基于网络药理学探究苏黄泻浊丸抗肾间质纤维化及其调控铁死亡的作用机制

目的：基于网络药理学探究苏黄泻浊丸治疗肾间质纤维化（Renal Interstitial Fibrosis,RIF）及调控铁死亡的作用机制。方法：通过中药系统药理学数据库与分析平台（TCMSP）、STRING、OMIM、Gene Cards、DisGeNet等筛选苏黄泻浊丸的中药活性成分及RIF关联靶标,借助Cytoscape 3.6.0软件构建苏黄泻浊丸活性成分-RIF靶标网络,结合STRING数据库构建方药与RIF关联靶点蛋白质-蛋白质相互作用网络,利用DAVID数据库进行京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路富集分析;利用FerrDb数据库获取铁死亡调控基因,最终获取公共靶标基因,构建苏黄泻浊丸活性成分-RIF、铁死亡共同靶标网络,结合STRING数据库构建共同靶蛋白相互作用网络;利用DAVID数据库进行KEGG通路富集分析。结果：筛选出药物活性成分102个,与RIF关联的靶基因177个,经基因本体论（GO）、KEGG分析,苏黄泻浊丸治疗RIF的生物过程与RNA聚合酶Ⅱ促进转录的正调控、转录因子活性、序列特异性DNA结合等有关,通过调节脂质与动脉粥样硬化、白细胞介素（Inter...     

玉女煎治疗糖尿病肾病的网络药理学研究及实验验证

目的 利用网络药理学技术结合动物实验验证，探讨玉女煎治疗糖尿病肾病可能的作用靶点与作用机制。方法 从基因表达综合数据库（GEO）中获得人糖尿病肾病的差异基因；通过TCMSP、HERB和TCMID数据库搜集玉女煎活性成分及其对应的作用靶点。将获得的差异基因与玉女煎的作用靶点进行交集分析获得共同靶点，并对共同靶点进行蛋白互作（PPI），获取玉女煎作用的核心靶点。构建“玉女煎活性成分-共同靶点”网络，获取玉女煎的关键活性成分。通过KEGG富集分析，获取玉女煎作用的核心基因。将玉女煎中关键的活性成分和核心靶点及核心基因进行分子对接。以自发性2型糖尿病大鼠（GK大鼠）肾脏为研究对象，蛋白印迹检测网络药理学及分子对接预测的信号通路相关蛋白的表达情况。结果 通过GEO基因芯片差异分析，获得了1 434个糖尿病肾病的差异基因。从数据库中筛选了37个玉女煎活性成分，共对应419个靶点。通过交集分析共获得47个共同靶点。PPI互作网络拓扑分析可得核心靶点血管细胞黏附分子1(VCAM1)，通过网络分析玉女煎关键活性成分20个。KEGG结果可知玉女煎作用的核心基因为上皮生长因子（EGF）、血管内皮生长因子（V...     

基于网络药理学研究灵芝干预肝癌的作用机制

目的：灵芝辅助抗癌临床治疗20余年,但是其具体的活性成分及其对肿瘤的调控机制尚不明确。文章采用网络药理学的方法探究灵芝干预肝癌的作用机制,为灵芝进一步作为抗癌治疗和化学预防药物提供科学依据。方法：使用中药系统药理学数据库与分析平台数据库筛选与预测灵芝的活性成分和作用靶点,分别在GeneCards、OMIM、TTD、DrugBank和PharmGKB等5个数据库筛选、去重,获取治疗肝癌的相关靶点。利用Venny在线工具获得灵芝与肝癌的共同作用靶点（即灵芝干预肝癌的靶点）;基于String数据库进行灵芝-肝癌共同靶点相互作用网络的构建与分析;使用Cytoscape软件构建灵芝干预肝癌的“活性成分-靶点”图。最后利用R软件对共同作用靶点进行基因本体论（GO）功能富集分析和京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路富集分析。结果：经筛选与预测,获得灵芝的活性成分13个和作用靶点38个;GO和KEGG富集分析得到41个生物学过程和28条信号通路。结论：通过构建和预测药物、靶点-通路网络证实和预测了灵芝治疗肝癌的分子机制,提示有11个核心靶基因可以作为灵芝治疗肝癌的潜在标志物。     

