基于网络药理学研究益气凉血生肌方预防冠心病PCI术后复发心绞痛药效机制.方法 通过TCMSP,获取该方各药有效成分及各个成分对应的靶点,并对成分-靶点相互作用结果进行可视化,"心绞痛"相关靶点通过Genecards和OMIM获取;通过VENN图取药物与疾病靶点交集,将交集靶点提交至String获取PPI图以及相关...     

芍药甘草汤治疗多囊卵巢综合征高雄激素血症的网络药理学研究

运用网络药理学探索芍药甘草汤对多囊卵巢综合征高雄激素血症的作用机理。方法 通过TCMSP数据库结合口服生物利用度（OB）、类药性（DL）、半衰期（HL）筛选芍药甘草汤的有效活性成分及作用靶点，运用Genecards、Drugbank、OMIM数据库获取多囊卵巢综合征高雄激素血症的治疗靶点。借助Cytoscape3.7.2 软件构建“中药-活性成分-靶点”可视化网络，利用VENNY图筛选出药物与疾病的共同靶点，运用STRING在线分析工具构建蛋白互作网络图（PPI），通过David数据库对关键靶点进行GO功能富集分析及KEGG通路富集分析。结果 从芍药甘草汤中筛选出槲皮素、山奈酚、7-甲氧基-2-甲基异黄酮、 刺芒柄花素等83个有效成分，作用于MAPK3、MMP-9、STAT3、TNF、IL-6、VEGFA等41个关键靶点。KEGG通路富集分析发现这些靶点参与了TNF、HIF-1、FoxO、Toll样受体等信号通路。结论 芍药甘草汤中的槲皮素、山奈酚等可能通过TNF、IL-6、STAT3、VEGFA等靶点作用于TNF、HIF-1、FoxO、Toll样受体等信号通路来调节糖脂代谢、保护血管内皮、参与炎症反应，以减少雄激素的合成，发挥治疗多囊卵巢综合征高雄激素血症的作用。     

基于网络药理学研究六君子汤治疗年龄相关性黄斑变性的机制

目的 通过网络药理学分析六君子汤治疗年龄相关性黄斑变性(AMD)的靶点和信号通路,并探讨其作用机制.方法 从中药网络药理学数据和分析平台(TCMSP)搜索六君子汤6味中药的化学成分,并筛选出可能活性成分;在Swiss Target Prediction数据库查询活性成分的对应靶点;使用DrugBank、TTD和OMIM...     

基于网络药理学角度探讨当归四逆汤对子宫内膜异位症的干预机制

目的 基于网络药理学探讨当归四逆汤治疗子宫内膜异位症（EMS）的作用机制。方法 利用中药系统药理学数据库与分析平台（TCMSP）筛选当归四逆汤有效活性成分及潜在靶点，在Genecard、OMIM和TTD数据库中寻找EMS相关靶点基因取当归四逆汤靶点基因与EMS相关靶点基因共同靶点。通过Cytoscape 3.5.0软件构建“当归四逆汤活性成分-潜在靶点-EMS”网络图。运用String数据库构建构建蛋白质互作（PPI）网络图。对潜在靶点基因进行基因本体（GO）富集分析和京都基因和基因组百科全书（KEGG）通路分析。结果 数据库筛选的得到当归四逆汤有效活性成分151个，与EMS相关潜在作用靶基因71个，KEGG富集通路分析主要包括化学致癌受体激活，脂质和动脉粥样硬化通路等。结论 当归四逆汤具有多活性成分，能通过多靶点，多通路发挥EMS保护作用。     

二至丸抑制皮肤黑素瘤细胞生长的分子网络机制及关键靶点探讨

[目的] 基于网络药理学探讨二至丸抑制皮肤黑素瘤生长的分子网络机制及关键靶点。[方法] 通过中药系统药理学数据库与分析平台筛选二至丸有效成分,在GEO数据库获得皮肤黑素瘤细胞与黑素细胞的差异基因表达,应用CytoScape3.7.2软件建立蛋白互作网络,利用基因表达谱交互分析数据库筛选黑素瘤枢纽基因,并进行生存分析。通过DAVID生物信息学资源进行差异基因的富集分析,并构建KEGG网络。[结果] 获得二至丸有效成分21种和皮肤黑素瘤相关靶点1889个。枢纽基因中首位是NFKBIA,它在各期皮肤黑素瘤中均呈低表达,并显著影响生存周期。代谢途径包括TNF信号通路、IL-17信号通路,趋化因子信号通路等。[结论] 二至丸通过上调NFKBIA对皮肤黑素瘤产生抑制作用,最重要的信号通路是TNF信号通路。     

基于网络药理学和分子对接探讨凉血消斑汤治疗寻常型银屑病的作用机制

目的:使用网络药理学和分子对接技术研究凉血消斑汤治疗寻常型银屑病的关键成分与靶标,并探讨其可能的作用机制.方法:从中药系统药理学数据库(traditional Chinese medicine systems pharmacology,TCMSP)、中医药分子机制生物信息学数据库(bioinformatics anal...     

基于网络药理学探讨独活寄生汤治疗类风湿关节炎作用机制

目的 运用网络药理学方法探讨独活寄生汤治疗类风湿关节炎的作用机制,使中药在防治类风湿关节炎中发挥更大的临床作用.方法 通过检索中药系统药理学数据库(TCMSP)获得独活寄生汤方药中各味药物的有效活性成分及相关靶点,类风湿关节炎的疾病数据通过OMIM和Genecards数据库获取,运用R×64 3.6.1软件绘制药物-疾...     

菟丝子—黄芪治疗骨质疏松症的网络药理学机制研究

【目的】运用网络药理学方法探讨菟丝子-黄芪治疗骨质疏松症的作用机制。【方法】首先采用中药系统药理学分析平台(TCMSP)和GeneCards数据库,分别筛选菟丝子、黄芪的中药活性成分,中药靶标及骨质疏松症的疾病靶标,将中药靶标一一映射到疾病靶标,得到中药-疾病靶标并构建中药-成分-疾病-靶标调控网络。其次通过构建中药-疾病靶标的蛋白互作网络和条形图,筛选核心靶标。最后将中药-疾病靶标进行基因本体论(GO)功能富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,得出中药-疾病靶标涉及的功能和信号通路。【结果】筛选得到菟丝子-黄芪治疗骨质疏松症的21个有效成分和127个中药-疾病靶标,中药-疾病靶标涉及的GO功能主要包括转录激活活性、转录因子活性、辅因子结合、核受体活性、类固醇激素受体活性、RNA聚合酶Ⅱ转录因子结合、泛素样蛋白连接酶结合、类固醇结合等。中药-疾病靶标涉及的KEGG通路主要包括前列腺癌信号通路、糖尿病并发症的晚期糖基化终末产物-晚期糖基化终末产物受体(AGE-RAGE)信号通路、动脉粥样硬化信号通路、结直肠癌信号通路、乙肝信号通路、肿瘤坏死因子(TNF)信号通路、小细胞肺癌信号通路、内分泌失调信号通路、细胞凋亡信号通路、乳腺癌信号通路等。【结论】运用网络药理学研究方法可预测出菟丝子-黄芪治疗骨质疏松症的主要活性成分、功能活动和信号通路。