基于网络药理学和分子对接技术探讨参苓白术散治疗抗生素相关性腹泻的分子作用机制

目的：运用网络药理学及分子对接技术探讨参苓白术散治疗抗生素相关性腹泻（Antibiotic-associated Diarrhea,AAD）可能的分子作用机制。方法：在中药系统药理学数据库与分析平台（TCMSP）获取参苓白术散的活性成分与药物作用靶点,在Gene Cards和OMIM数据库中获取AAD的靶点。采用Cytoscape 3.6.0构建“中药-活性成分-参苓白术散”对AAD作用靶点的调控网络图,结合String数据库构建蛋白质-蛋白质相互作用网络,筛选出参苓白术散对AAD调控网络中潜在的最佳靶点。利用DAVID数据库进行基因本体论（GO）功能富集分析及京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路富集分析。最后,运用Auto Dock Tools 1.5.6和Auto Dock Vina 1.0进行分子对接验证。结果：搜索得到参苓白术散活性化合物156个,对应的靶点276个;其中作用于AAD的靶点186个,AAD疾病靶点2 787个。有GO条目440条与KEGG通路127条。参苓白术散的核心化合物木犀草素、槲皮素、山柰酚作用于关键靶蛋白JUN原癌基因（Jun Proto-oncog...     

基于网络药理学和分子对接探讨双夏汤治疗不寐的相关作用研究

目的：通过网络药理学和分子对接技术探讨双夏汤治疗不寐的主要活性成分及作用机制。方法：通过中药系统药理学数据库与分析平台（Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform,TCMSP）数据库获取双夏汤活性成分,通过Swiss Target Prediction数据库预测其成分的作用靶点,结合OMIM、Gencards、Drugbank数据库获取不寐的作用靶点,取二者共同作用的靶点制作韦恩图。运用Cytoscape 3.7.2软件筛选并构建“活性成分-核心靶点”网络,利用STRING数据库构建蛋白质-蛋白质相互作用网络图,筛选出核心靶点后对其进行基因本体论（GO）富集分析和京都基因与基因组学百科全书（KEGG）通路分析,最后将核心靶点与主要活性成分进行分子对接验证。结果：筛选得到双夏汤治疗不寐的22个活性成分和115个药物与疾病的共同靶点,推测丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶1(Akt Serine/Threonine Kinase 1,AKT1)、白细胞介素（Interleukin,IL...     

基于网络药理学和分子对接的五苓散治疗肝硬化腹水作用机制探讨

目的：通过网络药理学和分子对接方法探讨五苓散治疗肝硬化腹水的作用机制。方法：使用R软件结合中药系统药理学数据库与分析平台（TCMSP）、UniProt、GeneCards、OMIM、TTD和DrugBank数据库收集五苓散治疗肝硬化腹水的活性成分和相关靶点。采用Cytoscape 3.8. 0软件筛选关键活性成分并构建中药-活性成分-靶点网络,结合STRING数据库对交集靶点进行蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）网络分析并筛选出核心靶点,使用R软件进行基因本体（GO）分析和京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路分析。利用AutoDock Vina 1.1. 2对核心靶点和度值排名前3位的关键活性成分进行分子对接。结果：五苓散治疗肝硬化腹水有17个靶点,涉及23个活性成分,Cytoscape 3.8. 0软件筛选出β-谷甾醇、(+)-儿茶素、花旗松素、表儿茶素、常春藤皂苷元、3β-乙酰氧基苍术酮等关键活性成分,以及胱天蛋白酶3 (CASP3)、CASP8、热休克蛋白90α (HSP90AA1)、环氧合酶2 (PTGS2)、过氧化氢酶（CAT）和雌激素受体1 (ESR1)等核心靶点。GO分...     

基于网络药理学探讨玄参-麦冬药对治疗焦虑症作用机制

目的 应用网络药理学方法探讨玄参-麦冬药对治疗焦虑症的作用机制,为临床应用玄参-麦冬药对提供依据。方法 利用中药系统药理学数据库与分析平台（TCMSP）和中医药整合药理学研究平台（TCMIP）收集玄参、麦冬的化学成分,结合TCMSP、SwissADME数据库及文献筛选活性成分,利用Swiss TargetPrediction数据库预测活性成分作用靶点;通过OMIM、GeneCards、DrugBank数据库获取焦虑症的相关靶点,与活性成分作用靶点取交集;利用STRING数据库建立活性成分-疾病共同靶点蛋白相互作用（PPI）网络,采用Cytoscape3.8软件对PPI网络进行MCODE聚类分析,得出关键靶点;利用DAVID6.8数据库对活性成分-疾病共同靶点进行GO和KEGG富集分析,通过活性成分-靶点-通路网络筛选核心活性成分,用分子对接模拟核心活性成分与关键靶点的结合强度。结果 共筛选出玄参-麦冬药对37个活性成分,潜在靶点471个,焦虑症相关靶点753个,活性成分-疾病共同靶点42个,对其PPI网络进行MCODE聚类分析得到4种类簇,筛选出关键靶点14个。GO和KEGG富集分析显...     

血府逐瘀汤治疗子宫内膜异位症的网络药理学研究

目的以网络药理学方法探讨血府逐瘀汤治疗子宫内膜异位症可能的作用机制。方法通过中药系统药理学分析平台(TCMSP)获取血府逐瘀汤各中药的主要活性成分,再利用Swiss Target Prediction数据库获取与主要活性成分相关性位于前15位的作用靶点。借助GeneCards筛选治疗子宫内膜异位症潜在的作用靶点,用Cytoscape 3.6.0软件建构血府逐瘀汤活性成分-子宫内膜异位症靶点-通路网络图;使用STRING数据库建构靶蛋白相互作用网络,用Cytoscape 3.6.0软件构建蛋白质相互作用网络图,根据Degree值筛选出前5位的靶蛋白,采用Systems Dock Web Site预测筛选出的靶蛋白与活性成分的结合活性。最后,利用g:profiler数据库对关键靶点进行KEGG通路富集分析和GO基因富集分析。结果从血府逐瘀汤中筛选出主要活性成分164个,与子宫内膜异位症相关的作用靶点105个,血府逐瘀汤治疗子宫内膜异位症主要涉及肿瘤坏死因子(TNF)信号通路、雌激素信号转导通路等。结论血府逐瘀汤可作用于子宫内膜异位症的多个靶点,参与多条信号通路的调控,可为其药理机制研究提供新的方向。     

基于网络药理学和分子对接研究三仁汤治疗肺癌的分子机制

目的：采用网络药理学方法筛选三仁汤君药药对（SRJMP）的活性成分及核心靶点,探讨三仁汤君药药对治疗肺癌的作用机制。方法：依托中药系统药理学分析平台（TCMSP）,检索三仁汤 3 味中药相关的所有化学成分及预测作用靶点,采用STRING 数据库与 Cytoscape 软件构建“药物-活性成分-靶点”网络和蛋白互作网络,通过 ClusterProfiler、ClueGO、DAVID 数据库对核心靶点进行基因本体（GO）分析及京都基因和基因组百科全书（KEGG）通路富集。把候选作用靶点映射在 KEGG 通路图上分析结果,最后应用 AutoDock 软件进行分子对接。结果：共筛选出 40 个活性成分和 222 个相应蛋白靶点。首要分析核心靶点47 个,GO 分析共包含 117 条富集结果,KEGG 通路富集筛选出 30 条通路。结论：通过网络药理学验证了 SRJMP 多成分、多靶点、多通路的特点,其可能是通过调控免疫细胞分化,肿瘤相关信号通路以及干预细胞代谢过程,达到抗肿瘤作用。     

益脑康胶囊治疗缺血性脑卒中的网络药理学机制研究

目的运用网络药理学方法探究益脑康胶囊治疗缺血性脑卒中（Cerebral ischemic stroke,CIS）的潜在效 应机制。方法从中药系统药理学分析平台（TCMSP）及网络药理学分析平台（BATMAN-TCM）数据库中获取益 脑康胶囊的化学成分和靶点,通过人类基因数据库（GeneCards）获取缺血性脑卒中的治疗靶点,并利用R 语言 筛选共同靶点;使用Cytoscape 软件构建“药物有效活性成分-疾病靶点”可视化调控网络图,利用STRING 数 据库构建蛋白互作网络图（PPI）,然后运行R 语言对PPI 进行核心蛋白的筛选;最后,通过R 语言对共同靶 点进行基因本体（GO）功能富集分析和京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路富集分析。结果共筛选出益脑 康胶囊36 种类药成分及541 个潜在靶点,缺血性脑卒中相关靶点1 826 个,药物-疾病共同靶点245 个,GO 功能富集分析涉及3 052 条生物过程,影响对氧化应激的反应、活性氧代谢过程、循环系统血管功能、对细菌 源分子的反应、对脂多糖的反应等过程;KEGG 通路富集分析得出170 条通路,涵盖了PI3K-Akt 信号通路、 丝裂原活化蛋白激酶（MAPK）信号通路、糖尿病并发症中的AGE-RAGE 信号通路、流体剪切应力与动脉粥样 硬化信号通路等重要通路。结论益脑康胶囊可能主要通过调节氧化应激、调控细胞功能、改善血管内皮功能 来发挥对缺血性脑卒中的治疗作用。     

基于网络药理学探讨薏苡附子败酱散治疗高尿酸血症的作用机制

采用网络药理学的方法,对薏苡附子败酱散治疗高尿酸血症的作用机制进行研究分析。方法：通过中药系统药理学分析平台（Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform,TCMSP）和Uniprot数据库对薏苡附子败酱散进行活性成分及作用靶点筛选和标准化;利用GeneCards数据库和人类孟德尔遗传数据库（Online Mendelian Inheritance in Man,OMIM）检索高尿酸血症疾病相关靶点,并获取薏苡附子败酱散治疗高尿酸血症的关键靶点,对活性成分和关键靶点进行分子模拟对接。构建关键靶点的蛋白-蛋白相互作用（Protein-Protein Interaction,PPI）网络并将结果可视化,并对交集靶基因进行基因生物过程（GO）富集分析和京都基因与基因组百科全书（Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG）通路富集分析。结果：共得到薏苡附子败酱散活性成分40种,预测靶点101个,其中薏苡附子败酱散治疗高尿酸血症的关键靶...     

实脾饮治疗肝硬化腹水的作用机制研究

目的：运用网络药理学方法,探讨实脾饮治疗肝硬化腹水机制。方法：运用TCMSP数据库检索实脾饮中成分与靶点,通过GeneCards和DISGENET数据库查询肝硬化腹水相关靶点。借助Uniprot数据库对检索的靶点进行基因名称校正,将交集靶点输入String数据库,构建蛋白质-蛋白质相互作用网络,通过Metascape数据库进行药物-疾病交集靶点的热图富集总分析,通过David 6.8进行基因本体论（GO）富集分析、京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路分析及药物-靶点分析,使用R语言对KEGG富集分析结果进行可视化操作,利用Cytoscape 3.9.0软件,构建成分-靶点-疾病网络,进行拓扑分析。结果：实脾饮中与治疗肝硬化腹水相关预测靶标蛋白共120种。GO富集分析结果显示,生物过程有631个条目,分子功能有107个条目,细胞组分有52个条目。KEGG通路分析结果显示,120个靶点共得到256条KEGG通路。结论：实脾饮治疗肝硬化腹水的作用机制主要与其对RNA、DNA酶转录的正调控有关,涉及癌症信号通路、脂质和动脉粥样硬化信号通路等,主要靶标蛋白为苏氨酸蛋白激酶（Akt Serin...     

基于网络药理学与分子对接技术研究淫羊藿治疗少弱精症的作用机制

目的 利用网络药理学、分子对接技术探究淫羊藿治疗少弱精症的有效成分及作用机制。方法 利用中药系统药理学数据库与分析平台（TCMSP）筛选出淫羊藿主要活性成分及对应靶点基因；通过GeneCards、在线人类孟德尔遗传数据库（OMIM）获得少弱精症靶点基因；利用UniProt对所有基因进行校正；利用Cytoscape 3.9.0软件构建药物-活性成分-关键靶点调控网络，根据度值筛选关键活性成分；将活性成分与疾病共同靶点上传至STRING 11.5数据库构建淫羊藿靶蛋白-少弱精症靶蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）网络，根据度值筛选关键蛋白靶点；利用DAVID数据库对关键靶点进行基因本体（GO）功能富集分析及京都基因与基因组百科（KEGG）通路富集分析；利用Protein Data Bank（PDB）数据库及TCMSP数据库获得靶蛋白和活性成分的分子结构，通过AutoDock Vina 1.1.2软件对活性成分及核心蛋白靶点进行分子对接；最后通过淫羊藿活性成分淫羊藿苷干预少弱精症模型大鼠，验证淫羊藿苷对蛋白靶点表达的影响。结果 从淫羊藿中筛选出23个活性成分，淫羊藿与少弱精症的共同关键靶点50个，核心靶点6个，包括肿瘤蛋白p53（TP53）、表皮生长因子受体（EGFR）、前列腺素G/H合酶2（PTGS2）、胱天蛋白酶（Caspase）-3、受体酪氨酸蛋白激酶erbB-2（ERBB2）、Caspase-9。GO功能富集与KEGG信号通路富集分析淫羊藿活性成分主要参与P53信号通路、癌症途径、细胞增殖和凋亡等。分子对接结果提示淫羊藿苷、槲皮素、8-异戊烯醇三个活性成分与靶蛋白结合能力较强。淫羊藿苷干预实验结果表明，与空白组比较，少弱精模型大鼠睾丸中靶蛋白表达显著下调；与少弱精症模型大鼠组比，淫羊藿苷可显著上调靶蛋白在淫羊藿苷组睾丸中靶蛋白的表达（P<0.05）。结论 淫羊藿主要通过淫羊藿苷、8-（3-甲基丁-2-烯基）-2-苯基色酮、8-异戊烯醇，调节P53信号通路、癌症途径、细胞增殖和凋亡等路径发挥治疗少弱精症的作用。     

基于网络药理学探究大黄治疗脑水肿作用机制

目的 基于网络药理学方法探究大黄对脑水肿的治疗作用及其机制。方法 运用中药系统药理学分析平台数据库（TCMSP）获取大黄活性成分及作用靶点,在Uniprot数据库寻找大黄靶基因,并与GeneCards、OMIM及TTD等数据库筛选得到的脑水肿疾病靶点,通过建立药物靶基因与疾病靶点venn图寻找共有基因靶点;运用Bisogent对共有基因靶点进行蛋白相互作用（PPI）网络分析,运用拓扑方法分析关键靶点及药物-成分-靶点网络中的关键成分。通过Metascape对共有基因靶点进行GO分析及KEGG分析,构建靶点-疾病-通路关联图,揭示高频药物治疗脑水肿的潜在作用机制。结果 通过TCMSP获得大黄30种活性成分,113个靶点;脑水肿疾病靶点1 691个,二者共同靶点共45个,其中较为关键的活性成分包括2-羟基丙酸、芦荟大黄素、β-谷甾醇、L-羟基丁酸、泽兰黄醇等;关键靶点包括HSP90AA1、APP、ESR1、CUL3、HSP90AB1、XPO1、EGFR等。涉及的传导途径主要包括癌症蛋白多糖通路、雌激素信号通路、神经活性配体-受体相互作用通路等。结论 研究表明大黄治疗脑水肿的作用机制可能与抑...     

基于网络药理学探讨苦参治疗结直肠癌活性成分、作用靶点及潜在作用机制

目的 使用网络药理学方法分析抗肿瘤中药苦参活性成分及其治疗结直肠癌的潜在靶点与作用机制。方法 通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)数据库筛选中药苦参活性成分,并使用PubChem数据库验证所收集活性成分化合物结构,运用SwissTargetPrediction数据库反向分子对接预测苦参活性成分可能作用靶点。采用GeneCards、DisGeNET、TTD、MalaCards数据库预测结直肠癌疾病靶点,通过Cytoscape 3.8软件构建“药物-活性成分-靶点-疾病”关系网络图,利用STRING数据库分析苦参-结直肠癌共同靶蛋白PPI蛋白间相互作用网络,采用DAVID数据库对关键靶点进行基因本体论(GO)富集分析以及京都基因和基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。结果 共筛选获得中药苦参活性成分45个,通过调控结直肠癌相关作用靶点54个,参与体内信号传导、蛋白质磷酸化、凋亡等生物学过程,并通过调控癌症相关信号通路、PI3K-Akt信号通路、癌症蛋白聚糖信号通路等途径发挥治疗作用。结论 中药苦参能够通过多途径、多靶点协同发挥抗结直肠癌作用。     

基于网络药理学和分子对接技术研究黄芪-白花蛇舌草治疗非小细胞肺癌的作用机制

目的：通过网络药理学和分子对接技术，探讨黄芪-白花蛇舌草抗非小细胞肺癌(NSCLC)的潜在活性成分和作用机制。方法：利用TCMSP和Uniprot数据库获取黄芪-白花蛇舌草的主要活性成分及靶点基因；GeneCards、OMIM数据库获取NSCLC靶点基因；绘制韦恩图得到疾病和活性成分共同靶点；STRING数据库构建中药成分靶蛋白-疾病靶蛋白的蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络；Cytoscape 3.9.1软件绘制成分-靶点网络图，通过网络拓扑分析筛选出关键靶点及成分；DAVID数据库及Bioinformatics平台进行基因本体(GO)功能和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析；PyMol软件和AotoDock软件绘制相应的分子对接图。结果：经筛选共得到653个黄芪-白花蛇舌草活性成分靶点和6178个疾病靶点，两者交集靶点154个。GO功能富集到747个生物过程、83个分子功能和150个细胞组分，KEGG通路富集分析得到167条信号通路。分子对接结果显示，PTGS1蛋白与活性成分槲皮素、山柰酚、芒柄花黄素均结合稳定。结论：黄芪-白花蛇舌草可能通过槲皮素、山柰酚、芒柄花黄...     

青黛治疗银屑病作用机制的网络药理学分析

目的基于网络药理学探讨青黛治疗银屑病的药效物质基础及其作用机制。方法通过检索中药系统药 理学分析平台（TCMSP）、中药综合数据库（TCMID）及中国天然产物化学成分库,筛选青黛的活性成分及作用靶 点。利用TTD、GeneCards、DisGeNET 等疾病基因数据库获得银屑病的疾病相关靶点。利用Venny 2.0 软件获 得青黛活性成分靶点与银屑病疾病靶点的交集即共同靶点,作为青黛治疗银屑病的潜在作用靶点。将活性成分 和潜在作用靶点导入Cytoscape 3.8.0 软件构建“青黛-活性成分-潜在作用靶点”网络。将共同靶点录入 STRING 平台构建靶点间的蛋白相互作用（PPI）网络。运用Metascape 数据库对潜在作用靶点基因进行基因本体 （GO）富集分析和京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路富集分析。结果共获得青黛有效活性成分9 个,包 括β-谷甾醇、靛玉红、异牡荆素等,作用于JUN、PTGS2、CASP3、RELA、MAPK14 等32 个共同靶点（潜在 作用靶点）,这些靶点主要富集在PI3K-Akt、IL-17、Th17 细胞分化、TNF、VEGF 等银屑病相关通路。结论 青黛可能通过调控细胞凋亡与增殖、抑制炎症反应、调控血管生成等多个方面发挥治疗银屑病的作用。     

基于网络药理学-分子对接技术研究柴胡治疗卒中后抑郁的药效物质基础及作用机制

目的：通过网络药理学和分子对接技术,探讨柴胡治疗卒中后抑郁（Post-stroke Depression, PSD）的潜在活性成分和可能的作用机制。方法：利用中药系统药理学数据库与分析平台（TCMSP）和蛋白质序列数据库（Uniprot）筛选出柴胡主要活性成分及其靶点基因,并将目标蛋白名称标准化,通过GeneCards、OMIM数据库获取PSD靶点基因;对两者靶点取交集后采用STRING数据库构建柴胡治疗PSD的潜在靶点的蛋白质-蛋白质相互作用网络图;利用Cytoscape-v3.9.1软件进行核心靶点筛选;利用DAVID数据库对潜在靶点进行基因本体（GO）功能富集分析及京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路富集分析。最后,利用PyMol软件和AutoDockTools-1.5.7软件对柴胡主要活性成分与核心靶点使用分子对接技术绘制相应的分子对接图。结果：共筛选得到柴胡活性成分17个,去重后对应靶点175个,疾病靶点852个,经Venny数据库预测到疾病-药物交集靶点45个。GO功能富集分析结果显示共获得323个GO功能注释,KEGG通路富集分析结果显示获得106条信号通路。分子对接...     

基于网络药理学探讨白及治疗消化性溃疡的活性成分及作用机制

目的：基于网络药理学探讨白及治疗消化性溃疡的活性成分及作用机制。方法：利用中药系统药理学数据库与分析平台（TCMSP）搜索白及活性成分及药物靶点信息,通过GeneCards、OMIM、DrugBank、TTD数据库查询消化性溃疡疾病的基因靶点信息。使用Perl软件、R语言、Cytoscape、STRING数据库、PMV-1.5.6软件进行基因本体论（GO）富集分析和京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路富集分析,构建中药白及-活性成分-靶点-通路网络图。结果：从TCMSP数据库中筛选出9种白及活性成分,检索出223个白及靶蛋白,利用CMD分析出77个与消化性溃疡关系密切的靶蛋白。通过GeneCards、OMIM、DrugBank、TTD数据库筛选出717个消化性溃疡靶点。利用Venny 2.1软件筛选,白及治疗消化性溃疡可能通过一氧化氮合酶2(Nitric Oxide Synthase 2,NOS2)、前列腺素氧化环化酶1(Prostaglandin-Endoperoxide Synthase1,PTGS1)、雌激素受体1(Estrogen Receptor 1,ESR1)、雄激素受...     

基于网络药理学和分子对接探讨强力定眩片治疗高血压的作用机制

目的：基于网络药理学和分子对接技术,探讨强力定眩片治疗高血压的作用机制。方法：使用中药系统药理学数据库与分析平台（TCMSP）、中药分子作用机制的网络药理学在线分析工具（BATMAN-TCM）平台检索强力定眩片活性成分,使用Swiss Target Prediction数据库,对活性成分进行靶点预测。通过GeneCards、在线人类孟德尔遗传数据库（OMIM）、治疗靶点数据库（TTD）得到高血压相关靶点,整合药物靶点和疾病靶点,获取交集靶点。使用Cytoscape软件构建药物-活性成分-作用靶点-疾病网络图,筛选核心成分。利用STRING平台构建蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）网络,筛选核心蛋白。使用MCODE对PPI网络进行蛋白聚类分析。利用DAVID数据库进行京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路富集分析,Hiplot分析平台进行基因本体（GO）富集分析,再使用Autodock Vina和Pymol实现核心成分-核心蛋白的分子对接。结果：检索得到强力定眩片活性成分44个,作用靶点679个,疾病相关靶点2 367个,药物与疾病的交集靶点305个。KEGG分析显示,交集基因主要富集于PI3K-AKT信号通路、Ras信号通路、Rap1信号通路、钙信号通路、cAMP信号通路、HIF-1等信号通路。GO富集分析显示,交集基因主要富集于循环系统调控过程、血管管径调节、MAPK级联正向调节、血压调节等过程。分子对接结果显示,主要核心成分与核心蛋白均有较好的结合活性。结论：强力定眩片可能通过调控肾素-血管紧张素-醛固酮系统、血管平滑肌收缩、氧化应激、钙离子通道等方式,起到降低血压的功效。